3T6IA

Endothiapepsin in complex with an azepin derivative
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with an azepin derivative
rcsb
total genus 89
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t6iA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t6iA01
1B6LA 2UXZA 5KR8A 5OZPA 2WF0A 5KOSA 1MUIA 5P1QA 2HS2A 1EPRE 4I0DA 3EMYA 3OHHA 1ZPAA 1K6TA 2AODA 3VG1A 4DJQA 1M4HA 1XE5A 3OAGB 3L5BA 1EEDP 1D4JA 3PWRA 1PPKE 4JPEA 5P5YA 5P0SA 5P11A 2WEDA 3TTPA 1W5XA 3F9QA 3EL9A 4I8ZA 5P4LA 5COPA 3KM4A 5ENMA 5P7OA 5P62A 5P05A 2P83A 5P1LA 3LHGA 3IN4A 2CENA 2VS2A 3PLLA 5KR1A 5P7XA 2XYFA 5P7YA 4XX3A 1DW6C 4EXHA 4J1IA 5DR7A 5P8BA 2BJUA 5P00A 1T6GA 5P5LA 5P2ZA 1IZDA 3ZPTA 4DPFA 1SBGA 3GGUA 5P1RA 4Y37A 3BXSA 3OUDB 4DJPA 5P67A 4B0QA 2BKTA 1W5VA 3OU3A 4RZ1A 3NU6A 3GW5A 2PYMA 3OU1B 1KJGA 3S43B 4Y58A 5P65A 4APEA 4JOOA 4OBKA 1XN2A 5P83A 3QRSA 3NUJA 3VFAA 3L5DA 1GVXA 5P0MA 2ANLA 5P7VA 4CP7A 1SIVA 5P6DA 3H0BA 4R8YA 5OZKA 1KJ7A 3ZMGA 5P2LA 5P82A 3DJKA 3WB4A 5OZOA 3LIYA 5P2WA 1M0BA 5P35A 5P4PA 2WF3A 3EXOA 5P0YA 1Z1RA 4K4QA 5HDZA 3L38A 2AVQA 5P3DA 1XN3A 3INEA 3C9XA 3LIZA 1TCXA 1C6YA 1YG9A 2G1OA 4Y3PA 4J54A 4X7IA 3DCRA 1T7JA 2IENA 1MESA 5P4NA 1FKNA 3RVIA 5I3WA 1TW7A 1HEFE 2RENA 5P5CA 3ER5E 1PSNA 3OOTA 4ZPEA 1LYWB 2NR6A 5P28A 2VIZA 3KFSA 3SPKA 3S8IA 5OZDA 2NNKA 1HVSA 2ER6E 4NPTA 2OHTA 4R91A 3BHEA 5P7PA 1TQFA 1HTFA 3MSJA 5P7JA 3VUCA 4Y6MA 5P3JA 5P4KA 2AQUA 3D3TA 5P3CA 2I4XA 1D4IA 5P3WA 4ACXA 3WZ7A 2R5PA 5P6SA 1UH9A 4KUPA 5OYUA 8HVPA 5P0EA 2Q15A 1HBVA 2P3CA 5P8OA 1RQ9A 4H3FA 3UHLA 5P0HA 5P89A 2P3AA 1QBUA 4Y5PA 1TSUA 1EC1A 2B8LA 4S1GA 5OZNA 1K1UA 2QNQA 1F7AA 3KT5A 3O9LA 5P41A 4NJUA 4NJTA 5P07A 3IAWA 5P0CA 5T4SA 1G2KA 1FQ5A 1FIVA 3L5CA 2Q3KA 7HVPA 4FSEA 3JVYA 3PMYA 4OBZB 4Q5MA 5P5SA 4Y45A 3WB5A 5P2UA 1W5YA 5P29A 4GJ7A 5P1CA 5JODA 5P0RA 4YD6A 2FDDA 4CPXA 4EYRA 4DJUA 5P0LA 1HSGA 5P3MA 1TCWA 5P02A 3OXWA 2IL2A 1AVFA 3OU4A 1ER8E 5P0GA 3TPPA 5HD0A 5P3OA 5DQ4A 3LNKA 2JJJA 2WL0A 