3WUEA

The wild type crystal structure of b-1,4-xylanase (xynas9) with xylobiose from streptomyces sp. 9
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
TATLGELAEAKGRYFGSATDNPELPDTQYTQILGSEFSQITVGNTMKWQYTEPSRGRFDYTAAEEIVDLAESNGQSVRGHTLVWHNQLPSWVDDVPAGELLGVMRDHITHEVDHFKGRLIHWDVVNEAFEEDGSRRQSVFQQKIGDSYIAEAFKAARAADPDVKLYYNDYNIEGIGPKSDAVYEMVKSFKAQGIPIDGVGMQAHLIAGQVPASLQENIRRFADLGVDVALTELDIRMTLPRTAAKDAQQATDYGAVVEACLVVSRCVGITVWDYTDKYSWVPSVFPGQGAALPWDEDFAKKPAYHAIAAALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase A
publication title Structural perspectives of an engineered beta-1,4-xylanase with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp.
total genus 126
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wueA00
1O7AA 2WYSA 1BYCA 2FGLA 3EDJA 2XIBA 1KGUA 1CXHA 2B31A 1F4HA 1HKKA 1XCWA 2VO5A 5F7UA 1UA7A 2WZIA 4N42A 4B9YA 3WD1A 2CBJA 1FA2A 2W4XA 1GONA 2FGZA 4W84A 2XTKA 1G9HA 3QGVA 1E4LA 5I6SA 3CGTA 1JNEA 2DEPA 5CLWA 2JIWA 4TXEA 4HZ8A 1PIFA 4XZWA 1LG2A 1E0WA 1UD6A 1EDGA 1P6WA 1H49A 4E8DA 4XV0A 3VIFA 3W29A 1ODZA 1VB9A 4BZYA 1UZ4A 1UWTA 2GK1A 2ZWZA 1B1YA 4W87A 1G01A 4AZCB 3PZGA 3CTTA 4CVUA 3OGVA 4MNLA 3WDIA 3CZGA 1UD5A 4MAZA 1ZBCA 2WVVB 4RE2A 1Q4NX 4P7OA 2XYLA 3A4WA 5CZKA 3SCTA 1OD8A 3ARUA 4H8UA 3WQ8A 4GO8A 1CLVA 3W37A 2W63A 2WCAA 5D9OA 1NQ6A 2Y8VA 4UFMA 1H2JA 2YDRA 3WF1A 4S3KA 2CYGA 2ZUNA 2EPNA 1W9PA 3OGSA 2Y24A 3VD4A 2PBGA 4MB1A 3VD3A 2WLYA 1UD4A 4URIA 2E40A 1GVYA 2XJ7A 5M03A 1GORA 2J47A 1BHGA 1EQCA 4LXFA 3B9AA 1HKJA 1GUVA 3G6MA 1W1VA 4LPCA 4MB3A 1OGBA 3AXXA 1JFXA 2VR5A 1FH9A 1NOFA 1US2A 1J0YA 1ISYA 4UZUA 1UHVA 3VIOA 5A8OA 1CXIA 1S46A 2YBUA 5AYIA 4P7RA 1JFHA 4AYSA 3SCRA 3ZO9A 5ABGA 4ZXLA 1TG7A 1QHPA 3MUY1 3O6AA 3O9NA 4JKKA 4HOXA 3W38A 3ARQA 3KEHA 4R27A 4QFUA 4M80A 1E4IA 1NWRA 3N9KA 1RP8A 2WKGA 4WKHA 3WEOA 3EMCA 3AIUA 4L4OA 9CGTA 