3UWZA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 83
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwzA00
4O57A 4O4VA 4FNSA 4XUGA 1IF2A 3LXBA 4LNYA 1LCOA 3O63A 2YYUA 2WNZA 2PURA 3BO9A 4H6KA 1H7NA 1GTHA 3GXPA 1TTJA 2DP3A 1J2WA 1SW0A 1KV8A 1TPB1 2B7NA 1KLZA 3Q37A 3QJAA 4HT3A 2QCDA 5HJLA 3O05A 4ZQPA 1FCVA 2R14A 3EXRA 1RV8A 4PL1A 5HINA 3H53A 3UY8A 4JTIA 3NQFA 1Y0EA 1YTDA 2A4AA 1WX0A 1LBFA 4UUIA 3DKJA 2H6RA 4DO4A 3QFEA 3PULA 2G96A 3C56A 4UFJA 2E1DA 5I3HA 3CIXA 1U83A 1WBJA 3NZ1A 4BFAA 3HB9A 3LXAA 3N73A 3G18A 3HGRA 5LNWA 3ANYA 3M5VA 5D30A 5T26A 5I3JA 1H1YA 4MZ8A 4A3UA 3S1WA 4EF8A 3W88A 4CCEA 3KFTA 1AW2A 5EMUA 1LYXA 1EIXA 4NU7A 3L67A 2Z2UA 3U2OA 1S5TA 3W70A 4FHAA 2QUUA 3IV3A 4RZ5A 5G2WA 3PY2A 1UJPA 3L5MA 4O54A 1ML1A 2DZPA 4GUFA 3HMJG 4O53A 2V82A 1EB3A 3LI0A 4NXSA 3R8RA 1SSGA 2F7FA 2HTMA 1A5AA 3ZWSA 1F73A 1IXPA 5ABTA 2RDUA 3R13A 1I2RA 4LW7A 2WSRA 3TV8A 4Z0JA 3TFXA 3BW2A 1ZY9A 3T7VA 1G4SA 4AWTA 2A6LA 3L2IA 4IUOA 3LHTA 5J5RA 3SJ3A 4P2VA 4UTMA 4NNCA 3LTPA 4ALDA 3TJLA 4ORIA 5G1TA 2X1TA 1XDLA 3EX3A 3RK8A 4LC8A 5CSSA 3OIXA 2B4GA 5AC6A 5KITA 2QCNA 2CZEA 3SI9A 2CLLA 2QCDB 2WKJA 3LLFA 4JTSA 5DCDA 1FWSA 3IVUA 4FNTA 1M6JA 2C19A 1WBHA 4OBTA 3H54A 3WK0A 3FJLA 3GKFA 4E0CA 3ABQA 1ZALA 5E1QA 5LZLA 5K2ZA 1WAUA 3EWUA 3OVRA 2XN1A 5HUOA 4FXSA 2HS8A 5FF3A 3PSVA 4LRSA 5SWUA 3ABOA 3DU0A 4UC5A 5A5WA 3PAJA 5AC7A 1BTMA 1OX6A 3S5OA 4UTLA 3M5XA 1HUVA 3DAQA 1SPQA 2C0AA 3K30A 2WQPA 1TPWA 2VEPA 3UD6A 4MUZA 1LOLA 1FWTA 3TQVA 3O06A 3RMJA 4O1AA 3W7KA 3BPWA 5CPOA 2CWNA 1OFAA 3R5EA 3N9RA 5DXYA 4O11A 4X9SA 2V0TA 1W3IA 3W1AA 3GDMA 2QAFA 2H8XA 3GX9A 3G22A 3MHUA 4QQ3A 3P84A 4TMBA 3LCLA 1B3OA 4UXDA 2NXGA 4XWUA 4MVAA 3QQ0A 3GNDA 1KM3A 3ZR4A 5HNRA 