3T7PA

Endothiapepsin in complex with a hydrazide derivative
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with a hydrazide derivative
rcsb
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7pA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7pA01
4Y3YA 3OQDA 5OZ8A 5P2HA 3BUFA 2FDEA 5P2VA 2FNSA 3NWQA 5P7YA 1LZQA 3LHGA 3JW2A 5P3OA 5P2UA 1MT8A 1IZIA 2FXDA 1UPJA 2PC0A 4J1IA 2OHQA 4Y53A 1HTEA 1EPPE 5OYSA 4Y5AA 2VIYA 3IXOA 3O9LB 3SO9A 1K6CA 1IVQA 5P7AA 5OZOA 1TSQA 4FM6A 4D85A 4KE0A 4R91A 1SGUA 4K4PA 1SDUA 4X2LA 3R4BA 5DQ5A 4TRWA 4OD9A 5P2AA 2UPJA 4ZLSA 4J1HA 2G69A 3PBDA 1SMEA 5P3XA 2BPXA 4QJ7A 4YOAA 3UPJA 2ZJNA 4BEKA 5OYTA 1K1UA 4XX3A 5DQ4A 5P08A 5P2JA 3KMXA 1UH9A 3TOGA 5P1SA 4EP3A 1APVE 5P14A 3TPPA 3QI1A 5P2WA 1K2CA 1D4YA 5P0ZA 5KQZA 5J25A 4FE6A 2IL2A 5P5WA 1BIMA 3UDQA 5OZZA 3NDTA 4J54A 3WZ8A 5HDVA 3HVGA 2VIZA 5P28A 2RMPA 3GGUA 3PSUA 2QI4A 5P35A 1W50A 3ZL7A 4I0JA 1HTRB 4H3JA 4LXMA 2G1YA 5DGWA 2XFKA 5P11A 4F73A 5P5KA 4DJRA 1W6IA 2ZJLA 5F00A 3KMYA 5P52A 2ZDZA 3BC4A 1WBKA 3FNUA 1GVXA 5P6VA 4Y5GA 3ZPTA 2P3BA 1FMUA 5ENMA 4MC2A 3QRVA 2ZHRA 2AVQA 3EMYA 3SA9A 5C9DA 1E82E 5P20A 4BFBA 2QNNA 2B8VA 4Y4AA 3HBOA 1B11A 4RRSA 1KJ7A 5P6UA 5OYVA 5P5MA 5OZXA 4Z2ZA 4Y44A 4OBZA 1HWRA 3IXKA 2QHZA 4PZWA 5P30A 4Y4JA 3RTMA 4I0ZA 2P83A 5P5RA 2VKMA 4YCKA 4DV9A 4GJ9A 2OAHA 4GYEA 4DQCA 2OHNA 5P4NA 1EPRE 3NYGA 5SXNA 1B6JA 4BFDA 1AZ5A 1OHRA 2R43A 5P57A 3EL4A 5OZNA 5P0YA 5P1GA 4H3FA 5P86A 3OQKA 2FDDA 2PSGA 2QNPA 3QN8A 1C6ZA 2A1EA 3PSGA 2QI3A 5P7TA 5P1RA 1D4SA 1UH7A 5HTZA 2HC0A 4MC1A 2IDWA 2F3FA 4DPIA 3EKQA 5P1DA 1KJ4A 4OC6A 2O4LA 4OBFA 5OZGA 1FMXA 3GI6A 4K4RA 1ZJ7A 3DV5A 3WSJA 1K1TA 3CICA 2I4DA 4Y4WA 5TOLA 3I7EA 4I8WA 4K8SA 1XE6A 5HU0A 4I0EA 4NPUA 1HPSA 3PJ6A 4ER4E 2B8LA 