3T9XB

Glutamate bound to a double cysteine mutant (v484c/e657c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLCREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKCFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB02
4U4SA 4HCWA 1A7LA 3R7XA 3I6VA 3DM0A 3C31A 5H8NA 3QSLA 2OWTA 3V83A 1VR5A 4ZECA 3DP6A 1PEBA 2V3UA 3VXBA 1XS5A 1GR2A 2DVZA 4GRKA 2RC9A 2ZYMA 3FUZA 3E13X 1UIUA 1MXYA 4JWXA 4ZEKA 2F6PA 5H8FA 2O7IA 1Y1ZA 4IO2A 4X9TA 3I3VA 5HBCA 1L5TA 4HCYA 5CMKA 1AMFA 4DDDA 4OFJA 2HEUA 1WDNA 4ZEFA 3B7DA 2UXAA 5H8QA 3K6WA 2I3VA 4R72A 1O64A 4ELQA 3Q29A 3B6TA 2Q89A 3VFJA 3QXMA 4BLAA 3Q27A 2O1MA 2OJTA 3K01A 1NNTA 2HCAA 3U1OA 4EQBA 1ZIUA 3QIMA 3K00A 4F19A 1Y20A 3K1MA 1UQWA 5A5XA 3K6VA 1MRPA 4U1OA 1D9YA 3SEVA 2XXYA 3RLFE 1WVJA 3IO6A 2F35A 1R9LA 1H44A 4G2ZA 4OWDA 3MC2A 4O3AA 3T22A 4R9GA 1EZ9A 1LAFE 4HW8A 2HXWA 3U72A 1ZJLA 1JW4A 1M5EA 5CMBA 3T9UA 3VVFA 4L17A 4JXIA 3UORA 5I58A 4LQ5A 1CB6A 3DLNA 2AYSA 4P11A 3KEIA 1B6HA 3DELB 4M4GA 4EDPA 1USYE 4YKJA 3IR1A 3R26A 3K0VA 5AE4A 3FATA 2Z23A 1HSJA 3ILUB 4Z0IA 2DSFA 3KOSA 4M1VA 3I5OA 5F1QA 3C9HA 4GVOA 2O68A 3CG1A 3GLBA 4OXVA 5IAIA 1Y9UA 3TZAA 5I57B 1FQFA 1MXVA 1P1UA 1OLCA 1FQEA 1P1NA 1XOCA 4IO4A 2PYYA 3C33A 4KCDA 4H8JA 1OQHA 1JEVA 2OZZA 5DVFA 2XXWA 1SW5A 4EQ9A 4F31B 5B70A 3IB2A 1FQBA 4BDNA 3M3FA 2NUVA 3QUFA 1MY1A 1IXHA 4C1TA 3BFUA 1LBBA 4FORA 4YKIA 1B3LA 4P0IA 4N07A 2Y7PA 2RC8A 4F3GA 2F97A 1II5A 4I62A 4Z7EA 1NNFA 4Q8RA 3D4CA 2V3QA 1D9VA 3RPWA 4RYAA 3MQ9A 5KDTA 3HHFA 2YLNA 4TOZA 3EHTA 2VD3A 1IXCA 1MXXA 4ZEDA 5I56A 3USDA 2VD2A 5CC2A 2REJA 1MY2A 1I6QA 3E3KA 5BWJA 3MPKA 2E0SA 1OQGA 5JEIA 4QSDA 2DXRA 1FCKA 1B32A 1N3XA 2RKMA 2I49A 1HSEA 3O6GA 4R6HA 1B51A 1QVSA 3SERA 3GXAA 3MAMA 3KN3A 1D4NA 2OCUA 5K2YA 3MZ9A 5CMCA 2ZMBA 3EF7A 1MH4A 2QS1A 4OYVA 5DEXB 3O6IA 4E0XA 1BLFA 2ABHA 2DE2A 1S9TA 1LAHE 4F39A 2XXQA 3MZBA 3SEXA 3IOVA 3OELA 4IY6A 1OLAA 1FTJA 5F7VA 3LSLA 2Z8DA 3A3UA 3SDFA 2UVHA 2Q8JA 4EXKA 1KWHA 4R6YA 2DE4A 1IITA 2D21A 3EHUA 3TYHA 3LSXA 3RN8A 1I6AA 2M8CA 4F2QA 3TELA 1UTHA 2Y7WA 1PB7A 4XTCQ 1PB9A 3FXUA 3KBRA 1MM7A 1FQAA 2DE3A 3BFTA 1MS7A 3MP6A 