4JP9A 1B6JA 2RMPA 1K2CA 3UFLA 3RTNA 4KB9A 2QK5A 3EKQA 3K5CA 4J1EA 2P3DA 5P8FA 1ENTE 2BPVA 1LYBB 3OQKA 5DQ5A 2PH8A 4R93A 3R0WA 3UQPA 3BUGA 2BPXA 5P2KA 2WEAA 5P5BA 2I4DA 5IVSA 4ZE6A 5P80A 1BXQA 3NDXA 4YD5A 5P3NA 2OHSA 3INHA 3MSKA 1BILA 2ZJJA 4I10A 4ZPFA 1YTIA 5P3UA 3KF0A 4J17A 5P5GA 2O4NA 3CKTA 2ZJMA 1T7IA 3GGVA 4YCTA 5P1GA 1ZSRA 2FLEA 5P8KA 3OY4A 5P7IA 5P88A 4I0JA 5P0NA 2JE4A 5P79A 2I4WA 2R8NA 3HVGA 4FLGA 5P3QA 1E81E 3S7MA 4QJ8A 2Z4OA 3HZCA 2XFIA 4RCEA 5IVTA 2HB3A 4I0HA 5OYTA 4KE0A 1GVUA 1LYAA 2ASIA 3IXKA 4Y5LA 1QBTA 5P66A 4Y3YA 4ZSMA 5TOLA 4TVGA 3PCZA 2HAHA 2O4LA 2Q55A 2OHKA 5P52A 4L1AA 3PRSA 2ZJKA 5OZZA 2QMDA 1QBSA 4DQGA 3LPIA 3KMXA 4GJ8A 1D4YA 5P4RA 2O40A 3SAAA 3JW2A 4Z22A 5P18A 5P16A 3S2OA 2IGYA 1G6LA 5F00A 5OYYA 1BWAA 1ZJ7A 3BGBA 1AZ5A 1EC0A 3OUCA 3L59A 3S54A 3UDJA 1FQ4A 4Y47A 5P6VA 5OZGA 1LEEA 4YBFA 2QZKA 4Y3LA 3SA4A 5P10A 2QNNA 4FM8A 4L7GA 3L5EA 3VF7A 9HVPA 5COOA 4QJ6A 1E82E 4RVJA 2NXMA 5HTZA 5I3YA 3I7EA 6UPJA 5P3RA 2F81A 4Y3RA 3LZYA 4Y5BA 4AA8A 1A94A 2AOCA 1FB7A 3PM4A 2G1NA 1FEJC 1HVHA 2WECA 4TRWA 3VV8A 3UQWA 4A6BA 4YCYA 1YT9A 4RYCA 2HS1A 4CPSA 2OAHA 4XX4A 2NNPA 2I4QA 1K6CA 2APRA 2B42A 3QS1A 5P47A 3QVCA 5EZZA 1D4KA 5DR4A 1OD1A 1APVE 1MTBA 3TKGA 3SA6A 5P0IA 5P8VA 1Q9PA 1HPOA 2V00A 4YA8A 5P8UA 5APRE 1HXWA 3IVIA 2ZGAA 2AZ8A 4GJ9A 1MSMA 5PEPA 4MC6A 4Y3EA 5P37A 2QI3A 1HOSA 3GI5A 5P23A 3TLHA 3LIVA 4D89A 3QBHA 2ZHVA 2ZJLA 4COEA 5P85A 3SA9A 4FIVA 1ZP8A 4B05A 5HE4A 5SY3A 2HB4A 5P2FA 5P8MA 1APTE 5P5EA 4ZSPA 1T6EX 5P6KA 5P3FA 4TVHA 1B6KA 4WY1A 2FS4A 2G27A 2Q64A 4Y38A 5P6FA 4DVFA 5P7KA 5HE7A 1HSHA 1SIPA 1MT8A 2I4VA 1HPSA 5KR2A 1SGUA 3TPLA 5P1ZA 5P5DA 2G24A 3NYGA 5P2JA 4FRSA 5P2EA 3PBZA 4U8WA 1AIDA 7UPJA 3BVBA 3FIVA 1C6ZA 5P34A 5P27A 4U7VA 3UTLA 3I25A 5OZBA 4ER4E 3KFPA 3NU3A 3OAGA 1A8GA 5OZXA 1K6PA 2AOIA 5JFPA 1XS7D 5P01A 2VA6A 4I8WA 1AM5A 3ZKNA 2P8HA 2HC0A 1IZHA 5IE1A 3IXOA 5E5JA 1LF4A 4B72A 4D8CA 3PVKA 4Q1YA 5P54A 1Z1HA 4EQJA 1D4HA 3QRVA 4J1KA 3PB5A 2QZLA 