4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
3FJEA 1BA7A 1M2TB 1XYFA 5BXSA 2NP0A 3VUOA 2DRZA 1ISWA 4EFPA 3N7MA 5BOWA 1AFCA 2NM1A 1Z4SA 2KH2A 3OJ2A 2Q3NB 2D7RA 5F8YA 4ZLBB 1V6UA 3TC2A 4P0JA 4EEEB 4QD2C 5EG6C 4CJMA 1E0OA 3RTIB 1IILA 3NBCA 5GAQA 4QC4A 3UJ0A 3O3QA 5BQUC 4I4SA 4EFQA 4I4OA 3BA4A 3HBWA 1DQOA 4HA2A 4EB2B 1HCEA 3RMXA 2IHOA 1VCLA 1Q04A 1IRAX 4LO8B 3H6QA 1BFCA 4J2YA 4IHZA 4F83A 3BADA 1S0DA 2WRYA 5BQUA 4ZOTA 4IQPA 1ISYA 2AQZA 3FJKA 1TIEA 2VXRA 2L5XA 1DFQA 5FZUA 3MPPG 4JKXB 3BAOA 1TFMB 3C9ZA 2FDBM 1S0GA 4ENDA 3V0AA 4I37A 1NUNA 3CRIA 1IJTA 2ZQOA 1QXMA 4JAWA 4ZBVB 3ZXGA 1S0EA 3V0BB 1EPWA 4IY8A 1Q1UA 2VUAA 4JQ0A 5DSSB 1XG6A 3VEQA 1HKNA 2R9KB 4ISQA 3BAHA 4D0ZA 2HW9A 3VSFA 5DZUA 4IZEA 5D63A 4II0A 2FO1A 2AXMA 1TWEA 3R4UA 4L4IA 4A7YA 3FJFA 2Q9XA 3FJAA 5F8SA 2MC2A 2MLLB 3ZC9A 3FJCA 3F1RA 4I4XA 1W3FA 1BASA 1NZKA 1TTUA 1ITBA 5BXRA 3VT2A 2D24A 3AZWA 1ONKB 3KMVA 1MC9A 2VSAA 1AVAC 3H6RB 4J2SA 2GO2A 3N0KA 1KNMA 2M49A 1IHKA 3AH4A 1FWUA 5FNWA 3S8KA 3BA5A 3UJ4A 4OEEA 1OQLB 5DVHA 5JLVA 1JQZA 1TP0A 4QBCA 1HCDA 4USOA 4A7KA 4I4PA 4LO3C 1IOBA 1S0BA 7I1BA 5DUYA 1QQLA 1TOOA 2LIQA 3V79C 3CRGA 3O4BA 3WMUA 1PZZA 2BFHA 3AKIA 1PUUB 3FGMA 4KEJA 2NTDA 1DLLA 1GGPB 4LO3A 3HMYA 2ET2A 3WMVA 3B9UA 2GZBA 8I1BA 2KI6B 3W9TA 1PUMB 5FZYA 4LO7B 1BFGA 1PC8B 3BAQA 4HR6C 2AAIB 2VLCA 2DREA 1AVUA 2ERMA 1BFFA 5D62A 4AN7B 4XFSA 3FJHA 3CA1A 3NJ5A 3O4OA 1FN0A 4I7IA 1J0SA 41BIA 3O5WB 3POKA 1JT4A 3UD7A 1I1EA 21BIA 1I1BA 5BXTA 4H9WA 1K5VA 2Z49A 1YTOA 31BIA 4I0YA 1HWMB 3AH2A 4Q9GA 1AF9A 4I4RA 2Z48A 4XKIA 2ZQNA 1L2HA 3BTAA 4X39A 3AZVA 3ZXDA 1DZCA 3UD8A 5B2HA 4KEKA 1FMZA 2F2FC 3FFZA 1D0HA 1JLYA 1HWPB 4QKSA 2Y9XE 1IRPA 3I29B 3P6JA 3OGGA 1RG8A 1CE7B 1Q03A 1JLXA 2Y9GA 4XFUA 3HN1A 2BEAA 3E8LC 4I6IA 1IT0A 3ZX7A 1XZZA 2F2FA 4QO3A 3UD9A 3BRGC 3PHZA 3CA0A 3BB2A 