3T7QA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA01
5P23A 4ZSMA 3URLA 2WJOA 5OZ8A 2PK6A 3OQ7A 1K6CA 1LF4A 3KYRA 2G94A 5P1CA 2AZCA 2B60A 2IRZA 5P0CA 4GJ9A 4Y35A 3T7QA 1YG9A 5P5XA 2ER0E 3OOTA 2QNPA 5P4VA 4YBIA 1K2CA 3BUFA 4I11A 2ER7E 3EL5A 3QROA 5P2MA 4RVJA 2O4PA 5P4YA 4F74A 3LPJA 2FXEA 4Y3EA 1ZJ7A 2BPYA 3L3AA 4L6BA 2VJ9A 3PI0A 4Y3TA 5OYUA 5DQCA 5SY2A 2QD8A 5P3LA 5FIVA 4R5NA 3S85A 1YTIA 1PPME 3RVIA 1ER8E 4FRJA 3GI6A 4CPUA 1BWBA 3APPA 4Y3XA 4DJPA 4U8WA 5P89A 5P1AA 5P5DA 4APRE 5OZ0A 1E81E 1ZSFA 3IVIA 5P1JA 3NDXA 2NMZA 5P6HA 3L5FA 1B5FA 5P12A 4EXGA 5P1XA 5P2UA 3VLBA 3OU1A 5P3XA 2I0DA 1SP5A 5P7PA 2HS2A 4YD6A 3PGIA 3EKXA 1D4SA 2NXMA 3PWMA 5P4UA 5OYQA 1D4LA 3INHA 5P71A 5P06A 3PRSA 4Y4ZA 3VV7A 5P4JA 5AHBA 3WB5A 5P6KA 3LPKA 3ZKSA 3D1ZA 5P5WA 3CMSA 5P7WA 2PQZA 5T4SA 3SM2A 4I8ZA 5OYXA 3NDUA 5P70A 5J25A 2PYMA 5DR8A 4OBGA 3SKGA 2A4FA 3ST5A 2R9BA 3LZSA 4QGIA 1BVGA 1APWE 5P2OA 5P29A 2ZJIA 3UPJA 3WSJA 4HDFA 2CEMA 5KOSA 3HZCA 5P3DA 1RQ9A 4D8CA 5P6JA 2HB2A 5P6WA 4Y4XA 4BFBA 4Y3HA 2WF1A 3OTYA 4FM6A 2ASIA 4Y3RA 4CMSA 4Y5BA 5P14A 5OZFA 5P6QA 4Y47A 4EQJA 1GVVA 1CZIE 6UPJA 3PB5A 3K5GA 4GJ5A 5OZPA 1OEWA 4ZEAA 2QAKA 1VIJA 4GYEA 2WECA 3ZKMA 5P1PA 2F3FA 2P3CA 2AZ9A 5P7TA 2ZJHA 5P8TA 5C9BA 4YDFA 5P6DA 2WF4A 4GJ8A 5P22A 5P2FA 4R92A 2IGXA 4EPJA 2PSVA 4EQ0A 4PHVA 5OZTA 1XL2A 5IVSA 2XYFA 4JPEA 2NXDA 3VG1A 4Y3GA 5DQ1A 5P3KA 4FAEA 5P0NA 5P73A 5KQXA 5BRYA 4F76A 1SIVA 1YX9A 3QPJA 5P3JA 5P0GA 4CKUA 5SZ9A 2QI5A 6FIVA 2H6SA 4LHHA 4Y4DA 5I3YA 1FQXA 3NXNA 4RCEA 5P72A 1MIQA 2NPHA 4K4RA 4A6CA 2IDWA 5P74A 3HLOA 5P17A 2BPXA 1ZAPA 2OHRA 1T7JA 2ZGAA 4B77A 1HEGE 2V00A 3OGPA 4J1CA 3N3IA 5P3YA 2HB3A 1ZBGA 4OBFA 3U7SA 2G21A 1FEJC 4NJTA 3EC0A 2AIDA 3PBDA 