3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
3QCWA 4EFRA 1S0FA 4I4YA 3FFZA 1AF9A 1W0PA 4FGFA 4QALA 1ISVA 5H9PA 2YXSA 3AZWA 1JT5A 4Z8SB 1PZ7A 2NYYA 1LODA 2DTYA 3OPZA 3UJOA 3WHUA 1FV3A 4J2XA 1MVEA 2NTDA 2PHRA 1AZDA 2AH2A 1GBGA 2W39A 3VEQA 3HBWA 2ERFA 1DZCA 4CZSA 3M3OA 3SITA 3QW5A 3O0WA 3R4UA 4I0YA 4KEKA 3FJCA 3OJBA 3ZUSA 4G9NA 4WZFA 5JOYA 3BRDA 3OBRA 3FJ9A 5BQUA 2W2DA 7I1BA 2ZGOA 1MS9A 1MACA 1GZWA 1ISXA 4UW4A 3RQ0A 4GP0A 1JY0A 1IJTA 1KQRA 4GWNA 1ILR1 1V6OA 1D0HA 1YIFA 1PWAA 2FFUA 1H30A 3IM0A 1Q04A 4TLPA 1AX1A 2XHLA 5EC5A 1LCLA 4Y20A 4D0TA 3PVNA 3CA0A 2FHRA 4P0KA 3FLRA 2EAKA 4FPFA 2A6XA 2P3KA 3IN9A 1SCRA 3C89A 2PHXA 1DQ2A 4Q2FA 5GLUA 1ZN3A 1YO8A 4BOWA 1G9CA 5DVHA 3CU1B 3AYAA 4G9MA 1H9PA 3A22A 4LO1C 1RITA 4WBCA 3ILNA 4ZKTB 3H6RA 3WZ1A 3N36A 1S0LA 2Z42A 1FATA 1FX5A 1WW4A 4YM2A 31BIA 3RG0A 1RY7A 1S0DA 3VKNA 1Z0HA 4C1WA 3CA1A 2PHTA 4UW3A 1AX0A 3GALA 4JC1A 1HWMB 2OVUA 1ABRB 4RA0A 1CPMA 4F83A 5KXDA 4GAFA 2ZR1B 3ZSLA 5DSSB 1S0GA 4KTXA 4ZFWB 5CAZA 1LEMA 3B3QE 3NF3A 2X2TA 3HN1A 5HPZA 3V0AB 1IT0A 1YRZA 2D43A 2WT2A 3AZYA 2A3WA 2HW9A 3IPVB 1FYUA 4FPCA 2WSUA 4BLJA 2ZACA 4OEEA 1DIWA 1C1LA 3H6RB 1SLCA 1N47A 4Q9GA 1R8OA 4YZ4A 3T1LA 2MLLB 2RHPA 2FMDA 2Y9WC 1L2HA 3M2MA 4XFUA 3NV4A 4OEFA 4Y22B 4YGBA 2AAIB 3FUQA 1Q56A 1KITA 1YF8B 1SLBA 4CRQA 4XKIA 1Y7BA 1LHUA 4YGEA 2E53A 1FWVA 1OFSA 1ENQA 3VWCA 1QNYA 4XMAA 3O4AA 1S0BA 1W6PA 2NN8A 5GLZA 2ETFA 1MS4A 5H9RA 1KRIA 1RMLA 2ESUA 3LSEA 3JRRA 1RIRA 1W6NA 1HLCA 4I1EA 1V6VA 2YMZA 1S1AA 2D6MA 3AZVA 3WINC 3CRHA 4QBCA 5KXEA 4H04A 4CTEA 3WDTA 1IOAA 2ZHNA 1ENRA 4FPOB 1Q8QA 1LOAA 1Q1UA 1DQ0A 1SBEA 3RMXA 4LBKA 5F5QA 3AKGA 4XTMA 3ENRA 4FPLA 3BA4A 1H9WA 4BLIA 1BARA 1IKQA 4I4SA 1MR5A 2ZHLA 3PVOA 2KLLA 3FJDA 2R0HA 4KS6A 5LK5A 1FWUA 1N3PA 3WCSA 4XIKA 2BFHA 1II4A 1SACA 3WMVA 1W0OA 4XJAA 5D61A 1EVTA 2KI4A 1V6MA 1MS0A 1BFCA 1LGNA 2KI6B 4K1YA 1BFGA 1V6JA 3POWA 2WLQA 1DBNA 4BMBA 4PBPA 4QD2B 3POKA 2FPQA 1YYNA 1MVQA 1APNA 4FP3A 5HCBA 