3V0B | Genus

Total Genus 409

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	409
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
molecule keywords	BoNT/A
publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium botulinum
total genus	409
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0bA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0bA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0bA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0bA01

4XFTA 1RZOB 3E8LC 5T50A 3AYEA 1DIWA 2DS0A 3I4IA 3PHZA 4WV8A 2D6OX 2NMOA 3FUOA 1JQZA 4R9BA 4LBQA 5BQMB 2GALA 3B9CA 1LHWA 1R8NA 4XOGA 5GZCA 1WLDA 3SH5A 4USPA 1LHNA 3RG0A 3O4BA 5BXSA 1LENA 1OQ1A 4P0KA 4WZFA 1CPNA 1MVEA 5FNWA 2A6VA 3PVNA 3BAHA 3QIXA 1AVAC 3A21A 1G82A 3AKFA 1HDKA 2ZZJA 1OKQA 1W6MB 3IAGC 3AZZA 3BAUA 3QCWA 1MACA 3WDUA 3T1LA 3D5OA 1TFMB 3O5SA 2ZMNA 2IWTB 2E6VA 2DUPA 3WUCA 3PVEA 2IMAA 1MZ6A 1N4KA 3WZ1A 3C88A 3CU1B 1VLNA 1ULFA 3RQ0A 3FLRA 4GXLA 2ZGPA 4PF5A 3WO4A 4Y24A 3ZURA 4AVTA 1UMZA 2GNTA 3MW3A 3VV1A 4UW5A 4YZ3A 2KH2A 4G1RA 3ZXFA 2UWCA 1IS6A 3HMYA 2E7QA 4M3CE 2PHRA 4JPZA 5BXPA 5LK5A 2DRZA 2EXHA 3VKOA 2A5ZA 1PWAA 1W6QB 2C9AA 1MZ5A 1F9KA 3ENRA 3CRIA 2A3WA 2EAKA 1UZYA 3M3EA 4ZGRB 2X2TA 5BQMA 5GALA 3VKFC 1MS4A 2FFUA 1JLYA 1G9CA 5DSSB 1RITA 1ITBA 3IKWA 3WG2A 4FOWA 5KXDA 3WLUA 3QIZA 4C1XA 3VT2A 2E4MC 3IPVB 1BYHA 2D23A 1F82A 2QN0A 1CESA 5KXBA 2D6NA 4GP3A 3BRDA 1OFSA 3AP6A 3IIRA 4YFZA 4AN7B 4FQ4A 4I1EA 3OBRA 5D62A 2HWAA 5D63A 3I2XA 1W6MA 2VSEA 3NJ5A 3W59A 4P0LA 1NLSA 5DZUA 3AZYA 6I1BA 3EF2A 1IS4A 2R49A 4DRVA 3OJBA 4DCKC 4JCKA 2ZMKA 3AK0A 3DSEA 3NV1A 3JRRA 5HCBA 1LESA 1K5VA 2ESUA 3TAYA 4NOTA 1I3HA 1UKGA 4QBVA 4I8MA 3KQRA 4FOQA 3H6SE 3C8AA 2UURA 7I1BA 1FV2A 1HQLA 1Q8PA 4FQZA 2TEPA 4CTEA 3WO2A 5JOXA 3VKMA 5JOWA 3I29B 4XILA 3AP9A 4YW4A 1DQ1A 3SH3A 3MEPA 41BIA 4X39A 1N1VA 4XE9A 1DGLA 1B09A 2NYYA 4H04A 5G00A 3NV3A 3F1RA 3AXEA 2YROA 5F8SA 31BIA 4YM2A 3ZXJA 2WQZC 3AJZA 3IPVA 4JAWA 1XQNA 3H6RA 