4PODA 1A5BA 2J9ZA 3ELFA 3E02A 1VHNA 1JVNA 3W2KA 5K4ZA 1EWDA 4BWLA 1TQXA 1O60A 3G0UA 3EKZA 2A7RA 1W5OA 2C3ZA 4O50A 3THAA 4RV8A 1QFEA 4Q33A 4UFIA 1NSJA 1B9BA 5AHNA 3FIGA 4YMZA 1KFJA 8TIMA 2YPIA 3P5ZA 1WV2A 2Y70A 3DFPA 3CQ0A 3W2MA 1PCKA 1OX4A 1ZENA 2G95A 4KKXA 2ZZ3A 5G2IA 4KFOA 3PB2A 2VEIA 4GFSA 5LKYA 2YFNA 2QJIA 3TCEA 1W54A 4Z1BA 4WXZA 3KHJA 2QDHA 3TIMA 1GG0A 1QDSA 3GDLA 1LBMA 2YR1A 3L21A 5CZSA 1K3UA 1GOXA 2ZRVA 2A21A 3HGJA 3EWYA 1L6SA 1M7PA 2FB3A 1XC4A 5BOOA 4N6EA 3IGXA 1SZNA 2IQTA 4N6FA 1EP1A 3B04A 3FJ6A 4UMCA 2ZA3A 4UNLA 3MWAA 2VELA 3MO7A 1GVQA 1TPDA 5DCEA 2GQAA 2J27A 2BX7A 3LCIA 3LCWA 4EVZA 3DHFA 2DZUA 1L2UA 3TC7A 2V2DA 2ZFAA 4O13A 5U7SA 1QOPA 2FFCA 3BARA 5DN1A 4IWWA 2Y89A 5GVJA 3UWVA 4CNNA 4DELA 1VGAA 2VFHA 3U6WA 2ZRZA 5KINA 4KWVA 2R94A 3NL6A 2YZRA 3QF0A 4WY0B 2NXHA 2QUVA 3M5ZA 3B4UA 4OT7A 4ZL1A 3EXSA 3FKKA 2UV8G 3VCRA 2FTPA 1TMHA 4Q32A 1TPC1 1YPIA 1XXXA 1BWLA 2QCLA 5HWMA 1EA0A 3QMRA 4GUHA 3CC1A 1W8SA 3M41A 5HQEA 4PCFA 1TV5A 3RNDA 1GWJA 5BW6A 4AMAA 3G8EA 4O4WA 3LOTA 2GOUA 2Z6JA 3KXQA 4A29A 3TK7A 1ZAHA 3W7IA 1G67A 1R2RA 3STGA 1AL7A 3E0IA 2QR6A 1LROA 2EPHA 4BR1A 3PG8A 3OBKA 1XUZA 2X1RA 3BW3A 1QNVA 3S42A 4LT9A 5CPLA 4A21A 1OX4B 3F03K 3N9SA 1NFBA 2P0OA 1MEIA 4LVFA 4O16A 4R7JA 5J5DA 4FIRA 1BEUA 1PV8A 5D33A 2DORA 2ABAA 3M16A 3NPUA 2QCGA 2QJHA 4R33A 4AEOA 1Z48A 4HIBA 1EX5A 4NT0A 1T99A 1LZOA 1A5SA 4O1DA 4CCCA 3PBVA 2FPVA 3GNNA 4ADSA 2Y7EA 2G5WA 4RZ6A 1HO4A 3QYQA 3W1XA 3NQ6A 3CLMA 4JDYA 3QPYA 2HMCA 4UMAA 4CLMA 3HF3A 4Z1AA 3ATZA 4ML9A 3EWBX 3D0CA 3PUDA 5CSRA 3MI2A 1EP2A 2A6NA 4FX7A 4YCPA 2NV2A 3S5YA 4L4LA 5D2TA 4GUIA 1MEWA 2NLIA 1YTKA 1OK4A 3NQCA 1M5WA 1XCFA 4JNMA 3LX9A 5IBXC 4WOZA 4CCDA 1YXCA 2PRMA 3LCFA 2Q8LA 4X2RA 2VFFA 