5CONA 3EM3A 4EJKA 1GVWA 1BWBA 5P5WA 4Y3AA 5P64A 5P4XA 1UPJA 2BPYA 5P4QA 1C70A 3INDA 4X2LA 4Y4WA 3ZLQA 2VA7A 1OEWA 5P45A 3OUDA 3AUPA 5P1HA 1MSNA 2B8VA 2PC0A 3S56A 4OC6B 3UFNA 3R0YA 1KJFA 1TZSA 3OU1A 5P6GA 4D85A 5P3ZA 2BPZA 5P6WA 2P3BA 5DGUA 1ME6A 5P5NA 5P8NA 4Y4DA 2BB9A 1HVJA 1SDVA 5OZJA 3K5FA 1G0VA 3UDHA 2Q5KA 3EC0A 1XL2A 3PHVA 1HVRA 4HA5A 5P31A 3SACA 1LF3A 5P6IA 3KFNA 4J5JA 5OZLA 2FMBA 3UDMA 2QHYA 3K1WA 2QI4A 3CYWA 1EAGA 5P2RA 1BXOA 5P3YA 5P4YA 2H6SA 5P72A 5P4EA 4YE3A 2WHHA 3BC4A 3ZOVA 4K4RA 2QD7A 1A30A 2HPFA 1NH0A 2FIVA 4BEKA 3WZ8A 1JLDA 2B7FA 4J1HA 5P8DA 3EL4A 1B5FB 3ZKXA 2WKZA 5P77A 4OD9B 5P0OA 1D4LA 5C9FA 2WF1A 2FDEA 2AOHA 5CLMA 2P4JA 5P5MA 1AJVA 2ZE1A 2F80A 1EPLE 4Y3TA 4ER1E 5OZEA 5OYSA 4GZFA 4RYGA 2ER7E 4U7QA 3D1XA 4D83A 5P7EA 2AZ9A 5C9DA 3O9IA 3UDPA 4DUSA 5OZ6A 5P4IA 5P60A 2RKGA 4F73A 1GKTA 3EKTA 2AOFA 3RSXA 4Q1XA 3UCBA 3CIBA 5BWYA 1W6HA 5AH8A 2QI6A 3JVWA 3RSVA 3NSHA 4DH6A 1RV7A 1YTGA 4Y4ZA 3EKWA 4DJWA 4Y3XA 2QHZA 4OBHA 3EBZA 3A2OA 5P8AA 1B11A 4J0VA 2QMFA 2FGUA 1ZBGA 4RCDA 1UH8A 3DCKA 4OBZA 4B77A 1OEXA 3OTSA 2V10C 4HDFA 1KZKA 2I1AA 5P6YA 5P6TA 1HVIA 3BUHA 3G70A 4QJ9A 2ZHSA 1K2BA 2QZXA 2A4FA 2G69A 2PQZA 5OYXA 5OZ4A 1ODWA 2A1EA 1ZTZA 2RSPA 5P1EA 3VF5A 1MTRA 2J9KA 5P3AA 3DV5A 1HIVA 2FDPA 1RL8A 3EM6A 5P3TA 3TOGA 3O9CA 5P7DA 4HEGA 5KR0A 4I0FA 5DQ2A 5P4HA 5OZYA 4Y3FA 2HPEA 2WEBA 3SA8A 5P08A 4DJOA 5P4UA 4K4PA 5P5AA 4FRKA 5DGWA 3K4VC 2Q11A 5DR8A 5P8GA 1IVPA 3D91A 1YTHA 3ZKGA 2PSVA 4Y4TA 5P4DA 4DQEA 1HTGA 3G6ZA 4PHVA 4Y9WA 1U8GA 5P0ZA 2AZCA 2F3FA 2IRZA 5P6NA 3LIXA 5P3KA 4WTUA 5HU1A 2AVMA 1QBRA 2PWRA 1MPPA 4HDBA 5OYZA 2ZDZA 2VJ7A 4JPCA 3FNSA 5P14A 5P7WA 3K5GA 5P25A 5P24A 5P36A 5P3VA 2J9JA 2PYNA 1XL5A 5P1KA 3CIDA 4EQ0A 5I3VA 2FXDA 5OZSA 1SGZA 3U7SA 5P7LA 5P87A 3NWQA 1HPVA 4HDPA 3PI5A 5P1MA 4LC7A 4Y5KA 4PZWA 1XDHA 2BBBA 1CPIA 2AVVA 3TPRA 3VCMA 3ER3E 4Y5AA 5P3HA 2NXLA 5KQYA 5P6JA 4Y4EA 4Y5NA 1W6IA 4CPQA 2QU2A 5P2AA 5P06A 4EWOA 4LBTA 5P15A 4I12A 4Y3DA 