3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
2VH9A 2A97A 4YW2A 1XTGA 1ZB7A 2CL2A 3I4IA 2KI4A 3QYDA 4AWDA 3ILAA 3AKHA 3IM0A 4FP2A 2V5YA 1FV2A 4LO1A 3ZXKA 2ZHLA 4YZ3A 3A0KA 1IKQA 2D6OX 4XHXA 2A6ZA 1WCSA 4YG6A 2P39A 2NP0A 2ZZJA 3CNAA 1GV9A 2P34A 2EALA 4XJAA 3FJ9A 5HCFA 3Q7XA 4ZLBB 1UZYA 3AYEA 3AK0A 2E7QA 1LGNA 1RINA 3CU1B 1SR4C 2C9AA 3C8AA 4YZ5A 3ZSKA 3ZXEA 1GZWB 1LHVA 2ZGKA 4LO2A 2X2TA 3BA4A 4RA0A 5CA6A 1IILA 4XTPA 3CA6A 4QALA 3DDBA 4PCRA 4EFQA 4XILA 4QD2B 3UJOA 3S8JA 3POSA 4YW4A 1Z4SA 2E4MA 3MALA 5AVAA 4I4SA 3WG2A 1RZOB 1QDOA 3HALA 3ENRA 4K20A 1RY7A 1AFCA 5DZFA 1ENSA 3ZC8A 5GLUA 2LALA 1MACA 3FUQA 1G82A 1W6PB 4JKXB 4EJ5A 4NOTA 1W0PA 3WINC 4YW3A 2DRZA 5DSSB 1ISVA 2GNMA 4XTMA 3C2UA 1DYKA 2HWMA 5BVPI 3M3EA 2JD4A 4P0LA 3DGTA 3QIXA 1W3FA 4I8MA 1W6NB 1S0CA 1ABRB 1ILR1 3M3CA 1LTEA 2CNAA 3ZUQA 4XMAA 2PHFA 4HANA 1HWMB 1S0FA 1GKBA 1HQLA 1MS5A 4OW4A 2VW0A 1J1TA 1FAYA 2VW1A 1I3HA 1V00A 4U2AA 2DYCA 2IMAA 1W6MA 2FFVA 1I1EA 3UD8A 1ENQA 2NTDA 1YTOA 1IS6A 4TZDA 3IIRA 1NLSA 1N1SA 4X38A 2WQZC 2PHWA 5E8AA 3ILFA 3APBA 3PUBA 4YGDA 1A8DA 3BRFA 1BFGA 1D0HA 3WNXA 1CVSA 5GALA 5F9TA 1Y7BA 1QQLA 1UMZA 4I4XA 1LEMA 5GZCA 3U4XA 2JE9A 2KI6B 2A8AA 4XJUA 3F1RA 4A7KA 3N7KA 2PHRA 1SLTA 1Z78A 2VSAA 2ZGOA 4YM2A 1ULFA 4BLJA 3ZSJA 4Y1YA 1L2HA 4Q91A 1YRZA 4R9AA 5D62A 3UJ0A 3S8KA 4GKYA 1S0GA 4G6MA 1VCLA 1N1TA 4XBNA 2E51A 2D6PA 4L4HA 1S0JA 3RQ0A 4P6AA 4YW5A 4XJ9A 5H9SA 3FJFA 2H0BA 1BFFA 5IK5A 1FMMS 3TC2A 3M3QA 2GNDA 4AN6A 3PVOA 2WT0A 1BLDA 4BMBA 2JDZA 2ZGLA 3DDAA 2EXKA 2Q9XA 4WZFA 1CPMA 2DV9A 4X37A 4FOWA 4H55A 4ZOTA 1V6OA 3FFZA 5DVHA 1N1VA 4QD2C 2Q3NB 2NVHA 3AYAA 3VKOA 1JT3A 5JOXA 1LESA 3T1LA 1W6QB 3BB2A 1DQ4A 3IM6A 3A21A 3AX4A 2D6LX 4Z9WB 4YGEA 3Q7WA 5BOWA 3WG3A 1XYFA 1V6LA 4Y20A 2TEPA 3HBWA 4BLIA 4HJJA 2XHLA 4I6IA 4F83A 3QIZA 4Q9GA 4FGFA 1LODA 1O4YA 3B9CA 1JTCA 2IWTB 4FOYA 5G00A 2B7YA 