The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
ASTQPTHSWKVGDKCMAVWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SURVIVAL OF MOTOR NEURON-RELATED-SPLICING FACTOR 30
|
| publication title |
Structural Basis for Dimethyl-Arginine Recognition by the Tudor Domains of Human Smn and Spf30 Proteins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Rna binding protein
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| total genus |
10
|
| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-10-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LH0 A; 3MP8 A; 3QBY A; 3S3N A; 3O8V A; 2RI2 A; 2L8D A; 2BIV A; 2JTF A; 1WJR A; 3MEA A; 1OYX A; 5FRM A; 4QQD A; 4PLL A; 3L2V A; 2GFU A; 3NTI A; 2R58 A; 3GOX A; 3S3O A; 5C6S A; 5J39 A; 2MWP A; 2R5M A; 3OYH A; 3MEW A; 3MET A; 2X4W A; 3NTK A; 4B9W A; 1WJQ A; 3PFS A; 3FDR A; 3MP6 A; 5FRN A; 2L3R A; 1MHN A; 2MWO A; 2EFI A; 3NTH A; 4IUQ A; 4EDU A; 5M9O A; 4B9X A; 3OYN A; 2PQW A; 3E9F A; 3SD4 A; 3OYD A; 3S3M A; 3OYI A; 5J26 A; 3OS2 A; 1OZ3 A; 2XK0 A; 3FLG A; 4BE0 A; 5C0M A; 3OYE A; 4C5G A; 2RJF A; 1RI0 A; 4BDZ A; 4RG2 A; 4IUT A; 2DIQ A; 4IUU A; 3PMI A; 4BE2 A; 1WJS A; 2RHX A; 3LX7 A; 2LTO A; 3OY9 A; 4A4F A; 2EQK A; 1OI1 A; 3DB3 A; 5KCH A; 5D6Y A; 4IKF A; 2YRV A; 3P8D A; 3MEV A; 3OYC A; 4FL6 A; 2X4X A; 3OYB A; 3FC3 A; 3PMT A; 2EKO A; 2HQX A; 2RHI A; 2RJE A; 3M9Q A; 4QVZ A; 5KE2 A; 5KH6 A; 3OS1 A; 3OYL A; 4QQ6 A; 3OA6 A; 2E5Q A; 3UWN A; 2X4Y A; 3E9G A; 2EQJ A; 4PL6 A; 4N4I A; 5KCO A; 3OYK A; 4E7J A; 2RO0 A; 4OVA A; 2O4X A; 3P8H A; 3FEO A; 3H6Z A; 3ASK A; 3OMC A; 4Q5W A; 2IG0 A; 2D9T A; 3UT1 A; 2DAQ A; 5CIU A; 4Z02 A; 2B8A A; 5IAY A; 3OYM A; 4BDY A; 4ZTJ A; 4II1 A; 3BDL A; 3QKJ A; 4GY5 A; 4A4E A; 3C4S A; 4IUR A; 4BD3 A; 3LLR A; 2G3R A; 3OYJ A; 3MEU A; 4E7I A; 2GFA A; 1KHC A; 2FHD A; 2NLU A; 2X35 A; 4BE1 A; 2RJC A; 4UC4 A; 2E6N A; 2HQE A; 5D6X A; 4CRI A; 2CKK A; 4ZTF A; 3Q1J A; 1H3Z A; 3L2R A; 3OQ5 A; 3L2U A; 2O4X B; 2RHY A; 4LD6 A; 3OYA A; 3CEY