4A57A

Crystal structure of toxoplasma gondii nucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (ntpdase3)
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
594
structure length
594
Chain Sequence
ADTEKRINVGKKHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIGAGKRFAGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEKQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARCMIDEYGVKQCRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVNNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIKGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMIVTGGGMLAAINTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPNARGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRNAYEAGYSHNLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural Insight Into the Activation Mechanism of Toxoplasma Gondii Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolases by Disulfide Reduction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NUCLEOSIDE-TRIPHOSPHATASE 1
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
total genus 190
structure length 594
sequence length 594
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a57A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a57A02
3AGRA 4A57A 4KH4A 4KH6A 4A5BA 4A5AA 4KH5A 4A59A 4JEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0RA 3VA0A 1NK8A 3MEGA 2NRTA 3AVHA 3D0PA 2ZGZA 3TAFA 3D7EO 4QS9A 2FSJA 4DS4A 2NRVA 4W5QA 1U2VB 2E6LA 2A3ZA 1HKBA 4HVJA 4CZLA 2BE2A 4NCBA 4PWDA 4H5WA 3CC4N 2FC0A 3PSFA 2CGLA 3BGRA 3CCLN 2PY5A 3G0ZA 3OBWA 1YTUA 3CC7N 4H0YB 5M1OA 3L3UA 2RKIA 1T6DA 4FJ5A 3OJUA 1OVQA 3FZLA 1VSLA 4WFNL 3PO5A 4Z4CA 1NK7A 2HHHK 1Q86O 3CFOA 4KHUA 4H5RA 1X9MA 4DQSA 2QEXN 3QIOA 2GELA 4N41A 1VQ8N 4FLUA 4AH9A 1JXEA 5AQNA 3NGZA 3ISNC 4MQ3A 2BDPA 4JKGA 5JS1A 3OYGA 3KD1E 2BGGA 1W7AA 4RW9A 1S5JA 1QSYA 1XWLA 4HTLA 4CIEA 1VQ7N 3RRHA 3RSEA 3WQUA 4IKFA 4KH4A 4ZHRA 3VEVA 4JKFA 1HYZA 4JKCA 2CGKA 4WQ4C 2P51A 5AQUA 4OLAA 1U04A 2W6LA 