2VNMA 4FLGA 3HW1A 3IA9A 2G26A 2WL0A 1Q9PA 3FNTA 5P57A 3QVCA 2IQGA 3L5CA 3TLHA 5HE4A 2QU3A 5P85A 4WY6A 3HVPA 5P3FA 3O9LA 5P3IA 1XDHA 3A2OA 3QAAA 5P7LA 4Q1YA 1W5WA 4J1HA 3FIVA 5OZIA 5P5AA 2RKGA 1K6TA 3GGAA 1D4YA 2I4UA 1AAQA 3RTHA 4CPTA 4ER4E 5P4FA 1FQ6A 4JOOA 5P5EA 5P05A 2B42A 1IZIA 3Q5HA 5JODA 5P08A 1W5XA 3OUBA 5P10A 2V11C 5P7IA 3KN0A 4AUCA 2QZKA 5P6YA 4OC6A 4CP7A 5HCOA 2P3AA 2HS1A 3INDA 5AHCA 1D4KA 4Y6MA 4OD9B 5BWYA 2R43A 2JXRA 3FSMA 5P01A 3PWWA 1TQFA 3RSXA 4I0ZA 1NH0A 2JYSA 2Q15A 1B6PA 4QJAA 1MT7A 5P2EA 4BELA 5P5SA 5KQZA 1IVQA 1XL5A 5P58A 3S54A 1APUE 2FDDA 5P09A 3VYFA 3UQUA 4COEA 4YOAA 1YT9A 3MSKA 5HD0A 4N00A 4ACUA 5P8IA 2F81A 3VLAA 2QHYA 1W51A 3IXJA 5P32A 3VYEA 3OHHA 3O9BA 4H3JA 3TOFA 2PSGA 1IIQA 3BGCA 2O4SA 2BKSA 1HXBA 4Y4UA 3MXEA 5P5GA 5IE1A 3GGXA 5P55A 4Y56A 1C6XA 3NU3A 4Y3LA 2P4JA 4RYGA 1SGUA 2CENA 2V12C 3SABA 1AIDA 2P3DA 5P8CA 1QBSA 5P2WA 3U6AA 4OBDA 5P2VA 1APVE 3OQAA 3SA5A 1EBZA 3DOXA 5P5LA 5P2ZA 1FG6C 3TKGA 2QI4A 3LPIA 4I0FA 1BDQA 1C6ZA 1OHRA 5P6TA 3T6IA 1BDLA 5P1IA 4Y9WA 4FM7A 3SACA 2EWYA 1A30A 5P1TA 1YM2A 4K4PA 2AZ8A 2RSPA 5P63A 3NYGA 2APRA 1FGCC 5P2LA 2HPEA 5COOA 1IBQA 2QI6A 3FNSA 1YTHA 4J0PA 2IKOA 3GI4A 5P3GA 5P4RA 5ENKA 5SXNA 1LF3A 5OZ9A 3AIDA 4YE3A 3QIHA 3QRSA 5P7SA 4FAFA 1EC3A 5P3VA 1LYWA 4YOBA 5P65A 3KMYA 5P43A 4B1DA 3Q4BA 4Y58A 1GNOA 4OBJA 3L38A 2HAHA 5B18A 4YHQA 5COPA 5P6CA 3D91A 4LBTA 5P5ZA 4I10A 3O9FA 2Z4OA 5P0WA 5P7MA 4D88A 5P7NA 5OZXA 3S8IA 1QBRA 4U7VA 4Y3DA 3BHEA 5P8UA 3ZKNA 1MSMA 1A8KA 5OZ6A 1LYBB 1OEXA 3QS1A 4K8SA 1EC2A 1W6IA 3UQWA 4OD9A 1FMBA 4I0HA 3EKQA 1EPME 2IEOA 3OTSA 4H3FA 5DR7A 5HU0A 5KQFA 1EBWA 3NDTA 1FG8C 5P5JA 4Y39A 4Y51A 4Z50A 3VYDA 7UPJA 4JP9A 4L7HA 4OBKA 2IS0A 3NUJA 1HWRA 