3T93B

Glutamate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B02
4N13A 1A8FA 3A3UA 3IJXB 3WAEA 4OFOA 4DCYA 2PT1A 1MXXA 2Q88A 1AOVA 2HAUA 3G3FA 2XX8A 1L5TA 4R9GA 2V3UA 1N7XA 5FHOA 1AL3A 4FECA 3N5LA 2OZZA 4XTCQ 4GQOA 3E4RA 1VFDA 1EZOA 5B7DA 3EHTA 1IXIA 1MXYA 1B7ZA 3IOUA 2XXTA 4OFLA 1B52A 2D3IA 1YCJA 4LQ5A 3LSFB 4YAHX 3V8XB 4BLAA 3L6HA 1FQDA 3K1MA 4XKPA 4N6PA 3DP8A 5TU0A 3THIA 3PGFA 3G7WA 1FQEA 3U8QA 4LZ7A 1MXZA 3O29A 4PQJA 4XKRA 3QUFA 3I6VA 4H6DA 1ZKBA 3T22A 4P0IA 4NF8A 2HQ0A 3SKPA 3H4ZA 5CMCA 1EZ9A 2ZYMA 3IL1B 3KSJA 4KHZE 1B5HA 2GFEA 2Y7RA 1IITA 1DPPA 4R9FA 2D5WA 2B3FA 4XIGQ 3OXNA 1SBPA 3K1PA 1PB8A 3LC8A 3R7XA 3VXBA 3FXRA 3TAJA 3B7DA 4GIZA 1B7HA 3M3FA 3M3LA 3OO8A 1EZPA 3T66A 3UIFA 1B3HA 2FA7A 1P99A 2UVGA 3N26A 4KI0E 2ZYNA 3N94A 3TPAA 3H6TA 4ZECA 3H6VA 4EXLA 4YU0A 3G3GA 3T9XB 3E13X 4TQUQ 3R6UA 1FW0A 4P0GA 2A5TB 3MP8A 1NNKA 3C34A 3MPLA 5BWJA 1FQFA 1Y3PA 2DQVA 3TODA 3U1OA 3TTKA 2I4CA 1Y3QA 3IK6B 3BBRA 2ANJA 3QK6A 3EHSA 1MH4A 4AB5A 5H8NA 1URSA 2ZNTA 5TP9B 1XOCA 4OESA 3SESA 4NF4A 4QFOA 5CRYA 5TPAA 3TFLA 2X7QA 1MG1A 4RJZA 1UIUA 3S9MC 1FTLA 1Q1KA 4PE5B 1B58A 2ONKE 3UN6A 4I62A 3ECRA 1XVXA 3SEVA 4X48A 4G4PA 3RTWB 3EPEA 1VE4A 1B6HA 1B1XA 1I6AA 3LUYA 2AL4A 4PFTA 4F39A 1LAFE 4ISUA 4DLDA 2PYYA 4IO2A 3AXFA 4F3SA 1USYE 2A5SA 1LCFA 4ZEBA 1ZTYA 1CE2A 4H5FA 4G8HA 1TXFA 2QMXA 5KCJB 2P2AA 2DWAA 3RLFE 1S7YA 2F6GA 1B7UA 1UTBB 4KQPA 3FV1A 2Y7KA 3G3KA 4N07A 4F3BA 2B65A 5JTYA 2I49A 1NFTA 2Z8FA 3OO9A 3GZGA 5H8HA 4GVOA 4LVQA 5CI5A 4FJPA 1M5DA 2IA4A 1IZ1A 1JEVA 2I0CA 5CMKA 5I59A 1MPDA 2RKMA 2RCBA 3CG1A 3JZJA 1MQGA 3SEUA 2PVUA 3LSXA 2DSFA 2GRVA 4NWDA 4R2FA 3QIMA 2W7YA 1QJMA 2DWJA 3N6UA 4E0WA 4EF2A 3RGYA 4POWA 2BJJX 3KGCA 2I4BA 3HPIA 1Z7NE 3S9LC 2I48A 4NF6A 3QUJA 1II5A 2DP8A 4OMBA 1B0HA 1MY0A 5CMMA 5FHNA 4R2BA 3T9UA 2O7IA 3QAXA 2V93A 4YB6A 4OETA 4NWCA 3VVDA 3MP6A 5AA1A 3HV1A 1MXUA 4DCXA 4KYSA 4JDFA 3OD7A 1VR5A 3PUVE 4RXLA 1R1NA 4FORA 4F2OA 4I1DA 1NH7A 1Y1ZA 3LSLA 3KJTA 3WAFA 3A3CA 4YKIA 4LQ2A 2Z23A 2P0SA 4FEDA 1R9LA 3W9VA 3CVGA 4XKNA 1XC1A 1LB9A 1LSTA 4ZZAA 