1DJSB 9ILBA 2PHXA 3SISA 1S0JA 4M00A 2PELA 4LBNA 2DTYA 1W3FA 2EXIA 2BEAA 2G7QA 2GNBA 1O4YA 4OWLA 2ZA9A 1PZ7A 1D0HA 2RSTA 3KMVA 3BAQA 2NZ9A 2DUQA 2JE9A 5JMCA 4LO2C 4F34A 5BXRA 3ZXGA 3H0OA 4USOA 2ERFA 3WUDA 1GKBA 3D4KA 5IK7A 4I4PA 1JTCA 3AJYA 1V6VA 2R9KB 3T2TA 4QC4A 2ISEA 3O0WA 3OJ2A 2ZQOA 4J1LA 1P63A 4G9NA 5BQNA 3DUIA 3V65A 2I1BA 1ISXA 3FJKA 3V64A 1ENRA 1X50A 1C4RA 1SFYA 4QO3A 1M16A 5DZGA 4XHBA 3W58A 3B01A 4FPCA 2ZBJA 5T5JA 3B9UA 3BAVA 2GDFA 3BOPA 1HIBA 1MS8A 2KKIA 1JBCA 4Q9PA 4UW6A 1JW6A 2ZGMA 4M3CA 3TB0A 2AQZA 1E0OA 4W65A 3V0AB 4FGFA 1T3CA 3BWIA 3A0NA 3FJBA 3DEBA 2LALA 4KEIA 4FPJA 1TIEA 3VEQA 3O5WB 5F8YA 2D7FA 3A23A 2AGSA 4XFUA 4LO3A 2DVGA 2D22A 5JVVA 2HWMA 2DRYA 3W9TA 1S0FA 2ISGA 3VKNA 2NTDA 1BFFA 2DVDA 3TC2A 2A70A 3VUOA 1G9FA 2G4IA 4IONA 2D6PA 2FHRA 2WJSA 1AZDA 1QQLA 3PVOA 1Q8SA 5H9QA 1DQ4A 2WT1A 1F31A 5BVPI 4TYSA 1BASA 3UD9A 4XIOA 1AX0A 4I2SA 3DDBA 1LEMA 1SLCA 1YRZA 4XMAA 3M3OA 4ZXKA 3BOOA 4QBCA 4DFSA 1DLLA 4AGGA 3UJ4A 3VSZA 1ZN3A 2G7PA 4P14A 4AYUA 1RMLA 4JKQA 2CTVA 5EC5A 4Y20B 1FNYA 3QLQA 4XKIA 4LBQB 5BQUA 3OGGA 1O4ZA 2A6YA 4TZDA 4LBOA 4YGEA 3CA3A 3SNVA 2FFVA 3AFKA 4HJJA 5FREA 3WMUA 3WNXA 1VCLA 1IILA 5T5OA 4ASMB 1QNWA 4I4QA 1LHOA 3WCSA 3BONA 3VKLA 3ZXLA 4I37A 1NXD1 1N1TA 1BJQA 4C1WA 1FAYA 1AVWB 2AUYA 3T1MA 4Y1YA 1YYNA 1LGCA 4I96A 1XYFA 3BX1C 3OBTA 4XTPA 4Q8KA 3RTJB 1NZKA 5SV8A 2ZGOA 4Q9GA 1FNZA 5H9RA 2QYIB 4EFRA 3OJMA 1N3QA 1A78A 1EV2A 3HBWA 2NN8A 3CA5A 5JOYA 5L73A 2R0FA 1LOFA 4WBCA 1BARA 4XDQA 1JT4A 5CNAA 1GV9A 2WT0A 2FDBM 2ZGRA 3POYA 4YW3A 4PBPA 5IUQA 3WDXA 2LTNA 2ISHA 2UWBA 1AFCA 4Y1VA 1APNA 1YF8B 2Q9XA 4XBNA 3HN1A 3FJCA 4I0YA 5FZZA 4Y20A 1R8OA 3SH4A 3NBEA 2OUJA 5GZGA 3S8KA 1JLXA 3JUUA 4JRAA 1AJOA 1AF9A 4YW5A 1EVTA 4ISQA 5I1BA 1C57A 1BFCA 3ZUQA 1V00A 4AVVA 1W0OA 5D61A 2VW0A 1LJ7A 3MALA 4XTMA 2KI6B 2AH2A 1UX6A 1ZM1A 1SLBA 5BP5C 4BPZA 1SCRA 4I1BA 4GWNA 3GNEA 1CPMA 1LGBA 1VALA 5GZDA 2ZGSA 5CBLA 4LBMA 4ATFA 1A3KA 1Q56A 3BOKA 3O4DA 1LEDA 3P6JA 4I3NA 1FMZA 