3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
2K43A 4CRQA 1QKQA 1YO8A 3DSEA 2GO2A 4JKQA 4P0KA 1YTOA 2YZ4A 1R1ZA 1QU0A 4UW5A 1KRIA 2GNBA 5T54A 3D6EA 4DCKC 1JY0A 4FOVA 2W2DA 3QW5A 4P9YA 4USOA 3IMNA 3P6IA 4LBNA 3LLPA 1AVWB 2FFUA 5FREA 1WCSA 2FFVA 5EHAA 4XZPA 4ZJXA 1DQ6A 2D24A 4EB2B 1SLLA 4Q91A 3HN1A 3FJIA 2P37A 4XKIA 3MW3A 1N1VA 2MC2A 2C9AA 3H6RB 1GNZA 4Z8SB 4IY9A 1SBEA 4GWMA 2D3SA 5KXCA 2AENA 3UJOA 5BOWA 5KXBA 1CPNA 4FOQA 2WT2A 2ZHLA 2PHUA 3WCRA 4L4HA 3BOKA 1QOOA 3Q7WA 5EWSA 2SLIA 2ZMNA 2DUOA 2A3YA 4PQ9A 2A6VA 1SLCA 2QN0A 1DIWA 3ILRA 2DVGA 3WMUA 4EFPA 2ZHMA 1JT5A 1BARA 4X3AA 3PVEA 1UX6A 4I4XA 4Q8KA 3VKMA 1DBNA 3DGTA 4Q9GA 3POKA 2DUPA 3MEPA 5BQNA 1YYNA 4R9AA 2Y9GA 2ARXA 1V6LA 5GZEA 3K3QB 4M3CE 3RG0A 2RSTA 1LHOA 1AVXB 1Q03A 1LOFA 1Q8VA 4YM0A 4FP3A 3TB0A 1RMLA 5CB7A 3RRDA 4YM3A 2ZGSA 2G7PA 3BTAA 2R0FA 3H0OA 1IS3A 4HANA 3N7JA 4QALA 3T2TA 3AYAA 2P3KA 2DRYA 4LO1A 3AZXA 5IK4A 1M16A 4LO7B 1MS9A 1IRAX 2BEBA 4PCRA 3F62B 4XFSA 2YMZA 1S0EA 4D69A 2L5XA 4M3CA 1N3OA 3POSA 3RMXA 3SITA 5I1BA 1IILA 3SNVA 4IZXA 1H9WA 1FV3A 3CA1A 1PZ9A 4I1BA 3SH5A 4JP0A 2GNMA 4OW4A 4WVVA 2A6XA 1IKPA 2D7FA 1T9FA 1GZWA 4D0TA 4FPGA 4JAWA 1Z4SA 1Q8OA 2E7TA 3POWA 1JT7A 1OQ1A 3DS9A 1VLNA 1LOEA 1V6MA 4LBJA 4XIOA 5EXOA 3O0VA 4UW3A 4ASMB 5L73A 1DZQA 4IQPA 4GALA 4W65A 5DG2A 5GJ6A 2A7AA 1ULDA 4K21A 4FP2A 2UWAA 3WDVA 5BQMB 3ZVXA 2NM1A 4AGGA 3FLPA 1JLXA 2V73A 3ZUQA 2VXRA 1MZ5A 2F2FC 2GALA 2ISHA 3BAGA 2D3RA 4HJJA 4IYBA 2PHFA 3HSMA 1WBLA 1SACA 2ZAAA 3VEQA 3M3OA 1YVGA 2ZMLA 1FN0A 4YW2A 1FQ9A 4WZFA 5HCBA 5F5QA 1ONKB 1LOAA 2DTYA 3IPVB 1GSLA 4XXPA 6I1BA 1BXHA 1V00A 2JECA 5JDBA 2GMMA 4AVVA 3CRGA 2KH2A 1F5FA 4DS0A 1JQZA 5FNXA 1FMZA 3BRFA 4P14A 4TZDA 1DQ5A 1ZL5A 3BX1C 2DYCA 3WHTA 3W58A 3VSFA 2PHXA 3O0XA 4M3CF 4GP0A 5F8YA 1RIRA 4MYEA 2GN3A 1DYPA 1V6WA 2XHLB 1C4RA 4ISRA 1V6OA 1LHWA 1FAYA 3WA1A 1V6IA 4R6UB 