3ZTLA

Crystal structure of decameric form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
180
structure length
180
Chain Sequence
LLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEVCPVNWKRGQHGIKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 56
structure length 180
sequence length 180
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ztlA00
4KGIA 1UA5A 4PGTA 4PUFC 1OYJA 2HZFA 4MF7A 2WGRA 2PN8A 5ECRB 3F4SA 1GRXA 1QQ2A 2FWHA 4JEDA 2LTKA 1O6JA 3QPMA 3PGTA 2BTOT 4I2UA 1WMJA 3ZFLA 1A0FA 1SK0A 2B6MA 1YZXA 2V6OA 5E59A 5ECQB 2H8LA 4HI7A 2C3NA 2H6XA 1U3AA 1GNEA 5DBQA 2YV9A 3SBCA 5B7CA 5HFKA 2OJLA 2FCHA 1EEMA 2EIOA 2M80A 4WF5A 3FZ5A 1AC1A 4F0BA 1XWBA 4NAXA 2A2SA 3J7Yb 3QDNA 3RDWA 3KTBA 2LKUA 5DALB 5EY6A 3W8JA 1XOAA 2VCWA 2YJ7A 1BJXA 1EGOA 3F4RA 3IE3A 4OO5A 1FVJA 3C1SA 3VI7A 3UVHA 3GTUB 1K3OA 4GQFA 3ZYWA 3UBKA 1I9DA 2JACA 3F3RA 2WULA 1GP1A 4IQ1A 2H74A 1PKZA 5FHIA 3EVIA 4IJIA 3KMNA 2L59A 5CNWA 2I4AA 2DMLA 3ZMLA 3UBLA 4IP6A 4NHZA 1OC9B 4JBBA 4MPFA 2R2JA 1NSWA 3L78A 3HY2A 6GSYA 3GHAA 1ERUA 1MEKA 1V2AA 4KCAA 4GLTA 4MMMA 5AISA 4WEYA 4JRRA 3M1GA 2L4QA 2K8VA 1K3LA 3VFIA 4K7NA 1FB6A 2KP1A 3LGCA 3VWWA 1Z5YE 2IFQB 4GRFA 2FA8A 2F3MA 1EZKA 3KP9A 2YZUA 2L6DA 2VCXA 22GSA 3EURA 4XS6A 2FNOA 5HFGA 3BOAA 1UN2A 6GSWA 2VCZA 4EDZA 3S9FA 1QUWA 2O89A 5IMAA 4PUAA 4XCSA 2B3SA 3F9UA 5ECHB 3ME7A 4NWYA 3TJJA 1W4VA 2AB6A 1SJZA 2C8UA 1LU4A 3C73A 2C4JA 2CAQA 2CV4A 2AAWA 3GYKA 3TOUA 3TRXA 3CSIA 1X5CA 1PD21 1DE1A 17GSA 4EC0A 5IPGA 1GLPA 2X64A 2ON7A 4IHUA 4RUVA 4XIHA 3I9V2 1SENA 1AXDA 2HSHA 3D6IA 4N30A 1PKWA 1MD4A 4MZBA 2FGXA 5ECMB 2FLSA 1GNWA 1WJKA 1FO5A 4EF0A 4IKHA 4HZ4A 3GV1A 1G0TA 1R5AA 4YQMA 5KN2A 4XRAA 3DMLA 5HR3A 4MJBA 3CYNA 2HE3A 1XVWA 2LSTA 5A4WA 5KEJA 4ZILA 2GQMA 1AW9A 3IBHA 3DEXA 1EV9A 3DIEA 1SD9A 4L8EA 1KTEA 1J08A 1F2EA 5IMDA 4RI6A 1OC3A 1SKRB 4XS4B 6GSUA 2HZEB 2IMEA 5J3RA 3O3TA 2FA4A 1BG5A 5DCHA 4LMVA 1S3AA 3ZLPA 1YQ1A 5IQYA 2VD1A 5A4VA 2G2QA 3VWXA 3RPNA 2LNTA 3IC4A 