A; 2L89 A; 2RHU A; 3F70 A; 1XNI A; 2RI3 A; 3L42 A; 3MO8 A; 4C5I A; 1OZ2 A; 4IUP A; 3ZEH A; 2RI5 A; 4N4G A; 2BKD N; 2K3Y A; 2DIG A; 1WGS A; 4E7L A; 3KUF A; 3OMG A; 2LVM A; 2QQR A; 2WAC A; 2LDM A; 2LRQ A; 2BUD A; 2M16 A; 2RHZ A; 3MP1 A; 4FU6 A; 5KE3 A; 2JZ2 A; 1SSF A; 4X34 A; 3OYF A; 5FRO A; 3QII A; 2R57 A; 2F5K A; 3QJ6 A; 1G5V A; 1N27 A; 2QQS A; 4QQG A; 4A4G A; 5D6W A; 4QW2 A; 3H8Z A; 4NS5 A; 2M1H A; 5IN1 A; 4BAC A; 3EAE A; 3LYI A; 2RJD A; 2XDP A; 3OYG A; 2VYT A; 4A4H A; 4C5E A; 3LGF A; 4E7H A; 3L2Q A; 4L59 A; 3S6W A; 2LCC A; 4HCZ A; 4IUV A; 4N4H A; 3PNW C; 4PLI A; 2P0K A; 2M0O A; 2R5A A; 3LGL A; 2EQM A; 2EQU A; 4E7K A; 3DB4 A; 3OB9 A; 3L2W A; 3ME9 A; 2K3X A; 3OS0 A; 2GF7 A; 4C5H A; 3DLM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3I56 T; 1WJR A; 5KYY B; 1KQ2 A; 3M4Y A; 5FU6 B; 1I81 A; 2DMO A; 4J9D A; 2YSQ A; 3S3O A; 3OW2 S; 2RQT A; 2EJG A; 2ZAE A; 2AKL A; 4FT4 A; 1QVF S; 2DXB A; 3NGP A; 1YI2 Q; 1VQP A; 4DOW A; 3BW1 A; 2XK0 A; 1M1K U; 3CCE Q; 4O5V A; 3CCR T; 3QUI A; 4JRQ A; 3PMI A; 1YJW A; 3I55 T; 2KRN A; 2DFU A; 2OAW A; 2EYW A; 4M78 D; 3JCM g; 1BCM A; 1VQ8 A; 2YRV A; 1JB0 E; 3MEV A; 5A2Q E; 4BB7 A; 5GAO l; 3M55 A; 2EJ9 A; 1W6X A; 1QW1 A; 1VQK Q; 1KD1 R; 2RQU A; 2EW3 A; 1M9S A; 2MF2 A; 2E41 A; 1YWO A; 4M7A B; 4HA8 A; 1YJN A; 2ZCF B; 4RKU E; 2J6O A; 3IQL A; 1X6O A; 1RL2 A; 1WHH A; 4RUG A; 1QCN A; 1UG1 A; 1ZX6 A; 2KT1 A; 4IUR A; 4JJN K; 2GFA A; 4E7S A; 4KUL A; 3EGU A; 2E6N A; 5A0G A; 1UGS B; 1QP3 A; 1X2K A; 1PSF A; 1F1B B; 1VQ6 Q; 1YIJ A; 1ZBJ A; 1N8R C; 1RAA B; 2DZ9 A; 2LJ0 A; 1HJD A; 1GRI A; 1XTD A; 5GMK j; 4XU0 A; 2HKQ B; 4PKC C; 5FU7 C; 1SHG A; 4FU6 A; 3H41 A; 2K5L A; 4FYY B; 2LC4 A; 3JRZ A; 1AWX A; 2V1R A; 2ED1 A; 5GAM h; 3QPH A; 3THK A; 1Q95 G; 3CCQ T; 2QXF A; 3TCJ A; 1D1B A; 3CC2 T; 2JMC A; 2EGE A; 4L59 A; 3PNW C; 1YJ9 A; 1D3B A; 4FIB A; 1U1T A; 4E7K A; 2EKH A; 4PJL A; 3OS0 A; 2GF7 A; 4JZ3 A; 3M0T A; 4KT0 E; 2C0O A; 2BIV A; 3QG1 A; 2GFU A; 2JN0 A; 3VS4 A; 1UGQ B; 2P0P A; 2ZGW A; 