4A62A

Parm from r1 plasmid in complex with peptide from c-terminus of parr
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDEADSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords PLASMID SEGREGATION PROTEIN PARM
publication title A Bipolar Spindle of Antiparallel Parm Filaments Drives Bacterial Plasmid Segregation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
total genus 109
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a62A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a62A01
3M6GA 5LJVA 3ZX3A 3VEWA 3TPQA 1BDGA 5JICA 3DXKA 3D7EO 4CZLA 3MMVA 3QBWA 4FO0A 3H1VX 4HWIA 2NRHA 2Q2RA 3VERA 2QW9A 4PL7A 5FPDA 3MN6A 2YJFA 4B1XB 3VF2A 4CBXA 4CD1A 3CQXA 1J6ZA 3DXKB 4BQLA 3HTVA 3UB5A 4LC9B 3MK6A 3A5LC 3A5NC 3MDQA 5BN8A 1K8KA 1OKJA 2E2OA 3FLCO 1NGHA 3IFRA 5AQHA 5EX5A 3VETA 5CE3A 3AAQA 4H0VB 3R6MA 4PKGA 3AARA 2QM1A 1X3MA 3MN7A 3VF4A 1NGJA 5F0XA 3UE5A 5F1XA 1RGIA 2HMPA 4BVPA 5KPTA 3CJBA 5KPRA 1HKGA 4BR4A 3ZETA 2YHWA 1NGGA 2ZGZA 2A42A 4IXCA 4L3QA 4AM6A 1BO5O 4O5FA 5AQOA 3JS6A 3CIPA 5ADXH 4JAXA 2OANA 3ID8A 4BQZA 2VWBA 3CETA 5AR0A 3HI0A 4H0OA 2YHXA 3ZETB 4B1VA 1NLVA 2J4RA 3ENHA 3GOIA 4CZJA 4AM7A 3LDLA 1CZAN 2FF6A 3QFPA 4FWRA 3WEEA 2D0PA 4FWSA 4ISGA 2GELA 4A61A 2Q31A 3A5OC 2P9SA 4JD2A 3O4WA 3L4IA 3UKRB 4CBUA 3ULEB 1Q18A 2CGLA 3WEEB 4IWVA 3IDHA 2I7NA 5AZIB 1BOTO 1V4TA 1YXQA 3FZHA 3GL1A 4E1JA 5KPZA 1SZ2A 4IO8A 4MO5A 4JD2B 3GBTA 5E84A 3FR0A 1ESVA 1E4GT 2QWLA 4BRMA 2PBDA 1WOQA 1JCFA 3DWLA 2QWRA 3A8YA 2E8AA 5AQMA 3UKUB 4WYBA 3R9PA 4RTFD 3JXUA 1U2VA 2A41A 1XC3A 5JMVA 2IVOA 2HOEA 5EOYA 1KAYA 3H45C 4BVOA 4CZMA 5AQSA 5AFUH 3W3DA 4B9QA 4WQ5C 1S3XA 3A5MC 1GLCG 5AQNA 4KBOA 3WXJA 2Q36A 4CJ7A 4IJNA 4FL9A 1U2VB 2P9LA 1LCUA 3C0BA 4CD3A 4C23A 4JN4A 4BRNA 4BRAA 1GLEG 1NBWA 2F9WA 2NLXA 3DXMA 3CJCA 4DB3A 5BRDA 2AA4A 5AZJA 2P9NB 3QICA 1LOTB 2YJEA 1KXPA 3R8EA 3QMLA 1T6CA 2ASPA 3WXIA 4BRDA 1JCEA 3CJAA 4H03B 5AQTA 3H46O 3CJ7A 5FPEA 4BC5A 2QXLA 4WQ5A 4BR9A 3GG4A 1MWMA 3FZLA 1HKCA 3QB0A 3BF3A 4FPAA 2QWNA 3BP8A 4FWMA 