3TRPA

Crystal structure of recombinant rabbit skeletal calsequestrin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
EEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Calcium-binding protein
molecule keywords Calsequestrin-1
publication title High-capacity Ca2+ Binding of Human Skeletal Calsequestrin.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 106
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3trpA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3trpA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3trpA02
3HZ4A 3KD0A 4JR4A 2V32A 5D8IA 4D73A 1PMTA 4MK3A 1Z9HA 3VI7A 2VM2A 3ZL5A 5HFGA 1ON4A 3GHAA 5LNKe 4GSTA 5J5NA 2YWIA 2VOCA 3GMFA 4EUYA 2FWHA 4FH8A 1KTEA 1AC1A 3GRXA 2YWMA 2EIOA 2B7JA 3ZZXA 4ZL7A 2XC2A 2B5XA 4TRXA 3RBTA 3TJFA 1PA3A 4FYUA 3GKNA 1VF4A 1O85A 1FG4A 2B7KA 2LRNA 5J9BA 2AAWA 4KCEA 3DIEA 2ZUPA 2C80A 4YQUA 4HQZA 3GX8A 1JHBA 4JU5A 1S3DA 1B4QA 4IHUA 1J9BA 4N11A 5H5QA 1T8EB 2H0GA 3KEBA 5ECHB 2VUPA 3PGTA 4OFTA 1XWKA 3DGQA 2DIZA 3GYKA 4HU9A 4TR1B 3TKSE 3IV4A 5ECNB 3ZFLA 3SWLA 4KAEA 4MCUA 3NIVA 2F8AA 1THOA 5D96A 5EY6A 5ENUA 4ML6A 1YKCA 5JCUA 4L8EA 1T3BA 3Q6OA 3UIWA 4RQXA 3H1NA 1PX6A 4F9ZA 4CHSA 1EV4A 3FZAA 3TJBA 3C8EA 3VWUA 1PL1A 4XS1A 3P90A 2CX4A 4LMVA 4PNFA 4OCFA 4ZILA 3TGZA 2LSTA 3CYNA 6GSSA 1A2JA 4MJBA 3KJYA 1W89A 4DVCA 4RI7A 1HD2A 5D9WA 1OE7A 3F6DA 4HJ2A 4JR6A 2PERA 1B9YC 3ERGA 3ERFA 4NWYA 5H5SA 7GSSA 1G6YA 3G7YA 5G5FA 2BTOT 1K0MA 3D4MA 2YZUA 3BOAA 1U87A 2GTUA 1F6MC 5KEJA 2YOIA 1A0RP 4EL1A 5D73A 1YF0A 4EC0A 3FZ5A 5F07A 1RW1A 4PURA 4G2EA 1EEMA 4I2UA 5ECMB 5ELAA 3EINA 2IMFA 6GSYA 1A0FA 3F3QA 2JZRA 4PUFC 2FWFA 1S3CA 2C8UA 3L9SA 3HA9A 4POMA 4GXZA 1GLQA 1TRUA 2CZ2A 1GTUA 1QFNA 4L5LA 4J56E 2V2GA 1XOAA 1F2EA 4POLA 2L4CA 2RM5A 2HFDA 4ZBBA 1BX9A 2PWJA 1M2DA 4ML1A 2A2SA 1AQWA 4K7OA 3UBKA 3E9JB 1PKWA 1ZGNA 4MA9A 3UL3A 5CP1A 1GSSA 3UJ1A 3RDWA 3KGKA 2O8VB 5D9XA 2BJXA 3MAKA 3L9UA 2R3XA 3FRCA 3FKFA 3CRUA 1GUKA 1ERVA 3US3A 5DQYA 2RLIA 1KNGA 4JE1A 4WF4A 2DMLA 