3T9HB

Kainate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9hB02
3QK6A 4OTEA 2XX7A 1B05A 4BDQA 3DLNA 3CFLA 2ESNA 2XXIA 3FATA 3H6UA 3EHUA 4MLVA 2QPQA 4OESA 1A7LA 4EQ7A 2XHDA 1XVYA 3PUVE 2ONSA 1A8EA 4ESWA 4TQUQ 1VR5A 3LUYA 2RKMA 3FJMA 3T9VA 1SI1A 1P1NA 4UACA 2IA4A 2AL4A 3CR9A 5CMBA 4LQ2A 4OYVA 3MP6A 5FHOA 2OJTA 4O3CA 5DTBA 4WXJA 3IOWA 1NH8A 5AA4A 3PUYE 4X48A 3CG3A 3S4UA 1DMBA 4RNSA 4ZEIA 5ITPA 4YKIA 2Z8EA 3CI8A 2O68A 1RKMA 2RC9A 4XIGQ 3R26A 2M8CA 5CBSA 5HBCA 2DSFA 3MZ9A 1TFAA 4YKPA 4ZZAA 3R6UA 3IJOB 3MVXA 1NNKA 4PFUA 5I58B 1QJMA 3I6VA 3UP9A 3FV1A 1N3XA 4ZZEA 5J1DA 4MH5A 5JTYB 1Y1ZA 1OLCA 3KBRA 4GF8A 1LFHA 1FTOA 4GL8A 4N07A 1O7TA 3IB1A 2HXWA 3SEVA 1D4NA 4ZE8A 3LSWA 3KN8A 3O6IA 3UK4A 3TDJA 4NF5A 4ONYA 4C0RA 4R9FA 3IAZA 4F1YA 1VE4A 1MRPA 1N7WA 4XKPA 2DWIA 3FXUA 4HW8A 1A54A 4OEVA 2XXHA 1N3WA 4F2QA 4BDLA 2QRYA 4G2ZA 1B3GA 1FQFA 3T22A 1URGA 4DXUA 1B32A 3PPQA 1GR2A 3OENA 1ZBMA 5FHNA 1IXHA 4KCDA 1P1QA 2O1LA 5L9MA 1L5TA 4EDPA 1OQGA 4DDDA 4YMAA 4GXSB 1T0KA 2X7QA 2UYFA 4ZEKA 4F3PA 3VVDA 4HTGA 3SERA 3QUJA 4EF1A 3Q29A 2F7BA 3VDFA 1HSLA 3K1NA 2ONRA 2E1SA 3MP1A 4Q5TA 5FTIA 3TFLA 1JVYA 4OZ9A 1M5EA 3N26A 4NF8A 2ZYMA 1P1UA 5ISUA 1B7UA 1FQEA 2HQ0A 5AA1A 1CB6A 1LFIA 1PB7A 3RPWA 3PUWE 1QULA 1GGGA 1SW1A 4IO2A 1SI0A 2I58A 1MXZA 3IK6B 4LATA 5TPAB 5AA2A 1JNFA 3K6XA 1LAGE 2DQVA 4H6DA 1IXGA 3RTFB 1LBCA 2DE4A 3WAEA 2THIA 3MWBA 3A09A 1TFDA 5CC2A 2DWHA 2VP1A 5HM4B 3VVFA 3GXAA 3QIMA 1D9YA 1B5HA 1HSEA 4LQ5A 1FTKA 2CMOA 3TODA 3FJ7A 1HSJA 3D4CA 5FTHA 4KYEA 3T9UA 3O28A 1A55A 4NF4A 3EF7A 3RT6B 3TELA 4F22A 2QS2A 4MF3A 4IB2A 2XXYA 5I56B 1IUDA 3U94A 4ZECA 1FTLA 3EN3A 4OETA 2ZNTA 1IEJA 4TLLB 3LBSA 3TUSA 3PD8A 3OEMA 1IITA 1JEVA 1LLSA 3T96B 4AB6A 3MZ1A 1EZPA 3I3VA 4R72A 1RYOA 3OO8A 3K4UA 3T66A 3M3LA 5H8SA 4P11A 3HV1A 1UTHA 4FEDA 3M8UA 1OLAA 3PUXE 4NF5B 3UGWA 3MPLA 1NKXA 2Y7KA 3OSQA 4RPNA 