3ZVJA

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITINDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 33
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjA00
3LQ7A 4FH8A 3ZMLA 2HRFA 1WPIA 1JLVA 2WCIA 4ZILA 3LXTA 1SL2B 4NMUA 1B4PA 3I9V2 1DUGA 3PR8A 1V2AA 2H6ZA 2M72A 2OE0A 4PQHA 1XWCA 3L78A 5ECPB 4IHUA 4GLTA 1XVWA 4G10A 4IELA 4XCSA 2PN8A 1TW9A 1GLQA 1GWCA 3IDVA 4GXZA 6GSVA 3GKXA 1JFUA 1G7OA 4ZXGA 4KW6A 4MJCA 3IA1A 4IJIA 3G9BA 1DE1A 3TKQA 2ALBA 3JCML 3D4MA 1THXA 4ILFA 5ELGA 4F0BA 4FO5A 3GX0A 2PPTA 1X5CA 2B3SA 1CQHA 3F9UA 2K9FA 2VM2A 3MAKA 3FZ5A 3L0HA 1SU9A 1VF2A 2EIRA 5DCHA 4P3YB 4QL9A 2E2MA 1TU8A 2MMNA 2F3MA 2JZRA 1GRXA 22GSA 4MJAA 4ECCA 4O92A 3RAZA 4X1UA 1AIUA 4LL4B 5DQYA 3EMXA 4MP4A 2LQQA 5IMFA 4N11A 1K0NA 4JE1A 3WGDA 2ON5A 2RUFA 3UJ1A 1HNAA 1DSBA 1SK1A 4L0UA 2IJYA 1A24A 3IAS2 1JZDA 2B1LA 1SJIA 2CVBA 2V6OA 1SJ6A 4BA7A 1ZYEA 2H1GA 4CDOA 1X5DA 2R37A 4TKYA 3RHBA 3KMNA 4N10A 2H30A 4XS4B 4OFNA 1X9MB 1W89A 4K7OA 2YPMA 3J7Yk 1K0OA 1NHOA 3TB2A 1PQNA 1QXHA 1NHYA 4K6XA 1T3BA 4D73A 5J5NA 3GL5A 4G19A 4YAPA 3TJFA 1R4WA 1E2YA 3APOA 4KDXA 1TI1A 4V1Ap 2VL2C 1B48A 3LYPA 4KB3A 2XPEA 5H5SA 2GZZA 3ZYWA 3GURA 3DYRA 1U88A 3I43A 4K1FA 4OCEA 4ZB6A 1O85A 2FWEA 5B8BA 1F9MA 6GSWA 3KMOA 4KDUA 5DDLA 3HXSA 5HR1A 5CRDA 1O6JA 1TTZA 2RM5A 3FHKA 2K8VA 3QFAC 3KCMA 2DIYA 4EKZA 3FR3A 5ECMB 4KDYA 4IP6A 4TR3A 1OC3A 3DRNA 3RBTA 1OE8A 4ACSA 3H79A 5ID2A 4YQMA 4IS0A 3Q19A 3D0ZA 3EVIA 2C1YA 1ZOFA 3ZLPA 1BEDA 1GTUA 1K3YA 3QD9A 3HYPA 2H0IA 4ML1A 1FVJA 2P31A 5AISA 3CMIA 3HDCA 3TOUA 3H4KA 3U6VA 3D5JA 1SJZA 4EF0A 2MMAA 4KCEA 4YQVA 2VLVA 4ID0A 4MF7A 4G2EA 3LEFA 3KP8A 2HI7A 5JCGA 2K6VA 20GSA 4WBJA 5HR3A 4WF5A 5GAPD 3PINA 1S3DA 2R5GA 2YOIA 2MBSA 2GT6A 2B7JA 1KBNA 2VIMA 3CSIA 1ACVA 1MDKA 5B8AA 2MYGA 5J9BA 1LJRA 5F07A 1NM3A 2HE3A 2YJHA 3ZZXA 1TXXA 4TXOB 5CAXA 1A23A 1PA3A 1WE0A 5JCUA 2WS2A 3CRTA 4K0GA 4KGIA 3H93A 2CT6A 4MJEA 2IPAA 4GTUA 5CRHA 1Z5YE 