3T7XA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
total genus 88
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7xA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7xA01
3EL0A 5OZOA 5JFUA 2WEDA 3PEPA 4LHHA 4FS4A 4L1AA 5OZ7A 1AIDA 3K5CA 4Y3MA 3WB5A 3OY4A 4Y39A 4DQGA 4K4PA 4Y3RA 1BDRA 3RSXA 3O9CA 3GI5A 4F75A 5P5FA 3CKPA 3PGIA 4Y3LA 3O9DA 5P11A 1ME6A 4KE0A 1HWRA 3OOZA 3TKGA 5P6KA 5P8KA 2VA6A 1M0BA 3KMXA 2Q3KA 2FIVA 5P5CA 5KQFA 5P0HA 5P61A 1TCXA 3Q70A 4ER2E 1HRNA 1BBSA 1MSNA 4YDFA 4JOOA 3HVPA 5IS4A 5TOLA 3K5FA 2V16C 1EC2A 5P2LA 5P65A 1BDLA 1MTBA 2RKFA 2CEJA 5P74A 3R0WA 5BS4A 2PWRA 1FEJC 2I4WA 4QLHA 2Q64A 1EEDP 3CKTA 4Y3YA 3S2OA 5P6RA 3S8IA 5P1LA 4DJXA 1T3RA 3ER5E 3CMSA 3PI5A 5P0TA 1HTEA 1YTJA 4R93A 5ENMA 5P0DA 5P5XA 5KOQA 5P44A 5HCTA 4CPTA 4OBHA 2G1NA 3TTPA 2MIPA 4EJ8A 3TH9A 1VIKA 2B7ZA 5AHCA 3SLZA 1C6YA 4DJUA 1D4HA 4DFGA 1DPJA 5P71A 6APRE 1SMRA 2QU2A 1QBRA 5P0OA 1AZ5A 4S1GA 5P22A 4GJ6A 1TSUA 2O40A 4N00A 3H0BA 5OZHA 5P30A 3SAAA 1EC0A 3S45A 3IN3A 5P10A 1HSGA 5P8DA 5C9FA 3LIZA 3ZKMA 4BFBA 3UPJA 1PPKE 4LC7A 5P55A 3SA5A 2FDEA 5SZ9A 1A8KA 1EPPE 4Y6MA 5EZXA 2AZ8A 4DJWA 5P0XA 1E5OE 5P5WA 2P3AA 3WB4A 4DUSA 2BBBA 4RVXA 5P0CA 5P80A 2UXZA 3MSJA 4Z50A 5JG1A 4ZSQA 2HB4A 2F3KA 4PYVA 4I0HA 5P16A 4Y44A 5P39A 1E80E 2AZCA 4APRE 2FGVA 5P7JA 2V00A 4GJ5A 4FCOA 4ZSRA 4Y48A 5KR1A 3OAGA 5P83A 4FSEA 3RTHA 2XFJA 3OADB 1K6VA 1QS8A 4Y5GA 2HS2A 2OF0A 3EKVA 1IZDA 2QNQA 2AOGA 3NU4A 1KJHA 4I8WA 2Q11A 5JFPA 4FRKA 5P78A 5P2IA 1DMPA 1BVEA 3GGVA 2HB2A 5P7QA 5P40A 3GI0A 3VV8A 5P60A 5OZ3A 1FQ4A 5P53A 5P6AA 1PROA 5OYUA 4GZFA 2AOFA 1EBWA 5HE4A 5P69A 5P8UA 4K4RA 5FIVA 4Y58A 2RMPA 4NPUA 1CPIA 5P6DA 3ECGA 4RZ1A 1D4JA 5OZXA 5CONA 4L7GA 5HD0A 2FNTA 3HZCA 1XE6A 4GYEA 