4G6JA 2KLLA 5H9PA 1LOCA 1GZCA 2MLLB 1KDMA 1AXZA 4FP3A 3QR5A 1I1BA 1CONA 1SLLA 3KM5A 2H0BA 5GLWA 2VH9A 4EFQA 4FPFA 2Q5TA 1KRIA 4EKXB 1S0BA 5BYNA 2PHUA 3T8SA 2VY0A 2D6MA 1XTGA 1IRPA 3WDVA 2A6XA 1KJLA 1N47A 4ENDA 1AXMA 3O4CA 5JDBA 1DYPA 4DENA 3CNAA 3C8BA 2KM2A 3FJFA 1H9PA 1MS1A 3NWKA 1IOBA 2E51A 3BA5A 3N7JA 3N7KA 4UW3A 4KC3A 4EB2B 3ASIA 1LHUA 3JU9A 3ZVXA 4YGDA 1FWVA 3LTQA 4OWJA 4Q2FA 2JDZA 4XJAA 2HZ9A 3QW8A 2ZGNA 1RINA 2ZHLA 3LCPA 4YM3A 5EYYA 4JKXB 3SNMA 1MVQA 1YIFA 2WBCA 3AP5A 3H6RB 2F2FA 2AYHA 4I4VA 1SR4A 4G9MA 2NP0A 1LOBA 4XJWA 4GWMA 4LO3C 3M3QA 5DUVA 2ZABA 4RL7A 1HQWA 3AP7A 1CVNA 3AKIA 1Z7HA 1BA7A 2AAIB 1YO8A 1C1LA 2YY1A 4JC1A 4PCRA 4Q26A 3V0BB 2D6KA 4MYEA 1BXHA 1SZ6B 3UD8A 2HW9A 3IN9A 5AVAA 4QKSA 5IT6A 1AX2A 4ITCA 4YZ5A 2YV8A 1ULCA 3P53A 1J0SA 1Z78A 1Z4SA 3HR9A 5DUWA 4BOWA 2ZQNA 3GALA 1URXA 2ZR1B 3ZYPA 2K4AB 4Q8LA 5CB7A 3WCRA 4QKRA 2XOAA 3I8TA 4YLZA 1DQ5A 5IK5A 3QYDA 3AP4A 2YUGA 1XHBA 2XG3A 1G86A 1MS0A 3FJEA 3FJHA 2Z49A 3SLIA 2C5DA 1ZL6A 3NV2A 4K21A 2AENA 3ZSLA 3CAHA 3OGFA 3FJIA 3ZUSA 5BQUC 21BIA 1DQGA 2Y9XE 4Y1XA 4YW1A 1IRAX 4M3CB 4D8HA 1V6IA 3ZSJA 1Q04A 1GYKA 4D0TA 2NMNA 4XBQA 4KBBA 4LBLA 2E53A 1QKQA 4R9AA 2D7RA 3AH1A 3QJ0A 2W2DB 1WBFA 1AVBA 3WINA 1IS3A 2ZAAA 5BP5A 3OPZA 2A6WA 2GO2A 4ZFUB 3IMNA 5DG2A 5DZEA 4M01A 3ZSKA 1IJTA 3SITA 3FJAA 1DQ0A 4EFPA 5FZUA 4I4SA 3V0BA 3D6EA 4Z8SB 1QOTA 1CE7B 3FUQA 1G7YA 3APBA 1V6OA 1AJKA 2WSUA 5T52A 1LOAA 1ONAA 4XFSA 2JKBA 3AXDA 5HPZA 1LOFC 3FLPA 5GM0A 3UJ0A 4ZJXA 2JJ6A 2ZHMA 5T55A 2D20A 3C9ZA 3DS9A 3PG0A 2DVAA 1N1SA 4LO8B 4L4IA 3VT1A 2A3YA 5CA6A 1S0CA 1XTFA 2AREA 2DYCA 2A71A 2D6LX 4YGBA 4DQAA 3O4AA 4LO1A 4ZLBB 2W39A 1EPWA 1DZQA 3UJQA 4XZPA 1RY7A 1FWUA 1IS5A 3JUTA 4KTXA 4LO0A 3QW5A 3C2UA 4J23B 3R4SA 3ZXEA 1N1YA 4QD2B 4GOVA 4G6MA 3U4XA 1CN1A 1PC8B 1GNZA 1S0IA 4XIKA 3USUA 1S0DA 3O4OA 4I4OA 4FVVA 4PQ9A 1WW4A 2WNEA 1G9AA 1SLIA 4R9DA 5GZFA 5HCFA 3WHTA 2UUSA 2D3RA 1JT5A 4ATEA 1GANA 1DQOA 1ZKXA 3RS6A 2OW4A 3OY8B 4I4UA 2EXKA 5FZYA 