5AN1A 4TR4A 5F06A 1EGOA 1FB6A 3A2XA 3ZFLA 5CP1A 3FR9A 1PMTA 3WT2A 4PNFA 2B5YA 4OCFA 2IFQA 2X99A 4XS1A 2XHFA 1TRSA 1GSDA 1GL8A 1FB0A 5IIZA 4HQZA 2CX3A 2CAIA 5DALB 2YZUA 4FYBA 4DSSA 4O5RA 1OAZA 2VUPA 4DSQA 5G30A 3GH9A 4IBPA 3OR5A 4POKA 2V41A 3UL3A 2HLSA 3IRAA 5DAKB 2PUKC 3ZIJA 1XWGA 1IYHA 1J0FA 1GUHA 4EDYA 2VLUA 4TR1A 3SWLA 2H01A 5LCZA 1GSUA 5KEJA 1B9XC 3O6TA 2HZFA 4TW5A 3KD0A 1K0DA 2WZ9A 2PU9C 3RHCA 3KJYA 3O3TA 3VLNA 3QPMA 3TCOA 4HU7A 2ZNMA 3KTBA 2GSSA 3HD5A 2C0EA 1PRXA 1JLWA 3HJPA 2FLSA 1X9SB 2AV4A 2VCXA 4IJ3A 1DBYA 2YP6A 3QOUA 12GSA 1QK8A 2IN3A 1K3OA 3GFKA 4K2DA 4J2FA 4Q5FA 5D9TA 2DJJA 1H75A 4XS6A 1T4ZA 1TI3A 4HDEA 1XOAA 3GSSA 1N2AA 2H75A 4X0XA 2H70A 2GSQA 1YEXA 5IM9A 2C0GA 1QUWA 1QQ2A 2YWNA 1EEJA 5J41A 1GTBA 1U87A 3HZ4A 4F0CA 5G31A 7GSSA 16GSA 4V2NA 1C72A 4F9ZA 3IHQA 3IPZA 1EEMA 2YCDA 2L5LA 1SKRB 1OC8A 5G5FA 1WIKA 2CZ2A 4LA1A 4MMMA 3L9VA 1G7EA 2V1MA 5A5KA 5GSSA 4TOPA 5ECQB 2B5EA 1FAAA 3M9JA 1J9BA 1T4YA 3W6GA 1NW2A 4TXVA 1F3BA 1GSSA 1TRVA 2MZCA 2JACA 4KX4A 3G7YA 1X0RA 1J08A 5A4WA 5DQSA 2VCVA 2H76A 3FYGA 3LORA 1JZOA 1KTEA 1PSQA 5IPGA 2VO4A 1K0AA 2YJ7A 2GGTA 1IYIA 4HS1A 1EWXA 3M0FA 1YDKA 2VAFA 3GL3A 4F2IA 4KUNA 1G6YA 1M99A 3ZFBA 1Z3EA 4NPBA 2FHEA 1GP1A 3PGTA 4G9HA 2GVPA 2TIRA 2P5QA 1EOHA 3HVXA 3HCZA 4LL1B 1FVKA 1XZOA 1YKAA 4GWRA 4FYUA 4D73B 1T7PB 2N5AA 4HI7A 5GAND 2V2GA 5G2ZA 4MH3A 1A2MA 1M2BA 3KEBA 1GH2A 2WFCA 2DLXA 4TR0A 3IE3A 1K3LA 1HD2A 2CVKA 2HNLA 4XHMA 3RPNA 3M9KA 1W4VA 2WULA 1AUCA 3BJ5A 3TKSA 3EU3A 2QSIA 2EC4A 4OWYA 5IMDA 1F2EA 4H86A 1XW5A 3ZVJD 1OKTA 4MPGA 2LS5A 4PNGA 3WD6A 4OMVA 4EDZA 13GSA 2LV3A 1GUMA 5F05A 5INYA 1FOVA 2K8SA 1JZRA 2XC2A 1X5EA 2GT5A 3S9FA 3VFIA 1V57A 4K9ZA 1WJKA 1A0FA 3F6DA 3F4RA 1ILOA 2MMZA 4AJ6A 5ECLB 1PL2A 1SD9A 3PH9A 1Z6NA 2ES7A 1YEPA 4V1Ag 3GKNA 4BWSA 2H71A 2AJQB 1TJDA 2FNOA 3WGXA 4HQSA 3G7JA 4FIWA 3EMPA 3IC4A 5EVOA 3UOMA 2REMA 3TDGA 1HYUA 3ZREA 4NV2A 2O7KA 2WJUA 4EXJA 4LLRA 4EE0A 4ECIA 5JWOB 