3IN4A 5P5YA 1D4KA 3VSXA 5P4YA 4HLAA 1BAIA 5P2DA 3NU3A 5P66A 2AOFA 3NDUA 3R0WA 2Q15A 1TCXA 1K2BA 3QPJA 5P59A 1WKRA 3PM4A 4J0TA 2WEZA 5JODA 3SA4A 1LS5A 3OOZA 3PBZA 5KQFA 5P73A 1YT9A 5HCTA 4Y6MA 2I0AA 4ZPFA 5P3KA 4WY6A 4N00A 1HSGA 1WBMA 5P4TA 4Y3GA 5P63A 1QBSA 3OADA 5P4GA 4UPJA 1HIHA 3BXRA 4B78A 5OZYA 2PSUA 4FCOA 4ZSRA 2QU3A 1HBVA 5P36A 4WY1A 5HE7A 3MXDA 4Y3SA 5OZ0A 5P7UA 5P1ZA 2RKFA 3ER3E 1W5WA 1FFFC 1ODYA 4Y4GA 4Y38A 1Z1RA 1NH0A 5P7PA 3IXJA 3PWMA 3Q5HA 2ER0E 5P7LA 5AH7A 4Q1XA 5AH9A 3BVAA 3K5FA 2OHTA 2PSVA 1B5FA 5P33A 5P50A 5DR0A 5HDXA 5OYZA 1C6YA 1NPVA 4AUCA 3FNSA 3VSWA 1T7JA 5P7MA 2IGYA 1MT7A 5P3CA 5P18A 5SZ9A 1RQ9A 1HXBA 2NMYA 4GJ5A 1HRNA 5P2LA 3UTLA 3O9HA 3LIXA 4Y3NA 1YTGA 4HA5A 3KN0A 5P3IA 2Q64A 3S45A 1BXQA 5P7EA 3FX5A 4Y43A 4I0IA 2G1SA 3ZKMA 1HEFE 5P7HA 4TVGA 1Q9PA 5UPJA 2P4JA 1PPME 3QROA 4Y35A 5OZBA 3UDMA 4E43A 4FRSA 4KE1A 1OEXA 2QHCA 4FIVA 4J1CA 4PYVA 1AJVA 3OXXA 2RKGA 2G21A 5P3FA 1B6KA 3TKGA 5P16A 2WKZA 5OZHA 1HHPA 3KT5A 3IN3A 4HVPA 4F76A 3O9CA 5C9BA 3NU9A 1G0VA 1BBSA 5IVSA 5IE1A 4R93A 1SDTA 2NTRA 1ER8E 1QBUA 5P72A 2QD8A 5P1UA 4AMTA 5DPZA 5I3VA 2Q55A 4RVJA 3ZLQA 3SQFA 5OZJA 3S43B 1D4LA 2JJJA 4XXSA 2ZJMA 1ZLFA 3MSJA 3CIDA 3OU4A 5HE4A 2VNMA 1EBZA 5P6PA 3LZVA 2I4UA 3FNTA 5P4EA 4XKXA 3LZYA 5P1MA 4ACXA 5P4PA 5IVTA 5P7BA 5P51A 5P25A 2BQVA 5P2NA 4DJYA 3FIVA 3DCRA 3GI5A 5P8KA 3OQAA 4R92A 4Y9WA 3HW1A 1LYAB 2VS2A 3FV3A 3H5BA 1NPAA 4TRYA 2FS4A 4GJAA 2QI6A 3K4VA 3NLSA 5P5HA 4J1KA 1YM4A 5P19A 5SY2A 5IVRA 3U7SA 1GVWA 5JFUA 5ER1E 3D1XA 2O4NA 1A94A 1GVUA 5HD0A 5P85A 5P8SA 4HZTA 5P6LA 3KFRA 3DV1A 2XFJA 2OHKA 2A4FA 5P3TA 3S56A 3VLAA 5P7SA 2APRA 5P7XA 3KDDA 3O9LA 7HVPA 5P69A 4ZPGA 1A9MA 5P6BA 1HOSA 5F01A 1MSNA 1T3RA 4L6BA 2QI0A 3HVPA 3NSHA 5OZ9A 5OZWA 1SH9A 3TPLA 