1LHNA 2HW9A 4LBQA 4TYSA 3IMNA 4FPYA 4DPNA 1LECA 1XZZA 3V0AB 4XDQA 3D5OA 4FOQA 2EXJA 3FJCA 3F62B 1LHWA 1SCSA 4OEFA 4LBMA 1SCRA 4WVVA 4FPGA 2ISGA 3BOOA 1WUVA 4XE9A 1ZL5A 2AYHA 4YGBA 3POKA 1SLAA 4UW5A 5FZZA 4I4YA 3NV4A 1DBNA 2GNTA 4EB2B 3JUUA 3WMUA 4DRVA 2E53A 4I30A 5JOYA 2OW4A 4FQZA 2FPQA 1V6KA 1IRPA 5JVVA 3ASIA 4K1ZA 3H6RA 2ZHKA 3QIYA 1Q8OA 1D2SA 2SLIA 1AVXB 3AP4A 3UJ4A 2IMBA 1APNA 2D1ZA 4ISQA 5JDBA 5IK8A 3OYWB 2GNBA 3INAA 2R9KB 1F9KA 3UD9A 1IRAX 3A4UA 4A7YA 3SH5A 1F31A 1C4RA 1DQ1A 1CE7B 4JQ0A 2D43A 4W65A 5F5QA 4A7ZA 4AVSA 1S0IA 5GZFA 1TTUA 3ZURA 4BQ1A 3ZC9A 1JXNA 4YW1A 1Q04A 1PUUB 3UD7A 1LCLA 2VY0A 4G1RA 1DZQA 1R8NA 4Y1VA 4Z8BA 3PG0A 2KLLA 5BP5C 1N4KA 4HEVA 5EC5A 1QF3A 1V6JA 4YZ4A 3BRDA 4KC3A 4HA2A 5BQNA 4P9XA 3WMVA 4GP3A 1II4A 4GAIA 1JT5A 2WKKA 3RMYA 2D3SA 2R49A 1Q8PA 2LTNA 4R9CA 3WUDA 4KTXA 3WCSA 1SLBA 1OFSA 2ISHA 2MIBA 3B9UA 1GBGA 2DURA 2CY6A 1AXZA 1DQ6A 1DIWA 1RMLA 3AH1A 4P0JA 3WDVA 4FPJA 4K21A 1GGPB 4J2XA 2R0HA 2DVFA 1TIEA 3AYDA 1NZKA 4IONA 2ZQOA 1Q8QA 2E6VA 3VT0A 3N7LA 1IS5A 2NMOA 4WBCA 1YBIA 4J1LA 2W68A 1SR4A 3LSEA 2PHTA 2BEBA 4Y22B 3P53A 2EXIA 1Z0HA 4UW3A 4ZFWB 3I8TA 3FLPA 5BXPA 3ATGA 5KXDA 1KDMA 4XBQA 2ZGPA 2HWAA 1P63A 2A75A 3MW4A 3W9TA 3ZUSA 5L73A 3WVJA 1G9BA 3AZVA 3DUIA 4M3CB 3WA1A 1WBCA 2ZHMA 1Q1UA 3OBTA 3ZXGA 3WV6A 3N36A 4IY8A 1SBEA 1LJ7A 2UU8A 4LO0A 3T2TA 3D7WB 5HPZA 1QQKA 1ZA4A 1BFCA 1JLXA 1UN1A 1QOOA 1OQ1A 3MEPA 3BODA 4LBQD 1AX1A 3USUA 2EF6A 3O0WA 1DZDA 3WINA 3IM5A 4DCKC 5DZGA 4Y24A 4BOWA 1WLCA 2YXSA 2ZGRA 3QW8A 1KJLA 1DJSB 2DUOA 3B3QE 3BRGC 3HMYA 1FMZA 2ZGSA 2GO2A 2K8RA 5FNWA 2ARBA 3KMVA 1LOGA 3NWKA 3OJMA 3WCRA 2ES3A 5DG2A 4G6JA 2A6VA 5BQMB 3BAQA 1T9FA 5CB7A 2K4AB 1C1FA 5IK4A 1YF8B 5H9QA 3ZPYA 1AXMA 2Y9WC 2FHRA 3ZXFA 1G8WA 1HKDA 1MS8A 4P0KA 3QLQA 1VLNA 1URXA 1X50A 1PUMB 2PHXA 5IUQA 2DREA 3WDWA 4CJMA 1K5VA 2RG9B 2DTYA 4I0YA 1CIWA 3QJ0A 