4BR0A 4V19S 5DK5A 5AR0A 3CIPA 4MLHA 2A41A 1JCEA 4L8RB 1X9WA 3KKRA 5TKWA 4PKIA 2RHKA 1L3SA 5DM7L 4B3TK 2UUBK 3QO9A 3AA2A 4BWMA 3EE8A 4M41A 3VGKA 4YOTA 2GEMA 3C65A 5LMUK 3KTQA 2YX6A 3RR7A 3K59A 4E0DA 2JWKA 5J2NA 1NOYA 4OLBA 4YOYA 2HHWA 2RF2A 1P8ZA 3J7YP 1NGEA 2IOCA 5IWAK 4CGGA 2FBXA 3WEEB 3ZSRA 1U45A 3DXMA 3K58A 2QWNA 3QEPA 5IT9O 3EZWA 4F2SA 1JCFA 4C8OA 1Y64A 2F9TA 3ASMA 3D2EA 3IRXA 3UKUB 1GLEG 3UIQA 5C15A 1TL3A 5J2PA 3J7ZO 2XO7A 1ATSA 4K41A 4IOAL 3EY1A 3CMAN 4CHZA 3PX0A 5HRSA 5HRNA 2YNGA 3G4SN 1KLNA 4Z4FA 2RPIA 3CG7A 5LJVA 3J80O 3RMBA 3LP0A 2O8DB 3MEDA 3BF1A 4F2RA 1VSEA 3DXKA 4HUFA 3O80A 4DU3A 4DV5K 1JLBA 5BPNA 4E1MA 1TAUA 2P5OA 1DTTA 2IIRA 4E1JA 1RILA 2FSKA 1NK5A 3N4PA 2HOEA 3ZETB 2OTJN 1RGIA 1YJNN 5FPDA 4YFUA 1A5XA 3DXMB 3M8PA 4O0IA 2FF6A 4DTSA 4DUYK 2D4WA 3MN6A 3VQEA 3DAWA 2HNZA 2NRHA 3D2EB 3HI0A 4BDZA 2P9PB 3M8SA 3DLEA 1TKZA 3DMJA 4I6MA 5E41A 3VQ9A 3EZ5A 4B1YB 3ATUA 5AFUH 4U67L 2EX3A 3A5MC 1XC3A 2NRWA 1C6VA 4KH6A 3CFPA 4PQUA 3LPTA 2WBNA 1YJWN 2XY7A 1WUAA 5MLCQ 4H8KA 3WT0A 4NCGA 4KO0A 3FFKB 1U47A 1BCOA 2YNFA 3R3LA 1R0AA 3DXKB 1B92A 4R79A 4LY7A 4DWIA 3DLGA 1RTIA 4EFHA 3OJSA 4X64K 5KQDA 3K5MA 3G6EN 3NGYA 1D4XA 4JS4A 4BRDA 2DPNA 3VEYA 3WNEA 3DJCA 1JLFA 1ASVA 2IAJA 4K0KK 2FBYA 1Z05A 3OYCA 3CPEA 2HVIA 3NH1A 4QS8A 1ZBLA 3HVRA 5I9EB 4JI5K 4CZGA 2VQFK 4B3MK 4CF2A 3TAEA 4LH5A 3ID8A 4A62A 4PY5A 3ENHA 3KIOA 3L2UA 2OZSA 1SAZA 4GKKK 1EXQA 2WC9A 1IKWA 2GWJA 3T69A 3MWTA 1D8YA 1BQMA 3NHGA 2EWSA 2PYLA 1NJZA 2B4JA 2E2QA 4O44A 4CF0A 4CE9A 4M42A 1RDCA 4IG0A 1KD1O 5KPRA 4WFAL 4FJKA 3P38A 4CF9A 3VA3A 3VEXA 3ZSVA 4DTRA 2KHOA 3MX2A 4GV6A 2A1RA 1REVA 3QINA 3PO4A 4FWPA 5HLFA 1V4SA 3FR0A 4B8AB 1C0TA 1CZ9A 1RBVA 4LH4A 3NH2A 1U48A 4JKAA 1XNRK 3SQ2A 3LAMA 4JKBA 1WBDA 1MWKA 4B9UA 4UY8O 5LL6Z 1FK9A 4DU4A 3KZBA 1IV0A 1NK0A 3VEZA 3A8YA 3WNFA 5T7BA 1NGHA 1YXQA 3QETA 4NLBA 5EXWA 3FLCO 2A6AA 3EE9A 5SZTA 2HNYA 3VF4A 4CIFA 1ILYA 1VSFA 1BOTO 1GOAA 3M3ZA 4W5NA 2ZD1A 1S1WA 3EN9A 4GKJK 4CJUA 1RTHA 1KC8O 1DKGD 3T19A 4PL8A 