The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
64
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structure length |
64
|
Chain Sequence |
ASTQPTHSWKVGDKCMAVWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis for Dimethyl-Arginine Recognition by the Tudor Domains of Human Smn and Spf30 Proteins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Rna binding protein
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| molecule keywords |
SURVIVAL OF MOTOR NEURON-RELATED-SPLICING FACTOR 30
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| total genus |
10
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-10-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XK0 A; 2EQM A; 2RO0 A; 2LCC A; 2LDM A; 4ZTJ A; 2MWO A; 2JZ2 A; 3P8H A; 3OYL A; 4QW2 A; 2GFU A; 5KCH A; 2JTF A; 2DIG A; 2QQR A; 3F70 A; 5FRO A; 2EQU A; 2LRQ A; 3CEY A; 4X34 A; 5KH6 A; 3FLG A; 3OYE A; 3O8V A; 5CIU A; 3L2R A; 2WAC A; 3MEU A; 3FDR A; 2RJD A; 3OYC A; 3NTH A; 4BE2 A; 2D9T A; 2R5A A; 2VYT A; 3P8D A; 3Q1J A; 4PLL A; 3OYB A; 4NS5 A; 4E7L A; 3MEW A; 4A4E A; 3OY9 A; 3OA6 A; 5IN1 A; 3E9F A; 4IUQ A; 3H6Z A; 3L2Q A; 4BAC A; 3PMT A; 2L8D A; 3S3N A; 2PQW A; 2CKK A; 3LYI A; 2EQJ A; 4ZTF A; 4BE0 A; 3KUF A; 4E7K A; 1WGS A; 3DB4 A; 5D6X A; 2RI5 A; 3NTI A; 3OMC A; 2L3R A; 3FEO A; 4PL6 A; 3QII A; 2XDP A; 4II1 A; 3S6W A; 4N4I A; 1XNI A; 2RJE A; 3L2W A; 1H3Z A; 2NLU A; 3QJ6 A; 3PMI A; 5IAY A; 3QKJ A; 3S3M A; 3OYH A; 5D6W A; 2P0K A; 4PLI A; 3MET A; 3SD4 A; 3OYI A; 4BE1 A; 2RHU A; 4HCZ A; 3E9G A; 4E7H A; 4IUT A; 3MP1 A; 2R57 A; 2MWP A; 4RG2 A; 2E5Q A; 3L42 A; 2F5K A; 3L2V A; 3MEV A; 4BD3 A; 4C5H A; 3MP8 A; 3OYD A; 3UWN A; 3OS2 A; 2RHI A; 4Z02 A; 5KE3 A; 4QQ6 A; 2M16 A; 3MO8 A; 2IG0 A; 4N4H A; 2R58 A; 2HQX A; 3LX7 A; 2RJC A; 4IUR A; 4A4G A; 5J26 A; 1OYX A; 1KHC A; 3PNW C; 4C5E A; 2RI3 A; 4B9X A; 1MHN A; 4IUP A; 3OYA A; 4IUV A; 2K3X A; 3FC3 A; 2X4Y A; 4CRI A; 2RHZ A; 2G3R A; 2RJF A; 5C0M A; 3ZEH A; 4QQG A; 3OMG A; 4C5I A; 3NTK A; 2M0O A; 3OYM