4ZSQA 1BV9A 5P3BA 4I1CA 5AH7A 5IS4A 3D1YA 4M8XA 4R5NA 5KOQA 1RNEA 2UY0A 5P0TA 4CKUA 3SLZA 2QI1A 3ZKQA 1FGCC 5P44A 5P0FA 5P2IA 5P2TA 5SY2A 5KAOA 3QAAA 3Q5HA 4MC1A 4DJXA 3FSMA 5KQFA 6FIVA 5P8SA 2AIDA 3G72A 3I8WA 4YD7A 5P0VA 5DQCA 5AHAA 1HVCA 4R95A 5DPZA 1HVLA 1APWE 4Q1NA 2G1RA 5ISJA 5DR0A 3UDQA 1SH9A 5P6PA 1SMEA 4L7HA 4GJ6A 3DM6A 4B70A 4GJBA 5ER2E 3UDKA 3LZUA 2NMYA 2VIJA 5OZIA 4B78A 4QJAA 4CPRA 5P70A 2HIZA 3LIQA 3PLDA 1IDBA 2IGXA 5P2GA 3SQFA 5P1BA 3TOHA 5HE5A 5COKA 1EBZA 1FG6C 2CEJA 4Y5GA 6APRE 5B18A 4GB2A 4A6CA 3OU4B 4N00A 3NU4A 3MWSA 5P7AA 4CMSA 3HVPA 2G1SA 5ENKA 3VYFA 4NKKA 3PSGA 5OZ2A 2AZBA 3O9HA 1T3RA 2OHPA 3LPKA 4Z50A 3OQAA 1MIQA 2H6TA 4Y3WA 3QP0A 4PYVA 4DJVA 1NPVA 4EHCA 3OGQA 3UDRA 1FG8C 2QAKA 4WY6A 5P20A 5P2YA 3VYDA 4Y36A 1M43A 3N4LA 3AIDA 4H1EA 4YCKA 3R1GB 3TH9A 3CYXA 5P0AA 3GGAA 2F3KA 5ER1E 2AOEA 5P50A 3CKRA 2QP8A 4LP9A 3HW1A 1ODXA 4XXSA 5P2OA 5OYRA 5OZMA 4K9HA 2EWYA 5P1PA 4Y54A 4EXGA 2G1YA 4Y3ZA 5P32A 5P8RA 5P0PA 1BV7A 4J55A 5P30A 5P2XA 2R3TA 3CICA 5HCOA 4FM6A 5SZ9A 4Y3HA 5OZVA 2B7ZA 1N49A 1D4SA 5P8EA 2ZHRA 4Y41A 1SDTA 2ER0E 4HZTA 3PWMA 3OWNA 3SM2A 3PJ6A 1LYAB 1EBWA 5P1UA 5P5PA 4OC6A 1KJHA 3KFRA 5P0XA 4Y5EA 3PGIA 5P1WA 3S53A 3Q3TA 1BVEA 4JECA 5AGZA 5P6XA 3KDDA 4LXKA 3SO9A 3S85A 4L1AB 3UDNA 3QVIA 5P4WA 1FQ6A 2ZJHA 3TOFA 4XKXA 3SKFA 2CEMA 5OZHA 5P8LA 5SXNA 2PWCA 5P5XA 3OUAA 2XYEA 3RU1A 5DR3A 2R38A 5E5KA 5P42A 2PMAA 5DQ1A 1QRPE 4CPWA 5P6HA 1HHPA 2WEZA 4RCFA 4Y5MA 5P5FA 4TRZA 2IDWA 3UQUA 1PSAA 1ZSFA 4DQFA 4J0YA 1A9MA 4H3GA 3URLA 1FFIC 5P1VA 3NDWA 5BRYA 5P1TA 3I2LA 2FNTA 5AHCA 3PBDA 5P7TA 1FLHA 3K5DA 4YOBA 2G26A 1MT7A 5P57A 3EKVA 1FQ8A 1EPOE 1B5FA 4AZYA 4F75A 3ZPUA 4FAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B6L A;  2UXZ A;  5KR8 A;  5OZP A;  2WF0 A;  5KOS A;  1MUI A;  5P1Q A;  2HS2 A;  1EPR E;  4I0D A;  3EMY A;  3OHH A;  1ZPA A;  1K6T A;  2AOD A;  3VG1 A;  4DJQ A;  1M4H A;  1XE5 A;  3OAG B;  3L5B A;  1EED P;  1D4J A;  3PWR A;  1PPK E;  