3UARA 2LRNA 2JZTA 2B6MA 2I4AA 2H6XA 2L6CA 4NV5A 3DD3A 4CHSA 4V2LA 2NPBA 5D96A 5FHIA 2P0GA 1S3CA 2DBCA 2KHPA 1TP9A 4POMA 1HNCA 4XIHA 1VF3A 3ERFA 2HT9A 2QKEA 2OACA 4XRAA 1RQMA 5L71A 3VPQA 3HZ8A 3HA9A 4IKHA 3F63A 1XPVA 2A4VA 4J56E 1OC9A 4PUAA 1U3IA 3GTUA 3QFBC 3C8EA 2VM1A 4ZBDA 2JZSA 3L9UA 3F8UA 2A2RA 1YF0A 4EUYA 1WWJA 2H6YA 3ZITA 2JL4A 2L6DA 4MZCA 3C1RA 4GQFA 4L5LA 1XBSA 3APSA 3BD2A 3TRPA 2G2QA 5IMCA 4K8MA 4LMWA 3C71A 3M1GA 4ZBBA 3UVHA 3K8NA 4DSSB 3N9JA 1AXDA 3VWWA 4MPFA 4N0ZA 5ECKB 2C0DA 1YZXA 5JWQB 1EOGA 2CX4A 2J9HA 3GYKA 5G5EA 4JBBA 3RPPA 1Z7RA 2I81A 1MD4A 3NIVA 1TRUA 5D9XA 4IQAA 2C4JA 3EE2A 2HSYA 1MD3A 1ZCPA 2H72A 1SKWB 2PMTA 1T1VA 4GRFA 5HR0A 4X43A 2E0QA 2DMLA 2ZCTA 1WOUA 3F4TA 1RK4A 1R7HA 4AJ7A 2LJAA 4BWQA 2IMIA 3DMLA 3QAVA 3H1NA 1EV9A 2V32A 3O76A 4ML6A 3Q18A 2IWTA 2L59A 2ON7A 5IO2A 5DBQA 4HOJA 3V1WA 1N8JA 2J23A 4MCUA 5KN1A 3IBHA 3HKRA 1BJXA 1UN2A 3F0IA 2FUG2 2VLTA 4AGSA 3A3TA 2G0FA 4I5QA 5CO3A 2IMKA 2OA7A 2HRNA 1V40A 2JADA 2GZPA 2O87A 1UC7A 3MNGA 2VCQA 1SK2A 4JEDA 1S3AA 2OE1A 3ZVJA 5IOXA 1XCCA 2RIIA 2LJRA 4GCIA 2FWFA 4MZBA 3P7XA 3UEMA 14GSA 1FW1A 3GRXA 4AJ8A 4QQ7A 1PD21 4GQCA 2LJKA 3AY8A 4PQIA 1X9WB 2PBJA 3DXBA 2VCZA 1HQOA 1XW9A 1GUKA 3EINA 2MBTA 4N30A 2RM6A 1H4OA 4WR4A 4I8BA 3KP9A 1AAZA 1V9WA 5ECIB 1EP8A 1PKWA 5F8BA 2FGXA 4MF6A 1ERWA 5B6NA 3F6FA 3IXRA 4L0WA 2OBKA 4RI6A 4ZBAA 2X8CA 1Z6MA 3VK9A 1UA5A 5EL8A 6GSXA 3D4TA 5COHA 3CTGA 1BG5A 3HY2A 5B6MA 2LNSA 4PQ1A 3MWHA 2YV7A 1V98A 2C3QA 3C7MA 3IAM2 3US3A 1SYXA 1QFNA 8GSSA 1YQ1A 3P2AA 4FYCA 1PN9A 2H1BA 3GH6A 5E59A 3VI5A 2OADA 3E9JB 6GSYA 2R3XA 3H8QA 1KEBA 5CYYA 3HVVA 5CREA 3TJBA 1K0BA 1GSQA 1ERVA 2MMOA 1YY7A 3WT1A 3BBYA 5ABRA 3MDKA 3LXZA 3UBLA 1BYEA 4JR6A 4Q5RA 1THOA 3DKSA 2P5RA 2VCWA 1VRSD 1ZYQB 3IV4A 5FWGA 4I97A 3FK8A 1B4QA 3TKRA 1WP0A 1QGVA 4L5OA 5ELAA 3DVXA 4ISDA 3DGQA 4I2TA 3QCPA 3GNJA 4TN8A 4JU5A 3QAWA 3TJJA 4WEYA 2KUCA 1URMA 5LD0A 3IK7A 1B9YC 5H5RA 5ENUA 4RQXA 