4K7VA 3NOEA 2E09A 3UWQA 1DL3A 1DJQA 3W2UA 4IMGA 1WOBA 2QCHA 1IIGA 5HWJA 4RR4A 4QNWA 4EIVA 4BF9A 1JQVA 1PVNA 4X3ZA 1SZFA 1JCLA 1AG1O 3EEGA 4TX9A 3W72A 5F4WA 3CWNA 3A24A 3LCGA 3C6CA 2ABBA 4AHPA 1GYLA 1SFLA 4FX6M 4JR5A 1GTEA 3W7CA 4N02A 3STEA 1TPFA 4I7VA 4M7TA 4IMFA 4ZVJA 4O1BA 1OVDA 1LOSA 4K6AA 1YDOA 2V8ZA 1ICQA 2QJGA 3KVJA 5E93A 2FQIA 1OYAA 4NVTA 4WUIA 1OG0A 4TU1A 1K7EA 2V5LA 2DJXA 4CQ8A 1FCUA 4UFHA 1JULA 3NYZA 3LTSA 1IXQA 4JTGA 4O8RA 1AW5A 1T0OA 3GIYA 1DJNA 1ME7A 3TQKA 2TSYA 3OVPA 4LTSA 1VYRA 2VC6A 3LTYA 1KA9F 4DQWA 4JIQA 2A85A 1JQXA 1W37A 2QAPA 2FLIA 4S2BA 1RQEA 3OVQA 4U28A 4HNVA 2ZA1A 2NZLA 2OCZA 1DHPA 3PG9A 3NZRA 3BG5A 3EX6A 2ZRUA 3GDRA 1L6YA 1THFD 2EGZA 2NV1A 3TX9A 3LHUA 1F2JA 3MP4A 1X7FA 1EWEA 3PF3A 4JEQA 2P10A 1H1ZA 3T78A 3JRKA 2B7QA 3W86A 3G1XA 3A22A 3NL3A 1QPNA 4ZMGA 2CLMA 5CPNA 2ZZ2A 3NPXA 3A23A 4FEZA 4UTWC 4UR7A 1YYAA 5G4EA 5LSMA 3FS2A 2E5BA 3OG3A 1LLZA 3W7JA 3NR0A 1I2NA 1H7WA 4LS1A 1NVMA 1W3NA 3WJXA 4ZQRA 5FF7A 1TTQA 2EKCA 1ZFJA 1JCYA 1KFCA 3P61A 1VR6A 1ZAJA 3NDOA 2YFOA 2BTMA 1E51A 4FNRA 5F4XA 1G7VA 3PBUA 3GB6A 1H5YA 4M5PA 5CZJA 4OE7A 5D2VA 3IIOA 4M6QA 5AYXA 1OHLA 4A2RA 3C2EA 1K03A 1VCFA 4GRSA 4E38A 1GJPA 1VQTA 1GPWA 1IXOA 3W1MA 3UXDA 2RKXA 1QO2A 3HG3A 1GG1A 5HWNA 4XBKA 4JX5A 3MI3A 3S9YA 1EEPA 4IJBA 1SW3A 1ADOA 1TTIA 3H55A 1WA3A 1QWGA 3NL2A 2VENA 3HGSA 3BK0A 4IXHA 4N9BA 3BLIA 2C14A 4PEKA 4LS2A 3A9IA 1QCWA 5F2GA 3A21A 3KOFA 3IGUA 3GYEA 1A53A 4FNUA 2NUYA 3UPWA 3I68A 3BG3A 3QC3A 2NX9A 4NJIA 4OV9A 2R8WA 3W1TA 3P67A 4P61A 2OZ0A 4HN4A 3HPSA 5I3KA 1TPH1 3QM3A 3VNDA 4LUIA 4AXKA 2RFGA 2E5CA 1T96A 2Z0IA 3LERA 4FF7A 1SZEA 4PL2A 5D03A 2E68A 2Q3RA 3R12A 3IEBA 3NM1A 4Q4KA 2FB2A 3W2NA 4Z08A 3T4CA 4MY1A 4IOTA 1YDVA 