3LUYA 3HHGA 3KJTA 5JTYB 2P2AA 3FIRA 3C34A 2XXHA 3C32A 3TQLA 2D3IA 5FTIA 5TU0A 1MY4A 3LSWA 1ZBMA 2Z22A 1EZOA 2REGA 3FVNA 4DLDA 4UA8A 4TQUQ 1R9QA 4OEVA 3DP8A 1BIYA 2NVUB 1B7HA 4YB7A 2F7CA 3WAEA 1EH3A 4KPTA 1UIVA 2I4BA 2XHDA 3O66A 2VGQA 1B58A 3H06B 1QW0A 4MH5A 2ONKE 4Q30B 4RPNA 2Q2CA 3HN0A 1MDP1 3OOAA 3MZ1A 3GBBA 4G8NA 1N0TA 4BDQA 3THIA 4DZ1A 1MY3A 1BTJA 2O6AA 5M2VA 1POY1 3ZKKA 4F22A 4OZ9A 2THIA 4N6PA 1QUIA 5TPAA 3JZJA 4RK9A 1AH5A 5EYFA 1Y3PA 2ONSA 2DQVA 1B2HA 4QHQA 5ITOA 4IO5A 4XKNA 4RJZA 3T93B 4U1ZA 4R2FA 1MQDA 3MVXA 4IO3A 2F5XA 5H8SA 1NL5A 5DYHA 3IL1B 2CMOA 2VP1A 3TUSA 1MPBA 4ELPA 5H8NB 3PD8A 4NTLA 3T96B 4R75A 4YU0A 1PBPA 3U92A 2F36A 1Y4TA 1IQ7A 3OSRA 1AIVA 3HSTA 3L6GA 2ESNA 5CI5A 1N3WA 3ONMA 3TFLA 2OWSA 3VE1B 3K6UA 2QSXA 2V93A 3G3IA 4LQ2A 3B6WA 3RQTA 1LCTA 5ISUA 4KHZE 5H8FB 2FNCA 2FYIA 1P1OA 2F6GA 1LSTA 1AL3A 1JETA 2XXRA 1NH8A 2XXTA 5H8QB 3PPOA 1Y4CA 3LR1A 4NEDA 3G3HA 5AA2A 3KZGA 2X7QA 1USYH 2AL5A 1D3KA 5L9MA 1SI1A 1Z7ME 4EXLA 3MBPA 4OETA 3FD3A 2A5TB 2WKYA 4PFWA 3A3CA 3HCQA 3AXFA 5A5XB 2Y7IA 3VLUA 3DP4A 3SESA 4OQOA 1P1QA 1SBPA 3MP8A 3FJ7A 4JWOA 4YB5A 4GXAA 3SKPA 2XD2A 3OO7A 1RYOA 2Z8FA 1BP5A 5DVJA 2QJEA 4WEPA 2A5TA 2ANJA 3TAJA 2ZXTA 1IXIA 1NKXA 5ITPA 3IB0A 4U22A 1LAGE 1N04A 2QS3A 2ONRA 4FJPA 1DTZA 1P1WA 3WAFA 3TEPA 1FTLA 4KR5A 3PPQA 3K6XA 2H4IA 2UYFA 2X26A 4JDFA 1QKBA 3H7MA 1HSLA 4YZZA 2NXOA 4BDOA 5I58B 4IB2A 3FXRA 3S9MC 2HZLA 3JYRA 2V3TA 3QYTA 4R6KA 2ZNSA 4OTEA 1VSOA 4I8CA 2XXUA 1B5JA 3HPIA 4O3BA 4R2BA 2I4CA 5J1DA 3RT6B 4OFOA 3T9VA 3KJ7A 3IK6B 1UTBA 4OENA 3EN3A 3FJGA 4NMYA 1PB8A 1PBQA 4U23A 1A40A 3FGSA 2IA4A 1IIWA 1DPPA 2HAVA 3RT8A 3CI8A 3HO7A 4ZZEA 2QMWA 2QS2A 3LBSA 1R6ZA 5I59A 1GVCA 1B3HA 3MUQA 1FTMA 1LCFA 3T66A 4ECFA 1NFTA 3D4GA 4QF9A 3IOTA 4XKRA 1JVXA 3PPPA 4KYDA 2DWIA 4G68A 2DVCA 4ZE9A 1ZLQA 1URDA 4NF8B 2UVGA 3O29A 4EF2A 3VLWA 2RINA 5K2XA 1B9JA 1SVXB 2ZYKA 1TFAA 1DTGA 3S9NC 3IOWA 3VXCA 1VE4A 5KZTA 1B3FA 2QMXA 3RNNA 3N6UA 3MP1A 4NF5A 4F1YA 2DS9A 4NF8A 4QFPA 1XVYA 2DYXA 3EPEA 5DTBA 2O51A 2DWAA 4LP2B 4JBZA 5KDTB 3LC8A 1B7UA 3R6UA 3HV1A 3IORA 1M5FA 5L9SA 3P7IA 4XKQA 