1A99A 4RK2A 4FAJA 2Y7PA 4OFJA 1B51A 4EQ7A 4Q30B 4WEDA 4QSCA 4TOZA 2HAVA 3PU5A 4JWYA 2F7CA 3P7IA 1BIYA 1Q35A 4Q5TA 5L9OA 1A40A 1B46A 1GGGA 3H06B 3RN8A 2X7PA 3PPOA 3IJOB 4PFYA 1H44A 3TEPA 3PPQA 4BDMA 4GLIA 3M3KA 2O1MA 4MLVA 4EXKA 3IOVA 2LAOA 3S2VA 1FTOA 3D4GA 3HHGA 3F11A 4NEDA 3KOSA 3BFTA 4I9DA 3PMXA 4F18A 1ATGA 1BLFA 4Z0IA 2IEEA 2XXXA 5K2XA 1M5EA 4G68B 3IOTA 2OWSA 4BDRA 1MXVA 1Y3NA 4EQBA 5FHMA 2VHAA 1ZIUA 4F29A 2O68A 4GF8A 1SW4A 2Q89A 4ZE8A 3VLWA 4OHNA 2ZNUA 1NMUA 4QF9A 3EHUA 2XXYA 1LB8A 3DLNA 4EF1A 4OXVA 3KFMA 1LFHA 3HO7A 3DP6A 3UGWA 4IO6A 3K6VA 1P1QA 1P1WA 3BFUA 3IOWA 4H5GA 1ZLQA 4O3CA 1QULA 4RYAA 3R26A 2F6PA 4GD5A 1FTKA 1JQFA 1OLAA 4BDQA 4G2ZA 2F8DA 2R71A 1NNFA 2F7AA 2VD3A 1MPCA 2F35A 1B4HA 1CB6A 5ICQA 4BDNA 2QMWA 5I57A 1MY2A 4BDOA 1OLCA 1NH8A 4X9TA 3VLVA 2NVUB 5AA4B 5JK4A 5DTBA 2HFBA 2UVIA 2ZYOA 3MJNA 4U22A 4DZ1A 4DXBA 2DYXA 4MFIA 1AH5A 5A5XB 1D3KA 2G93A 3VLUA 4IGRA 1MY1A 5EYFA 1LCTA 3VDFA 2Y7WA 3FJGA 4JXIA 3BKIB 5AA3A 1O7TA 1MY4A 4OWDA 5DEXB 4F3PA 3C4MA 1MQDA 4KFQA 3O6HA 4ONYA 3RT6B 3C33A 1QKBA 1B9JA 4G8NA 4QRZA 3SETA 4F22A 1SYIA 4GRKA 1ZJLA 1F9BA 2OCUA 4NTLA 4RK9A 1WDNA 2PX1A 3MZ1A 2DOJA 1R6ZA 2NXOA 1B5JA 3OSRA 2DXRA 1OVTA 2OWTA 2UVJA 3FXUA 3ONMA 1KWHA 4M4GA 3OMBA 4ESXA 1D9VA 4XXUA 1MY3A 3VVEA 4YICA 5DVJA 1FQBA 5H8FB 2QS3A 2Q2AA 1FCKA 2G29A 1SW2A 5I2KA 2O84X 3RT8A 2OK2A 5BUUA 5AA2A 2DXYA 1POTA 4WXJA 1B40A 3T9HB 3QXMA 1MDP1 3S9EA 3OO6A 2XXUA 4WKMA 4U4SA 4HTGA 1H43A 4U1OA 3ZKLA 2Z22A 5DVFA 1QVSA 2RC8A 3EF7A 1DSNA 4JB7A 4NF5B 4GXSB 3CG3A 3TTRA 3S9NC 4FIMA 1SQYA 4ZEIA 4NMYA 2F97A 2REGA 4GFRA 3K02A 3K6WA 3PD9A 3T9VA 1HSJA 1A7LA 4F1VA 1A55A 5HPQA 2PT2A 3GLBA 5DVIA 5HBCA 1WODA 1LAGE 3FJ7A 2QS4A 2V3TA 3L6GA 3RY3A 3RNNA 2H98A 1GVCA 2ONSA 3MVZA 3CIJA 3OSQA 3Q29A 4OTEA 3KJ7A 2YPNA 2O7UA 3VXCA 2WKYA 4U4XA 3TCGA 4R6YA 3KEIA 3PUXE 1N3XA 4H8JA 3Q27A 3DP4A 4ZZEA 1URDA 5J1DA 4ELPA 3RUMA 1N0TA 4TLMB 5LOMA 2VGQA 1JW1A 5IKBA 3HHFA 1US5A 4UACA 1OVBA 5KDTB 1IQ7A 1A54A 3FGSA 3TKDA 1WVJA 2HZKA 5I2NB 5L8DA 3K01A 3O6GA 3V89B 3VV5A 3CFZA 4YZZA 3FIRA 