3I2AA 3OJMA 5BVPI 3VT1A 1EVTA 1DFCA 4ZA3B 1WD4A 4WBCA 3AKHA 4X3AA 5HPZA 1RMLA 3RMYA 4J23B 4G9MA 4Z9WB 5G00A 3BA7A 1YYNA 3WA1A 4DEPA 1T9FA 4FVVA 1EV2A 3LLPA 4LO0C 4OEFA 4ISRA 1SR4C 3FUQA 3IM6A 2DS0A 3BAVA 1RZOB 3CA5A 1YXWA 5F8WA 3N7LA 3A22A 2MIBA 1BARA 3A07A 1YBIA 1BLDA 1HWNB 3IIRA 3O4DA 2P23A 4LO0A 2QN4A 1SR4A 2Y9WC 6I1BA 4I1EA 1S0LA 3CRHA 4KEIA 4Q9PA 2FFUA 2HWMA 2UUSA 3NBDA 4G6JA 2LIEA 3QYDA 4JP0A 4IZXA 4JKQA 4G9NA 4ZFUB 3CA3A 1S0CA 1K5UA 1ISZA 2D44A 3A21A 4OW4A 4I96A 2P39A 3PMEA 1DJSB 4GAFA 4OWLA 1FV3A 1PWAA 3FJBA 3IAGC 1FMMS 2X2SA 2X2TA 3MALA 2D43A 2E4MC 1FGAA 1BLAA 1JT3A 3V0BA 2YUGA 1P63A 3RSJA 1FQ9A 1WD3A 3FJJA 1JT7A 3H6SE 4ZGRB 2D20A 4QD2B 3IM5A 2DRYA 3PUBA 2E4MA 2ZR1B 3P53A 5BXPA 3N7JA 4AN6A 4OEGA 3A23A 3LTQA 3Q7WA 3IM7A 4FGFA 4I4VA 3O49A 4ZKTB 3UDAA 2K43A 4G6MA 1V6VA 5EC5A 2FFVA 4EKXB 5E24E 2KLLA 3VWCA 5JMCA 4I3NA 3V0AB 3WO4A 4USPA 1YF8B 4JPZA 3T8SA 2RG9B 2HZ9A 1V6WA 2RQ9A 3OGFA 2D22A 3R4SA 5FZZA 3H6RA 4L4HA 1AVWB 2NVHA 3OJVA 3FJDA 3AKGA 1M16A 1G9BA 3CA6A 2HWAA 2NYYA 1W3AA 1R8OA 4DENA 3CU1B 4GOYA 4PC4A 4OUJA 4I4QA 4TLPA 3I2XA 4D8HA 4GAIA 1ISXA 4LO7C 2VSEA 1DQGA 1Z2VA 3NBEA 4XFTA 4I4YA 1RY7A 2K8RA 2KKIA 4QKRA 1BFBA 3AJ5A 3AKFA 3F62B 3WO2A 1ABRB 1AVXB 2XOAA 3HOMA 4J2XA 2QYIB 4LO2C 2D23A 4EFRA 3BRFA 2AFGA 2BEBA 4A7ZA 4YOLA 5D61A 1G9CA 2VXTI 3Q7XA 4P0LA 3WINC 4QBVA 2RSTA 2ESUA 5F90A 3FUOA 4DCKC 3CQAA 3FJIA 3O44A 4P0KA 4LO2A 4IYBA 3FJ8A 4D0TA 3O4AA 1T4QA 2I1BA 3CAHA 3WINA 1TWMA 3ILAA 3VT0A 4I8MA 4OWJA 4P6AA 3PG0A 4G1RA 1FWVA 3QR5A 1EYLA 4GP3A 4J2KA 3CA4A 4LO1C 1DIWA 4R6UB 5FNXA 4KC3A 1V6XA 4Z8SB 4JRAA 2KI4A 3OBRA 3AH1A 1FV2A 3N7KA 3WO3A 1JT5A 1G9DA 5BP5C 1CVSA 1UPSA 1W3GA 4LO1A 1MD6A 4I1BA 1DZDA 3VSZA 3K1XA 4GOVA 9ILBA 3ZC8A 1ILR1 4I4UA 3HALA 3P6IA 1II4A 2Y9FA 4KBBA 3BRDA 5BP5A 2WBCA 1G82A 1S0FA 3SNVA 3BAUA 