3WZ7A

Endothiapepsin in complex with gewald reaction-derived inhibitor (6)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Tracing binding modes in hit-to-lead optimization: chameleon-like poses of aspartic protease inhibitors
pubmed doi rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2014-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3wz7A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3wz7A01
3TPRA 3LPJA 3EBZA 4YD5A 5P2ZA 4B77A 5P3YA 3TTPA 3R2FA 2BKSA 2V13A 4DFGA 4QJ6A 3R4BA 5P0AA 3UDNA 4YCTA 5P16A 3I25A 5KQYA 3KMXA 2ER7E 1BDLA 5P7DA 3KMYA 3LINA 2V10C 4TRZA 5P6WA 2FXDA 2I4QA 5P0HA 1D4HA 3PGIA 4B72A 3VG1A 5F01A 1B6JA 3SACA 4FM6A 5P3MA 3UDYA 3PBDA 5P45A 5P24A 5P59A 3ST5A 1OEXA 2P83A 5P12A 2UXZA 1A30A 3HAUA 2V0ZC 3T7XA 2F3EA 4DH6A 3KN0A 2AVSA 1HVRA 3S43B 3WZ6A 2IKOA 3EL1A 4J1CA 1IDAA 5DQ1A 3OU3A 5IVRA 3PLDA 2QI3A 4DJWA 3C9XA 2QAKA 3URIA 1HHPA 2G94A 2WHHA 4Y48A 5P0RA 3VF5A 5P0YA 1FMUA 2AVMA 3VSXA 5P0QA 1ZP8A 2NPHA 5P5EA 4PYVA 5SY2A 5P1ZA 4BFDA 3UDJA 1T7KA 3GGAA 3L5FA 3D3TA 4R5NA 1ZPKA 4RCDA 5OZUA 2G1YA 3H0BA 4FAEA 3O9GA 5P67A 4Y3GA 5P11A 4J1HA 5P0SA 2R9BA 1APVE 3OQKA 5P6VA 3TLHA 5P88A 5I70A 2PMAA 1E82E 1FQ6A 5P89A 2G21A 5P2RA 5P53A 4EJDA 3L5DA 5P51A 5P6YA 3T11A 4CPUA 3O9FA 3ZPSA 3TPPA 2VA6A 5P4KA 4B70A 5KAOA 1FQ7A 4B1EA 1FIVA 2NMZA 4CPWA 5P1HA 2V16C 4R92A 1XDHA 4ER4E 3O9LB 5P8MA 1FEJC 4B78A 2NNPA 2WJOA 2G27A 4A4QA 5P4NA 1AAQA 1HTGA 3EKVA 5P8CA 3FX5A 1ZPAA 3KDBA 3BXRA 5P2VA 1EPOE 4HDBA 5KR8A 5P7RA 1GVVA 5P8LA 3G6ZA 5P7UA 3QRSA 1EC1A 3SA7A 4LL3A 2QCIA 4L7GA 4YD7A 1KJGA 5OZ7A 5P36A 3IN4A 4IVSA 2AVVA 2QHYA 4I0EA 4LHHA 3MXEA 5IVQA 3K5GA 5P7WA 2HIZA 5P41A 4QJ9A 4Q1WA 5P3UA 4OBZB 4Y3TA 5P30A 3PWWA 5P0XA 5HDVA 5P3SA 5P29A 5P7FA 1C70A 8HVPA 5I3YA 5P02A 5P6MA 3RU1A 4Z2ZA 