A; 2X4W A; 1WJR A; 4QQD A; 3MP6 A; 2RHY A; 2O4X A; 2X4X A; 3MEA A; 3OYF A; 3OQ5 A; 3OS0 A; 1G5V A; 2RI2 A; 2GFA A; 5C6S A; 4B9W A; 4E7J A; 1OZ3 A; 2BKD N; 2DAQ A; 4IUU A; 4N4G A; 4QVZ A; 2EFI A; 4A4F A; 4E7I A; 2LVM A; 4A4H A; 3OYG A; 3DB3 A; 3GOX A; 3LLR A; 4Q5W A; 3H8Z A; 4GY5 A; 4BDY A; 4L59 A; 2L89 A; 2K3Y A; 3ASK A; 2RHX A; 1RI0 A; 1WJS A; 4IKF A; 5J39 A; 2BUD A; 3OS1 A; 4FL6 A; 4BDZ A; 1OZ2 A; 2YRV A; 3DLM A; 2LTO A; 3LGF A; 3BDL A; 4LD6 A; 3UT1 A; 5FRM A; 2R5M A; 4FU6 A; 5D6Y A; 5FRN A; 2E6N A; 2QQS A; 2BIV A; 3OB9 A; 4UC4 A; 5KCO A; 5M9O A; 4EDU A; 3OYK A; 1WJQ A; 2GF7 A; 3OYN A; 3ME9 A; 2FHD A; 2EQK A; 1OI1 A; 3C4S A; 1SSF A; 2O4X B; 3OYJ A; 3PFS A; 2X35 A; 1N27 A; 4C5G A; 4OVA A; 2B8A A; 3M9Q A; 2EKO A; 2DIQ A; 3LH0 A; 2HQE A; 2M1H A; 3LGL A; 3L2U A; 3S3O A; 3QBY A; 5KE2 A; 3EAE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MML A; 3CC7 A; 1QKW A; 4C8Q F; 3JB9 H; 2KK4 A; 2EWN A; 3TRE A; 1OOT A; 5CCA A; 1OPK A; 1VQ5 A; 2D1X A; 3EG1 A; 2YRD A; 1KQS S; 4HCB A; 3I56 T; 3VRZ A; 1WNL A; 3LW5 E; 2RJD A; 2DE0 X; 3GIB A; 3NTH A; 3P8D A; 2E65 A; 3ZFJ A; 1RAI B; 4C8Q A; 2F2V A; 4J6X A; 1LPL A; 1JJ2 A; 5GAM f; 3OBY A; 4E7S A; 5D6X A; 1ACM B; 2AIR B; 1VQM T; 5I2M A; 5LJ3 d; 3URG A; 4II1 A; 3E1S A; 1KC8 C; 5IXB A; 1VUB A; 4C92 G; 3JCM c; 4J5Y A; 5GAN f; 1VQ9 A; 2LQK A; 2MK5 A; 4RG2 A; 1AOJ A; 3L42 A; 4RTX A; 2LNV A; 4BD3 A; 1Q86 C; 4J9D A; 4ZGE B; 2QEX T; 2XU8 A; 4BY6 B; 3JB9 D; 2QXF A; 1YJ9 A; 1ZSZ B; 1GBQ A; 1TSF A; 3PNW C; 3VV0 A; 4C5E A; 3OS5 A; 4MDW A; 4BUG A; 1IO6 A; 2LP5 A; 5HCK A; 2KRO A; 2RHZ A; 4OB2 B; 4Z89 A; 1UHF A; 1Y57 A; 3NTK A; 1T0H A; 3EG9 A; 1VQO A; 4PJO C; 2CT3 A; 3QJY A; 3QWX X; 4R55 A; 1SPK A; 2YHT A; 1G5V A; 3EHQ A; 3SDZ A; 1VA7 A; 4PJN A; 2SRC A; 2EKH A; 3G4S T; 3EFO A; 4ZN3 A; 5LL6 S; 1DJ7 B; 2L89 A; 3JCM f; 4IKF A; 1WPY A; 1UGQ B; 2HBW A; 4PJM A; 3EGX B; 2DL7 A; 2DYB A; 1Q95 G; 2X3W D; 2LCL A; 4R56 A; 2A3L A; 3EGX A; 1U06 A; 2DL5 A; 2M1H A; 3LGL A; 2RM4 A; 5GJW B; 1QCN A; 4M78 C; 4C92 B; 