5P7UA 2VIZA 3LINA 2R43A 2QU3A 2P3CA 3EM3A 2P3BA 5J25A 5P25A 5P1XA 1HPVA 4GJCA 1YG9A 3EL5A 2SAMA 3L5FA 1ZPKA 5DQ4A 4TVHA 4Y3AA 3T7PA 4U8WA 4MC9A 4J1HA 5AH9A 5OYRA 3EMYA 4Y50A 2Q63A 2VKMA 5P4FA 3S43A 5DR0A 5P3FA 1APUE 4Y4TA 5P1RA 1B6MA 1HIVA 1PSOE 3VSXA 4J1KA 5P7LA 4CKUA 1IVQA 2AIDA 5OZDA 3PSYA 5E5KA 1GVXA 5COOA 5HDZA 3INEA 5HU0A 5P09A 3VYDA 2EWYA 1LYBB 3OUBA 1K1UA 3FIVA 4R8YA 3O9FA 5P0NA 4Y5PA 5E5JA 4R91A 5P3KA 4HEGA 5KR8A 4Q1WA 1HEFE 5P20A 5P2UA 5P6IA 2P83A 1QBUA 9HVPA 3Q3TA 3OQ7A 5P57A 2B60A 3FNTA 5AHAA 2B42A 5P62A 2PH8A 2IKUA 3OU1B 3OUCA 3R2FA 1GKTA 2FLEA 5P7IA 5SY2A 1WBKA 2BB9A 2G1OA 3BUGA 1BXOA 5P1VA 4R92A 2O4PA 3S53A 1W5YA 1HPSA 3QVCA 3RTNA 1NPWA 4Y3JA 2AVMA 5P8AA 4U7QA 3SPKA 4J0VA 5P5QA 4OC6A 2NR6A 5DGUA 3PSUA 5KOSA 5ENKA 1EAGA 1OHRA 2WJOA 2QMPA 1YT9A 2FS4A 5IVTA 2ZJKA 1SBGA 2G94A 4I0GA 2P8HA 4A6CA 1KZKA 5P4VA 1G35A 3KFRA 2AQUA 3SQFA 1QDMA 3OXWA 4D83A 2QD6A 3NDTA 5P1FA 5P6OA 1SH9A 2WF3A 4NJVA 2O4SA 2ZE1A 3OK9A 5P33A 2G20A 2HPEA 5P7TA 5P3NA 2RSPA 1A30A 4PZXA 3K5DA 4YDGA 3T7QA 5P1WA 3OUDA 2OAHA 4Y5MA 4OD9B 1ODYA 5P7XA 1HEGE 2FGUA 3L38A 1HXWA 5P1MA 2IEOA 3UDJA 4Y36A 5P2RA 5P4CA 3PSGA 5AH6A 5EZZA 3EL1A 3L5EA 4Y47A 5OZCA 3HDKA 3PBDA 3UQWA 4I0FA 4QJ2A 1HSHA 4XX4A 4ER1E 2HIZA 2ZJJA 5P1KA 1E82E 4DH6A 1B5FA 4NKKA 5P1JA 2WF4A 5OZGA 1FG6C 2VNMA 5C9BA 4FL8A 5KQXA 1W51A 1SIPA 2G21A 1YX9A 4Y9WA 4WY6A 3LZYA 4EXGA 2QI3A 4QJ6A 3O9IA 5KAOA 4LP9A 2V11C 4H3IA 4ZPFA 1W6IA 2O4NA 3D1XA 4RGHA 5P4BA 2IL2A 2HPFA 2G27A 2J9JB 3QBHA 5IVQA 2FDPA 1OD1A 4ZEAA 1HBVA 3R1GB 2VJ6A 5P4WA 3KDCA 4MC2A 5P3RA 5P4OA 4AZYA 3QBFA 4K4QA 4R5NA 5P3EA 2G22A 4Y43A 4GJBA 5DQ1A 5P27A 1B6KA 1W5VA 5P5OA 3T6IA 4YD6A 1D4LA 2ZHSA 3IN4A 1T7JA 4PHVA 2FNSA 4HLAA 4ZPEA 2G24A 3OU3A 3JW2A 