3TUSA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 A Resolution
rcsb
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA02
4Q30B 1UTHA 1H76A 3A3CA 1B52A 1B0HA 3RTWB 3IB1A 2F6GA 1IZ1A 3C36A 1ZU0A 2RF1A 2Y84A 3OSQA 2REJA 3UK4A 1RYOA 1P1NA 4I62A 5DYHA 5DT6A 2ZXTA 1QUJA 3KG2A 3U8QA 3M3LA 4O3CA 3KFMA 4KCCA 3C32A 3B6WA 3TPAA 2DVCA 1Y3PA 3L6GA 1IIWA 4F3SA 2Q89A 2RCAA 3PGFA 1J1NA 3CI8A 1R1NA 3OEKA 2VHAA 4OERA 1S7YA 1QULA 4RA1A 1B4ZA 2XXUA 3MJNA 3FVNA 1P1UA 1B3LA 4FJPA 4YMAA 3PUZE 2R71A 1H43A 5ITPA 2I48A 4QFPA 2XXYA 3T9HB 4GWOA 5I59A 4TQUQ 3FVGA 4U23A 5H8NB 2I0BA 4XKPA 4FORA 3ZSFA 3C9HA 4H5FA 1LFIA 2PX1A 2RKMA 2VP1A 2DE4A 1LB8A 1I69A 5I57B 1FTMA 3LR1A 4LUBA 4DCXA 5I2KB 3FXQA 2Z23A 4G68C 4NF5B 4WEDA 3EF7A 4MLVA 3P7IA 1FQCA 3VVDA 4U22A 4IO5A 2OCUA 4N6PA 3OXNA 2F78A 3OO9A 4JXIA 4E0XA 2QS2A 4F19A 4RK9A 5AA2A 1M5FA 4NF4B 2NWJA 2HEUA 4G68A 1NNTA 2PBWA 2OJTA 4RPNA 2PT2A 3PPRA 2GHAA 4GFRA 4QSEA 3PD9A 4ZS9A 1USYE 4H67A 1I6AA 4ELPA 1IQ7A 3Q29A 3O2AA 1F9BA 4POXA 3IO4A 1PBQA 3EPEA 3O6IA 4PFTA 4OMBA 5AA2D 2O1MA 3MP6A 4M4GA 4GVOA 3B7DA 2HCAA 1B4HA 4HW8A 5AA1A 2NUVA 3KEIA 1PB9A 3KOTA 4H8IA 2A5SA 2YJPA 4DXCA 1A99A 3CVGA 3WAFA 1OQHA 5TU0A 3T93B 5H8HB 2DE2A 1EZPA 4OFOA 4O3AA 3VE1B 2V93A 3TUSA 3KSXA 2OWTA 3MVXA 1B3FA 3RPWA 2UVGA 1WODA 4JWOA 4POWA 3OO6A 4IB2A 5CI5A 3N6TA 4YU0A 3OEMA 4G77A 3K0VA 3SESA 3LBSA 1VE4A 3ODBA 3S4UA 3K1PA 4XKRA 3ZKLA 4F1VA 2RINA 4RNSA 1USYH 4FATA 2Y7WA 4QFLA 1JW1A 3EQ1A 1N04A 3U93A 1MY1A 1B7ZA 1SW1A 3H6UA 2Y7PA 4JBZA 1PB7A 5TP9B 4NF4A 1MRPA 3MZ1A 2F97A 2UVHA 2ZNUA 4NF6B 3KN7A 1B32A 2PT1A 4U21A 1ZIUA 3H6TA 4K3FA 3PUVE 3OELA 3K6XA 2I3VA 4ELOA 1UTBB 4BDOA 4FAJA 4FE8A 1VSOA 3G3GA 3JV9A 4IO6A 3MPKA 1VR5A 1PBPA 4OXVA 4G8NA 2DWIA 4OEUA 2GFEA 1A54A 5L8DA 4NMYA 4EUOA 4EF2A 1JW4A 1FTOA 4IY6A 3USDA 1LAGE 3TEPA 3VLUA 3UGWA 1LB9A 3EHUA 5CBSA 4C0RA 3TELA 2UVIA 3O6GA 2VOZA 5ISUA 3PU5A 3M3FA 2F35A 5HM4B 2B3FA 2RC9A 4GIZA 5AA4B 3V83A 1B3EA 5B7DA 2XXTA 3SKPA 2H25A 2DOJA 1SI1A 3TCHA 4OFLA 1XVXA 4F18A 4OETA 5EYFA 3VXBA 1Y9UA 3PPPA 3A09A 1FCKA 5DEXB 2IEEA 1AH5A 