5IMAA 3GKKA 4GTUA 1HNAA 3VI5A 3ME8A 1HNCA 1OC9B 1QUWA 2K8SA 3I6AA 1UA5A 4XS4B 4DSRA 5D9VA 2BMXA 5IQYA 1ZL9A 2DSAA 2VIMA 4KDYA 3Q18A 4PXOA 2YCDA 3WT1A 4NHWA 1WOUA 2YWOA 4MJCA 1AAZA 3AY8A 2E2MA 2B6MA 1SD8A 2X8HA 3FK8A 1TI1A 1XWBA 3HVVA 22GSA 4XS4A 4CDOA 2RUFA 2H1GA 2GLRA 3APOA 2GDRA 4MDCA 2DJ1A 1AQXA 1DSBA 1YJ6A 2JZSA 2FGXA 2HLSA 3TJJA 3RHBA 5HFKA 1XW5A 3KIJA 1FVKA 2P5QA 2DIYA 2VCTA 1F37A 5ECQB 1M0UA 2HZFA 5IO2A 2ON7A 2QGVA 3NOFA 5JWQB 2H75A 2OE3A 3LYPA 5HFIA 1V9WA 2REMA 1GSFA 2VAFA 1GTIA 3BD2A 4G10A 1GNEA 2PBJA 4JEDA 2HSYA 2P5RA 1JLVA 4H86A 1GSEA 3HHVA 4MPGA 5CRHA 1TK5B 5CRGA 1GNWA 3FEUA 4MP4A 2H30A 2GZZA 2G0FA 2YZHA 4ZBDA 1EEJA 2FD3A 5GZZB 3VPTA 3LG6A 4ID0A 2NVLA 3LORA 4KE3A 5ECKB 2CAIA 3CXGA 2ZNMA 2MMOA 5EL8A 2C1YA 1U88A 3ED3A 1XBSA 1WIKA 3ZREA 1EGOA 2IL3A 1O81A 4BVYA 4IKHA 2I3YA 1OYJA 2YJHA 1UC7A 3O3TA 3F4SA 5B8AA 2O7KA 1WP0A 2RUEA 5ELGA 2GT5A 1AIUA 1U3IA 4XHMA 3WGDA 3MNGA 1MTCA 2XBIA 4GSSA 1J08A 4X0XA 5AN1A 4F03A 4E8HA 5IPHA 1DBYA 3GKXA 2KHPA 2WGRA 3WD6A 5JWRB 2H66A 1M7TA 2VCXA 2IMIA 1TKDB 1A2MA 3TCOA 1Z7PA 2NDOA 2OA7A 4Z7XA 3SBCA 4EO3A 5DQSA 5E59A 3RHCA 1NM3A 3TRXA 3M0FA 4WEYA 1SENA 4V2NA 4AJ6A 4XIHA 4EDZA 1ERTA 3HZ8A 3EYTA 4BWQA 3GSTA 4MF6A 2TRXA 10GSA 1HQOA 2B1LA 2TIRA 5ECRB 2VLUA 2X8CA 3F0IA 1YEXA 1GSYA 1VGLA 1TRWA 4POKA 3A3TA 5KN0A 4WR5A 1BEDA 5FT3A 2TRCP 3QD9A 2CAQA 2B1KA 2F51A 1FOVA 3BBYA 3D21A 5A4WA 3KM6A 4Q5FA 3EURA 2LJRA 2HI7A 4DSSB 1K0DA 2LKUA 1Y6EA 3HVSA 1XWGA 4HEA2 3G9BA 1V98A 2I1UA 4KW6A 2A2RA 3D22A 1R4WA 3EE2A 1FVJA 5IM9A 2YPMA 2H72A 3RPPA 3KZQA 1OE8A 4IELA 2WJUA 2VL9A 5ID2B 3S9FA 2YJ7A 1OVNA 2LTKA 4DSSA 1H75A 2DJ2A 4KX4A 3KMOA 3UARA 2IJYA 2WZ9A 4MLYA 3KH7A 5CNWA 2LNSA 2RM6A 3D4TA 3EMXA 1ZOFA 1M99A 1TU7A 2K18A 3V1WA 5ID2A 4I8BA 3VFIA 4L0WA 4ZXGA 2N5BA 1MDKA 4G19A 1R26A 3U5RE 1FO5A 4Q5QA 1C72A 3E3EA 3D0ZA 2LNTA 5J9CA 1I9DA 2VCWA 2L4QA 4TXOB 2EIQA 4QL9A 5LD0A 1RK4A 4K0GA 1TP9A 4TN8A 1JZWA 1JZRA 1F3AA 3J7Yb 1URMA 1TJDA 3L9VA 4AF2A 2JSZA 1TDIA 2C0FA 2QKEA 2H0HA 