3UOM | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	352
structure length	352
Chain Sequence	GLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Calcium-binding protein
molecule keywords	Calsequestrin-1
publication title	High-capacity Ca2+ Binding of Human Skeletal Calsequestrin. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	103
structure length	352
sequence length	352
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-11-16

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3uomA03
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3uomA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3uomA02

2EC4A 3VWVA 4IQAA 3ISOA 2VO4A 3IV4A 3QAGA 5CAXA 3KH9A 5ID2A 3I43A 1XVWA 1TU8A 5IOWA 2YZHA 3QFBC 3UL3A 3ERFA 1CQHA 3G7IA 4NHWA 1K0CA 4TN8A 3BOAA 1XFLA 2AB6A 1M2AA 5B6NA 3L9VA 4RQXA 3ED3A 2WCIA 4G2EA 2I1UA 3UJ1A 4HDEA 1GNEA 1WMJA 5HR2A 2PN8A 4XS4B 3JCML 3UAPA 1OAZA 4HEA2 4TXVA 3HZ8A 1FAAA 4XS6A 2CVKA 4CDOA 4PGTA 4JEDA 1QFNA 3KP8A 3TJGA 1O81A 5KN2A 2P5RA 3TJBA 3VI7A 2GDRA 4IJIA 4HJ2A 1Y6EA 4IKHA 5C04A 3ZYWA 4LA1A 7GSSA 1KEBA 1N8JA 4K2DA 1Z6NA 2HNLA 1A8LA 4HOJA 1UA5A 5J9BA 2H74A 3GYKA 3KIJA 3CYNA 3TCOA 3BCIA 3D0ZA 3HYPA 3KZQA 5GAND 2NTOA 4MPGA 2JU5A 3WYWA 3BJ5A 1ZGNA 2P5QA 3D22A 2GSTA 4GXZA 1EP7A 4ZB8A 1A2JA 4PQHA 1JHBA 1XBSA 3O76A 4X1UA 1T4ZA 4OMVA 1U88A 2CV4A 4POKA 4K7OA 2C8UA 4LL4B 5CRDA 2CX3A 5ECLB 6GSVA 5FWGA 4G9HA 4KDYA 4GF0A 5B6MA 1SYXA 1TJDA 5FHIA 1H4OA 1S3AA 2G2QA 3P90A 1IYHA 2L59A 4ZB6A 3HJOA 2O85A 4FYBA 5GAPD 1VRSD 2H71A 1J0FA 2K18A 2H6YA 2BTOT 2DJ2A 5CNWA 1GUMA 3GUSA 4XRAA 1PL1A 3ZMKA 4F0BA 4Z7XA 3HXSA 1DSBA 4TR4A 5B8BA 2KP2A 4EL1A 4JBBA 2VCWA 5DBQA 3FR9A 5FT3A 1AAZA 5AIVA 4PQ1A 1AIUA 4GQCA 1V2AA 2KLXA 4PXOA 3KH7A 4P3YB 2C0EA 2DJ1A 4KE3A 1O7UA 4KH7A 2HLSA 1AXDA 2VM2A 4TXOB 3NZNA 2FA8A 1TI3A 4AJ6A 1Z3EA 3QD9A 3QMXA 3H79A 4ZL7A 1SU9A 11GSA 1F9MA 1O8XA 3KMNA 1GSFA 1B9YC 1YEXA 1NHOA 5D96A 2DLXA 1THOA 1YKCA 1XOBA 2GQMA 3QOUA 4MP4A 1PL2A 2X64A 4JZQA 5CO3A 3IAS2 1TK5B 5ECKB 2VCTA 1SL1B 