3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
4U23A 5KDTA 5KZTA 5AA2A 1URDA 2F36A 3OSRA 2REJA 3ONMA 2RCBA 1O64A 3IL1B 3H06B 2R9JA 1NNPA 1Y1ZA 2DXYA 2RC7A 1FQBA 4OYVA 4ELRA 1KWHA 4ND9A 3K00A 4EF1A 3QIMA 1B3LA 4ZDMA 2CMOA 3PUWE 2Q88A 3KOTA 2DE2A 5J1DA 2REGA 2O1LA 1LBBA 1MDQA 4RY1A 1ZJLA 5CMCA 2QS3A 5FHOA 2P1SA 4QFOA 1M5EA 4IO6A 5CMMA 1VFDA 4YZZA 3C32A 3H6WA 3D4GA 3IB1A 2ZYKA 4OXVA 1B40A 4X48A 2XD3A 1SDXA 3Q27A 4JWYA 4LONB 5TP9B 4X1DA 3BFTA 4FIMA 1N3WA 2V25A 3IOVA 3KGCA 2UYEA 1MXVA 4H67A 2O1MA 2LAOA 1JW5A 1MXWA 1POY1 3QUJA 3H6TA 1GGGA 1NNFA 2I3WA 5I58A 4DXCA 4FATA 1YCJA 5CM6A 3SETA 1LCTA 4U1OA 1BTJA 5EHMA 4U22A 4QSCA 1AIVA 3U92A 4HCYA 4KPTA 1JEUA 3HV1A 4GL8A 4X9TA 1YAEA 1EZ9A 4R6YA 3E9XA 5K2YA 4JWOA 2H9BA 3C36A 4RJZA 5DVJA 3JZJA 4NMYA 4R73A 4THIA 3ILTB 4UA8A 3Q26A 3MW0A 4XTCQ 1IXHA 3CFLA 4F1UA 1ANFA 3OO9A 1SQYA 4IO4A 4IO5A 3MPKA 3P7IA 4AB5A 4OEUA 2YPNA 2NVUB 4NEDA 5AA3A 2OZZA 3CIJA 2RC9A 2Q2CA 3IAZA 3OO6A 3IR1A 4NF5B 3O2AA 3C33A 3G3GA 1LCFA 4O3AA 3PPRA 1XS5A 1GV8A 2I4CA 4E0WA 3A3UA 2V3TA 5FHMA 3HHFA 3GXAA 1XVYA 4P11A 1SW5A 5A5XA 5I57B 3FJGA 4PFWA 1S50A 1IIWA 4I1DA 4DE8A 1H45A 1QVSA 3PD9A 3JV9A 3GBBA 2H5YA 4I8CA 5I56A 1DMBA 5JTYB 4OVJA 2F7CA 2B3BA 1S9TA 4ECFA 3VLWA 3FV2A 1WODA 4GXSB 2O84X 2V3QA 3HN0A 2F35A 3U72A 3TZAA 5L9MA 1POTA 1A55A 1B1HA 3K0VA 1RYOA 3V83A 1Y3NA 2RINA 2P2AA 3KG2A 2ZNSA 1MQHA 4UACA 4H65A 3RN8A 5B7DA 1B05A 4ZZAA 3KZGA 3C34A 2G93A 2DWAA 3OO8A 3KJ7A 4EQ7A 1R9LA 5TPAB 1NH7A 1DTZA 1OQGA 1ZMGA 4JSDA 2UXAA 3LSFB 3HPIA 4IGTA 2XXYA 3HSTA 2F97A 3B6TA 2E0SA 3RY3A 2XXWA 5DT6A 4POXA 3RTFB 4EUOA 4BLAA 5FTHA 1SW2A 2XXRA 1IQ7A 5L8DA 3ECRA 2DE3A 4YU0A 1LFIA 4GOTA 4DDDA 3VVEA 4ZEFA 2XXTA 3QYTA 3UK4A 2PX1A 1FTJA 1AMFA 1FQEA 4PE5B 5F1QA 1B0LA 4BDMA 4IGRA 1NNKA 3DM0A 1B6HA 1MM6A 2XXIA 1TFAA 3W9WA 3TCFA 1YPNA 3KOSA 2HEUA 1J1NA 1IEJA 2NUVA 3H7MA 