3SH4A 1WLWA 3AP9A 1JW6A 1AVUA 1PZ8A 1LHVA 4G1RA 5EC5A 1JN2P 1UAIA 5H9SA 5E8AA 3H6QA 4JQ0A 4OZXA 3FJ8A 3BODA 2FMDA 4Q2FA 3IM6A 1YF8B 2VUAA 3NBEA 4XILA 3O4BA 1QQLA 3P53A 3AKHA 2RHPA 3OGFA 2WT0A 3VKOA 2I1BA 2X2SA 4ZOTA 1OQLB 2GNDA 1AXZA 1WBAA 3HR9A 1K5VA 3I29B 1HWPB 1YIFA 3N7LA 3K1XA 1W6OB 3MW2A 4HL0A 4I4YA 1VIWB 3NJ5A 2EXJA 4TYSA 1A8DA 4R9BA 1IS6A 5LK5A 1XZZA 2BFHA 1AFCA 3NV4A 1C57A 2UUSA 2DVBA 2MLLB 2KM2A 2D43A 4KEKA 4I96A 2R49A 2BEAA 4YZ3A 3SISA 2EXHA 2CYFA 2EAKA 2V5YA 1MS8A 3T1LA 3WHUA 3OY8A 3UJ0A 1G8WA 3A23A 3OJMA 4YOLA 4XIKA 4Y22B 3OPZA 1HWOB 4QD2B 4Y1ZA 1JT4A 3AZZA 31BIA 3WNXA 1ABRB 4EFQA 4OEFA 1TEIA 3V0AB 1S0GA 3GNEA 5HPZA 1DGLA 3WINA 3WO4A 3A22A 4FPFA 4Y20B 1S1AA 2DWRA 3I2AA 4I1EA 2XG3A 3BIWE 2R1DA 2D6NA 3HALA 2D6KA 4DQAA 3RQ0A 4P0LA 4LO2C 4LBOA 3V65A 4IZEA 3A0NA 5JOYA 1MR5A 4J2XA 3AK0A 3L2YA 4I4PA 3VUOA 1DQ1A 3CNAA 7I1BA 5IK7A 1Z78A 3OGGA 1R8NA 3M3CA 3OJBA 4AN7B 3T8SA 2NTDA 3ZURA 1W6NB 2PELA 4OEGA 1XTGA 4FPCA 3V64A 3ZYRA 4PBPA 4Q1RA 1LGNA 2A8AA 4YGBA 1G9DA 3P6JA 4ATEA 1G9CA 4G6MA 1W6MA 3DUIA 1QF3A 1CE7B 1RITA 3FIIA 4OEEA 1Q8PA 2DVDA 2EXKA 2CL2A 2NP0A 3BAVA 1V6JA 1FNYA 3SNMA 3O4CA 2NVHA 3VWCA 1J0SA 1A78A 3NV2A 2ZHNA 3AP6A 3WG4A 3WLUA 2G4IA 1HCEA 2CNAA 3B9CA 1HQWA 4AVSA 4D0ZA 1Z7HA 4TLPA 2GMPA 2WBCA 3VKNA 2E4MC 1N1SA 3WG3A 1JBCA 4R9DA 1PUMB 1PZ7A 2K8RA 3OYWA 4XJAA 2WSUA 1DQ2A 4WV8A 4LBQA 2AH2A 3SH3A 1ISWA 2ES3A 3WG2A 3APBA 4IONA 1WW4A 1LULA 1IHKA 3ATGA 2QN4A 3FLTA 1DLLA 3CRHA 2ZGMA 1C1LA 3S8JA 3BB2A 1J1TA 2ZACA 1CQ9A 2P39A 5DZFA 2A6WA 5GZGA 2YROA 5GZCA 1BZWA 1FYUA 3WOGA 2GZBA 1IS5A 2NMOA 2DURA 4U2AA 3B69A 2JDZA 1ZL6A 3QLQA 1O4YA 5KXEA 2Y9XE 4BMEA 1TWMA 3A4UA 1SLAA 3RTJB 3INAA 2ET2A 4CZSA 1MD6A 1OFSA 3AJZA 2R1BA 2GDFA 5H9QA 2DU0A 1AXKA 1NLSA 1CIWA 4EEEB 1H30A 1GZ9A 5BXRA 2ZMKA 4QBVA 1HQLA 1LU2A 1APNA 4YG6A 1I3HA 4KUFA 4OUJA 4XJZA 5D61A 1HCDA 2E7QA 