2Q9TA 1GV8A 4KCCA 2DWHA 1UIVA 4Q0CA 4O3AA 5F7VA 3I3VA 3QSLA 1O63A 5H8QB 2A5TA 3MVXA 4FEBA 4QFLA 3JYRA 2RC7A 4F3GA 3SERA 4QFKA 3Q28A 3K6XA 1DTZA 1B0LA 4ELQA 1XS5A 3H03A 4DDDA 2GHBA 2I58A 2DVCA 5TP9A 4RA1A 3MP1A 2DE4A 4L17A 2XHDA 1GR2A 1LAHE 2H99A 4IO5A 4GOTA 2DVZA 4YMBA 2QRYA 4MF3A 1LAXA 4LA9A 3N6TA 3RPWA 1B3EA 4R74A 3GBBA 4JWXA 2VOZA 1ZU0A 1H45A 3OELA 3OEMA 4MBPA 3EQ1A 1IIWA 4C1UA 4IO4A 3I5OA 3SEXA 1NNTA 3MC2A 1XVYA 1PB7A 3B6WA 1TT1A 2GH9A 3ODBA 4ZEKA 1I6BA 2X26A 4QFPA 1B1HA 1UTHB 4H1XA 2F34A 3IAZA 3HSTA 2R9JA 1UTBA 2YLNA 5ELVA 5ISUA 1ZMGA 4HS7A 2I3VA 1VSOA 3C31A 4RPNA 3FXQA 2M8CA 2ALUA 3ZS6A 1BKAA 2QSXA 2HEUA 4LONB 3FATA 1LLSA 3MBPA 4X1DA 1LGBC 4YB7A 4Z7EA 1Y4CA 4TLLB 1P1UA 4RPOA 4GWOA 4JSOA 4H0WA 1HSLA 3KSXA 1B3GA 4C0RA 2O6AA 2YJPA 2FYIA 4LUBA 2DWIA 5I58A 4OEVA 2KLFA 3KG2A 1QUIA 3ZSFA 5I57B 3G3JA 2AYSA 3H7MA 4C1TA 4R73A 3JV9A 5M2VA 1SDXA 4FE8A 1MRPA 1IXHA 4PFWA 3TQLA 4IGTA 3O66A 3Q25A 4IY5A 3OO7A 2XD3A 1Y4TA 4ZEDA 3KBRA 2FNCA 4YKKA 3T93B 2XXHA 4Q8RA 1UQWA 1JW4A 4R6KA 3KZGA 4QFNA 4HCYA 4YMAA 4QSEA 4G77A 3V83A 4GL8A 1AMFA 1B2HA 3RQTA 3ZKKA 3U92A 1I6QA 2Q8JA 4ELRA 1SVXB 2F78A 2RC9A 4OVJA 4M1VA 3O2AA 1N76A 1M5FA 5EHMA 2H4IA 4PFUA 1MPBA 1DTGA 1JVXA 3K2DA 5ITPA 2ZMBA 4YKJA 4NF8B 3ILTB 3TTNA 1OQGA 2H25A 2VP1A 5I56A 1D9YA 4PP0A 2QS1A 2ABHA 2Q2CA 1ANFA 3KN7A 4QSDA 4KR5A 1MQJA 4I8CA 5ITOA 4GL0A 1T0KA 3SEYA 2NWJA 1DPEA 3PUYE 4ZDMA 4U23A 1OIBA 1AIVA 1SW1A 3IB0A 3C36A 3RTFB 4KYDA 2UYEA 1YTVA 1QKAA 3DELB 1JW5A 2OLBA 2V25A 3K4UA 5IAIA 4IO3A 1QUKA 3FV2A 4KPTA 4DXCA 5K2YA 2XXWA 3CSBA 3FVKA 3TQWA 1O64A 3C9HA 1DOTA 2DE2A 1EH3A 3KOTA 3EN3A 1A8EA 4G68A 2OJTA 4KCDA 4U1ZA 1B05A 2NOOA 1FTJA 3IX1A 5FTHA 3MZ9A 4BDLA 4DXUA 2E0SA 4O3BA 5H8NB 1RYOA 4JWOA 3O97A 3MUQA 2I3WA 3MZBA 3CFLA 1M5BA 2F7BA 3O9PA 4MLQA 1B3LA 4NF4B 5TPAB 3ILUB 2Y84A 1NL5A 1MS7A 5I84A 1GTKA 3Q26A 2XXIA 4KD5A 4G8MA 1MXWA 1XT8A 5CBSA 5AE4A 3FVNA 1FTMA 1PC3A 2XXVA 4LATA 3FVOA 3VVFA 3VE1B 3K1NA 3PD8A 1N84A 5HM4B 4OYVA 4HCWA 3W9WA 1YPNA 2F5XA 3A09A 4ZEFA 3TDJA 2QJEA 3TTLA 1RKMA 3H6WA 4OEUA 2DE3A 