3ZLPA

Crystal structure of schistosoma mansoni peroxiredoxin 1 c48p mutant form with four decamers in the asymmetric unit
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVPPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Switching between the Alternative Structures and Functions of a 2-Cys Peroxiredoxin, by Site-Directed Mutagenesis
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 29
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, V, W, X, Y, Z, a, b, c, d, e, f, g, h, i, j, k, l, m, n
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zlpA00
3ZIJA 2R3XA 2ES7A 2O85A 2YZUA 1QMVA 3APOA 4NXIA 1K0OA 4JBBA 2JZTA 2D2ZA 1CQGA 4I2UA 2VD1A 2H1GA 2IPAA 1B48A 2GDRA 3UJ1A 2IMKA 4KSOA 1YKAA 3FRCA 1GNEA 2N5AA 2H1DA 5KN1A 2YWOA 3VPQA 2HSYA 3F6FA 2C0FA 2M46A 2CZ3A 1AAZA 5J9BA 1XVWA 1EV4A 1SU9A 5IMCA 3CMIA 6GSXA 1BEDA 2IJYA 1GSUA 4PUFC 1DSBA 5G31A 4MJAA 2FWEA 1GSFA 4KNDA 5B6NA 1F9MA 5L71A 2H76A 3RPPA 5CO3A 4CHSA 3E0UA 2H71A 2Z9SA 1XWGA 1F37A 1XW6A 4G2EA 5IPGA 1THOA 2HXKA 2RUFA 1F3AA 3GHAA 3TKSE 5HR3A 5EY6A 4K8MA 1AQWA 2CAIA 4L5LA 1T3BA 1O8XA 1U88A 1TI3A 2MMAA 2PU9C 3D6IA 4IS0A 4O32A 3KTBA 4X0XA 3F63A 3UIWA 4ZL7A 3IR4A 3LJRA 5IOWA 2VIMA 5F07A 3N9JA 4KAEA 5DVBA 2CV4A 5EVOA 4L5OA 1K0AA 2H0IA 4EE0A 1SD8A 2LKUA 5DQSA 3VI5A 3HJMA 3FR6A 2X8HA 1S3DA 4BVYA 5IMFA 5J9CA 1FB0A 5ECIB 1Q4JA 2B7KA 1HQOA 4WR5A 1IYHA 2YANA 3E3EA 2G2QA 5FWGA 3VWVA 2O7KA 1BQ7A 1SKRB 1YKCA 3ZTLA 3HHVA 3RHCA 3H93A 1JHBA 2H30A 1DE1A 2H6YA 3TKRA 1EP8A 1BX9A 4I5QA 1OC8A 1GRXA 4PQ1A 4WF4A 3FK8A 2FCHA 1MD4A 4YQUA 2B1LA 4ZBDA 1TW9A 5F06A 5ABRA 4HOJA 1SJZA 3EC3A 3HDCA 2FNOA 4V1Ap 3FKFA 1T7PB 18GSA 3CRUA 4IBPA 2BTOT 4K6XA 4EKZA 3IOSA 2QGVA 3C8EA 1LU4A 4I6XA 4TVEA 2IN3A 2R5GA 3CTGA 1ON4A 3IV4A 3PGTA 3Q74A 2H72A 1R5PA 1CQHA 1HD2A 2YOIA 4PNGA 4JEDA 3LG6A 5ECLB 2FGXA 3IE3A 2OE3A 2L4QA 3VURA 5A5KA 4ZILA 3TRXA 5IM9A 16GSA 2GQLA 3L9UA 2I3YA 5EL8A 3ZMLA 2P31A 1XBSA 4K1FA 1O6JA 2B3SA 1SK1A 3D22A 1SJIA 2MMOA 1WWJA 2YPMA 4TR0A 1Y25A 4D73A 4NPBA 