3C35A 4H67A 2O69A 4BDMA 2PMSA 4ZZAA 3OEMA 5I56B 2H25A 4POWA 3OXNA 1H3DA 3UIFA 3KN7A 3KGCA 4YMAA 1RYXA 4IO6A 1MQIA 1Y3NA 4QRZA 4O3CA 5HPQA 1OMPA 1RKMA 2Y84A 3TTLA 3TTKA 2KLFA 4AB6A 4OESA 4R9FA 2R6GE 3U94A 5I2NB 1VFEA 3L6HA 1A8FA 1YCJA 4YAHX 3PGFA 5EHSA 4OMBA 2YPNA 2ZNTA 3O97A 1LGBC 1QULA 2XXXA 5I2NA 5AA4A 4H1XA 1DOTA 2VOZA 1H45A 4U4XA 1WODA 3FZVA 4QFNA 5H8HA 5DVIA 3UK4A 1SDXA 3O9PA 1A8EA 4RXLA 4DXUA 1OVBA 4FECA 5CBSA 1N7XA 1M5DA 3FV2A 5FHNA 3IX1A 3K1PA 4FE8A 3SETA 2OBGA 3O6HA 4FEBA 1UTHB 2RC7A 5IKBA 2R71A 4RPOA 1FTOA 4JB7A 4PE5B 3CIJA 3IJOB 4GD5A 4OEUA 1B46A 2NOOA 4N13A 3TMGA 1US5A 3G3KA 4H6DA 2G29A 4GFRA 4IGRA 2H9BA 4IO7A 4THIA 4LVQA 5B7DA 1JW5A 1QJMA 1YPNA 1B52A 4F1VA 4U2RA 3OO8A 3RUMA 1LAXA 4H0WA 4RK2A 4LONB 4JSDA 3S2VA 4F18A 1MXUA 4ONYA 1URSA 2XXVA 3CFZA 1NNPA 4WXJA 3C4MA 3EHSA 1MDQA 3B6QA 3VDFA 4LZ8A 5ICQA 2B65A 1SW4A 4LA9A 1A55A 1GGGA 3GZGA 1ANFA 5AA2D 2H5YA 3PPRA 5TPAB 2F78A 2V84A 4KYEA 4PETA 3UGWA 2Q88A 2HAUA 3RGYA 1TT1A 3IOUA 3Q26A 4ELOA 4Q5TA 3W9WA 4ND9A 1FQDA 4YICA 4X1DA 2RCAA 5CMMA 3M8UA 4PQJA 3H6VA 1MY0A 1B4HA 4GL0A 2F34A 3G3GA 5I2KB 1Z7NE 2RF1A 2QS4A 3SEYA 4GXSB 2GHBA 4H8IA 4HTGA 1MM6A 1FTKA 4OVJA 1IXGA 1B4ZA 4RA1A 1MQHA 1QUKA 4YMBA 1JVYA 4R73A 1SD3A 3S9LC 5I2KA 5TP9A 4NWDA 3QK6A 3G3FA 3FVKA 3KOTA 5KCJA 1XT8A 3TQWA 2AIXA 4X48A 3OO9A 2PT1A 4LUBA 1N84A 5CM6A 2Z8EA 4NF4A 3S4UA 4QFLA 3A09A 1DSNA 3ODBA 1US4A 2B3FA 1MPDA 5I84A 3IAZA 5JK4A 2Y7KA 2HZKA 1VFDA 2P0SA 5L9OA 4YB6A 4DCYA 3TPAA 4EQ7A 5FTHA 1FW0A 4PFUA 3W15C 4NF6A 3C36A 4G8MA 3T9XB 5AA2B 1MXZA 4PP0A 4ESWA 3H6UA 4F3BA 3TCGA 3CSBA 4ESXA 1SI0A 2IEEA 4RNSA 1A54A 3W9VA 3FXQA 2I3WA 1URGA 4TLLB 2E1SA 4DIGA 4WKMA 4DCXA 3ILTB 3CRBA 3K02A 3U8QA 2F7AA 4G68C 4K3FA 3M3KA 3KSJA 2QPQA 2GHAA 3VLVA 4H5GA 3OO6A 1S50A 4NWCA 3U93A 1F9BA 1JQFA 1Q1KA 1IUDA 2V25A 2DWJA 1DPEA 3CSGA 2FA7A 1POTA 4GLIA 1O7TA 1B5IA 2NWJA 4F1UA 3PV0E 4I1DA 1UTBB 1NMUA 3CFXA 3TCHA 5ICTA 4GQOA 1N7WA 3PD9A 2DWHA 1DMBA 1T0KA 2D5WA 3OENA 1B40A 4LATA 1TFDA 1SW2A 3TODA 1XHYA 2H98A 1ATGA 3QUJA 3PUYE 4QFKA 5I59B 5DT6A 3RTFB 1B05A 1YTVA 4G8HA 3MVYA 4DE8A 3MWBA 4G68B 