7HVPA 4L1AB 5P8UA 5P14A 5P54A 3U6AA 5P1AA 5P39A 5P1EA 2ANLA 4ZPFA 3D1YA 2Q15A 3EL4A 3HLOA 2WF0A 2ZE1A 4PEPA 5HE4A 3SLZA 3UCBA 2ZJMA 1D4KA 3UDHA 4Y44A 4TRWA 2G1NA 2I1AA 1VIKA 3OUDB 3I7EA 3URJA 3NLSA 2QNNA 2ZJHA 4EP2A 2V11C 3HZCA 2OHUA 3KT5A 4XKXA 4Q1YA 5KOSA 1HBVA 5DQ4A 2QD8A 4I0DA 2PSUA 5AH9A 4ZSMA 3OU1B 4DJYA 3SFCA 2AZBA 3TH9A 5AH7A 2IS0A 1GVTA 3PBZA 5HCTA 5P3XA 2ZHVA 3PEPA 5P74A 3SM2A 3ECGA 3DUYA 5P0TA 1FQ4A 2R3WA 5P0LA 3RVIA 1BAIA 4GJ7A 5OZWA 5P2SA 5P5PA 5OZCA 1YX9A 5BWYA 1GNNA 5JFPA 1ME6A 3OADB 1MEUA 3VUCA 3RSXA 3SA8A 4OC6B 3IVIA 3K5CA 3PRSA 3QBFA 5IS4A 4NJVA 1F34A 1K2BA 1EPME 4D88A 4ZSRA 3UDRA 5P4IA 3EM3A 5P8AA 5OZ9A 2Q11A 4NKKA 5P85A 3NUOA 4J0ZA 3DCRA 2HS2A 4I0IA 4JECA 5OZ0A 4RYCA 5OZXA 5P8FA 2QZLA 2WEZA 5P4XA 2QMDA 2WL0A 4RRNA 1WKRA 1IZHA 5P6HA 5P4SA 3VYEA 5P22A 5P3RA 4Y4UA 5APRE 3PI0A 5P5WA 4ZPEA 1E5OE 1HIIA 3PCZA 1FFFC 5OZPA 2O4PA 3TPJA 1LYBA 1BBSA 2I0DA 3K5FA 3BUHA 2BPVA 2AOCA 4Y57A 3QIHA 5DR8A 3SA3A 2ZJNA 3INEA 5P8VA 5IE1A 1FMXA 4Y5GA 3D1XA 5P0UA 2QNPA 3GI6A 5OZ1A 4DJOA 2ASIA 1LF4A 5P13A 5B18A 2APRA 5P1DA 2VIYA 5P2KA 1ODYA 3ZPUA 4DPFA 3JVWA 1HTFA 2IENA 3SPKA 2FDPA 2G26A 4QGIA 3F9QA 4I0HA 3DJKA 4MC9A 3CIDA 5P2EA 5P5XA 3RSVA 3K1WA 4YD3A 5OYTA 1HOSA 3PM4A 1EPNE 5P01A 4ZSQA 5P2AA 5P23A 4LAPA 1HVSA 1XL2A 2AZ8A 3JVYA 1ZTZA 3LPIA 1FB7A 2QMFA 3OXWA 1KJ4A 3TOFA 1MUIA 5OZTA 1D4YA 1QRPE 5P26A 3OQ7A 4Q1XA 3BVAA 5P76A 2BBBA 3NU3A 4S1GA 1FQ8A 5OZDA 2G22A 5P18A 3GI5A 3BVBA 3QS1A 5KQXA 2ER6E 1EBZA 1AJVA 1GVXA 3ZOVA 4YDGA 2Q55A 2QI6A 2FS4A 2IDWA 2HS1A 3UHLA 5P4PA 1MIQA 2PSVA 4OBFA 4ZSPA 5P6OA 3NDUA 4JPCA 4CPSA 5P2DA 1HRNA 3PMUA 1QBTA 5AH6A 3T7PA 2FGUA 1HVIA 4TRYA 4YDFA 1FQ5A 4HEGA 4FRJA 2HC0A 3OQAA 5P4CA 4F76A 1W50A 4J1EA 4Y3XA 3EKQA 5AHCA 3ZKXA 5DQ5A 1BXQA 3INFA 5HDUA 5P5AA 3PSYA 4AUCA 