2LIQA 3CQAA 1EVTA 3LSEA 3FGMA 3QJ0A 1LHNA 1JYCA 4J2YA 1QOSA 3W59A 4H9WA 2D1ZA 4XOGA 1WW5A 3USUA 3O4DA 4KC3A 3N7MA 1T3CA 3ZC8A 1WD3A 4JPZA 3SLIA 3NBCA 1SBFA 4FQ4A 3CAHA 2ZBJA 1NUNA 5FRAA 1LOCA 5DG1A 4ZGRB 4I4QA 3FIEA 2RQ9A 1RY7A 1AVBA 3AP7A 4SLIA 1G9AA 1LJ7A 3I2XA 1S0DA 1S0LA 1AX2A 4LO0A 4OWLA 5FNWA 5T5PA 1HIBA 4LBLA 5DZUA 4KTXA 5E88A 2FDBM 4BPZA 5BYNA 1AZDA 1W6QB 1LENA 1F31A 3LCPA 4YZ5A 3FLRA 3N0KA 2DU1A 2E53A 2F2FA 1JYIA 4LBQD 1T3AA 1K5UA 4C1WA 2CTVA 1V6VA 4X38A 3AZWA 3C88A 2JKBA 5JVVA 4XMAA 2WNEA 3B01A 3IKWA 3V79C 2B7YA 1IOAA 5DUYA 3DDAA 4JKXB 3FBYA 3IN9A 3AZVA 4G9NA 4EJ5A 1V6KA 4ZBVB 1T4QA 4JCKA 3BA5A 5DUXA 1LU1A 1CONA 3WDUA 2LIEA 4USPA 3UD7A 4FVVA 1W3FA 4Y1YA 3FJHA 4XJ8A 1U0AA 1JT3A 1W3AA 4YG3A 5F9TA 1JLYA 1AJKA 4QKSA 3AJYA 1QMJA 2D7IA 4AYUA 4GOVA 1O4ZA 2EF6A 4YFWA 1EPWA 3C2UA 5AVAA 2Q9XA 2VW2A 1N1TA 1XTFA 4F34A 5T5LA 4FOYA 3M3QA 2AQZA 3TAYA 5FZUA 1PZZA 2G7NA 5GLUA 1JXNA 3IM0A 4KEIA 2HWAA 1VCLA 3B3QE 3MPPG 4XFTA 3KMVA 4GAIA 4LO0C 5BP5C 2IMCA 1UMZA 1P63A 1BFFA 3AJ5A 1TWEA 4Y20A 3WUDA 3KM5A 4FPHA 3WCSA 1SZ6B 2A3WA 2LALA 1TFMB 3AXEA 2DV9A 2W39A 1LOBA 1FX5A 2Q3NB 1I1BA 1BFBA 2VLCA 2HYKA 4XFUA 5T52A 1TOOA 5IK5A 2JJ6A 3R4UA 2W2DB 1GYKA 2AYHA 4I37A 2A3XA 5F8WA 4XTPA 5CBLA 3Q7XA 5DXDA 3C8BA 1IJTA 1FWVA 4HR6C 2ILPA 5F8SA 5FZZA 1URXA 3HBWA 3CA6A 3FJKA 1CJPA 1KDMA 2FGFA 2W08A 2DVFA 3NV3A 4I0YA 1W6PA 1YRZA 2ESUA 3WV6A 1AXMA 1BLDA 2K4AB 1ISYA 3AH2A 1HDKA 4YGCA 4QD2C 3ILNA 4C1XA 1MC9A 4XE9A 1L2HA 2FHRA 1JUIA 2VU9A 2CY6A 1QNWA 3PVOA 3C9ZA 3IM5A 2NZ9A 1W3GA 3WO3A 1HWMB 3POYA 4GXLA 2OUHA 2ZQOA 1GKBA 1SR4C 3E8LC 4YGDA 2OW4A 1TP0A 5JMCA 2WLQA 3V0BB 1YXWA 3IM7A 2A5ZA 3N3HA 3D5OA 5GLZA 2AAIB 1QGLA 1X50A 1LEDA 3NWKA 3PJQA 1FGAA 1UN1A 2ZGLA 4BLJA 5GM0A 2ZGNA 3PG0A 5H9RA 1N3PA 3C8AA 4LO2A 1LODA 2YXSA 4FPLA 1MS4A 3VT1A 5IT6A 1E1HA 3WDWA 1N47A 1SLIA 1WW6A 3IIRA 1BLAA 1HKDA 