3WZ8A

Endothiapepsin in complex with gewald reaction-derived inhibitor (8)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Tracing binding modes in hit-to-lead optimization: chameleon-like poses of aspartic protease inhibitors
pubmed doi rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2014-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3wz8A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3wz8A01
3GGAA 2FLEA 1MIQA 5B18A 4WTUA 1DP5A 4Y3WA 2I0DA 2P83A 4Y5EA 3NU9A 5P4HA 3K5FA 1B5FB 5P0CA 5P5EA 5DR4A 3DV5A 3BUGA 5P3CA 4JP9A 5P6QA 5OZKA 3K4VC 5P7UA 4YBFA 4QJ6A 3OADA 3URJA 4COEA 3VF5A 5P4CA 1EPOE 1EC0A 4RVJA 4Q1YA 3JVYA 2QMDA 3HZCA 1T3RA 1A94A 3VLAA 3BHEA 3PSYA 3OHHA 4RCDA 1GNOA 1SDVA 3R0WA 1EBKC 1G2KA 2G20A 5COOA 1N49A 3SFCA 1EBYA 1T6GA 3KFSA 2FDPA 2HPFA 4YOAA 5P1VA 4QJAA 3INEA 3VCMA 1MT9A 4FLGA 4EQJA 2NMZA 1MT8A 5OZAA 2WF0A 2AZBA 2IS0A 5P8KA 3S7MA 5P3MA 3WZ8A 4DQBA 3Q4BA 2G22A 4K4QA 4Y4JA 5P29A 4K4RA 2AIDA 3PSGA 3SA9A 5P84A 4FM6A 2O4KA 5P0RA 4OBGA 5P7LA 4J0YA 2BPXA 5P2VA 3EKXA 5IS4A 5P31A 3ZLQA 3TOFA 4B70A 5DQ1A 5C9BA 5HDZA 5P8QA 2NMYA 5T4SA 3APRE 4Y3FA 5P67A 5P3WA 5P7IA 3GI5A 6UPJA 1M43A 5OYZA 1BXQA 3OQ7A 2ZJLA 5P2JA 2HS2A 3ZMGA 1LYWB 2QNPA 3KF0A 1B6KA 2V10C 4AZYA 1RQ9A 2AZCA 3NWXA 4WY1A 3LINA 1ZPKA 5P50A 5P13A 5P48A 3DJKA 3QI1A 5SY2A 4LC7A 3N4LA 1E80E 4ACUA 1PSAA 2HB3A 2QP8A 3FX5A 2R5QA 2ZJKA 3SACA 3ZL7A 5P3HA 1YTJA 5OZGA 2JYSA 2JE4A 1SGUA 4DFGA 5P5UA 2RENA 4Y5LA 5OZ3A 2IGYA 3BRAA 5P6PA 3OADB 2F8GA 1EAGA 4NJUA 5P79A 2PWRA 4FAFA 1FB7A 2ZHRA 5AHCA 3RU1A 5P60A 3PRSA 1TZSA 3Q6YA 5P61A 5P6AA 4Z4XA 3CKTA 5P03A 1HVCA 1HVLA 1FFFC 2QD8A 5P3SA 2QI0A 3CKPA 5P36A 5P1HA 2QD6A 5P6WA 2AOFA 3WZ7A 5OYYA 3EKYA 2HAHA 3Q3TA 2I4XA 3LNKA 5P8HA 5P17A 2IRZA 3SKGA 5P5SA 2FGUA 2NNKA 5OZWA 