3TSUA 3K9JA 3SQ4A 4XIUA 4G1QA 3O6WA 2YNHA 3VENA 3DRSA 2F96A 2QI2A 1NGGA 4H0XB 1VRTA 3M8RA 4KHQA 3OS0A 3JYTA 4EZ9A 3QIPA 1TVRA 3CERA 4BR9A 1KVBA 4CI6A 2KFZA 1SL1A 4BE1A 4FJJA 3VF2A 2BANA 2HBJA 5BREA 4JLHA 4CBUA 2DY4A 4CZJA 3PSIA 4CJQA 4O5BA 1S1XA 1SKWA 4FJMA 4DLEA 1QSSA 4AHCA 1VK0A 3O1BA 1NKCA 4KHNA 4WQ5C 3QLHA 3WXIA 5HRPA 4BC3A 1WB9A 3ULDA 1T44A 3RR8A 2D5RA 4E7IA 1U6ZA 3QEWA 1M90O 3H45C 4DKWA 4FO0A 4LF8K 2KZZA 1VSJA 2ZM6K 3K5LA 4BROA 4CZKA 3WNGA 3HM8A 4DSKA 3THVA 1C1CA 3SYZA 4OPHA 5FPNA 3CQYA 4ID1A 4R5PA 3VESA 5JS2A 1EETA 4CK2A 1VQKN 3DLRA 3TTFA 4H03B 2B6AA 3C95A 1XC9A 4YDUA 1ESVA 3U3GA 3H6EA 1T05A 3GG4A 1QHAA 1X3MA 4DFKA 1SS6A 1HX1A 5KRTA 2JLEA 2I7NA 3NH0A 1JCGA 4A2AA 1DLOA 1NWKA 4HUEA 4GVMA 5GAGP 1UA1A 3V9UA 3OW2M 3AVKA 3IG1A 4BG8A 5AZIA 2E5LK 1C0FA 1CXUA 5KPZA 3ZT1A 4AHVA 3MN9A 1BGXT 2Q3SA 5EVZA 1IBMK 3PIOL 4FJIA 1HNWK 3HO1A 3HVTA 3HOTA 1VQMN 2HHSA 4YORA 3NGIA 1XI1A 4IFEA 4CF8A 3ZSWA 3CQXA 5AQVA 5JLHA 3BF3A 1SKRA 3VQBA 2QKKA 5M1QA 1TAQA 2E2OA 4XH1A 4DFMA 4LFBK 3PUFA 3Q7CA 4EAHD 5B8HA 2WOMA 1DTQA 3V1OA 3TU5A 4B9LA 3LM2A 2E20A 3OYDA 3ZSQA 1ZBIA 5LY3A 3LALA 4CFBA 3QEVA 4JI0K 5JVGL 4BE0A 1D9FA 1T3VA 2HHUA 1EWRA 4MO5A 1HUXA 3EL2A 4RWTA 4LF4K 3VF6A 1IKVA 2GX9A 5AZIB 3MCPA 4BC5A 3SV3A 5M1KA 4ISFA 1WN7A 4OKKA 2ATQA 3DI6A 4C8LA 4DF4A 2QXFA 1GLDG 3CCJN 4FWRA 1KXPA 4IDKA 2JWLA 2JGUA 2A1SA 1TL1A 4JI1K 3S3OA 3PY8A 2YNIA 2Z1IA 1TUYA 4CZMA 1C0GA 4HWIA 3WXLA 4BGBA 2O8EB 2HMPA 4DHYA 4BR4A 1WSHA 4CJ4A 3V9SA 1NU0A 3C7NA 4YDUC 3KJVA 3VQQA 3QNOA 5AQZA 3NF6A 5FRNA 3EO3A 4CESA 3EKSA 2YJEA 3LP1A 4A2BA 4CD1A 1BG3A 1HLUA 1GLAG 2YKMA 4CECA 4XH5A 4B9MA 4FOEA 3TANA 1VQ6N 3O9RA 3DOKA 2QW9A 2A42A 3C6TA 4GNIA 4JHDA 1HKCA 4CEZA 3NE6A 4PL7A 3GDQA 1I39A 1OVYA 4KHYA 3L2WA 3TPQA 1UWBA 4FW1A 4M3RA 1HQEA 3FZHA 4GV3A 4FSVA 1KSPA 4E7LA 1A5WA 3E9OA 3CFRA 2A5XA 4Z4HA 4Z4GA 1KAXA 3O5BA 4CZHA 1OH8A 1N34K 3DOLA 3JSMA 4CFCA 4EHUA 4KTWA 4H0PA 4DCHA 3EKUA 5C2DA 4EZ6A 2A40A 4FWMA 2E1YA 5A2QO 3LZJA 4CJPA 4F4KA 4YOUA 3R6MA 4KH5A 