3ZREA

Reduced thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia pseudotuberculosis
total genus 44
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zreA00
11GSA 2H0IA 2E0QA 3G7YA 5H5SA 3PINA 5B7CA 1U87A 1PRXA 1UA5A 1K3LA 1KTEA 4HU7A 1MTCA 4OFMA 1OE7A 1WJKA 3VWWA 1M99A 2FLSA 4MK3A 5G1KA 2BJXA 1XW5A 3VWVA 1DSBA 4G2EA 5ECRB 4EF0A 3ZZXA 1V2AA 2TRCP 2H72A 5AIXA 4PQIA 1O6JA 1U6TA 1X9WB 3RPNA 2PERA 2GZPA 4DEJA 4V2NA 3GL3A 2B3SA 4X1UA 4O7HA 2AB6A 2C3QA 2K8SA 2CX3A 5IO2A 5DQYA 2FA8A 4EDZA 1T4ZA 2LRTA 4G19A 1EP7A 4K6XA 1O73A 1EWXA 5L71A 2RUEA 3EMPA 4XHMA 5ECQB 1ZOFA 2IFQB 2L5OA 3L9UA 4V2MA 4YQMA 2RM5A 4HZ2A 2HLSA 3GFKA 4L5LA 1TU7A 4ZIJA 4H86A 5H5RA 4D73A 2R4VA 3KTLA 4JU5A 4ECIA 1HNCA 4IJ3A 2H6XA 3HYPA 5ELAA 1EGOA 1SJIA 3F6DA 4BWSA 2BMXA 3QOUA 3J7Yb 2H0HA 3TJBA 1H75A 4LA1A 1X5DA 3PGTA 1AW9A 1O7UA 1ML6A 1URMA 4GCIA 4Z7XA 3F9UA 3I9V2 2VUPA 4GTUA 5HR2A 1XBSA 3F0IA 4HJ2A 2P5QA 4ZB8A 3I69A 1H4OA 3QD9A 4K7IA 1A2LA 2RUFA 2GQKA 1AIUA 1NW2A 3UARA 4RUVA 4HJMA 2R5GA 4DVCA 5EL8A 2VLUA 1PSQA 3M3MA 1DE2A 3UL3A 4EUYA 4EO3A 3RHCA 1SU9A 1UN2A 2PMTA 5B6NA 3EU4A 3CXGA 4JR4A 1F6MC 3GHAA 2F51A 4OCEA 4N0VA 4PNGA 2H30A 4XS1A 1XCCA 3UEMA 1W89A 3TJFA 4WF4A 5J41A 2JU5A 1Q98A 4GSTA 1Q4JA 1N8JA 2PU9C 6GSUA 2KP2A 2BTOT 5EPFA 1TW9A 2B5XA 4IQAA 1WRYA 2WGRA 1I5GA 2A2RA 2FY6A 5KEJA 5J3RA 1WMJA 4MZCA 5ABRA 4O92A 3WGEA 3LG6A 1T3BA 3QAVA 1B4PA 1PL2A 2ZNMA 4OO4A 1SK2A 1M7TA 3GSTA 5F05A 2VIMA 2YJ7A 3CSIA 3E3EA 3ZIVA 3LYPA 1MDJA 2JSYA 4FH8A 2GT6A 2HSHA 1A0RP 2OADA 5JCUA 14GSA 2MZCA 3TKSE 2JZTA 3R2QA 4YQVA 2HZFA 1Z6MA 2X8GA 4RI7A 3IK7A 3ZFLA 2K9FA 3RBTA 1GSSA 1QQ2A 2GLRA 4P3YB 2GVPA 2LNTA 1IYHA 1GSEA 20GSA 2REMA 3IAS2 5G30A 1SD9A 2C0FA 3EURA 2LV3A 2H1AA 3GTUB 2V6KA 2KHPA 2OACA 2G0FA 2R37A 3VLNA 4PUAA 4TXVA 4WBRD 5J9BA 1S3DA 2DJ1A 2F8FA 1O8WA 3HXSA 3PR8A 2DLXA 3WYWA 1XFLA 1DE1A 1OAZA 4YAVA 1VRSD 1FB0A 4I6XA 1V9WA 3V1WA 4JEDA 1RK4A 1JZRA 3FRCA 4J2FA 2H6YA 