1WMJA 5D73A 1U6TA 1R26A 1NSWA 3FZ4A 2ZUPA 2AYTA 3CSHA 5D8IA 3GA4A 4K0NA 2A2SA 2K18A 1PKZA 1AC1A 9GSSA 3J7Yb 2FWGA 4I6XA 5D9VA 2GZYA 2I3YA 2NDOA 2LNTA 4IGJA 3ME7A 1ML6A 4WR5A 4WXTA 5D9WA 1I5GA 3R2QA 1KNGA 2CAQA 3W8JA 4Q5NA 2OBIA 4KA0A 2H0GA 4MLYA 3A5WA 1ZGNA 5IMVA 1XFLA 2M46A 2YWMA 3QAGA 4YQUA 4ZIJA 1M0UA 4MF5A 3TKSC 4RI7A 2FA8A 4ECBA 4QL7A 3L4NA 3LSZA 4TVEA 4HUAA 4DVCA 3FRCA 2GSRA 1O81A 3ERGA 1MTCA 2M80A 2CVDA 1M2DA 4MH2A 5HQPA 2IMDA 2N5FA 4Z7XA 5DALA 2OE3A 1TKDB 4POLA 3FZAA 4BVXA 3KZQA 1SYRA 2RUEA 4NAXA 3HHVA 2X64A 2C0FA 5JCWA 1A2JA 1UVZA 1DE2A 3CTFA 1ZL9A 4WBRD 2B5XA 3ZL5A 2YANA 2WDUA 2TRXA 1PGTA 3GIXA 5DAKA 1GNWA 4ZL8A 4KE3A 5IQYA 5AIXA 3TOTA 4YAVA 5FT3A 3KGKA 2KOKA 1EZKA 2PVQA 1T00A 3LYKA 1F3AA 2OJLA 4PX1A 3IOSA 5IOWA 3A2VA 4F03A 4ZL7A 2E2GA 2LSTA 1R5PA 4KNDA 2X8GA 3A2WA 3EWLA 3TJKA 3APQA 2JU5A 6GSTA 5C00A 1PX7A 1JZWA 5ID2B 2AAWA 3KXOA 4KSMA 5KN2A 2KP1A 1ERTA 2YWOA 4HJMA 2KP2A 5KN0A 4E8HA 3HJOA 5DJMA 3FR6A 1CQGA 2IMEA 3TGZA 1I9DA 3LFLA 2HZEA 1SKSB 2VL9A 3G7IA 3W8SA 1XWAA 2H19A 5EY6A 4ZL9A 1TK0B 2F9SA 4GSNA 2JSYA 2WGRA 5ECRB 2CQ9A 5G1LA 1YKCA 1GTIA 3EU4A 4KAEA 1U3AA 3GN3A 3QR6A 3KM6A 2QGVA 3VWVA 1T8EB 3LJRA 3LWAA 5HFKA 1MDJA 4XTSA 1AQXA 3GKKA 3IK9A 1A2LA 4K7IA 2PGTA 4LMVA 4O32A 3TJGA 3KH7A 4PXOA 1Z7PA 1LU4A 2HSHA 3FKFA 4ZB8A 2H74A 1YJ6A 2TRCP 2H1DA 1ZZYA 1F6MC 1Q4JA 1XWKA 4J57E 1TDIA 3TRXA 2DIZA 3CRUA 2H0HA 2WB9A 2O89A 1TK5B 4EL1A 3EURA 2C80A 1EP7A 3I69A 5CRWA 3KTLA 3UBKA 1TK8B 3E0UA 2IMFA 2IFQB 5EPFA 1B8XA 2FCHA 2DC5A 4WETA 1M9BA 4K7NA 4BPYA 2CV4A 1V58A 4IW9A 1A0RP 2F51A 2XBQA 3M3MA 6GSSA 2O8VB 1GSFA 3ZIVA 2FD3A 2NTOA 1USBA 4HJ2A 2GDRA 3N5OA 4IP1A 1M2AA 3NZNA 4OD7A 4PUFC 4NHWA 4HZ4A 2B7KA 1R5AA 5AIVA 2VOCA 4TR1B 2HYXA 10GSA 1GSYA 4DEJA 4WF4A 2HFDA 2QC7A 4ULXA 1ON4A 5HFIA 3GSTA 5D93A 2LKUA 2DSAA 2WRTA 4BVYA 2VCTA 2IIYA 4KCAA 5IMZA 2H66A 1EV4A 2YZHA 3CYNA 3F4SA 1AW9A 3WYWA 4RUVA 3CXGA 5DJLA 4L8EA 2LEGA 3KH9A 2E7PA 