1RYXA 1LAXA 3MQ9A 3FXRA 2QL3A 4N6PA 4AB5A 1IXIA 3TTMA 1YAEA 3IO4A 2P0SA 4H5FA 1B0LA 4IO3A 1MQIA 5I2KA 2Y7RA 1TWYA 4JSOA 1LCTA 1J1NA 4F18A 3FVNA 4F2OA 1SD3A 1Z7NE 5JK4A 1EZ9A 1IZ1A 4BDRA 2FA7A 3PUZE 3FD3A 1B9JA 2PX1A 3TTNA 3U93A 3N94A 4LP2B 3SDFA 4NF8B 4HCWA 4IO6A 1SYHA 2RF1A 2DXYA 3HO7A 3VLUA 3P7IA 3KGCA 3FJGA 4R6KA 2G93A 4F29A 3MP8A 4XKQA 2PT1A 2D21A 3OELA 3GBAA 2YLNA 4BLAA 4QFNA 3FGSA 5I58A 1JQFA 1MY0A 3MUQA 4OXVA 3QSLA 1M5CA 5AA2B 3O97A 1USYH 4GVOA 4PP0A 5JTYA 4KQPA 3U92A 2H98A 4OERA 1N0TA 3C34A 5I57A 3E9XA 4LUBA 2XXRA 1NFTA 3H6WA 5I59B 3TTKA 4ND9A 5L9SA 4WEPA 1SW5A 3G7WA 1LGBC 3M3FA 4G8HA 3ZKLA 4DZ1A 2A5TB 4NF4B 3PV0E 2XD2A 4OFOA 2Z8FA 3VV5A 5EYFA 3TEPA 3FASA 5ICTA 2HZLA 2REJA 1OMPA 3O66A 1MY3A 3H3GA 1ATGA 4MFIA 1B52A 2QMWA 4RXLA 4ZEBA 3TMGA 2ONKE 1Q35A 3JV9A 4F3GA 4ELPA 3V5AA 3H6VA 1UTHB 3OO7A 4M4GA 5F7VA 1MY4A 2VD3A 1AL3A 4QF9A 1Y1MA 2O7IA 2I4BA 4WEDA 2QS1A 3PD9A 2DYXA 3TQLA 1MDP1 5AA3A 3FVOA 3SETA 1Y4TA 3TZAA 2PYYA 2X7PA 1YTVA 1A99A 2D3IA 2XXTA 4QSDA 4E0WA 3IR1A 1SDXA 4Z7EA 2I3VA 3B6QA 5TPAA 4H1XA 4OHNA 3HHFA 2F97A 5I2KB 1JETA 4NF6A 4ISUA 4R6HA 2AYSA 3EHTA 4LVQA 3RN8A 4NTLA 2Q89A 3R7XA 5M2VA 1XVXA 2G29A 1B5JA 1PC3A 2NUVA 2B3FA 1MPCA 3A3CA 3LSFB 1QW0A 3HPIA 4YB6A 3IOVA 4FE8A 5CBRA 4RK9A 4HS7A 3ODBA 2OWTA 1TXFA 4IO4A 2Y7IA 5ICQA 2Z23A 3W9VA 1WVJA 4Q0CA 4KYSA 1M5BA 3H4ZA 5I56A 2AIXA 3T9HB 3K01A 4Z0IA 4JB7A 4RPOA 2GHBA 1MXWA 1B7HA 2HFBA 3VVEA 5ITOA 1ZIUA 1SYIA 1NMUA 1MQJA 4O3BA 4XKNA 3S9NC 2LAOA 1PEBA 1UQWA 5TP9A 4F19A 4PFWA 4KHZE 4DLDA 4DCXA 5I57B 1FCKA 1Y3NA 3OO6A 4C1TA 3TYHA 3FV2A 2FYIA 3MVYA 4GOTA 3TAJA 2UYEA 4R6YA 4KFQA 3O6HA 3KOSA 3PPNA 1GV8A 4I1DA 1MQDA 3F11A 1N84A 3DM0A 3ILTB 1POY1 1AMFA 1QUIA 5K2YA 3PPOA 1JEUA 2ZNUA 3TTRA 1DTGA 4N13A 3G3HA 1XS5A 3H7MA 3VE1B 2DS9A 4QSEA 5H8FA 1M5FA 3VFJA 1I6BA 4E0XA 3N5LA 3KZGA 4R2FA 3WAFA 5BUUA 3K02A 2I0BA 