2VM1A 4HDEA 2HRNA 3FY7A 4OO5A 3LSZA 1TI3A 3IAM2 4EKZA 5AIXA 4HZ2A 4GQFA 2JACA 1X9SB 2AV4A 3C73A 2JU5A 2C0EA 2LJAA 2IWTA 3DKSA 1GWCA 2B5EA 3DEXA 4O92A 2KP2A 1SKRB 5IOWA 2F3MA 4ZB6A 3APQA 3BCIA 1MDIA 20GSA 4TR1A 1NSWA 1FB0A 4E8EA 3FR9A 3ZLPA 3F4TA 1Z3EA 2IFQB 1PD21 2B3SA 3UVTA 1GTAA 2HRFA 2AHEA 3UVHA 3HJMA 3TB2A 1J0FA 1ST9A 3JCML 2DBCA 3MDKA 1GUHA 3IK9A 3L78A 1THXA 2JZTA 2AUVA 2L59A 4TR4A 1PSQA 2IFQA 2H6ZA 2OBKA 3PH9A 4KNDA 1YF1A 2X8GA 3IR4A 4G9HA 3N9JA 1G7OA 5ABRA 1T7PB 2JADA 2M46A 1EWXA 1JLWA 4FIWA 4OMVA 4WETA 2R5GA 2PU9C 1Z7RA 1NHOA 3D6IA 2HE3A 1Q4JA 4GSNA 2J9HA 3BCKA 4IS0A 4FYBA 2MBTA 3MSZA 1M2AA 3LWAA 5KN3A 3EMPA 5KN1A 4BA7A 4NXIA 4MZWA 2L6CA 2M72A 3P2AA 3WYWA 2XPDA 5A4VA 3HY2A 4NAXA 3E0UA 4ILFA 1B9XC 3KTLA 5FHIA 1SYXA 2VLVA 3FYGA 1USBA 5B7CA 2O87A 4K6XA 2DJKA 4MJEA 4EF0A 3M3MA 4PQ1A 2IN3A 1TK0B 4WBRD 4TR0A 3LXTA 3C1RA 1M2BA 4ECJA 5CYYA 3DMLA 1VF1A 1E6BA 4XRDA 2PGTA 4KA0A 4OCEA 4AJ7A 4GWRA 2WS2A 1XPVA 4YQMA 4RQRA 4OO4A 2VCZA 4HQSA 1ILOA 3TUEA 2PMTA 3U6VA 3MWHA 5G30A 3FHKA 1O8WA 2MZCA 3CBUA 1VF3A 5ECPB 4KGIA 3HCZA 2WDUA 3F9UA 2VL3A 3F8UA 4XCSA 3ISOA 4TXVA 1V2AA 3FW2A 2DC5A 2XPEA 3ZFBA 2QSIA 2VLTA 4I6XA 5EVOA 4ECIA 3F6FA 3Q74A 2FWGA 4BL7A 2C3NA 4ECBA 2DJ3A 1OC9A 5AGYA 3ZRDA 1QXHA 3LJRA 2RIIA 4QL7A 5F05A 2L5LA 2JL4A 2R4VA 3QAWA 1PN9A 3IHQA 5IOXA 1KEBA 2YN1A 1V40A 3TOTA 5JCWA 1AXDA 4L5OA 5J41A 1K3LA 3GH9A 2ES7A 4PGTA 3H4KA 5GSSA 2WCIA 2FNOA 1XIYA 4L0UA 3CTFA 5F0GA 2DJ0A 1BG5A 1YZXA 1GRXA 4RI6A 4KUNA 4HUAA 5HR1A 4LL1B 5CO3A 3ZTLA 4PX1A 3QR6A 5CRWA 4KSMA 3LQ7A 2IMDA 5HR2A 2VL2A 3VK9A 2XHFA 2K6VA 3TKRA 1W4VA 3ERWA 2OKAA 4LLRA 1GL8A 3GX0A 1SL0B 2V6KA 4TOPA 3GV1A 5KN2A 1BAYA 1WWJA 1EZKA 4OFNA 1X9WB 3CMIA 1S3AA 3A2XA 3IC4A 4JZQA 1SJZA 2M80A 2OJLA 1XWCA 12GSA 2CA8A 1YQ1A 2DLXA 4AJ8A 1SKWB 2H6YA 3KP9A 5G2ZA 1QMVA 1SYRA 4PQHA 1B4PA 3LXZA 5ECIB 4V2LA 3KCMA 1R7HA 4MF5A 4HI7A 1TOFA 3ZVJA 2K9FA 3EWLA 3EVIA 4N0VA 3HJPA 2R37A 4MZCA 4HS1A 2Z9SA 4WR4A 3H93A 5DJLA 3RPNA 1ZZYA 1XFLA 5IO0A 1A2LA 4EXJA 