4WF4A 4KH7A 2X8CA 1T7PB 4KE3A 4HS1A 3SWLA 3G9BA 1YY7A 2GLRA 1X5EA 1IYHA 4I2TA 4IBPA 5HR2A 1BX9A 3UIWA 2YCDA 5J9BA 2DJ1A 4LA1A 2B5XA 4Q5QA 3EMPA 3GMFA 4I5QA 1ZGNA 1V57A 2C1YA 4BPYA 1YDKA 1ZYEA 2V41A 1IYIA 2H0GA 5D9TA 3TKSE 2EIQA 5HR0A 2H76A 1SKWB 3KZQA 3IK7A 2LUSA 2H01A 1GH2A 1RW1A 4N0VA 1TOFA 5G5EA 1W89A 2FHEA 2CVDA 4HJMA 1OC8A 3FYGA 3ZMKA 4MABA 2FD3A 4BVXA 3KTLA 5H5SA 12GSA 2IMIA 1YEPA 3TB2A 3GKKA 3EE2A 1A2MA 1QMVA 1A24A 4WETA 4L5OA 3TJGA 2PVQA 4ACSA 1BAYA 4KDYA 1XBSA 2IL3A 4G10A 5DJLA 5DJMA 2C80A 4TR0A 1O81A 3RPPA 4AJ7A 1CQHA 3Q74A 5IMVA 4OFTA 3KCMA 2LRNA 3CTFA 2LRTA 5ECLB 3D4TA 1EGRA 2B5EA 3APSA 2DC5A 3LXTA 2R3XA 3FR3A 2NTOA 2H19A 1N2AA 3UARA 2C3QA 5CO3A 3IPZA 2WJUA 2IPAA 2CX4A 1SK2A 1JZWA 1M2BA 4F9ZA 2V2GA 1YF0A 1GUHA 1HQOA 2YPMA 4POLA 1RQMA 1T4ZA 3BBYA 3UJ1A 3TRQA 2QC7A 1OKTA 3LYPA 3UOMA 2KHPA 5J41A 4MZCA 4V1Ag 5B6MA 1M99A 1E2YA 2GQLA 1EOGA 4XRDA 4K7IA 3D4MA 4MF5A 5DDLA 3NIVA 4ULXA 1O85A 1MDKA 3G7YA 1CQGA 4IN0A 1TXXA 5D9VA 4ZBAA 3IR4A 3FR9A 3D22A 4WR5A 3KXOA 4TRXA 3GH9A 3F6FA 2OACA 5IOXA 3LQ7A 1FW1A 2RM5A 1M9AA 1TK8B 1B48A 3TKSA 2JZRA 3NOFA 1VGLA 1Y25A 4BA7A 3H93A 3KEBA 5HR1A 2H75A 4GQCA 2N5BA 4MJAA 2EIRA 4P3YB 3EYTA 5IMFA 2O7KA 1VF1A 4PURA 2ALBA 4TR3A 2YWMA 2WZ9A 3HJMA 3GN3A 4TVEA 1A8LA 4FYBA 4XTSA 1J9BA 4IW9A 5CYYA 1LJRA 1G6YA 1NHOA 3W8SA 4GSNA 5IIZA 1GSYA 2LRCA 3IRAA 1QXHA 1TDIA 4MP4A 3KD0A 2MZCA 3MWHA 3I43A 3GX0A 3TCOA 1WOUA 4G9HA 3A5WA 1O7UA 2I1UA 2L57A 4QL7A 4TN8A 2VM1A 3FZ4A 3C1RA 4MPGA 3IOSA 5E4WA 2DSAA 2AUVA 2F9SA 2V6KA 2FY6A 2YWNA 1SK1A 3VWUA 3APOA 3H1NA 3I69A 4KUNA 1XWGA 2H6YA 2V32A 5JCWA 4ID0A 5ECNB 1K0BA 2Z9SA 5ECOB 2DJ0A 4GF0A 4POMA 1A2JA 3DVWA 1GLQA 3GH6A 3M8NA 4PQ1A 3TKSC 4OFNA 3FZAA 3WGEA 3KM6A 4WKWA 3IAS2 2VO4A 2VCTA 5CREA 5B8BA 3DGQA 2PMTA 3QFAC 2DIYA 4KCEA 1PN9A 4CW9A 5L71A 2JZSA 4NV2A 1YKCA 4BWQA 5F07A 3IHQA 3GFKA 4PNFA 4XHMA 4KDUA 3GX8A 4FH8A 4KW6A 3WD6A 2H1AA 2OBKA 1B9YC 2YV7A 2OE1A 3CRTA 4O92A 4H86A 4RQXA 5DVBA 3HJPA 2QSIA 