3HY2A 1VF4A 1NHYA 1RQMA 2H1GA 3UMAA 2ES7A 2L5LA 1GLQA 2XPDA 1SK2A 4BVYA 4AGSA 3CMIA 3LJRA 2FCHA 4F9ZA 2H76A 5HR0A 4IP6A 3ZIVA 4BA7A 3H93A 2OADA 4EKZA 1HYUA 1B4QA 3F0IA 1FVKA 3H8QA 1TRVA 1T3BA 5F0GA 4L0UA 2HSHA 1FG4A 4HJMA 2YV7A 1GTBA 1ERTA 2HRFA 1FW1A 5L71A 2TRCP 3DMLA 5ECHB 2H70A 3KGKA 2C0GA 5DCGA 3D4TA 3TKQA 2O7KA 2B7JA 4GCIA 5IO2A 4MF5A 2DC5A 1CQGA 4K0NA 3D6IA 2GQKA 2YWMA 3IAM2 2OBKA 2YPMA 5DVBA 4WF5A 4ECIA 5HQPA 2B3SA 3DVWA 4RI7A 2HYXA 3F8UA 1TRSA 2C1YA 2R5GA 4OD7A 2IMEA 14GSA 4JR6A 1TK8B 3HD5A 5J3RA 3HJMA 4K1FA 5G30A 3IXRA 2MMOA 2FNOA 2DSAA 5CREA 3FYGA 3TKRA 3F4RA 2GGTA 2YJHA 2F9SA 4IVFA 4POBA 3EINA 1QQ2A 4IQ1A 2H01A 6GSSA 1XW5A 2VLUA 1ZZYA 1JLVA 1QGVA 1A8YA 1BAYA 2ON7A 2H1AA 5ELAA 4EC0A 5G1LA 2OKAA 1OC3A 2FWHA 1XWAA 3GH9A 4MK3A 1J08A 2GZYA 2H6XA 1X0RA 3ZRDA 1A2LA 1OC9B 6GSTA 5JCUA 1F6MC 1QK8A 2NDOA 5KN3A 3U6VA 1PD21 3L78A 1OE7A 5B8AA 5KN0A 2A2RA 3LGCA 4E8EA 1X9SB 4XIHA 2HFDA 3GNJA 2YOIA 3A3TA 3W6GA 4ML1A 5D9VA 1EWXA 4HQZA 2IWTA 1K0BA 1M9BA 1B9XC 3GN3A 3IDVA 1TDIA 4GTUA 3U5RE 2B5EA 4GRFA 1Q98A 2FWEA 2H8LA 3DWVA 3SBCA 2TRXA 3WGEA 4EXJA 1BYEA 1RK4A 2RUEA 3R2QA 3ME7A 5IM9A 2WZ9A 4F03A 5ECOB 1AQWA 2MMAA 2DJJA 5CRWA 1Q4JA 4V2NA 2J9HA 1I9DA 4RI6A 2K8VA 1G0TA 5DCHA 5DJMA 2E2GA 4POLA 2V32A 3VPTA 2VL9A 2VCVA 4TR3A 5DJLA 2L6DA 4ULXA 5ECRB 3KCMA 5EY6A 1EZKA 4YQMA 1ZYEA 5COHA 5IMDA 5H5SA 1USBA 2CZ3A 4LLRA 1PN9A 4O5RA 3VWWA 5CP1A 4EDYA 3HDCA 3DGQA 18GSA 3ZFBA 1T8EB 3TDGA 4N11A 16GSA 4EF0A 1WRYA 3E3EA 1GSQA 3AY8A 2KP1A 2C4JA 3HHVA 5J9CA 1NM3A 2VAFA 2A2SA 3IC4A 1MTCA 4KB3A 4MJCA 3IA1A 1C72A 4GWRA 4NMUA 2N5AA 5ELGA 3Q19A 3LEFA 3BCKA 4OFNA 2FGXA 2GS3A 2GSSA 4MPFA 3F9UA 1GWCA 3GSSA 3EWLA 5F05A 4EDZA 2I9HA 3P2AA 1XW9A 1ERWA 5ID2B 3GSTA 2WS2A 2OE3A 1T4YA 4IELA 4NV5A 2IMKA 2YCDA 1M0UA 3E0UA 3F6FA 4OO5A 1LBKA 1YY7A 2H66A 1OYJA 1SL2B 2ALBA 3EC3A 1GP1A 1PGTA 4AJ8A 1W89A 1YF0A 4PUFC 5G2ZA 3FZ4A 5JWQB 1Y25A 3DXBA 1FB6A 2N5BA 2LTKA 5IO0A 4FO5A 1H75A 1MDIA 1F37A 1FB0A 3APOA 2LNSA 3TJFA 2IMIA 1HQOA 5D73A 3EYTA 3E9JB 2QGVA 5IMZA 4HZ2A 