3D4TA 4XHMA 4YH2A 2DIZA 1XOAA 5JWRB 2WCIA 2WFCA 2C0EA 4ECJA 4K9ZA 2JADA 4TRXA 2PGTA 4OCEA 2VOCA 1YEXA 1TP9A 4EC0A 3KMOA 1U3IA 4XS1A 2L6DA 1FB6A 1ZZYA 1ZYQB 2GLRA 3EE2A 4QQ7A 1I9DA 3TKQA 1FHEA 1QQ2A 2REMA 3VWXA 2MYGA 3VWWA 1ACVA 4TR4A 1FVJA 5ECKB 4BPYA 2F9SA 10GSA 3HA9A 3H4KA 3D21A 1TRSA 3FW2A 2O8VB 1AW9A 5E59A 3QPMA 1THXA 3L9SA 2OJLA 1BG5A 2I4AA 5KN0A 2L6CA 1S3AA 1AUCA 1TTZA 1EV9A 3TKSC 1A2JA 2OACA 2B5XA 4OWYA 1ERVA 4V2NA 1PA3A 3AY8A 4D73B 2LS5A 3WGEA 1TOFA 2X64A 2LJRA 5J41A 2C4JA 4EL1A 1OE7A 3QD9A 4AJ6A 3ZRDA 3UMAA 3ZITA 3ZFBA 5A4VA 5A4UA 1UN2A 1YEPA 4HDEA 2LJKA 3L9VA 1EP7A 4HQZA 1NSWA 4O92A 1EZKA 1K0BA 5AISA 4YQMA 1GP1A 2DMLA 3V1WA 1GSDA 3FR9A 4OO4A 3TCOA 2MMNA 2GQKA 5EPFA 2DJJA 1OKTA 1KTEA 3L4NA 2CVBA 3EYTA 1QXHA 3I69A 2P5RA 3P90A 3GH6A 4Q5QA 2EIOA 4NV2A 2IWTA 1XCCA 5B8AA 5HR1A 4MZBA 19GSA 2V2GA 4QL7A 1WP0A 1GUKA 1X5EA 1PKWA 3KMNA 2GS3A 1X5CA 1K3YA 5CP1A 2DSAA 3IK9A 2WULA 2LSTA 4HU9A 1G7OA 4L8EA 3Q6OA 3F4SA 5HFIA 3JCML 3ZYWA 1VF2A 1F3BA 5B7CA 1V9WA 5INYA 2X8CA 2JSZA 4K0NA 3SWLA 2DJKA 1R7HA 2WB9A 2YV7A 4P3YB 3HVSA 2L5LA 1GH2A 3IPZA 4V2MA 1O8WA 3HVXA 5CNWA 3GSTA 3IRAA 2LRTA 3HJOA 1JZWA 3F8UA 4FH8A 2DJ0A 4KCAA 1M9BA 1Z7RA 1G6YA 2P0GA 2H19A 3G9BA 2LJAA 3GRXA 4MK3A 3HJPA 4AGSA 5ID2B 2DJ1A 2VCXA 4ECBA 1BAYA 4N30A 3UARA 4OFNA 4GXZA 1FW1A 3LORA 5CYYA 1T4YA 2LRNA 2XC2A 3TJKA 3MAKA 3ED3A 4ZB9A 1SL2B 1XWKA 2LV3A 2H0GA 1WRYA 1VF1A 1PMTA 2LTKA 5HFGA 4L0UA 1SKSB 1GUMA 4RUVA 4MABA 2JU5A 3M9JA 2HRNA 4MA9A 4ZIJA 3TOUA 3F3RA 1GNWA 4LLRA 3ERWA 5G2ZA 2NDOA 4GTUA 3ZREA 1E6BA 4RI7A 2YP6A 4N10A 2IMEA 4IVFA 2C80A 2AB6A 4POBA 3CSJA 5AN1A 4DSSA 3TRQA 2V41A 1O73A 2E2MA 1YF1A 4MLYA 5KN2A 2VCQA 3LEFA 2LQQA 3TGZA 4I2TA 5B6MA 1MTCA 1OAZA 5AGYA 1YQ1A 4F2IA 5CRWA 1GLQA 2XHFA 1HYUA 2JL4A 2OKAA 4KDYA 3HXSA 2OBKA 3QAWA 2FUG2 1M0UA 3I9V2 2H66A 5ECNB 4MPGA 5LCZA 4MF5A 6GSSA 4LL4B 3RHBA 3GKMA 3TRPA 4WKWA 2WGRA 1XVQA 4TKYA 3GIXA 1GTBA 1TDIA 4WXTA 3QAGA 3DD3A 2XBQA 3UVHA 1XW9A 1JLVA 1V2AA 2VL9A 3FY7A 3R2QA 1PGTA 1USBA 2F8AA 2EC4A 