1XWGA 4BWQA 1VF1A 3DEXA 4MF5A 2D2ZA 3APOA 3IAM2 2LJKA 2PWJA 4WETA 3LORA 2LTKA 1SKRB 3P2AA 2YWIA 1SKSB 4L0UA 3FZAA 2WB9A 1O8XA 5DBQA 4XS4A 3HJOA 4TW5A 8GSSA 4ECJA 4QL7A 3GURA 1G0TA 3TRQA 3GKNA 4MLYA 1EV4A 4TKYA 16GSA 5F06A 3UVHA 5J9CA 3KH9A 5D9WA 1UVZA 2DJ0A 1TRSA 5CNWA 4KW6A 4MH2A 3K8NA 3IR4A 4JBBA 3CSHA 5HR0A 1PKZA 1AXDA 3KD0A 4L5OA 2K6VA 4EL1A 4LL1B 1HNAA 3TB2A 2A4VA 1TDIA 3J7Yk 2NTOA 2XPDA 1SYXA 4OFTA 4Q5FA 1ERWA 2DJ2A 6GSVA 4WEYA 5HQPA 1W4VA 2LJRA 1TU8A 1ILOA 3TKPA 3GH6A 4AGSA 1EP8A 1VF2A 2VCQA 3F63A 2IMKA 1B8XA 5DAKB 5LD0A 5ID2B 3A3TA 3FR9A 5EVOA 4KGIA 3NOFA 1T1VA 2FCHA 3L9SA 4PXOA 3OR5A 2A2SA 3U5RE 1THOA 5ECMB 1ZYQB 2HXKA 2K8VA 1BJXA 2N5FA 1YEXA 2H8LA 2K18A 2XHFA 3WT1A 4I5QA 5D9TA 3O6TA 3ZL5A 4ZL8A 1GULA 2HI7A 4IW9A 4NMUA 3TRPA 3IRAA 1V40A 2CT6A 2I3YA 5FWGA 4EVMA 2M80A 3FKFA 2LRNA 4OFNA 3GUSA 3DMLA 4TRXA 4MJAA 3H79A 2VCTA 1EEJA 3GX8A 1FOVA 1C72A 4X43A 3ERWA 4ZBBA 3GKKA 3D4TA 1M9AA 2IMFA 4NHZA 2H74A 2XC2A 3M0FA 4IHUA 4XRDA 1T4YA 2LKUA 4GF0A 1ERTA 1A8YA 1G6WA 2KLXA 1SYRA 1XPVA 3CMIA 3H1NA 2V41A 4WBJA 1GSDA 4ULXA 5G2ZA 3FZ4A 4TR0A 1EZKA 1QMVA 3D21A 1M0UA 4K9ZA 1JLWA 2MYGA 5IMVA 2XBIA 4MCUA 4MJBA 3GKMA 3EVIA 2RLIA 1XW6A 1ZGNA 2DJJA 2GSTA 2N5AA 4IJIA 2CVBA 5ECOB 1M2DA 4V2LA 3A2WA 2WCIA 2V2GA 1Y6EA 3SWLA 3LGCA 3ZREA 1E6BA 2I1UA 5J5NA 4MZBA 1PA3A 1AAZA 1NM3A 2OBKA 1DBYA 2YWNA 2CZ3A 4NV2A 1TI1A 3EINA 3TUEA 2RM6A 1VF4A 3GYKA 3KGKA 2GSRA 5H5QA 5C04A 3S9FA 2H70A 1BX9A 5F07A 4IVFA 1R7HA 2LUSA 3RHBA 3UBLA 2L57A 2CA8A 4WR4A 2H73A 5ECLB 4ZILA 1GUKA 3RAZA 6GSTA 4I2TA 3PH9A 1T7PB 3RPPA 4ECBA 4MA9A 4YH2A 4HDEA 2WDUA 2AV4A 2LEGA 4MJCA 2F3MA 4J56E 2QKEA 3IOSA 2TRXA 4MP4A 2V32A 1ZMAA 4HQZA 1K0MA 2H19A 2VOCA 5DALA 4F82A 2FWGA 3ZIJA 4MF6A 3L4NA 2H1GA 2QSIA 4KCAA 3UVTA 1U88A 17GSA 5ECNB 5AGYA 4TR1A 2H1DA 1QXHA 2ALBA 1CQGA 3FK8A 3IV4A 2YCDA 1WE0A 2WS2A 2E2MA 2X64A 3FYGA 1X9MB 3APQA 3DVXA 3G7IA 2C3NA 2HNLA 5GAPD 1WPIA 4AF2A 1AC1A 1SL2B 