1SVXB 2UVJA 1AH5A 3KEIA 1FTJA 5IAIA 3K6WA 3BFUA 4KD5A 4LZ8A 4U4XA 2H4IA 1YCJA 1Q1KA 3SESA 1PBQA 1N76A 5DVIA 4QFLA 1P1WA 3KJTA 1PB9A 1SQYA 2PMSA 3CIJA 3CSGA 5L8DA 1MH3A 1EU8A 3CG1A 3UA8A 1MQGA 3TCFA 1FTMA 4U23A 1NH7A 1FW0A 4JWYA 1B51A 1IXCA 2F36A 2I48A 1NNTA 4IGRA 3ZS6A 1BTJA 3C32A 1ZU0A 4ELOA 4EQBA 1AOVA 3IJXB 4NF6B 5EHSA 1PB8A 3E3KA 4FJPA 1USYE 1FQAA 1B5IA 1MXXA 1VFEA 4YB7A 4OMBA 5I59A 3OXNA 3BBRA 4ELRA 1MDQA 4PFTA 2ZNSA 2ABHA 2Q2CA 4ZEFA 1ELJA 4NE4A 4LZ7A 2A5TA 5CMCA 3RNNA 4UA8A 3Q26A 5CI5A 2DVZA 4PQJA 3RUMA 5CM6A 3W9WA 3FUZA 2QMXA 3JYRA 1I6AA 2O69A 3S9EA 2DXRA 3GBBA 1MXYA 5CRYA 1ZLQA 3FXQA 1ZMGA 4F3SA 4MLQA 2NOOA 5TP9B 2PVUA 1DSNA 2F8DA 3CRBA 2W7YA 4KCCA 2QJEA 1R6ZA 1YPNA 4RYAA 3BFTA 4LONB 3LC8A 2UVGA 3B6TA 3TQWA 3K6VA 2O7UA 4H8JA 3HHGA 1B4ZA 1B3LA 1JVXA 2O84X 3LSLA 5KDTA 4I8CA 1NNFA 3FIRA 2Z8DA 2HCAA 1DPPA 4I9DA 2F5XA 2XXVA 1F9BA 3EHSA 2ZMBA 4GXAA 5A5XA 3JZJA 2F7CA 3U72A 3FVKA 3USDA 5H8FB 4U22A 1US5A 5JEIA 4G77A 2GFEA 3MAMA 3PPRA 1B2HA 3HSTA 5BWJA 4JXIA 1B3FA 2V3UA 3DP8A 1P99A 1POTA 2OK2A 2NXOA 3M3KA 4GFRA 1NNPA 4QFPA 3ZKKA 2DVCA 3G3GA 1JW1A 2O1MA 4EF2A 1GTKA 2RCAA 1FQBA 4RJZA 3U8QA 1A8FA 5CMKA 1B1XA 4OWDA 1H44A 2OBGA 4G4PA 2HEUA 3OSRA 2B3BA 3B6WA 3RT8A 1MM7A 3KN3A 1MQHA 2DP8A 1DPEA 4DCYA 3K1PA 4U21A 1MM6A 2Y7WA 2DE3A 1PBPA 3TKDA 3OOAA 4R73A 3CFXA 4IO5A 1OVBA 3MBPA 4NWDA 3AXFA 2V84A 2ALUA 2OWSA 1OIBA 2I3WA 1A40A 3KN7A 2D5WA 4YKJA 4DIGA 2O6AA 1TT1A 3IORA 2GH9A 1QKBA 4YKKA 2R9JA 3GZGA 5KCJB 3MJNA 2GRVA 1XOCA 2P1SA 1UTBA 3PMXA 4KYDA 3OD7A 2NWJA 2DE2A 2VGQA 1H3DA 1R1NA 3N6UA 4JWOA 3C9HA 2I49A 3SEXA 5DT6A 1B7ZA 3IOUA 1H76A 2DWJA 2DWAA 2XXQA 4H5GA 4KR5A 4OENA 1MXUA 1B46A 2ZYOA 4LZ5A 4OVJA 3PMVA 4OEUA 2PT2A 1ZTYA 5CMMA 5I84A 5KDTB 1QUKA 4QHQA 3SEYA 4L17A 3S2VA 3T9XB 3SEUA 1B3EA 3IB2A 2V25A 2FNCA 2YJPA 3H06B 2XD3A 3EPEA 5A5XB 3QAXA 3THIA 5DEXB 5I2NB 4TOZA 