3T9VA

Cnqx bound to a reduced double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA02
2E0SA 1SQYA 5IAIA 5H8NB 4EF1A 3RT6B 5DYHA 5FTHA 3IK6B 4F1VA 3CFXA 4BDNA 2XX7A 1SW4A 3PD9A 2XXTA 1Y9UA 2Y7KA 3Q29A 1B51A 1KWHA 1MS7A 2F34A 3W9VA 1OQGA 4P0GA 3K1NA 3M3FA 1PB9A 1POTA 4NWCA 5KZTA 4X9TA 2OLBA 5I56A 4DCXA 1PC3A 4M1VA 3MBPA 4YKKA 3UK4A 2RC9A 2OJTA 1US4A 4JSOA 1LBCA 3RTFB 4F3PA 2XXXA 5TPAB 1JEVA 5I84A 5H8FA 4I62A 2XX9A 1XVYA 1IITA 5CMKA 3H6UA 1DMBA 2VGQA 5I2KA 3G3JA 2OZZA 5AE4A 1SW2A 3RN8A 3R26A 1NH7A 2F6PA 2V93A 1MY0A 2HAUA 3TTLA 4BDQA 4OENA 4F29A 1B5HA 3OSQA 2O1MA 1UTHA 1B7ZA 4MLVA 3MPLA 1CB6A 2O69A 1NKXA 3TEPA 3K1PA 4ZEBA 4IY6A 1QKAA 2QRYA 5AA3A 3IO4A 5H8HA 2I3VA 1PBQA 2OWSA 4GVOA 3U72A 2FA7A 1TXFA 3O28A 1SVXB 1O7TA 3QIMA 4LZ7A 2NWJA 3G3FA 4U22A 4LA9A 1D3KA 1B58A 3FATA 3IOWA 1A8EA 3VDFA 4BDOA 3R6UA 3CFLA 1LBBA 1MPCA 1MY2A 4GL0A 1ZU0A 1A55A 3QUFA 3LSXA 4R2FA 2HCAA 3RGYA 2XX8A 4DLDA 2XXRA 1R1NA 3VXCA 3T66A 4DIGA 1HSLA 5KDTB 1M5BA 2G93A 1IZ1A 1R9QA 4P11A 3GBBA 4PFUA 2ANJA 3MJNA 1JVXA 2DVCA 3HPIA 5TP9A 4G68A 3TKDA 3KBRA 2F36A 3OEKA 4OZ9A 3HHFA 4ZEFA 1SW5A 3B7DA 3EN3A 1MY3A 4QSCA 1FQAA 4GL8A 1MPBA 2I48A 2THIA 1YAEA 4YICA 1IXHA 3K6XA 1N84A 4F2QA 1N7WA 1OIBA 2DOJA 1ZTYA 2PX1A 4ISUA 2Q2AA 1MQHA 5I58A 5I59A 4HS7A 4UACA 3V83A 1ANFA 3U93A 2UVGA 1FW0A 3TFLA 5L9SA 3A3UA 4ZDMA 3IB0A 1PEBA 1Y4CA 3V89B 1N76A 5CBRA 2Q2CA 4RPOA 3TCFA 1P1UA 2RCAA 5JK4A 1DSNA 2PVUA 1LFIA 2F35A 1QVSA 3G3KA 1P1OA 3S9MC 2XXUA 3QXMA 3O6GA 2Z22A 3HN0A 3T9XB 2IEEA 1ZJLA 3QYTA 1YCJA 1B3LA 4G8HA 3GXAA 4WEPA 1GTKA 4JDFA 3TTKA 3MVWA 2Y7IA 1JW4A 5ICQA 4F22A 1B2HA 4ZE9A 3C4MA 3PV0E 1VFDA 4NF8A 4U1ZA 4ZZAA 3MW0A 4ONYA 1B46A 1N3XA 1WVJA 2HZKA 1MXUA 3CVGA 3H4ZA 4POXA 1T0KA 3KJTA 2UYEA 4GFRA 1USYH 3LBSA 2RF1A 3VVFA 4KCDA 2XD2A 1B40A 3O9PA 1XHYA 4ZEKA 1VR5A 2F6GA 3FUZA 3JYRA 4F3GA 4FAJA 3OMBA 1JETA 2H9BA 1MQIA 1NH8A 4JXIA 5ITPA 1EZ9A 4ECFA 1FCKA 5CBSA 4C1UA 1Y20A 5IKBA 3OOAA 3L6HA 2DS9A 1PBPA 4YZZA 3K4UA 4OQOA 5I2NA 1ATGA 4HW8A 4YMBA 2HZLA 3C35A 2XXVA 1CE2A 3VE1B 1SBPA 4BDLA 4Q0CA 4EXLA 