1UGP B; 1UHF A; 2F5T X; 8ATC B; 1Y7X A; 2DL7 A; 2VGN A; 3OS5 A; 3CME T; 5IHK A; 4L5G A; 3EFO B; 2JVV A; 1SRL A; 4AFZ C; 4HCK A; 2DD5 A; 3CCV Q; 2DE0 X; 4XTZ A; 3AT1 B; 1Q7Y C; 3E2U A; 5CCA A; 2YWW A; 4JDS A; 1NEG A; 3VS1 A; 1S1N A; 3OYC A; 4M4Z A; 1UDL A; 2LX9 A; 3U23 A; 1M1K R; 1O75 A; 2EWN A; 3VV0 A; 2EQJ A; 4M75 B; 2LQK A; 1WQ7 A; 1Y07 A; 2MK5 A; 2BE7 D; 3PVQ A; 4BI8 B; 5GJV B; 2O01 E; 2KRO A; 1IRE B; 3CCJ A; 3GPL A; 2M0Y A; 1AT1 B; 5IXB A; 4M7D E; 3X25 B; 2E3I A; 2KNB B; 1UGR B; 2RHU A; 1YCY A; 3VS7 A; 1M2V B; 1OZ2 A; 3JV3 A; 2VB6 A; 1K8A U; 1SG5 A; 1X27 A; 2FPE A; 4C0G A; 1G8X A; 3CPW S; 5KE3 A; 3CC7 T; 5HK0 A; 1B07 A; 5GMK h; 1N27 A; 2L3S A; 4XU2 A; 2DL5 A; 2DX1 A; 2XDP A; 3VS5 A; 4PJO B; 2CZ1 B; 4M7D F; 4F7U B; 1GFD A; 2R5A A; 2EQU A; 3QDF A; 1PC0 A; 4C8Q B; 4R55 A; 1KQS S; 2VKN A; 2QDL A; 5LJ3 e; 3EG2 A; 2J05 A; 1C0M A; 1GFC A; 3O8V A; 2QEX T; 2QA4 Q; 2ZPB B; 1I5O B; 5J3B A; 5LJ5 j; 2QG9 B; 1K76 A; 4ZGD B; 3GNG A; 2AHJ B; 3PFS A; 4F17 A; 4HT8 A; 3DKM A; 2AK5 A; 4ZN3 A; 1MV3 A; 3E9F A; 3G71 T; 3CBP A; 5I2S A; 3VS2 A; 1JJ2 S; 1Q82 U; 1KC8 C; 3H9N A; 4M7D G; 4J9G A; 1ZSZ A; 1Y57 A; 2FB7 A; 2ROL A; 1NJI C; 3V7C A; 4J9C A; 4A63 B; 4QVC A; 1ZA2 B; 3H0I A; 1OU9 A; 2QTX A; 2K6D A; 2KMT A; 1VQ4 Q; 2DK3 A; 3EG9 B; 4N4I A; 2FL7 A; 3I5R A; 2JS0 A; 1C6V X; 2JTE A; 3ZL7 C; 2SEM A; 2DNU A; 4F04 B; 2DBK A; 2K5F A; 2B8A A; 3HP9 A; 5LJ5 f; 2F2W A; 2LCS A; 4QT7 A; 5GAO p; 4XTW A; 1B3Q A; 4JRI A; 2KGT A; 3OYJ A; 3QYG B; 3I56 Q; 3OYY A; 3X26 B; 1QVG A; 5GAM e; 1AZE A; 1UTI A; 1XOV A; 1HYO A; 1YN8 A; 2KR3 A; 1SKU B; 2CP6 A; 2RH2 A; 2COZ A; 1IXD A; 3JCM P; 2RQV A; 3MO8 A; 4C5I A; 1YHQ A; 2NWM A; 3UA6 A; 3E19 A; 4N4G A; 5HY6 A; 3G4S T; 1YWP A; 2DPP B; 1SPK A; 2JS2 A; 1KD1 C; 4DBR A; 4FCY A; 5DLQ E; 4JRP A; 3OYF A; 3CCU T; 2W0Z A; 1XJW B; 3G7Z A; 1OPK A; 4LD9 K; 4RTT A; 1BI3 A; 2E6Z A; 3PVL A; 4M7D C; 1G5V A; 2CZ7 B; 3J80 E; 2KXD A; 1WLP B; 2QAZ A; 2VYT A; 3FIF A; 1K8A R; 1G3Y A; 4M75 A; 4M77 B; 1ZQ1 A; 4MDW