1UIUA 3PU5A 2YPNA 1PDAA 4OQOA 2WKYA 1R9LA 4M1VA 2V3QA 2O51A 3CFZA 4U1ZA 2H9BA 4QRZA 3IL1B 3V8XB 4PFYA 4DXCA 1LB8A 4EQ9A 4YICA 1LAFE 4X1BA 2Q88A 1B0HA 2F35A 4IO7A 3MC2A 1AIVA 3ECRA 5H8NB 2XX9A 5TU0A 2PBWA 1LB9A 3K6UA 5F1QA 4H0WA 3TCHA 2NVUB 1B58A 1MH4A 2Q8JA 2Y7PA 3K2DA 3HN0A 3KJ7A 4H65A 3C33A 4G68A 3E4RA 5H8HA 3QXMA 4DXBA 1M5DA 1BKAA 1OQHA 4NEDA 1FQDA 4AQ4A 2E0SA 3KSXA 4F31B 3VXCA 2V3TA 3I5OA 2H5YA 3TCGA 5DVJA 1B4HA 4O3AA 5H8QA 2IEEA 4X9TA 3U1OA 4P0IA 4XXUA 1II5A 3S9MC 2XXUA 3EQ1A 3L6HA 2XXXA 1D3KA 1NL5A 3QYTA 4JDFA 3LR1A 1JW5A 4U1OA 2OZZA 4BDOA 2Z22A 3LSXA 4FORA 4TLMB 1BP5A 1MG1A 5B7DA 1DTZA 1UTBB 3G3JA 1LSTA 1SW2A 3V89B 3V83A 4XKRA 3PMWA 3DELB 4ZS9A 2HAVA 3SKPA 4GWOA 1N7XA 1P1OA 4ESXA 3E13X 1MY2A 4YMBA 5L9OA 4YZZA 3KFMA 2VHAA 2XXPA 3O2AA 2H99A 3ONMA 4G68C 1DOTA 4IY5A 1IIWA 1I69A 4BDNA 1ZKBA 2F6PA 4C1UA 1QUJA 1N04A 4HCYA 4OFJA 4KI0E 3FZVA 3K0VA 3IO6A 4H67A 3MVZA 4U4SA 1MXVA 2F7AA 4H8IA 2HAUA 4THIA 4YB5A 4R75A 4R2BA 4POWA 2QS3A 3MPKA 2RC8A 4MBPA 1UIVA 3KOTA 1WDNA 2VD2A 4G8MA 3VLVA 2ZXTA 2DOJA 3A3UA 1JW4A 3HCQA 4GL0A 3RLFE 4GIZA 2GHAA 2VOZA 3N6TA 1H45A 1S7YA 3IOTA 1SW4A 3Q27A 4FAJA 4FATA 4LA9A 4ZDMA 4GD5A 1R9QA 3BKIB 3C35A 2Y84A 3VXBA 1URDA 5AA4B 4GLIA 5LOMA 1LCFA 1ZJLA 3B7DA 4RK2A 1D9VA 4BDMA 3O29A 1O63A 3C36A 3UORA 1B3HA 4KPTA 4P0GA 5KCJA 3RY3A 5HPQA 4G68B 4R9GA 2HZKA 4ELQA 5KZTA 3TTLA 5H8HB 3ILUB 3Q28A 4F1VA 3CSBA 4FIMA 4YU0A 3ZSFA 4ECFA 3G3IA 4DE8A 5AE4A 4F39A 1WODA 5H8QB 2F6GA 4POXA 4R74A 4X1DA 3FVGA 4EXKA 3SEWA 4JSDA 4ZE9A 3MZBA 2REGA 2A5SA 1BIYA 1IQ7A 5DYHA 1KWHA 1URSA 3IB0A 5B70A 3PPPA 1EZOA 1LFGA 3C31A 3GLBA 4PE5B 3IX1A 2AL5A 2P2AA 1LBBA 3RTWB 4FEBA 4RA1A 1GVCA 1US4A 5AA2D 5DEXA 5I2NA 3C4MA 1Y9UA 4K3FA 2ZYNA 1S50A 1Y3PA 3MW0A 2X26A 2UXAA 4IY6A 1MS7A 4RY1A 3CVGA 3H03A 1EH3A 1H43A 4F3BA 4NMYA 2XXWA 4JBZA 3OMBA 4NWCA 2OCUA 3H6TA 3TPAA 1B1HA 2H25A 