9ILBA 4AVVA 1VLNA 1EV2A 5FNWA 2D7FA 1U0AA 2DS0A 5GZDA 2ZGRA 3ZXDA 1Q8OA 3DUIA 1HQLA 2A75A 4OWLA 5FZYA 4BMEA 2WBCA 3BAOA 4QD2C 4QC4A 2XB6C 1ULCA 4OZXA 5BXRA 3VUOA 3H0OA 4LBQB 1FQ9A 3WDWA 5BP5C 4YGCA 3FBYA 4M01A 1NZKA 1LGBA 8I1BA 1T9FA 2CNAA 1FMMS 2D6LX 3NBDA 1FMZA 3UJQA 1AX2A 1QNWA 4D69A 2RG9B 3WHTA 1CVNA 4FOVA 3AH2A 1IRPA 1MC9A 1XG6A 1TFMB 4GKXA 3C88A 2AUYA 4ZLBB 2DUOA 3SNMA 1ULGA 5G00A 2DVFA 2IMBA 3FJEA 3LSDA 3W9TA 4QBVA 2RSTA 4KUFA 4I1BA 3AP7A 3QIZA 3POSA 4Y24A 5FRAA 1MS1A 1NUNA 1HCDA 1A78A 4ZA3B 3I4IA 2VW1A 3OYWB 4U2AA 3O0VA 2GN3A 4FPKA 4XILA 2NP0A 1XZZA 1SBFA 1HWPB 2GZBA 1TWMA 1PZZA 4YFZA 4MYEA 2P23A 1UL9A 5DUWA 1IS5A 4XFSA 4FVVA 2D3SA 5DUVA 2ZHKA 3O3QA 5D62A 3VKMA 3IAGC 1LECA 1KJRA 1HKNA 2WNEA 2ZGTA 2ERMA 4I4VA 1PZ8A 2DREA 4M3CE 2UU8A 2JJ6A 1KDMA 2WKKA 2OW4A 3K1XA 3A23A 1TIEA 1QU0A 3ZX7A 1WBFA 4Y1YA 4A7KA 1I1EA 4YZ1A 3OY8A 4GKYA 2BEAA 1G9FA 4II0A 2WJSA 3FJJA 3ATGA 2AYHA 1QKQA 1V6IA 3IKWA 4LO3C 5IK5A 3INAA 1ULEA 1AXMA 1SLAA 1DJSB 1W6QB 2QN4A 2D23A 1ISWA 4ITCA 3ZPYA 3WG4A 5BYNA 4YW1A 1IOBA 1BLAA 4BQ1A 4X38A 3JUUA 1V6UA 4EKXB 3BOOA 1MD6A 2ENRA 2JE9A 3CA3A 3AYCA 1DZDA 4Y1ZA 1JBCA 1WD3A 2JD4A 2ZGPA 4M00A 4JQ0A 5JOWA 3MEPA 3NJ5A 2A6YA 2ES3A 3HSMA 4G6MA 3N7LA 3BAVA 3EF2A 5BVPI 1CJPA 2DVBA 3SH4A 3QW8A 1AVBA 4XTPA 4Q27A 2GALA 1WBLA 1S0JA 2LALA 5DUYA 5FZUA 3UDAA 4OEGA 4XBLA 3IM6A 3P53A 1JLYA 2OUHA 3VKOA 5HCAA 4LO2C 4AWDA 1DQGA 1R1ZA 2ZQNA 4I30A 4P0LA 1DYPA 2E4MA 4A7ZA 1AVWB 3SH3A 3WLUA 2HZ9A 2GMMA 1XYFA 3ZYRA 3O5WB 5GLVA 5D63A 4HEVA 2NMOA 4XZPA 4G6JA 1ISYA 2QN0A 4FPYA 5GLWA 2YROA 5BQMA 2R9KB 2GNBA 3V0BA 1GZCA 2W68A 3R05A 1LENA 2ZGQA 1G7YA 4XE9A 3A4UA 1N1TA 5JVVA 1G9DA 5I1BA 4JKQA 2NZ9A 1JUIA 1TTUA 1LU1A 2YV8A 2R0FA 3ZSMA 5GZFA 1A3KA 3QJ0A 4YM0A 2P37A 4Z9WB 5H9SA 1VIWB 1UPSA 4M3CA 3FLPA 2D6NA 2A97A 4AGGA 1C4RA 1QDOA 1ZM1A 4OUJA 3ASIA 2EXJA 5FREA 5B2HA 3ZURA 1DQ6A 1G82A 5EXOA 3O4DA 5FNXA 2P3IA 3WDXA 3BAHA 4NOTA 3TB0A 4PC4A 3S8KA 2VW0A 5L73A 