3T96B

Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t96B02
1MG1A 2X7QA 3MZ1A 4KYDA 1URSA 1XC1A 1Q1KA 4QFLA 5LOMA 3K02A 1MDP1 3GBAA 3SEWA 1FQFA 3VVFA 1OQHA 4KQPA 3KOSA 5TU0A 3GZGA 2REJA 3BFUA 1LGBC 5KDTB 2P2AA 4NMYA 2FNCA 4C1TA 2VGQA 4U23A 1N76A 4XKRA 4HCYA 4HS7A 4YMBA 1Y3QA 1EZOA 3PPNA 4G2ZA 1QUKA 1B6HA 4H8IA 5KCJA 4F1YA 2DWJA 3KFMA 2ZNTA 4PFWA 5AA4A 1IITA 1MDQA 3C36A 1SW2A 2UYFA 1BKAA 3CFLA 2QMWA 2HFBA 1N0TA 1ZMGA 3B6WA 3RNNA 4GL0A 4FAJA 3BBRA 1CE2A 3PUVE 1FTOA 1URDA 1UTBA 5F7VA 3C9HA 4EDPA 3CG1A 2F97A 4GLIA 1MQJA 1D9VA 2PT2A 2QJEA 2ZNSA 1LAXA 4LUBA 3DM0A 4Q30B 3QIMA 3TCFA 1M5DA 3CFZA 3HSTA 4KYSA 4H0WA 4ELRA 3M3FA 4XKNA 5AA2D 4OVJA 4KCDA 5EHMA 2V84A 1SYHA 3MPKA 4G68C 4R75A 3DP8A 2A5TA 3A3CA 4BDNA 3RT6B 4X48A 3PMVA 1LSTA 4H1XA 4R74A 3VLUA 4NEDA 2UXAA 1B1HA 4N6PA 3TELA 1P1WA 5AA2B 1I69A 1Y3PA 5DT6A 1IXHA 3IB2A 3KEIA 1SW1A 3LSFB 4IO3A 4JXIA 5BUUA 3OOAA 2I6EA 3RPWA 3DP4A 1ANFA 2DVCA 3BFTA 2ESNA 1B3LA 3IOTA 5I2KB 3FATA 4WEPA 2OJTA 5KCJB 3MZ9A 4ESXA 5EYFA 4MFIA 5CC2A 5IAIA 3TTNA 1NH8A 1QUIA 5CM6A 5ICTA 3VDFA 5J1DA 4R6YA 2Z8EA 1CB6A 4Q5TA 4NF4A 1MXVA 3EQ1A 1EZ9A 2Z22A 3IJOB 3K1PA 1R9LA 3PPOA 3E13X 1VSOA 1FQAA 1VFDA 3R7XA 3PPPA 2OZZA 4N13A 3ILUB 1LAHE 4QFNA 4BDRA 1GGGA 2V3UA 2X26A 3KOTA 5FHMA 3JYRA 1Y3NA 3IOWA 1JEUA 1ZLQA 3E9XA 1OLAA 1MY3A 2P1SA 1PB9A 2ZYMA 2ZXTA 4ND9A 4ISUA 1GR2A 2YPNA 2O84X 3C34A 4HTGA 3TEPA 1QJMA 2H99A 2F6PA 3EHUA 3CSGA 1LFIA 2QSXA 1II5A 3OELA 4BDLA 4O3AA 5TPAB 5I59B 2RC7A 4EXLA 2RC9A 5ICQA 2D21A 5ISUA 5A5XB 1SDXA 2F34A 2OBGA 4FATA 1B5HA 5AE4A 3N6TA 1B3FA 1TWYA 4EUOA 3TZAA 4H5GA 4U1OA 5B7DA 3N94A 2XXWA 3G3IA 3ONMA 4QFPA 4ZEKA 2OK2A 2QS3A 4LA9A 3OENA 4F1UA 1NKXA 3OD7A 3S2VA 2RKMA 2Y7RA 3IOVA 3AXFA 3MP1A 5FHOA 4DXCA 1N3WA 1A40A 1URGA 5DEXA 2F36A 4XIGQ 3C35A 3M3KA 2HAUA 4JWYA 4U1ZA 3TQLA 5H8HA 2NUVA 3RT8A 1PB8A 1N7WA 1QKBA 4GL8A 2V93A 3FVOA 4MLVA 1LBBA 4DCYA 3SEVA 1MS7A 3SKPA 3U94A 3DELB 1BLFA 5CBRA 3HO7A 3KSJA 3SEYA 2F8DA 1MQIA 1R6ZA 3IB0A 4QF9A 4F3SA 4UA8A 2F7CA 2I49A 1BIYA 3V89B 1N3XA 1XHYA 1Y1ZA 3MWBA 3VLWA 