5JBEA 2YLLA 3BGAA 5LYRA 5ABFB 1VAHA 1TE1A 2XFFA 1C90A 3BSHA 1JZ2A 1PJ9A 3GXMA 2ZE0A 1E1EA 2YBTA 2BHYA 3K46A 1UQYA 1BFNA 1NOUA 1MXDA 4PMUA 2VX7A 1UKOA 4LYRA 3CPUA 5E09A 5DEZA 4Q7NA 1XC6A 2CESA 1E3XA 1KCLA 2DH3A 3EDKA 3M7SA 3RJYA 1G1YA 1VBUA 5A6KA 5BXTA 1UH3A 1IT0A 1CIUA 3AIRA 3MKKA 4FK9A 1XRVA 5HPCA 2D3LA 3AXHA 1WDRA 3WY1A 2YA1A 5BROA 5IHRA 2WHMA 1E71M 4FLSA 3WDJA 3VDHA 3LPFA 1JYWA 3SCPA 1MW2A 4CUCA 3LMYA 1E6SM 3BLKA 3AS1A 1WO2A 2VZSA 4D6CA 3CMJA 1C92A 3WMBA 1D2KA 2YIHA 1ZBWA 3OLIA 4GKLA 4IUGA 3BXWA 3WNOA 1J01A 4D1IA 4PBGA 4HZ6A 3UERA 2Y5EA 4RE4A 5AC5A 1WAWA 5GNZA 4P8XA 4F8XA 1R7OA 1UWRA 3VGEA 2PWDA 1B30A 3AIVA 3VUPA 4U31A 1V03A 1US3A 4GI9A 1GQIA 2ZUUA 2XVPA 2XG9A 2VX6A 4F9JA 4A3HA 5M3WA 3BMVA 2VMFA 1VFMA 2WBKA 5E6ZA 3HU7A 2EXOA 5D9MA 4WKFA 2MANA 3WH8A 4TVUA 5CSYA 2DH2A 1C7TA 2BS9A 6A3HA 1Z32X 3AYSA 4D6IA 3MSDA 5I3DA 4BQ5A 4GZIA 4JKLA 2EO7A 1TZ7A 3VIIA 3UETA 2WBGA 3CLWA 4GI8A 4NF7A 3ECQA 2VX5A 1PZ3A 1WDSA 5EFFA 1Q6FA 4L4PA 1HJSA 2DT0A 1VEMA 3QHOA 3BC9A 3BMWA 2G3JA 2VNCA 5A6MA 3VX0A 2QV4A 2YJQA 2CETA 1GOQA 1CLXA 2ZUVA 3PZQA 1UR8A 3ZT7A 1BGGA 4KRTA 3CZJA 4W8LA 3MUIA 2DGAA 4UQAA 4D71A 4UOZA 4ZE4A 3EMZA 5FIPA 5A8QA 2D22A 1KWGA 1GNXA 1J0ZA 1GOIA 3OZOA 1CECA 3QOKA 4S3JA 4A4AA 2VQUA 1ZJBA 4HMCA 2XVKA 3VKKA 2D20A 2PWFA 4W88A 1LF1A 3MMDA 1J0KA 5A94A 2O9OA 4ATWA 3CZLA 2QMKA 1V6UA 3CH9A 4UQDA 5LA1A 1BYAA 4Z2KA 1H0IA 4AMCA 3ZOAA 3MANA 5BXPA 2JFEX 2BY2A 2WK2A 3OBAA 3AHTA 2CHNA 3ARSA 1HXJA 2WSKA 3PZ9A 1V3LA 3LPGA 1LWJA 4QAWA 2UWFA 2C8NA 4AIUA 4AD1A 4IPLA 2WVUA 1WCGA 1JZ8A 5D8WA 2WHKA 2J75A 3BAJA 3WH9A 2VUYA 1LL4A 2DQXA 3PZUA 5C70A 2CKSA 3CUJA 5BYWA 3WFZA 3AMLA 3WNNA 3NYDA 3UESA 4KGLA 4W8BA 5JIPA 3VD7A 2ZX5A 2D3NA 4WIWA 4MNKA 4W85A 3WDPP 2A3BA 1VFFA 4CD6A 4U3AA 4AD0A 1M7XA 1GOOA 2ZXDA 2J7GA 2UY5A 2VC9A 3I3EA 3D3AA 4AISA 3GBEA 1E6ZA 1JD9A 1VEPA 3WQWA 1VRXA 2WMHA 