4BELA 4YD3A 5P3NA 3INEA 4Y4ZA 1BWBA 3PEPA 1SGZA 2QMFA 5P62A 4OBDA 4NJSA 3HZCA 1PSNA 3ZKGA 5P81A 4R95A 1A8KA 3MWSA 1IVPA 5P83A 3L58A 5HE5A 3L5FA 4R8YA 2WF1A 4I8ZA 4OBGA 5P06A 5P45A 5P8AA 5P6SA 4R5NA 4Q1NA 1W5VA 3IVHA 4QJ8A 2AIDA 5BWYA 3MXEA 5OZ2A 1IZDA 4MC9A 4EWOA 1KZKA 3L3AA 1YG9A 5P0MA 5AH6A 4LC7A 4D89A 1EBWA 4B72A 1HVLA 1DAZC 3D91A 3DUYA 3CMSA 2BB9A 5P3DA 3SA6A 3EKTA 2AZCA 4Y5CA 3EC0A 3D1ZA 5P03A 2WF4A 3WB4A 5P64A 2VA5A 4A6CA 2PMAA 1YTIA 5P58A 2R5PA 2ZHVA 3NWXA 3Q3TA 5P1BA 1D4HA 1PROA 3UQRA 4Y39A 4FM8A 4LAPA 5P4MA 3L5CA 4Y3ZA 4Y4EA 5P5FA 3VUCA 5P10A 3KA2A 5P1WA 1N49A 5KR1A 4M8XA 1F7AA 2ZJIA 3PI0A 3PGIA 4Y5NA 2O4PA 2NR6A 4U8WA 1AJXA 3OK9A 3R1GB 3PLDA 3Q70A 3SKGA 3VF5A 2HPFA 3IAWA 5OZPA 4EPJA 5P4AA 3K4VC 5P22A 4Y41A 1HVIA 1LYBB 5P4HA 1EAGA 1B6LA 2QI5A 1TQFA 5P5AA 5P8HA 5P6XA 5P6QA 3WB5A 2AOIA 4J5JA 1MTRA 3SM2A 2AVOA 1LYWB 3O9IA 4D8CA 5BS4A 5P3ZA 5P4WA 1SDVA 2OHRA 5P43A 1FQ5A 2HIZA 4PEPA 2QCIA 1W5XA 1PSAA 5P6OA 5P2IA 4Q1WA 4I11A 3L5DA 1CZIE 3O9FA 1JLDA 4J55A 3T3CA 5I70A 5P1PA 3LIQA 2Q54A 1YTJA 4EP2A 5IVQA 3LPKA 5P6WA 1KJHA 5P3VA 3ZKNA 4M8YA 4OBHA 3BGCA 5P00A 4FGXA 2ZHSA 4ER1E 5P02A 4Y3EA 2G26A 3D1YA 4ZSMA 1ZP8A 4GJCA 4DH6A 2ER7E 4Q5MA 5P3WA 2NXMA 5P8MA 3HD8A 3RSVA 1A8GA 1AVFA 3PI5A 1BILA 4Y3FA 2IENA 2ZJJA 2FIVA 3S2OA 4Y4DA 2NXLA 5P67A 5APRE 5P13A 1T6GA 5KQXA 3RVIA 2V00A 3T7QA 2P3CA 2FGUA 5P7NA 2HB3A 1PPLE 1ZTZA 4Y4XA 1HVRA 5PEPA 2WF2A 5OZ4A 5P4ZA 3U6AA 4FS4A 2FGVA 3T7XA 3LIVA 1SMRA 4RGHA 5P1NA 5P5EA 3WZ7A 4JECA 2I4XA 3HLOA 5P1TA 3T7PA 5P82A 5SY3A 5P41A 3PSYA 3A2OA 3QS1A 1HPVA 2QD7A 4ZPEA 8HVPA 1XS7D 4CPXA 3Q6YA 1MPPA 2ZHTA 3D3TA 3QP0A 4PHVA 3UQUA 4YD5A 1DMPA 2JJIA 2IS0A 5COPA 4DI2A 5P3SA 5OYWA 4Q1YA 5P0XA 5P53A 3OXVA 3K1WA 2IEOA 2I4VA 2H6TA 5P0PA 5P8UA 