1FO5A 2K8VA 1PRXA 5ECPB 3UEMA 3KGKA 1T00A 1WMJA 12GSA 1AIUA 1JZOA 3GKNA 1G0TA 2VCVA 3GV1A 4F9ZA 4FYCA 4DSSB 1EGRA 4FYUA 1TRVA 2B6MA 2M80A 1F2EA 5KEJA 3A3TA 1QGVA 4LMWA 1FOVA 1EEMA 5DCHA 4ZB8A 4OD7A 2XPDA 1MDJA 1SK2A 1GSYA 1NW2A 6GSYA 3A2WA 1PQNA 5F8BA 4HU7A 3W8JA 5G5EA 2A2RA 4IQAA 1W4VA 1PN9A 3O76A 4KA0A 1MD3A 2YJHA 1NHYA 1A0FA 3GFKA 4ECIA 3BCKA 5IMVA 1RK4A 2VAFA 4PGTA 2TRCP 3M9KA 5IOXA 1YJ6A 4DSRA 4QL9A 5HR2A 5IQYA 2FA4A 4BA7A 17GSA 3HVVA 3G7YA 5GSSA 4TN8A 4F0BA 2CZ2A 4HUAA 3QDNA 4O7HA 9GSSA 4XIHA 3J7Yb 5A4WA 1T4ZA 2CQ9A 5GZZB 4POMA 2E7PA 4H86A 4I8BA 4EF0A 1U3AA 5CREA 1M2BA 2IMFA 3LFLA 2K8SA 4ZL8A 4MH3A 5IO0A 4PUAA 4ACSA 2R37A 4ML6A 5GAPD 2QKEA 2GSTA 4OFMA 4WBRD 3M3MA 1LJRA 6GSUA 4FO5A 3M0FA 3EVIA 2YNXA 2VCTA 4Z7XA 1U6TA 4PQIA 1BYEA 3L78A 1K3LA 2ON5A 4IN0A 2JACA 5DBQA 3UBLA 3EMPA 1GULA 1YY7A 3W8SA 4LL1B 2PPTA 3Q18A 1LBKA 3VLNA 3ISOA 2K9FA 3EMXA 4PXOA 3GX0A 2L59A 5FT3A 3KCMA 4KGIA 2V1MA 3GSSA 3EINA 3ZFLA 2H01A 2GVPA 4GSSA 4TXVA 2C3TA 2IL3A 2H75A 3O3TA 4G19A 2PUKC 1K0NA 3C73A 4TW5A 2CT6A 4JRRA 3GN3A 2GZZA 2QSIA 4XCSA 3RPNA 4N0VA 1SYXA 4HS1A 3RAZA 20GSA 4KCEA 3GKKA 1M2DA 14GSA 1B4PA 3CTFA 3H8QA 3TB2A 2XPEA 3DVXA 2H0HA 2H6XA 1U87A 3L0HA 2HYXA 2GT5A 2J23A 5ECSA 2DMMA 4OO5A 3GNJA 5FHIA 3A2XA 4YAVA 3EURA 1G6WA 4YQVA 3WYWA 2ZUPA 1X9MB 2PVQA 3W6GA 4AJ8A 4ZBBA 3APSA 3QFAC 1M2AA 5H5RA 3FR3A 3UOMA 1NHOA 4MZWA 11GSA 4POLA 2R4VA 1UC7A 2HZEA 3D5JA 3CSIA 1MDIA 5ECQB 5IPHA 2K6VA 2BJXA 4KE3A 4PQHA 4LMVA 3O6TA 1MDKA 3HCZA 1TRUA 3GYKA 3DWVA 4OMVA 2PMTA 5IO2A 4V2LA 3A2VA 2RLIA 3ME7A 3EU4A 5D93A 5CAXA 2KP1A 4MJBA 2YWNA 1OE8A 3ZL5A 3C1SA 1KNGA 3KTLA 3IK7A 3U5RE 3HY2A 3TOTA 2L57A 2FHEA 3GUSA 4IP1A 2FLSA 3TDGA 1W89A 4CW9A 2VL2A 2VLTA 2EIRA 4JR6A 2NPBA 4GWRA 2OADA 2H70A 2YJ7A 1SL0B 4J57E 1A23A 1B8XA 1WJKA 4XRDA 2E0QA 3LSZA 1H4OA 2JZSA 3P7XA 5IIZA 4K2DA 2HZEB 3HYPA 5D9XA 4RQXA 5ID2A 3BBYA 3LYKA 3GX8A 4MH2A 3RBTA 4XRAA 2HNLA 3PH9A 4DSQA 3BOAA 2OE0A 1A8LA 3IHQA 4PURA 5ECMB 4V1Ag 1PKZA 4X43A 3IBHA 4ZXGA 2DJ3A 3Q19A 5JCWA 4IJIA 