1OKTA 1A0RP 4K6XA 4TRXA 1F2EA 3F3RA 1JZOA 4V1Ap 3CSIA 2JACA 4ID0A 1N2AA 4WXTA 2VLTA 2K9FA 4KCAA 3M9KA 4BL7A 2VOCA 1YDKA 1ILOA 3L0HA 4ZB9A 2REMA 2F3MA 5H5RA 1V58A 1JZRA 4I2TA 2DMLA 5D9TA 4EUYA 4OFMA 2JSYA 1XW6A 5HFGA 1TU7A 3GFKA 1BEDA 2DBCA 3FZAA 4V2MA 2N5FA 4OWYA 1K0OA 1FVJA 4WKWA 5DDLA 1OC8A 2B5YA 1EOGA 4LMWA 4IN0A 5G1KA 1QXHA 2GSRA 1YZXA 4MJEA 4Q5FA 2H72A 3ME8A 1MDJA 5F8BA 1TRWA 1PX6A 1ZMAA 2NPBA 1JFUA 3A2WA 1SKRB 2GLRA 1R5AA 5IQYA 1XVQA 4I6XA 1S3CA 2MBTA 2H0HA 5A4VA 3CRUA 3M0FA 3DD3A 1V40A 4K9ZA 2YJ7A 4YH2A 4ZIJA 1J9BA 4N0ZA 4YAVA 4GLTA 4KDXA 5ECIB 3FR6A 2PGTA 1K0DA 3QAVA 3KTLA 2FHEA 2FY6A 3IHQA 2DJKA 2YV9A 2IIYA 4X0XA 1B8XA 3BBYA 1TW9A 3LWAA 3ZL5A 2CVBA 4IHUA 2JL4A 2PERA 2RLIA 2CVDA 3RHCA 4MF7A 4EO3A 4MF6A 2CZ2A 3A5WA 3DEXA 2GQLA 2BJXA 4WETA 2IL3A 4KCEA 4ECJA 3QPMA 4NPBA 2TIRA 1MEKA 6GSUA 1XWGA 4IP1A 4JR4A 1GTUA 3L9UA 3MAKA 2WB9A 2RUFA 3I69A 5J41A 2E0QA 1ERUA 1XCCA 3NOFA 2GT6A 2X8GA 4HS1A 3EMXA 1PSQA 3LORA 1URMA 2VM1A 1ABAA 1GNWA 3J7Yk 4OO4A 1GLPA 2M80A 4MZBA 4XCSA 3IR4A 3VPQA 1GSUA 2VCXA 2B7KA 2PMTA 2LQQA 3LXTA 3LFLA 6GSXA 3IOSA 4TKYA 3TJJA 3TUEA 4WBJA 2F51A 3RDWA 2H6ZA 2QC7A 4MABA 3OR5A 4KDUA 4MMMA 2L4QA 1B48A 1GTIA 3D5JA 1RW1A 3KXOA 1M2DA 4HUAA 3C73A 4KGIA 9GSSA 3HCZA 2LSTA 3J7Yb 4RUVA 2YZUA 4ZL8A 1FHEA 4PURA 12GSA 2O87A 3QCPA 4ZL9A 1BG5A 5D9XA 1A2MA 2XPEA 1EEMA 4GSTA 1YF1A 2LS5A 3KD0A 4XS1A 5E4WA 2IN3A 1GUHA 1XOAA 1G6WA 1EV4A 3WD6A 3DIEA 5CYYA 5DALB 4ZBBA 3TRPA 4MJAA 1PA3A 3GKKA 2A4VA 2EIOA 2AUVA 2LJRA 2RM5A 2D2ZA 4I5QA 4PX1A 5DALA 3IPZA 3TRQA 3HVSA 8GSSA 3H1NA 1U6TA 4XTSA 5IPGA 4ZBDA 3ZZXA 5F07A 3FKFA 2GZPA 5LCZA 2LRNA 6GSWA 6GSYA 3GHAA 3US3A 1F3AA 3EU4A 4PUAA 2V1MA 1GUKA 3L9SA 2H75A 1V98A 1HD2A 4KW6A 3ZIJA 4D73A 4TW5A 3ZREA 2LJKA 2X8CA 3IBHA 1TOFA 1GSDA 2XC2A 3RHBA 2P0GA 4IS0A 3EVIA 5HFKA 3MWHA 4G10A 1G7EA 2LNTA 4KNDA 1YJ6A 3TOTA 1KBNA 3DYRA 3EMPA 2HZEB 3CSHA 4DVCA 1A23A 1Z9HA 2IMDA 2FLSA 5ECNB 4PNFA 4I8BA 2VLVA 2OE1A 5DAKB 5KEJA 1SJIA 3QAWA 4G19A 3GTUB 3F6DA 2HZEA 2LKUA 2GVPA 2R6KA 1VF2A 3APSA 