3TKQA

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 with mixed conformation
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
191
structure length
191
Chain Sequence
SKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 61
structure length 191
sequence length 191
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tkqA00
4X0XA 4KH7A 1V9WA 2H74A 3U6VA 5C04A 1QQ2A 1TK8B 2ON7A 5HFKA 3CTGA 4Q5NA 4YAPA 2IFQB 4JRRA 2YWNA 3GH9A 4F0BA 5A5KA 2IMDA 1XCCA 4MF7A 1R7HA 3KH7A 3QAGA 5IO2A 2DMMA 5INYA 2G0FA 2NBSA 2PMTA 2HZFA 1EOHA 4ZBAA 2GLRA 2IWTA 5LCZA 1EGOA 2X99A 2B1KA 3J7Yk 5ECKB 1EEMA 1TI1A 4F2IA 5GAPD 1PQNA 3KM6A 1ZGNA 3FHKA 1Y25A 1TP9A 1T4YA 4ULXA 3LG6A 4HQSA 3HD5A 6GSYA 2GT5A 2CAQA 2FGXA 3U5RE 5JCWA 4NXIA 2HFDA 2QC7A 1GSEA 1QMVA 1M2AA 3ZLPA 4FYUA 3GSSA 1C72A 1OE8A 3AY8A 1EP7A 2WB9A 4BVYA 5CRDA 4G2EA 3E3EA 1WOUA 2K18A 2OE1A 3HA9A 3ZVJA 1N8JA 1ST9A 4WETA 1S3DA 1WIKA 3C8EA 2C0DA 2HE3A 4LMVA 3TRPA 2DLXA 4IELA 1TTZA 3DYRA 1XOBA 3QOUA 1BYEA 5IOWA 4RI7A 2H70A 2P5RA 5IPHA 5AISA 6GSUA 3KTLA 4MCUA 2BMXA 3HKRA 4I8BA 4DSSA 5IM9A 2DBCA 1WP0A 1ACVA 1XW9A 5IIZA 1Q4JA 2H01A 4Q5QA 4TOPA 1V57A 3GL3A 5DJLA 5E4WA 1YKCA 2LS5A 2E2MA 2CQ9A 4OFTA 2O87A 3VWXA 4TKYA 4QL9A 2PGTA 2VM2A 4HU7A 1TK0B 1TOFA 3LORA 3LQ7A 1HD2A 1OVNA 3KZQA 4MJAA 4WR5A 3KP8A 1BG5A 3UBKA 2HLSA 3GX0A 2MYGA 3FZAA 3O76A 2IMKA 4PGTA 1EZKA 3ZITA 1XWBA 3OR5A 1U3IA 3GTUA 4POKA 1PMTA 3VI5A 1YJ6A 4BPYA 5D9XA 3MNGA 1ZL9A 3BCKA 3HVSA 5DBQA 4KCAA 1FG4A 2LTKA 3TDGA 1ZYQB 1K0AA 5D73A 1U3AA 1SK0A 1U6TA 3D4MA 4OFMA 4N10A 2FWFA 1AQWA 1A2LA 3A2VA 4N0ZA 2VCWA 4OCFA 2YNXA 5KN2A 1XWCA 4PQIA 3VK9A 3L9VA 1VF1A 2VOCA 3F0IA 1W4VA 5ECRB 9GSSA 2HYXA 4H86A 1Z9HA 1OC9A 2BTOT 4HI7A 2F9SA 3N9JA 1EP8A 1XXUA 3A2WA 2DJ3A 4D73B 1Z6NA 4KX4A 1TRVA 1NHYA 1NM3A 1W89A 5JCUA 4K1FA 5L71A 3RBTA 4YQVA 4NHZA 1FVKA 3TKSE 3F6DA 4OCEA 1O81A 4JE1A 2J23A 3EMXA 1RK4A 1QXHA 1V98A 2RM6A 1F3BA 4HZ2A 2K8SA 2RM5A 4GXZA 1R4WA 5DCGA 4FYBA 3UIWA 3L4NA 