4CKUA 3BUGA 5P5CA 3CICA 2BQVA 3NWXA 4FIVA 3UDQA 3IAWA 1FMBA 2QI5A 5P15A 5UPJA 1C6YA 1HPXA 1MT7A 2AOGA 3OWNA 2CEMA 5COOA 1LYAB 1CZIE 1HEGE 5P7IA 3SA5A 4WY6A 3KFNA 3HDKA 4H1EA 2FNTA 4DJUA 5P68A 1XE5A 2VJ6A 3GW5A 3VV7A 1FFIC 5P48A 1NSOA 3VLAA 4K4RA 4DQCA 3QP0A 2AOEA 2JE4A 4ZE6A 4MC1A 2F3FA 2AOIA 5P09A 1HVKA 2F8GA 1IVQA 5P08A 3BGCA 4KUPA 2QD7A 2ZGAA 4QJ2A 2G20A 5P6AA 3EL9A 2QMGA 2BPWA 3L58A 1NPWA 2IEOA 1UH9A 4I12A 2OHSA 5TOLA 1SDUA 1T3RA 4Y45A 1SMRA 3BRAA 3CYXA 1D4SA 5HCOA 2HPFA 5P3DA 4Y5EA 5P4BA 3OTSA 5P2MA 3UQXA 2P3AA 1IDBA 1K2CA 3UPJA 1YM2A 5P2NA 3MSLA 5OZ8A 1A94A 5P20A 5P6KA 5DR4A 4K4QA 5P0JA 5P2WA 1PPLE 5P4JA 1K6CA 5P6PA 2J9JA 3OU4A 5KOQA 2AOHA 4DV9A 4FRSA 1IZDA 1QS8A 4J0PA 4Y5CA 3L5EA 5P7XA 3KYRA 5P70A 2OHTA 2XFJA 1QBRA 4Z50A 5P0IA 4HZTA 3VSWA 2P3BA 4H3JA 4APRE 5P79A 3OK9A 3A2OA 4JP9A 5P5NA 3VLBA 1BV9A 3S7LA 3NDWA 4YCKA 5DR0A 3OQDA 5P38A 1G0VA 4LP9A 3PHVA 5CONA 1EPPE 4B1CA 1TCWA 4Y4JA 1ODXA 3VF7A 1W51A 2G24A 1HSHA 5P3LA 2OHNA 4XX4A 5P4DA 3PWRA 5P8NA 5P1BA 3O9DA 5HU1A 5P84A 1FGCC 2QZKA 5E5JA 5OYYA 1B11A 5P5HA 5OZLA 5P4AA 4NJTA 4Y3MA 2AQUA 3QN8A 4GJCA 5P3IA 2CENA 5P1XA 2O4SA 3LIZA 3S53A 5OZYA 3DM6A 3KFRA 1C6ZA 5P2HA 5P7YA 5P8QA 2OHPA 3OTYA 1W6HA 2CEJA 2B7ZA 1XL5A 5P3GA 3NYGA 1BILA 4DPIA 1IVPA 5P7ZA 5JODA 2VIJA 4FM8A 5P3CA 1K1UA 4L7HA 3PI5A 2Q64A 5P04A 3DOXA 4ACUA 1RL8A 4RYGA 4RCEA 5P2IA 5P77A 5FIVA 3WZ7A 5P1RA 1TSUA 1T6GA 1OD1A 3GGUA 3NU5A 2BB9A 5COKA 3UQUA 2AIDA 5PEPA 3SO9A 3SM1A 1CPIA 5DQCA 3EKYA 2RKGA 3PLLA 3R1GB 3FSMA 5OZNA 2P8HA 4GJ9A 5OZAA 4Y5NA 4N00A 3L38A 1OEWA 3S43A 2WECA 5P4RA 5BS4A 1MSNA 2ER9E 2RKFA 4EJLA 2V00A 1W5YA 2PH8A 5P6DA 3HAWA 3O9EA 1LYWB 1BIMA 1D4LA 5OYRA 1HWRA 3LITA 4DQHA 2XFIA 5IVTA 4B0QA 3KT2A 1KJHA 3O9IA 2VNMA 2ZYEA 3G70A 2HB4A 3PSGA 5P7MA 3FV3A 3EKTA 4X7IA 