1V9WA 3TGZA 1K0MA 5A5KA 5DAKA 3HKRA 3GTUA 20GSA 1WPIA 22GSA 3W8SA 3P8WA 1TTZA 2M72A 1O85A 3CSJA 5ECSA 3LQ7A 4EE0A 3HJPA 3IK7A 3TKSA 5EVOA 4POMA 3M9JA 1WP0A 4O7HA 4K7NA 2JADA 4Q5QA 1AQXA 2ON5A 3GURA 1ZCPA 2YNXA 1EV9A 3HZ4A 4MZCA 5IPHA 3N9JA 4IW9A 2CX4A 1X5CA 4HZ4A 4JE1A 1WE0A 3RAZA 2VD0A 1ON4A 3MSZA 3PH9A 2AAWA 4K7IA 3M3MA 4OCFA 1PKWA 3Q74A 3CRTA 3F3QA 4YQVA 2WFCA 1GTAA 2F8FA 1W4VA 3H4KA 2IFQB 2DIZA 2HXKA 4MA9A 5C00A 3NIVA 1M7TA 3KJYA 3PINA 3LSZA 2ZNMA 3QR6A 3V1WA 4IBPA 3TKSC 2IFQA 2HI7A 4XRDA 4V1Ag 2YWOA 5DQSA 2I81A 3ZMLA 4KSOA 1AUCA 1OE8A 1R4WA 3UARA 2L6CA 2AYTA 2YN1A 1R26A 1AC1A 4JRRA 3F4SA 2L4CA 3D4MA 1M9AA 3HVVA 5EL8A 1XZOA 2LEGA 4KSMA 1VF1A 2P31A 3TJKA 2H0IA 4X43A 2H1DA 4ECCA 1BJXA 1YKAA 1PQNA 3GKXA 1U87A 1R5PA 3O6TA 4ZXGA 3I9V2 1X5DA 4MZWA 4ML6A 4DSQA 5INYA 2PPTA 3G7YA 3FW2A 1PKZA 3ZVJD 13GSA 5B7CA 2ZCTA 1SKSB 3GX8A 2C80A 2K6VA 3SWLA 1T1VA 4JU5A 2OACA 1XXUA 1SKWB 4DSSB 4BWSA 4PQIA 3WGXA 2R4VA 2JZTA 2H30A 4WEYA 19GSA 2WDUA 1THXA 2L5OA 1XPVA 2QKEA 1HNBA 4HU9A 4LMVA 1EEJA 2VCZA 4DSSA 3WGDA 5HR3A 2B6MA 3VWXA 2WRTA 3VFIA 3G9BA 3PGTA 3UVHA 1T7PB 1AQVA 1IYIA 4AF2A 4V2LA 4AJ7A 3VI5A 5DQYA 1HNCA 2J23A 2R37A 2H1BA 4Q5RA 5AIXA 1DBYA 3UBKA 4Q5NA 5AGYA 2GZZA 5CRGA 2KOKA 3GKMA 2CQ9A 5GSTA 1DE2A 3Q6OA 2VIMA 1DE1A 3HVXA 1TXXA 4NWYA 1HNAA 2V2GA 1TKDB 4EVMA 4E8HA 1ZL9A 2FWFA 2PUKC 2GSQA 2VL3A 5AN1A 4XS4A 1YEPA 1FO5A 3UBLA 3M1GA 4WBRD 3RBTA 4MH3A 5A4UA 1GSYA 3LYKA 4YQUA 1E2YA 3GL5A 4I2UA 3WT1A 5IMAA 2Z9SA 2VUPA 2KHPA 4QQ7A 2MZCA 4NHZA 2PWJA 1ZYQB 5HR1A 5J4UA 1EOHA 2MBSA 2CA8A 4FH8A 5H5QA 2YP6A 2L57A 1UC7A 1MD4A 1WOUA 1BQ7A 2VL2A 1JZDA 2DMMA 3QDNA 4DEJA 4GSSA 5IMCA 2F8AA 4MDCA 4MH2A 1OVNA 4FYUA 2PBJA 3KP9A 1K3OA 2PVOC 5G31A 4TR1B 4MLYA 2QSIA 1A24A 4ISDA 1Z7RA 5G5FA 2B1KA 4HQSA 4TR1A 1SJZA 1YQ1A 4HU7A 1M99A 2C0FA 1O8WA 1G6YA 3A2VA 4N30A 2C3QA 1K0AA 2FD3A 4BVXA 4QL7A 1Z7PA 3GKNA 3LYPA 4N0VA 4F0CA 3VURA 2AJQB 2DJ3A 1WIKA 2LJAA 4H86A 3G7JA 3W8JA 3ZFLA 4L8EA 1B4PA 1GSSA 5CRHA 2VL2C 5LNKe 1WWJA 2V41A 3ZTLA 4MCUA 3KMOA 3TKSE 1ML6A 