2H0IA 5CO3A 1GH2A 4XS1A 12GSA 3P8WA 5AGYA 1MDJA 4ACSA 5HR1A 1O85A 2LRNA 2OADA 2R5GA 4ZBDA 3GFKA 5IMAA 2HRFA 19GSA 1GLQA 3CBUA 4MPGA 5J9BA 2YPMA 4HDEA 1SJIA 5AIVA 1ERUA 1GRXA 2DJJA 4DSQA 2H19A 2PVOC 5F0GA 1O73A 2MMOA 1ZOFA 3CMIA 2L6DA 1O8XA 3TRXA 1PL1A 4PNGA 4K9ZA 2OACA 1AQXA 3LXZA 3R2QA 5JWRB 1N2AA 4RQXA 5ECQB 4OO4A 4NAXA 4GSTA 3GH6A 3I9V2 2A4VA 1X5EA 4ZIJA 2PERA 1NHOA 3H1NA 3UAPA 5KN3A 3WGEA 1J08A 3DRNA 3GKKA 5DQSA 2VD0A 4E8HA 6GSVA 1HYUA 4RQRA 4MABA 1PN9A 5ID2A 3G7YA 1DSBA 2R2JA 2GSSA 3LGCA 5CRHA 1JZOA 3IE3A 3LEFA 5H5SA 2RUEA 2L4CA 4NMUA 2PU9C 3V1WA 1M9BA 1SU9A 1FB6A 2J9HA 3HJOA 4PNFA 3VFIA 4EO3A 3FRCA 2KHPA 2JSYA 1LJRA 5KN1A 5D9VA 1DE1A 3W8SA 4HU9A 6GSTA 2JZRA 3EU4A 3D5JA 1TK5B 3M8NA 2KLXA 2PPTA 1PX6A 1T7PB 2YJ7A 2YOIA 2DJ0A 1I9DA 1O8WA 2P5QA 3TOTA 3L78A 3M1GA 1K0MA 1M7TA 1VRSD 1WWJA 3FR6A 3GV1A 3GIXA 3TJJA 4TXOA 1OKDA 5DDLA 2V32A 1SKSB 5H5RA 1XIYA 3GUSA 4V2LA 3ZL5A 5KEJA 1PX7A 3BD2A 2LRTA 1G0TA 3VURA 3TJKA 1VGLA 1A2JA 1U87A 2M46A 1HNBA 5IOXA 3M3MA 4GF0A 1B48A 2GZYA 3I69A 2PN8A 5IO0A 3F63A 3UVHA 2WJUA 2C3TA 1SD8A 1EGRA 3E0UA 4V2MA 1OC3A 4JR4A 1MEKA 2OA7A 4L5LA 3PGTA 2B1LA 14GSA 3HZ4A 5E59A 2LV3A 2GS3A 2K6VA 3M9KA 1SK2A 5LD0A 1XWAA 3ERFA 1VF4A 2WCIA 1AUCA 1UA5A 2JZTA 1XVQA 3IRAA 5AIXA 1GTIA 3EU3A 4O5RA 5DALA 4K8MA 4MK3A 3PR8A 3PINA 3IK7A 4F82A 4POMA 1T8EB 2FWEA 2XBQA 1JLWA 4OO5A 5A4VA 2IIYA 1BAYA 2VL3A 3IV4A 3I6AA 2R3XA 3NZNA 4ZL8A 3KH9A 4BVXA 2LJRA 4KGIA 1FHEA 5ECLB 1FB0A 1WJKA 2H73A 3L9SA 1JLVA 1A0FA 4MH3A 4N30A 2F51A 4MJCA 2M72A 4HS1A 2A2RA 3TB2A 4CHSA 1CQHA 3UJ1A 1YZXA 4IBPA 4LMWA 1V2AA 1Z7PA 1GTUA 1T4ZA 3CRUA 3HZ8A 3CXGA 4HJ2A 4MJEA 4IGJA 4KA0A 3Q19A 1TRSA 2DSAA 2TRXA 1YDKA 4K7NA 5D93A 3EWLA 2JZSA 1HNCA 2OE0A 4AF2A 3F9UA 2OBIA 1YF0A 2VL2A 3DVXA 5JWOB 3BOAA 4IQAA 3G9BA 3ZTLA 3EINA 5IPGA 3EE2A 2A2SA 5J41A 1B8XA 1SYRA 4IHUA 3VPTA 6GSXA 1URMA 1SL2B 4GWRA 2RUFA 1RW1A 1XFLA 3CSHA 4EKZA 4KDXA 4MLYA 2H76A 2IMEA 4N0VA 1AXDA 2CAIA 4TR3A 4JU5A 2H30A 4IJIA 