2GSTA 5IO0A 4TRXA 2EIQA 1XW6A 2VL2A 3EC3A 3TUEA 1O7UA 3E3EA 2C3TA 3FW2A 2BJXA 2FA4A 17GSA 1JHBA 3QMXA 1BAYA 3KIJA 3UIWA 4IQ1A 2GLRA 1SENA 2AHEA 4MJBA 3VPTA 2DJ1A 1O8XA 4PURA 1GSEA 2BTOT 4Q5QA 1TRWA 3ED3A 2FWHA 1A8LA 1AQVA 2AUVA 3MSZA 5LNKe 5GZZB 3DVWA 2LQOA 1YF1A 4NHZA 4N0VA 3DEXA 1FHEA 2OKAA 1Y6EA 3F3RA 2R4VA 3P8WA 1RW1A 3HVSA 3RDWA 2F8FA 1F37A 3GKMA 1XXUA 1M7TA 2L57A 5J3RA 1M9AA 3BCKA 1VF1A 2Z9SA 1A8YA 2L5OA 4KSOA 2L4CA 2H73A 1AQWA 3ERWA 2PWJA 2C3NA 2H1AA 4YH2A 3FZ9A 2VL3A 5JWRB 3C1SA 2X8HA 2NVLA 2KLXA 2B1KA 3F3QA 4XS4A 3VURA 3UVTA 3TRQA 1O8WA 1ST9A 5DCGA 3VWUA 2BMXA 3TKSE 3P90A 4F82A 5J9CA 2GS3A 4MDCA 3TKPA 5HR2A 4JZQA 1K0CA 2O85A 4O7HA 3GUSA 1Y25A 2R6KA 2L4QA 1BX9A 2XPDA 4E8EA 3D21A 4HZ2A 4OO4A 2FY6A 4AF2A 2DJ3A 2EIOA 4JRRA 4HEA2 4DSRA 3CBUA 3VI7A 4ECJA 3U5RE 2F8AA 4GSSA 1SD8A 4IVFA 3ME8A 5GSTA 2YNXA 1ERUA 1WRYA 1XOBA 2CZ3A 1FG4A 3C73A 3VWXA 1TU7A 3LGCA 3GMFA 1XWBA 3DWVA 6GSUA 5J4UA 5IMAA 1XVQA 3D6IA 3BOAA 4EC0A 2RLIA 2PVOC 4CW9A 3QDNA 2CA8A 5G1KA 1FO5A 3CSJA 1XIYA 5DVBA 2V6KA 3GHAA 4POBA 4HU9A 19GSA 1OYJA 3BCIA 2LUSA 3SBCA 2LTKA 2DJ0A 1GNEA 1QMVA 3ISOA 2NBSA 4MABA 1SL0B 3ZRDA 2DMMA 4KH7A 1LBKA 2IL3A 5AGYA 1SK0A 4EVMA 2YN1A 4MZWA 1HNBA 5B7CA 2R2JA 3WGEA 4BL7A 1EGRA 1OE7A 2GQMA 2HZEB 5ECSA 2N5BA 3EYTA 3GX8A 4NXIA 2D2ZA 5IPHA 1GULA 1O73A 5CNWA 5H5QA 2H8LA 4OFTA 2LRTA 1Q98A 1K0MA 11GSA 5KN3A 4OO5A 4WKWA 5C04A 18GSA 4PGTA 4EO3A 2DJ2A 4MK3A 5A4VA 2C8UA 5F0GA 3I6AA 1BQ7A 2I1UA 3D22A 1OVNA 2LRCA 3DIEA 4TXOA 3LG6A 3FY7A 1MEKA 4I2UA 2VD1A 3UMAA 2GQKA 4JR4A 1OKDA 2HXKA 1TOFA 1G0TA 1MDIA 1SL1B 1E6BA 5A4UA 1OC9B 1ABAA 5ECNB 3GTUB 2YV9A 1VGLA 3ZMKA 4GF0A 4OFMA 4NWYA 1VF4A 3IR4A 3ZTLA 2GQLA 3L9SA 2YWIA 5ECOB 4GSTA 3HJMA 5E4WA 5ECHB 4RQRA 2VD0A 3UAPA 3M8NA 4IN0A 1G6WA 1ZMAA 1Z9HA 1PX6A 1GLPA 2DJKA 2PERA 2XBIA 4V2MA 1GTAA 3NOFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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