1IS3A 1G86A 1QF3A 2D6KA 1ZKWA 1UZZA 3QLQA 1DGLA 2WQZC 1TP0A 2Z48A 4LBJA 5JOXA 1WD4A 2IMCA 1IS4A 4GP3A 4X37A 5BQMB 2P34A 2TEPA 3AK0A 2DRZA 4I4UA 2FO1A 3BAGA 4XJUA 1T3AA 4XHBA 1V6WA 4Z8BA 3MW4A 5T5JA 1LTEA 2A3XA 3AP4A 2E7QA 1Q8PA 4HANA 1DFQA 1J0SA 2E4MC 1WW7A 1GGPB 2KH2A 2P39A 4IZEA 4PCRA 4ZXKA 1LOFA 5T5OA 2CWMA 4H55A 2W52A 2F8XC 1UMZA 4R9CA 4ELCA 1S0CA 2CTVA 2W2DB 1QXMA 5T54A 4M3CB 1GZWB 3VSFA 3H6SE 5F8WA 3NV1A 2PHWA 3E8LC 1G9BA 4YW3A 4I7IA 3OGGA 4RL7A 4I4RA 1JT3A 3AP9A 4YZ3A 2V5YA 2D7IA 5T55A 3M3QA 2XHLB 1K5VA 3OBTA 1ZL6A 4Y20B 5BQUC 1LHVA 3ILRA 4Y1XA 2AR6A 1IS6A 4K21A 4ATEA 4IONA 2KM2A 3FLTA 3Q9OA 3AP6A 4JP0A 1RZOB 4LO0A 2AQZA 2X2SA 3WO4A 2D3PA 1LESA 2RQ9A 4Q9PA 4XFTA 3USUA 4P0JA 1UAIA 3O5SA 4TZDA 3RTJB 4FOYA 4DENA 3ZXLA 5DG2A 1YBIA 3TC2A 2B7YA 1AVUA 4I37A 3FJ8A 3PMEA 5GJ6A 3BB2A 1XHBA 1CR7A 2VW2A 3KMVA 4HA2A 1BASA 3UJ0A 1TEIA 4GWMA 4Q1PA 6I1BA 1LHNA 1EPWA 1W3GA 5IK4A 1GNHA 4DEPA 5IK8A 21BIA 4ISRA 2YZ4A 3FJAA 3M3EA 1PUMB 1DZQA 2WT0A 3WOGA 1MS3A 3DS9A 3DGTA 1V6KA 3M1HA 5CA6A 2VXRA 4XXAA 1ULFA 3LCPA 2GNTA 4I4QA 4X3AA 4J1LA 2ZGMA 3VT1A 4ZJXA 1YTOA 4JAWA 2W08A 1BXHA 2SLIA 2Q9XA 5DZGA 3HMYA 3B00A 3SISA 3SNVA 1LU2A 3A21A 3O4BA 3AXEA 1DFCA 1HKDA 1GLHA 2A71A 3ZVXA 5GLTA 2ZMKA 1URXA 3AH1A 2JECA 1XTFA 4LO0C 3WG3A 2L5XA 2ZMNA 3WA1A 3IM7A 5CBLA 4XOGA 1AVXB 2G7PA 1N1YA 3A0KA 1UN1A 1CN1A 1V6NA 1W6PB 1JN2P 4ENDA 3B9CA 1J1TA 3I2XA 4FQZA 3O0XA 2GMPA 1IILA 2I2SA 1W6NB 2P2KA 3UD7A 2PELA 4J2KA 3HR9A 2GO2A 2ET2A 4I4PA 2JDZA 2A6WA 5SV8A 1GKBA 2ZA9A 4YFWA 3BA5A 3BRGC 4IZXA 3BAUA 2Q5TA 2XOAA 1YVGA 2UURA 4XJ9A 3N35A 1ONAA 4C1XA 2ISEA 1F5FA 2AREA 3QYDA 2VY0A 3VKLA 5H9QA 1GZ9A 3PUBA 2EALA 2G4IA 4YM1A 4ZFUB 2A6ZA 3VV1A 1W3FA 4YW5A 3QW6A 2PHUA 3QW7A 3AJZA 4U36A 3P6JA 5CB7A 3MW3A 4XXPA 3V64A 5F90A 4PQ9A 4QKRA 3ZXGA 1WBAA 2ZGSA 3AFKA 4FOQA 1ULDA 4M3CF 2Q3NB 4DFSA 2ZQOA 4UW6A 1QOSA 4K20A 2F2FA 5KXBA 3CA5A 3D6EA 2MC2A 4IHZA 5DZEA 3PVEA 3BOKA 4I8MA 1SBDA 3WV6A 2Z49A 1CIWA 