1LU2A 1E1HA 2JJ6A 1DFQA 1JYIA 4Q1PA 1IT0A 2WT1A 5DZUA 1GLHA 1G86A 3WHUA 1LULA 2ZGMA 4WVWA 4AYUA 3CAHA 3AXEA 4I4OA 4JC1A 21BIA 3CRHA 3MW2A 4GWMA 2CWSA 2KH2A 2ZMKA 4XXPA 3BA7A 1QNWA 4M3CE 1WBFA 1C57A 3AZXA 1C1LA 2GN3A 2DVAA 1CQ9A 1GZWA 2AGSA 3O12A 2P23A 2A7AA 1H9WA 4X39A 1U0AA 1UL9A 3A0NA 3B69A 4IZEA 3BAHA 2IHOA 2ZR1B 2D7FA 3O4OA 5D61A 3FIEA 2FGFA 5T55A 5IT6A 3AFKA 3NJ5A 4IY9A 1AX0A 4FPCA 2GDFA 2WSUA 3VWCA 3POYA 1MR5A 1UX6A 4TLPA 1W6PA 5IK7A 4LBKA 1J0SA 4D0TA 5JOZA 2RHPA 3SLIA 2G7QA 4ZFUB 1YXWA 1JN2P 1SLCA 2IMCA 5B2HA 1UAIA 3K1XA 2D24A 1ZKWA 1WBLA 1ONKB 4YOLA 4I4UA 1W6NA 1TP0A 1FNZA 4FQ4A 2I2SA 5BQUC 4HR6C 2F2FA 1BYHA 3VSFA 3SH3A 3LCPA 2AQZA 3D3XA 1HQWA 6I1BA 4ISRA 1T3AA 1JW6A 3ZSMA 5E89A 5DG1A 4LO1C 4SLIA 4JCKA 5DUXA 4YZ2A 3H0OA 4L4IA 4R6UB 1IS3A 2CYFA 3RMXA 4ITCA 1JLYA 4QKRA 1RIRA 4XZPA 2ENRA 3NBNA 5H9RA 2UURA 1IKPA 3VEQA 2WBCA 4JRAA 3CA1A 1VAVA 1ZN3A 2D23A 3BIWE 5HCBA 2DUPA 1ONAA 2D6NA 2AXMA 3H6SE 3BADA 5KXEA 5BYNA 1YI7A 3I2AA 4EFRA 1EVTA 1CPNA 3D6EA 1FWUA 2R16A 3VUOA 3L2YA 3WDUA 1HWPB 5CNAA 3C8BA 1H30A 1XQNA 3BA5A 4LO2C 3PJQA 4PF5A 3BOKA 2XG3A 1DZCA 4FPFA 4Y1ZA 2GZBA 3N7MA 1BZWA 2VSEA 3SNMA 2ZGNA 4FPKA 2A70A 1T4QA 1VAMA 3M1HA 4I3NA 1PZ7A 4XJ8A 2G7NA 1N3PA 4YM0A 3IPVB 4OWJA 1LGCA 5DUWA 5GLTA 4OEEA 4PBOA 1NXD1 2AR6A 1EPWA 3RTJB 2MLLB 1W6QA 3AP7A 4WV8A 1ISYA 1JHNA 4XXAA 1WD4A 4OEGA 5BXTA 2WT2A 3AP6A 1ULGA 3IPVA 3NV3A 1MZ6A 1KNMA 1OKQA 1UPSA 2ZKNA 4Y26A 3DS9A 5GJ6A 1MS4A 4J2KA 4M00A 1LOFC 2GMMA 5EXOA 5CBLA 3LTQA 1HKNA 1CVNA 3JU9A 4HL0A 2ZABA 2NZ9A 2P3KA 1W3GA 3OJBA 2W08A 1TOOA 4LBLA 3QR5A 1FWVA 2OUHA 4DRRA 1K5UA 2Y9GA 2Y9XE 3V0AA 4KS6A 1YVGA 1V6UA 4FPLA 3OBRA 4IYBA 2FDBM 1SBFA 3IN9A 2GMPA 2D3RA 1W6OB 3T8SA 3W59A 4AVTA 1CR7A 3RTIB 5F90A 1ENRA 2D7IA 1CJPA 3AP9A 5GLVA 1BQPA 2R1BA 2WRYA 5FZUA 3ZVXA 5BXRA 4I4VA 2F8XC 4FPEA 1EYLA 1YIFA 1N1YA 5HCAA 3O4AA 1N47A 