5OZ3A 5P09A 5P8OA 2IQGA 5OZVA 2HPEA 5P7GA 5P2FA 5P1QA 2F3KA 4Y57A 5P3HA 5P8QA 4EJKA 3VF3A 4Y3MA 4B1DA 2R8NA 5IS4A 1TZSA 2AVMA 3UDYA 4QJAA 3PCWA 5P05A 4GIDA 2QMDA 5P61A 5P70A 5P7DA 3UF3A 1FQ8A 3SA7A 3FKTA 2VA6A 1M43A 3VFAA 3S54A 4YD4A 4FRKA 2QZLA 3ST5A 5P6YA 2FNTA 1QBRA 1EPQE 2AODA 3QRMA 2G22A 3AUPA 3S43A 3AIDA 4J17A 4Z50A 1APTE 3INHA 5OYQA 2PWCA 5OYYA 3URJA 1HXWA 5BRYA 4YDFA 7UPJA 1EPNE 3T6IA 2R5QA 1VIKA 3GW5A 2I4QA 4X7IA 3NDXA 1W5YA 4FSEA 2QI1A 5P5VA 3SA3A 1HVJA 5AH8A 4PPHA 1HVSA 2NNPA 1LYAA 1HVCA 5P47A 4CKUA 5P5CA 1FQ4A 3VYFA 1EC3A 2PH6A 3QVCA 2QZWA 2AVVA 3KM4A 5P4XA 1ZSFA 3OTSA 3OY4A 1BXOA 3BUHA 4FRIA 1PSOE 1MVPA 1HPOA 4J0VA 3VFBA 1GKTA 4DVFA 5P15A 1META 2G24A 3VCMA 3PHVA 3TKWA 2VJ7A 4ACUA 5P7WA 3WZ6A 2ZGAA 4Y3WA 3CYWA 3RTNA 2AVSA 2V16C 5P5QA 4ZSPA 3GGVA 4B1EA 1EPLE 5P79A 3SABA 4L1AB 2WF3A 3OU3A 1HTGA 1MEUA 1NSOA 2PYMA 4Y58A 3I6OA 5P31A 5P3RA 1FG6C 4Y3DA 2G1OA 2VJ6A 5P3BA 5HU1A 4EQ0A 3DCKA 4DJUA 5CONA 3HDKA 3ZKXA 5DR7A 4F75A 2QNQA 3L5BA 3BUGA 3OHHA 1GVVA 2ZHUA 1BV9A 3PVKA 4KB9A 4DQGA 3BGBA 4I0HA 1K6TA 1ZAPA 3TNEA 5KR0A 5P4KA 1MESA 5P8JA 4GB2A 4JOOA 5P8BA 3APRE 5P1JA 3G6ZA 5P68A 2QK5A 1SP5A 5P2OA 4A6BA 3OAGB 3ZPUA 5T4SA 1LF3A 3OTYA 3Q4BA 4H1EA 3PMUA 1SIPA 4DQEA 3NR6A 3KYRA 3UQXA 5DR4A 1DW6C 5P4BA 1BV7A 1Z1HA 3TPJA 2QAKA 1BDLA 4LXKA 1XDHA 5P0OA 1D4IA 5P24A 5P3YA 2PK5A 5OYRA 1YX9A 5P0FA 4NJVA 5P0CA 4D83A 1HEGE 3N4LA 1APWE 4YD6A 4QLHA 5P07A 4EJLA 3VF7A 3L5EA 4U7QA 2WEDA 4QGIA 1F34A 4FSLA 3S85A 5EZZA 1G6LA 3I25A 3UCBA 1EC1A 1B6MA 4B05A 1J71A 5P1EA 2VJ9A 3VLBA 1BVEA 2XYEA 5P4DA 3OUCA 2WF0A 4JPEA 3LIYA 2HS2A 2AOCA 5P8TA 3IA9A 3UDNA 5P1XA 1VIJA 2Z54A 2OHLA 1HVKA 3NU6A 3DOXA 5P3GA 1C70A 5FIVA 3U71A 5P0UA 3O9BA 1XN2A 4OBJA 3EKYA 2B7ZA 5I3YA 2R38A 5P0DA 3EL1A 