4A7ZA

Complex of bifunctional aldos-2-ulose dehydratase with the reaction intermediate ascopyrone m
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
887
structure length
881
Chain Sequence
EQPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 200
structure length 881
sequence length 887
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7zA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7zA03
3BAQA 2D7IA 5DUYA 3FFZA 4I3NA 3CA0A 4HA2A 1CVSA 4P0JA 3EF2A 3BAGA 5D62A 1J0SA 5BP5C 2Q9XA 5B2HA 3FJ8A 4II0A 3WMUA 1V6VA 3HSMA 1IRPA 3O49A 1W3FA 1HIBA 3NBNA 4QO3A 2P39A 2DRZA 4FVVA 4IY8A 3ZXDA 1HCDA 1JT5A 1R8NA 5DVHA 3CQAA 1S0EA 4A7ZA 2I1BA 1IILA 4GAIA 3BAVA 2LIQA 3CA3A 4OEEA 4LO1C 4ZOTA 1CE7B 1AVAC 4DCKC 4X3AA 4Q91A 3WMVA 1ONKB 2MC2A 4G6JA 4EFQA 5EHAA 1G9CA 2AXMA 3FJBA 1SR4C 2FFUA 1IJTA 2ZQOA 2AAIB 4H04A 1Q03A 2X2SA 3AKHA 4I4QA 3ZX7A 1PC8B 3ZXGA 1OQLB 1BFCA 4J2XA 4G6MA 5BQUA 1D0HA 3NBEA 2QN4A 3HMYA 1RMLA 4OWKA 3P6IA 1S0DA 1ABRB 4J23B 3O3QA 1F31A 3O4CA 1EVTA 4WBCA 1YXWA 2DS0A 2UUSA 1AVUA 3BAOA 5BQUC 3VT2A 3OBRA 3V0AB 4I4VA 2D20A 3FJ9A 2E4MA 1Q04A 4X37A 1IOBA 4LO7B 3N7LA 3RMXA 4KEIA 5BXSA 2GO2A 1NZKA 1QQKA 2LIEA 3V0AA 1K5UA 4LO3A 1DJSB 4J2KA 3UD7A 2KI6B 4Z9WB 1HWPB 1TTUA 3VEQA 2D22A 5G00A 4X39A 2FDBM 1DZCA 2J3PA 2AQZA 1NUNA 5F8WA 2D23A 3BA5A 1S0LA 1AF9A 3UD9A 1Z2VA 2WRYA 3IM5A 4JRAA 1JTCA 2VU9A 3FUQA 4J2YA 1EYLA 3ZC8A 4QALA 4I4XA 2NTDA 5BOWA 2ZR1B 4OWJA 3A23A 1YTOA 3O44A 4ISRA 2HZ9A 3F1RA 3QR5A 3UJ4A 1HWMB 4KEJA 5FNXA 1RZOB 3CRGA 4F83A 3TC2A 4D0TA 1BFBA 1IT0A 4QD2C 1ISZA 4CJMA 4EB2B 2D43A 4EFRA 3Q7XA 1AXMA 3SNVA 1HWOB 1M2TB 4EEEB 3AH2A 4JAWA 3OJMA 2WBCA 3CRHA 1N4KA 1HCEA 2BEBA 4KBBA 2HW9A 1AFCA 4OW4A 2IWTB 4H9WA 3NBCA 4LO2C 1Q1UA 1L2HA 5GAQA 1FMZA 4JKQA 4GOYA 3IM7A 3ZC9A 1PUMB 2X2TA 5F8YA 3H6QA 4PC4A 1GGPB 3HOMA 2XOAA 3R4UA 5FNWA 3RTJB 6I1BA 5HPZA 2Q3NB 3S8KA 4LO1A 3BX1C 3C9ZA 1K5VA 3R4SA 3LLPA 2HWAA 2FFVA 3PUBA 4IZEA 2D24A 3FUOA 1JQZA 3UDAA 1W3GA 4DENA 4ZKTB 1SR4A 1S0GA 1YF8B 3WA1A 1IHKA 4XFUA 1S0FA 4ZA3B 2YUGA 3HN1A 3Q7YA 1ISXA 3P6JA 21BIA 4R6UB 2P23A 4I4YA 1BA7A 3RMYA 2DRYA 1ISYA 4JP0A 3UJ0A 5BXPA 3CU1B 1XZZA 1WD4A 2Y9WC 4ZFYB 3FJAA 3RTIB 3MALA 3V0BB 4J2SA 5DZUA 2F2FC 3N0KA 3WINC 1FWUA 1TFMB 1FN0A 3CA6A 4XFTA 4ZBVB 1DQGA 1WBCA 2BFHA 3OJ2A 3AH4A 3V0BA 1R8OA 2ERMA 2MIBA 1W3AA 2VSAA 4ZLBB 3AJ6A 3A21A 3D7WB 4IZXA 3AZVA 4ZFUB 2KI4A 4USPA 1BFFA 1ILR1 1M16A 4ZGRB 4QKRA 2BEAA 8I1BA 3AKIA 4IY9A 4I4RA 3VSFA 4OEGA 3BA7A 1BFGA 1RY7A 3AKFA 4USOA 5F8SA 4TLPA 3CA5A 1P63A 4D8HA 3AZWA 