3L0NA 4WD0A 2V5BA 3IIPA 3HO8A 1MO0A 1QMLA 2QEZA 4TR9A 1ZCOA 3LRLA 4DPQA 1DQXA 4IX0A 1XI3A 4EOUA 1P1XA 1YPFA 1ZNNA 2PRHA 3IVTA 4AWSA 5FEWA 1WQ5A 2VFDA 4IMCA 2W6RA 3I65A 4Z1CA 4O12A 3W71A 1Q3NA 1QR7A 3DFOA 3W6YA 2Y61A 5EA9A 1ZJIA 4TIMA 4O10A 1K02A 1PCWA 2YW4A 4PFMA 1OFPA 5H91A 1FWRA 3JR2A 5FI8A 5D2WA 4JS3A 5K9CA 5C54A 2J24A 3TSBA 2WV8A 2E77A 3O6DA 1XBVA 2ZZ6A 3W75A 4LU0A 1D3HA 1W56A 5C2XA 3G1HA 1CW2A 4OGZA 4QISA 1S3HA 2EF9A 2DJLA 4LOCA 1QPQA 3GXTA 1B4KA 3BLFA 4Z0SA 1HO1A 4M19A 1YTEA 3CU2A 5AC8A 3NNTA 1AMKA 3G1SA 3TNOA 3L5LA 3A5VA 3GR8A 3P80A 3NM3A 4LUJA 1C9DA 4Y9AA 2ZDRA 1KM6A 1TJRA 2J9XA 1IXNA 3C52A 4JN6A 2VXNA 4MYAA 4NZFA 1TYGA 1VLWA 4RX0A 2BSLA 3DBPA 3G3MA 2WNNA 1O5KA 3G1VA 3PR2A 4JY9A 3OEXA 4O17A 5LNRA 3QH2A 4DXVA 3WJSA 5K9XA 4GXMA 1QOQA 3TKFA 5L6UA 1RD5A 3W7RA 3UQNA 2I9EA 1DVJA 3EKLA 1H61A 3P5YA 4ORMA 3HIJA 4LRTA 3NPWA 3NQVA 1G4TA 1JUKA 1PE1A 4C1LA 3M6YA 1IGSA 4RXFA 5D05A 3C8FA 3LHVA 3NQAA 2VOMA 1I45A 1T8XA 3S0CA 2PRLA 3G0SA 1ICPA 1PIIA 4LY8A 3C2OA 3M43A 4WJEA 4YL2A 1O95A 2JBMA 4CQAA 4GC4A 2WPBA 1P0KA 4GNJA 4PH6A 1VCVA 2TMDA 1K8ZA 4ICNA 2QCFA 4QSHA 2X2GA 4I7WA 4YLWA 3W74A 2NX1A 1CX9A 2GVJA 1FCBA 3EWZA 3S5ZA 1S5WA 5D38A 4S2CA 2E6FA 2FJKA 3KVKA 1W5PA 2BLEA 3LRMA 5F1VA 3CT7A 1KTBA 1RR2A 1W31A 1XL9A 4RZ4A 5I3IA 3TXZA 1OFBA 4DO6A 4B5NA 3E49A 1G4PA 3DGRA 2ZTKA 5C6MA 2Y88A 2EAWA 5DBTA 3F4WA 3NGJA 4RCXA 1VC4A 3QMSA 3P62A 4FNQA 1IIHA 1W1ZA 3TMLA 4DBEA 2C16A 2RHGA 3Q58A 3LHYA 4ZQMA 4ONVA 3TU9A 4A22A 4FIQA 1B57A 1SR9A 2CLHA 4DEFA 1J4EA 5AYZA 3MBDA 3UZ5A 4MZ1A 4IMEA 4BI6A 3M5YA 4JTFA 3ZFHA 3W7HA 4MFDA 1O94A 1M7OA 4WZHA 3MHFA 1FXQA 1H62A 4QM1A 3CEUA 5F2MA 5DLCA 1TJPA 4TO8A 3STFA 3CHVA 3N14A 4GWEA 4HPJA 2FDSA 3G24A 5K4XA 3QEZA 