3OO9A 3S9LC 3DP6A 1VSOA 3L6GA 4JWXA 5H8NA 1B6HA 3G3KA 2QS4A 2F34A 4XTCQ 2ANJA 2I6EA 3MVWA 1Y3QA 4FECA 5IKBA 1XT8A 2R6GE 2OLBA 5K2XA 1OVTA 3D4GA 5FHMA 1I6QA 1XC1A 1ANFA 2XX8A 3RQTA 1XHYA 2ZYKA 2UVHA 2I0CA 4F1UA 3K00A 4Q30B 4Q8RA 5EHMA 2B65A 3KSJA 4PETA 2V93A 1MY1A 1QKAA 3Q25A 3O9PA 4QSCA 4OFLA 2Q9TA 3KG2A 3QUFA 3K1MA 4I62A 1VFDA 3O6GA 4G8NA 4GRKA 3DP4A 1Z7ME 4YAHX 3G3FA 1SBPA 4IGTA 4QFKA 1Y20A 2R71A 3UIFA 2RC7A 4U2RA 1Y4CA 3VLWA 1CE2A 4EUOA 1BLFA 2QSXA 4EXLA 5ELVA 1LAHE 3RGYA 1O64A 1S9TA 1FQCA 2F78A 2Q2AA 2CZLA 2UVIA 4GQOA 1MPBA 2KLFA 2BJJX 3T93B 1B40A 3PGFA 2RINA 4QFOA 3UN6A 1QVSA 2I4CA 3OEKA 4ZEDA 5DVFA 1MPDA 3W15C 2RCBA 4WKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QK6A 1NUXA 4OTEA 2XX7A 1B05A 4BDQA 3DLNA 3CFLA 2ESNA 2XWVA 2XXIA 3IFAA 3FATA 3H6UA 3EHUA 2F3DA 4PC9A 4MLVA 2QPQA 4OESA 1A7LA 4O7IA 4EQ7A 2XHDA 1XVYA 3PUVE 2ONSA 1A8EA 4ESWA 4TQUQ 1VR5A 3LUYA 2RKMA 3FJMA 4P8BA 3T9VA 4PF8A 1SI1A 4N8YA 1P1NA 4UACA 2IA4A 2AL4A 3CR9A 5CMBA 4LQ2A 4OYVA 3B50A 3MP6A 5FHOA 2OJTA 4O3CA 5DTBA 4WXJA 3IOWA 5EQ9A 1NH8A 5AA4A 3PUYE 4X48A 3CG3A 3S4UA 1DMBA 4RNSA 4ZEIA 5ITPA 4YKIA 2Z8EA 3CI8A 1NV5A 1FPFA 2O68A 1RKMA 2RC9A 4XIGQ 5EQ8A 1YXIA 3R26A 2M8CA 5CBSA 5HBCA 4UABA 2DSFA 3MZ9A 5EYHA 1TFAA 4YKPA 4ZZAA 3R6UA 3IJOB 3NOHA 3MVXA 4PE3A 1NNKA 4MAGA 4PFUA 5I58B 1FJ9A 1QJMA 3I6VA 3UP9A 3FV1A 1N3XA 1NUWA 4ZZEA 5J1DA 4MH5A 5JTYB 1Y1ZA 1OLCA 3KBRA 4GF8A 1LFHA 1FTOA 4GL8A 4N07A 1O7TA 3MSTA 3IB1A 2HXWA 2KR0A 3SEVA 1D4NA 4ZE8A 3LSWA 5IZ1A 3KN8A 3O6IA 3RPLA 3UK4A 3TDJA 4NF5A 4ONYA 4C0RA 4N8GA 4R9FA 2FBPA 3IAZA 4F1YA 1VE4A 1MRPA 1N7WA 4XKPA 2DWIA 3FXUA 4HW8A 1A54A 4OEVA 2XXHA 1N3WA 4F2QA 4BDLA 2QRYA 4G2ZA 1B3GA 1FQFA 3T22A 1URGA 4DXUA 4NQ8A 4OA4A 1B32A 3PPQA 1GR2A 1K9ZA 3OENA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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