A; 1FXX A; 2DBM A; 3CCL A; 4KGV B; 1MMA A; 4AG2 C; 3S3N A; 2XG8 D; 1NYG A; 4IIO A; 4J6X A; 1U1S A; 3LH0 A; 1WI7 A; 2CUD A; 4M78 B; 2RF0 A; 2HNI A; 2EIF A; 1BI0 A; 1PG5 B; 3V7S A; 1R77 A; 2RB6 A; 3MEW A; 1K73 U; 1W2B A; 3KXT A; 3OYN A; 2PQW A; 2XDD A; 3OYI A; 4JPB W; 2BZ8 A; 2K4Y A; 3M54 A; 2IPO B; 3X28 B; 1W70 A; 1WQW A; 3CC4 Q; 5CKH A; 1FYN A; 3RNJ A; 4WCI A; 1M90 U; 5A0D A; 1BU1 A; 3UAT A; 5D6Y A; 3GNF B; 1PD0 A; 1VQN T; 1VQ6 T; 1YCS B; 3OA6 A; 2GNC A; 1Q82 R; 1VIF A; 3SB2 A; 3UT1 A; 3CCQ Q; 1GCQ C; 3QWY A; 4CI0 C; 3UDC A; 3A8M B; 3OYM A; 1E7O A; 3J7A F; 1NZ9 A; 1WXB A; 4GY5 A; 2JJ9 A; 3JCM d; 5GAN g; 4AFQ C; 1UFF A; 4LN2 A; 2HSP A; 4N0A A; 3DLL A; 4FSS A; 2V8J A; 5GMK e; 5GAN 3; 4BE1 A; 4J83 A; 3RKW A; 1TWB A; 4OMP A; 1ZUK A; 3C0C A; 2CP0 A; 5KYU A; 4XAX B; 4C92 E; 1XNI A; 1AZG B; 1W2B P; 4IUP A; 2WAC A; 2FYK A; 9ATC B; 2E70 A; 2HCK A; 3TQ7 P; 2R57 A; 1YIT Q; 3MKD A; 1QP2 A; 1BIB A; 4XTY A; 1KQ1 A; 3GIB A; 1RAG B; 1H64 1; 2ZPG B; 1I8F A; 2E10 A; 4PLI A; 2KK4 A; 1KSW A; 4C92 F; 4BY6 B; 3OB9 A; 4OB2 B; 2DYI A; 2K3X A; 2L3P A; 2Z0W A; 2HZY A; 1Y0M A; 1YI2 A; 2J7I A; 4PLL A; 5FWC A; 2FPF A; 2YRD A; 1WA7 A; 3CCE A; 2F1L A; 4KUI A; 2OTL T; 1NE8 A; 2GTO A; 3CD6 Q; 2AKK A; 4FW1 A; 5CKE A; 3R6N A; 3CXC S; 1VQK A; 4IUT A; 3OW2 A; 2K7A A; 2HQH A; 4ANJ A; 5KCH A; 1K73 R; 3HFN A; 1QVF A; 1FMK A; 4CC7 A; 2EQI A; 2DZC A; 1AVZ C; 3CC7 Q; 5LJ3 j; 2KDS A; 3G6E Q; 4JS5 A; 1M90 R; 2O88 A; 1JXO A; 2HEQ A; 1BI1 A; 1MNE A; 1QMC A; 2PVG B; 1NYF A; 1OUL A; 3QYH B; 4MZM A; 3C4S A; 1RLQ C; 1TG0 A; 2SRC A; 4JUV A; 3TU4 K; 4M7D D; 2JOY A; 1VQO A; 1VOM A; 2XD0 A; 3Q1J A; 4EMK C; 4JRK A; 2Y90 A; 2L0A A; 2QA4 T; 1D0X A; 1X69 A; 4XTU A; 4V2S A; 3KUF A; 1WNL A; 5GAN 5; 1VQM T; 3MP1 A; 3G71 Q; 1S72 A; 3JB9 I; 2LQN A; 3OW2 P; 3KBG A; 3WVD B; 1I07 A; 2CZ6 B; 4BAC A; 4C92 C; 3QWX X; 5LJ3 f; 1VIE A; 1RLP C; 2Y4X A; 1QVF P; 4IUV A; 4RTX A; 2GQV A; 1D0Y A; 2COY A; 2XI9 A; 2K2V A; 3DLM A; 3URG A; 4JLG A; 3QBY A; 4D6W A; 1D1A A; 