5A0D A; 1VQ4 Q; 2RO0 A; 2LDM A; 1RLQ C; 3F70 A; 2XHC A; 2HKQ B; 3M4Y A; 1Y96 A; 2JNG A; 1PC0 A; 1NYG A; 3VYG A; 1YJN A; 1WLP B; 3X26 B; 2PNI A; 2DTI A; 3V7R A; 1ZUK A; 2J6K A; 2JM9 A; 2ZPG B; 3C12 A; 2LX7 A; 1M3A A; 1ABO A; 5DLQ E; 1H64 1; 1R8O B; 1WGS A; 1NYF A; 2HNI A; 4LE9 A; 2NLU A; 2RN8 A; 2LJ0 A; 2X51 A; 3M57 A; 5I21 A; 2WSE E; 4J8O A; 4C0F A; 2CRE A; 4R0K A; 1YJW T; 5KYW B; 1UJY A; 4C92 F; 1W70 A; 2CP2 A; 1YHQ A; 2VGN A; 2HD0 A; 3EG2 A; 2OTL T; 3DLL A; 2CDT A; 1G3T A; 3LWH A; 1ARK A; 4XTU A; 2EBP A; 1OYX A; 1KHC A; 1PD0 A; 4JZ4 A; 1U1S A; 1R0C B; 2YSQ A; 4B9X A; 4C8Q B; 1PHT A; 4F7U G; 1KFZ A; 2QGF B; 3RUX A; 2EGC A; 2FRW A; 5GAN d; 3HL8 A; 4JDS A; 5CKF A; 4MZP A; 2K79 A; 3QDR B; 2LT1 A; 1M1K R; 2YWW A; 1Y7X A; 2HAX A; 1Y0M A; 4JS5 A; 1SF9 A; 2LQ8 A; 4FT4 A; 2VUB A; 4XU1 A; 4JJB A; 2F1L A; 3A8M B; 1K73 C; 4M7A A; 2KNB B; 1VQN T; 2KYB A; 3HHT B; 3CCE T; 3TSZ A; 2E64 A; 4ATO A; 2LJ3 A; 4DQ2 A; 2CUB A; 2QAS A; 4M77 F; 2BUD A; 2DL3 A; 2GGR A; 1TXQ A; 5IHN A; 3M53 A; 4J83 A; 5IHI A; 4MZT A; 3G6E Q; 2GTO A; 1SHF A; 5CK9 A; 2HKN A; 4Z8A A; 2L0A A; 2EPD A; 1HK9 A; 3L2U A; 2C0T A; 2VGM A; 3G71 Q; 3SFM A; 2JS2 A; 3VS1 A; 4WTO B; 3M0S A; 4ZTJ A; 4VUB A; 3BY7 A; 4Z88 A; 4JS4 A; 1QWF A; 1F1B B; 1T0J A; 4M7A F; 3M5A A; 3A98 A; 5IN1 A; 1KC8 U; 3H6Z A; 4FIB A; 3G71 A; 3S3N A; 2CKK A; 2KR3 A; 4ZTF A; 2RB6 A; 5GAN 7; 4AG1 C; 1Q86 U; 3QYH B; 4CC4 B; 1VYT A; 5FWC A; 1W6X A; 1M1G A; 4HCZ A; 4F7U B; 5D7U A; 4PJO G; 2GCX A; 3RBB B; 2DD5 A; 3CC2 T; 2G6F X; 3RNJ A; 1VQ7 T; 4E6R A; 3H0F A; 1VYU A; 4F7U A; 2DVJ A; 4A4G A; 4EMK C; 3WVE B; 2QA4 T; 2LJ1 A; 4M7D B; 1JQQ A; 5GJV B; 3I5R A; 4PJO D; 4M7A D; 4D6W A; 2RHY A; 4HKE A; 1VQP T; 1NEG A; 1W1F A; 1VQ7 A; 2DJQ A; 3CC4 Q; 1M8M A; 1R0B G; 3I55 Q; 4B9W A; 2BKD N; 2RPN A; 4IUU A; 4E7I A; 3HTR A; 2KRN A; 3AT1 B; 3LLR A; 3PIP A; 1ZSZ A; 2K3Y A; 1K9M R; 2XD0 A; 5GMK l; 2GQI A; 1E6G A; 1WDX A; 3SWN A; 4M7D C; 1OEB A; 5CAI A; 5KCO A; 1WIE A; 4PK4 A; 2DF6 A; 3I9Q A; 1OX8 A; 5LJ3 e; 1IGU A; 1T3S A; 