3TAOA

Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SRKPLIAGNWKMNLNHYEAIALVQKIAFSLPDKYYDRVDVAVIPPFTDLRSVQTLVDGDKLRLTYGAQDLSPHDSGAYTGDVSGAFLAKLGCSYVVVGHSERRTYHNEDDALVAAKAATALKHGLTPIVCIGEHLDVREAGNHVAHNIEQLRGSLAGLLAEQIGSVVIAYEPVWAIGTGRVASAADAQEVCAAIRKELASLASPRIADTVRVLYGGSVNAKNVGDIVAQDDVDGGLVGGASLDGEHFATLAAIAAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structural and functional characterization of Mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 99
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3taoA00
1YDOA 4LTSA 3L0NA 3TQVA 1DBTA 5U4NA 4CLMA 3BGGA 3MWAA 4UR8A 3UXAA 3MBDA 3LBCA 1TPUA 4UTHA 1KFKA 2LLEA 1XKYA 4JNMA 4KFNA 3W83A 3RLVA 3FA5A 1MZHA 5CPLA 4PTNA 1OK4A 1OF8A 3U2OA 5TQLA 3CHVA 2UV8G 3P82A 3LCFA 2YFNA 1GG0A 2FTPA 4H3DA 3F03K 1XFBA 2NUWA 2V2DA 2F84A 2B7PA 4M7SA 3W2UA 3TX9A 1PV8A 1TJRA 4K7VA 5HUPA 3DFNA 2VXNA 3WJYA 1F73A 5D09A 3L5LA 1D3HA 2WSYA 5KZMA 3PM6A 3C2FA 3OBKA 2XN2A 3S1WA 1EPXA 1H7WA 3ZWTA 4Y90A 1J4EA 2YR1A 4WOQA 2WSRA 3MYOA 3NL6A 1R2TA 4CQAA 1B4KA 1W5QA 3N14A 3FIGA 1TPB1 4X2RA 1TPDA 1J2WA 4UFLA 1GZGA 2NWRA 3KRSA 4OU1A 5D33A 4MKNA 5LKYA 1TPVA 3SGUA 4O13A 2BTMA 3HJZA 1B4EA 1ZHAA 4O50A 3TNOA 3RK8A 3SR7A 1JCNA 2I1OA 2V8ZA 4GUIA 4HHPA 5HWJA 1ZY9A 4HNTA 3E02A 1MSSA 1GQNA 3R13A 5CZ0A 3LDVA 3P62A 3O6CA 2Z6IA 4CCEA 3W7GA 4EOUA 4GXMA 4FF7A 1F6PA 3TK7A 3DFQA 1GPWA 4Z08A 3M6YA 3NPVA 3VI2A 2ZZ1A 1FXPA 2YGYA 4S2CA 1CW2A 5K7JA 3SIZA 3NQFA 1C29A 3TAOA 4NXKA 3VE9A 3STFA 1Q6RA 5F2GA 4J9JA 2E68A 1JVNA 2ZTKA 3VFLA 4AB4A 3CM4A 2C3ZA 1IXPA 2A21A 4TIMA 1C8VA 3UYCA 4LT9A 1ME9A 3TCEA 1TTIA 3CU2A 4NXSA 1CX9A 3O06A 4PEKA 3BW2A 4GJ1A 5LSMA 4O14A 4DPQA 3EWYA 3W23A 3H53A 4P2VA 1A5SA 4O11A 4IMCA 3LLFA 1UUMA 1JCXA 4IUOA 4TMCA 3KOFA 4HKPA 3FYOA 3M44A 3KRUA 4MY8A 1OFQA 3E49A 2CLKA 1GVFA 4JTJA 1JQVA 3TQ0A 3PR2A 4OWGA 1G69A 2OT1A 1EUNA 3HO8A 4Z1BA 1XDLA 5D2YA 4R53A 4IXXA 3HF3A 5BMWA 1EWEA 4RJEA 1EWDA 3QYQA 3TV8A 2ISSA 3IIVA 5H91A 2E5CA 4FB7A 4JTUA 4NJIA 5AYXA 4NX5A 