4MF6A 5ECOB 3WGXA 4TOPA 4GSNA 2DJ2A 2LEGA 4KW6A 2O87A 1TRWA 1OYJA 1ZL9A 2VCZA 3I43A 4NHWA 4NV5A 3P2AA 1WPIA 5ELAA 4XS6A 2TIRA 2VD0A 2RM5A 3KD0A 2O89A 1V40A 4L0WA 3DXBA 5DJMA 3CBUA 4WETA 2TRXA 3KIJA 1C72A 3MNGA 1EOGA 2AHEA 2KLXA 4KDXA 3D0ZA 3F4TA 4MJEA 4HJMA 4ILFA 2WJUA 1XIYA 2WDUA 3QAVA 1T8EB 1F6MC 5AIVA 3F3QA 3DGQA 5C00A 5HR0A 4IGJA 5D73A 5DJLA 5ELGA 1SKWB 3NOFA 2IIYA 2GSSA 5DCGA 3IDVA 5DALA 3WT2A 4NWYA 3KH9A 2KOKA 2R6KA 3A5WA 3TJGA 2DIYA 1GSQA 4PX1A 2L5OA 2MBTA 1Z6NA 1XWAA 5G1KA 3CYNA 1HNAA 2I9HA 2FWHA 4HEA2 1TKDB 2E2GA 3FZ4A 5D8IA 2P5QA 1GSEA 1XZOA 3HZ8A 3FZ9A 3P8WA 1BJXA 3DEXA 2GSQA 3IC4A 4TR1A 2PVOC 4OCFA 3ERFA 1ILOA 3TUEA 2GTUA 2VL3A 1AQVA 2X99A 1ZGNA 1AXDA 2I81A 5JCGA 1VF3A 1EOHA 3I6AA 5H5SA 4ECCA 1HNCA 3UBKA 5DAKA 3J7Yk 4YAPA 1FG4A 1GTAA 5LD0A 4G10A 1N8JA 3KP9A 5DALB 4K7NA 1ZOFA 2K18A 2MMZA 1M99A 1TU8A 4MZCA 2PN8A 3VK9A 4OFTA 1T1VA 1X5DA 4BVXA 22GSA 2AJQB 1TXXA 4GQCA 1QFNA 2XBIA 3MDKA 5IMAA 2YWIA 4MMMA 5ENUA 2FD3A 4ML1A 2H8LA 1VRSD 3KH7A 3C1RA 4EVMA 5KN3A 4HJ2A 1VGLA 3HKRA 1TK0B 1V98A 3C7MA 1A2LA 1GUHA 4TR1B 3VI7A 3GTUB 3US3A 1TI1A 3M1GA 3QFBC 1J9BA 4J2FA 3FEUA 3G7IA 1HNBA 2VLUA 1B4QA 3KEBA 1MEKA 1OC9A 4I97A 4PNFA 3IAM2 1ZCPA 2C0DA 5DAKB 1QK8A 2HZFA 4JR4A 2NTOA 3ZZXA 5G5FA 1A0RP 5C04A 2VUPA 1PL1A 2F8FA 3QR6A 1V58A 1H75A 2ZCTA 3RDWA 4BWSA 3DRNA 5JWOB 5IMDA 2FA8A 2C3NA 3WD6A 1ML6A 3KP8A 2DC5A 3BJ5A 2F51A 4IELA 2N5BA 3LQ7A 1NM3A 1GSSA 1S3CA 4NHZA 2PWJA 1WE0A 3M8NA 3KZQA 2HFDA 1GWCA 4F03A 4MP4A 3DMLA 4E8HA 1R4WA 1XXUA 1KEBA 4N11A 1XFLA 2DLXA 2WRTA 1Z3EA 3QOUA 1I5GA 2F3MA 4POKA 5B8BA 3GH9A 5D96A 1OC9B 2LNTA 2A4VA 4GLTA 1TK8B 2HRFA 5COHA 4ZB6A 2YCDA 7GSSA 1GL8A 1Z7PA 3CSHA 2C0GA 1E2YA 5J5NA 1PSQA 2GZYA 3LGCA 1VF4A 2AUVA 2B1KA 3UVTA 1YDKA 2BMXA 3QCPA 2YZHA 3EWLA 4XS4A 1X9WB 1YZXA 2NBSA 3APQA 3MSZA 3MWHA 2A2SA 1JLWA 1M7TA 6GSVA 4IQ1A 2X8GA 1TU7A 1A2MA 2HI7A 3GL5A 1SL1B 2LUSA 4Q5NA 2M72A 4HZ2A 1XPVA 2VL2C 4G9HA 3LYPA 4K0GA 1UVZA 4JZQA 3OR5A 1WOUA 2LQOA 3NZNA 1Z5YE 4IP6A 2CVKA 3IAS2 1OKDA 3ZMKA 