3CRBA 4H5GA 3TTKA 4L17A 1ZMGA 5FHNA 4KQPA 2VD3A 3C4MA 1HSEA 1P1OA 4G8HA 4H8JA 3ILUB 1MM6A 4AQ4A 4I8CA 1D3KA 4ECFA 2P2AA 4GXAA 2ZYKA 2HXWA 4GL8A 3MVZA 2NXOA 3HN0A 2B3BA 4U1OA 3BKIB 1XS5A 3EHTA 3RUMA 2I3WA 3IOVA 4PETA 2DS9A 4YKKA 2V3QA 4YKIA 5TP9A 4R2FA 3ZKKA 1EZOA 2RCBA 3TYHA 4ELRA 3G3JA 5H8QA 1FTLA 2XXRA 3GBBA 4EF1A 2QL3A 3FGSA 1NNFA 1UTBA 4YB6A 3TODA 1A7LA 4QHQA 1N7XA 1MY4A 3IOTA 5EHMA 4FECA 2DXRA 5CMBA 2I49A 3PPOA 1NL5A 2NVUB 3QYTA 5FHMA 3SERA 2O51A 3OD7A 3IL1B 5K2XA 4HCWA 3IJXB 2D3IA 3U94A 5F1QA 3N5LA 4F3BA 1P1QA 4RJZA 4BDLA 5JEIA 2QMWA 4O3BA 4P0IA 1JNFA 5FHOA 4EXKA 2F36A 3E13X 4HS7A 1B9JA 2A5TA 1LCFA 4M1VA 5JTYA 3PUXE 1IXCA 2ZYMA 1NNPA 2ABHA 1DOTA 3UA8A 2CZLA 3MZ9A 3W9VA 3H3GA 3MPLA 1B7UA 2DWAA 1B5IA 1ZTYA 4LVQA 3ZS6A 3OOAA 1M5CA 3IAZA 2B65A 3K01A 4DLDA 3BFUA 5CRYA 2Y7IA 1ZBMA 4QSDA 5B70A 4ELQA 4HTGA 3MVYA 5IKBA 2Q9TA 2V84A 4QFOA 1XT8A 3KN8A 4IO2A 1R9LA 4WEPA 3RT8A 2QS4A 4GRKA 1RKMA 3R7XA 3OSRA 3Q25A 5KCJA 4R6KA 3B6QA 1JETA 1M5EA 4RYAA 4NWDA 1ANFA 1MXYA 1Y4CA 5IAIA 5I56A 1B7HA 3VXCA 1SW5A 4E0WA 2THIA 3MBPA 3PPQA 5TPAA 3T22A 3THIA 3VLWA 4DXBA 1QJMA 4H1XA 2I4CA 2O68A 2Z8EA 2AL4A 3TTNA 4KI0E 4ESXA 3AXFA 4YB7A 4N13A 4GLIA 2FYIA 5H8SA 4JSDA 3SEXA 1MPBA 4NF8B 3LSFB 4OYVA 2H98A 3G3IA 1II5A 4U2RA 2O84X 2E1SA 2AL5A 1B40A 2H5YA 2F7CA 3KGCA 1AMFA 4OWDA 5LOMA 2AIXA 3VFJA 1NNKA 4BLAA 2XXQA 4IGRA 3DP4A 1MDQA 1LAFE 1FQAA 3MAMA 2I58A 4BDMA 2XXWA 1TFAA 5JK4A 1SW4A 1MG1A 3MW0A 3L6HA 1IITA 3FD3A 3PV0E 3FV1A 1B1HA 3FJGA 4ZDMA 1URGA 2O69A 3ECRA 1YTVA 3TQLA 3VLVA 5CMMA 2QPQA 3MZBA 1MM7A 1WDNA 1DTZA 3UP9A 1RYXA 1QUKA 3K6VA 3E3KA 3TTRA 3KJ7A 5FTHA 2F5XA 1FQEA 4IO7A 3CIJA 1YPNA 3C35A 1MY3A 1Z7ME 1P1WA 4F3GA 4XTCQ 3S2VA 3H6WA 4ZE8A 1MH4A 1US4A 1T0KA 1JVXA 4DXUA 3K2DA 4XKNA 4ISUA 5H8NA 1MQHA 2X26A 4LZ5A 4IO3A 5I58B 4GF8A 5KDTB 3JYRA 3BBRA 2ALUA 5AA3A 1DMBA 1FTKA 3FJMA 3PD8A 3FASA 5I57A 1N76A 4R72A 1WVJA 3K1MA 1I6QA 3G3KA 2Q8JA 1VFEA 5I2KA 3TFLA 4ONYA 3RTFB 3I6VA 1PEBA 1GR2A 4NF5A 2PMSA 4NE4A 4PFUA 1XOCA 1BIYA 3C33A 4OFJA 3K1NA 3U72A 3TZAA 1LBCA 3IO6A 3H03A 3H4ZA 3BFTA 