4RMO A; 2VXF A; 2RI2 A; 2L8D A; 5GAM j; 3TSW A; 2RNA A; 5GAN 2; 2EYZ A; 1VQ4 T; 4O6J A; 3NTI A; 1HD3 A; 3CCV A; 3JB9 F; 2MWP A; 3RDV A; 3MET A; 2E3H A; 3MP6 A; 1R8O B; 4IIM A; 2OTJ A; 2J6F A; 2LNH B; 2DLP A; 4EMK A; 3OSV A; 3CCM Q; 5KYN A; 1NBE B; 1K8A C; 1VQ5 T; 2RHX A; 4DQ2 A; 4PJJ A; 5GAO n; 5CO7 A; 1ZUY A; 4GLM A; 2IVW A; 1Q86 C; 1RI9 A; 3G4S Q; 4MMK A; 2CT4 A; 5KE2 A; 2V1Q A; 2YDL A; 2EPD A; 3UWN A; 3CCU Q; 4BI3 A; 2M9U A; 3L2Z A; 4C92 A; 3V8L A; 2YUN A; 4XU3 A; 5CK9 A; 2D6F A; 5LJ3 h; 3CBO A; 5GAM f; 3LH5 A; 4M7A E; 1U06 A; 2O9V A; 1FWZ A; 4EIK A; 1PKS A; 3REB B; 2DXC A; 1GXI E; 4DBF A; 4E7I A; 1Y71 A; 4JS4 A; 1U8R A; 2GCX A; 1JRI A; 2A36 A; 1N5Z A; 4RTY A; 1TOV A; 2ZZD A; 2A0F B; 1VQ7 A; 2NUZ A; 1RAI B; 1OX8 A; 1EZZ B; 4OMN A; 2RI3 A; 2EYQ A; 4MZP A; 3WVE B; 2JW4 A; 2K3Y A; 3CCS T; 4M7A F; 1Q82 C; 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5GAN d; 1M90 C; 3QII A; 2VWF A; 2F5K A; 3V8K A; 2KRM A; 3M0U A; 3CD6 T; 2LCL A; 1FX7 A; 1LNX A; 2KVQ G; 3D7S B; 3VUZ A; 3L2Q A; 4PJO E; 2RMO A; 3LWH A; 2YXY A; 3C95 A; 2HAX A; 2K5I A; 1X01 A; 1ZSZ C; 4C8Q E; 2PUK B; 4PFO A; 3INZ A; 2QGG A; 3RUX A; 4FSX A; 4M75 G; 1NPR A; 2V26 A; 3L2V A; 2CH4 W; 1Q86 U; 2GBQ A; 4J7I A; 2PZ1 A; 4ME7 A; 2PUO B; 3SFM A; 3G6E T; 2CT3 A; 5CR2 A; 2X4W A; 3NTK A; 1TU0 B; 2CP2 A; 1YJW Q; 3E1S A; 3EGD B; 1IO6 A; 4JJB A; 1VQ8 Q; 5J26 A; 1E6G A; 1X43 A; 4M7A A; 4F16 A; 3PE0 A; 3SWN A; 3OY9 A; 1OI1 A; 2JNG A; 1AOJ A; 2KEA A; 4RCC A; 3H0H A; 3CCQ A; 5FW9 A; 4PFP A; 3CC2 A; 2HQX A; 1VQM Q; 1ABQ A; 4M7D B; 4XTV A; 1YJN Q; 4DBQ A; 4J9I A; 2X4Y A; 1KIK A; 2HBW A; 3VS3 A; 2QYZ A; 3JCM W; 1OX9 A; 2P84 A; 4Q5W A; 2RPN A; 1YP5 A; 5GAO q; 4HCC A; 3HTR A; 2HL3 A; 3UPU A; 3T9N A; 4A4E A; 1YIJ Q; 2FZK B; 1QCF A; 4M75 C; 2DA9 A; 1SHF A; 3CME A; 5D6X A; 4QKU A; 2O4X B; 1H8K A; 1T0H A; 1QWE A; 2CP3 A; 4GBQ A; 1V1C A; 1LCK A; 3M4G A; 1ZSG A; 1B34 B; 4X9C A; 2DRM A; 1SSF A; 2RN8 A; 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