1GANA 3AJYA 2DRYA 1OQ1A 5KXCA 3AKIA 2DYCA 3NBNA 3ZC8A 2K4AB 1QQLA 4R9BA 4Y1UA 3BADA 5E88A 1RG8A 2YY1A 2PHFA 1SLTA 4KEIA 4PF5A 4GOVA 4P9YA 1IRAX 4YOLA 4XBQA 3T1MA 5JLVA 3QIXA 2FFVA 2YUGA 2ZGKA 5F8YA 4FQ4A 2I1BA 2GNDA 2R16A 3B69A 4XJ8A 5E8AA 2D22A 3ZXEA 3BODA 2Y9FA 1SZ6B 1FNYA 4GAIA 1W6OA 4K1ZA 3B01A 3WDYA 3R4SA 5EYYA 2JE7A 5GZGA 3N0KA 4LBNA 2K43A 4BM8A 2VH9A 3PJQA 5JDBA 4AGRA 3FIIA 2D6OX 1GV9A 4IYBA 1MZ5A 2CYFA 1W6MA 1MS5A 3ZSKA 3WO2A 3VT2A 5DZFA 2CL2A 3CNAA 2D6PA 3HOMA 2LIEA 3NBCA 2A70A 5IK7A 1F82A 2GDFA 2VXTI 1D2SA 4JRAA 3WCRA 1N3OA 4DS0A 3FJKA 4HL0A 4DCKC 3BONA 1Q8SA 3RMYA 3IIRA 2VUAA 4Q91A 1Z78A 5DG1A 5DXDA 1JYIA 5T5PA 3WVJA 4LO8B 3L2YA 1FN0A 1A8DA 3V79C 4YG6A 3BX1C 2NMNA 3I29B 3O4OA 2JKBA 2XG3A 1Z2VA 4EJ5A 4FPJA 4I4OA 2GNMA 2WT1A 3CQAA 1LEDA 3OY8B 3PG0A 1WW6A 4YG3A 5DUUA 2UWBA 4YZ5A 4X39A 2R1DA 4WVWA 4H9WA 2DV9A 1JYCA 2R1BA 2LTNA 3C2UA 2A5ZA 4DPNA 1ONKB 4AGVA 3H6QA 3LLPA 3AJ5A 1O4ZA 3ILFA 1YI7A 1I1BA 2HWMA 5GZEA 3SH5A 2ZGUA 1BQPA 4WVVA 3DSEA 3CAHA 4YGDA 3F62B 5E89A 3NV2A 5AVAA 1JXNA 3O44A 1AJOA 2ZKNA 3Q7WA 3CA4A 3Q7YA 1C1FA 2EXKA 4XBNA 3BWIA 3ZXFA 5EWSA 4ZOTA 4XHXA 3T8SA 4TYSA 3IM5A 2DVGA 1QQKA 4KC3A 3O49A 3LTQA 1Z7HA 4I2SA 1BZWA 3WMUA 5T52A 5BXSA 3AXDA 3HALA 2VSAA 1B09A 2D7RA 1CESA 4UW5A 2V73A 2E7TA 3UK9A 1JTCA 2ZGNA 2DURA 1LOCA 3FJBA 4J2YA 1OKQA 3M3CA 2DVAA 1QOTA 4EFQA 4GALA 2K8RA 2ZHMA 1CQ9A 2ARBA 2D3RA 2DU1A 4XYXA 1ZA4A 2DUQA 2CWSA 1FNZA 1DQ4A 3V0BB 3ZC9A 3BA7A 1FV2A 1C57A 5GM0A 4DQAA 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 2DWR A;  2ZML A;  4IY9 A;  1ITB A;  3AZZ A;  2UWC A;  1WUV A;  1CVS A;  1JQZ A;  3A0N A;  2Y9X E;  4AYU A;  1W6M B;  1F9K A;  4ZFY B;  4AN7 B;  3BOP A;  1DLL A;  2UUS A;  1VCL A;  3ZXK A;  4R9D A;  1QGL A;  2EXI A;  2D20 A;  4J23 B;  4XDQ A;  4LO1 A;  2DVD A;  1CPN A;  1BJQ A;  1T4Q A;  3D4K A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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