3TA9A

Beta-glucosidase a from the halothermophile h. orenii
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
449
structure length
448
Chain Sequence
AKIIFPEDFIWGAATSSYQIEGAFNEDGKGESIWDRFSHTPGKIENGDTGDIACDHYHLYREDIELMKEIGIRSYRFSTSWPRILPEGKGRVNQKGLDFYKRLVDNLLKANIRPMITLYHWDLPQALQDKGGWTNRDTAKYFAEYARLMFEEFNGLVDLWVTHNEPWVVAFEGHAFGNHAPGTKDFKTALQVAHHLLLSHGMAVDIFREEDLPGEIGITLNLTPAYPAGDSEKDVKAASLLDDYINAWFLSPVFKGSYPEELHHIYEQNLGAFTTQPGDMDIISRDIDFLGINYYSRMVVRHKPGDNLFNAEVVKMERPSTEMGWEIYPQGLYDILVRVNKEYTDKPLYITENGAAFDDKLTEEGKIHDEKRINYLGDHFKQAYKALKDGVPLRGYYVWSLMDNFEWAYGYSKRFGLIYVDYENGNRRFLKDSALWYREVIEKGQVEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 1
publication title Expression, purification and preliminary crystallographic analysis of the recombinant (beta)-glucosidase (BglA) from the halothermophile Halothermothrix orenii
pubmed doi rcsb
source organism Halothermothrix orenii
total genus 162
structure length 448
sequence length 449
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ta9A00
1E9LA 4F9JA 4OUEA 1UUQA 3UCQA 2V5DA 4DWSB 3CZJA 4GZIA 4V27A 4NZCA 1VAHA 2YA0A 3GBEA 2JIWA 5A8QA 3WUEA 4C7FA 3EBVA 1JNEA 3SCSA 1MXDA 3FAWA 2YDSA 2OLHA 2VVNA 3IK2A 1UWQA 2EPKX 1XSIA 2J8GA 1MWOA 2BS9A 3MU7A 4IPNB 2CEQA 2XVGA 4CU8A 4CCDA 2CNCA 3LPGA 1VJZA 5CPTA 3ARVA 2X8RA 3N18A 1WAWA 4PMQA 4UOQA 3AXHA 5E09A 1CXLA 3AZRA 1HX0A 1HJWA 5A6SA 1WZLA 4PMVA 1NP2A 1Q6GA 4M81A 4ATLA 1BSIA 3RJYA 1TVNA 4M80A 2J25A 4V28A 4P7LA 1GCYA 4B16A 3LPFA 3O9NA 4M8UA 4PUEA 2J79A 2WLZA 1LL6A 1MQQA 4P8UA 3ALFA 1CLVA 1AQHA 1UZ4A 4XZWA 1UWIA 4WJXA 5DT5A 1G01A 3GXIA 4DWSD 1M04A 1HP5A 2QF8A 1ZB5A 1QI2A 1PEZA 1XH2A 3APGA 2BVTA 1LG2A 1UKSA 3TTQA 7TAAA 3AIQA 1KR1A 3CHEA 2RGMA 1E15A 4J3SA 3AIUA 4D6FA 4GXPA 4E8CA 2CKRA 3FN9A 1JZ5A 3SCRA 2G8ZA 4D6DA 2XFRA 4KGJA 4URIA 1GORA 1HJUA 3SCOA 4AZHA 4AIEA 3K8MA 1DHKA 1HXJA 1CLXA 3ZJ6A 3L2LA 1JZ2A 5M5DA 2D0FA 4D6CA 3AI0A 1GOMA 1QPKA 1VEOA 3ECQA 3W38A 3CZLA 4W5UA 2XVLA 1OINA 2C7FA 1G1YA 2J7GA 3QGVA 2BY1A 3PZMA 1XD1A 3VGGA 1H0GA 1LL7A 4CN1A 5I77A 2IUZA 5KZ6A 3W25A 2ZUTA 1C92A 4PCSA 1JDCA 2DSUA 3PHAA 4OKDA 