4QJ2A 1BILA 5KAOA 5P4BA 1ZPAA 1Z8CA 5JFUA 3SA4A 3EM6A 2QZXA 5P3EA 4XXSA 5P6IA 4Y3SA 4ZLSA 5P4CA 5P7HA 2QD7A 3K4VA 5E5KA 3UDKA 4R93A 3S7MA 1YM4A 1FMXA 4EP3A 2B8VA 3EL1A 5P0VA 4RVXA 3PMYA 5OZYA 2OHPA 5ISKA 3D1XA 4I0JA 5P6PA 1T3RA 3TPJA 2AZBA 4AMTA 5P8PA 4EJLA 2WF3A 5DQ2A 3QP0A 1JLDA 1E82E 5F01A 5HDVA 5P5HA 5P76A 5P3QA 1T6GA 4Y3WA 1ZTZA 5P18A 5P4GA 5P8FA 3OWNA 3OQDA 4NJUA 3UFNA 2AVOA 4FRIA 1HPVA 3LNKA 2IENA 3PSGA 3UDMA 2BPWA 5P0BA 3UDRA 3CIDA 3QVIA 2O4KA 3GGVA 2FNSA 5P6AA 4Y5GA 5P2RA 4PEPA 5OZ7A 5P34A 3BC4A 3UF3A 1W5YA 5P27A 5HDUA 3OGQA 5P0AA 3MSJA 5P8SA 2AOEA 5KQYA 3OADA 3CKTA 1ZPKA 2HIZA 4EXHA 4Y5AA 2F80A 5P7CA 3UQXA 5P8VA 5P6UA 3SM1A 5P49A 3TTPA 3VSWA 4XX4A 4R91A 5P3OA 5P11A 3UFLA 4DQCA 5OZNA 5UPJA 3VV6A 1E5OE 4CPRA 4FE6A 3M9FA 1G35A 3UDNA 4WY1A 5P4OA 5P4XA 4Y37A 2PYNA 5P5KA 3KF0A 5P26A 5OZ4A 4Y5CA 5P60A 4I0GA 3SLZA 2FIVA 5P0ZA 3QBFA 1HVKA 3G70A 2PH8A 3I25A 1AM5A 2J9JA 5DPZA 4EJKA 5P35A 3WZ6A 4J0VA 3PCZA 4GJ6A 2Q63A 1IZHA 3HBOA 3D1YA 1IDBA 5P83A 2I4XA 2R5PA 4DJRA 3OAGB 4YBFA 1HIHA 5P4EA 5P3ZA 3TPRA 4J0YA 5P16A 5CLMA 4B1EA 4ZSQA 1KJ7A 1DAZC 4LP9A 4Y57A 5OZOA 1BAIA 4D85A 1XS7D 3S53A 4DI2A 3KT5A 4YCKA 5P68A 5AH8A 5P5OA 5P5CA 4Y4GA 3RTMA 1FF0C 4EHCA 3PMUA 4J1KA 5P19A 1PROA 2AOCA 4DH6A 1PSNA 5DGWA 1MRXA 2QMDA 3K5DA 2PK5A 5P04A 2WHHA 2G1OA 5P4ZA 1ZP8A 1W5VA 3L5BA 3RSVA 5P4PA 5P28A 5P1HA 3EKVA 4DJXA 5P3PA 3EKPA 5P50A 4J1EA 1K2BA 3PVKA 2I4DA 1HVJA 4TVHA 3NR6A 5DQ5A 4AA9A 2P8HA 3CIBA 2VS2A 1ME6A 3PHVA 2J9KA 4DV9A 4YA8A 5P82A 1HIIA 5P56A 5P6GA 4FRSA 2I4WA 3SA7A 3SA9A 1A8GA 5F00A 5P20A 2FGVA 3VF3A 1PPLE 5P5NA 5DR1A 1NSOA 2UXZA 2G69A 3S43B 3L59A 4J54A 3DV1A 1MTRA 4HDBA 3H0BA 4YD5A 3ZLQA 4QLHA 3O9EA 4FM8A 4Y4AA 1BXOA 4TRZA 