3WUHA 1C0GA 3HM8A 4B1ZA 2QWPA 1HUXA 3WQTA 2P9UA 5AQGA 5BPNA 4BC2A 1U6ZA 3LM2A 4H0XB 4BG9A 3IUCA 4FWKA 3AAPA 3MN5A 2P9PA 4M63C 3LM9A 3VGLA 2UYTA 4BRKA 4O8KA 3VEYA 3G25A 4BR5A 2PAVA 2P9UB 1P8ZA 1KAZA 2NZTA 3O5BA 1TUYA 2A6AA 4BRQA 4K25A 3DAWA 3EKUA 4XH1A 1RFQA 1KAXA 1NGIA 1K8KB 2E2QA 5EVZA 2KHOA 4K42A 3WXLA 3I33A 5F2RA 3ENOA 4MO4A 3QBXA 3HSCA 5I9EB 2H3GX 3WT0A 5E26A 4FWNA 5ADXA 1EQYA 3U9DA 4M7YA 2CH6A 3J8AA 4FOIA 1QZ5A 1D4XA 2D1KA 3CI5A 2FF3B 4BRPA 4BGBA 3P4IA 1IJJA 2Q0RA 1C0FA 3S41A 3BEXA 3CHWA 1YVNA 2V7ZA 3BF1A 4H0TB 5B8HA 2ASMA 1H1VA 4BRIA 2P9IA 2E20A 3W0LA 1ZXOA 4YDUC 3VPZA 4BR7A 1HJOA 5AQVA 5AQKA 4JHDA 2ZGYA 3C7NA 2A3ZA 1BWFO 2VCPA 5JLFA 2E2PA 3BUZB 3O1WA 2FXUA 3WXKA 4M7XA 4I6MA 5AQIA 3D2FA 3VGKA 1T44A 1DEJA 1ATNA 2P9SB 4Z94A 1NM1A 2FSKA 4WQ4C 1HLUA 3KHYA 4FWOA 3LDQA 4MLHA 1MA9B 1QQNA 3VEZA 2ASOA 1GLDG 4I6MB 4H5VA 2P9KA 2CH5A 5AFUA 4RWTA 4FPBA 5KQDA 4DCHA 3QFUA 3CQYA 5BRHA 1BA0A 3SMPA 4F9OA 3QDKA 1R59O 5AQQA 4EHTA 5BRFA 1GLJO 4HTLA 3M3ZA 1ATSA 4H5RA 2E1ZA 5AQRA 1YUWA 2P9KB 5BN9A 1TUUA 2WUSA 1NGCA 1NGFA 3SJHA 1SQKA 2ZWHA 1NWKA 2ITMA 5ELZA 2QWMA 3F9MA 2E2NA 4A2BA 3FZMA 5EY4A 2GTDA 5KQ8A 4A2AA 4CI6A 4EAHD 5BPMA 2P9LB 5TKYA 2EWSA 4EIAA 1BUPA 2CGKA 1GLLO 5AQZA 5LY3A 4CZHA 1ZBSA 4BGAA 3DXMB 4H0PA 2GWJA 3FFKB 5AZJB 2V51B 1TYQA 3VOVA 4BREA 1RDWX 3HBTA 3H3OB 4QS9A 4K43A 5BR9A 3EO3A 2AP1A 3EKSA 1NGEA 2QWQA 3GDQA 5JLHA 3ATUA 4H5NA 3A0IX 2E88A 1QZ6A 4H5WA 3MCPA 4BC4A 1JCGA 4Y0WA 1BA1A 4JNEA 4BRFA 4FSVA 3L6QA 3EZWA 2BUPA 1HX1A 2HF4A 1NMDA 4B1YB 5BREA 5AQUA 1DKGD 2IIRA 3H3NO 1WUAA 2P9PB 4BROA 2Q1NA 4B1WB 4XH5A 1HPMA 1QHAA 3SK3A 1Z05A 2Q0UA 2W40A 3CJ9A 1NGAA 1GLBG 2ZF5O 1GLFO 4H5TA 3VEXA 5AQYA 3KVGA 1NGBA 4EHUA 3KZBA 4BG8A 2F9TA 4CZGA 3ZX0A 3HZ6A 4BRHA 2E1YA 1MWKA 3VESA 3FZFA 2BTFA 4BRGA 4CZIA 1ZC6A 1G99A 2GWKA 3VF6A 2D4WA 3DJCA 2QWOA 2YI1A 4BRLA 3OHRA 4XH4A 5FPNA 1E4FT 1S22A 4H0YB 4MLEA 4DQ8A 1DGKN 2CGJA 3M1FA 3GE1A 2VYPA 4FOEA 5AQPA 3O80A 3VEOA 1IG8A 3D2EA 3VGMA 4PKHA 4A62A 1MDUB 1QQMA 4NB4A 4B1UB 3U4LA 2P9IB 3IMXA 