1PDAA 4U4XA 1B2HA 1NNPA 3OO6A 3I5OA 5H8NA 3MVYA 4RK9A 3TTKA 2DXRA 5F1QA 3L6HA 3OMBA 3EN3A 1OIBA 1B4ZA 4NWCA 4YAHX 1FQCA 1PB7A 2DSFA 2NOOA 2O1MA 3UA8A 1JW5A 4DXUA 2F6GA 4OZ9A 5HM4B 4M1VA 3U1OA 2VP1A 3OO8A 3T9VA 5H8SA 1JVYA 4LQ2A 3FXQA 3MPLA 5I2NA 1GTKA 4GF8A 1LFGA 1B40A 2Q2AA 3TPAA 1YCJA 1HSJA 1A8EA 2QPQA 3THIA 3IORA 3QXMA 1POY1 1A99A 3V8XB 4GWOA 4ELQA 3VE1B 3RGYA 3LUYA 3A09A 2HEUA 3E4RA 2UVHA 5AA3A 2M8CA 1UTHA 1NNFA 2AL5A 3FVGA 2VD2A 4DE8A 2H9BA 2Q9TA 3K6UA 4NTLA 4ZZAA 4ZS9A 1B3HA 3C33A 4YB7A 1B52A 4OEUA 4ONYA 2FA7A 3B6QA 4ZE9A 1OQGA 2Z23A 3FV1A 4R6KA 2VD3A 2GRVA 1H43A 1SI0A 3FV2A 4GOTA 4ZDMA 2XX8A 2NXOA 3VXBA 2XXIA 4RY1A 1AIVA 2RCAA 3ZS6A 4MLQA 2Q88A 3ODBA 1ELJA 4F22A 3RUMA 3N26A 1B4HA 5FTIA 3FXRA 3KGCA 1JETA 1MM7A 1O7TA 1H76A 4G68A 3O2AA 2Y7WA 4FECA 2RF1A 3EHTA 4PE5B 4YB5A 4YU0A 3U8QA 3TTMA 1B0LA 5CMCA 3MVZA 3QAXA 4F39A 4F2OA 4YICA 4G4PA 2UVGA 5H8QB 1WODA 4G8HA 4EF2A 1Q35A 3KJ7A 3IL1B 1FTMA 4P11A 1MPCA 3K01A 1FW0A 4NF8A 3W9VA 1VFEA 1P1OA 1SW4A 3HN0A 4XKQA 3H6VA 3SETA 4JSOA 3H6UA 5I58B 1IXGA 4LZ5A 4QSEA 1MY0A 1UIUA 2Z8FA 1MXXA 4LONB 3JZJA 1BTJA 3S4UA 2Y84A 2XXHA 3PUWE 2VOZA 1Y4TA 3KG2A 4O3BA 2DWIA 2XX7A 5JTYA 2LAOA 4OHNA 4POXA 4RPNA 5FTHA 1ATGA 2VHAA 3G3GA 1RKMA 3TTRA 4PFUA 4ZEBA 2B3BA 2ONSA 1B46A 3N5LA 4JWXA 1B7HA 1NH7A 1IXIA 5K2XA 4XKPA 3CR9A 2DWHA 2GHAA 1POTA 4U21A 3VXCA 3T96B 5AA1A 3A3UA 2F7AA 3LR1A 3H06B 4FE8A 1DPEA 4THIA 3C4MA 5I57A 1B9JA 1B7ZA 4U22A 3U93A 3CIJA 3OEMA 3FGSA 2OLBA 3PUYE 3K2DA 3K4UA 1TFAA 3TKDA 1RYOA 4IGTA 1FQEA 4PQJA 4MH5A 2I0CA 4F3PA 2E0SA 3EHSA 1FQDA 4LP2B 2PX1A 1US4A 4ECFA 5AA4B 5L9OA 3T22A 4G77A 4Q0CA 2H5YA 1J1NA 5ITPA 3R26A 4OETA 3LSLA 3O9PA 4NF8B 5DVJA 1WVJA 1OVBA 1IZ1A 3UP9A 3MZBA 1DPPA 4MBPA 1UTBB 2GHBA 1N84A 4OEVA 1LCTA 3TTLA 2XXPA 4BDQA 1A55A 3ZKLA 4EQ7A 3PMWA 1XVXA 1DTZA 2DP8A 2Q2CA 3QUFA 4KI0E 1B51A 4GFRA 4E0XA 5L9SA 3S9MC 4YB6A 3O97A 1JQFA 2PT1A 4KFQA 2IA4A 4RNSA 2XXXA 3KN8A 2O7IA 3K1NA 3OEKA 1B58A 4TQUQ 4H67A 3IO6A 2A5TB 1FQBA 1MRPA 2HZKA 1AH5A 3FZVA 5DTBA 3H7MA 1MPBA 3MP6A 4OMBA 1YPNA 4OXVA 1B1XA 