3WJZA

Orotidine 5'-monophosphate decarboxylase d75n mutant from m. thermoautotrophicus complexed with 6-amino-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVANIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wjzA00
3P74A 3I7QA 3A22A 1G4SA 2QCFA 4O8RA 8TIMA 3MJYA 2AGKA 1H1YA 2WSRA 2NV1A 5K3VA 4UNLA 4LV9A 3W74A 2Z6IA 2QCHA 3A21A 4YL2A 1FY6A 2NZLA 4ADTA 2CLHA 4IJBA 4TMBA 1T96A 3B06A 5G4WA 2Y88A 1F5ZA 1Z41A 1QAPA 4RXGA 2BXVA 3TC6A 4IX2A 5HULA 1HO1A 4X2RA 3BLIA 3EXRA 1IIHA 4O57A 3G1YA 3ZR4A 1XKYA 3HG4A 3T44A 3P81A 3CT7A 5CZSA 3S9YA 5KINA 3W88A 1AK5A 2R94A 2GQ8A 4M6QA 1OX5A 2RDTA 3SSJA 5AB3A 2QCGA 4LVGA 3PUDA 1G4EA 4XBKA 3M9YA 3MP4A 2CZEA 4NU7A 3G24A 4DEFA 5D32A 5DBTA 4WXYA 2Y70A 4LC6A 4O4VA 3UXAA 5G1YA 1B4EA 3IVSA 4DBEA 4XBSA 3N14A 4CLMA 1PE1A 1FCVA 4GNJA 3NZ1A 3MBDA 3W2MA 3C3NA 3G1FA 3QQ0A 4JGDA 3C8FA 3QH2A 1ICPA 1AG1O 1UCWA 4O19A 3TC7A 3ELFA 1XBZA 1KW1A 3B8DA 3LCHA 3LCFA 1WX0A 3M44A 4UTHA 4GC4A 3CB8A 2H3BA 3TROA 1R2TA 4FNQA 1OF8A 3M7WA 1AW5A 1DKWA 3W1PA 1ZHAA 3DFPA 2X1TA 5D30A 3YPIA 3P8JA 4N6EA 1A50A 2RDUA 4O4WA 1QR7A 1KA9F 1SO3A 4FX6M 5FF3A 3W6YA 1NVMA 3R2GA 1ZAJA 3O07A 1F73A 2Y7GA 4UTTA 2E6AA 1VCGA 1GVSA 1H63A 4JNMA 4LS2A 4LY8A 1R2SA 3GDTA 4H4IA 1YDNA 3G8RA 3STEA 4Y96A 4UTKA 2NUYA 1YXCA 3PWAA 3DH7A 3STCA 1TPEA 3ABRA 3O06A 3W2NA 4C1LA 4IOTA 4JDYA 5I3JA 5K9CA 2FPYA 2LLEA 2NXGA 3P8IA 4Z1CA 5G2WA 4EOUA 3W2KA 4N02A 2ZRYA 5DCBA 3OIXA 1OG0A 3S8HA 5ABTA 4IPJA 2VFIA 2Y63A 3W83A 3TX9A 2X2GA 3S1UA 3GXPA 4AB4A 1G6CA 3O6DA 3EX6A 5T26A 2BX7A 3W7QA 4MLRA 2CLMA 5F2LA 3N2MA 2Y89A 4LWWA 1HFBA 4LVFA 3OVQA 2YYTA 3QF0A 2HTMA 4OHQA 4YCPA 2CFFA 3C6CA 1YPIA 3W1MA 5LNRA 1QO5A 4A29A 3QM3A 3TXZA 3W07A 3UYCA 1HL2A 3L5MA 4O13A 1DOSA 3PSVA 4OGZA 3RLVA 4RCXA 4X22A 1TTQA 3MP3A 3PC0A 4CQ8A 1Z48A 3LOTA 3W1NA 1W5QA 5C54A 3DKLA 3U2OA 3BW3A 4UC5A 2QAPA 3STGA 4XQ6A 5EL1A 3FLUA 3TFCA 1OFPA 2ZRUA 2VFHA 3M1ZA 1QPOA 2ZBTA 