2DTWA 2R0FA 1JQZA 3BWIA 1E0OA 2E7TA 1WW5A 2CWMA 3OYWA 3C89A 1MVQA 3M3OA 3AKIA 3C88A 1GANA 1ZM1A 2DUQA 1QNYA 1O4ZA 4UW6A 3VKFC 2D7RA 4GALA 5T54A 1SZ6B 3BONA 2AAIB 4IZXA 4D0ZA 3FJ8A 2L5XA 2JECA 1IOBA 1ULDA 2W52A 3P6JA 3ILNA 2GN7A 1G9FA 1FYUA 1FN0A 1WW7A 2V73A 1DLLA 5D63A 2AFGA 4G9NA 3TB0A 4P14A 3WO2A 3A22A 2X2SA 1PZZA 1SACA 1BJQA 2ZMLA 4UW4A 3A23A 5EHAA 2DU0A 1Q56A 3BAVA 1CONA 5F8SA 1WLDA 1UKGA 2ERFA 3HOMA 3CRIA 3CA3A 5I1BA 2W2DB 3C9ZA 3WDXA 8I1BA 5EYXA 2Z42A 3OGFA 1QU0A 4LO8B 3O49A 2ISEA 1V6NA 1T3CA 4ENDA 1YYNA 3WZ1A 1HWOB 2P2KA 2YV8A 1W0OA 4DS0A 3DSEA 1G9AA 1LOEA 3I29B 4DENA 3BAUA 2ARXA 2D20A 4ZFYB 3KQRA 4Z8SB 4IQPA 3AYCA 4Q8KA 3SNVA 5GAQA 1QOSA 3OJ2A 3PVNA 2ZACA 1Z2VA 5F8WA 3ZSLA 2UWAA 1IHKA 4XOGA 2DRYA 5DXDA 5FZYA 5T52A 4YG0A 3FGMA 3V0BB 2PHUA 2A3YA 2ZMNA 3N35A 4Y1UA 4Y1XA 1LOAA 4AGVA 2WSVA 4LO3C 1N3OA 4Y22A 2NYYA 1JBCA 3HR9A 1AXKA 1QOTA 4L8QA 2WNEA 2HZ9A 4F34A 2QN0A 1MZ5A 5T5LA 31BIA 4FPOB 1CESA 3PVEA 1GNHA 4M3CF 1R8OA 2P3IA 4M3CA 3FLRA 3WO4A 3VKMA 1TWMA 2QYIB 2ESUA 1IOAA 5JMCA 5GLWA 1ISXA 4GOYA 4PBPA 5JOWA 4GAFA 4R9BA 2BEAA 1VALA 3E8LC 3FJKA 2VXTI 2GALA 3ZXLA 3ZYPA 3AJYA 3OGGA 2YY1A 2ZHNA 4YM1A 3RG0A 4I4PA 2JE7A 4II0A 3CA4A 1GZCA 4LO7B 4RL7A 1AVBA 2ILPA 5BQUA 5DUVA 2R1DA 4USOA 4EFPA 4P9WA 4LBNA 4CTEA 4KUFA 3N0KA 1FGAA 3HN1A 3EF2A 3FJDA 2VLCA 2DVDA 5BQMA 1KQRA 1XHBA 3NF3A 3RRDA 3BX1C 4J2SA 4XKIA 4YZ1A 2ERMA 2ET2A 1MS3A 4ASMB 4LBOA 2A6WA 3WUCA 3LLPA 5KXCA 2WLQA 3VV1A 1S0DA 1G7YA 3NBDA 2J3PA 2YZ4A 3QCWA 1DQOA 3POWA 1CN1A 2Q5TA 5GM0A 3NV1A 1PWAA 1GYKA 2A3XA 3O44A 3NBCA 1N3QA 1PZ8A 3B01A 4NO4A 3ILRA 2Y9FA 4I1EA 2DVBA 5GLZA 4GP0A 4XFSA 1BKZA 3AZZA 4XMIA 4Q26A 3AP5A 2ZGQA 3CA5A 4OWLA 1V6WA 1ISWA 3FIIA 4ATEA 1GSLA 4R9DA 1VIWB 3CA0A 5LK5A 1DYPA 3AXDA 3W58A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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