3CERA 3O08A 1HKBA 2GUPA 4IJAA 1T6DA 4GY2B 3UKRA 3ULEA 4JHDB 1XQSC 2FLOA 2V7YA 3C7NB 3D2EB 3LDNA 1BG3A 3U9ZA 2HF3A 4NO7A 5AZIA 3RSEA 3LDPA 3MN9A 3FE1A 2A40A 1NGDA 4PL8A 3LL3A 3D2FB 3I8BA 4YDUA 3ZX2A 5AQLA 1V4SA 4BRCA 2A5XA 2YHYA 4FWLA 3U8XA 2D0OA 3UKUA 3WQUA 3O8MA 3RSEB 2W41A 3FGUA 1Z6RA 4IZ9A 5AQWA 3FZKA 2DPNA 2YCHA 3ATVA 5EXWA 3LDOA 5AQFA 3H1QA 4QS7A 3CJ1A 4FWQA 2IVPA 2FSJA 3EL2A 4DHYA 5FPMA 3EN9A 1QQOA 4WQ4A 2V52B 2FSNA 4ISEA 3H6EA 1YAGA 1Y64A 2GEMA 4FWPA 1XUPO 4BC3A 1GLAG 4ISFA 3L0QA 3O6WA 4CZEA 3ZEUA 1SAZA 3AY9A 3O1BA 3VEVA 4CZFA 4J8FA 2P9NA 4K41A 3SMSA 2I7PA 3B8AX 3VENA 5AQXA 1X9JA 4BR2A 4QS8A 3ZEUB 2Q97A 3SLCA 4GNIA 2IVNA 4BR0A 3TU5A 1ATRA 5AQJA 4XEIA 5LJWA 4CBWA 4EFHA 4PKIA 1TYQB 1X3NA 4RCHA 4CZKA 5BPLA 1BU6O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WBDA 1W97L 1NK4A 5T7BA 4QAGA 1OH8A 3DXKA 3D7EO 3MMVA 3BGRA 4FO0A 3BDPA 3H1VX 4HWIA 5M1QA 2O8FB 2VWKA 4IDHA 4JKFA 4E1MA 5DM7L 3VF2A 4FJ7A 4CBXA 4CD1A 1J6ZA 3CCJN 3HTVA 5J1EA 2UUBK 1JXBA 1O1WA 3Q7BA 3MK6A 1TKDA 1D8YA 1UWBA 1A5XA 4HCBA 3QETA 1NGHA 3VETA 1C6VA 4FVMA 2X74A 3C6UA 3SYZA 3EY1A 2OCEA 4H0VB 4PKGA 4O8UA 3ZT0A 4DTOA 1BIZA 1NGJA 4DSIA 4CEBA 1CZ9A 5KPTA 1LWFA 3CJBA 4YOYA 2JWLA 5KPRA 3SAHA 1U45A 1VSHA 1UAXA 1NGGA 3HO1A 1U04A 4Y1CA 1FJGK 1BCMA 3VQEA 3DRRA 5AQOA 3CIPA 4NYFA 5M1PA 2F96A 3ID8A 4KFBA 1NLVA 2J4RA 5C12A 4Q5VA 4CEQA 3EEQA 3O9RA 3IG1A 4GKKK 2P5GA 3WEEA 4DUZK 2D0PA 4N56A 2GBZA 4FWSA 4FW1A 3T1AA 1S6QA 4A61A 1TK8A 3NF8A 2P9SA 4JD2A 3CQ8A 1Q86O 3O4WA 3L4IA 3QO9A 4L8RB 4NCAA 1Q18A 3RMAA 1WNSA 1BOTO 3L2UA 1WLJA 3LPTA 1SZ2A 1U48A 3ZSVA 5E84A 1E4GT 2QWLA 2YV0X 3PSFA 4Z4GA 3M5RA 4GVMA 3A8YA 3UKUB 4WYBA 4AHRA 1HNVA 4CHNA 2O8DA 2IVOA 2P51A 1KAYA 4BVOA 4AHUA 1A5VA 4CZMA 1VSLA 5AQNA 4KBOA 3ZYYX 4IJNA 4DF4A 4M3UA 2JWKA 4C23A 3O9TA 1C1AA 4JN4A 3QLHA 1GLEG 2Z1GA 5BRDA 3SUPA 4IFVA 3T3FA 1LOTB 3ID6A 4YY3K 3R8EA 4DLGA 2ASPA 1YIJN 4CK2A 1JLBA 4H03B 2I5JA 1WSGA 4W5QA 4WQ5A 1TKTA 4BR9A 2E5LK 1S9GA 3VTHA 3EYZA 3GG4A 1MWMA 1NJXA 1VQMN 2KFZA 3HM9A 4FPAA 