2OE0A 2TIRA 3QMXA 2IN3A 3HZ8A 1SL1B 1SJZA 3ZITA 1X0RA 1A0FA 4X0XA 1TK8B 3EU3A 3ZRDA 4AJ8A 2OBIA 1V57A 4POBA 2AUVA 4LMWA 5D93A 2H0GA 1QGVA 4TVEA 4GQFA 3EMXA 1A24A 2LQOA 1TI3A 1TJDA 1J08A 5DCGA 1XZOA 1CQHA 5IPHA 1O81A 1XW9A 2HT9A 4KAEA 1YY7A 3GRXA 3QAWA 3W8SA 1NSWA 3LYKA 1M2AA 3E0UA 3DYRA 3H8QA 1Z6NA 2MMZA 3UBKA 2OE3A 4TR4A 3VPQA 3IE3A 1SJ6A 3KM6A 2C80A 4IBPA 1TXXA 2YV9A 2AJQB 4POLA 5HR1A 2CV4A 12GSA 5GZZB 3QFBC 6GSYA 3KP9A 4PNFA 4NXIA 1MD4A 2J23A 4PGTA 1SL0B 5DJMA 2HFDA 2C3TA 4JRRA 1MDKA 4HEA2 1M2BA 4NAXA 4PQHA 2HZEA 2GT5A 1F3BA 5ECIB 1K0BA 5IMFA 2VCZA 1A2JA 5CAXA 3LQ7A 2R3XA 2NBSA 1OC3A 4BVXA 3Q19A 4HQSA 3ERGA 2CAIA 4NHWA 2R6KA 4EXJA 2MMNA 1UC7A 1JZDA 2CZ2A 3Q18A 2IL3A 2EC4A 5DCHA 4EDYA 2DJ3A 4OWYA 3M8NA 2X8HA 3P90A 3FY7A 3F3RA 3WT2A 1GSUA 2ZCTA 2ES7A 1XIYA 2H01A 5C00A 1QFNA 3DVWA 4XIHA 5F8BA 1BG5A 2B7JA 2QGVA 3E9JB 4E8EA 5IIZA 3HA9A 3M1GA 1U3AA 3W8JA 5IMCA 4I8BA 5A4UA 5DVBA 3US3A 5G5EA 3GN3A 2M46A 2YANA 1ERVA 4OMVA 3D6IA 5JWOB 3VFIA 2G2QA 3LWAA 2FHEA 1LBKA 5G5FA 5D9VA 2VL2C 4JZQA 1OC9A 5GSTA 2VLTA 1XWKA 2FA4A 4N30A 3F8UA 3JCML 3VURA 4DSSA 1JFUA 3QR6A 4GSSA 2WZ9A 1GSQA 2LSTA 3TJJA 5G1LA 4F03A 2VL2A 3HCZA 1GTAA 1GTBA 3TOUA 2C1YA 4F0BA 2IWTA 2PVOC 3KMOA 1TKDB 4DSRA 1TP9A 1K0NA 2JZRA 3Q74A 3DWVA 2HRNA 3A5WA 5KN1A 1B4QA 3CRUA 3TOTA 1YKAA 3F3QA 4ML1A 2F9SA 3D0ZA 4KCEA 5F0GA 1R5PA 1PMTA 4TXOA 3BOAA 2ON5A 1PX6A 3U6VA 4WF5A 4MABA 2P5RA 5ELGA 3FW2A 3DKSA 2KUCA 1BEDA 4MPFA 4FYUA 5HFIA 2H1BA 3WD6A 3F4SA 2O8VB 4BA7A 5ECHB 4PURA 3ZYWA 2C8UA 2DIYA 4XS4B 2YWOA 1MEKA 3KMNA 1SKWB 5A4WA 2WJUA 2B7KA 2WFCA 2FNOA 2P31A 3ZVJA 4IP1A 4I2UA 1OVNA 3ZFBA 1SK1A 9GSSA 3GNJA 4IELA 1AQXA 1EOHA 2GSQA 5E4WA 3MWHA 4J57E 2JZSA 1KEBA 2IPAA 1VF3A 2IJYA 4V1Ap 3DD3A 4Q5NA 3A2VA 3A2XA 18GSA 3G7JA 1E2YA 1ZCPA 5D73A 4BPYA 2HRFA 3LJRA 2LNSA 2LRCA 2O85A 5B6MA 3GX0A 1K3OA 3BCIA 5D8IA 2X99A 5AN1A 5COHA 1HD2A 4IGJA 1R5AA 3UAPA 5DJLA 2KOKA 1GLQA 3VPTA 1OE8A 2DJKA 