5JIWA 1ZL1A 4CU6A 4W5UA 4AD2A 1HVQA 1JZ7A 1FP9A 1PIGA 1OSEA 1W3KA 4P7LA 4C7DA 4DUVA 1I1XA 2CBIA 4RE3A 3SCUA 4JHOA 1HJVA 4GINA 5TD4A 4PMQA 1OWQA 3W24A 2BVDA 1XH2A 4PMNA 4NRRA 1ZS2A 1CXEA 3M07A 1E56A 2JEPA 1LL6A 3SCWA 2VX4A 2WNWA 1M53A 1EO7A 1DTUA 1H11A 1WNOA 3MMUA 4P7QA 5HOSA 1W1YA 2EPOA 2E9BA 1J0IA 1V0KA 3VD5A 4PMDA 5GNYA 1BQCA 1ZBVA 1HP5A 4W7VA 4EANA 1E40A 3K1DA 1UA3A 1V6YA 3WD0A 3FW6A 1EHAA 3TOPA 1E3ZA 2WB5A 5AC4A 1BLIA 3G6LA 3EMQA 3IAQA 3F5JA 2XVNA 3W0KA 5A2BA 1UG6A 3A4AA 4AC1X 4QCEA 1QPKA 1KB3A 2DT1A 4DUXA 1OD0A 1MWOA 3TONA 2IXVA 1JI1A 4CKQA 3WUFA 2X0HA 7A3HA 3F5KA 4W7WA 1GHSA 1E5JA 4Y7EA 3GH4A 2WSPA 4LGXA 1C8YA 5FOOA 2XIIA 3WDRA 3ZSTA 3WD3A 3WQVA 2VL4A 3B9EA 3VM5A 1MQRA 4HU0A 4FMVA 1JD7A 1SYTA 2CEQA 4HU8A 1EXPA 1E5NA 1DWHM 3M6DA 3FHAA 4JFWA 1M03A 1UH2A 2DT2A 1WZKA 2OYMA 4FLOA 4JHZA 5E0FA 3GM8A 4CVWA 3RM4A 5FL0A 1TMQA 4ACZA 1N82A 2VVNA 3WL1A 3VMPA 3IJ7A 1W3JA 1DHKA 4U5IA 3MV01 3ZSSA 3D5HA 2ZUSA 1V0NA 4TX6A 4WLCA 3OLDA 4GIAA 3BCDA 4WK9A 4MB4A 2UY3A 1UWQA 2WKLA 2X1IA 4AEEA 3VNYA 1CGVA 4AD4A 1BVNP 3MO4A 1V3JA 2J7DA 1O6IA 2JIEA 2WHLA 3AISA 2YL6A 1UD2A 3PZTA 5BCAA 5DO8A 3TTQA 4HPHA 3VIPA 1EHNA 5CGMA 1OM0A 1EOKA 3BAXA 4J28A 2NW0A 5I5RA 1JF6A 5A6JA 3K4AA 2J25A 4UOQA 1HN1A 2FDMA 4MPKA 3VNZA 3UCQA 3ZT6A 2VR4A 4NRSA 5IHSA 1D7FA 1HKIA 3S2CA 1MVYA 2WC7A 4WSJA 4GPNA 4OJYA 3W6MA 4CCDA 1MW1A 3TA9A 2G4FA 2Y8KA 3SCSA 3W82A 3W81A 2VRQA 2G3IA 5C8BB 2GDVA 1UD3A 3SUVA 1R86A 2E9MA 4HP5A 4PTMA 1FOBA 2WW5A 1U33A 3WNPA 2DSUA 4C7FA 1B0IA 4D6JA 3K4DA 4Z2GA 2WPGA 3K8MA 1ISXA 4W5ZA 4BS0A 2ZXAA 4CN1A 1GQJA 2J74A 4ZEPA 4MNMA 3GNPA 1W32A 2AOSA 4F9DA 4J7RA 1WKYA 1H1NA 2NSXA 1EH9A 2QF8A 5A8NA 2FHBA 3KWXA 2G3NA 4AY1A 1RH9A 3IANA 2ZIDA 3ALGA 1PZ2A 4HOZA 1VFOA 2D1ZA 2DSKA 2D0HA 1UKQA 2BY1A 3EYPA 1JZ5A 1JG9A 8A3HA 4CD4A 2V3EA 1UH4A 3DYMA 5I79A 4P7NA 5E9AA 1K9TA 1JZ4A 3VIMA 1ODUA 