3OYGA 2QWNA 3BP8A 3WUHA 4JEPA 1C0GA 4FJLA 2QWPA 2VQFK 1XMQK 5CR4A 1VSJA 5BPNA 1J9AA 3OTOK 4MQ3A 3U3YA 5HP1A 3MXIA 4Q0BA 2HVIA 2P9PA 4M63C 3LM9A 4DV3K 3RRGA 3QNOA 2WFBA 2FBVA 3D45A 4O8KA 3G25A 2P9UB 1P8ZA 3O5BA 1TUYA 3SAFA 2HW3A 1XMOK 3T7ZA 1C0TA 2KHOA 5F2RA 3AVHA 5I9EB 2VWJA 1ZBLA 2X6SA 4LFAK 1IKVA 4FWNA 1N32K 2IS3A 4UQGA 3J8AA 2XY8A 4FK2A 4CJKA 2GV9A 1D4XA 4EZ6A 1HNIA 4BRPA 1RCHA 3IS9A 1REVA 1NKCA 1RT6A 1IJJA 2Z1JA 2DY4A 3BEXA 2EX3A 1YVNA 3TTCA 3VQ4A 2P9IA 2E20A 4CJWA 3ZSWA 1T3VA 1C0UA 4YFUA 4B3OA 4YDUC 3L4QA 2OZMA 5AQVA 1TV6A 1EO1A 3C7NA 2PFUA 1YJ9N 1DLOA 3VQ9A 1YI2N 2HNZA 4CEZA 3PUFA 1VQ6N 2IOCA 4DQPA 1ATNA 2P9SB 4Z94A 3RWUA 4N47A 3JAMO 2FSKA 3B6OA 1HLUA 1QSLA 1HRHA 1Q7YO 3QESA 1JKHA 1GLDG 3E1YA 3OYBA 2D0AA 4AHCA 2P9KA 1M1KO 5AFUA 3K57A 5KQDA 2O8EA 4DCHA 4OPHA 3CQYA 4FJIA 1R59O 1MU2A 1SUQA 2E1ZA 1TAUA 1J53A 2WUSA 1VQ9N 4IEEA 1NK9A 3SJHA 3TARA 1KLNA 1S1XA 4HVJA 3AA4A 4KAZA 2QWMA 3LZJA 4KI4A 5EY4A 5KQ8A 3AGRA 4JK7A 4DSLA 5BPMA 4CHYA 3FFIA 1QVGM 1XNQK 3FFKB 2UXDK 4NCBA 3VOVA 4GV6A 1B9DA 4RW8A 4LSLA 4BREA 4F2SA 4QS9A 3CCMN 1Q9XA 2AP1A 3V1OA 3KLHA 4CIGA 4GV9A 1IO2A 1JLCA 3ATUA 3WNFA 2ZJRL 4E7KA 3HPHA 1YITN 1IBLK 5FDLA 3SNNA 2P1JA 1VQ7N 1RDUA 3L6QA 2BUPA 4JKDA 3RMCA 5CY4A 3ZSXA 5AQUA 2ZQBA 1DKGD 2IIRA 2UUCK 1L3SA 2P9PB 4BROA 4B1WB 5LL6Z 1HPMA 3CCQN 1Z05A 1EP4A 4FM1A 3JYTA 4H5TA 3CD6N 1NGBA 4EHUA 3THWA 2WC9A 4BRHA 3G4SN 1VSIA 2UXCK 1ZC6A 3TAGA 4N76A 2YI1A 4BRLA 3F5TA 1HNWK 4CESA 1U49A 4W5RA 4FLWA 1RDAA 3LP1A 2VYPA 2UU9K 4FJJA 1SL0A 2IGIA 3RMBA 1X9MA 4DU1A 1IG8A 3HSTB 3VGMA 4DS4A 4PKHA 2HHQA 5A2QO 5SZTA 3VQ8A 2P9IB 4CHZA 2QA4N 3OYFA 4LF8K 3CERA 5IWAK 4CHQA 1T6DA 2FLOA 3C7NB 3D2EB 3SUOA 1EWQA 4DV1K 1NKEA 1I94K 3K9JA 5AZIA 3KLFA 5K14A 3DRPA 4GW6A 3SI6A 1ZBUA 4FLXA 4LF6K 4OPAA 5AQLA 1RDDA 2YHYA 4IG0A 4KHYA 4Z4EA 4AHVA 1FK9A 3HVTA 1D9DA 3IAYA 3V4IA 5C2FA 1VQ8N 3CMEN 3ATVA 1HPZA 3PO4A 3H1QA 4JI8K 2IVPA 1X9SA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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