4Y28 E; 4DBF A; 2DM1 A; 2F2W A; 5GAM d; 1KD1 R; 3LWI A; 1RAA B; 4KT0 E; 2QAZ A; 1VQ8 Q; 4OB1 B; 4OB3 B; 5CKD A; 1RAC B; 4P5N A; 1SRM A; 3JRZ A; 1YCY A; 2JJ9 A; 3JCM h; 2FYK A; 3NFC A; 4IIO A; 2PUK B; 5DLO A; 1G83 A; 3RKW A; 1VQL Q; 4E47 A; 1TUC A; 8ATC B; 2KXD A; 3CCU Q; 1P92 A; 1QVF A; 4JLI A; 2JM8 A; 1VIE A; 2R57 A; 4DBH A; 4WF2 A; 4NOY A; 2YRC A; 2IPO B; 4LDX A; 2F2X A; 2KVQ G; 4QQ6 A; 1I8F A; 1UDL A; 3I5S A; 2R58 A; 3VS7 A; 5J26 A; 4M75 F; 3CCR A; 3G4S Q; 1M90 R; 2CT4 A; 1X69 A; 3OYA A; 1K73 U; 1AWJ A; 2FZC B; 4FCY A; 1D09 B; 1QVF S; 3EHR A; 4M78 D; 1UJ0 A; 1UGV A; 3OQ5 A; 1EX4 A; 2EJF A; 1ZLM A; 5FWB A; 2DET A; 1OZ3 A; 8AT1 B; 1N5Z A; 3FJ5 A; 3CCJ Q; 3VS2 A; 4ELZ C; 2JN0 A; 3TVT A; 3OS1 A; 2C0I A; 4BDZ A; 1YIT T; 2CZ7 B; 9ATC B; 2LQN A; 1QMC A; 2K2M A; 4FT2 A; 3OB9 A; 4K11 A; 1X6B A; 4M77 B; 2CYZ B; 4KGV B; 3NPF A; 4JRI A; 3TSW A; 3RMS A; 2X35 A; 2RMO A; 3L2Z A; 4X1V A; 1Q7Y U; 1I81 A; 3CME Q; 4AG2 C; 2JZ2 A; 2QDY B; 2DBK A; 2GFU A; 1K4U S; 1V76 A; 2QTX A; 4AFQ C; 2E4H A; 5CKE A; 4ZN1 A; 1WZO A; 3OBW A; 4B6M A; 4QVD A; 3CMA Q; 2RQT A; 4PLL A; 4HVW A; 5GMK i; 2KQW A; 3PMT A; 2HSP A; 2HL5 C; 1UGP B; 1MMD A; 1PKS A; 4J9I A; 4OB0 B; 3WVD B; 3NTI A; 1EZZ B; 1EIF A; 2FB7 A; 2L3R A; 1WHG A; 1D3B B; 1YIT Q; 1OU8 A; 1B07 A; 4XTY A; 3JB9 F; 5CQX A; 3S3M A; 1HYO A; 2P0K A; 3OYI A; 1AEY A; 4D8K A; 2ZPF B; 1Q82 R; 2E5Q A; 3M0U A; 1NBE B; 4C5H A; 3AHU A; 3M0P A; 4XU3 A; 3OYD A; 4KUD K; 1T3L A; 3D7S B; 2CZ6 B; 1VQK T; 1YIJ T; 4M75 C; 2KEA A; 4BI4 A; 1YIT A; 3GPL A; 2CP6 A; 5A0L A; 2DXU A; 1IHV A; 2BZY A; 3MJX A; 4C0G A; 3JSC A; 2MPX C; 5CR2 A; 2KYM A; 3V8L A; 1NPP A; 1YWO A; 4M7A C; 5KYX A; 5GMK e; 1W2B S; 4M78 E; 2A28 A; 1NJI C; 3CMA A; 1IZ6 A; 2KBT A; 2HQH A; 5GAM h; 4EMK A; 3VS4 A; 5IH2 A; 4PKC C; 2EFI A; 3CPW P; 1VQ4 A; 3JCM d; 3ASK A; 1UEC A; 4KH1 B; 4F04 B; 4FL6 A; 5HY6 A; 1G3Y A; 4LD6 A; 2COW A; 1OQK A; 2HEQ A; 3EFR A; 1OI1 A; 3CC2 Q; 1N27 A; 2M02 A; 3CCS A; 1QWE A; 2OTJ A; 1Y96 B; 3T9N A; 3EAE A; 1KQ2 A; 2LCC A; 2OJ2 