3SKGA 5P76A 5P1ZA 5P6EA 3N3IA 3PLDA 5DGWA 2R3WA 3UHLA 1KJGA 4DI2A 1SMEA 3TPPA 4Q1YA 4IVSA 1PFZA 1FQ8A 5COPA 5OZJA 2ZJHA 1ZSFA 3LIXA 1Z1HA 2WKZA 4YE3A 2HAHA 1IZHA 3QROA 4ZPGA 2PSUA 4Y3SA 5P3SA 4EHCA 4I12A 2APRA 1T7IA 5P8IA 4GJ8A 4GJ9A 4APEA 2WEBA 1HOSA 2ER0E 1SDVA 2V0ZC 2XFKA 5AHBA 1UH8A 3PB5A 4GB2A 4RCFA 2QI0A 4Y5LA 2Q5KA 5SXNA 2WHHA 1HPOA 4A4QA 2Q15A 5HCOA 3EKQA 5P3HA 5JODA 5P7AA 5P7WA 2ZHRA 4RCEA 3BGBA 2WECA 3SM1A 1ZBGA 5P2EA 3JVWA 3QVIA 3QN8A 2QZXA 5OZVA 3NDUA 5ISJA 5DQCA 1YM4A 3I25A 4AMTA 1W5WA 1K2CA 4PZWA 3SA6A 2QHCA 4DJYA 5P6VA 4MC1A 3L3AA 2QHYA 3EM6A 4FAFA 4FIVA 5DR3A 2ZJMA 2VIYA 4I1CA 5I3VA 1A8GA 2V12C 4J55A 5BWYA 1TW7A 3OXXA 2I1AA 4DQHA 1MTRA 3Q4BA 3LZSA 4Y3PA 5P7PA 5KR0A 5P54A 2OHMA 3PWWA 5P5BA 5P5TA 5P38A 3RTMA 4Q1NA 1FG8C 1HTGA 4QGIA 3HLOA 4PEPA 2VNNA 5P5EA 3OGPA 5I3YA 3PI0A 3KFPA 5P5PA 4YBFA 5P35A 5P8OA 1G2KA 2NXMA 5UPJA 1ZPAA 3UDKA 1GVVA 5P5HA 4EXHA 3G70A 5BRYA 1FGCC 3HAUA 5P8EA 3HD8A 3OADA 1BDQA 5DPZA 2ER9E 4QJ9A 1MERA 2ZHUA 1FMBA 5C9DA 1NPVA 5P3WA 1RNEA 5P5VA 2NNKA 5ER2E 3EBZA 1IVPA 1ZP8A 2R8NA 5P2JA 2ZYEA 5P0YA 5P4MA 5OZAA 3S56A 3IVHA 1RL8A 2AZ9A 4DQEA 3NXNA 3SFCA 5P45A 1TCWA 4YCKA 1HVKA 5P0GA 3NWXA 1RQ9A 3WZ7A 5OZZA 2ZJNA 5P3DA 5I3XA 2QI7A 4QJ7A 5P3MA 4CPRA 4OBKA 4J1EA 3CKRA 5OZ8A 3JVYA 3GGAA 4Y54A 3FSMA 3ZPTA 4I0DA 5OYQA 5OZIA 1DIFA 2AOJA 5P17A 4GJ7A 4LL3A 3GGXA 3AIDA 4RVJA 1HSIA 3KA2A 2OHUA 3O9LB 3UDMA 2NXLA 2BPWA 2VA7A 4FGXA 5P88A 4YA8A 5P59A 5P8GA 5P7FA 5P4GA 2PH6A 5P7KA 3FX5A 5P0JA 2QK5A 1G6LA 4WTUA 4QJAA 3KMYA 5P8QA 3DK1A 5P50A 5P0QA 3I8WA 3KM4A 3NYGA 3VEUA 4B00A 4YD7A 2NTRA 3EKWA 3OXCA 1PSNA 2OHSA 1M4HA 1GNNA 2XYFA 5KQZA 4CPXA 3UQPA 4EP3A 4H3GA 5P8TA 1J71A 3VF3A 3LPKA 4IVTA 1FMXA 5OZQA 3IXOA 2IQGA 5P0MA 3ZKXA 3O9HA 