2O8FB 4DR3K 3AVCA 4FJNA 3AVIA 3MXJA 4NCAA 2KLAA 4CVNE 3NAEA 2Y1IA 1O1WA 4FJXA 3UE5A 2RE2A 4ILHA 4CJWA 1ATRA 3PIPL 5AQGA 4FWNA 4CEDA 2VQEK 1MU2A 3KLIA 4JHDB 3HZ6A 3DYAA 2E2NA 4ZTFA 1S9EA 4JI2K 4DV4K 1WOQA 3O9QA 3ZX0A 4K42A 3DRRA 1BA0A 1DEJA 4CEQA 2OPRA 2G8VA 4DR5K 5AJ3K 4NO7A 3TI0A 3QFUA 3AAQA 3AAPA 1RT4A 1IH7A 2NRXA 3SMSA 3QFPA 4CFDA 5KPTA 5M1PA 2UXDK 3KVGA 1W97L 2IDOA 3MMVA 4JRQA 3VEWA 3D2FA 3SUPA 1Q8IA 2FXUA 5JICA 4KTQA 2YV0X 3VQCA 4E1NA 1QQNA 1HPZA 5FLXO 4JD2A 4DR2K 4EP4A 2F7TA 1U4BA 3PV8A 5FRMA 1VSMA 2O8BA 3SUOA 1BHLA 1EX4A 4DG1A 4M3WA 2D0CA 1XMOK 2HF4A 2VGNA 2YKNA 1S1TA 1KVAA 3OYKA 3NF7A 3R1XA 3HP9A 4BRAA 3AO2A 1J6ZA 3CCUN 3KK2A 4N76A 3G25A 4BVPA 4BRHA 4Y1DA 4JN4A 3B6PA 4Q0BA 1VRUA 4FVMA 4YOWA 4JI8K 4FWQA 2VYPA 2WONA 1JXBA 4M63C 4FCYA 1BISA 3CJCA 1E3MA 1EP4A 3KLHA 1VQ4N 3ALYA 1KTQA 2XY8A 2X78A 4CEBA 5BRHA 3AY9A 5GIPA 5BRDA 3D2FB 4AHRA 2G8UA 2Q1NA 4JKGB 3DLHA 3TAMA 3LAKA 5AQYA 1VQPN 4H0VB 4M3XA 4FM1A 1N36K 4JD2B 1VQON 4M7YA 1NJXA 3KWIA 1WNSA 3F2KA 4BRLA 1ASUA 3RSEB 3DLKA 2O8BB 4DV3K 3HSTB 1YF5L 1DT9A 3MX5A 1YHQN 3DRPA 1QQCA 4CJLA 3OS2A 3TAGA 5AQJA 3H1VX 3F9KA 3CJ1A 3CJ7A 3BZKA 4DSFA 4F9OA 4H0TB 2Q36A 4XEIA 5HRRA 3OVNA 5M1NA 1HNXK 3CXCM 3IMXA 2D1KA 4BG9A 4DR7K 4DTMA 3HSCA 3BY5A 4DSEA 1DGKN 1J9AA 4NYNA 1I94K 2UUCK 3C94A 4FWKA 4KAZA 3EYZA 1M1KO 3C6HA 1HYVA 2IVNA 1S6QA 3I8BA 4M3ZA 3RVCA 2WUSA 2AP1A 4K25A 2UU9K 3C0BA 1K9MO 3ZLJA 1CLQA 3BZCA 3FZKA 5BN9A 4M3TA 1OH6A 4FJ9A 2NNWA 5F1XA 1BA1A 2FLOA 3N4QA 4A61A 4CHPA 2ZQBA 3A0IX 4ID5A 4CD3A 2WTUA 3JS6A 1RT2A 3A5LC 2BH1A 1SQKA 1YTAA 3VQ8A 1R59O 3SK3A 4JKEA 4AHTA 4DSJA 1VSHA 3CCRN 1RDDA 4ZTJA 1L3TA 3AVFA 2Q97A 4N5SA 4H0OA 2F8SA 2W40A 3LP2A 3OYNA 3K57A 3MCAB 1NJYA 4LF6K 2VWKA 5FDLA 4JI4K 2BUPA 2FBVA 4XH4A 3H08A 1B9FA 1VQ5N 2O8CA 3QBXA 3H46O 5EU7A 3OYEA 3CF5L 4B1UB 3MXIA 3THXA 5AQIA 5FPMA 3FGUA 2Z1HA 1FKPA 3ZSYA 3L2RA 4YNQA 4CJ5A 1C1BA 3ZT0A 4I6MB 3OYLA 1FW6A 4DQ8A 3B6OA 4FK2A 4PKGA 4Y1CA 4WFBL 3AA4A 4LF5K 3SPZA 3M6GA 4AQYK 4BE2A 4IO8A 4E7HA 