4RCFA 1B5FB 4RZ1A 1DMPA 3FNUA 3WZ8A 4CP7A 1MVPA 2Q5KA 5P5FA 2HB3A 4Y54A 3VV6A 4I8ZA 1XE6A 2OHRA 5EZZA 3LZUA 5P6FA 3CKRA 1B6LA 2O4KA 1HXBA 4MC2A 4Y51A 3RTHA 6APRE 1LF2A 4FAFA 5P34A 1META 5OZ5A 3CIBA 3ZKNA 4YD4A 1OHRA 3ZMGA 2VIEA 5P8GA 1MTRA 3EKWA 4K9HA 1HVCA 4Q1NA 3D20A 5P65A 3UQWA 1SDVA 5P4EA 1UH8A 1LS5A 5P0GA 4YE3A 5DR1A 4PHVA 2FDEA 1UPJA 2F81A 4Z22A 2AZCA 3NDTA 5OZOA 2IGXA 5COPA 1BV7A 1K6VA 5BRYA 3TKGA 2Q63A 5P8HA 3O9LA 4FL8A 5P50A 5P1OA 2AVQA 2RENA 5P7GA 3B80A 5P0DA 4Z4XA 5I3WA 1A8KA 2OF0A 4Y4BA 2OHQA 2ZJJA 4EP3A 5P0ZA 5P7LA 3CYWA 4F75A 1SIVA 4Q5MA 1ODWA 9HVPA 1K1TA 2IKUA 2ZHTA 4HE9A 3AIDA 2WF3A 3K4VA 4L7JA 4R93A 4LXKA 5P5KA 1G6LA 4DJVA 1JLDA 5P71A 3SKGA 2H6SA 4J54A 5P5TA 5P2FA 5CLMA 4EYRA 1YTIA 2PQZA 3SQFA 1DIFA 5P6QA 6FIVA 4OBZA 4DQGA 3QVCA 5P6JA 4R8YA 3LZVA 1HSIA 3HD8A 4OD9B 2R5QA 3KM4A 1F7AA 4LXAA 5I3XA 1IZIA 4Y4WA 2B8VA 1MRWA 4J1KA 4PZXA 1IIQA 5P4WA 1NPAA 2WF4A 5P2CA 3LIVA 3SKFA 4AZYA 5P66A 3K4VC 5OZ4A 2FGVA 1HTRB 3PVKA 3OAGA 5OZZA 5T4SA 4ZLSA 4LBTA 1PFZA 1EBKC 3KDDA 1XS7D 2NXDA 5P8EA 5P46A 5P5LA 5IVSA 4RVIA 4Y3EA 1RQ9A 1RV7A 5P56A 4PZWA 1GNOA 2QI0A 2BJUA 2P3CA 1MESA 3VFAA 2FNSA 5P73A 3R0WA 1VIJA 1PSNA 1J71A 3LPKA 5P0VA 5P0WA 4YD6A 5P44A 1G35A 5P3ZA 5P6NA 5HDZA 5P19A 5HE7A 2FMBA 2JJIA 4Y43A 3T7QA 4GJDA 4I8WA 4FSLA 3O99A 4EPJA 5P3KA 5OYXA 1GNMA 3NXNA 5SY3A 1MRXA 4GB2A 2PK6A 4RROA 4XX3A 3EL5A 5P2UA 2QK5A 4RGHA 4QJ8A 1KJ7A 5P0CA 5P3NA 4YOBA 3INHA 3UFLA 1K6TA 3MSKA 4OC6A 5P8IA 5HTZA 4GJ5A 4Y4XA 2AOJA 2QMPA 1MTBA 4DVFA 5P2XA 5P8TA 4CPRA 5P5BA 5P5VA 5P5ZA 5OZIA 4J17A 5P25A 1E81E 4APEA 4GJ6A 3S56A 1KJFA 4Y3PA 2A4FA 4Y3YA 5P61A 4K4PA 2OHLA 4OBGA 3CMSA 1T7JA 5OZQA 4ER1E 5P5DA 3KF0A 3SA4A 5P43A 1LZQA 3GGXA 3LZYA 2I4VA 2QP8A 2WF2A 1UH7A 3GGVA 2BPYA 3PB5A 4DQEA 3ER5E 5P1WA 5P1FA 5P7OA 