4DJUA 4Y3DA 5P69A 1Z1RA 5P0JA 3VSWA 1QBTA 2G1SA 3GI6A 5P4DA 4MC1A 2G27A 2Q63A 4YCKA 5P6XA 2AVVA 2H6TA 5I3VA 3NXNA 1QBRA 1TSQA 3QN8A 2PH8A 3C9XA 5OZRA 4JECA 1KJHA 2VIJA 4Y3TA 4GJAA 5AH9A 1EPPE 5P07A 1OD1A 5P32A 5P8GA 5P86A 1A8GA 4Y47A 2O4NA 3TPRA 4ZPFA 3B7VA 1EC3A 3FNTA 3FV3A 1U8GA 5ISJA 5P1QA 5P14A 3I25A 3ZPUA 1MTBA 4HLAA 3LIZA 4GJDA 2QI5A 3SM1A 4APEA 2VJ6A 2UPJA 3ECGA 5P7DA 2G1NA 1ODYA 5P3XA 5P5GA 1HIHA 5P23A 3NYGA 2BPWA 4F75A 4GJBA 1HVJA 4DQFA 3OU4B 5P72A 3CICA 1AZ5A 5P6UA 3VUCA 4J5JA 5OYWA 4Y44A 6APRE 5P4WA 2APRA 3PB5A 4EHCA 3RTMA 3OXWA 1BVGA 2I4VA 4F76A 4Q1XA 4ZSQA 4DPIA 5P1EA 3BC4A 4Y3EA 3O9EA 2Q3KA 3L5FA 4DQCA 3BXRA 1HWRA 4Y57A 3FNUA 1YG9A 3OGPA 3KFPA 5OZVA 4Y5BA 1KJ7A 3CYWA 3TOHA 5DQCA 5P4JA 1ZBGA 2V13A 1FLHA 3O99A 3EC0A 3SAAA 1W50A 2F3KA 4ZIPA 5P5KA 4J0PA 5P4VA 2QZKA 2G1YA 2BJUA 3KT5A 4J1HA 4L7GA 5OZMA 5P0AA 5ENMA 1E81E 5OZLA 5OZ5A 5P05A 5OZ1A 3PBDA 3WZ6A 2I4DA 2NTRA 3OUAA 1HVRA 4ZE6A 5P7KA 5P3BA 5F01A 1SGZA 2CEJA 1HRNA 2UXZA 5P1AA 3SQFA 3URLA 5P6GA 1ENTE 5P2QA 5P1PA 5HDVA 3EL0A 5P4BA 1DAZC 2VA6A 5P56A 4EYRA 4RYCA 3KDDA 4B72A 5P28A 4BELA 4I10A 1NPAA 3OXXA 2ZGAA 1EC2A 1ZP8A 5P26A 4AA8A 3IVIA 5P10A 3IN3A 2B8LA 4LXMA 1WBKA 4MC2A 3SABA 2QU3A 5P8IA 5P7VA 2BPYA 4A4QA 2OHQA 1OEWA 3TTPA 5OYSA 2R3TA 1CPIA 4LP9A 5P2YA 5P8UA 1K2CA 2WEZA 3PBZA 3UPJA 2ZJHA 3R1GB 4U7QA 3R2FA 1HEGE 5P4RA 5DGUA 4RVIA 1PPKE 2AVOA 5P53A 5P22A 5P4LA 2XFKA 5P0MA 4RRSA 3INDA 3EXOA 3KMXA 3SO9A 4IVTA 3EL9A 3LPKA 4TRWA 5P7CA 3NU4A 3KMYA 5OZJA 3S8IA 1F7AA 5P89A 3UDKA 1YTHA 4B1CA 5P7QA 1C6YA 5P1TA 5P7ZA 4GJCA 4J1FA 5P8RA 1Z8CA 5P83A 1AM5A 3ZKSA 4FRKA 1NPVA 4EJLA 5P54A 3MSJA 1HVIA 3QPJA 5P3NA 5I3WA 1KZKA 1HOSA 2PSGA 4RROA 5JFPA 2QNQA 3U7SA 3EKTA 1F34A 4NJSA 3PLDA 4Y4TA 4Y50A 5P27A 5P43A 2V11C 4PHVA 3IXOA 3BVAA 5P0LA 