1OH5A 3U4LA 3MDQA 1ZXOA 3ATVA 3P5JA 1TYQA 4KHSA 3A5OC 4DTJA 4FZZA 5J1EA 2G8KA 1XNQK 4C1NI 3HPOA 1IKXA 1EQYA 1V4TA 5JMVA 3AA5X 4DUZK 5KI6A 3KK7A 5CYQA 4IFYA 3V81A 2ZWHA 4DFJA 5AZJA 2LSNA 4YOVA 1A5VA 4NXMK 1TKTA 2J4RA 2O8CB 2QWPA 4EIAA 3OYHA 2VWJA 3J81O 3PLAA 1C0MA 2QWOA 3I33A 1WAFA 1JLEA 3I0SA 1JLCA 5C2FA 2UYTA 2IGIA 3CD6N 3CCQN 3NVKA 1JLQA 1B9DA 4K8XA 4JK7A 3SBTA 2W6KA 4DQIA 5KGXA 4FJLA 2NUBA 1L3UA 4X66K 2HHXA 5BRFA 1SL2A 4AM7A 4W5TA 2FBTA 3QEXA 1RBUA 1Q82O 4JYAK 2O4IA 4MDAA 4FWSA 4DTXA 1S9GA 1YITN 3B8AX 3WXJA 5C10A 2VG7A 2GBZA 2IC3A 3I0RA 2D0AA 1NGIA 4E89A 5LMNK 1XUPO 3GL1A 4JKDA 4IFVA 4WE1A 2G8FA 3WXKA 2HW3A 1YT3A 5F2RA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AGR A;  4A57 A;  4KH4 A;  4KH6 A;  4A5B A;  4A5A A;  4KH5 A;  4A59 A;  4JEP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q0R A;  3VA0 A;  1NK8 A;  3MEG A;  2NRT A;  3AVH A;  3D0P A;  2ZGZ A;  3TAF A;  3D7E O;  4QS9 A;  2FSJ A;  4DS4 A;  2NRV A;  4W5Q A;  1U2V B;  2E6L A;  2A3Z A;  1HKB A;  4HVJ A;  4CZL A;  2BE2 A;  4NCB A;  4PWD A;  4H5W A;  3CC4 N;  2FC0 A;  3PSF A;  2CGL A;  3BGR A;  3CCL N;  2PY5 A;  3G0Z A;  3OBW A;  1YTU A;  3CC7 N;  4H0Y B;  5M1O A;  3L3U A;  2RKI A;  1T6D A;  4FJ5 A;  3OJU A;  1OVQ A;  3FZL A;  1VSL A;  4WFN L;  3PO5 A;  4Z4C A;  1NK7 A;  2HHH K;  1Q86 O;  3CFO A;  4KHU A;  4H5R A;  1X9M A;  4DQS A;  2QEX N;  3QIO A;  2GEL A;  4N41 A;  1VQ8 N;  4FLU A;  4AH9 A;  1JXE A;  5AQN A;  3NGZ A;  3ISN C;  4MQ3 A;  2BDP A;  4JKG A;  5JS1 A;  3OYG A;  3KD1 E;  2BGG A;  1W7A A;  4RW9 A;  1S5J A;  1QSY A;  1XWL A;  4HTL A;  4CIE A;  1VQ7 N;  3RRH A;  3RSE A;  3WQU A;  4IKF A;  4KH4 A;  4ZHR A;  3VEV A;  4JKF A;  1HYZ A;  4JKC A;  2CGK A;  4WQ4 C;  2P51 A;  5AQU A;  4OLA A;  1U04 A;  2W6L A;  4BR0 A;  4V19 S;  5DK5 A;  5AR0 A;  3CIP A;  4MLH A;  2A41 A;  1JCE A;  4L8R B;  1X9W A;  3KKR A;  5TKW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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