1ZSRA 5KR8A 4Y50A 5OZ7A 3QAAA 4YOBA 4EYRA 5DGUA 2FMBA 3UDJA 2RENA 3SA8A 4RZ1A 3GI4A 1FG8C 5P8NA 3S7LA 2QU2A 5P04A 2XYFA 2AOGA 5P7ZA 1T7IA 1YM2A 2G20A 3D20A 3NXEA 4HDPA 1LYBA 3MSLA 2UY0A 4I12A 5P6TA 5P76A 2J9KA 1AM5A 2G94A 6APRE 1HSIA 5P5GA 4DFGA 3ER5E 5KQYA 3DM6A 5HDZA 3IVIA 3KF0A 1EPME 5P0WA 5P77A 5P40A 1LYWA 1IZHA 3GGAA 4YD7A 3JVYA 1ODWA 3CKTA 5ENKA 1ZBGA 4GJBA 4DQFA 4GJ7A 4Y5BA 5AGZA 4Y5PA 2B60A 3KFSA 5KOQA 3OHFA 3NU4A 3M9FA 5P3EA 4Y37A 4CPRA 5P2YA 4B1CA 3URIA 5OZ6A 3RU1A 3EM3A 2G1RA 1E81E 3OWNA 4APEA 4I0DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Y3Y A;  3OQD A;  5OZ8 A;  5P2H A;  3BUF A;  2FDE A;  5P2V A;  2FNS A;  3NWQ A;  5P7Y A;  1LZQ A;  3LHG A;  3JW2 A;  5P3O A;  5P2U A;  1MT8 A;  1IZI A;  2FXD A;  1UPJ A;  2PC0 A;  4J1I A;  2OHQ A;  4Y53 A;  1HTE A;  1EPP E;  5OYS A;  4Y5A A;  2VIY A;  3IXO A;  3O9L B;  3SO9 A;  1K6C A;  1IVQ A;  5P7A A;  5OZO A;  1TSQ A;  4FM6 A;  4D85 A;  4KE0 A;  4R91 A;  1SGU A;  4K4P A;  1SDU A;  4X2L A;  3R4B A;  5DQ5 A;  4TRW A;  4OD9 A;  5P2A A;  2UPJ A;  4ZLS A;  4J1H A;  2G69 A;  3PBD A;  1SME A;  5P3X A;  2BPX A;  4QJ7 A;  4YOA A;  3UPJ A;  2ZJN A;  4BEK A;  5OYT A;  1K1U A;  4XX3 A;  5DQ4 A;  5P08 A;  5P2J A;  3KMX A;  1UH9 A;  3TOG A;  5P1S A;  4EP3 A;  1APV E;  5P14 A;  3TPP A;  3QI1 A;  5P2W A;  1K2C A;  1D4Y A;  5P0Z A;  5KQZ A;  5J25 A;  4FE6 A;  2IL2 A;  5P5W A;  1BIM A;  3UDQ A;  5OZZ A;  3NDT A;  4J54 A;  3WZ8 A;  5HDV A;  3HVG A;  2VIZ A;  5P28 A;  2RMP A;  3GGU A;  3PSU A;  2QI4 A;  5P35 A;  1W50 A;  3ZL7 A;  4I0J A;  1HTR B;  4H3J A;  4LXM A;  2G1Y A;  5DGW A;  2XFK A;  5P11 A;  4F73 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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