3P90A 4GCIA 3WT1A 2LKUA 1MTCA 3IAM2 3HVXA 3ZREA 4BWSA 3TRQA 4TR0A 1O7UA 3GYKA 3DWVA 4ZB8A 2K8VA 2WGRA 2QKEA 1H75A 5AN1A 2X8HA 1GNEA 7GSSA 1G7EA 2V6KA 4ECCA 5ECHB 1XVWA 4MA9A 1WE0A 4KDUA 2FY6A 2B5YA 2O8VB 3BJ5A 2GSTA 1XW5A 4WXTA 1WPIA 3WYWA 1USBA 1X9MB 3FYGA 18GSA 1GSDA 3HCZA 3CRTA 3TKRA 2GDRA 3LFLA 2H72A 2C3QA 1PRXA 3L0HA 4POLA 3HYPA 1PGTA 4IQ1A 1GSQA 4MPFA 2FA4A 4F9ZA 4IP6A 13GSA 1PKWA 4EDZA 4BWQA 2I81A 2GQLA 1AW9A 4XCSA 1K0BA 3LYKA 2HI7A 1TXXA 1K3LA 1M2BA 2B7KA 1NSWA 2FHEA 2YP6A 1BEDA 2IJYA 1CQGA 1B4QA 4NV2A 3PH9A 2YWOA 2GSRA 4P3YB 5ELGA 2HZEB 1GTAA 2AHEA 6GSWA 2L5OA 2KOKA 1FW1A 1MD4A 3I43A 2E0QA 3EYTA 1X9SB 5F05A 4AJ6A 3KIJA 4J2FA 1MDIA 1HQOA 5J5NA 2VAFA 5D8IA 2D2ZA 4XS4B 4Z7XA 3Q74A 2CVBA 4HZ4A 2LJAA 5EVOA 2IFQA 4YQMA 1BQ7A 1EOGA 3TKSC 1K0OA 2OBKA 2DMLA 2EC4A 4TR1B 1R26A 17GSA 2L59A 1E6BA 2VL2C 3APQA 3P7XA 5DVBA 2GGTA 4WBJA 1UN2A 3QD9A 1VF2A 3QPMA 4V2NA 1T00A 1YEXA 4XIHA 5D9WA 3H8QA 2C1YA 2FNOA 1ON4A 2H1AA 3H79A 2XHFA 2PUKC 4FO5A 3VLNA 3FR9A 2JL4A 3TJBA 3C71A 5COHA 5G2ZA 5HFGA 4ZL9A 4KDYA 1XOAA 4NV5A 1FO5A 4EL1A 4K7OA 4L0UA 4LL4B 1J9BA 3A3TA 4ZB6A 2IMIA 1GSFA 4KB3A 3KMOA 3GKXA 4GSNA 1F3AA 2HNLA 1K0CA 1YQ1A 4N11A 2NVLA 1YKAA 3A2XA 1XWGA 2B3SA 1GSUA 2F8FA 2YJHA 4MZBA 4RUVA 2RIIA 4EXJA 5CRWA 4PQHA 1DBYA 2X8GA 4V1Ag 3HJPA 1IYIA 2GT6A 5HFIA 2JADA 3ZIJA 5GSTA 2H1BA 3KEBA 3D0ZA 2HT9A 4WF4A 4EC0A 1SENA 3G7JA 3QCPA 5G1KA 4ID0A 4NHWA 5G30A 4G19A 3GHAA 2V1MA 5DAKB 4GTUA 2C8UA 2H0HA 1LBKA 5ELAA 2WRTA 1B4PA 5GAND 3P2AA 5CYYA 1Z3EA 3FK8A 5FWGA 2P0GA 4MF5A 2C80A 2EIQA 2I9HA 2H8LA 4IVFA 3CTFA 1OC8A 5J3RA 1ML6A 2VM1A 2GQKA 3GRXA 1Z6MA 2H6XA 4KW6A 4EUYA 2LQQA 5B6NA 4MJBA 2CVDA 3C1SA 4L5OA 2IPAA 4YH2A 5J9CA 3VWUA 5B8AA 1QGVA 3IC4A 4IW9A 3F4RA 3DKSA 2HSYA 3FZ4A 3O6TA 4OMVA 4PUAA 4KCEA 1M9AA 4AJ7A 3GURA 4PUFC 4HQZA 2HXKA 3D22A 4KAEA 1SKWB 2GSQA 4DVCA 1G6YA 2YZHA 4WR4A 2H1DA 1X0RA 2QSIA 5B7CA 2TRCP 4NWYA 2HRNA 3TJFA 1K3OA 4I6XA 2H75A 1M2DA 4WF5A 4RI6A 5F07A 1PKZA 