4OCFA 3QPMA 5IO0A 4K1FA 2PVQA 3TRXA 3I43A 5DQSA 4MZWA 4HU9A 3HZ4A 3BBYA 3FHKA 1OKDA 3KP8A 3IXRA 3LEFA 3WGDA 5DDLA 1ZL9A 1Z5YE 3KH7A 4HI7A 1FAAA 2FWEA 2VO4A 1QUWA 2JSZA 1A8LA 2VCWA 3KTBA 3NZNA 4YQUA 3EC3A 6GSXA 3ZVJD 4RQXA 3MSZA 2WRTA 5CO3A 4IP6A 3O3TA 4XCSA 4AJ6A 1M9BA 3C71A 3APSA 3I6AA 3BD2A 1NHOA 4KSMA 1ON4A 2B1LA 1AQVA 3BJ5A 3TKQA 4ID0A 3WGXA 1GSYA 1GP1A 1AUCA 3L9VA 1PD21 2OJLA 2YP6A 4HZ4A 2C0GA 5JCGA 4IN0A 4ZL7A 3GMFA 4KA0A 1O85A 1FVKA 2L59A 4RQRA 4HS1A 3GKXA 4F9ZA 4KDXA 3DIEA 4XRAA 5IOXA 3IC4A 1ERUA 1GUHA 5CYYA 1TRVA 2I81A 1OC8A 5KN3A 3KIJA 1F9MA 4KUNA 5IMZA 2AAWA 2ZUPA 3SBCA 4EE0A 4YAPA 1LU4A 5ENUA 4NPBA 1JZOA 1Z7PA 4N0ZA 2EIRA 4GLTA 2GDRA 3HJMA 1SENA 3H4KA 1XWCA 2HYXA 4Q5RA 1GH2A 2JACA 3KZQA 2Z9SA 4MPGA 2LQQA 4GWRA 1JZWA 3L0HA 5CRWA 4KH7A 4XTSA 3UOMA 2HSYA 2MMOA 1S3CA 5G31A 2VCVA 1XOBA 3EE2A 4K7OA 2VCXA 2YPMA 4HOJA 2YOIA 2L6CA 4XS6A 5CRGA 2XBQA 4K0NA 2IFQA 4ZBDA 2XPEA 3CRTA 1XOAA 2H66A 3HY2A 3UIWA 2YN1A 4ZXGA 3VI5A 1HNBA 3QFAC 1EV9A 1K0CA 3MNGA 5CRDA 3DGQA 1AQWA 1WOUA 2HE3A 1Z7RA 4ISDA 1B48A 3G9BA 1GLPA 1XVQA 2YV7A 5D9XA 5ECKB 3N9JA 2GZZA 5LCZA 3Q6OA 2IMEA 5JWRB 2RIIA 3QAGA 5J4UA 5ECPB 5CREA 4LL4B 2MMAA 3ED3A 5CRHA 4K7NA 1TRWA 5HFGA 3GV1A 4TR3A 4MDCA 2FWHA 5HFKA 2VLVA 3LSZA 1YZXA 2GGTA 2VD0A 3CTGA 1Z3EA 2YNXA 1FO5A 3HVXA 5DALB 1YEPA 4KSOA 1K0AA 1B9YC 4IS0A 2GTUA 1J9BA 4TOPA 4OO5A 4RI6A 1PX7A 4TR1B 5EY6A 4L8EA 5GSSA 2H6ZA 2GZYA 3M9JA 1YKCA 3HVVA 3C1RA 3N5OA 2F8AA 2JL4A 5ECSA 4K8MA 4D73B 19GSA 2N5BA 1N2AA 3KCMA 1EOGA 1OYJA 1GNWA 1K0OA 4POMA 3D4MA 2B5YA 4MJEA 1TTZA 4F2IA 2H76A 3HD5A 1K3YA 4KNDA 1WP0A 1KNGA 1WWJA 1GL8A 3F6FA 5IMAA 2KP1A 3TKSC 2DMLA 2M72A 3MAKA 1V58A 1X9SB 2VM2A 2PUKC 3C1SA 3ZTLA 4JR6A 4KDYA 2J9HA 4WXTA 22GSA 2GQLA 1U3IA 3GSSA 2PPTA 5CP1A 3UMAA 1G6YA 3IHQA 4PX1A 1F37A 2EIOA 2GSSA 3TKSA 1PN9A 1NHYA 3W6GA 3VWXA 1FG4A 4MMMA 5E59A 2WULA 4O32A 1YJ6A 4FYCA 2JADA 2CAQA 4ILFA 2VL3A 3ZMLA 3DRNA 6GSSA 1HQOA 