5P1RA 1FFIC 3K1WA 4WTUA 5P2YA 3Q70A 1SDUA 4DJQA 1HHPA 4YDGA 2VJ7A 5P7DA 3EL0A 1MVPA 1HVIA 1MPPA 5P7JA 5AGZA 2PWRA 4L7GA 2QNNA 4FIVA 2RENA 4QJ9A 3O99A 3K5FA 2P3BB 2Q5KA 1DP5A 5OZZA 1HVHA 2V13A 4B00A 1NPAA 4J1IA 5OYSA 3SQFA 1EAGA 4E43A 1BXQA 5P53A 1HPXA 1EEDP 2RKFA 3APRE 4JPCA 2ZDZA 1D4HA 2QHCA 4QJ7A 5OZRA 2XFJA 5P84A 1K6VA 5OYZA 3GI0A 2VKMA 3VF5A 5P0LA 1HVSA 1WKRA 3EKWA 3VEUA 1FFFC 1CPIA 2Z54A 4Y4TA 1HIVA 3BRAA 5HCTA 2R5QA 2OHKA 1G6LA 2ZJLA 3O9GA 1T7KA 1HVRA 5P1QA 4APEA 2ZJKA 2OHQA 4QJ6A 4ZSRA 4MC6A 5P5IA 3OAGA 5DR4A 5C9FA 5P1OA 4HE9A 4NJSA 5P2BA 2QHZA 5P4QA 2NMYA 3PSUA 4GMIA 5OZUA 9HVPA 5P46A 1BIMA 1SMRA 1AZ5A 4DJUA 3TPLA 4LXAA 5ER2E 2FXDA 4I0DA 5P5RA 5P5PA 5P78A 5P0KA 1APTE 1B6KA 1U8GA 3BUHA 1J71A 1ZLFA 5P61A 5P7XA 2Q3KA 5P6SA 4H3GA 5OZMA 1PSOE 2AVQA 1HTFA 2PH6A 5P1NA 4I8WA 5P1YA 3PWRA 1IZDA 2VIEA 5JG1A 4NJVA 3UCBA 4X7IA 2AOFA 3OU3A 2R3TA 4Q5MA 1HTGA 1RV7A 4OBZB 2G1YA 4RGHA 2BKTA 5P1GA 4DQGA 2PMAA 5P2DA 1K1TA 5P4MA 5P7GA 3T3CA 4M8XA 3I2LA 4MC2A 3T7PA 3PI5A 5OZGA 5HDZA 5P1VA 4ZE6A 3IVHA 5P4SA 2OHLA 1QBUA 1TSUA 5HVPA 4J55A 5I70A 1GVUA 1BV7A 1PSAA 1DPJA 5P1DA 3ER3E 4LL3A 1TW7A 1LYAB 3S43A 5P4IA 5I3VA 2G20A 3R4BA 5P8MA 5P0OA 1B11A 3OXXA 2QP8A 1HSGA 5P2NA 1EPPE 3S56A 3D3TA 1SIPA 2G22A 1F34A 3ZKXA 2WKZA 2JJJA 4ACXA 3CICA 1QBTA 4A6BA 3VCMA 4Y4WA 5P1KA 3PCWA 5ENMA 4ZPEA 5P37A 3PM4A 4YD4A 1IDAA 5P33A 3BVAA 3TOGA 5P79A 4K9HA 1E80E 5P1BA 5P4WA 2SAMA 1SMEA 2FDPA 1T6EX 2QK5A 4Y3JA 3QBHA 4ER1E 1PFZA 4I1CA 1MERA 5KR1A 4Y3AA 3GGUA 1BV9A 4FL8A 3LITA 5IVQA 3OUDB 5P5TA 3EM3A 4RRNA 1ODXA 5APRE 2QZWA 2NXLA 5P6EA 3HAWA 3UDPA 3FNUA 3JVYA 5AHAA 4Y45A 2O40A 4MC9A 3I7EA 3Q3TA 4KE1A 5P00A 3QRMA 1Z1RA 4Y3MA 3FKTA 4BFDA 5P02A 4ZIPA 4PZXA 