2VI0A 2BY0A 4Q7NA 3A4WA 2OWWA 1WKYA 5E0FA 4HOWA 2WMJA 4H8UA 1DWHM 1CGTA 1QNRA 3NYDA 4W87A 2WANA 1B90A 1MYRA 3U57A 2WC3A 2VZVA 4YHEA 5ABEA 3L4UA 1EXPA 4JCLA 1PAMA 2XG9A 1QBBA 5CXPA 4RL3A 3AS2A 3AOFA 3NSMA 3ZM8A 3CZEA 4J3WA 4HZ8A 3WY1A 4ZEPA 5GNXA 5D9OA 1JI1A 3MUY1 1OWQA 1ZL1A 2YA2A 3GTNA 3BH4A 3F4VA 4GQRA 1BAGA 4JFTA 4JL1A 2JEPA 3OGRA 3CH9A 4PMXA 1V0KA 4UTFA 2TAAA 1QW9A 4PEEA 2DIJA 4OZOA 1HJVA 3TONA 4AEEA 1UHVA 5BYWA 3AHZA 4GINA 2VTFA 1EDTA 1UH3A 1W1PA 5GNYA 2ZUWA 1RH9A 1KCLA 1I1WA 3ARZA 1DWGM 4UZUA 3AIEA 2VZUA 2VCCA 4D71A 1QHZA 2D2OA 4EK7A 1V0MA 3ZMRA 4MADA 1BHGA 4IISA 3AYSA 1ZJBA 3N04A 1UD4A 4YN5A 3N15A 1PX8A 3BC9A 1V3IA 2WC4A 4J27A 4P7QA 2WBGA 1E5NA 2PF0A 3U5YA 3PTKA 4FK9A 7A3HA 5A69A 1KXVA 2DH2A 3SCPA 1KBBA 4P8VA 7CGTA 1X6LA 3BCFA 4EKJA 1BGGA 2Y24A 1X1NA 1E5JA 2CITA 4N42A 4JFWA 2J7DA 2UWFA 3SCTA 1B9ZA 2IXVA 4MDOA 2VZOA 2OSXA 1HJSA 3E1F1 2BXYA 4MDPA 3K4DA 1C93A 4AW7A 1NWSA 1VB9A 3MUAA 1CBGA 4WKHA 2NW0A 3WNMA 1UQYA 2BHZA 4JIEA 4PYSA 5HXMA 4HZ7A 5CGMA 2NT0A 3OZOA 3J7HA 3ZQ9A 2XM2A 3WEZA 3GM8A 4UCFA 1F4HA 3AISA 3NDZA 5IDIA 3WELA 2FHCA 2YBUA 1FHDA 1JGIA 1E70M 1RPKA 1EGZA 2GVYA 2RGLA 2YBTA 4BQ4A 4HMEA 1E55A 4TX8A 2ZUMA 3T0DA 5CPQA 2BHYA 2G3IA 3EDJA 3VDHA 2DT1A 3AIRA 1HKIA 1GQLA 2QLYA 2PBOA 3GXMA 1E56A 3VU2A 3L4TA 3ZO9A 3U7BA 3WQ5A 1V0NA 3CHCA 4EAMA 1DWJM 1GQIA 4S3JA 5CQ1A 2PWDA 3MKKA 3UETA 2E8YA 3KL3A 3ZT7A 4YHGA 2OYLA 1GVIA 3W6LA 3BCDA 3SUSA 2ZX6A 3BXWA 3CUIA 1UWTA 1JF6A 2C8NA 2WVVB 2VMFA 4PTXA 4QLJA 2VX6A 1NM9A 2VZTA 3VMNA 4XUYA 3RPMA 5A3HA 4MNMA 3MMDA 4JFSA 5DO8A 1E6NA 4K68A 3N17A 4BQ5A 3RILA 1B2YA 2NT1A 1MVYA 3MS8A 4C7GA 1FH7A 1H09A 2DSWA 3WN6A 1YHTA 1MFVA 4UFJA 2WC7A 5LA0A 1IT0A 3VM5A 2WWCA 1H41A 4AZGA 5BXPA 3AJ7A 1HNYA 2W91A 4OOZA 1E3XA 2GJRA 2D0HA 1FP9A 3WNOA 4W5ZA 2VCBA 3M7SA 3PZVA 3F5JA 1UD8A 1E6XM 2Y8KA 2BY2A 5HNNA 2CIPA 4PTWA 1A47A 3WEMA 4W88A 3WQ8A 2WMFA 1WDPA 2ZWYA 1UOKA 2GJXA 3W26A 1KWKA 3T08A 4AD4A 3BAWA 5EFFA 1YQ2A 4IPLA 1KQZA 1UZ1A 1WZMA 5A6BA 5F7UA 1HKMA 4DUWA 1V6UA 4AD3A 2Q8XA 2VJXA 3VGFA 1LQ0A 5IHSA 3FAXA 4ML4A 4EE9A 1EDGA 3FHAA 2CBIA 3PTMA 6CGTA 4GKLA 1LWHA 3BSHA 4GO9A 4KGLA 3B9AA 