5OZFA 2QCIA 5SY3A 5DQ5A 1LYBA 5P24A 4HZTA 3QRSA 5P64A 3LZUA 2AVSA 5P6JA 1LYWA 3INDA 5P4DA 1TQFA 5P8NA 4HVPA 5P8BA 1B6JA 2I4DA 3KDBA 3DV1A 3LHGA 1QRPE 3L5DA 5P6PA 1LF4A 5I70A 3OU4B 4Y5NA 2NXDA 5OZKA 5DR4A 1GNMA 1APTE 1T6GA 3SO9A 1META 3F9QA 5P36A 4Y56A 1MIQA 3OU1A 4J0TA 1HTRB 2WEAA 3U6AA 2CEMA 1EC1A 5P85A 4B0QA 5HDUA 1FQXA 5P2NA 3U71A 3NSHA 6FIVA 4J0PA 4NJUA 5OZLA 3NU5A 3QIHA 4X2LA 3O9BA 5P7CA 1PPLE 4D85A 4ZLSA 3CYWA 3BHEA 1LYAB 1T7KA 5P47A 2AOIA 5P6UA 4DJQA 1EPQE 5P6LA 3TPRA 3NWQA 1C6ZA 5P6YA 3KN0A 4L7JA 3EKYA 4HA5A 5P6NA 2VA5A 4J0ZA 5P3LA 1FFIC 5P0KA 5P4QA 2VIEA 5CLMA 5P13A 3UDPA 3OQAA 5P1IA 3LITA 1FFFC 2G1YA 2AVOA 2OHKA 1FMUA 3OAGB 4Y41A 1WKRA 4I8ZA 5P2HA 4Y45A 5P1PA 3ER3E 4TRYA 2I4UA 3VUCA 4I0JA 3PRSA 2QHZA 4Y3XA 5P70A 3L59A 3OTSA 1LF3A 2F3FA 1G0VA 3URLA 2UY0A 5P0SA 3ZPUA 3TOFA 5P37A 2F81A 3RU1A 3DUYA 1F7AA 5P1UA 2AOEA 1AJXA 2WL0A 2RKGA 2R5QA 2IDWA 3KYRA 3TOGA 5P15A 5PEPA 4B70A 1BXQA 2J9KA 2ER7E 3HVGA 5P0IA 5HVPA 4KB9A 5P4XA 5P3VA 2JXRA 5P0WA 2BPZA 4UPJA 4Y5AA 3N4LA 4OBGA 3VCMA 4KE1A 4B78A 5HTZA 2I0DA 3O9GA 2ANLA 1TSQA 5P7VA 5P43A 2HB3A 5ISKA 2R3TA 3FV3A 5P2BA 4Y3QA 1BIMA 5P5ZA 5P4TA 2AODA 2ZDZA 4QJ8A 4EQ0A 3TPJA 5P6BA 5P4RA 3NDWA 3EC0A 1SDTA 4J1CA 2J9JA 5P05A 5P3CA 1BV9A 4Y4EA 4AUCA 1D4KA 3ZKNA 4Q5MA 4XX3A 5OZBA 5P1OA 5P7RA 2O4LA 4BFDA 2VS2A 1HVRA 2JJJA 2JJIA 3S43B 3CIDA 1DP5A 1BAIA 4Y4UA 1B6LA 3NDXA 5F00A 5P8VA 2OHRA 5P3ZA 1K6PA 1LZQA 5P1SA 3GGUA 2G26A 4Y3WA 3QI1A 2NMZA 3T7XA 1EBYA 4ER4E 5OYTA 4YOBA 5P0VA 4Y4GA 5P0RA 3I7EA 5P4NA 3PBZA 5DR7A 7UPJA 2G69A 3L58A 3RSVA 3EKTA 4LXMA 3CIBA 5OZRA 1Z1RA 1IBQA 4X7IA 4AA8A 5P02A 1KJFA 4B1EA 5AGZA 4DQCA 1Q9PA 4F76A 3SABA 1MT8A 5P0PA 3OHHA 3L5CA 4I0IA 4EJDA 3Q6YA 4R95A 5P23A 3VYEA 1ODXA 1B6PA 