18GSA 4WF5A 2IMKA 1GUMA 4X1UA 3QFBC 1R5PA 1AUCA 1A24A 1GH2A 4K8MA 2AJQB 1PX7A 4ISDA 4XRAA 2V41A 6GSXA 3FR6A 2LV3A 5B8BA 2MMAA 4MMMA 1XW9A 2AYTA 2LRCA 4I5QA 5C04A 2ALBA 4EE0A 5DDLA 3BJ5A 1A8LA 4K2DA 5B6MA 5HR3A 4IP1A 1A23A 3O76A 4EVMA 2YANA 2JSYA 4K7IA 1MD3A 3IOSA 3C7MA 4XTSA 2VO4A 1SK1A 5AISA 2E0QA 3J7Yk 2VD0A 5H5RA 3RAZA 4TW5A 1OC8A 5J3RA 1TW9A 1T4ZA 1M9AA 3PR8A 4CW9A 3ZIVA 4DEJA 5A4UA 5J4UA 5GAPD 4MABA 2NBSA 1GSQA 4MJAA 3QDNA 5G1LA 2FLSA 5L71A 1F9MA 1OAZA 2GQKA 4LMWA 2A4VA 2DMMA 1TU8A 1SK2A 3IDVA 5CREA 4MPFA 3TOUA 4O5RA 2VD1A 4NMUA 2MMZA 2L57A 1ABAA 5B6NA 2WB9A 3I9V2 1U3AA 2HYXA 4F2IA 2FA8A 1WE0A 1EP7A 1OKDA 1H4OA 1V57A 2PVOC 3K8NA 1FW1A 3A2WA 5DVBA 3HXSA 3CSIA 4K7NA 2GSSA 1O6JA 4TVEA 4EDYA 4N0ZA 5F06A 1WMJA 3VURA 4GLTA 1IYHA 2EC4A 5ECLB 1KBNA 3ZIJA 5CAXA 3IBHA 1ZYQB 1MDJA 2WFCA 1RQMA 1SU9A 2LRTA 1TRSA 1PGTA 1X5DA 2C0DA 3HDCA 3WGEA 3N5OA 3KMNA 3VWVA 2GGTA 5AIVA 1XW6A 1PQNA 1EGRA 1HNBA 4N10A 3F4RA 1VF2A 2CVDA 3GL5A 2P31A 3C1SA 17GSA 2CZ3A 4JRRA 2GQMA 3DWVA 5G5EA 1GP1A 1M9BA 4XS6A 4KDXA 2V1MA 1K3OA 4LL4B 2J23A 3TDGA 3O6TA 2ZCTA 3H79A 1ERWA 2H70A 2GSRA 3TJKA 2E2GA 1NW2A 5IPGA 4TXOA 5ECSA 1SD9A 2LEGA 9GSSA 4GF0A 2CV4A 2H0IA 1ERUA 1O73A 3TKPA 2R2JA 3DVWA 4BVXA 2LQQA 1SL2B 1O7UA 4GCIA 3TRQA 4JBBA 1YEPA 4KSOA 2YNXA 3LEFA 1CQHA 3KTBA 5COHA 3M1GA 2GSQA 1ZCPA 4MZBA 4OFMA 3EU3A 1ML6A 2H1BA 3GL3A 5DAKB 4MH3A 2H19A 1MD4A 3GKMA 1N2AA 3LYKA 4ULXA 1NHYA 5DALB 5C00A 5GSTA 3R2QA 4OD7A 4V1Ag 4BPYA 4KCAA 3IRAA 4YH2A 4OWYA 2FWEA 1LJRA 3KH9A 5DAKA 3ME7A 3QAVA 4F82A 4K1FA 4IGJA 1DUGA 4NPBA 3DRNA 1LU4A 3H8QA 2FCHA 4V2MA 3GIXA 5DALA 3M9JA 2WRTA 5EPFA 4IBPA 2KLXA 5IMZA 1AW9A 4NHZA 3IA1A 5LCZA 1FHEA 2PN8A 4ZL8A 3A5WA 5GAND 3QPMA 16GSA 2O89A 4HJMA 1DE1A 1HYUA 1G6WA 3CSHA 4PQIA 4DSQA 1MEKA 3C71A 1BYEA 4WBJA 3LGCA 2KUCA 4BWSA 2HZEB 5IMVA 3W8SA 2X99A 4NV5A 1XVWA 3G7IA 4GRFA 1B8XA 2H1DA 3GA4A 1EV9A 3UAPA 2IPAA 2L6DA 4YAVA 3TRPA 3LFLA 1VRSD 1IYIA 2C3QA 1AQVA 2B5YA 3IK7A 1XZOA 2FY6A 3VWXA 5HQPA 2HZEA 3HYPA 1TRVA 