A; 1D0Z A; 1ZBJ A; 2JTF A; 1BBZ A; 4NL3 A; 3CEY A; 2QA4 A; 2RQR A; 2JMA A; 3HRS A; 2R5A A; 4F17 A; 1YIJ Q; 1VQN A; 1B7T A; 5KYN A; 3JCM W; 3RKX A; 3C94 A; 2OAU A; 2EVR A; 1ABQ A; 2LX9 A; 1S1N A; 4OML A; 3PIO A; 1RAD B; 4CC7 A; 2XDP A; 2PUO B; 4EMH A; 3QUI A; 2IIM A; 2FZG B; 3EH2 A; 1GL5 A; 2MWP A; 2L3S A; 3E19 A; 2F5K A; 1X75 C; 3MP8 A; 3CCV A; 2Y90 A; 2V8I A; 4OMO A; 2EJG A; 1OV3 A; 1ZUU A; 4RG8 A; 4ZNX A; 1AWO A; 1WFW A; 4FYX B; 2ENM A; 1ZQ1 A; 2J6F A; 5KYY B; 5HK0 A; 2G3R A; 2VB6 A; 1IRE B; 2K6D A; 2QTV A; 4QQD A; 1M8V A; 2DFU A; 4M78 B; 1M27 C; 3CD6 Q; 1YI2 Q; 3OS0 A; 2A37 A; 1OPL A; 2NWM A; 4N4G A; 2EGE A; 2K5L A; 2VVK A; 4M7D G; 1NM7 A; 3QYG B; 2JTM A; 1YWP A; 4HVV A; 1X6G A; 3VS0 A; 5GAO l; 2EJ9 A; 3JCM P; 4FSX A; 3QHS A; 1W2B A; 2OTL Q; 2PTK A; 3OYJ A; 3HSB A; 5GMK m; 4E7Z A; 3CBM A; 3G7Z A; 1JB0 E; 2JTE A; 1PRL C; 2C06 A; 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1RAE B; 1EFN A; 2W10 A; 1B34 A; 3H0H A; 2CUD A; 3CCS Q; 2EQM A; 1X01 A; 4ESR A; 2EYY A; 1TOV A; 3OYL A; 2EIF A; 3I55 A; 1WHH A; 4LNP A; 2FZK B; 3MEU A; 3CCV Q; 1QP2 A; 3Q1J A; 4E7L A; 2KRM A; 3OA6 A; 3E9F A; 3CCL A; 1N6A A; 4FYW B; 1SRL A; 3OMC A; 4J7F A; 3I35 A; 5KYX B; 1M1F A; 3S6W A; 3PVL A; 3DKM A; 1VQO Q; 2DLP A; 1QVG A; 3ER0 A; 2DXC A; 4DOW A; 3MET A; 1UGR B; 1K1Z A; 1NJI R; 1M3B A; 3SHW A; 4ORZ A; 1RUW A; 1Y07 A; 3CBO A; 1D1C A; 3KFV A; 4EMG A; 4LDW A; 3EGU A; 2COY A; 2O9S A; 2E3H A; 3EFS A; 5IHK A; 1MV0 B; 1X2K A; 2V8K A; 1RAB B; 2VV5 A; 3KBG A; 3FC3 A; 3I56 A; 2ROL A; 4MMK A; 2MYS A; 3OYM A; 3MP6 A; 5GAM j; 2DER A; 3CPW A; 3OYF A; 5LJ3 f; 2RK2 A; 3VJP A; 4DEY A; 3A8O B; 4XQ3 A; 2LT4 A; 3UF4 A; 1FMV A; 2RD1 A; 4AFU C; 2KMT A; 1QQJ A; 1KQ1 A; 1C6V X; 5J39 A; 4HT8 A; 2YRV A; 3MCA B; 2ABL A; 5FRN A; 2E6N A; 3M59 A; 1TG0 A; 2IVW A; 1NEB A; 5DM7 R; 1BI2 A; 2ESW A; 2DZC A; 2EQK A; 1Z9Z A; 3PFS A; 1Q81 R; 2BTT A; 5CKB A; 1TTH B; 4XTX A; 2ZPH B; 1I4K 1; 2E6Z A; 1MMN A; 2CH4 W; 1N8R R; 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