4U3CA 4Z2HA 4DUWA 2WXDM 1KGXA 3BH4A 4J3TA 2A3EA 4ATDA 2F8QA 3VILA 5EB8A 3T2PA 2YDQA 5A6SA 1W9BM 4TUFA 3DECA 2WC4A 3VGGA 2V5CA 4HA1A 3E1F1 3VIJA 1ZJAA 2FHFA 1J9YA 2VRKA 5A3HA 3L4YA 1QI2A 4Z2LA 5M5DA 4GXPA 1HVXA 3VINA 2EQDA 1MW3A 4JFUA 4UTFA 4CD5A 1Q6EA 4H2CA 1NP2A 1HKMA 3ZM8A 4H8VA 3KL5A 1OT1A 1SMAA 1A3HA 2OWXA 5EFDA 1U2YA 5A1AA 1J18A 1SFSA 4J3VA 1TVNA 3ZR5A 4MAVA 2WAGA 4NI3A 2E4TA 1F4AA 4MJ2A 4QDMA 2YL5A 2WVTA 3WBAA 2Q8XA 1VJSA 2DIJA 4GQRA 1QI0A 1LG1A 2DDXA 2OYKA 4AZ7A 1OCQA 2XUCA 4E4PA 4PSRA 2PWEA 1TA3A 3AMCA 3ALFA 4ZXOA 2XWEA 2VQTA 3K8LA 3UG3A 2PWGA 1UWSA 2UY4A 4WJXA 4PMVA 4CN4A 3GNRA 4CU8A 1CDGA 1GOMA 3MMWA 3AIEA 2GUYA 2O9TA 1LQ0A 3L4ZA 1K6AA 3NSMA 1H0GA 3N18A 3GXDA 4MADA 1KFWA 3ZQ9A 1AQMA 1EO5A 2BV9A 2IUZA 1ITXA 1EOMA 1GZJA 2ESCA 4F66A 2E8YA 3AZSA 1KQYA 3RO8A 5BXRA 1QHOA 1QI5A 3O2LA 1WP6A 1E70M 5KEZA 3AROA 1QNOA 1TFVA 4PMOA 5HDRA 4BQ4A 2WC3A 3CZEA 4OOUA 3VX1A 4JCLA 2RGLA 1W3HA 2QLYA 1UZ1A 3HJEA 4YPJA 4AW7A 1JDAA 3WUGA 2YL8A 3EBVA 1JDDA 1KXQA 2HVMA 3VD9A 4P8VA 1UR2A 1JYXA 1R8LA 3AS0A 5ABHA 4JL1A 3AIBA 4D6DA 1OB0A 3VO0A 3RCNA 2EPMX 2W92A 4DM1A 1XYFA 2CNCA 2EPKX 1B31A 3WQ4A 3BAKA 2D23A 4P8WA 4XZBA 4GO9A 3A47A 3AMDA 5A2CA 4B9ZA 3AIQA 1JXKA 4UQCA 1XH1A 2W67A 4M29A 3WD4A 2J8FA 5DFAA 1WB0A 1CYGA 1OBAA 3WNKA 4KH2A 5ECUA 2C7FA 5DF0A 1AQHA 3AOFA 1UKSA 1G0CA 3W26A 2J7BA 3WDQA 3WNLA 3U57A 5C71A 1HL8A 1NWTA 1BGAA 3AFBA 4KGJA 4D1JA 3L2LA 2GDUA 4PTXA 4J27A 2OLHA 1XH0A 1EIBA 1I75A 3EDEA 1UOKA 2VCCA 1AQ0A 4RL3A 1DWAM 3ARYA 2XPKA 4PMZA 2CHOA 2PB1A 5IDIA 1L8NA 1QBBA 4XX6A 3BAIA 1KXTA 3ZJ6A 5HXMA 1DWJM 3L4XA 4UFLA 4AWEA 3AZTA 1AMYA 3HN3A 1KR0A 3PZMA 1CGWA 1W9DM 4MNJA 3RILA 1QI3A 3GXIA 1CEOA 4MTVA 4PCSA 3CZKA 3U5YA 2D0GA 1M01A 4WF7A 2WANA 3FXYA 2DSWA 1K9EA 1E6QM 4TOQA 4BQ3A 1RP9A 3VPLA 4UQEA 1SR0A 3PZIA 2XM1A 2XFYA 3WNMA 3AMGA 3WUEA 4OZOA 4M8UA 5IXEA 5LA2A 3PTQA 