1PMTA 3QR6A 1UC7A 3LG6A 4PQHA 1NM3A 3JCML 2R4VA 2O8VB 3EWLA 2L5LA 2PUKC 4HUAA 2GDRA 1GWCA 3WGDA 4GXZA 2E7PA 2VL2A 1VF4A 3MSZA 4BVYA 2B7JA 3QAWA 3TUEA 19GSA 3HA9A 1ERWA 2I9HA 3UL3A 5HQPA 4HDEA 3TGZA 4HEA2 1JZOA 4OFMA 5ELGA 1VRSD 2E0QA 2BJXA 2X8HA 4KDXA 3WT2A 3IAM2 3LWAA 4EKZA 1MTCA 2R6KA 7GSSA 4DEJA 2R37A 3APQA 5C00A 3VLNA 3HHVA 1EP8A 3KGKA 4GSSA 4EE0A 1OE8A 2H66A 4X1UA 3A3TA 2AYTA 3TJFA 1FOVA 4IELA 4KA0A 5KN1A 4OCFA 2A4VA 3A2VA 2CQ9A 3TJBA 2K18A 5ECPB 1SJ6A 4CHSA 3QOUA 1OKDA 2MYGA 1GSQA 4L0WA 5FT3A 1UVZA 2NVLA 3H8QA 3ZTLA 4FIWA 5H5QA 2VLTA 4KNDA 2XPDA 4EUYA 2H1BA 1ERTA 2IN3A 1GL8A 4MDCA 4POBA 1GTAA 1DUGA 5IM9A 2PERA 2VCQA 3C71A 3QCPA 1B9XC 1ACVA 1XW5A 4OD7A 1XXUA 3MAKA 1TP9A 1V58A 3QFBC 3GKXA 1TI1A 2YWIA 2MMOA 2OE0A 6GSXA 1K0NA 5FWGA 1NW2A 1ZOFA 2K9FA 1VF2A 3BD2A 5DQYA 2PPTA 2MMNA 2YOIA 3KH9A 4O5RA 4NV5A 3R2QA 4ECIA 3VPTA 1N8JA 1SD8A 1T00A 3U6VA 3ZREA 3L9UA 3CTGA 1GSUA 2AHEA 1TRVA 5G30A 4V2MA 1HNBA 3M3MA 2WRTA 10GSA 5D8IA 2C0GA 3D21A 3GSSA 1V40A 2GSQA 4ECJA 2HSYA 1PL2A 1NHYA 4HZ2A 2RUFA 2KOKA 5DQSA 1TI3A 1KBNA 2OKAA 1U87A 5EL8A 1M0UA 2N5AA 1SYRA 2DBCA 3PR8A 4K6XA 3DYRA 4IP1A 1XWCA 3F0IA 1T4YA 3GL5A 1T1VA 4ECCA 4O7HA 1ERVA 2IIYA 2B7KA 4EXJA 1K0CA 5JCGA 1PA3A 4F82A 1X9MB 1F37A 2RM6A 5D9XA 14GSA 1A23A 1TKDB 2AV4A 2OE3A 4K0GA 2F8FA 1JLVA 3IK9A 2KLXA 2NPBA 1YJ6A 2LJAA 2GT6A 3CSHA 2LS5A 4K1FA 3TDGA 3FY7A 4F2IA 2PU9C 1AQVA 4TR4A 2HI7A 2M72A 5AGYA 5CRGA 2JSZA 4XS1A 2CZ2A 1EV4A 4GTUA 2KUCA 1ZCPA 4L0UA 2IJYA 4PNGA 2LQQA 1T8EB 1MDJA 6GSSA 1A2LA 1ILOA 5A4UA 1F9MA 2HYXA 5GZZB 1X9SB 1AQXA 4KAEA 2VOCA 2GZYA 1KEBA 1EOHA 3QAGA 1TRWA 2I81A 4QQ7A 4LMWA 3DKSA 1GUKA 1R26A 5IO0A 4Q5RA 2M46A 1YEXA 2XC2A 3P7XA 3ERFA 2ZUPA 1U88A 2WB9A 4ZB9A 3M9JA 3GL3A 3H4KA 2E2GA 3GKMA 3VI5A 3VWVA 3ZZXA 2O87A 3EINA 1G7OA 1M9BA 1A0RP 3ED3A 4I8BA 5CAXA 3M0FA 3F6DA 2GZZA 2DLXA 5COHA 3DD3A 3PINA 2PWJA 2NBSA 3D5JA 4ILFA 4ZL7A 1EEJA 2PVOC 4TR1A 3A2WA 3KH7A 5ID2A 1K3YA 1HNCA 2QKEA 3F8UA 4HOJA 3TKRA 3P2AA 