2F36A 5JEIA 3GBAA 4OENA 3GXAA 4LP2B 1MDQA 4DE8A 3UP9A 2PBWA 5AA4A 3TYHA 2UVHA 1LFGA 5JTYB 5DYHA 4R75A 4ZE9A 3V5AA 2CZLA 5H8HB 5A5XA 4GXAA 4EDPA 1MM6A 3CSGA 2UYFA 2XXRA 3HN0A 4H67A 3TELA 3TUSA 5I59B 3CFXA 2B3BA 5AA2D 4H65A 5B70A 2I0BA 2QL3A 5DEXA 4F1UA 2XX9A 2ZYKA 3PMWA 1SD3A 2RINA 4XKQA 1N7WA 3E9XA 4NF6B 3USDA 4YB5A 2HCAA 4JSDA 4F31B 1YAEA 1URGA 2NUVA 5CMBA 1JETA 1S50A 2CMOA 3IO6A 3U93A 4E0XA 1Y20A 4U2RA 2Y7IA 1R9QA 3TZAA 3G3IA 4IY6A 2Z8DA 5H8FA 2I6EA 4HW8A 2R6GE 3OEKA 2QPQA 4EUOA 1TFDA 2AL5A 1JVYA 3CI8A 3PMVA 1IUDA 4ELOA 4RNSA 3U94A 3CRBA 3H3GA 3QYTA 4FATA 3TMGA 3UORA 1MH3A 1PEBA 3LSWA 1NKXA 3MW0A 4K3FA 3FZVA 3OENA 1LBBA 3U72A 3K0VA 1TWYA 3FASA 3UK4A 2E1SA 4NF5A 1B3FA 4IO7A 1I69A 3MAMA 4NE4A 3CR9A 1ZBMA 1SI0A 3OOAA 3SEWA 4U21A 1MQIA 5L9MA 3H6UA 3UA8A 3PPPA 3PV0E 2O1LA 2XD2A 3T96B 3VFJA 3MPKA 1P1OA 1LFIA 1POY1 5I58B 4F19A 3G3HA 1FQAA 3KN3A 3C32A 4X1BA 3LBSA 1SW5A 4QHQA 3M8UA 4ZS9A 1D4NA 3PPNA 1B4ZA 2ZNSA 2O51A 2THIA 3FJMA 3D4CA 4F2QA 4G68C 1IXCA 2XXQA 4PETA 5CBRA 4H8IA 3O28A 2ONRA 1OQHA 3IB2A 3C35A 4LZ8A 1Z7ME 1MM7A 1LBCA 4R6HA 2H9BA 5KCJA 4THIA 1PB9A 3MVYA 5KDTA 4JBZA 1PDAA 4AQ4A 2D21A 1H76A 1VFEA 1JNFA 5I2NA 4OQOA 2QS2A 4WEPA 1HSEA 1N3WA 1JEUA 5DT6A 1US4A 1SYHA 1ELJA 3B6QA 1BP5A 3IO4A 3SDFA 2O69A 1SI1A 3TCFA 2UXAA 4F1YA 1H3DA 4ECFA 5ICTA 5I56B 3KN8A 2ESNA 4OZ9A 3FUZA 1MQHA 5H8QA 1P1NA 4MH5A 1N04A 5EHSA 3PUZE 3PUWE 4AB6A 2XXPA 5KZTA 1DMBA 5H8SA 3PPRA 2RF1A 3K6UA 3FD3A 1TFAA 4RY1A 2REJA 4OERA 1FQCA 4DIGA 2DS9A 1EU8A 3FVGA 3MVWA 4KYEA 3MWBA 2V84A 3W15C 2V3QA 1USYH 3IB1A 4YKPA 2OBGA 3MQ9A 1PBQA 5CM6A 1XHYA 3K00A 5FTIA 5F1QA 2P1SA 3HCQA 3B6TA 5CC2A 2ZXTA 3LR1A 4IB2A 4POXA 4ND9A 3TCHA 2Z8EA 5L9SA 3S4UA 3IR1A 2XX7A 4R72A 2RCAA 1PBPA 2HZLA 1BTJA 2GHAA 2VD2A 1UTHA 4UA8A 1B5IA 4ESWA 1IEJA 4P11A 1J1NA 3DM0A 1IXGA 1QW0A 2HXWA 4EQ9A 1M5CA 1S9TA 4LZ5A 2PMSA 2AIXA 1Y1MA 3E3KA 1QUJA 2H5YA 5I2KB 1NNPA 3TTMA 3IORA 1RYXA 1Y9UA 5AA2B 1B32A 1OMPA 3O6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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