3WF0A 4PSRA 3AIBA 2JF7A 1OD8A 2O9RA 2W67A 1WDQA 3SCUA 2X05A 2V5CA 1OT1A 2GSJA 3O6AA 3N11A 3WD4A 2X0YA 1GOIA 2EPOA 2W62A 1HIZA 3VGDA 3WDRA 2WYSA 2J74A 2OYKA 5AC5A 5DFAA 3MUZ1 5A2AA 1DEDA 1JZ3A 3CHFA 3AS3A 3WDJA 1UH2A 2J7BA 1JXKA 2YKKA 4AEFA 4PMRA 1P6WA 3AMCA 1FH8A 4DM2A 3QR3A 4JKKA 3L4WA 3EMCA 1J0ZA 3SEPA 1FP8A 2V3FA 3NCOA 4NRRA 3T0BA 1JZ6A 1KB3A 5E70A 4UFLA 4HU8A 1CDGA 1E4NA 5A95A 3DYOA 3WDPP 1BPLB 1QW8A 1S46A 2MANA 2DIEA 3NIYA 4JKMA 4EANA 1NOWA 4GO8A 4QCFA 2E4TA 5DEZA 1SMAA 1DTUA 2FHFA 4PN2A 1GOOA 2ZXDA 1XGZA 1Q4NX 4TXEA 5BXTA 3WF2A 1E1FA 2VRJA 3PZTA 1TA3A 5HPCA 2YL8A 4J3XA 3WH6A 2WVUA 5EMYA 3CMJA 1JZ4A 1TUXA 2W63A 3VX1A 3SCVA 4CVUA 1H0IA 2YDQA 1X6NA 3AHVA 3GXDA 4OBRA 1VJSA 5JBFA 1NOUA 3RM9A 1W9VA 5I0DA 2NSXA 4UQBA 2ZWZA 4AZCB 2VOTA 2CHNA 1XV8A 2F8QA 4BA0A 5IXEA 3ZOAA 4M1RA 1H1NA 1LG1A 2WNWA 3BMWA 1UR0A 3VILA 3OIHA 3WQWA 5D8WA 4GZEA 1I75A 4PRWA 4HMCA 2GK1A 3IJ8A 4X0VA 5CZKA 3SUUA 4FLSA 3MMUA 5LA1A 2VX5A 2Y5EA 3DECA 1TVPA 2CYGA 1C3FA 5A8PA 2HISA 5A8OA 1J0IA 5CLWA 2YLAA 1CZ1A 1UH4A 4MNJA 3PZIA 1GPFA 1UWUA 1J0JA 1XC6A 3HN3A 3T2OA 1LWJA 2PWEA 4ZE4A 2CCRA 3ZR6A 1GHSA 2VR5A 3FHQA 4AD5A 4HTYA 3W6MA 2WSKA 1CGUA 5D9MA 1C91A 3GH5A 1GOQA 2ZXAA 3AIVA 3W0KA 1EIBA 2DEPA 3BMVA 1GW1A 3W4RA 4JL2A 2J75A 1TG7A 4D1IA 3CPUA 2EPLX 2YL6A 4FLOA 2EQDA 3PZNA 2WAGA 5M03A 1W9BM 1R86A 1OGGA 2J7HA 3WF4A 1E43A 2BY3A 4HZ6A 1GOKA 2VQTA 4CCCA 2UY3A 1QI0A 1KGWA 4W84A 4HOXA 1XHGA 4HU0A 5IFTA 4CD8A 3O2LA 3WIJA 1UKOA 4MJ2A 5FL1A 2YJQA 2F2HA 2DT3A 1UKTA 4W8LA 4CD6A 2O9OA 4JCMA 4WKFA 3ARPA 4DWSC 1CWYA 1E6SM 1ZS2A 1TE1A 3EDKA 2G3JA 3TTYA 1CYGA 3VDCA 1IV8A 2CXGA 3GNRA 5A6LA 2XPKA 2A3HA 3LPOA 1XCXA 2DQXA 1VF8A 1O6IA 4DM1A 4KWUA 1V3JA 5KEZA 3SURA 1KQYA 1ZJAA 1J10A 3GDBA 4AZIA 4C7DA 1FA2A 2FHBA 4X0NA 3T09A 2XWDA 1BG4A 2OSWA 2C0HA 1E3ZA 4CUCA 3U5UA 2YL5A 3WH7A 2DPEA 5FOOA 2WVTA 4OOUA 4HA3A 3VD7A 1QI3A 3NJ3A 3CUHA 4U3AA 3U7VA 3ZJ8A 1PX3A 3BAIA 3AHTA 2WMIB 2UY2A 3WMSA 5BXSA 1UR4A 5AC4A 4MTVA 3N9KA 2D3LA 4BCEA 3UR7A 2VT0A 1MXGA 2E3ZA 3GH7A 5A8NA 4ATDA 3KE0A 1V6VA 2WXDM 3A3HA 1EA9C 1HP4A 4JHOA 3WQVA 1D3CA 4OBSA 4TTUA 4H2CA 3OLGA 1VEPA 3QHNA 