3VLUA 5DEXA 4OESA 1NNFA 4YAHX 3OXNA 1WODA 1EZPA 4ELPA 4LZ5A 4RK2A 1N3WA 2XXIA 1GVCA 2X26A 3LSFB 1JNFA 1MXWA 4TLLB 2P2AA 4IO4A 5JEIA 1LFHA 1MPDA 2HQ0A 4GQOA 3EHSA 3ILTB 2VD2A 3A09A 4IO6A 3C32A 4FECA 3G3GA 4FIMA 2GRVA 4R6KA 2AIXA 2DWJA 5I57B 3VFJA 2UYFA 1VFEA 3N94A 1B4ZA 5K2XA 3W9WA 1LB8A 2R71A 5TU0A 4OERA 3IOTA 1Y3PA 5EYFA 4K3FA 3PPOA 2D3IA 3MZ9A 4RY1A 2G29A 2XD3A 1MM6A 4EQ9A 2DP8A 4QF9A 4POWA 4NF5B 3TDJA 2OCUA 3FV1A 5F7VA 4Z7EA 1IQ7A 4H8JA 4G8NA 1H76A 4ZECA 1JEUA 4X1DA 3ODBA 2NOOA 5EHSA 3PUXE 4G4PA 3OEMA 1FTKA 2O7IA 5BWJA 1B3FA 4BDRA 2P0SA 4DXBA 2V84A 3TQWA 2H99A 1JW1A 2I49A 3EPEA 4O3BA 5KCJB 3C9HA 5AA2B 1LAHE 1R9LA 3B6TA 3E9XA 3TCGA 1US5A 3TCHA 1LSTA 3FVNA 1RYOA 2B3BA 5H8NA 3RNNA 2DQVA 4QHQA 2AL5A 2F5XA 1MXYA 1USYE 1YPNA 5A5XB 3CIJA 1MXVA 4U23A 1FTMA 4HCWA 4NF4A 3IOVA 4YKPA 1XT8A 3RUMA 3MP6A 4NMYA 3G7WA 5F1QA 5CMBA 4GWOA 3PMVA 4QSDA 3TMGA 1SYHA 4HTGA 3MZBA 4FJPA 4EQ7A 3O66A 2FYIA 3N6UA 1HSEA 3FIRA 4ESWA 1OLAA 3K6VA 4EUOA 4R2BA 3LC8A 2GHBA 3QK6A 4BLAA 2BJJX 4YB5A 2OWTA 5K2YA 2ZNUA 5B70A 1A7LA 4C0RA 1II5A 1OLCA 2ZNTA 4H67A 1OMPA 1BLFA 4XTCQ 2RC7A 4P0IA 2V3QA 2D5WA 2QMXA 2YPNA 4ZE8A 2DE4A 4X1BA 2PBWA 3PMWA 3MPKA 4MF3A 3DELB 4H65A 1B0HA 3VXBA 4DZ1A 3LR1A 1JVYA 3O6IA 3S9EA 1SI0A 1GR2A 4OFJA 4R6YA 3S9NC 3TTNA 2F78A 2ONSA 3CSBA 5I2KB 1B1HA 2ONKE 1Y4TA 3VLVA 4AB5A 3KN8A 4AB6A 3VVDA 3C31A 2ESNA 3HCQA 1FQCA 2HFBA 4U21A 1NNKA 3GBAA 3FVGA 3VVEA 2B3FA 4GRKA 4MLQA 4XIGQ 2XXWA 2RC8A 3N6TA 1IXIA 4F3SA 3O6HA 4DDDA 3E3KA 3PUWE 2QS2A 2XXPA 4KYDA 3K01A 1EU8A 1TFAA 2ZXTA 2Z8DA 1I69A 4GIZA 4F1YA 1UIVA 5H8HB 1MQGA 5DTBA 4YKIA 3OO7A 1YTVA 2HXWA 2DWAA 2PMSA 4IO3A 2QJEA 1PB7A 1H3DA 1O64A 1DTGA 1MQDA 3FXUA 4NE4A 2X7PA 4F39A 3UA8A 4R72A 4LQ5A 1LLSA 5ITOA 3VV5A 2KLFA 5AA4A 2RINA 4UA8A 4NF6A 1EH3A 3G3HA 5BUUA 5CC2A 4NEDA 4YU0A 2O1LA 2REJA 4IY5A 1OVBA 3GZGA 3LUYA 1B1XA 3P7IA 1XC1A 1SI1A 3THIA 4Q30B 4JB7A 4R74A 4IB2A 3EHTA 4N07A 4O3AA 5H8QA 2QPQA 2H98A 4FE8A 4F1UA 3Q26A 5J1DA 3KFMA 5DVJA 1NNPA 1IXCA 1UTBA 4PE5B 1GGGA 1PDAA 1B9JA 4PFTA 4ELQA 4OVJA 2GH9A 4QRZA 2AYSA 3C33A 