6TIMA 1L6WA 1YTDA 1LOSA 3DXIA 3F4NA 3WK3A 1I2OA 3B03A 4UTLA 3NQ2A 1MEHA 4OV9A 5HMSA 3DI1A 3NQAA 3UY7A 4UTWC 1KM5A 3BLFA 5I3IA 3NQ8A 4KWVA 5D2WA 3KRZA 4FNTA 4NNBA 4K39A 4PCFA 3H55A 1VZWA 4NXSA 4IXXA 2VEMA 1EPXA 1JCLA 1JQXA 3HOJA 1TIMA 2DZWA 1K03A 2ZDRA 3EX2A 3W72A 1WA3A 3L2IA 4ZQRA 4M6VA 4ML9A 5IBXA 4WUIA 1SO4A 1PIIA 1UUOA 3GVGA 3T78A 5E93A 2PE4A 4PEKA 3PB0A 3PY2A 2PRMA 3W7JA 3W7MA 4ICNA 4QAIA 1KFKA 3NL3A 2W79A 3FIGA 3BG5A 3FS2A 4CCEA 5CSSA 1TMHA 1I2PA 2NXIA 3GAKA 3Q94A 1QNVA 4J9JA 4IMDA 3CEUA 5F4WA 4EF8A 4NJJA 3GIYA 3QMRA 5D2VA 5J5RA 2WNZA 2C15A 2Z1BA 4I7WA 2X16A 1QCWA 1VYRA 2C19A 1TO3A 3B4UA 1W56A 2ISVA 3C4UA 4PC8A 1RQBA 1KFCA 3KVJA 4PL2A 5A8GA 2WKJA 1G7UA 1TQXA 3ABSA 4AH7A 3UD6A 3U6WA 1ZJIA 2DZXA 1YPFA 4RXFA 2B7PA 2VXNA 3O16A 4N4PA 4GFSA 2BZNA 3MWAA 4MY8A 3TQKA 1TSIA 3T40A 1CI1A 1OFQA 3DI0A 1LYXA 5LSMA 2FFCA 2QCEA 4ORIA 2ABBA 1W3TA 2A1YA 3P84A 3PUEA 5AYYA 4M7SA 2Y61A 4Y90A 3M43A 5AFDA 1IXNA 2VOMA 3VCRA 1S5VA 1ONRA 2DU2A 3EWBX 3N9SA 1PVNA 3LXBA 2W0UA 1ME8A 3UPWA 3TMLA 3TFXA 1WXJA 3FYPA 1FWRA 3R89A 3FFSA 4UTUA 3LCGA 1DL3A 5F1UA 1AW2A 2CU0A 4R7JA 3HGRA 1GG1A 2J88A 3CIXA 3UWQA 1PHWA 1FX6A 2YCEA 4FXSA 4XZ9A 3ZS4A 4MYXA 1N7KA 1UJPA 1HO4A 4TU1A 5KSWA 3GXTA 5LNSA 3G1HA 1EP1A 3PUOA 2V2CA 1GTHA 2JKEA 2QJHA 3PAJA 5AHNA 1W54A 4AWTA 4E2BA 5IM51 5DY3A 2C18A 3KHJA 5K2ZA 1J4EA 4OV4A 3W7EA 3PBWA 3TA6A 3GDMA 4FEZA 4MY1A 1C8VA 1N55A 1VYPX 3UWZA 3TJXA 2ZCGA 3F03K 4CNNA 1GOXA 5TBOA 1MZHA 2B7OA 4OE7A 3BGJA 1ZAHA 3UZ5A 3GKFA 1F6PA 5BMXA 1J5TA 1W3NA 3C2OA 1V5XA 1ZY9A 4UTJA 2ZTJA 2YW4A 4TR9A 3TW7A 1QPQA 5H2ZA 4UR7A 3GZ3A 4O15A 5G2IA 1C29A 1SUXA 1XDLA 1TPB1 4KKXA 3CLMA 2FB3A 4O1BA 3TAOA 1SO5A 4DF2A 1FWNA 3EKLA 1LBFA 1JUBA 1SW3A 4JR5A 4UFHA 4WY0F 1L2UA 4XKYB 4FB7A 3DFQA 1KFLA 2V82A 3L5LA 4CNOA 1TPUA 5FEZA 1G4TA 1L6SA 1QFEA 4AWSA 3M6YA 1OABA 3LGEA 4H3DA 4JTSA 3F4WA 2C3ZA 3TSMA 2GVJA 3GNDA 4Z0JA 2VEIA 4MYAA 1XC4A 2J6XA 5MHBA 