4Y37A 4RYCA 4EWOA 1FLHA 2FMBA 5P8LA 4Y4ZA 5P0FA 2Z54A 4J54A 3K1WA 1HTFA 4CP7A 5I3WA 3BC4A 5OZ1A 4NJSA 5P1DA 1RV7A 5P2VA 5KQYA 4Z22A 5OZ2A 3UQRA 1GVUA 3PLLA 2QMFA 5P29A 5P4EA 1FQ6A 4J1IA 3D3TA 4TRZA 5P4HA 5P5MA 4ZE6A 2P4JA 1AJVA 1BVGA 4Y3EA 1PSAA 4YD5A 5P4PA 2A1EA 1E81E 5P5KA 3LPJA 1AXAA 3QP0A 3NR6A 3ZMGA 3OTYA 1T6EX 3BGCA 3LIQA 4HDPA 5P1HA 3TNEA 3K5GA 2FXEA 3T3CA 5P6MA 3SA4A 3VLBA 1MPPA 2QI6A 2IKOA 2BQVA 4YCTA 2XFIA 4Y4JA 2BKTA 4FSLA 3VF7A 4JP9A 2AVQA 1A9MA 3QS1A 5P8PA 2VIJA 3DOXA 3ZL7A 2AVVA 6UPJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EL0 A;  5OZO A;  5JFU A;  2WED A;  3PEP A;  4LHH A;  4FS4 A;  4L1A A;  5OZ7 A;  1AID A;  3K5C A;  4Y3M A;  3WB5 A;  3OY4 A;  4Y39 A;  4DQG A;  4K4P A;  4Y3R A;  1BDR A;  3RSX A;  3O9C A;  3GI5 A;  4F75 A;  5P5F A;  3CKP A;  3PGI A;  4Y3L A;  3O9D A;  5P11 A;  1ME6 A;  4KE0 A;  1HWR A;  3OOZ A;  3TKG A;  5P6K A;  5P8K A;  2VA6 A;  1M0B A;  3KMX A;  2Q3K A;  2FIV A;  5P5C A;  5KQF A;  5P0H A;  5P61 A;  1TCX A;  3Q70 A;  4ER2 E;  1HRN A;  1BBS A;  1MSN A;  4YDF A;  4JOO A;  3HVP A;  5IS4 A;  5TOL A;  3K5F A;  2V16 C;  1EC2 A;  5P2L A;  5P65 A;  1BDL A;  1MTB A;  2RKF A;  2CEJ A;  5P74 A;  3R0W A;  5BS4 A;  2PWR A;  1FEJ C;  2I4W A;  4QLH A;  2Q64 A;  1EED P;  3CKT A;  4Y3Y A;  3S2O A;  5P6R A;  3S8I A;  5P1L A;  4DJX A;  1T3R A;  3ER5 E;  3CMS A;  3PI5 A;  5P0T A;  1HTE A;  1YTJ A;  4R93 A;  5ENM A;  5P0D A;  5P5X A;  5KOQ A;  5P44 A;  5HCT A;  4CPT A;  4OBH A;  2G1N A;  3TTP A;  2MIP A;  4EJ8 A;  3TH9 A;  1VIK A;  2B7Z A;  5AHC A;  3SLZ A;  1C6Y A;  4DJU A;  1D4H A;  4DFG A;  1DPJ A;  5P71 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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