3PU5A 2V3TA 2GHAA 5CRYA 3PD8A 2I4CA 4RYAA 5I58B 4KFQA 5I59B 3FVOA 2W7YA 4F19A 3CI8A 3C36A 2Y7PA 1IUDA 1FQFA 2F7BA 1R6ZA 3PMXA 4GD5A 1B32A 3KZGA 1TT1A 1XS5A 1NNTA 5FHOA 3D4CA 3L6GA 4C1TA 2ONRA 3UP9A 4LZ8A 3FJGA 4KCCA 1A99A 3M3KA 4OMBA 2I4BA 3N5LA 1UQWA 1MH3A 4R73A 4YMAA 2CMOA 2Y7RA 4OWDA 1SD3A 1QKBA 2VHAA 3E4RA 2YJPA 4ZZEA 1LGBC 4KQPA 1WDNA 3OD7A 1S50A 1B5IA 1S9TA 3IL1B 1D9YA 1B6HA 3ZS6A 4JBZA 3SKPA 3T9VA 3TTRA 4N13A 2O68A 3Q25A 4GLIA 4PQJA 1S7YA 5FHNA 4ESXA 4I9DA 4U2RA 5JTYA 2XHDA 2V3UA 4KHZE 3MP8A 3O97A 2NXOA 4OEUA 1AIVA 1AH5A 3UIFA 1H44A 3S2VA 4H8IA 3OSRA 5LOMA 3CG1A 1IXGA 3FGSA 4KD5A 1FQDA 1MXZA 3WAFA 1HSJA 5HM4B 4IO7A 1ZBMA 4OFLA 3VLWA 3I6VA 4RXLA 2VD3A 3TZAA 2D21A 3C34A 2Q88A 5M2VA 1SYIA 1URSA 4ND9A 1B4HA 1FTLA 3JZJA 1FQBA 1Y3NA 3UN6A 1VE4A 1MG1A 2F7CA 2QMWA 3FASA 3FJ7A 4QFKA 4FEBA 1M5CA 3CRBA 5DEXB 1B52A 2XXHA 3KOTA 3MAMA 4R6HA 3OENA 1ELJA 4KYEA 4YB6A 3LSWA 5ICTA 1QUKA 3FXRA 3IR1A 4JWXA 1QULA 2M8CA 2DWHA 3MVXA 4NF5A 1Z7ME 4LATA 4PP0A 1D4NA 5CMMA 5L9MA 1J1NA 2Q89A 3KG2A 5HPQA 4F3BA 3RY3A 3ONMA 1DTZA 2A5TA 1Q1KA 1N7XA 1LB9A 4EXKA 4EDPA 3TAJA 2DWIA 3QAXA 3EQ1A 2OK2A 3I3VA 3IB1A 4U1OA 2H5YA 4OYVA 3K0VA 3CR9A 3K6WA 4E0XA 1H43A 4GF8A 4YKJA 3DM0A 3MC2A 2H4IA 2P1SA 3FXQA 1F9BA 1DOTA 1P99A 4MBPA 2UVIA 3CG3A 3TELA 3CSGA 4G68C 3SEUA 3FV2A 1FQEA 5A5XA 3H7MA 1B3HA 4JWYA 2O6AA 2O51A 2F97A 3E13X 4G2ZA 4MH5A 3TPAA 3OO6A 2XXQA 2UXAA 4FEDA 3T22A 4H6DA 4ZEIA 1BTJA 3T9UA 3V8XB 1B7UA 3IORA 4IO2A 4O3CA 2ZYOA 3W15C 3OO8A 3U8QA 3UORA 4NTLA 1ZMGA 4F18A 4FORA 4OFOA 3MZ1A 2ZYMA 5HBCA 1NMUA 4NF4B 5TPAA 1NFTA 3FVKA 4G77A 3O2AA 1FTOA 3R7XA 3ECRA 4TQUQ 5DVIA 2YLNA 3AXFA 3OO9A 3H03A 3M3LA 2I58A 3IX1A 2PT1A 2DVZA 3DLNA 3TODA 1M5FA 5I56B 3IAZA 4M4GA 2UVJA 4LONB 3KN3A 2VOZA 5H8FB 1QJMA 1DPPA 3U94A 3KSXA 4XKQA 4H5GA 1MDP1 2DE3A 3MUQA 2I0BA 3K2DA 2RCBA 3PGFA 2Y84A 3PPPA 1JQFA 1I6BA 1NL5A 1MXXA 1QW0A 3EF7A 4EQBA 2B65A 3DP4A 5CI5A 2LAOA 4THIA 5H8SA 1EZOA 4DXCA 1URGA 3K6UA 3Q28A 2Z8EA 4RPNA 3D4GA 1UTHB 3RPWA 4AQ4A 3MQ9A 1I6AA 3T93B 2CZLA 4KYSA 2F7AA 2AL4A 3V5AA 1ZLQA 2I6EA 