4H8JA 3IORA 1JNFA 1XVXA 3G3KA 4ZEIA 4NF4A 3BFUA 4G77A 1UTHA 3VXBA 5I2KA 3T93B 1LB8A 2ZMBA 4MF3A 4KCCA 3TQWA 4NTLA 1VFEA 2I3VA 1B3FA 4PQJA 3KFMA 3L6GA 4BDLA 1Y3QA 2PVUA 1SVXB 4LVQA 1TT1A 4KYSA 4MLVA 3PUXE 5H8FA 3IX1A 2QJEA 3PPNA 1MH3A 5H8SA 1GTKA 3RUMA 3FXQA 2M8CA 1UTBA 1LFGA 4GD5A 1FTLA 1PB8A 4EF2A 3TYHA 3PPOA 1SYHA 3OXNA 4LQ2A 4G68C 4R9FA 3N94A 2OCUA 1B4ZA 1B3HA 3IO4A 1MPBA 4WKMA 1NKXA 4BDOA 1USYH 3M8UA 5KCJB 1PBQA 2I4BA 4OZ9A 2XXHA 1HSJA 5DEXA 1B3GA 1MH4A 5IKBA 3DELB 4H1XA 1B5JA 1A8FA 1N0TA 4HCWA 3DP4A 4O3BA 4YB5A 1MQJA 2D5WA 1MQIA 4GWOA 2ZXTA 3OOAA 4F3GA 3K01A 1H3DA 1OQHA 2FNCA 2GH9A 1XT8A 5I59A 4U2RA 5H8HB 2ONKE 3D4CA 5IAIA 4HS7A 1URSA 4WEDA 3QSLA 3JYRA 4QF9A 2G29A 3THIA 3E13X 3M3LA 1VSOA 4KCDA 2O7IA 2H98A 4KHZE 1Q35A 1EZOA 4FORA 1HSLA 4NF6A 3O6HA 1LAXA 3TTNA 3ZSFA 1LBCA 1TWYA 3H3GA 1R1NA 2R71A 5AA1A 1OMPA 3SKPA 1B1XA 3RLFE 2I6EA 1N7XA 1H76A 4F2OA 2AYSA 1LFHA 4NF8A 1LGBC 1B7ZA 4Q5TA 3BBRA 3V5AA 2D3IA 4LA9A 1GR2A 4G4PA 1ATGA 2OWSA 2B3FA 5CBRA 3A09A 3KJTA 1NMUA 1IXIA 1L5TA 3IOUA 4LP2B 1DOTA 4PP0A 1FW0A 1TFDA 3LUYA 1XHYA 3AXFA 2AL5A 3TEPA 4DXBA 2O51A 1D4NA 4ZECA 3TDJA 2Z22A 1A99A 3EHTA 2IEEA 3WAFA 4GQOA 1IXCA 4OETA 2GFEA 2XXUA 3MVYA 2DSFA 1QKBA 2P0SA 1UIUA 3TFLA 2Y84A 4F1VA 2DYXA 4G68B 1RKMA 4ZEDA 1HSEA 3T9HB 4JSOA 3S4UA 2Y7IA 4JXIA 3CG1A 2F6GA 1B7UA 1QW0A 4I9DA 1JVXA 3K02A 4F18A 4IO2A 4HW8A 5CMKA 5TP9A 4F3PA 2W7YA 3MJNA 5DVIA 1II5A 3R7XA 4U4XA 4R2FA 2OBGA 3PPPA 4PFTA 3PMXA 4H0WA 5ITPA 1AL3A 1N04A 3IOWA 4I62A 3TTRA 3FGSA 3C4MA 4MFIA 3O6IA 1QULA 4AB6A 3KSXA 3QK6A 1H44A 4GLIA 1WVJA 3SDFA 3Q28A 4M4GA 2I0BA 1ZTYA 4KFQA 3CFXA 1LSTA 1MM7A 4C1UA 3FVGA 4EQ9A 5ICQA 3PMVA 3U1OA 4RPNA 3S2VA 3PGFA 1URGA 2X26A 5L9SA 4YMBA 3EHUA 4LZ5A 1P1UA 3CVGA 3H6UA 4R2BA 3IJXB 2E1SA 3O6GA 4NF5A 5CMBA 3KEIA 1A8EA 4P0GA 3K6XA 1LAHE 4RPOA 4U1ZA 3UIFA 5K2XA 4F39A 1DPPA 2QPQA 1N84A 4K3FA 3K6VA 2CZLA 5I57A 4PFUA 1Y9UA 2ALUA 2XXQA 2XXPA 3SEVA 1IZ1A 3C9HA 4HTGA 5FHNA 3T9VA 3VV5A 2I49A 5JTYA 4IB2A 3KN3A 3KBRA 4DLDA 1EZPA 1MG1A 4GF8A 1OLCA 2O6AA 3MBPA 4IY6A 3K6WA 4QFPA 1B5IA 5H8QB 3U93A 3SESA 4JWXA 1I69A 4FEBA 4F29A 3A3CA 2ONSA 3CI8A 3FXRA 3K2DA 4H6DA 1N3XA 1FTMA 2FA7A 3PUZE 1I6QA 4G2ZA 5TPAA 4OESA 3VXCA 2DWJA 1AOVA 5I2NB 5H8NB 1IITA 4QFKA 3LR1A 1BKAA 3ODBA 3T9XB 1MY3A 2F7BA 1MRPA 4OENA 4ISUA 4BDNA 2H25A 1R6ZA 1B7HA 1Z7ME 1M5BA 2I0CA 2HAUA 1B46A 3UGWA 3MZ9A 5H8QA 3ZS6A 4RNSA 5BUUA 1SI0A 4POWA 1SBPA 2O7UA 2GHAA 2B65A 1O63A 4GFRA 3UA8A 1MQDA 4U21A 2F8DA 3RT8A 3G3IA 1YTVA 5I2NA 3B7DA 1ZIUA 4Q8RA 4ESXA 1MS7A 3MP8A 2Y7WA 4YMAA 1JEVA 3MP6A 2D21A 2HXWA 1Y4TA 4FECA 1M5CA 2XX7A 3OEMA 2A5TB 2F7AA 2ZNUA 4FJPA 1DSNA 1IXGA 2Z23A 3G3FA 2QS4A 3SERA 2X7QA 4TQUQ 3O29A 2H99A 1B51A 4NWDA 3T96B 3KN8A 4M1VA 2A5SA 3QXMA 2UVIA 3VDFA 2Q2AA 1OLAA 3PD8A 2XD2A 2YJPA 1O7TA 1Q1KA 2VGQA 3O28A 4MBPA 2DE4A 2DP8A 4ZS9A 2FYIA 1NNTA 5AA4B 1OVTA 2ONRA 1MXYA 4ONYA 3MPLA 3MVZA 4XKQA 3TAJA 3VVDA 1RYXA 2V84A 3EHSA 5ITOA 3V89B 4G8MA 2HZLA 3QAXA 4F1YA 5TU0A 4WXJA 1D9YA 4Z0IA 4YICA 4XKPA 2HCAA 4EXKA 4TLLB 3FJ7A 3N6TA 4RK9A 5CRYA 3H6VA 5LOMA 1S7YA 3T9UA 4RA1A 4F22A 3FVNA 1AH5A 2GHBA 4LATA 3RQTA 1MY2A 2XX9A 1M5DA 2DOJA 1B2HA 2WKYA 3TODA 2HFBA 1SW4A 2DQVA 3MVWA 3IB2A 1EH3A 4IY5A 2UVJA 1NH8A 3FZVA 2ESNA 4EXLA 3O97A 4ZZEA 5KDTB 3MP1A 5AA2B 3T66A 1B52A 1Y4CA 1A7LA 1MPDA 5ISUA 1VE4A 2OK2A 3RT6B 3RPWA 5KCJA 3H03A 5DVFA 3TTMA 5HBCA 3FVOA 3UP9A 3TPAA 2NOOA 1LAGE 1OVBA 3N5LA 2ZNTA 2Y7KA 1P99A 2F78A 2QRYA 3UN6A 2QL3A 2IA4A 1SW1A 2R6GE 2O69A 5EHSA 2DS9A 1US4A 2Q8JA 2HZKA 3OSQA 3LSWA 4QSDA 1FQAA 3N26A 1LB9A 3FV1A 4QHQA 3USDA 1US5A 3G7WA 4MH5A 1D9VA 2H4IA 2AL4A 5B70A 3ILUB 2XXVA 2DVCA 3OELA 4EDPA 1QUIA 4OERA 1VR5A 1ELJA 3LSXA 4QFNA 3TTLA 5H8HA 1NL5A 5CI5A 3BKIB 3ZKLA 3M3FA 3UORA 2I48A 4ZE9A 1ZU0A 5AE4A 1JQFA 3SEUA 5EYFA 3MQ9A 3LC8A 3EQ1A 5I58B 4YKKA 3K1MA 5JK4A 3CRBA 1XOCA 1USYE 4R9GA 1Y20A 4N6PA 3CG3A 4QRZA 4ELPA 5CC2A 3MWBA 4PETA 1NFTA 3MZ1A 1F9BA 5AA2D 3CSBA 1MXUA 3O66A 4JBZA 1ZBMA 1UIVA 4RK2A 1OIBA 1MY4A 1ZLQA 4YB7A 3TELA 3W15C 1PC3A 3I3VA 2ABHA 3LBSA 4LUBA 4DXUA 3FD3A 3K4UA 1LLSA 4G8HA 2UYFA 1ZKBA 4R75A 4WEPA 2RF1A 1QUJA 2PBWA 4GXAA 4XKRA 3SEYA 1A54A 4H8IA 1BIYA 1I6BA 4PFYA 3GLBA 1GVCA 2Z8EA 2HAVA 5A5XB 5ELVA 5HM4B 4JB7A 4LZ7A 4U4SA 4G68A 4R74A 3FXUA 3I6VA 4ZE8A 2UVGA 1BP5A 3FIRA 3VFJA 1Y1MA 4R6HA 1B0HA 3LSLA 3EPEA 2VD2A 4H5FA 4GL0A 4H5GA 5I56B 4OEVA 3HHGA 2VP1A 2V93A 2AIXA 4DCXA 2NXOA 4BDQA 3MC2A 4KYEA 4OFLA 4KR5A 4XXUA 3PUVE 1D3KA 4BDRA 3QUFA 5M2VA 4FEDA 3B6QA 4ZEBA 4FE8A 1P1OA 3U8QA 3PPQA 3IOTA 3C35A 4QSEA 3MVXA 3OMBA 1H43A 3TCGA 2THIA 4MLQA 1P1QA 4N13A 4NWCA 1B5HA 2ZYOA 4LZ8A 2KLFA 3KN7A 4OWDA 4C0RA 4KQPA 2RC8A 4ELOA 1MXXA 4P0IA 3S9EA 1CE2A 1JVYA 4GRKA 3C31A 1QKAA 1PB7A 1MY0A 1R9QA 2DVZA 2XXXA 3I5OA 3G3JA 3TKDA 2PYYA 3V8XB 3OO7A 2X7PA 2Y7RA 3GZGA 2ZYMA 5I84A 4F19A 4N07A 2VD3A 3EF7A 3Q29A 4XKNA 3ZKKA 4X1BA 2PMSA 1JW4A 2F5XA 3E3KA 4G8NA 2XHDA 3N6UA 1PDAA 3DLNA 3U94A 1UQWA 4OMBA 2QS2A 4NE4A 3SEXA 4ZEKA 4KD5A 1MPCA 3M3KA 4YKPA 3EN3A 1B58A 1FQFA 3DP8A 3PU5A 1FTOA 3K1NA 3S9LC 1LAFE 3HCQA 3CR9A 2Y7PA 2ZYNA 4NF4B 1UTHB 4ESWA 1B32A 3RTWB 5F7VA 3O9PA 4YB6A 1WDNA 5I2KB 3MAMA 4F3SA 4Z7EA 1FQCA 1FQDA 4YKJA 3MZBA 4Q0CA 4IO3A 1FCKA 4L17A 4XIGQ 3R26A 2F34A 3S9MC 3RNNA 3R6UA 4IO7A 3FVKA 4F2QA 3PMWA 5ICTA 2VOZA 1B4HA 1JETA 4OQOA 2HQ0A 3CSGA 5H8FB 4EQBA 3OENA 1BLFA 3TQLA 1EU8A 2V3UA 1N76A 1UTBB 3K6UA 2QMXA 1XC1A 4OFOA 4KYDA 2QS1A 3KSJA 5H8NA 4AQ4A 3S9NC 1MQGA 2YLNA 3VLVA 4DZ1A 4F3BA 2F6PA 3TMGA 4GVOA 3TCHA 1I6AA 4E0XA 5JEIA 3G3HA 3OEKA 3SEWA 5DTBA 1IUDA 3T22A 1MDP1 1TXFA 1CB6A 1Z7NE 3L6HA 3FASA 1M5FA 2ANJA 1MY1A 2GRVA 4GIZA 3HO7A 3IO6A 4YAHX 5DYHA 3F11A 4JDFA 4F31B 3IJOB 4DCYA 5DEXB 4YKIA 3OD7A 2Q89A 2Z8DA 3TTKA 2RCAA 2PT1A 3Q25A 4R6KA 1DPEA 2QMWA 2XX8A 2OJTA 3TUSA 2UVHA 1SI1A 5CBSA 4RYAA 2BJJX 1DTGA 3CFZA 3VE1B 1FTKA 2A5TA 1T0KA 5BWJA 3FUZA 2Q9TA 3K1PA 3H4ZA 3WAEA 3PV0E 2I58A 3FJMA 3IK6B 1N7WA 1SYIA 4R72A 5I59B 5L9OA 4LQ5A 2OLBA 1P1NA 2PT2A 4Q30B 4DIGA 1Y3PA 4O3CA 2O68A 1PBPA 3MUQA 5HPQA 3PUYE 4TLMB 2NWJA 3VLUA 4FAJA 5AA4A 2DWHA 1P1WA 1B3EA 1JW1A 3RGYA 3DP6A 3W9VA 4NF6B 3GBAA 1QJMA 2QSXA 2VHAA 1MXZA 4QFLA 3B6WA 4C1TA 3FATA 4KI0E 3VVFA 1QUKA 1SD3A 3E4RA 2OWTA 1A40A 2DXRA 4OFJA 5FTIA 4RXLA 4ELQA 1PB9A 2RKMA 3IB0A 4TOZA 4NF8B 2DWIA 1B9JA 1PEBA 4OHNA 4OTEA 2Z8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AS4A 2OX3A 4U23A 5KDTA 5KZTA 5AA2A 1URDA 2F36A 3OSRA 2REJA 3ONMA 2ZZXA 2RCBA 1O64A 4PFRA 3IL1B 3H06B 2R9JA 2HPGA 5IZ1A 1NNPA 1Y1ZA 2DXYA 2RC7A 1FQBA 4OYVA 4ELRA 1KWHA 4ND9A 3K00A 4EF1A 3QIMA 4MNPA 3KBZA 2VPNA 1B3LA 4ZDMA 2CMOA 3PUWE 2Q88A 1NUYA 3KOTA 2DE2A 5J1DA 2REGA 3T0JA 3E79A 2O1LA 4N91A 1LBBA 1MDQA 4RY1A 1ZJLA 4PDHA 5I3SA 5CMCA 2QS3A 4MIJA 5FHOA 2P1SA 4QFOA 1M5EA 4IO6A 5CMMA 1VFDA 4YZZA 3C32A 3H6WA 3D4GA 3IB1A 2ZYKA 4OXVA 1B40A 4X48A 2XD3A 1SDXA 3Q27A 4JWYA 4LONB 5TP9B 4X1DA 4P3LA 3BFTA 2KQZA 4FIMA 5ET7A 1N3WA 2V25A 3IOVA 3KGCA 2QVRA 2UYEA 1MXVA 4H67A 2O1MA 2LAOA 4O7IA 1JW5A 5EQ8A 1MXWA 1POY1 3QUJA 3H6TA 1GGGA 1NNFA 2I3WA 3KC1A 5I58A 4DXCA 4FATA 1YCJA 5CM6A 3SETA 4GWYA 1LCTA 4U1OA 1BTJA 5EHMA 4U22A 4QSCA 1AIVA 3U92A 4HCYA 4KPTA 1JEUA 3HV1A 4GL8A 4X9TA 2ZZWA 2V4CA 2CZHA 1YAEA 1EZ9A 4R6YA 3E9XA 5K2YA 4JWOA 2H9BA 3C36A 4RJZA 1FBHA 5DVJA 3JZJA 4NMYA 4R73A 4THIA 3ILTB 4UA8A 4N8GA 4HE0A 3Q26A 3MW0A 4XTCQ 1IXHA 3CFLA 4F1UA 1ANFA 3OO9A 1SQYA 4IO4A 4IO5A 3MPKA 3P7IA 4AB5A 2CZKA 1KA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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