3FJMA 3KSXA 4GWOA 1LBCA 1MQGA 2O7UA 1LLSA 3TKDA 5EHMA 3QAXA 3Q28A 1SYHA 3ECRA 4XIGQ 1OVTA 4YKPA 2I0CA 3K2DA 4NF5B 4U21A 4X1BA 4KQPA 2XX9A 1JEUA 3RTWB 4RY1A 4FEDA 3CR9A 2LAOA 4P0GA 3FVOA 1M5CA 2DOJA 4QSEA 3N94A 2BJJX 1IEJA 1TXFA 4KFQA 4ZEIA 2PVUA 2Q9TA 4C0RA 2R9JA 1YAEA 3O2AA 2ALUA 3KN8A 4ZEBA 4F29A 2H99A 2UVIA 2ZNUA 4R74A 1MQJA 2XXIA 3IB1A 4ZS9A 5I57A 4LZ5A 1A99A 3H03A 2I6EA 2QL3A 1EZPA 2P1SA 4G77A 4HS7A 2ZYNA 3M3LA 3IJXB 3CG3A 3UN6A 5FHMA 1QUJA 3FVGA 3UP9A 4F3SA 5HM4B 3ZS6A 1B7ZA 2PX1A 2B3BA 1CE2A 4E0WA 3PMWA 1LB9A 5AA4B 3N6TA 4BDLA 5LOMA 2ZYOA 4UACA 1P99A 1PC3A 5H8HB 1XC1A 4H5FA 3BBRA 4POXA 4EF1A 4JSOA 1MXWA 3KFMA 1NH7A 3PMXA 2XX8A 3OSQA 2XX7A 3RY3A 2Y7RA 4LZ7A 1ZMGA 1H43A 5FHOA 4QSCA 3LSFB 4GIZA 3PUWE 4AQ4A 2A5SA 2XXPA 3EQ1A 1Q35A 1LFIA 2YJPA 3G3JA 3H6WA 3F11A 2G93A 2CZLA 4KD5A 4OFLA 3SEUA 4Q0CA 2XD3A 3PMVA 2Q2AA 2W7YA 2I48A 1EU8A 2F8DA 4PFYA 4KCCA 3N26A 1MH3A 3FV1A 2I58A 4EUOA 4IY5A 5AA3A 3E9XA 3MJNA 1ZKBA 2RCBA 1H76A 3GBAA 5BUUA 1Y1MA 3PUXE 3MW0A 4FAJA 1B5HA 1J1NA 4WEDA 3OEKA 3MPLA 1JW1A 5L8DA 3OMBA 5DEXA 4GL8A 4C1UA 1B3GA 2VHAA 4OHNA 3N5LA 4XXUA 3BKIB 3H4ZA 3V5AA 3PUZE 4MLQA 1SQYA 3TTRA 1ZTYA 2OLBA 3UA8A 5ELVA 4QFOA 1B3EA 3VVDA 1LB8A 1O63A 1GTKA 4XKPA 4DXCA 3K1NA 1XVXA 1OIBA 1MG1A 5CBRA 3H3GA 1S7YA 1SYIA 4ZE8A 3Q25A 4H65A 4JWYA 3VV5A 2OK2A 1N76A 4G4PA 4ELRA 3OD7A 5AA1A 2O84X 3H6TA 1IZ1A 4BDRA 2AL4A 4GOTA 3PU5A 4ZDMA 3TCFA 2DXYA 2HFBA 2F7BA 1QKAA 1R1NA 3V89B 4NE4A 1B1XA 5JTYA 3PPNA 3ZSFA 1SW1A 2UVJA 3S9EA 1LFGA 4MF3A 3ZKLA 1TWYA 3V8XB 2UYEA 1AOVA 1Y3QA 2GRVA 4MLVA 4DXBA 4I9DA 1M5BA 2QRYA 3CVGA 3O28A 3VVEA 4F2OA 3JV9A 1PDAA 2X7PA 3MVWA 5TP9B 4YKKA 4OERA 1I69A 1GV8A 4MFIA 1BKAA 4MBPA 5KCJB 3K4UA 1B0LA 2O1LA 4AB5A 3SEWA 2I0BA 4TLMB 3G7WA 2DP8A 1NNKA 3TTNA 4NF4B 5CRYA 2GFEA 3IO4A 3FASA 3CFLA 3MVZA 4ISUA 3TTMA 1MPCA 3E4RA 2GH9A 4F3PA 2PT2A 4FATA 1JNFA 1ZU0A 4FIMA 1B1HA 4NF6B 4PFTA 3PUVE 4IGTA 4KI0E 4GF8A 1I6BA 1FQCA 2PBWA 3T9HB 2HQ0A 4KYSA 3KG2A 3TDJA 1LFHA 1ELJA 1B0HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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