5AA1A 5KDTA 4DE8A 3TYHA 3SDFA 4U4SA 1BKAA 3TUSA 3H6VA 4IGTA 1SW1A 3GLBA 1MY1A 1PB8A 4OHNA 4R9GA 2R9JA 4WKMA 3PPRA 4G8MA 3M8UA 2A5SA 1URDA 1TFDA 2NUVA 2V25A 3BFTA 4EF2A 1AL3A 4PETA 3TQLA 1H45A 2Y7WA 4XXUA 3SEXA 3H3GA 4QSEA 3MP1A 3SEVA 1Y1MA 4H0WA 2QS3A 5TP9B 5AA4B 1B3EA 3SESA 4NF6B 4G68B 4FATA 1Q35A 1QUIA 5CMCA 3USDA 2XXYA 1JW5A 3KN7A 2O7UA 1ZIUA 5B7DA 1Y1ZA 2DXRA 4XKPA 1B3GA 1LCTA 3Q27A 2NVUB 1LCFA 2E1SA 5H8QB 1RYXA 4R9FA 4RK9A 2QS1A 1M5EA 3H06B 1FTJA 1IEJA 2ABHA 4I1DA 2H25A 4OXVA 2UVHA 1MRPA 2Z23A 4PFYA 4F2OA 2OBGA 1UTBB 4OEVA 4E0WA 1A8FA 4OTEA 4KR5A 3K00A 1Y3QA 2R6GE 1B05A 2HEUA 1P1NA 3IJOB 3KSJA 3FZVA 3UGWA 3IJXB 3PUYE 3S9LC 4ZS9A 1SDXA 4LUBA 1AMFA 3CFZA 1QUJA 3MVYA 2I3WA 1VSOA 4H1XA 5AA2D 3PPQA 1ZKBA 4RA1A 2FNCA 4IGRA 3A3CA 3KOSA 3FD3A 2O84X 5ISUA 5L8DA 3BBRA 3IOUA 5FTIA 4YB7A 3U1OA 5DVFA 3DP6A 3HHGA 2PYYA 4XKRA 3MWBA 4Q5TA 4JWOA 4U4XA 3IB2A 2QL3A 3JV9A 1XOCA 4QFLA 4RJZA 3ZSFA 4IO5A 3B6QA 3WAEA 3QSLA 4NF8B 1N04A 3H6WA 1XVXA 4KPTA 5CM6A 2RKMA 3ZKLA 4F31B 2DXYA 1LFGA 2Z8FA 1RKMA 4WEDA 3BFUA 4L17A 1TWYA 4RNSA 4TLMB 4N6PA 2ZYKA 1MDQA 3IO6A 1MY4A 1I6QA 5L9OA 2VP1A 2PT2A 3DP8A 1OVTA 3OELA 4ELOA 5JTYB 2F8DA 2I0CA 3T9HB 3K1MA 2DE2A 4QFNA 2ALUA 2DYXA 3KJ7A 4OETA 3MVZA 2Q8JA 4GXSB 3PUZE 1B7HA 4LVQA 4GOTA 3H6TA 4LP2B 5I2NB 3ILUB 5FHMA 1D9VA 2X7QA 3PUVE 3LSLA 2Q9TA 3FJMA 4JSDA 2ZNSA 1DPEA 1MQJA 5I57A 4I8CA 3KGCA 2WKYA 4KI0E 2IA4A 1LAGE 1L5TA 1IIWA 4MFIA 1P1WA 3SEYA 3HSTA 2GFEA 2HAVA 4X48A 4DCYA 5DT6A 3HV1A 3EHUA 1LAFE 2REGA 1O63A 1N0TA 1P1QA 4DXUA 3K02A 4ZEDA 4BDMA 3RQTA 2DSFA 3SEWA 3RLFE 4Q8RA 3N26A 1BIYA 5ELVA 1A40A 4ELRA 1B0LA 3PPNA 3B6WA 5EHMA 3TTMA 3BKIB 1A54A 3T96B 3F11A 2QSXA 1AOVA 1M5DA 1POY1 5KCJA 1GV8A 4QFPA 5AA2A 3I5OA 3RT8A 4LQ2A 4QFOA 4GXAA 1MH4A 4TOZA 3KEIA 2A5TB 3O29A 3S4UA 2ZYNA 3SETA 1MM7A 4NWDA 1Z7NE 1B5JA 4XKNA 4PFWA 3QUJA 1BP5A 3SERA 4WXJA 3HO7A 1UIUA 4H5FA 3G3IA 2QS4A 1OQHA 3ZKKA 4Z0IA 4HCYA 3U92A 1LAXA 4R75A 2ZMBA 3RTWB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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