1MEWA 3L68A 3FYOA 4NJIA 4MLJA 3P7YA 1MO0A 2NX1A 3NQFA 1W5MA 1H60A 3G1DA 4W9TA 4O10A 2QCMA 2EGZA 3HMJG 4O50A 1XI3A 1M5WA 2NUXA 2QUUA 1SFJA 3NA8A 2Y85A 4ZQPA 3GNNA 1YDOA 3GLCA 3LV6A 1J2WA 1RR2A 1TRDA 1TV8A 3GDKA 3CU2A 3GK0A 1EIXA 1F74A 2QEZA 4Z08A 2NX9A 3EX1A 1DQXA 2OT1A 2FTPA 3JR2A 4X3ZA 1K7FA 2YR1A 4AWUA 3MHGA 4PODA 2VFEA 1OYAA 2PURA 1KFBA 1YTKA 4RLIA 3HG5A 1QOPA 1THFD 1DQWA 4HNVA 1B9BA 1H50A 1SSDA 4GJ1A 3NO5A 3SZ8A 5G5IA 1SPQA 1W1ZA 1OX4A 4FX8A 3PF3A 4KFOA 5D05A 1LM1A 2ZA2A 1FQ0A 1A5CA 2B4GA 1KLZA 3N2XA 1IXPA 3QSTA 4NUWA 1EP2A 2B0MA 2Y62A 5F4XA 4LOCA 3IVTA 2YGYA 3FEMA 3LX9A 4TX9A 3NM3A 2J9XA 5D38A 4HNNA 3NDOA 4MFDA 3PVFA 5D2XA 1WOBA 3EKZA 3TDFA 3DFTA 3C0JA 3MW7A 1GT8A 3M5VA 2DZSA 4I7VA 3RK8A 5CZJA 2YXGA 2G95A 3W1XA 4GUFA 2X1SA 1OX6A 1UASA 3BLEA 4JXCA 3PS7A 3S0CA 1O5XA 2GQAA 3PM6A 5AHEA 1H62A 4IXHA 4O11A 1U5JA 1TRIA 4JTGA 2EPHA 3U8GA 3G1SA 3LTYA 3VI2A 4RKAA 5FF2A 3NGJA 5AHFA 2J9YA 4Z0SA 3LXAA 4I7UA 5J5DA 2RHGA 1VC4A 4MUZA 1WDWA 2RKXA 2ZZ7A 4O1AA 5F2IA 1XXXA 3NPUA 3W7NA 2CLFA 3IIVA 2QCNA 1OYBA 3TK7A 4A2SA 1H7RA 3DKJA 1SSGA 4HSOA 1R46A 5LGZA 3NPVA 4MJZA 2DORA 3VE9A 1VR6A 1SQ7A 4MY9A 3HQ1A 5CPNA 4WD0A 4WQ6A 4RZ6A 2ISWA 4UMBA 3THQA 4ALDA 5BNKA 3LI1A 3CEPA 3PBYA 1RVGA 5CPMA 1KM0A 4MOZA 1H7WA 4JIPA 2G96A 3PBVA 4P2VA 4N9BA 4LV4A 5CG7A 4LC8A 3BPWA 1I8JA 2VELA 1XFBA 3W1TA 1AL7A 3TQVA 4AHOA 3M5YA 2C16A 1JRBA 2Y7EA 5HUPA 2TSYA 5CZTA 2ZQ0A 1KTCA 4D2JA 1W5PA 3CWNA 1LORA 1W3IA 3LXCA 2Q3RA 4WJEA 5BW6A 2ZZ4A 4Z1AA 4IWWA 1M7PA 4N6FA 4R33A 5D09A 4UCGA 3N19B 1EB3A 1F6KA 4UTIA 4AEOA 2FPTA 4BI5A 4ZZ9A 1YTEA 3P62A 3LRKA 4ORMA 5K4ZA 3TXVA 3MHUA 1SR9A 4KWWA 4A21A 1FWWA 1P0KA 1LBLA 2DZUA 4HSNA 1R47A 3L0KA 4MFEA 3LHUA 1KV8A 2ALDA 3IEBA 4UTTC 3W7CA 3C2FA 1OFOA 3HIJA 3O6YX 3USBA 3IIXA 1GVRA 1H51A 4RZ5A 3WJWA 2QJIA 3T4CA 5FI8A 1WV2A 1KFEA 3M16A 4LT9A 4NX0A 3B0VC 5C2XA 4O12A 3I68A 1MXSA 3ZWTA 3A5VA 2ZTKA 5AYZA 4DO5A 4JN6A 