1D2SA 4U36A 3O0XA 2W2DA 3ZX7A 2JECA 1S1AA 3ZC8A 3B69A 4JP0A 1FATA 3FFZA 1V6MA 2JE7A 2FO1A 5DVHA 3UJOA 3AZXA 1QDOA 5GLTA 2EIGA 4BM8A 3IM0A 2ZGUA 4OEFA 5GLVA 1QGLA 3WDYA 1IT0A 1I1EA 2Z42A 4YG3A 1YBIA 3ILAA 1JN2P 1II4A 3N36A 3O44A 1ULGA 2VXRA 5E8AA 4GP0A 4HL0A 5DUYA 5F5QA 3RTIB 3HSMA 2P2KA 1PZ8A 3M2MA 3WOGA 1QMJA 2GMPA 2M49A 1ENQA 4ZKTB 2D3SA 1JT7A 1DZDA 3WMVA 3A07A 1DYKA 4D0ZA 3D3XA 1WLWA 2CL2A 3WVJA 4I4RA 3PUBA 4J2KA 1QNYA 4FPKA 1VAVA 3F62B 2D1ZA 2VU9A 1W6PA 4F83A 2QN4A 2W68A 3VSFA 5T5PA 4X37A 1T4QA 5EWSA 3ZC9A 3OYWB 2EF6A 3AJ6A 1DZCA 2IHOA 1IKQA 1Q8VA 5EG6C 2ETFA 4GKXA 4LO7C 1KITA 2RQ9A 1UPSA 4XJ9A 4IY9A 4K1ZA 2V73A 1HKNA 3PMEA 1DFQA 2YMZA 4ISRA 4YZ4A 2F2FC 4GA9A 1GSLA 1SR4C 3CA0A 3OY8A 1T9FA 5F8WA 2MIBA 3C89A 5DUXA 3DDAA 5GLUA 2K43A 3QW7A 4XHXA 2CYFA 4H55A 3CA1A 2E7TA 4OEEA 4BLJA 4I30A 1IHKA 4OW4A 2DV9A 1W3AA 3FJ8A 1Q8QA 3P6IA 2IMBA 1AXYA 3HALA 1PUUB 4YM0A 2BFHA 4XJUA 5GJ6A 1VIWB 2WKKA 1G8WA 2UU8A 3ZPYA 4AGRA 2ZGQA 4CRQA 2GZBA 3ZXKA 1ZA4A 2GNDA 2VLCA 3S8JA 2LIEA 3H6QA 4AGVA 1N3PA 2BEBA 1V6JA 2Z48A 2CWMA 2LIQA 1V6KA 1S0LA 3R4UA 4Q91A 1KNMA 4J2XA 3ILRA 5EYXA 3Q7XA 3FLTA 3WG1A 2ZHNA 4FPGA 1GICA 4XBLA 3NV4A 3O0VA 4JQ0A 3N3HA 3WO3A 1H9WA 3AZWA 2Q3NB 1Z0HA 2PHWA 4Z9WB 5FNXA 2RHPA 3OYWA 5E88A 1WD4A 1KQRA 5IK8A 2A97A 2ES3A 4LO7B 1TTUA 1WBCA 4AN6A 1RIRA 3QW6A 3O12A 2W08A 4EEEB 1MS9A 3FJDA 4FPOB 1JUIA 2P3KA 4LBKA 2Y9GA 3AKGA 1PZ9A 1LECA 1FN0A 3WINC 5T54A 2DREA 4YM1A 1WW7A 1JXNA 1DHKB 4XMIA 4YG6A 5EXOA 1SACA 4P9WA 4XJZA 4ZA3B 3N7MA 4WVWA 2P23A 3RSJA 1K5UA 2DU0A 4U2AA 5EHAA 3IM7A 3AYAA 3M1HA 2OUHA 1GLHA 2ZGLA 2UWAA 1T3AA 3N0KA 3BTAA 4DEPA 1HWMB 4IYBA 1OQLB 4IZEA 5DUUA 3V79C 1ZKWA 3UD7A 2G7NA 1MR5A 4LBJA 4EL4A 3VT0A 5CAZA 2WT2A 2ZACA 3BA4A 3WDWA 4ZFWB 1M2TB 4LO1C 2HYKA 1BQPA 2GN3A 4KEJA 2BQPA 4YZ2A 4LO0C 4I7IA 1YXWA 1H30A 2A6ZA 4IHZA 4KEKA 2ARXA 3NBNA 3WG4A 1WD3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3V0BA

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