9HVPA 4CPUA 3VLBA 5P8LA 3CIDA 5P4UA 5OZPA 3KYRA 4FIVA 3GI4A 5P42A 2Q55A 5P1NA 5P1MA 5P77A 5P7TA 5OZZA 3ZPSA 1FGCC 2A4FA 2IEOA 1FKNA 3NWQA 5P0SA 5P2WA 5P6RA 5P2BA 5P0WA 2ER6E 2B60A 1D4IA 4DQGA 3NDXA 5P3QA 2I4QA 2NPHA 4ER2E 3UDYA 1G6LA 5P5DA 3KT2A 2VIEA 5HE4A 3EM3A 4ZSPA 4KUPA 3D91A 5P2RA 1ER8E 5P8MA 5P3EA 4J1KA 5P4QA 1SIPA 5HTZA 3NU6A 5OZIA 1GVTA 3L5EA 4HVPA 3TPJA 4Y35A 5P2HA 5OZ8A 5P2ZA 5P6EA 1TSUA 2R8NA 3QBFA 1XDHA 3VFAA 5P2EA 3BGBA 3A2OA 4ZEAA 5P1XA 3MWSA 4Y3YA 3VF7A 3QAAA 1ODXA 5P4TA 5P11A 3UDPA 2Q5KA 4Z50A 5P08A 1SH9A 6FIVA 5P6DA 1D4YA 3OQFA 3UDMA 5OZXA 5P5OA 3CKRA 5P2UA 3TL9A 3N3IA 2VA7A 1NPWA 1YTIA 1IBQA 1A30A 3TPPA 1LYWA 1YTGA 5C9FA 1TCWA 5OZFA 1FQ5A 3L5BA 5OZNA 5P4MA 1HTRB 5P20A 5P6TA 3VG1A 3OTSA 1BV9A 1EPNE 1SBGA 4GYEA 4R93A 3LZYA 3D3TA 4PYVA 2BKTA 3EKWA 2R43A 2ZYEA 1PROA 3SA8A 1TW7A 5P5XA 3RTNA 5KQYA 1APVE 1W6HA 5P73A 3VYDA 3QRMA 4H3JA 4Q1WA 5P6SA 3MXEA 5IVQA 3INHA 2O40A 3EKPA 5P55A 3O9IA 3JW2A 1BVEA 5P8DA 5TOLA 3D1XA 3NU5A 4YD4A 1GVWA 5P3UA 5P09A 1HPXA 2VJ7A 5P15A 5P5HA 5P2AA 5DR1A 1BV7A 3PEPA 3BUHA 5P62A 4J55A 1A8KA 1HVKA 5P6IA 5P45A 5P1UA 5OZ2A 4I0GA 2O4SA 4FGXA 3EKQA 3NDWA 4OBDA 1G35A 2QCIA 2PQZA 5KAOA 2PK5A 4YBIA 5AGZA 4H3GA 3IA9A 2Q54A 3OWNA 5OYXA 3LIYA 4HDPA 5ER1E 2QI3A 3D1ZA 4X7IA 1MSMA 1K1UA 4I8WA 3U6AA 5P7AA 5P7JA 4RLDA 3EL1A 3G6ZA 1FQ7A 5P3YA 5P7XA 2QMGA 1HXWA 4RVXA 4FS4A 4KB9A 2V16C 2NXMA 2ER9E 2G21A 1META 1WKRA 4TVGA 2QZLA 3IAWA 5P82A 2VIZA 1HTEA 4Y3JA 3D20A 4F73A 2Q64A 1EPME 3OU4A 2WEAA 4Y3NA 3DCKA 1MTRA 2Z54A 4H3FA 5OZEA 2I4WA 1B6LA 4KE0A 2IENA 3UDJA 4JPCA 5OZDA 5P2KA 5P6VA 2B8VA 4DI2A 2FS4A 3DV1A 4Y39A 4I0ZA 2AODA 1ODWA 5P7SA 5HD0A 3UF3A 7HVPA 5OZUA 2QZXA 4YCYA 3UFLA 4DJVA 1BWBA 4Y3GA 2VJ9A 4Y41A 4L1AB 2P3BB 5P70A 1C6ZA 4BFBA 5P2LA 5JG1A 3O9CA 2WHHA 4EQ0A 