5ECIB 4D73A 4IS0A 4G10A 2FLSA 4PXOA 3M0FA 2N5AA 2TIRA 2QGVA 2OKAA 5FHIA 1H4OA 1Z5YE 2VUPA 5CAXA 2XBIA 2LRCA 2C3NA 1QUWA 3EC3A 3UOMA 1F6MC 3GA4A 5EL8A 5HR3A 4XS6A 4I5QA 3F6FA 3EURA 1ZCPA 4JEDA 3F8UA 3M9JA 3VPQA 4GSSA 3TKQA 1IYHA 5D96A 5CP1A 3GKNA 4EE0A 3KCMA 2WDUA 1ZYEA 4HOJA 3IBHA 2WFCA 2VCQA 3WGDA 4DSSB 2RLIA 4KE3A 1GSYA 1ERVA 3L9UA 4I2TA 2DIYA 4NPBA 4EDYA 2FD3A 2ALBA 2M80A 3C73A 3ZVJD 5ECOB 2AYTA 3DXBA 2LQOA 4TR4A 4K7IA 3UBLA 4K0NA 1SJ6A 5F8BA 2N5BA 2MMAA 5DCHA 1GULA 1G6WA 3QMXA 8GSSA 4X1UA 3MSZA 2AJQB 2AAWA 3D4TA 1DUGA 3VWVA 3GN3A 1XPVA 3GTUB 4ILFA 3GX8A 3HY2A 3W6GA 1ILOA 5C00A 3ME8A 2C4JA 2Z9SA 2VL9A 2FCHA 2KP1A 2V41A 2V2GA 4GQFA 3FW2A 3TUEA 1TRUA 2N5FA 4GRFA 2C0EA 1YF1A 2DJ1A 1XW6A 3ERGA 2H66A 5IMVA 3H4KA 5D9TA 1JZRA 1GWCA 3F4SA 1BJXA 2HSHA 2REMA 3KGKA 3TKSA 2VIMA 1U88A 2R6KA 2L4QA 3IR4A 1SL0B 3W8JA 3IA1A 1EEJA 2LEGA 1TJDA 4FH8A 1OC9B 5G5EA 4OWYA 22GSA 2VLVA 1S3CA 2YV7A 5B8BA 2L5LA 5A4UA 3ME7A 3Q6OA 3LJRA 4L8EA 2AUVA 1PSQA 2AB6A 1K0DA 4TVEA 1A2MA 3N5OA 5B6MA 3SBCA 4MH2A 1SYXA 3Q18A 1XWKA 2DJ2A 2O85A 1EWXA 1O6JA 1KBNA 4J57E 1FVJA 1JZDA 1K0NA 3RHBA 2GVPA 1F2EA 2I3YA 3HJMA 4HEA2 1TW9A 1OAZA 3FR3A 1MDKA 3K8NA 2PVQA 2FUG2 1OKTA 2EIRA 3ZIVA 3IDVA 2K9FA 5JWQB 3QR6A 3RDWA 3IK9A 3US3A 3ED3A 2WULA 3KP9A 3KXOA 1JZWA 5KN0A 2VD1A 5EY6A 4XTSA 2CZ3A 3FZ9A 4LLRA 2YCDA 1SJZA 1WRYA 3TJGA 4O7HA 4YQUA 2LUSA 4TXVA 3EVIA 1ERTA 1UC7A 4I97A 2X8CA 4QL7A 2YN1A 1EV9A 3KJYA 3J7Yb 3KMNA 1X9WB 5FT3A 2JSZA 1AC1A 5CNWA 2YANA 3QDNA 4ZB9A 2V6OA 3FKFA 2MMZA 2WS2A 3FY7A 2LNSA 1A0RP 1JFUA 3C7MA 5DQYA 3QAWA 3RPPA 3DIEA 2AV4A 2CX4A 1SK1A 3GL5A 1BX9A 4O92A 4F0CA 4PQ1A 1A8YA 1TDIA 1PL2A 3GNJA 1AIUA 2VLUA 1X5DA 5F06A 2CVKA 1A24A 5IMZA 3KTBA 4JR6A 3GKMA 1YEPA 3G7IA 1I5GA 5ID2B 1DE2A 1R5AA 3QFBC 4EVMA 2NDOA 3BCIA 1GL8A 3LYPA 3CSIA 2YZUA 1V40A 1PA3A 2IMFA 3DD3A 3UL3A 4J56E 1MD3A 4OD7A 1PD21 3DGQA 1XBSA 3IHQA 4KNDA 5DJMA 3RHCA 2XC2A 1QK8A 2EIOA 1KEBA 2GZPA 5EPFA 2E2GA 4YAVA 4TRXA 2VCVA 4L0WA 