1MS0A 3BADA 3AXDA 1AX0A 1AJOA 3UL2A 1YBIA 3ZXEA 4Y26A 4YW3A 2DTWA 1MS5A 1Q1UA 4DRVA 4HA2A 2AREA 5T50A 3R05A 3NBDA 1ULEA 2NN8A 1KITA 1ENRA 1DZCA 4YLZA 3UJQA 2KI4A 4YGEA 1DQ4A 1N3QA 2D6MA 3VT0A 1GICA 1XHBA 1EYLA 1ZB7A 3DEBA 4NOTA 3ZSKA 4FPKA 3LSDA 3ZXFA 1JOJA 3NF3A 3H6RA 4YZ2A 2ZABA 4WVWA 2KI6B 3OJ2A 1WW7A 4ISQA 5H9PA 1Q04A 2IHOA 1GZWB 3AH1A 2DUQA 4LO3C 2OVUA 5GALA 4Q8LA 1SCSA 2E4MA 3CA5A 1PWAA 8I1BA 3O5SA 1ZN3A 1JHNA 1QOTA 4ZLBB 4GKXA 5DZEA 2MIBA 4YW5A 2GNTA 3A07A 3ZSMA 3NBNA 5T5JA 3OBRA 2XOAA 3QIYA 4H55A 1G9BA 3AH4A 4DRRA 3O0WA 4LBKA 2A75A 1GGPB 1Y7BA 1G9FA 2UWBA 2ZGRA 4Q26A 1D2SA 1CN1A 5IK8A 4UW4A 3O5WB 4XTMA 2IMAA 1R8OA 4AGRA 4HEVA 5DUVA 3UD9A 3OJVA 4EKXB 4XJUA 3UK9A 1V6NA 4U36A 3CRIA 1N1YA 3O44A 1TTUA 5SV8A 2NYYA 4YG0A 3WG1A 4DENA 3BWIA 2WKKA 1BASA 1V6UA 3BOOA 4I8MA 1GNHA 1ENSA 3AZYA 4JRAA 3RMYA 1QNYA 1QXMA 1G82A 2F8XC 4ATFA 1RG8A 3N36A 3I4IA 3JRRA 4GOYA 3VV1A 4R9CA 2DVAA 4UW6A 2UURA 5HCFA 2SBAA 1DQGA 3QW6A 3QIXA 3A0KA 1Q56A 3PUBA 1IS4A 3BA4A 3PMEA 2DRZA 4Z8BA 2G7QA 2R16A 2HWMA 1DJSB 2ETFA 2ZGTA 3FJ9A 3QCWA 3QR5A 9ILBA 4I4OA 4OWKA 1LESA 4FOWA 1OKQA 2KLLA 5JLVA 1XG6A 2BQPA 2P2KA 4YZ4A 2ARBA 4LBMA 4P6AA 5DZGA 1I1EA 5BQMA 4RA0A 1MACA 4ZA3B 3FJJA 1FWUA 4L4IA 2FO1A 3WVJA 3WMVA 4GKYA 1FV2A 2TEPA 2WT1A 3ZXGA 2YY1A 5F90A 2G7KA 3B00A 1S0JA 2ENRA 2ZGOA 4XJWA 3RS6A 2VSAA 4GP3A 5CAZA 3BAHA 4FQZA 1TIEA 5EYYA 5DUUA 2ZGQA 4LO7C 4ZKTB 4QKRA 3FJFA 1WLDA 2D6OX 3IPVA 3TC2A 2IWTB 1CR7A 3AKIA 4AVTA 2WRYA 4P0JA 4I4VA 2W68A 1Q8SA 3OY8B 1IRPA 3BAUA 3AYEA 2Z49A 4AWDA 3UJ4A 4XMIA 1NXD1 3ZPYA 1Z0HA 3FJCA 1WD4A 1SLBA 2EALA 5BXPA 4G9MA 1WBFA 2PHTA 1ISVA 2D7RA 2A6ZA 3FJBA 2JD4A 2XHLA 3AP4A 4M00A 3B9UA 4EL4A 4BOWA 2ZGUA 3ZSLA 2PHWA 4ITCA 1VAVA 1ONAA 1WUVA 1MVEA 2ZA9A 4IY8A 1V6XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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