4IJBA 3TKFA 5EA9A 3LHWA 1IXNA 1OFOA 4O8RA 4KWWA 1TTQA 1FDJA 4JX6A 3N2XA 3N9SA 3B8DA 3IGUA 4KKXA 3HPSA 4XBSA 2NX3A 2FB3A 4Z1CA 2CZ5A 1YXDA 3I65A 3LV5A 3ABOA 4B5NA 2I14A 3MUXA 4WOZA 2YYTA 4IXHA 1DHPA 4E2BA 1EX5A 3DZ1A 2R8WA 2ZCGA 4LY8A 4Y9AA 5DY2A 1BKSA 2VOMA 4GFSA 3V1PA 1KM3A 2OJPA 3QW4B 5G1TA 3NQ6A 2VFGA 3B0VC 1H5YA 3LI0A 4UNKA 4AWUA 3MO7A 2E5DA 3CEPA 3S1VA 3P5YA 5DBTA 5K3VA 4UUIA 2YW3A 2ZA1A 2BSLA 4JXCA 1KFCA 3FOKA 1GWJA 3W2JA 4FX8A 1QOPA 3W7DA 5AFDA 5FEWA 2Y85A 4O0ZA 1V7YA 4O1AA 2C6QA 3R8RA 2QCDB 2B7OA 1SZFA 4M6PA 4GUHA 2VFIA 4I7VA 3IEBA 5DCBA 3ZFHA 3IRDA 1KTBA 2H90A 4N9DA 5G5IA 1YTEA 4K36A 4GBUA 4MYAA 2GJNA 3QQ0A 3LGEA 1OFPA 2TMDA 3EX2A 3W7MA 2QCFA 3DKLA 3P5ZA 2CLMA 2GJLA 3LBMA 4JTSA 3ABRA 1K8YA 1OYCA 1LLWA 2KZHA 4K38A 2JK2A 3IIZA 5K9XA 1GVSA 1P0KA 3NQ7A 3GR8A 1JULA 2DU2A 3NG3A 4RR4A 2P1FA 4MY1A 3P60A 4QSHA 3N73A 2C19A 3W7NA 3S8HA 4PA8A 5LHEA 4HIBA 5F4SA 4AXKA 3C3NA 5FEXA 6TIMA 1KBJA 1QAPA 3GX9A 1X1ZA 1FWNA 4MZ1A 3G0XA 5HNRA 2H3BA 1G7UA 5DBUA 2HTMA 5HR6A 2DJLA 1H60A 2NWSA 1TV5A 2Y7GA 4RZ5A 1G7VA 4S1FA 3HG2A 1YXCA 1X8FA 4AAJA 2ZRYA 1H7RA 3CLMA 2FQIA 1NF7A 2DZXA 4A2RA 1W3TA 1JJKA 1H50A 1TMHA 5HWMA 3CEUA 4O1DA 1PCKA 1D3GA 4X3ZA 1H7OA 3PBVA 2EAWA 3L66A 4LV9A 4RKAA 3THQA 4JTGA 3NL5A 3PBUA 3W1RA 2A1YA 2ZBTA 5D2XA 4Z1DA 3S5YA 1HO1A 4EF9A 2WQPA 4XTIA 1NFBA 3CWOX 2YW4A 4NT0A 3W1QA 4CCDA 3WK0A 3C0JA 3E96A 1KM2A 3SW6A 1VR6A 2C13A 4DPPA 4O52A 3LXAA 4JTEA 3MHGA 1W5OA 1W5NA 3GVGA 4G1KA 5AHEA 3MW7A 1A5CA 3BG9A 4DXVA 3GLCA 3L68A 4LS2A 3PBWA 2QCHA 5LGXA 1SQ7A 1QPNA 4FO4A 2H8ZA 2Q8ZA 2WOQA 1GJPA 4IGHA 4EIVA 1TPWA 4FIRA 4LNYA 4Y8FA 2VEIA 4JTFA 4MPQA 3OVPA 1H51A 1HTIA 4RX0A 3CIWA 4DO5A 2ZDRA 4ZQNA 1LLZA 1I4NA 1VC4A 4FNRA 5HINA 3NEVA 4JTIA 3W86A 1LRQA 1FBAA 3HG3A 4FXRA 5AHNA 3M7WA 4UMCA 3W7KA 5D2TA 3BARA 1XDMA 1T8XA 3HGJA 3K30A 3S5ZA 1OJXA 2Y88A 3D0CA 3LCLA 4AHOA 3BLFA 1W5MA 5F1UA 1H7NA 1TTJA 1M7PA 3KVKA 2A85A 5A8GA 3NGJA 3PS7A 3W7EA 2G97A 1FCUA 2QEZA 4A3UA 3LRKA 3IIPA 1HL2A 3KAOA 1KW1A 