1ZSRA 5F00A 5FIVA 5P0OA 1HBVA 2ZHUA 2VKMA 4FSEA 4OBKA 1TCXA 3UCBA 1W5VA 2G94A 3QVIA 2PSVA 3O9FA 5DR0A 2HC0A 1EPLE 4CPQA 2O4PA 5OYQA 5I3YA 2JXRA 3OOZA 1FF0C 5P5RA 4I1CA 2UY0A 5P2MA 4R8YA 3IN4A 3KM4A 2OF0A 1KJ4A 4L6BA 5P5QA 2QI4A 1W5XA 2ZHVA 1D4KA 5OZ0A 5OZHA 2P8HA 1SP5A 3NUJA 5P2SA 2ZJJA 4EXHA 1T7KA 3BGCA 3OUDA 5P40A 2PH6A 3AUPA 1KJFA 4PZXA 4H1EA 1EEDP 4HA5A 5DGWA 4HE9A 1AIDA 3EMYA 1KJGA 1DMPA 2FNTA 5P3FA 5P0DA 4GJ6A 1QBSA 4GJ7A 4Y4DA 4AA9A 5P3DA 3KFRA 5P7PA 3VV6A 2XYEA 3MSLA 3I7EA 2J9JA 3JVWA 5DQ2A 3HVPA 5P7BA 4FE6A 4Y6MA 5P19A 3TNEA 3T7PA 1D4SA 1B6MA 3HAWA 1CZIE 1MRXA 5KOSA 1HVSA 4L7JA 3I8WA 3EKVA 1K6VA 3OAGA 1YX9A 4Y48A 4EJKA 1ZPAA 5P59A 4KE1A 2IKUA 5HVPA 5P30A 1BDRA 4K9HA 2ASIA 2IL2A 4Y4GA 5OYTA 4Q1NA 5P7RA 1DIFA 3PCZA 3INFA 4EJ8A 4I0DA 4Y3SA 2ZDZA 2ER7E 1UPJA 5DQ4A 4LBTA 5P6CA 4H3IA 2G69A 2HB2A 3HBOA 4FL8A 3OOTA 2QAKA 5AH6A 4Y43A 1LYAA 5P52A 1FMXA 2OHUA 2AZ8A 1T7IA 3OXCA 3T7QA 3LPJA 5P0BA 5P02A 4FAEA 1TQFA 3LPIA 4R5NA 4CPXA 3OY4A 5P8AA 4RRNA 1DPJA 4I0IA 5P4NA 3SA4A 3ZKGA 2HB4A 5IVSA 1MESA 3NLSA 4RCEA 5DQ5A 5DR8A 5P51A 3Q70A 2FMBA 4B1DA 5EZZA 4QJ7A 1SMRA 1EC1A 5HDXA 3RSVA 5P5CA 2FGVA 1SMEA 4CPTA 5P85A 2I4UA 5P0EA 3PJ6A 4Y5NA 2HM1A 2P4JA 3QBHA 4JPEA 2FXEA 3SA7A 1BBSA 5P4OA 3VF3A 5P0KA 5P04A 5P6BA 3S43B 4D88A 2WF4A 5OZ7A 3PGIA 5AHAA 4Y5GA 4IVSA 3VSXA 5AH8A 3OUDB 4AUCA 2QI6A 3T11A 4B78A 3NR6A 5P57A 1BWAA 3IXKA 3O9GA 4I12A 4DJPA 3O9BA 4Y54A 1AXAA 5P5LA 4OBJA 4NJTA 2J9JB 5P5PA 4D85A 3UQXA 5P7HA 1BIMA 2AVSA 5P71A 4Y3PA 2G1OA 3UDRA 3LZSA 5P74A 5P4GA 5COKA 2V0ZC 2QMPA 2ZJMA 3PM4A 4TRYA 4YCTA 2QI7A 5P2TA 1AAQA 5P1ZA 4B1EA 5P8SA 1LEEA 3OAGB 1AVFA 1BDQA 1GKTA 4Y4WA 5J25A 5DR7A 5P49A 4B77A 3RTHA 1ZTZA 1HTGA 1QBUA 5P68A 4D89A 1MRWA 4DH6A 1YM2A 3DUYA 2V00A 3R0YA 3UDNA 5UPJA 4R95A 5P3AA 3ER5E 