3GTUA 3IBHA 6GSWA 13GSA 4Q5QA 1XXUA 1XWAA 1F2EA 1SK0A 3NIVA 3ISOA 2FUG2 1Y25A 1IYIA 1ABAA 4JE1A 2E7PA 1ZZYA 4I97A 3QDNA 5IM9A 3KJYA 1Z9HA 3EWLA 1YQ1A 2CQ9A 2B5EA 4FIWA 1JLVA 7GSSA 4DSQA 2HZEB 4O5RA 1SD8A 4IQ1A 1PQNA 4ZL9A 4LMVA 2YZUA 2MBSA 2DBCA 1FHEA 4N10A 5A5KA 1ST9A 1RQMA 1FW1A 2OE1A 4NV5A 3QCPA 1YDKA 1XVWA 3LFLA 5KN2A 4N11A 5FHIA 1JHBA 2PN8A 4KX4A 2IMDA 1TK0B 1FVJA 4G10A 2YZHA 4ZB6A 1G7OA 5AIVA 1USBA 3CBUA 3IDVA 2B6MA 3UJ1A 4MF7A 2O89A 4EC0A 4AJ7A 2VM1A 3C8EA 4WR5A 5B8BA 4L0WA 3FZ5A 4ZBAA 2DIZA 1J0FA 2H75A 1GNEA 3HJPA 4K0GA 3GH9A 1T8EB 1A23A 2VL9A 1BYEA 3C7MA 1R4WA 1XWBA 2CX4A 1GWCA 4MH3A 1A2MA 5INYA 3CTFA 3IPZA 1OC9B 1T00A 3H93A 4GRFA 2AYTA 3GA4A 4EKZA 4LLRA 5IOWA 4DSSB 2FD3A 1GSFA 5IMDA 3EYTA 4FO5A 2C0DA 3D22A 3CYNA 2C0EA 1QK8A 2FGXA 2IIYA 1B9XC 5FT3A 3FEUA 2GS3A 3LXTA 2AHEA 1X5CA 3M9KA 2PGTA 2EIQA 3HDCA 10GSA 1R26A 4QL9A 1FB6A 5DAKA 2NVLA 5ID2A 2OA7A 4GQCA 1OKTA 1KBNA 2C4JA 4KDUA 3C73A 1G7EA 3GIXA 1WIKA 3DXBA 1GUMA 4ZB9A 2L4QA 2DC5A 4ECCA 3F4RA 1MDIA 1GRXA 1X5EA 1DUGA 3ZMKA 4KB3A 4TXOB 3ME7A 3RDWA 2B1KA 3P8WA 2VD1A 1TRUA 2DMMA 5KN0A 2LJAA 2P0GA 5AISA 2V6OA 1THXA 3TGZA 4ML6A 2ON7A 2L4CA 3TJKA 5IPGA 5A4VA 4KE3A 4V1Ag 2I9HA 1K0DA 2NPBA 3HHVA 2GQMA 3AY8A 5JCWA 4CDOA 4BL7A 2R2JA 2O7KA 3VK9A 3MDKA 1MD3A 1EGRA 2PBJA 4TN8A 4G9HA 3O76A 2L5LA 2CVKA 3ZLPA 3FR6A 1PKWA 4NWYA 4GXZA 2H71A 4F0CA 4WKWA 4POKA 2VAFA 5LNKe 1V98A 4BVYA 2MBTA 1YF0A 2NDOA 3D5JA 3VWUA 3IA1A 2QC7A 5B8AA 2CVDA 3LXZA 1ZYEA 3BCKA 1ACVA 3HKRA 3FR3A 1BQ7A 1HYUA 1BAYA 4HUAA 5HR3A 2IMIA 3KXOA 3TDGA 3ERFA 2O87A 2V1MA 2YJHA 2OKAA 2E2GA 4ACSA 1GTUA 1TOFA 1F3AA 3TCOA 3CSJA 4GSNA 5IQYA 4PUFC 2L6DA 4IKHA 3TKRA 2YWMA 3ME8A 3GL5A 1RW1A 3F4TA 3HVSA 5D96A 1EEMA 4PQ1A 2DSAA 3IK9A 5JWQB 2X8CA 4QQ7A 3VI7A 3TJGA 1I9DA 1PL1A 4CW9A 4FYBA 2FWFA 4K2DA 4E8HA 1VGLA 5GAND 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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