1WQ5A 2H8XA 1XBZA 3LM7A 1K7FA 5BOOA 2V5LA 1X1OA 1PL9A 5D30A 5C6MA 2NV2A 2PC4A 5LNWA 4AF0B 2EKCA 3U6WA 4O57A 3O63A 1BWLA 4LW7A 3PG8A 3L67A 3W1AA 3G18A 2YXGA 2C16A 4ORMA 4NQ1A 2RDTA 3CB8A 2DZSA 3HPXA 4LOCA 1VYPX 4DO6A 4YWIA 2VFHA 3RFAA 3M9YA 1F74A 1DV7A 2QJHA 4UTWA 3C2OA 1FCVA 4TO8A 4BR1A 5DN1A 4UR7A 3FKKA 3W7JA 4YCOA 1G4PA 3Q37A 3UWYA 1H61A 2W6RA 3WJWA 2OZ0A 2J88A 1GT8A 1WBJA 3EX3A 1KM1A 1VZWA 5AHLA 3F1QA 1FUYA 4AH7A 4UFKA 1ADOA 3W07A 3I7RA 2WNQA 3GXNA 5KTLA 5F4XA 1ICPA 4ADSA 1PHWA 3UWQA 1O94A 3A22A 1XM3A 4FXSA 2XN0A 3THAA 3HBLA 1N8FA 1T0OA 3DFTA 5K9CA 3NA8A 1GVRA 4DF1A 1DOSA 1R2SA 4NJKA 5G4WA 3LRLA 1KV5A 4JIQA 3ANYA 1ZAJA 1I2RA 4OGZA 1SSDA 1EP1A 3NQ2A 1THFD 2CFFA 4MLRA 3PUEA 4IMGA 1OYAA 4UTWC 3L5AA 1XCFA 4ALDA 2QCCA 1TRDA 4M6QA 3EWUA 3R5EA 4MZYA 5KINA 3CQ0A 3HIJA 3WJZA 2CZDA 3IGSA 3TJXA 1AMKA 4N6FA 1TTPA 3RMJA 5E93A 4O15A 2A7NA 2A2IA 3NVTA 1B57A 5KZDA 3P74A 2A6NA 3T4CA 3OVQA 3TQKA 1N55A 1WYIA 4O4VA 4TU1A 1FXQA 2ZA3A 1XC4A 1P0NA 3DI1A 5FI8A 2F7FA 3LB0A 5I3JA 5I3GA 4IPIA 3TAKA 1VJIA 1OX6A 1LROA 2ZRXA 4O10A 1SFJA 2C18A 2WV8A 3UWZA 1RZMA 4M5PA 3MMTA 1LDCA 5AC6A 4GUGA 2CLOA 3TU9A 1KFBA 3NPWA 1H62A 3M5XA 4N6EA 2FJKA 1B9BA 1YTKA 4RZ4A 3Q58A 1ONRA 1WOAA 3GKAA 1M7OA 3PAJA 4EF8A 3Q94A 2YFOA 3UY8A 1OHLA 5MHBA 2RDWA 3AJXA 1ZJIA 1BTMA 3KVJA 2VFFA 3DKJA 1X7FA 3GDTA 3C2EA 1IIHA 1ZENA 5FF7A 3LTYA 3C6CA 1LOLA 3GB6A 1JUEA 4N9EA 1ML1A 1W5PA 3FEMA 2ZQ0A 3S5NA 3E9AA 5T26A 2FPVA 5I3KA 3SZ8A 3CPRA 3TDFA 2FIQA 3IIOA 3W2KA 2D73A 1OX4A 3TW6A 1QCWA 1VS1A 3HG4A 4WQ6A 5DLCA 2OX1A 4A2SA 2QUTA 2EGZA 3N19B 1R2RA 2X30A 3L65A 1TV8A 1XBXA 3PBYA 3BPWA 2WNZA 3IVSA 4C1KA 5EYWA 5CG7A 4IMFA 4O17A 3LTSA 3VKJA 1LYXA 4WXZA 3O07A 3UY7A 2DP3A 1AK5A 2BZNA 3L21A 1OYBA 1VPXA 4XBKA 1I2PA 4BI7A 2PURA 2YYUA 3TXZA 3QSTA 3MHUA 2FDSA 3IIXA 5LZLA 1SW7A 4A29A 3MP4A 3QF0A 4E2DA 2AQWA 1FWWA 2R91A 4RZ6A 5HWNA 4Q4KA 3W76A 1SZGA 3TMQA 2E1DA 1HFBA 3H54A 2CZEA 2RH9A 4L4LA 4UFHA 4GWEA 2CZFA 1EUAA 4WJEA 1TPH1 2TSYA 2QDGA 3AO0A 4MOZA 