1JZ8A 3GXFA 2YDRA 2XIIA 1WCGA 4MNLA 1HVXA 1JL8A 4AYSA 1DWFM 1UQZA 5BRQA 2E40A 1HF6A 3ZJ7A 4PTMA 1W1TA 2DSVA 1GUVA 5ABGA 1B3VA 4D6JA 2ZUVA 1V02E 3MO4A 5JIWA 5A6MA 3OA5A 2XM1A 3GZAA 2WBKA 3UEQA 1K9DA 4QFUA 5EBAA 4A3HA 2JIEA 3K4AA 1JYXA 1XD0A 4AC1X 3K46A 4UR9A 2BHUA 1V6YA 1CGVA 2E9BA 5FD0A 4MB1A 1CXEA 4P8WA 4E4PA 3ZIZA 1MW3A 4W7VA 5C8BB 1SYTA 4F8XA 4JKLA 2A3BA 1KXTA 3II1A 4NF7A 1M01A 3MSDA 1JI2A 1RD6A 4QCEA 3DYMA 1E72M 5GNZA 3T2PA 1Y7VA 3OLDA 5CSYA 1EQPA 1NP0A 2VURA 1H11A 3S6TA 3WQ4A 1GJWA 3IANA 1CGYA 1H5VA 1XSJA 4MJ4A 5CSUA 1NWRA 4Z2IA 3OLIA 3VM7A 3AFBA 3L4ZA 4UQAA 3AYRA 4QLKA 1FH9A 1E0XA 1R7AA 1J01A 2QV4A 3VD3A 2X09A 2IXUA 4PMNA 4MB4A 4AIOA 1E0VA 4CVWA 1HKKA 3OG2A 3WNNA 3A4AA 1HL9A 2EXOA 3VD4A 4PUDA 1BVNP 5BWFA 5DMYA 1FFQA 2X2YA 3EDEA 1WE5A 3VGHA 4WF7A 2A3EA 3RO8A 1BGAA 1H4PA 3G6LA 1E73M 1JAEA 1OGSA 4MAVA 1C8QA 1BVZA 3WD3A 2GJXB 4CN6A 1IZKA 1EO7A 3ZSSA 1CXKA 4UFMA 2YA1A 3FY1A 1ZBCA 4GI6A 3CUFA 1Q6CA 4RE3A 4Z2HA 2O9TA 1QNPA 2Z1KA 4JHZA 4M82A 1UR8A 1PX4A 1OSEA 2EJ1A 3VOCA 1ESWA 5D9PA 3CUJA 1PIFA 2WMHA 3IAQA 6A3HA 3WNKA 4W7WA 1HJXA 4U3CA 3CUGA 4H8HA 3EDFA 3PTQA 4XB3A 3WBEA 4PTVA 3ZT5A 2ESCA 1BLIA 2Y4SA 4BQ3A 1OBAA 5D4YA 3HJEA 3UG4A 2ZX9A 1LJYA 3THDA 3F5KA 4YPJA 2WWDA 1B30A 1C8YA 1SR0A 2BNJA 3MV11 4PMDA 3RCNA 4WSJA 2PC8A 2Y8VA 2AAAA 4LXFA 4BZYA 3WBAA 1CGXA 3EYPA 1B3WA 3A6OA 3VPLA 3VD9A 4GPNA 2Z1SA 1HVQA 1SMDA 1JD7A 1Q6FA 2F61A 4ACZA 5CG0A 4A4AA 3WH8A 1GQKA 3T2QA 1OD0A 1XYZA 4R27A 1U30A 3AHYA 3AZTA 2WZEA 2WHKA 1MQPA 3WDHA 5E6YA 2VCAA 1FOBA 1W9XA 3VGEA 2VQUA 1WO2A 5FCZA 3WKZA 4AIUA 2FGLA 2PWHA 5FKYA 2J77A 4AZ7A 1W9DM 2DSKA 4WK9A 2XVPA 4CKQA 1ODZA 1W2VA 5E0CA 1UR2A 3RDKA 4GQQA 4MB5A 3WUGA 1PBGA 1W9PA 1G0CA 2O92A 1G94A 1H3GA 1HL8A 1WB0A 1MW1A 4B3LA 3RMEA 2ZX5A 5AY7A 3RM4A 2OWXA 4HP5A 1PJ9A 4J3TA 2J7FA 4P7NA 1FHLA 1U2YA 1CECA 1TA3B 3EMZA 3M6DA 4KH2A 3VGBA 3B9DA 2VNCA 2QPUA 3AXIA 4PMZA 4AY1A 5GQBA 2VC9A 1JYVA 2XGBA 1CEOA 1D2KA 1V6XA 3I3DA 3W24A 2EO7A 3S2CA 3WL0A 2VO5A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E9L A;  4F9J A;  4OUE A;  1UUQ A;  3UCQ A;  2V5D A;  4DWS B;  3CZJ A;  4GZI A;  4V27 