1Z7PA 5GAPD 1GSSA 1AUCA 1VF3A 3L4NA 4TXVA 2VD0A 1DBYA 5GAND 5AIXA 3LYKA 3IV4A 3V1WA 5GSTA 6GSTA 1Z7RA 1HD2A 1YF1A 1PQNA 1XPVA 3GUSA 4WXTA 4DSRA 4IJ3A 4ZBBA 3HCZA 3ZIJA 3C8EA 4N11A 4NXIA 3G7JA 1JZDA 4OWYA 3P8WA 4E8EA 3FR6A 1MD3A 5JWQB 4PQIA 4X0XA 3UEMA 3KP8A 1U3IA 2C0FA 5B8AA 5GSSA 3AY8A 1HNAA 2GSTA 2YANA 3QMXA 2P5RA 4EVMA 1YKAA 4D73A 3Q6OA 5CP1A 3A2XA 2E2MA 5KN0A 3GA4A 4OMVA 5B6NA 1GTBA 4AJ6A 3OR5A 2HRFA 4ISDA 4YAVA 3J7Yk 5G1LA 2VCVA 5ECIB 2YP6A 4KSOA 2P0GA 2LQOA 3DVXA 1XWKA 4WBJA 3E0UA 3HD5A 4YAPA 4ZB6A 3GSTA 4K8MA 2LV3A 4DSQA 2GSRA 3I6AA 2K6VA 4NMUA 1AQWA 4MH2A 5HFIA 1GSDA 1V9WA 5DALA 1H75A 4EO3A 4WBRD 3MNGA 1R4WA 2KP2A 3GTUA 2XBIA 4K7OA 1M2DA 1KNGA 2FWGA 3US3A 4FYUA 1XW6A 5F8BA 2AJQB 4NHWA 5KN3A 4MA9A 5LNKe 1C72A 20GSA 1XOBA 4HJ2A 1M2AA 5EVOA 1R5PA 1QK8A 3FEUA 2OA7A 3HVXA 5IMCA 4D73B 1QFNA 5JWOB 2JSYA 3N9JA 4J2FA 4BWSA 1OC9A 3KIJA 2L4CA 2H0HA 1THXA 3ZL5A 2CT6A 2XHFA 2REMA 1RK4A 2WS2A 2PBJA 4KX4A 4ZB8A 2VL3A 5J9CA 2MMZA 1G6WA 1XWAA 1SKSB 4IVFA 1AAZA 2F51A 1B4QA 2O85A 2OBIA 1TRUA 1O8XA 4TW5A 3BCKA 3TKQA 1WWJA 3HKRA 2IFQA 2GQKA 3GRXA 3FRCA 3ZRDA 3DRNA 3HVSA 5D9WA 1XFLA 2H70A 2VLVA 4ZIJA 1LBKA 2CX3A 2ZNMA 3ERWA 4Z7XA 1QGVA 2TRXA 2CA8A 1ST9A 3UVTA 2B1LA 1TU8A 5JCUA 2ON5A 3Q18A 1BEDA 4F03A 3NZNA 4OO4A 4V2NA 5AN1A 2TRCP 1BQ7A 2LJRA 3ZVJD 3FZ9A 3CBUA 5IPHA 2DJKA 4NPBA 3BCIA 3WYWA 3VK9A 1TJDA 2IWTA 18GSA 3L9VA 3KJYA 1GUMA 1V98A 2FUG2 1B8XA 2WCIA 2X99A 3HVVA 1FG4A 2HFDA 1XZOA 4JR6A 5ECKB 4MF6A 4G2EA 2DJ3A 4Q5FA 1WP0A 2J9HA 2B5YA 4EL1A 4TOPA 4DSSA 1H4OA 3HJOA 1SYXA 3L9SA 2JU5A 2F8AA 3IA1A 5J4UA 1GSFA 1DSBA 4QL9A 1GSEA 5D96A 1OAZA 2CVKA 4K2DA 1FVKA 1ON4A 4AJ8A 2GZPA 3HXSA 3FHKA 1T3BA 4I97A 3QD9A 5CRHA 3O76A 2H72A 4JU5A 4MK3A 1JLWA 1K0DA 3TJKA 5CRWA 1GULA 1JFUA 3IDVA 2YWOA 1ZYQB 16GSA 4F0CA 1Q4JA 4XS4A 1ML6A 5JWRB 2HZEA 1J0FA 4FO5A 2CAIA 1GTUA 5AIVA 2HT9A 5EPFA 1XW9A 1O73A 1WE0A 5D93A 1SL2B 2PGTA 5G1KA 2FWFA 2VL2C 3QAVA 4K9ZA 2VLUA 4JZQA 1PX6A 4DSSB 11GSA 1OE7A 