3TTMA 1DTGA 1MXWA 3RY3A 4F3PA 2OZZA 3MUQA 4YZZA 5F7VA 4RPOA 1B6HA 3R26A 2VGQA 4QFNA 4LZ7A 1AL3A 2RC8A 2ONKE 3KOSA 1MDP1 4FIMA 1TFDA 4R9FA 4YICA 1B5HA 2F8DA 3S9NC 3O9PA 2ZMBA 4H65A 3S9MC 2XX8A 3T9VA 1TT1A 3PUWE 4R9GA 2LAOA 3CFXA 1QW0A 4DCYA 5H8FB 4OQOA 2NOOA 4QFKA 3KSJA 4LONB 1IXIA 1O63A 5H8HA 2DP8A 3V5AA 1N0TA 4ZEKA 3MVWA 1MPDA 3O97A 1ATGA 4F1UA 3K00A 2ZYOA 4YKPA 5K2YA 2PVUA 1I6BA 5I2NB 2KLFA 1MXUA 2DWJA 5DVIA 4MBPA 1SYHA 1YAEA 2XXXA 1MPCA 4LQ2A 4BDRA 1P99A 3PUYE 1LBBA 5I84A 1IUDA 1CB6A 4F2OA 2G29A 4ESWA 4IY5A 4TLMB 1N3WA 4U4SA 4DZ1A 1NH8A 2I0CA 2XXVA 4QSCA 1FQDA 5ICTA 1B46A 3LUYA 4PQJA 1PC3A 4G8MA 2P0SA 2HFBA 4EXLA 2F7AA 2UYFA 3FUZA 4BDNA 3M8UA 1US5A 4R74A 5DVFA 2D21A 4FEBA 4G2ZA 4NF6A 2UXAA 2O7UA 2R9JA 3PPNA 4LA9A 2F7BA 3R6UA 5CC2A 3QUJA 2DE3A 4XIGQ 4F29A 3VDFA 1CE2A 5CMKA 2GH9A 4XXUA 4OENA 3RNNA 3EHSA 1D9YA 2F6PA 3OO7A 1LCTA 5M2VA 3O28A 4P11A 3HV1A 2H99A 4X1DA 4BDQA 4JDFA 3VV5A 3U1OA 3JZJA 4ZZEA 4ZECA 4JWYA 4GL0A 5H8FA 2Z8FA 2WKYA 3FXUA 3S9LC 5I59B 5AA4A 3MP1A 1B3GA 1TWYA 4X48A 3PMXA 2XXHA 4DDDA 3HHFA 2P1SA 4YAHX 3M3KA 1B1XA 1B58A 2E0SA 3DP6A 3IR1A 3IB2A 4ZEDA 3ONMA 3B6TA 5DEXA 4AB5A 3HCQA 3LSLA 4UA8A 4QRZA 3SETA 3V89B 1O7TA 1BP5A 3K6WA 4R6YA 4R2BA 1A55A 2XXPA 3WAEA 2DXYA 2O7IA 4P0GA 2CMOA 1Z7NE 3SEUA 1OVBA 2QJEA 3TQWA 1Y4TA 5DVJA 4F2QA 2ANJA 2UVJA 4H0WA 3RGYA 4JWXA 4GXSB 1SVXB 3F11A 1BLFA 4OHNA 1Y1ZA 1Y3QA 2V25A 4Z7EA 1S50A 4G68B 1B0LA 2ZNTA 1MXZA 3LSWA 3TCGA 2HQ0A 1MXXA 1GGGA 3MWBA 2HZKA 1H45A 4EQ9A 3TTLA 3FV2A 1Y3NA 2HAVA 1OMPA 2H4IA 1VFDA 3DP8A 1FQFA 2D5WA 3U92A 1URDA 2DYXA 3MQ9A 2QS1A 1S9TA 4LATA 2O1LA 5A5XB 1H3DA 3TAJA 4X9TA 4FEDA 4EQ7A 1Y1MA 4TLLB 2V3TA 2O6AA 3HSTA 4OEVA 1LFHA 3W15C 1XC1A 3T9XB 1N84A 1XVYA 2VD2A 4LQ5A 2OK2A 2Y7KA 3T9UA 1LAXA 1N3XA 2ZYNA 3W9WA 3TDJA 3TKDA 5ITOA 1Y20A 2Q2CA 3IB0A 4YKJA 1A40A 4ZE9A 3SEYA 4N07A 1IXGA 1MQDA 1M5BA 3D4CA 3IORA 4GOTA 1MQJA 3CG1A 4KPTA 3SEWA 1IEJA 1HSLA 5KZTA 4C1UA 4TOZA 3RLFE 1TXFA 1OLCA 2F34A 3G7WA 4ZZAA 2Z22A 3O29A 3E9XA 1NFTA 1OIBA 3C31A 4Q0CA 3OENA 1QUIA 3O6HA 4R73A 3RT6B 1A8EA 3N6UA 1R6ZA 2Y7RA 