4LYQA 1TVPA 1GOKA 3FHQA 4W8AA 1BSIA 3AQUA 3VGBA 3U5UA 3OLEA 1MQQA 1EDQA 5E0CA 3KL3A 4PSPA 2VZUA 2BY3A 4JFVA 1OINA 1UR0A 1QNQA 1OGGA 2YDSA 5A8MA 2WMIA 3POCA 2UY2A 3AHXA 3GDBA 3SCOA 2ZUWA 1WZAA 3PZOA 2EJ1A 2WWCA 2CIPA 4J3XA 3WF2A 1KR1A 3FNDA 1PAMA 4J3SA 2J4GA 1V3KA 2V3FA 1V0MA 1DWIM 4UR9A 1BYBA 1BF2A 4PTVA 1V6VA 1B3ZA 2HISA 5GPRA 3N12A 3KL0A 2NT1A 3OB8A 1LJYA 4AD5A 5M17A 3EDFA 4DWSB 2O9PA 3GBDA 3TP4A 1E9LA 2J62A 1MW0A 4CU7A 4JFSA 5DT5A 4UOJA 1OIMA 2AMGA 1TCMA 2XM2A 3NDZA 1H3GA 2WZHA 3SUSA 2O92A 3VMNA 3SUWA 4U33A 3ARTA 1HX0A 2DSVA 3PHAA 2DSZA 3WIJA 2VRJA 1XCXA 3DC0A 1H4PA 2CBVA 1W1PA 2OSWA 2PBOA 3WBEA 4JZ5A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1O7A A;  2WYS A;  1BYC A;  2FGL A;  3EDJ A;  2XIB A;  1KGU A;  1CXH A;  2B31 A;  1F4H A;  1HKK A;  1XCW A;  2VO5 A;  5F7U A;  1UA7 A;  2WZI A;  4N42 A;  4B9Y A;  3WD1 A;  2CBJ A;  1FA2 A;  2W4X A;  1GON A;  2FGZ A;  4W84 A;  2XTK A;  1G9H A;  3QGV A;  1E4L A;  5I6S A;  3CGT A;  1JNE A;  2DEP A;  5CLW A;  2JIW A;  4TXE A;  4HZ8 A;  1PIF A;  4XZW A;  1LG2 A;  1E0W A;  1UD6 A;  1EDG A;  1P6W A;  1H49 A;  4E8D A;  4XV0 A;  3VIF A;  3W29 A;  1ODZ A;  1VB9 A;  4BZY A;  1UZ4 A;  1UWT A;  2GK1 A;  2ZWZ A;  1B1Y A;  4W87 A;  1G01 A;  4AZC B;  3PZG A;  3CTT A;  4CVU A;  3OGV A;  4MNL A;  3WDI A;  3CZG A;  1UD5 A;  4MAZ A;  1ZBC A;  2WVV B;  4RE2 A;  1Q4N X;  4P7O A;  2XYL A;  3A4W A;  5CZK A;  3SCT A;  1OD8 A;  3ARU A;  4H8U A;  3WQ8 A;  4GO8 A;  1CLV A;  3W37 A;  2W63 A;  2WCA A;  5D9O A;  1NQ6 A;  2Y8V A;  4UFM A;  1H2J A;  2YDR A;  3WF1 A;  4S3K A;  2CYG A;  2ZUN A;  2EPN A;  1W9P A;  3OGS A;  2Y24 A;  3VD4 A;  2PBG A;  4MB1 A;  3VD3 A;  2WLY A;  1UD4 A;  4URI A;  2E40 A;  1GVY A;  2XJ7 A;  5M03 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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