3TW6A 3G18A 3FJ6A 3P5YA 3FKRA 5EMUA 2E6DA 1GYNA 3RLUA 2DJLA 2QCLA 1SZEA 4RJEA 4OWGA 1KM1A 2WO5A 1R2RA 4GUJA 1PS9A 1D9EA 3W7OA 4N4QA 3HGSA 4NJKA 2TMDA 5I3FA 4FHAA 4BWLA 1YXYA 1M6JA 3IGXA 3UXDA 3W7GA 2DZVA 3AO0A 1XL9A 5AOUA 1HG3A 2ZA3A 3KXQA 4LVAA 3HB9A 4DELA 3W87A 3TIMA 3TNOA 5HWJA 2F84A 3TSDA 1TPFA 5A5WA 1VCVA 3PSWA 4ZQOA 2EAWA 3UQNA 4HNTA 3DU0A 3HF3A 4XTIA 2WQPA 1GQNA 2E5CA 2A0NA 1JCMP 1P4CA 4LUJA 3P80A 3B0UX 3OVRA 3W76A 3MI2A 3WK2A 3B05A 4JTTA 4S1FA 5D04C 4E0CA 1W31A 4MZ1A 3MYPA 4HKPA 3BO9A 1OJXA 4GE8A 3V1PA 3N34A 4BFAA 4JTHA 2WV8A 5EYWA 1EX5A 4YCOA 2GVLA 5D2YA 1TPC1 1A5BA 1X6UA 2HSAA 1WQ5A 4O53A 4AHQA 2VFFA 3EEGA 4WY0A 1EUNA 2CZDA 3NYZA 3QJAA 4KFPA 3BW4A 1XUZA 3EX4A 3MHFA 4HT3A 3EXSA 3HO8A 3LLFA 3EWXA 5DELA 1XBXA 2VFDA 5AHIA 2GJNA 3GR8A 2YFOA 1KV5A 5U7SA 1H7NA 4EF9A 5D37A 5LHFA 4ONVA 3OBKA 2FDSA 2J24A 1VS1A 5IBXC 3W71A 2ZZ3A 4K37A 3M47A 5CGQA 4HN4A 1LRTA 1G4PA 4ZQMA 3DHFA 1X7FA 5LNWA 2W6RA 1IIGA 1VJIA 4O0KA 1LCOA 5K7JA 1KFJA 1WOAA 5FEWA 3I6RA 2X30A 4UR8A 3G3DA 3QW4B 2B7NA 3UWYA 3W9ZA 3MMTA 4NQ1A 2BTMA 2ATSA 4N9EA 3ZWSA 5KMYA 3EWWA 3R5EA 1KLYA 1Z44A 4JTKA 3C2EA 4K6AA 1S3HA 3ANYA 4JY9A 3WJSA 4TMCA 3IV3A 3W1UA 1TPVA 1IF2A 1VRDA 2V5LA 5HNRA 2DJXA 1JVNA 1EUAA 4I9AA 2ZA1A 5LGXA 1NAL1 4OU1A 2ZRZA 2OX1A 3CC1A 4A3UA 3HJZA 3EXTA 4FNPA 4E2DA 1GYLA 3R12A 1H5YA 3HPZA 5C55A 1CW2A 4NNAA 4MPQA 3R13A 1TTPA 3C52A 5BOOA 3E49A 2ISSA 1FXQA 1P5BA 1B57A 1MEIA 2YW3A 3MO7A 4IX0A 3IIZA 3SI9A 2NLIA 4C1KA 2ZRWA 1T8XA 1Q6RA 2ZYFA 3NQ7A 4PTNA 1RQEA 1XUUA 1FBAA 4IPIA 4LVBA 1LBMA 5CPOA 1OK4A 1K8XA 2BLEA 3H54A 3O63A 3LI0A 5HR7A 3NL5A 3DFSA 3HPXA 4BR1A 3KVKA 1TJPA 3O15A 2NWSA 3SGZA 3TMQA 3BW2A 5AHMA 4DF0A 2DZTA 2JBMA 2PC4A 4QSHA 1MSSA 1ME9A 5CZ0A 3I7RA 1QWGA 3NQCA 1QPRA 5KITA 1YYAA 3PULA 5K9DA 3SY5A 1L9WA 5EKYA 5KZMA 4MZYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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