2OWSA 1GVCA 4R75A 1OLAA 4I1DA 4X1BA 3H6VA 5L9MA 1GV8A 4MF3A 2BJJX 4ND9A 2Q2AA 3CFLA 2DQVA 4KYEA 1MY0A 1QVSA 3OO8A 2OBGA 3K6UA 3FVKA 4U1ZA 1EZ9A 5L9OA 3CG3A 1H44A 3T66A 5CMCA 3KJTA 3SEVA 1LGBC 3TCFA 3QXMA 2XX9A 1FTJA 1XHYA 5J1DA 1DSNA 3VVEA 1PB8A 2QSXA 4OZ9A 1PDAA 3GLBA 5A5XA 3KBRA 1DPEA 4MLQA 3IOWA 1MH3A 1LLSA 3TMGA 1DPPA 3GBAA 1ZLQA 1JVYA 5CBRA 3GXAA 4R6HA 3FXRA 4IGTA 3MP8A 3RN8A 3G3FA 3I5OA 1O64A 4KD5A 3IJOB 4NEDA 3HPIA 2UYEA 3FIRA 1GTKA 5L9SA 3KZGA 1POY1 1A8FA 1SI0A 4PP0A 5ICQA 1FQBA 4NWCA 4DE8A 4NF8A 2M8CA 2XX7A 3OMBA 1R9QA 3QAXA 2DSFA 3S9EA 1URSA 4UACA 3EN3A 2HAUA 3H06B 1B2HA 5BWJA 4IO4A 5BUUA 1JW5A 3HHGA 1Q35A 5ELVA 2I4BA 2I6EA 3VVFA 1EU8A 1SD3A 1HSJA 2GRVA 2V3UA 3ILTB 1ZKBA 2G93A 1ELJA 1POTA 1YCJA 3A3UA 4ZEBA 1Q1KA 3MC2A 3DLNA 5H8QB 3QUFA 1AOVA 3QSLA 3K02A 2X7QA 3IX1A 3HO7A 3N94A 2QMXA 4OVJA 1UIVA 2AYSA 1QKBA 1ZJLA 4F1YA 4KYSA 1NH7A 2ESNA 3E4RA 4G4PA 3D4GA 4QF9A 3SDFA 1B5JA 3QIMA 4U4XA 3Q26A 1JEVA 5EHSA 3O66A 3LC8A 1BKAA 3QK6A 2IA4A 4F22A 2DVZA 3CSBA 3Q27A 4JB7A 2H9BA 2REGA 4MFIA 1QKAA 2ONSA 3CR9A 4YMBA 3RQTA 1D4NA 3UORA 5HPQA 1IXHA 1LFGA 1B3HA 4H6DA 5FTIA 4I9DA 4KCDA 3FJ7A 3Q28A 4OTEA 3CSGA 4Z0IA 4KHZE 5I58A 4ZEIA 1JEUA 1L5TA 5KDTA 4Q8RA 4XKQA 1LAHE 3LSXA 2XXIA 4ZEFA 2A5TB 3K4UA 1KWHA 1UQWA 4EDPA 5JTYB 3V8XB 1FW0A 4PFYA 2RC7A 4PE5B 4LP2B 2XHDA 3UIFA 1UTHB 2X7PA 2QRYA 3GZGA 4HCYA 2YLNA 5DTBA 3DELB 3FATA 1B05A 2QS3A 2PYYA 4PFWA 3H7MA 1NKXA 1MS7A 2HZLA 1OVTA 2DWHA 1D9VA 4KYDA 1EH3A 4RY1A 1SBPA 4KR5A 2OLBA 3DM0A 3PMWA 4RXLA 4LZ8A 2FNCA 4C1TA 4DIGA 2GHBA 1M5DA 2XD3A 3IOUA 1SDXA 2FA7A 5HBCA 1MQGA 5KCJB 3IK6B 4YB5A 4WXJA 2ZNSA 1SYIA 1SQYA 3PMVA 2ONRA 3I3VA 3C34A 1MQIA 1LSTA 5I56B 1OQGA 3CFZA 2Q88A 1B51A 3KN3A 4F39A 4THIA 5CM6A 1JQFA 5TPAB 3UN6A 4EQBA 2XD2A 4NTLA 4OESA 3FZVA 4Q5TA 3T96B 4MH5A 4GQOA 4GD5A 5I2NA 3FVOA 1MY2A 2YPNA 3G3HA 1AIVA 2R6GE 1MXVA 3N26A 1NMUA 4WKMA 4AB6A 4RK2A 1SW2A 1UIUA 2W7YA 4JSOA 1BTJA 4KFQA 2Z8DA 1N7WA 4F31B 5AE4A 5AA2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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