4CMSA 5P3JA 5OYUA 3KDBA 1K6PA 3O9LB 3UFNA 1LYAB 3LZVA 3OQKA 4DJYA 4LXKA 3F9QA 4PZWA 5KR0A 5P33A 1AJVA 2XFIA 5OZYA 2ER0E 5P4YA 1OEXA 3PMUA 5P8PA 1APUE 3WB4A 4BEKA 2ZE1A 5P1FA 4NJVA 3S2OA 3OGQA 5P8BA 5P44A 4YD7A 4HEGA 4ACXA 4Y3HA 5SXNA 1D4JA 2R5PA 3WB5A 1UH7A 4GMIA 5P1IA 5HU1A 3PCWA 1HPOA 5P5VA 2IGXA 3OXVA 1K2BA 1QDMA 5P3OA 3SA5A 3EM6A 2QZWA 2R9BA 2HIZA 7UPJA 1XE6A 3EL4A 1G0VA 5ISKA 3K5GA 2PWCA 4LXAA 4OC6A 3PWMA 3NDUA 4ZSMA 3ZOVA 1B11A 5P7EA 4Y3RA 3FKTA 1B6PA 3ZKNA 2FIVA 5P8OA 1PPME 4EXGA 1VIJA 3KDCA 3TKWA 3ER3E 4Y4ZA 5OYVA 4B00A 5P01A 5P6YA 1HVHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GGA A;  2FLE A;  1MIQ A;  5B18 A;  4WTU A;  1DP5 A;  4Y3W A;  2I0D A;  2P83 A;  4Y5E A;  3NU9 A;  5P4H A;  3K5F A;  1B5F B;  5P0C A;  5P5E A;  5DR4 A;  3DV5 A;  3BUG A;  5P3C A;  4JP9 A;  5P6Q A;  5OZK A;  3K4V C;  5P7U A;  4YBF A;  4QJ6 A;  3OAD A;  3URJ A;  4COE A;  3VF5 A;  5P4C A;  1EPO E;  1EC0 A;  4RVJ A;  4Q1Y A;  3JVY A;  2QMD A;  3HZC A;  1T3R A;  1A94 A;  3VLA A;  3BHE A;  3PSY A;  3OHH A;  4RCD A;  1GNO A;  1SDV A;  3R0W A;  1EBK C;  1G2K A;  2G20 A;  5COO A;  1N49 A;  3SFC A;  1EBY A;  1T6G A;  3KFS A;  2FDP A;  2HPF A;  4YOA A;  5P1V A;  4QJA A;  3INE A;  3VCM A;  1MT9 A;  4FLG A;  4EQJ A;  2NMZ A;  1MT8 A;  5OZA A;  2WF0 A;  2AZB A;  2IS0 A;  5P8K A;  3S7M A;  5P3M A;  3WZ8 A;  4DQB A;  3Q4B A;  2G22 A;  4K4Q A;  4Y4J A;  5P29 A;  4K4R A;  2AID A;  3PSG A;  3SA9 A;  5P84 A;  4FM6 A;  2O4K A;  5P0R A;  4OBG A;  5P7L A;  4J0Y A;  2BPX A;  5P2V A;  3EKX A;  5IS4 A;  5P31 A;  3ZLQ A;  3TOF A;  4B70 A;  5DQ1 A;  5C9B A;  5HDZ A;  5P8Q A;  2NMY A;  5T4S A;  3APR E;  4Y3F A;  5P67 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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