1B3EA 2Y7IA 4U4SA 4YKIA 1M5EA 3F11A 1I6QA 2D5WA 2I4BA 4XXUA 4AQ4A 1B5IA 2XXQA 3CG3A 3MC2A 2I3WA 3FXUA 4FIMA 3K6WA 1B0HA 4LQ5A 1EZPA 1QVSA 5IKBA 3O6HA 3MP8A 4P0IA 4IY5A 4FORA 2F78A 2XXUA 3VV5A 2G93A 3PPRA 1N7XA 3KJTA 1HSLA 1NFTA 3IAZA 1NNTA 3TODA 1SD3A 3C32A 2HQ0A 4OFOA 1S50A 1EU8A 2OWTA 4OESA 4ESWA 1JEVA 4JB7A 1JNFA 4NF6A 4NF4B 5ITOA 1ZTYA 3KN3A 1B32A 4GXSB 4I9DA 4F29A 3U72A 4R73A 1Y9UA 4G8NA 1LLSA 4H65A 4MF3A 2D3IA 4BLAA 3PPQA 5I56A 3T66A 1D9YA 4PFTA 1ZU0A 3FJ7A 2AL4A 3TDJA 3TMGA 3LBSA 2I48A 2IEEA 1FTLA 2Q8JA 1F9BA 2R9JA 2DE4A 2E1SA 2QRYA 5L9MA 3T9XB 1O64A 4KCCA 4ELOA 3UN6A 4I1DA 1JVXA 4ELPA 2QMXA 1FTKA 4YKKA 2O68A 1DTGA 2Y7KA 2G29A 3MVXA 3RN8A 3IOUA 3TYHA 2AIXA 4BDOA 5KDTA 4Z7EA 3RLFE 3W9WA 3E3KA 3TAJA 3SDFA 1P99A 2OWSA 3CI8A 3GLBA 1YTVA 4OQOA 3ZKKA 1TFDA 1IIWA 3IK6B 4JSDA 2HXWA 5DYHA 4EF1A 1TXFA 1I6AA 1IEJA 2AYSA 1A54A 3CFXA 1US5A 4F2QA 1IQ7A 4ZEIA 4QSCA 4IO2A 2XD2A 1P1QA 1B05A 2YJPA 4OENA 3LSXA 1LBCA 2HAVA 3K0VA 4KR5A 2XD3A 5FHNA 4X1DA 1R9QA 5L8DA 4IO7A 4C1UA 2O7UA 1M5FA 4GVOA 4H5FA 4X9TA 5DEXB 3QSLA 3UGWA 2OCUA 3K00A 4IB2A 4YKJA 2UYEA 1S7YA 2V25A 1DSNA 5H8HB 3QUJA 3O6IA 2I3VA 4M4GA 2XXRA 4EQ9A 4RYAA 5ELVA 1WDNA 2QS1A 2GFEA 3K1MA 3QK6A 3G3HA 1MQDA 3EPEA 4FEBA 1SI1A 3BKIB 4AB6A 3OSQA 4R9GA 2F7BA 3FD3A 3HV1A 3I6VA 3MW0A 3RTWB 3OSRA 2I4CA 4HCWA 4K3FA 5AA2A 4F19A 2R71A 5H8NB 4Q8RA 3VLVA 3JV9A 4ZE8A 4GD5A 3D4CA 3V5AA 1IUDA 2W7YA 3OO9A 3SEXA 2WKYA 1XS5A 2F5XA 4OYVA 1AL3A 2CZLA 3UIFA 5I2KA 3PV0E 2DE2A 3R6UA 5DVIA 2PBWA 4WKMA 3CRBA 4LVQA 3OXNA 2H25A 3FVKA 1A7LA 3RTFB 2O6AA 3B7DA 3VVEA 5I2NB 1QKAA 4RXLA 1MPDA 1D4NA 1FCKA 1LAFE 3HPIA 3USDA 1LB9A 1JW4A 4NE4A 1H3DA 4X1BA 2DE3A 4TLLB 1P1UA 3D4GA 3TQWA 5H8FA 4GIZA 5CMBA 4OERA 2ZMBA 2I0BA 1UTHB 3PUXE 5KZTA 3RQTA 5CRYA 5CMKA 1SYIA 1PC3A 3CVGA 4I8CA 2R6GE 4GQOA 1QW0A 5EHSA 5CMMA 2ABHA 2Q89A 5DVFA 4HW8A 4NF5A 3S9NC 3DP6A 4DIGA 4QSDA 3TCHA 4ZECA 3Q29A 2KLFA 3MVWA 3H4ZA 1SQYA 3RY3A 2PYYA 3PU5A 1UIVA 1Y4CA 4YZZA 1Y20A 2DOJA 4IO5A 4E0WA 1MXZA 3SESA 1ZKBA 4DDDA 4OFJA 3GXAA 1MM6A 3H03A 4G68B 3VFJA 3LC8A 