4DELA 2ZZ2A 4LWWA 1A5AA 1V5XA 4Z0SA 3QH2A 5G1YA 3NQGA 4AMAA 1XL9A 3BLIA 3BW4A 3OG3A 2VC6A 2YPIA 1KV8A 1O5XA 3SSJA 5L6UA 2C15A 3W1UA 3NQDA 1TCDA 3NQMA 4CQ9A 3G24A 1EB3A 3M47A 2O7QA 5D02A 2AGKA 1FWSA 4X22A 3GAYA 4IMDA 3GZ3A 3DH7A 3ZR4A 3W1PA 2W79A 3LERA 3RNDA 4YXGA 3ABQA 1SO6A 4Q32A 3G0SA 4RCXA 2CLEA 1OVDA 3PWAA 4I7WA 3DGRA 5C54A 3W71A 1YYAA 5K2ZA 1GEQA 1G4EA 2OT0A 4O12A 1ME7A 4MUZA 2AAMA 2X2GA 1G6CA 3E0IA 5CGQA 5CSRA 3S5OA 2C0AA 3LCHA 3B04A 1TPEA 1DQWA 1KM5A 4LVDA 3GDKA 4UNLA 4K7YA 2Q8LA 2GVLA 3VE7A 3W2NA 3UZJA 3QEZA 5LNRA 4FNPA 5SWUA 2GQAA 4LVBA 1EEPA 3KHJA 1W37A 4DBDA 2Y62A 4PL2A 1FWRA 1LRTA 4LV4A 1R30A 3NYZA 3QRHA 2C14A 4D2JA 4AEOA 3A21A 3EKLA 1KFJA 3W1MA 2G96A 1SO4A 1PIIA 3HGRA 2J9XA 4R7JA 4HPJA 3JS3A 3F4NA 2YCEA 3ATZA 3L0GA 3V75A 5FF2A 3W7RA 4EWND 1T99A 1LOQA 3CTLA 2Z2UA 4QQ3A 1A50A 3P81A 3NZRA 4PODA 4M7TA 3DFPA 2Y7FA 1S5TA 1UUOA 3HPZA 1KA9F 2NXGA 2R94A 2NV1A 3LHVA 3A5FA 3HMJG 1YADA 1UJPA 2X1SA 2QDHA 2ZRWA 4NNBA 3QW3A 4LC6A 3TE9A 2XN1A 3BG3A 4ADTA 1W56A 2QF7A 1LBLA 2QCDA 3OHIA 4UMBA 1PCWA 2ZFAA 3LHTA 3O16A 5AC8A 2QCMA 3R2GA 5HMSA 3MI3A 3I68A 2YZRA 1SSGA 5AOUA 4MVAA 1BWKA 4JTKA 2ALDA 1VCGA 3DBPA 1F05A 4KFOA 2DZVA 2VEPA 3L5MA 3P67A 4DO4A 3KX6A 1K8ZA 2CW6A 3RU6A 3LCGA 4K6AA 7TIMA 1OK6A 2JKEA 1QR7A 1KM0A 2DZWA 1QO5A 1UB3A 1O5KA 2J24A 2OCZA 4RV8A 3PSVA 4UFJA 4E38A 3JR2A 2QUVA 4WUIA 5TIMA 5CPNA 2Y6ZA 3A23A 2HSAA 1TYGA 4OV9A 4BI6A 3MP3A 4QNWA 2CU0A 4UTKA 4N02A 1TB3A 1MEIA 2B0MA 1F2JA 3UWVA 1FQ0A 2JBMA 1DORA 3SJ3A 3G1FA 1SZNA 3QZEA 5CPOA 4OE7A 1FDYA 1PE1A 1J5TA 5J5RA 1ZCOA 2X1UA 1WAUA 5CPMA 4TR9A 5LGZA 3A24A 3KFTA 1IIGA 4DF2A 5BW6A 4UFMA 4MIMA 2E77A 3PG9A 2J9ZA 1YPIA 3MI6A 1W31A 3P8JA 1F7BA 3CC1A 3R89A 2ZZ6A 3B0PA 3GNDA 1VH7A 2PRHA 2I9EA 1LBMA 1ZAHA 3KXQA 2C1HA 2DZPA 2QAFA 1SFLA 4FX6M 3UPWA 1QDSA 2GQ9A 2E5BA 3C61A 4LUJA 2IQTA 2RFGA 4XKYB 4R33A 4AWTA 2ZZ4A 4LUIA 1VGAA 1YTDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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