2D1ZA 3RTJB 3AJ6A 4HJJA 1HWOB 3BX1C 2J3PA 1R8NA 2K4AB 1A8DA 3OBTA 3S8JA 2F8XC 4ZFWB 3BAGA 2D7IA 4QALA 5EHAA 2VU9A 1HIBA 1XHBA 4X37A 3Q7YA 1QQKA 1WBAA 3D7WB 3O4CA 1N4KA 1WBCA 3JUTA 4F34A 4H04A 1ISVA 3NBNA 2IWTB 3JRRA 1SZ6B 4X38A 1JTCA 1JY0A 4ZFYB 1G9AA 4IONA 4OWKA 3FJ9A 1Z0HA 4I2SA 4IY9A 4GP0A 4Q91A 2FGFA 1AXMA 2NZ9A 3HSMA 5I1BA 3EF2A 1F31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLOA 1M2TB 1HN1A 4QKNA 1ENQA 3WUCA 3GBFA 3NL1A 1NY72 3N7MA 4AYUA 3VDBA 1Z4SA 2KH2A 3OYWB 3VZOA 2R6QA 1RUE2 1JYWA 1WBLA 4SLIA 1ZBA2 1MEC1 1OD5A 1PK6A 4HN0A 4UYBA 5LEJA 4AQ6A 4AVAA 4P0JA 3N9LA 2HWE1 2X5IA 4L9BA 4LOSA 4EEEB 4RFRB 2ZKLA 2VNRA 1OKOA 1VBA3 5E8AA 5FXXA 4QD2C 4CJMA 3O1MA 3RZGA 3Q8EA 2P3KA 3PUQA 4MGIE 1Z78A 4QX8A 3NBCA 5GAQA 4QC4A 2YZ4A 4JHTA 2PHTA 3O3QA 3M8LA 4ZPIA 4X8NA 1WA4A 1O4YA 1XYPA 3SH3A 1QJX3 1UN1A 5CNAA 1DQOA 1Z7S2 3C7EA 4H3WA 3RMXA 3TN93 5DAQA 1XRUA 4HANA 1Q04A 3AXDA 4LO8B 5AFBA 1BMV2 1ZBE1 1YFUA 4Y5Z0 3WCRA 1ZZCA 3O1TA 1X7NA 4BLIA 1S0DA 4ZY9A 4AGGA 2WRYA 1HJFA 5BQUA 1U5XA 4E2QA 5FLHA 1AVBA 2IXIA 1SACA 2PHRA 2Z42A 4RR3A 2AQZA 1CAVA 1TIEA 1RXFA 1VRH1 1DFQA 1KXGA 1UY3A 1QXJA 3WV6A 1FATA 2JG8A 2JIGA 5FZUA 3ZYHA 3POGA 3BAOA 4W6YA 1ALYA 2C4XA 3C9ZA 2WZR2 3GYDA 4BIFA 1JU4A 3ZFGB 5F9TA 3I2IA 1EV11 3IZOA 1R1A2 4RHV2 4CCMA 4HOOA 3WY6A 4ENDA 4UBGA 4HETA 1W8HA 4XE9A 2ZOEB 3CRIA 2RR12 3AX4A 1DQ0A 3GZAA 5BNNB 1QXMA 1UYXA 3LZZA 3NAPB 3ZN5A 3CMGA 2XHNA 4FQ4A 4J1WA 1XYNA 3OD4A 4FAGA 2ATFA 5GLWA 4OHZA 1Q1UA 5I91A 1UZZA 4AFDA 4IL7A 2GH8A 1XG6A 2PAEA 3HIFA 4B1LA 4Q0VA 3VZMA 1PO23 5FKBA 2J1EA 2TBVA 4ISQA 4HXCA 5LEKA 4GZ9A 3MIBA 2J1TA 4WBBA 3BAHA 1OURA 4D0ZA 2OIIA 4XABA 4JGZC 1SLTA 5F37A 2OXBA 3CIHA 4XAAA 3POIA 4XF4A 3VKLA 2RM22 2FO1A 1DZQA 4PIZA 3PIGA 2IXHA 1TWEA 4CYDA 1L7RA 5FMDA 3TEZA 2ZGLA 2Q9XA 3FJAA 1XSQA 4NMIA 1HX6A 3FL7A 