5BS4A 1BVEA 5P1WA 4ZPGA 5P4DA 1M4HA 4Y4JA 1C70A 3DCRA 5P3TA 5HTZA 4I12A 3WZ8A 4XX3A 4L1AB 1LS5A 3PLDA 3TKWA 3LIYA 3NWQA 1WBKA 1M0BA 1MRWA 3O9DA 5P5YA 5P5MA 5KR8A 1GVXA 2I0AA 4Y54A 5P5QA 5P5BA 1MT8A 4GJBA 4Z22A 1B6LA 1RL8A 2QI3A 3BXSA 2ZHSA 5P5FA 1EPNE 1QDMA 5P15A 5P1EA 1MSNA 3BXRA 3R0YA 1EC0A 3N4LA 3DK1A 3MWSA 1GNMA 4Z4XA 2G1NA 4F73A 3VF7A 1C6YA 2HM1A 1PPKE 5P2AA 1FQ5A 5OZKA 5OZEA 5P3MA 2OHMA 5IVTA 1META 2Q11A 4FSEA 2QMPA 5OZ3A 4DPFA 5P59A 2OHSA 3IXKA 3K4VC 5P8JA 3SO9A 4K4QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P23 A;  4ZSM A;  3URL A;  2WJO A;  5OZ8 A;  2PK6 A;  3OQ7 A;  1K6C A;  1LF4 A;  3KYR A;  2G94 A;  5P1C A;  2AZC A;  2B60 A;  2IRZ A;  5P0C A;  4GJ9 A;  4Y35 A;  3T7Q A;  1YG9 A;  5P5X A;  2ER0 E;  3OOT A;  2QNP A;  5P4V A;  4YBI A;  1K2C A;  3BUF A;  4I11 A;  2ER7 E;  3EL5 A;  3QRO A;  5P2M A;  4RVJ A;  2O4P A;  5P4Y A;  4F74 A;  3LPJ A;  2FXE A;  4Y3E A;  1ZJ7 A;  2BPY A;  3L3A A;  4L6B A;  2VJ9 A;  3PI0 A;  4Y3T A;  5OYU A;  5DQC A;  5SY2 A;  2QD8 A;  5P3L A;  5FIV A;  4R5N A;  3S85 A;  1YTI A;  1PPM E;  3RVI A;  1ER8 E;  4FRJ A;  3GI6 A;  4CPU A;  1BWB A;  3APP A;  4Y3X A;  4DJP A;  4U8W A;  5P89 A;  5P1A A;  5P5D A;  4APR E;  5OZ0 A;  1E81 E;  1ZSF A;  3IVI A;  5P1J A;  3NDX A;  2NMZ A;  5P6H A;  3L5F A;  1B5F A;  5P12 A;  4EXG A;  5P1X A;  5P2U A;  3VLB A;  3OU1 A;  5P3X A;  2I0D A;  1SP5 A;  5P7P A;  2HS2 A;  4YD6 A;  3PGI A;  3EKX A;  1D4S A;  2NXM A;  3PWM A;  5P4U A;  5OYQ A;  1D4L A;  3INH A;  5P71 A;  5P06 A;  3PRS A;  4Y4Z A;  3VV7 A;  5P4J A;  5AHB A;  3WB5 A;  5P6K A;  3LPK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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