1GP1A 3EMPA 4JBBA 4DEJA 2MMNA 3MWHA 1VF3A 2C0GA 4MP4A 2IL3A 4ZL7A 5ECNB 5IMCA 5ECSA 3CSJA 4K0GA 2CA8A 3UEMA 1TU8A 2DIZA 2O89A 10GSA 4LA1A 1YY7A 3ZMLA 4TXOB 5H5QA 6GSSA 2I4AA 1SD9A 2MZCA 1EV4A 1QFNA 3VWWA 4BL7A 3FEUA 3CYNA 4V1Ap 4WKWA 3GSTA 3TKPA 3NIVA 4PX1A 2X64A 1SL1B 5J4UA 2P31A 4ZBBA 2VCZA 5GZZB 2F8AA 4AJ8A 1TRWA 4GLTA 2B7JA 4BA7A 2YWIA 1M99A 4AGSA 1GUHA 3APSA 5IMDA 4Q5RA 1FOVA 4CDOA 4EF0A 3UMAA 1Z7RA 2XPDA 2ZNMA 4QQ7A 2R4VA 4WEYA 1A8LA 5HQPA 1A23A 1GNWA 1ERWA 2FA8A 3BBYA 4XRAA 5DALB 4TW5A 3ZZXA 4FYCA 2GQMA 4K6XA 3RAZA 3FZ5A 4Q5FA 3IPZA 4ZXGA 3JCML 4LL1B 4F03A 2CT6A 1Y6EA 4GQCA 4OFNA 5A4WA 2LJKA 3DVWA 3SWLA 3S9FA 1ABAA 4ISDA 4ML1A 2B5XA 2JU5A 2I1UA 2CX3A 4I2UA 1GUKA 11GSA 3ZFLA 4KUNA 5G31A 5HR2A 2VCTA 5CREA 2R37A 3TGZA 1R5PA 2L6CA 1RQMA 2LSTA 4MZCA 16GSA 2ON5A 2LNTA 4IP1A 3WT2A 1X5CA 1ZMAA 3E9JB 3LXTA 2IN3A 5JCGA 2G2QA 3IAS2 2ZCTA 3IXRA 3UVTA 3HVVA 4WBRD 3D6IA 1AAZA 1THXA 2FWGA 3GMFA 2HZEA 5HR0A 2WZ9A 1GUMA 3C1RA 1GSSA 2OE3A 4K2DA 4MDCA 4CW9A 3ZMKA 1T1VA 2H71A 3ISOA 2H6ZA 3F3QA 2MBSA 4XS4A 4ML6A 1KNGA 2YWMA 4ZILA 1E2YA 2B5EA 2KUCA 3F4TA 4POBA 1GTBA 3HDCA 1M0UA 2B6MA 1J0FA 2VLTA 5G5FA 2C0FA 4TR1A 2FWHA 2YV9A 3ZRDA 3HHVA 5ENUA 5CRGA 3ZYWA 3ERWA 1JHBA 3NOFA 4ECIA 4KSOA 2MBTA 1AQVA 1KTEA 3DEXA 4IKHA 4O32A 1OE7A 3HXSA 2ZUPA 3O3TA 2ES7A 4DSRA 1FAAA 3WD6A 3LWAA 5GSSA 2L57A 3ZFBA 5G1LA 3IOSA 1T3BA 4E8EA 1G7OA 3A5WA 2VCXA 5ABRA 3KD0A 1THOA 3TOUA 4ECJA 2VO4A 1F37A 3QAVA 5ECMB 2GZZA 2F3MA 1SKRB 1WMJA 2BJXA 1TKDB 3VI7A 3MAKA 2PBJA 1Q98A 1NW2A 1K3YA 4MZWA 1HNAA 3QFAC 4FIWA 1OYJA 2OJLA 2O7KA 1ZZYA 1B9YC 3APOA 5LNKe 3DMLA 2XPEA 4G9HA 2DJKA 1LU4A 4PURA 5IQYA 4KSMA 1UVZA 2H1GA 4IJ3A 20GSA 3UARA 4JZQA 1XZOA 1GLPA 3H93A 3TCOA 4HJMA 4XRDA 4MF6A 3D21A 5ECPB 2H0GA 4HUAA 4ECBA 2H6YA 5IMFA 2JACA 1F9MA 2NTOA 2KP2A 1TU7A 4TN8A 1TI3A 1V58A 3MDKA 2DC5A 2GTUA 5DAKA 2NPBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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