1GMMA 4GWJA 4L11A 2RS12 1Q8VA 4R9AA 1RUJ3 4UFMA 2JB8A 3LA3A 3ZXLA 1QXPA 2A6WA 4JTNA 4I4XA 1PO12 2BNOA 1W3FA 3AC0A 4PIYA 3M3EA 4IEZA 3NMBA 3POJA 3KF5A 4AEJA 1TTUA 5K0UA 2YFZA 4CXWA 4CU8A 1YQ5A 2ADEA 2CWMA 1DGRN 3HT2A 5LA1A 5FPZA 3KMVA 4GMP3 4RGAA 2GALA 4Q8KA 4FFHA 4LO6B 5T50A 1HXS1 1RINA 1FT9A 2ZGMA 1OFSA 4ARXA 3ILNA 5K7PA 4KU7A 3WCSA 3IMNA 2JKXA 4QQHA 5A7WB 1AL21 4URTA 4OHYA 2WN2A 4AI3A 5A6QA 2DUPA 3BOWA 1VMFA 1WMXA 3PUIA 5FZ7A 3I2KA 2NPIA 2VZRA 3AKTA 2FDIA 1AJOA 2CL2A 1JQZA 1XNCA 4NWVA 1TP0A 4QBCA 3D0JA 5GLTA 2R061 4QX2A 4E4ZA 2H6CA 3S5AA 1OMIA 5C33A 2ARXA 2PAMA 3PVOA 4E9KA 3A0KA 1VAKA 5FO7B 3ZSJA 1RUD3 3CRGA 3O4BA 4NHLA 5CU1A 4QGLA 2ZTNA 4YSFA 1PUUB 1W8NA 4I30A 2DUQA 1QMJA 4O7XA 1GGPB 1TG7A 1JI6A 2WSUA 3L9JT 2WO1A 3AM2A 3E5QA 4GH4A 3VDDB 5CFCC 2RHPA 2KI6B 3W9TA 3QH6A 1XNDA 3SQOA 2HWB1 1A6CA 2Q0AA 2QQLA 2ZBJA 4CEWC 3W5NA 1Q8QA 5FYUA 1BFGA 4TXWA 3BAQA 2AAIB 2DREA 3EO6A 2ZKNA 1URXA 1PNFA 4LBJA 4PDWC 2JDYA 4BOWA 1PM7A 3Q7YA 3KGLA 1YLLA 3KF3A 3SH4A 3FJHA 3NJ5A 4QU1A 3O4OA 1F35A 4BPZA 1YWKA 4GD4A 1IKPA 1N3QA 4K21A 5AC92 3ZXFA 4G4FA 3UD7A 3AMHA 4LLOA 5LA0A 4HVQA 3M4FA 3WX5A 1GZWA 1W8FA 4BWOA 1K5VA 1VBE1 2Z49A 4P9JA 4E4DX 3J7LA 2VVEA 3NSTA 4XQ4A 3NVCA 1LHVA 5FZ8A 5JXHA 4ZZ8A 4M3CA 1O8PA 3IAQA 5B2GB 1W6PA 1GOGA 2FDKA 4XKIA 4RQPA 4TTGA 4XF9A 1WW5A 2VXJA 3H3ZA 4XFTA 2Q30A 2R30A 1H8VA 2H6BA 4QAWA 1CD3G 2G9FA 5F8PA 5J96B 3WF2A 1D4VB 2D6NA 1NA1C 2VNGA 3FFZA 1FMZA 2F2FC 3HJRA 1JLYA 3NQHA 2GN3A 1BZWA 3I29B 4MGZE 1RUF1 2R043 1RMU2 2XH6A 4D6RA 2AR6A 1RUG2 4QPYA 3I2GA 2VZSA 3LAGA 4UF0A 1GR3A 3CLPA 3U10A 4AGRA 2Z4FA 4CDWB 1IPJA 2YV8A 5A6YA 1F8VA 1PZ7A 4QWNA 5A32A 1RITA 5JPMB 2G1MA 2GN7A 5KHHA 2BFUL 3K3NA 3KCYA 4QO3A 1XJAA 2YMZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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