2GT6A 1XWCA 4GQFA 3DIEA 2VCWA 3KXOA 2VO4A 2V32A 5DQYA 5HQPA 1JFUA 2EIQA 5HFKA 2AV4A 2AYTA 4TXOA 3D4MA 4F82A 2AAWA 4GCIA 5ECRB 2JZRA 5ECHB 1X9SB 2H73A 1B9XC 3FHKA 3H1NA 5F05A 5JCUA 2I1UA 3TJJA 4XS4B 1TK5B 4O5RA 2HSHA 2L4CA 4K7IA 1B9YC 3HD5A 2GGTA 5AIXA 4GRFA 4HI7A 1SD9A 4WEYA 5JWQB 1ZMAA 2J9HA 4EDYA 2RM6A 3ZLPA 4WF5A 2WS2A 1A24A 1ST9A 4HZ4A 1K0DA 5G30A 4NAXA 4JU5A 2JSYA 3BD2A 1J08A 4FIWA 2MZCA 4IJ3A 2CAQA 2OA7A 1K0MA 3QMXA 1FAAA 2B5YA 2VM2A 3N5OA 2NVLA 4TXOB 3KJYA 3CXGA 3ERGA 1OVNA 2N5FA 1DE2A 4J56E 1G7EA 5IMZA 2RIIA 3LWAA 5J4UA 2HE3A 1JZRA 1SJ6A 1XW5A 4ISDA 1YF0A 2ON7A 2IMDA 5LNKe 3G7JA 1J0FA 3U6VA 3UL3A 2HT9A 2IFQA 1M9AA 4HQSA 1QUWA 5DDLA 1SENA 3TJFA 4WBJA 4AJ7A 2C8UA 2KUCA 3GA4A 1SYRA 1GTUA 3DYRA 3VFIA 4KX4A 5G1LA 2C1YA 3F9UA 2IMIA 5CRGA 4GSTA 3S9FA 1N2AA 4JE1A 1URMA 1TJDA 4XTSA 1ERTA 1EWXA 3FZAA 1DBYA 1R5AA 3EU3A 3WT1A 4RI6A 3FZ5A 4KB3A 1EGOA 4AF2A 2GSRA 4BL7A 1Z9HA 3LXZA 1K0CA 2LRCA 3ZVJD 6GSWA 5D9WA 4FYBA 2ALBA 5F0GA 2G0FA 2PBJA 1XWBA 1V57A 1ZYEA 4KH7A 3WGDA 4X1UA 2CVDA 1UA5A 2IFQB 4BWQA 1FVKA 1PD21 4ID0A 4N0ZA 4IKHA 1K3OA 5J3RA 4MCUA 1ERWA 1XOBA 3LXTA 4F0CA 1RW1A 3KM6A 3PINA 4EO3A 2CA8A 4RQRA 2KHPA 2CX4A 2H74A 1SK0A 4MDCA 2RUEA 1PL2A 1PX6A 3E9JB 3GMFA 1IYIA 4NMUA 2HLSA 2CX3A 4EUYA 3TJBA 5D9TA 5E4WA 4KUNA 3NIVA 2PERA 2FWGA 4IW9A 5GAND 2FWFA 3F6DA 1AC1A 3TKSA 3FYGA 3IA1A 3UAPA 2B7JA 3HZ4A 3F4RA 3PR8A 3ME8A 2WZ9A 3GURA 1O7UA 2VLVA 4GF0A 4TR3A 4ZL9A 4DVCA 2YN1A 1O81A 2KP2A 3ZIVA 4DEJA 2YV9A 1A8YA 3H79A 6GSTA 5H5QA 1AQXA 1GTIA 4Q5FA 5GSTA 3C71A 2LNSA 4CDOA 2H1BA 2H1AA 2ZNMA 3VPTA 1OC3A 4IHUA 2GQMA 2GZPA 4EXJA 1Z6MA 1KBNA 3DVWA 13GSA 3GTUA 5D9VA 3F0IA 4MPFA 4WR4A 4MJCA 4KDUA 1PX7A 1JZDA 3K8NA 2H6ZA 2QC7A 1Q98A 3SBCA 1Y6EA 4EDZA 2MBSA 4ULXA 4MF7A 2OBIA 3DKSA 3IXRA 2YWMA 2VM1A 4K7OA 2R2JA 1DUGA 3BCIA 3CRTA 4LA1A 1ERUA 3VWUA 1ABAA 2C3QA 2FY6A 1X0RA 4KSMA 3ZVJA 4Q5RA 1R26A 1O85A 2V6OA 5CRHA 1GLPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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