5ENUA 1G7EA 3ZVJA 4IGJA 4MH3A 2QGVA 2VL9A 3D0ZA 1BYEA 4HU7A 3LORA 2YJHA 1OVNA 1ZL9A 2P31A 5DAKA 5G5FA 4GSTA 3LSZA 1MDIA 4ML6A 3CSJA 2GSSA 4GCIA 2YNXA 3M9KA 1R7HA 1FHEA 3EU3A 2VAFA 4K0NA 2LNSA 5IMZA 4X43A 4PX1A 4HU9A 3HYPA 9GSSA 2YN1A 1X0RA 4LLRA 1PRXA 2YZHA 3BJ5A 3F63A 3GIXA 1K0OA 3RAZA 2H30A 4IS0A 1K0AA 3E3EA 4L5LA 2RLIA 3HDCA 3ERGA 2X8GA 2J23A 1X9WB 3DWVA 2MBTA 2GS3A 4TKYA 1URMA 2A2RA 2H71A 2LJKA 2WFCA 5G31A 4J56E 5IO2A 2GTUA 8GSSA 1TU7A 1X5DA 5IOWA 3HZ4A 1JZRA 2JL4A 3N5OA 2GVPA 4JR4A 3F4TA 2DJ2A 2MBSA 1K0MA 3ME8A 1ZMAA 4E8HA 4EDYA 2C0DA 1SL0B 4HQSA 3TRPA 4ZL9A 5DAKB 4TXOA 2G0FA 2B1KA 5CRDA 3CMIA 1F3AA 1PSQA 1FAAA 2L6CA 2K8SA 3UMAA 2DMMA 2LEGA 1HYUA 3FK8A 1Z3EA 3ZFBA 4ECBA 2L5OA 2DIZA 4ZXGA 4RI7A 5LCZA 2JADA 3K8NA 2I3YA 3TKPA 1F6MC 4GWRA 4MJCA 4LL4B 1O8WA 4J57E 4OCEA 3C7MA 2HRNA 4YQVA 3KMOA 1U6TA 1TK5B 3F3QA 1PL1A 3E9JB 3ZIVA 2JZTA 5ELAA 3GKNA 6GSVA 1ZZYA 5H5RA 2R5GA 4HQZA 4MLYA 4N0ZA 1I5GA 1SJIA 1WPIA 4BL7A 2NDOA 1Q98A 5LD0A 4MZWA 5J5NA 2VUPA 4V1Ap 1Z9HA 3VURA 3TOTA 1B4PA 4MJEA 1EWXA 3GNJA 4G19A 2HXKA 3U5RE 1SU9A 2VIMA 3MDKA 3LJRA 1F3BA 1FB0A 2EC4A 3EU4A 4TXOB 3EC3A 3LFLA 2BMXA 3FW2A 1AIUA 3RHBA 1EP7A 2ES7A 3WGXA 3WT1A 3O6TA 2D2ZA 2TIRA 2MMAA 3P90A 1SL1B 2H1DA 4AGSA 4AF2A 1DE2A 2IMDA 3ISOA 1TTZA 5F0GA 5DCGA 3LXZA 2C0EA 5F05A 1TRSA 3HZ8A 3L0HA 2OADA 2IMFA 2P5QA 1Y6EA 4N10A 4V2LA 4FYCA 3VPQA 1XCCA 4Q5NA 1TW9A 4YH2A 2RIIA 3RBTA 4KB3A 4CDOA 2WDUA 3PH9A 3LEFA 3RHCA 4ML1A 2GGTA 2N5FA 4O32A 2HLSA 3G7IA 5ECSA 13GSA 4LL1B 5A5KA 2XPEA 5INYA 1THOA 1Z6NA 3H79A 2FWEA 1PGTA 2H0IA 1USBA 5F06A 4YQUA 2H6ZA 1XIYA 2H73A 2HNLA 2DJJA 2XBQA 5D73A 3W6GA 2C3TA 2CZ3A 1WRYA 4PXOA 4TR1B 2V1MA 5ID2B 4MCUA 4ZBDA 2ZCTA 1S3CA 1XVQA 5ABRA 2VM2A 2RUEA 4KSMA 1Z6MA 4ZL8A 3CXGA 4POKA 1WIKA 3ZITA 1A8YA 1JHBA 4WR4A 5C04A 3EMXA 4JE1A 3DXBA 1S3DA 4I6XA 1ABAA 1PX7A 1TK0B 2GT5A 5G2ZA 2CVBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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