4B00A 3WB4A 1SP5A 1LEEA 4I0JA 4DJXA 5P3JA 3QVIA 4Y3HA 1EBYA 2ZDZA 1EPLE 2O4LA 5P3EA 4FS4A 3WB5A 4D85A 4QJAA 2HB2A 2XYEA 4EQ0A 2BPXA 3ZKMA 1U8GA 5DPZA 5P6BA 2F3KA 3OUBA 4I11A 1DP5A 1TZSA 5P1YA 1EEDP 2O4NA 1DAZC 3APRE 5P10A 1AIDA 1BDRA 2Q54A 1PROA 3FNSA 5P5OA 2XYFA 5P83A 1Q9PA 4K8SA 3TPLA 4GZFA 3MXDA 4D89A 4ZPGA 5OZVA 2OHKA 1TW7A 3OGPA 2WEBA 2AODA 2FIVA 1XN3A 1HPSA 3QBHA 1C6XA 4FRKA 5P87A 4RLDA 2QNQA 1K6PA 5P2YA 5P52A 1E80E 3OOTA 5P17A 4H3FA 1YTJA 1KZKA 5P6TA 1XN2A 3BGBA 3OXVA 3DK1A 4KE0A 1MPPA 1APUE 2NR6A 3OQFA 5OZFA 5P1MA 4Y5MA 3ER3E 4OBHA 3LIXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TPR A;  3LPJ A;  3EBZ A;  4YD5 A;  5P2Z A;  4B77 A;  5P3Y A;  3TTP A;  3R2F A;  2BKS A;  2V13 A;  4DFG A;  4QJ6 A;  3R4B A;  5P0A A;  3UDN A;  4YCT A;  5P16 A;  3I25 A;  5KQY A;  3KMX A;  2ER7 E;  1BDL A;  5P7D A;  3KMY A;  3LIN A;  2V10 C;  4TRZ A;  5P6W A;  2FXD A;  2I4Q A;  5P0H A;  1D4H A;  3PGI A;  4B72 A;  3VG1 A;  5F01 A;  1B6J A;  3SAC A;  4FM6 A;  5P3M A;  3UDY A;  3PBD A;  5P45 A;  5P24 A;  5P59 A;  3ST5 A;  1OEX A;  2P83 A;  5P12 A;  2UXZ A;  1A30 A;  3HAU A;  2V0Z C;  3T7X A;  2F3E A;  4DH6 A;  3KN0 A;  2AVS A;  1HVR A;  3S43 B;  3WZ6 A;  2IKO A;  3EL1 A;  4J1C A;  1IDA A;  5DQ1 A;  3OU3 A;  5IVR A;  3PLD A;  2QI3 A;  4DJW A;  3C9X A;  2QAK A;  3URI A;  1HHP A;  2G94 A;  2WHH A;  4Y48 A;  5P0R A;  3VF5 A;  5P0Y A;  1FMU A;  2AVM A;  3VSX A;  5P0Q A;  1ZP8 A;  2NPH A;  5P5E A;  4PYV A;  5SY2 A;  5P1Z A;  4BFD A;  3UDJ A;  1T7K A;  3GGA A;  3L5F A;  3D3T A;  4R5N A;  1ZPK A;  4RCD A;  5OZU A;  2G1Y A;  3H0B A;  4FAE A;  3O9G A;  5P67 A;  4Y3G A;  5P11 A;  4J1H A;  5P0S A;  2R9B A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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