4H6DA 5TPAA 3U92A 5I59A 4PFYA 5K2YA 4R72A 3WAFA 1Y1MA 2XHDA 2Z8DA 5A5XA 3T93B 3H6TA 2HZLA 1UQWA 4EXKA 1M5CA 4KPTA 1H44A 2ZYKA 1SVXB 1JW1A 3WAEA 2P0SA 1DOTA 1LAGE 3FASA 3H3GA 4GXAA 2I58A 2H4IA 3KBRA 1T0KA 1NMUA 1P1NA 1MXUA 1MH4A 1RYXA 1I6BA 1MY1A 5H8FB 3IJXB 4H8JA 1USYE 5JTYB 4GRKA 1B3GA 3ILTB 1S9TA 3UK4A 5M2VA 4G8MA 3V83A 1R1NA 2NWJA 1M5BA 2REGA 1PEBA 4UACA 2V3QA 2GH9A 4P0GA 5JK4A 3MUQA 1IXCA 3H6WA 1QUJA 2DYXA 1AMFA 4KYEA 3G3JA 3PGFA 4ZEDA 5BWJA 4F31B 4YMAA 2XXTA 4NF5B 3HHFA 4IY6A 1NNKA 3PD8A 3M3LA 3VVDA 1MXWA 2XXYA 2QS2A 4RA1A 4QFKA 1OVTA 4YKPA 4LZ7A 5I57B 1OLCA 4OTEA 4PP0A 4F18A 4QRZA 4WEDA 3O66A 4QHQA 2THIA 4O3CA 1MQHA 5TP9A 3C31A 4RK2A 4DZ1A 3GBBA 5CBSA 1D3KA 1LFHA 1MXYA 4JWOA 4I62A 3OO7A 1VR5A 4N07A 4R2BA 4XTCQ 2O51A 4F3BA 4RJZA 3KZGA 4F1VA 3HHGA 3CSBA 2QL3A 1AOVA 4FEDA 1SW5A 1FTJA 3IX1A 3Q25A 1MQGA 4LZ8A 1XT8A 4IO4A 3HCQA 1B5JA 2PMSA 1O63A 3EF7A 2DQVA 3ZSFA 3S9EA 2ZYNA 1Z7ME 3K6XA 4LATA 5JEIA 3L6GA 4R9FA 2DWAA 3FUZA 2O69A 1PBPA 2DS9A 4IO6A 3G3FA 1LB8A 3PMXA 1OMPA 3UORA 4L17A 4DXBA 3KSXA 3TUSA 3Q28A 4R6HA 4DCXA 1N04A 4BDMA 4KHZE 3IR1A 3G3KA 2F35A 2QS4A 4IGRA 3O28A 4TOZA 4F3GA 3IB1A 3PUZE 4QFOA 3O6GA 1KWHA 3G7WA 2HCAA 3SEUA 1XVYA 4JDFA 3Q26A 2ONKE 2A5SA 1ZJLA 1MY2A 3FVNA 2B3FA 2RC8A 2FYIA 1YAEA 3W15C 2O1LA 4FJPA 1VE4A 4U2RA 1TT1A 4KD5A 4Z0IA 3SERA 3T9HB 3KN7A 1A8FA 1MY4A 2RINA 4OFLA 4EQBA 3MBPA 2UVIA 4WXJA 3I3VA 2DVZA 3FIRA 4RPOA 2V3TA 5TP9B 3FJMA 3MQ9A 4DLDA 1MH3A 1DMBA 1GV8A 5HBCA 2BJJX 3MJNA 2ANJA 3B6TA 1H45A 3DLNA 1EH3A 3FJGA 1USYH 3O29A 5H8QA 2UVJA 1SBPA 3LSWA 2ZNUA 1L5TA 4PETA 3ECRA 2CMOA 1QULA 1Z7NE 1GVCA 3TCGA 2PVUA 4NF6B 5CI5A 2RCBA 5I58A 4ZEFA 3P7IA 2XXVA 2ONRA 1BP5A 1B7UA 4TLMB 4R2FA 2NVUB 3QYTA 2XX9A 1NL5A 3T9UA 2H98A 4C0RA 1ZIUA 4POWA 3PD9A 5I56B 4JBZA 3M8UA 3Q27A 4NWDA 3S9LC 1HSEA 4AB5A 2ALUA 1PBQA 3MAMA 2Y7PA 2ZYOA 2YLNA 2DXYA 1ZBMA 1XOCA 4OWDA 2B65A 3K6VA 4ZZEA 5I84A 3N6UA 3TFLA 3IO4A 5B70A 5HPQA 2X7PA 1LCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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