5DBQA 3VLNA 1EOHA 1PL2A 2VCQA 3GN3A 4MH2A 2OACA 3CSJA 3FR3A 3QFAC 1UVZA 3HD5A 11GSA 1SJIA 1FB6A 1O8XA 2OBIA 2GZYA 1UN2A 1X5CA 4ZBAA 1YDKA 2YV7A 3F63A 2YV9A 3IPZA 1PKZA 2CVKA 1U6TA 3ZYWA 1WJKA 1QQ2A 2DJJA 2HSHA 3IAS2 3UBLA 1GTBA 1V58A 2I4AA 4TKYA 3UEMA 3HKRA 1XWAA 2CVBA 1K0AA 1ZMAA 1N8JA 4MF7A 1CQGA 3UMAA 4Q5NA 3QCPA 1BJXA 2GQLA 5IMFA 3FZ9A 1ZYEA 1Z6MA 3TKSA 14GSA 4K0NA 2CQ9A 2EIRA 4GQCA 4K9ZA 1T4YA 4HZ4A 1QGVA 1PRXA 6GSTA 2IMEA 3DD3A 2PVQA 2ON5A 3UOMA 1X0RA 2KP1A 3GUSA 1JZOA 3EC3A 2H8LA 4P3YB 2H73A 4O7HA 1XXUA 2PPTA 1JFUA 2YP6A 5A5KA 5HR0A 1T1VA 3GFKA 1EOGA 2I81A 3HVXA 2I9HA 1LBKA 4PNGA 2IIYA 3GH6A 3KXOA 2LQOA 2FA4A 2KOKA 1R5AA 4HU7A 2LJKA 1Z5YE 2GVPA 4O32A 2FUG2 2H1AA 1TTZA 3DVXA 2CT6A 4AGSA 2H01A 2AB6A 1EP8A 1XVQA 1QK8A 1GSDA 2LS5A 1BQ7A 2N5AA 5E4WA 2C0GA 3TJGA 3GTUB 1WRYA 3OR5A 5JWOB 1SJ6A 1JZDA 3GSSA 2OADA 4ACSA 1ACVA 3TKSC 3D5JA 2OE0A 3EU4A 2GZPA 5D93A 4N30A 2H71A 1SKSB 4IQAA 1K0OA 4IJ3A 3HJOA 1WPIA 1Z6NA 1GLPA 1Q98A 4RUVA 1FAAA 3GTUA 4J57E 2F9SA 4IW9A 8GSSA 5G31A 5CRDA 5IIZA 3NZNA 3P7XA 5F8BA 3W8JA 1I5GA 3Q19A 4ZL9A 4X43A 1Y25A 2H74A 4I97A 2HNLA 4IQ1A 1X9MB 2CX3A 4HOJA 3TKQA 1F3BA 5IMCA 3QMXA 1K3YA 4LA1A 1K0BA 3L0HA 2VL2C 2L5OA 4POBA 4IVFA 4KB3A 2GS3A 2G2QA 4YQVA 1B48A 3VPQA 2O85A 4FYCA 4I2TA 3F3RA 1YY7A 1K0NA 5DJMA 2K8VA 5INYA 3L4NA 1TXXA 1G7EA 2QC7A 4ECCA 3QAGA 4WXTA 2XBQA 3CTGA 2H76A 3KP8A 2NTOA 3APSA 4F0BA 4V1Ap 5FWGA 1DE2A 2OE1A 1K0CA 2X64A 2FHEA 4YAPA 3DXBA 4WKWA 3ZMKA 4IP6A 3P8WA 2MBSA 5JCGA 1GSUA 4NV2A 1SL1B 3W6GA 3PINA 2VCVA 2YWNA 3I69A 1OC3A 3GURA 4F0CA 2MYGA 3IXRA 3CRTA 5DCGA 2C4JA 5D9TA 3VWWA 1A8YA 5DCHA 2GT6A 1OKTA 3M9KA 5IMDA 13GSA 1XOBA 4IJIA 4KH7A 1G0TA 2MMNA 2C3TA 1TK8B 4PUAA 3A2VA 4QQ7A 2GSTA 2R6KA 1X5EA 4ZB8A 1YKAA 4Q5RA 3ZITA 3IE3A 2E7PA 1GULA 3M8NA 6GSUA 4TR3A 2NPBA 6GSVA 2H6XA 1SK0A 1T00A 3GNJA 4ZIJA 2LUSA 3ZMLA 3FZ4A 3QOUA 2PUKC 3G7JA 1E2YA 1XCCA 19GSA 2V6OA 4FO5A 2WULA 4ZB9A 4D73B 4KDUA 4IN0A 2N5FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite