3WH6A

Crystal structure of gh1 beta-glucosidase td2f2 glucose complex
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
443
structure length
443
Chain Sequence
MAGERFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLNLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQANPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords beta-glucosidase
publication title Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2
pubmed doi rcsb
source organism Metagenomes
total genus 178
structure length 443
sequence length 443
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wh6A00
4A4AA 2WWDA 1GUVA 1W2VA 4MB4A 4TTGA 4KWUA 2CNCA 4W86A 4PSPA 3PZQA 3QOKA 4CCDA 4P7OA 3WFZA 2EPLX 3W24A 3OLEA 3OG2A 3WF2A 5BXPA 2WSKA 2E9BA 2ZX9A 4S3KA 1J12A 5A1AA 1Q4NX 1W3JA 3TTSA 1QI0A 3JUGA 3ZT7A 2YLLA 2WKGA 4QFUA 1JFHA 1JYXA 3VGFA 3QGVA 2E3ZA 2J77A 3AOFA 2DIEA 1X6NA 1J01A 3QHNA 4NF7A 3WH5A 2GJPA 1UG6A 1UR8A 3ALGA 4F79A 1EIBA 1W1PA 4TVCA 4ZE5A 4CN6A 2ZXDA 5A94A 1KWKA 3ZR6A 5D4YA 1V6VA 1W3LA 4JFVA 2JALA 1WDQA 4Z2KA 1QBBA 1MXGA 3NSNA 3NDYA 1Q6EA 4J7RA 1CGXA 1BYDA 4BS0A 2WMKA 2V38A 4U3AA 5D9NA 1OCQA 3OB8A 4W8AA 4AZGA 3B9AA 1MW2A 1G5AA 3RJXA 2GJXA 1JDDA 5EFFA 5I5RA 4WF7A 1E15A 1GJWA 1ZBCA 1TCMA 2J7FA 3QOMA 5BCAA 3L4WA 2XM1A 4GIAA 1JDAA 5IFTA 1JYVA 3KWXA 2BFGA 2XVLA 4ATDA 1VB9A 5CXPA 2GK1A 4F9DA 1NP0A 4JAWA 1OD0A 4F66A 2A3EA 5BXRA 2WMJA 1NQ6A 4PUDA 4D6HA 4GPNA 2E4TA 1LL6A 2RGMA 2WM0A 4UOZA 2X0HA 4B3KA 2OLHA 2WLZA 1XH1A 4DWSC 4Q7NA 2GFTA 2WCAA 4IUGA 3WH8A 2BXZA 4MB3A 1XYFA 5I77A 4DWSA 3VUPA 1AMYA 3TP4A 4TX6A 3AHTA 4TUFA 1JIBA 4CVUA 4HOXA 1ISWA 4JL1A 1A47A 2YDSA 4EE9A 1F4HA 4LYPA 1BPLB 2ZUSA 3PZOA 2XFYA 1DWIM 1DHKA 3ARQA 5F7UA 2A3AA 3AZSA 1B3VA 1KGWA 2CESA 3NJ3A 4D71A 3A3HA 3T09A 3AIEA 3KEHA 4PYSA 5FL1A 2WB5A 3U7BA 2XIIA 3T08A 1H0GA 3BC9A 3U5UA 1UD8A 1CGUA 5M5DA 2VR4A 1GQKA 2ZWYA 3WDJA 5A95A 4J3WA 3UR7A 1GCYA 1SFSA 1M7XA 5A8PA 5EB8A 2WVVA 2QV4A 1K9EA 2V3DA 2WZIA 2OYMA 4J3XA 1J0IA 3WN6A 3ZM8A 2VJXA 5E09A 3CGTA 2EBNA 2YBTA 1H11A 2DSWA 3O2LA 6A3HA 3W28A 1V0MA 1G1YA 4UCFA 3EDJA 4YN5A 3ZJ7A 1E4MM 2D3NA 3SUUA 1QHOA 1EDTA 2ZXQA 1HKKA 1GOQA 1TVNA 1JD7A 1J0JA 1ZL1A 4PSRA 1LL7A 1V0NA 1V3MA 3VIHA 2J7DA 4A3YA 1OB0A 1UR1A 1IZJA 3FW6A 1L8NA 2FH8A 2DSUA 2EXOA 4D6EA 3BAYA 2JEPA 4HA1A 2W66A 2VX7A 5DF0A 2Y4SA 2WYSA 1MFVA 1TG7A 4W85A 2OYKA 4CKQA 4PMNA 4CN1A 2GDVA 1CYGA 1C91A 4K68A 3BAKA 1VJZA 2BHUA 1V6YA 3SUTA 2FGZA 3K8LA 5IHSA 1WAWA 3O9NA 4D6JA 1BGAA 4HMDA 1QBAA 3VDCA 1UWIA 3W27A 5D9PA 4HTYA 4MNKA 2UY3A 2VC9A 3U57A 3SURA 2WC4A 1K9TA 1M53A 3GH4A 4H7VA 3N04A 2GUYA 3WL0A 2JF7A 3K4AA 4JZ5A 1ITCA 2ZXAA 3A4AA 3L4UA 4LPCA 3AHVA 3PZIA 1UR9A 1UWSA 5A8QA 2WVTA 1KCKA 4PMZA 5D8WA 1VBRA 2OSWA 3VNYA 3VVGA 1BYAA 1NOUA 3IAQA 3KE0A 3A6OA 4DM2A 3AMCA 3ZMRA 4AZIA 3WUGA 4M56A 4J3SA 3SCUA 3VMOA 3BSGA 4GI9A 5C70A 1E56A 3TA9A 1FH7A 5KEZA 4J3UA 3BLKA 5EFDA 4XZWA 5KZ6A 2VZSA 4AZCB 1UWQA 1CPUA 1E6NA 1KB3A 4H2CA 2J79A 1H09A 4QLJA 1PIGA 1NWUA 1GOOA 2QMKA 2JF6A 4M24A 2VNCA 1TR1A 1VBUA 3THDA 5AC4A 2YL9A 1G01A 1DWGM 3IJ7A 3VM5A 5JIWA 3TTOA 3A4WA 5LA0A 1HJUA 1PBGA 1PX3A 3AIUA 3WBAA 1KGUA 1FOBA 1OD8A 5CJ5A 3BMVA 1VENA 2DDXA 1BQCA 2ZUMA 2E8YA 1LF1A 3DYPA 3NSMA 1CDGA 5M3WA 1V3LA 5GPRA 4J28A 4HA4A 3W0KA 1PAMA 1KWGA 1FFQA 3E1F1 4RE2A 2PBGA 1R8LA 3L4TA 3HMCA 2ZX5A 1O6IA 1CGYA 3AHZA 3NDZA 2WCSA 3ZJ6A 2BVYA 4CVWA 4UQBA 4J3VA 1V3HA 4HMEA 3CHEA 1WDSA 1FH9A 2YA2A 1SR0A 4YHEA 4D72A 1C93A 5A6LA 1QNRA 2XVNA 3FAXA 1WZLA 3CLWA 3CUIA 1IV8A 1JGIA 1HKIA 2B31A 2UY5A 4RL3A 4AW7A 3FHAA 1K9FA 1VFFA 4TVDA 1XSIA 2D0HA 3FAWA 2WWCA 1ODUA 3PZNA 3KL5A 2VZVA 3ARWA 4W87A 1E6XM 3AS1A 5IDIA 4HZ6A 3RIKA 5A8MA 3AHXA 4URIA 3ARRA 4MB1A 1CXLA 3CIVA 3ZQ9A 2X05A 1LG2A 4ZXOA 2EQDA 1CZ1A 1OINA 2XYLA 3WDRA 4IPLA 3ARSA 7A3HA 4GKLA 1QNQA 3VIOA 1M03A 4P8XA 3VO0A 4Z2JA 1JXKA 3BAWA 3T2OA 3ARVA 2Z1SA 5IXEA 3NIYA 3WNKA 1GORA 1UKTA 1JFXA 3CZLA 5TD4A 4OBSA 4CD6A 4HPGA 1BVNP 3CUFA 4DUVA 3AIQA 3T0DA 1C8XA 1E3XA 1JYNA 2NW0A 1E5NA 4N42A 2VRJA 1SMAA 4D6CA 3LPGA 2Y2WA 3IJ9A 3TTYA 3L4VA 1OIFA 1GOKA 4UQ9A 4B9YA 3UETA 3ZSSA 5LA1A 2DPEA 5I0DA 2A3CA 3WL1A 1JZ2A 3WEMA 1QW8A 2DSZA 4CGTA 3PTKA 3TOPA 3EMQA 3N18A 3WY1A 1NH6A 3L4YA 3OZPA 5D9OA 4JKMA 3WQVA 5ECUA 3ZSTA 4HPHA 1BYBA 2Y8KA 3WQ5A 1HJSA 2DT0A 2Y8VA 1JF5A 1NOFA 4UNIA 3MANA 3W6MA 2VI0A 1DP0A 6CGTA 4GZIA 1PX8A 1H1NA 2XVKA 5CGMA 1GONA 3CTTA 4MNLA 4WJXA 4FLSA 3GH5A 4UFKA 1E40A 1E4NA 2BHZA 4J3TA 3ARXA 1MW1A 1Q6GA 3SCRA 4QLKA 3F5LA 5CLWA 2JE8A 2DT1A 4UFHA 4E8DA 1MYRA 4PTMA 4BQ2A 1C92A 1B3YA 3WUFA 2XSAA 2E9MA 2W91A 4UR9A 2OWCA 5E9AA 3VD4A 3HN3A 4UTFA 2D2OA 8CGTA 2O9TA 3MUAA 1EGZA 4GXPA 2DGAA 2D1ZA 1AQMA 2VX4A 2NT1A 1Z32X 1UWUA 3FXYA 2WZEA 5CPTA 5M03A 1O7AA 4HP5A 5DEZA 1W9PA 2BHYA 2J7CA 1Y7VA 4WKHA 4WSKA 4FLRA 1UR0A 2W61A 2BY0A 1C7SA 3WELA 3WEOA 1W32A 1GQLA 3CZEA 1GJUA 2BY1A 5DO8A 4CD7A 5CPQA 3POHA 4M80A 1FFRA 1FP8A 2F8QA 1HKJA 2J47A 3T2QA 1E71M 4JHOA 3I3DA 4BZYA 4WKAA 1HVXA 4HU0A 1CEOA 3AMKA 1TE1A 1WDPA 1XD0A 3MMDA 4GO8A 1JNDA 4RE4A 4JL2A 5FKYA 1JZ4A 2PWGA 5ABHA 1C7TA 1GZJA 3NCOA 4S3JA 4AD5A 2BVTA 1ZB5A 1U33A 2QLYA 3VDBA 4H04A 1E1FA 2PI6A 1XH0A 1JL8A 2MANA 4Q22A 1FP9A 3WNOA 4U31A 1PZ2A 1JYWA 1EA9C 1UKOA 4ACZA 1HJVA 5HNNA 4AD0A 2CIPA 2O9PA 1UOKA 3WNPA 1HT6A 5A6MA 2FHCA 2WHKA 5ABFA 1B90A 3OLGA 4PRWA 4UOJA 2XPKA 3WNLA 3WF0A 1G9HA 1JG9A 5BROA 3IAPA 3VGDA 1X1NA 1QI5A 4JKKA 3K1DA 5GNXA 2XFRA 9CGTA 2YDRA 4LGXA 4WLCA 2ZX6A 2XJ7A 2EPNA 3OGRA 5JUVA 4P8VA 5BYWA 4U33A 3M6DA 1GOWA 1NWRA 3M7SA 2FDMA 1CECA 3ARUA 1TMQA 3WH7A 1B3WA 1GQIA 2EPKX 3RM8A 1RD6A 1E9LA 4QDMA 1UWRA 3N17A 3L2LA 3AMGA 1KQYA 1QI4A 3VNZA 5C8BB 4LYRA 4EKJA 4FLOA 3RJYA 1NWSA 4UZSA 2ZXBA 4W7VA 1HIZA 3DHPA 2ZOXA 5I23A 5FD0A 4V28A 5GNZA 1W9UA 5A2CA 1UKPA 2GVYA 2XVPA 3WH9A 3L2MA 4AZBA 3N1AA 3PTQA 3W38A 3VD7A 3G6LA 1SYTA 4IISA 4AZ6A 4XZBA 5BWFA 2WCGA 3ARPA 4NI3A 2HISA 4MJ2A 1CXFA 2TAAA 1LWJA 1JF6A 2W4XA 3II1A 5FIPA 4CD4A 4BQ3A 3BAIA 2D0GA 2WVUA 3J7HA 3WF3A 1WDRA 3BAJA 3GYCA 4FLQA 3KL3A 1HKMA 3BAXA 2X8RA 4PUEA 1FHDA 3VIGA 1BF2A 3AHYA 3VD5A 1UD3A 4E2OA 1U30A 2J7HA 4KRTA 1EHNA 4Y7EA 2OWWA 5EBAA 3M07A 3TONA 4YHGA 1V3IA 2PWFA 3GH7A 2WLYA 4MTVA 1WO2A 2QF8A 3VU2A 4AD1A 5DFAA 1B9ZA 3VX0A 1GOMA 4DM1A 1J10A 4CU8A 2DH2A 3UEQA 2CKRA 4HOWA 4TTUA 1CBGA 1EOKA 1H4PA 2EEXA 2OWXA 1UH4A 2RGLA 4PBGA 4ATLA 2D3LA 1LWHA 1E6PA 2DT3A 2EPOA 4AC1X 1VF8A 1UD4A 1UZ4A 3EDEA 1C90A 4W88A 1UQZA 2PWEA 1JNEA 1CGWA 2BY3A 1E3ZA 4PMDA 1N82A 4J27A 4UZUA 1QNPA 4CU6A 2DT2A 1ZU8A 5BRPA 3I3EA 3VX1A 3CZKA 4AEFA 4P7QA 1C8QA 3K46A 1V0LA 1W9BM 4QLLA 1E72M 3AQUA 2ZX7A 2WMGA 1W1YA 5A6BA 3OIHA 1E6SM 1G0CA 1UZ1A 3UERA 4CCCA 3MSGA 4UFIA 3WNNA 4ZE4A 3WD1A 1OBAA 1XSKA 3MU7A 3WUEA 1LQ0A 1HJWA 2WBKA 1E55A 5E70A 3VDAA 1EHAA 1EO5A 2W63A 1QI3A 2O9OA 2XSBA 4HZ7A 4PEEA 3WMBA 4AIUA 3VKKA 5I78A 5GNYA 2WHJA 2CHOA 2PBOA 1HP5A 2VURA 4QCEA 1ZBWA 3W81A 4F8XA 1ZBVA 1GW1A 2VQUA 2VO5A 3D3AA 1E0VA 1KXVA 2WMFA 4MJ4A 1JAEA 1H41A 5BRQA 3FNDA 1PJ9A 1CWYA 2F2HA 2V5CA 1QPKA 2EJ1A 2ZE0A 3PZUA 1JXJA 3AI0A 2WMIB 4TOQA 3WFLA 3BGAA 1E43A 3AS0A 4KGLA 1KXHA 2Z1KA 3K8MA 3VTRA 1B3XA 1F4AA 3DC0A 5IHRA 3ZR5A 3KL0A 3GNRA 3VM7A 2O92A 2ZUNA 4WKFA 2WNWA 3CHFA 3F5KA 3AZTA 3VGGA 3LPFA 5D9MA 3W29A 1D2KA 2YOCA 1KGXA 3VIJA 2J8GA 1J0YA 3VGEA 3GNPA 2W92A 3CUHA 4MAVA 2V5DA 3EMZA 5I79A 3WQ4A 1DEDA 1J0KA 4LQ1A 1NOWA 1BSIA 3T0BA 2V3EA 1NM9A 4HU8A 3CZGA 1J0ZA 1UKSA 3N12A 1UHVA 3HU7A 2FH6A 1KFWA 1B0IA 2G8ZA 1H5VA 3IK2A 1MFUA 4DWSD 1WP6A 3GNOA 1BG9A 4L4OA 4P7RA 4XV0A 2YA1A 4MAZA 3VGHA 1VEOA 4PCTA 5C71A 2VX6A 4TVUA 5A3HA 3W37A 4UQAA 2C8NA 4BCEA 1TVPA 1PX4A 4B3LA 3WF4A 5HXMA 1R7AA 1BTCA 2YDQA 5D8ZA 1B30A 3WUBA 2CEQA 1CGTA 3MO4A 1ODZA 2YKKA 3EYPA 3BCFA 4NRSA 1G94A 3AXIA 2ZIDA 3S6TA 4ATWA 4AEEA 3A47A 4AD4A 3WQ6A 1HJXA 1E70M 5HBFA 1ISXA 3W82A 3WMCA 1KBBA 3T2PA 1JAKA 4H8HA 1HXJA 1US2A 2CBIA 1GPFA 3SEPA 1BHGA 1VEMA 3APGA 3WENA 1NARA 1CENA 3FY1A 2FHFA 3PN8A 2UY2A 5E0CA 7CGTA 4CUCA 4B9ZA 1MQRA 1CNVA 4OZOA 1XSJA 2QHAA 4MNMA 3ZJ8A 1JZ5A 2G3NA 1CIUA 1QHPA 3AIVA 3I3BA 5AC5A 4PTVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A4A A;  2WWD A;  1GUV A;  1W2V A;  4MB4 A;  4TTG A;  4KWU A;  2CNC A;  4W86 A;  4PSP A;  3PZQ A;  3QOK A;  4CCD A;  4P7O A;  3WFZ A;  2EPL X;  3W24 A;  3OLE A;  3OG2 A;  3WF2 A;  5BXP A;  2WSK A;  2E9B A;  2ZX9 A;  4S3K A;  1J12 A;  5A1A A;  1Q4N X;  1W3J A;  3TTS A;  1QI0 A;  3JUG A;  3ZT7 A;  2YLL A;  2WKG A;  4QFU A;  1JFH A;  1JYX A;  3VGF A;  3QGV A;  2E3Z A;  2J77 A;  3AOF A;  2DIE A;  1X6N A;  1J01 A;  3QHN A;  4NF7 A;  3WH5 A;  2GJP A;  1UG6 A;  1UR8 A;  3ALG A;  4F79 A;  1EIB A;  1W1P A;  4TVC A;  4ZE5 A;  4CN6 A;  2ZXD A;  5A94 A;  1KWK A;  3ZR6 A;  5D4Y A;  1V6V A;  1W3L A;  4JFV A;  2JAL A;  1WDQ A;  4Z2K A;  1QBB A;  1MXG A;  3NSN A;  3NDY A;  1Q6E A;  4J7R A;  1CGX A;  1BYD A;  4BS0 A;  2WMK A;  2V38 A;  4U3A A;  5D9N A;  1OCQ A;  3OB8 A;  4W8A A;  4AZG A;  3B9A A;  1MW2 A;  1G5A A;  3RJX A;  2GJX A;  1JDD A;  5EFF A;  5I5R A;  4WF7 A;  1E15 A;  1GJW A;  1ZBC A;  1TCM A;  2J7F A;  3QOM A;  5BCA A;  3L4W A;  2XM1 A;  4GIA A;  1JDA A;  5IFT A;  1JYV A;  3KWX A;  2BFG A;  2XVL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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