1EGOA 3RPPA 4O92A 1SJ6A 4F82A 1ERVA 5G5EA 4GQFA 3GIXA 2YANA 4NXIA 3M8NA 2JSZA 1GL8A 2IJYA 4FIWA 4DSRA 2ZUPA 3GA4A 1SD9A 2O8VB 2C3NA 1K3YA 5JWOB 1KNGA 1SK0A 1XWKA 2HZFA 4TR0A 1EGRA 1UN2A 1V57A 3FZ9A 5A4WA 1QUWA 3FY7A 4ACSA 2DJ0A 2K8SA 2EIQA 1PX7A 4F2IA 5JWRB 4GSNA 5ECPB 1BX9A 4TXOA 5IMVA 4KX4A 1PRXA 2X99A 3GX0A 4IGJA 3CTFA 1X5EA 1GULA 2HE3A 2LQOA 1O6JA 1TRUA 2H73A 4ZBAA 4MJBA 5GZZB 3MDKA 3KTBA 3GRXA 5D9WA 1LU4A 2E7PA 3CBUA 2MMZA 3GV1A 3BD2A 1E6BA 3LXZA 4ECBA 4N10A 1U3IA 3DKSA 2WULA 3ZLPA 3TB2A 3TOUA 4TVEA 3FR3A 4L5LA 1OKDA 2JZSA 4KA0A 5JCWA 3IK9A 3C1RA 1EP8A 5EPFA 2B5XA 3APQA 4K0GA 1VF3A 3A2XA 3C1SA 5LD0A 2RIIA 4BWQA 3UIWA 2V6KA 1A0FA 3FEUA 1ST9A 4L5OA 2LV3A 2OBIA 3UEMA 1F3BA 1X9MB 2PU9C 3FHKA 4I97A 4WF4A 2B1LA 2R2JA 3WT2A 5J5NA 5ENUA 1GH2A 1XWBA 2VD1A 4D73B 2LRCA 4RQRA 4L0WA 1JZWA 2V6OA 2HSYA 4FYCA 4PNGA 1Z5YE 3FK8A 2WJUA 2X8HA 3ERGA 4J57E 1NW2A 3ZITA 1TI1A 3DRNA 3PR8A 3D21A 2OA7A 3KEBA 3HA9A 1PMTA 3FRCA 2RM6A 1U3AA 3TKPA 2AV4A 1K3LA 3UOMA 2MYGA 4ZILA 3IE3A 3I6AA 2NBSA 3MNGA 2DIYA 3EU3A 3RPNA 3GMFA 1I5GA 1LJRA 2VCQA 1JLWA 2CAIA 1DUGA 3QFAC 2E2MA 4KUNA 4ILFA 4WR4A 3L4NA 17GSA 4J2FA 3VWUA 5D8IA 3DVXA 1SENA 4O32A 4OFTA 5IOXA 1R7HA 2YWIA 1OC9A 1AW9A 3P7XA 2C3TA 4XHMA 1GSEA 1MDKA 1QMVA 2IMFA 2XHFA 2BMXA 4CW9A 3VK9A 2O89A 4KAEA 2XBIA 2HRNA 1NSWA 3GL3A 3EURA 1SK1A 2I3YA 2GT5A 4HI7A 2YWNA 1WJKA 3GH6A 2JZRA 2WGRA 1S3DA 4IJ3A 3C8EA 4BPYA 4YAPA 5IMFA 1VGLA 10GSA 4WR5A 5D93A 4LL1B 4K8MA 3N5OA 2MMNA 5HFIA 4NV2A 1SL0B 2FA4A 3F4TA 3IRAA 2EIRA 3KM6A 3UVTA 3C71A 1Z6MA 1ZOFA 2LRTA 1UVZA 1K0NA 3C7MA 2R3XA 1TK0B 4NAXA 5ABRA 2M46A 3TRXA 1X9WB 5GSSA 1TP9A 1XIYA 2FUG2 4TOPA 1GRXA 3VLNA 2G0FA 3EE2A 2H19A 1SD8A 4QL9A 3K8NA 4OCEA 1T00A 3Q18A 1MD3A 2XBQA 1XWCA 3LG6A 5F06A 3S9FA 2FWGA 1O73A 2AHEA 5JCGA 3O3TA 5ECQB 3CXGA 4CHSA 4J56E 2IPAA 2OJLA 3F63A 5E59A 2NVLA 1SYRA 2C0DA 2CT6A 2PVQA 2HT9A 2CAQA 3FZ5A 2LUSA 5ECMB 3ERWA 1ACVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3UOMA

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