4JPE A;  5P5Y A;  5P0S A;  5P11 A;  2WED A;  3TTP A;  1W5X A;  3F9Q A;  3EL9 A;  4I8Z A;  5P4L A;  5COP A;  3KM4 A;  5ENM A;  5P7O A;  5P62 A;  5P05 A;  2P83 A;  5P1L A;  3LHG A;  3IN4 A;  2CEN A;  2VS2 A;  3PLL A;  5KR1 A;  5P7X A;  2XYF A;  5P7Y A;  4XX3 A;  1DW6 C;  4EXH A;  4J1I A;  5DR7 A;  5P8B A;  2BJU A;  5P00 A;  1T6G A;  5P5L A;  5P2Z A;  1IZD A;  3ZPT A;  4DPF A;  1SBG A;  3GGU A;  5P1R A;  4Y37 A;  3BXS A;  3OUD B;  4DJP A;  5P67 A;  4B0Q A;  2BKT A;  1W5V A;  3OU3 A;  4RZ1 A;  3NU6 A;  3GW5 A;  2PYM A;  3OU1 B;  1KJG A;  3S43 B;  4Y58 A;  5P65 A;  4APE A;  4JOO A;  4OBK A;  1XN2 A;  5P83 A;  3QRS A;  3NUJ A;  3VFA A;  3L5D A;  1GVX A;  5P0M A;  2ANL A;  5P7V A;  4CP7 A;  1SIV A;  5P6D A;  3H0B A;  4R8Y A;  5OZK A;  1KJ7 A;  3ZMG A;  5P2L A;  5P82 A;  3DJK A;  3WB4 A;  5OZO A;  3LIY A;  5P2W A;  1M0B A;  5P35 A;  5P4P A;  2WF3 A;  3EXO A;  5P0Y A;  1Z1R A;  4K4Q A;  5HDZ A;  3L38 A;  2AVQ A;  5P3D A;  1XN3 A;  3INE A;  3C9X A;  3LIZ A;  1TCX A;  1C6Y A;  1YG9 A;  2G1O A;  4Y3P A;  4J54 A;  4X7I A;  3DCR A;  1T7J A;  2IEN A;  1MES A;  5P4N A;  1FKN A;  3RVI A;  5I3W A;  1TW7 A;  1HEF E;  2REN A;  5P5C A;  3ER5 E;  1PSN A;  3OOT A;  4ZPE A;  1LYW B;  2NR6 A;  5P28 A;  2VIZ A;  3KFS A;  3SPK A;  3S8I A;  5OZD A;  2NNK A;  1HVS A;  2ER6 E;  4NPT A;  2OHT A;  4R91 A;  3BHE A;  5P7P A;  1TQF A;  1HTF A;  3MSJ A;  5P7J A;  3VUC A;  4Y6M A;  5P3J A;  5P4K A;  2AQU A;  3D3T A;  5P3C A;  2I4X A;  1D4I A;  5P3W A;  4ACX A;  3WZ7 A;  2R5P A;  5P6S A;  1UH9 A;  4KUP A;  5OYU A;  8HVP A;  5P0E A;  2Q15 A;  1HBV A;  2P3C A;  5P8O A;  1RQ9 A;  4H3F A;  3UHL A;  5P0H A;  5P89 A;  2P3A A;  1QBU A;  4Y5P A;  1TSU A;  1EC1 A;  2B8L A;  4S1G A;  5OZN A;  1K1U A;  2QNQ A;  1F7A A;  3KT5 A;  3O9L A;  5P41 A;  4NJU A;  4NJT A;  5P07 A;  3IAW A;  5P0C A;  5T4S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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