5KMYA 2ZTJA 1MEHA 1Q6RA 3P8JA 1XDMA 2WO5A 4UTHA 5IBXA 1FDYA 3S5NA 3IVSA 4ADTA 3ABSA 3CB8A 1JJKA 5AOUA 2XN2A 3MYPA 4O14A 2AAMA 3SECA 3CM4A 2GPTA 3GR7A 2H3DA 1OFRA 3EB2A 5I3FA 4HNTA 3OA3A 1TPEA 3SFKA 1LRTA 1KFKA 1P0NA 3UXAA 4K36A 1DV7A 4LV9A 4JX4A 3PUOA 1JR1A 1BWKA 1VS1A 5I3GA 1MZHA 4DF1A 3Q2DA 4HKPA 4JYDA 4XZ9A 5TBOA 2FPYA 3W85A 3IGSA 5F2LA 3W76A 2NUWA 4RKAA 1TPUA 2H90A 2VFGA 2X1SA 3HG5A 1TRIA 4KFNA 5AYYA 3FKRA 5LNUA 1TO3A 4YXGA 4AB4A 1D9EA 4H4IA 5AFDA 4ZZ9A 3P81A 3NAVA 1SO5A 5CPMA 1NF0A 2X30A 4NQ1A 4J9JA 3RF9A 1FDZA 3TW7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RCQ A;  4QLL A;  4XUG A;  3WX7 A;  3LXB A;  3P14 A;  3O63 A;  1Y65 A;  3BMV A;  2XVG A;  4WF7 A;  1RY8 A;  3BO9 A;  1HL9 A;  2PDI A;  1H7N A;  1UA7 A;  2V3E A;  3T2P A;  3UBP C;  1TTJ A;  1NFG A;  1J2W A;  2VCC A;  3FGC B;  4DWS D;  3N04 A;  2B7N A;  3Q37 A;  4IL0 A;  3E6E A;  3ONB A;  1UR8 A;  5FSD C;  2A3A A;  4DUV A;  3EXR A;  1RV8 A;  8RUC A;  1F8I A;  5HIN A;  3UY8 A;  3NQF A;  3OLG A;  3WLT A;  4A35 A;  4UUI A;  1S38 A;  3BTN A;  3PUL A;  4DZ5 A;  2WQD A;  4UFJ A;  1WBJ A;  1JPK A;  2W3Z A;  2IKJ A;  1BRL B;  1XLG A;  2NVD A;  3M5V A;  1OQF A;  5D30 A;  5T26 A;  1FWF C;  1H1Y A;  4A3U A;  1NH6 A;  1DJW A;  5EMU A;  3Q45 A;  2Z2U A;  3UCQ A;  3FJN A;  1M65 A;  4H04 A;  2F38 A;  4GX8 A;  4LY4 A;  3LG3 A;  1M03 A;  1KC7 A;  3RX4 A;  3BOF A;  1B90 A;  1XIB A;  3B8I A;  1EKO A;  3B8S A;  2VUR A;  2P8B A;  3GBD A;  5EMY A;  4NXS A;  2NQL A;  2PSN A;  1SSG A;  2Z1S A;  1R3Q A;  4AG0 A;  4AXN A;  5ABT A;  1I2R A;  4LW7 A;  2WSR A;  3TFX A;  4DIA A;  1WZA A;  3T7V A;  1G4S A;  4AWT A;  2OFJ A; 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