A;  4NZC A;  1VAH A;  2YA0 A;  3GBE A;  2JIW A;  5A8Q A;  3WUE A;  4C7F A;  3EBV A;  1JNE A;  3SCS A;  1MXD A;  3FAW A;  2YDS A;  2OLH A;  2VVN A;  3IK2 A;  1UWQ A;  2EPK X;  1XSI A;  2J8G A;  1MWO A;  2BS9 A;  3MU7 A;  4IPN B;  2CEQ A;  2XVG A;  4CU8 A;  4CCD A;  2CNC A;  3LPG A;  1VJZ A;  5CPT A;  3ARV A;  2X8R A;  3N18 A;  1WAW A;  4PMQ A;  4UOQ A;  3AXH A;  5E09 A;  1CXL A;  3AZR A;  1HX0 A;  1HJW A;  5A6S A;  1WZL A;  4PMV A;  1NP2 A;  1Q6G A;  4M81 A;  4ATL A;  1BSI A;  3RJY A;  1TVN A;  4M80 A;  2J25 A;  4V28 A;  4P7L A;  1GCY A;  4B16 A;  3LPF A;  3O9N A;  4M8U A;  4PUE A;  2J79 A;  2WLZ A;  1LL6 A;  1MQQ A;  4P8U A;  3ALF A;  1CLV A;  1AQH A;  1UZ4 A;  4XZW A;  1UWI A;  4WJX A;  5DT5 A;  1G01 A;  3GXI A;  4DWS D;  1M04 A;  1HP5 A;  2QF8 A;  1ZB5 A;  1QI2 A;  1PEZ A;  1XH2 A;  3APG A;  2BVT A;  1LG2 A;  1UKS A;  3TTQ A;  7TAA A;  3AIQ A;  1KR1 A;  3CHE A;  2RGM A;  1E15 A;  4J3S A;  3AIU A;  4D6F A;  4GXP A;  4E8C A;  2CKR A;  3FN9 A;  1JZ5 A;  3SCR A;  2G8Z A;  4D6D A;  2XFR A;  4KGJ A;  4URI A;  1GOR A;  1HJU A;  3SCO A;  4AZH A;  4AIE A;  3K8M A;  1DHK A;  1HXJ A;  1CLX A;  3ZJ6 A;  3L2L A;  1JZ2 A;  5M5D A;  2D0F A;  4D6C A;  3AI0 A;  1GOM A;  1QPK A;  1VEO A;  3ECQ A;  3W38 A;  3CZL A;  4W5U A;  2XVL A;  1OIN A;  2C7F A;  1G1Y A;  2J7G A;  3QGV A;  2BY1 A;  3PZM A;  1XD1 A;  3VGG A;  1H0G A;  1LL7 A;  4CN1 A;  5I77 A;  2IUZ A;  5KZ6 A;  3W25 A;  2ZUT A;  1C92 A;  4PCS A;  1JDC A;  2DSU A;  3PHA A;  4OKD A;  2VI0 A;  2BY0 A;  4Q7N A;  3A4W A;  2OWW A;  1WKY A;  5E0F A;  4HOW A;  2WMJ A;  4H8U A;  1DWH M;  1CGT A;  1QNR A;  3NYD A;  4W87 A;  2WAN A;  1B90 A;  1MYR A;  3U57 A;  2WC3 A;  2VZV A;  4YHE A;  5ABE A;  3L4U A;  1EXP A;  4JCL A;  1PAM A;  2XG9 A;  1QBB A;  5CXP A;  4RL3 A;  3AS2 A;  3AOF A;  3NSM A;  3ZM8 A;  3CZE A;  4J3W A;  4HZ8 A;  3WY1 A;  4ZEP A;  5GNX A;  5D9O A;  1JI1 A;  3MUY 1;  1OWQ A;  1ZL1 A;  2YA2 A;  3GTN A;  3BH4 A;  3F4V A;  4GQR A;  1BAG A;  4JFT A;  4JL1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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