3UD8A 1VCLA 3FJDA 3VWCA 4I1BA 1TOOA 4G9MA 3WO4A 4LO0C 1I1EA 4DEPA 4AN6A 3O5WB 1JY0A 4ENDA 1V6UA 3JRRA 4QD2B 1DFCA 1QQLA 4YOLA 5BXTA 3MPPG 5EC5A 4I7IA 1G9DA 2L5XA 2Y9FA 4KEKA 4OUJA 5DSSB 3VT1A 1T4QA 3P53A 3PMEA 3I2XA 1Z0HA 2D1ZA 2D44A 1A8DA 4LO8B 3BRGC 3OJVA 2HWMA 3BAHA 41BIA 1PWAA 2VUAA 3A22A 5BVPI 4QBVA 3K1XA 3O4OA 3H6RB 2VLCA 3IM6A 5FZYA 1Z4SA 2RQ9A 4A7YA 1AVWB 2ESUA 4JPZA 4LO2A 3H6RA 4GP0A 3I2AA 4JKXB 2R9KB 5FZUA 2Y9GA 3W9TA 2Y9XE 4EKXB 1TP0A 4I4OA 3BRFA 1JT7A 4I37A 4GAFA 1AVXB 3F62B 3CA4A 3CA1A 4I6IA 3NJ5A 9ILBA 3AH1A 3FJIA 5D61A 3POKA 7I1BA 3HBWA 2ET2A 4I96A 4Q9PA 4QBCA 4X38A 4GOVA 1ISWA 1BLAA 3HALA 4IONA 4XFSA 1MC9A 2NZ9A 3RSJA 2FO1A 1SZ6B 2VXRA 3AKGA 1UPSA 3O4DA 4Q9GA 3IAGC 3JUTA 1DZDA 3AJ5A 4OWLA 3BA4A 3BRDA 2AFGA 3FJFA 1IRAX 4Z8SB 1PUUB 3B9UA 1DQOA 1BASA 1RG8A 5F90A 4I1EA 4I2SA 1WD3A 1II4A 3FJEA 4GP3A 5JLVA 5D63A 2F2FA 4I0YA 2NP0A 2K8RA 3WINA 3FJCA 3N7KA 4IQPA 4EFPA 4QC4A 1FGAA 3KMVA 4KC3A 4A7KA 4P6AA 2RSTA 1QXMA 1TWMA 3BB2A 4HR6C 4G9NA 1HWNB 2VXTI 4ZFWB 1S0CA 1S0BA 1EV2A 3O4AA 3WO2A 3H6SE 4I4UA 3E8LC 2K4AB 3A07A 2M49A 1G9AA 1I1BA 5BXRA 3FJJA 1V6WA 1EPWA 3T8SA 3S8JA 2KLLA 1DIWA 2K43A 5EG6C 2KH2A 3QYDA 4LO0A 1YYNA 3PHZA 2KKIA 3OGFA 5I1BA 5FZZA 4L4HA 4L4IA 4F34A 2GZBA 4P0KA 1FMMS 1JT4A 3BAUA 3NBDA 4FGFA 1KNMA 2QYIB 1XHBA 2Z48A 4D0ZA 2NYYA 4AN7B 2VSEA 3BADA 1E0OA 31BIA 2NM1A 1ITBA 1JT3A 1G9BA 3OGGA 3N7MA 3Q7WA 3WO3A 2D7RA 3VT0A 1FWVA 3BTAA 4QKSA 2FGFA 1G82A 3OBTA 5JMCA 1FV2A 1BARA 3FJHA 3N7JA 2E4MC 4XKIA 2IHOA 3VSZA 1YBIA 3PG0A 4G1RA 4P0LA 1JLYA 4LO3C 3ILAA 4IYBA 4LO7C 2NVHA 1ISVA 4HJJA 4I8MA 1V6XA 2MLLB 1DFQA 1TWEA 3FGMA 3FJKA 4I4PA 5E24E 3V79C 4I4SA 1FQ9A 4OEFA 1WBAA 2DREA 1HKNA 3CRIA 2RG9B 1TIEA 3O4BA 2F8XC 4IHZA 1MD6A 3CAHA 1XG6A 4ISQA 1BLDA 1FV3A 3I29B 3VUOA 1T9FA 2Z49A 3LTQA 3IIRA 1PZZA 1XYFA 1DLLA 4JQ0A 2ZQNA 1JLXA 5BP5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OUMA 2A71A 2VZTA 4PI0A 2D3SA 4SBVA 2YXSA 5J09A 3I3QA 4UT5A 2JDAA 2F6BA 1UOFA 2J1AA 3Q8BA 1FAYA 1U5IA 1YUDA 4I01A 3LEMA 4KG8A 5FCCA 3VBUB 5B2GB 3QOPA 1CVSA 4P0JA 4M3CA 1LGBA 2WZ8A 1OVSA 1J0SA 2BQPA 1UYZA 4IEOA 1GQHA 1AJKA 1WUVA 5A7WB 3AVSA 3VBUA 3FJ8A 3WMUA 1IPJA 5B2HA 1F4HA 2PHDA 4GQ7A 5BNNB 2VVDA 2QJVA 3O49A 5CVRA 4QO3A 1WCSA 3K46A 4BYYA 3ZXDA 3GDBA 2YV8A 2WR9A 5A7WA 4JKMA 3WG2A 1AR83 4A7ZA 4EWEA 5BNNA 4GAIA 1ND2B 1HJGA 2W1QA 3AKSA 5FWEA 3C2UA 4AVCA 3PU3A 5CKQA 5CYYA 4EV0A 1HRI2 3ACGA 4Q0UA 3MIFA 1CE7B 4AI2A 4Q4Y1 5ACA2 1YO8A 4GKYA 1V6IA 4EN8B 5FZFA 1ONKB 1ND2A 4KWKA 4DZGA 2ZGTA 4S2HA 2DBNA 4EFQA 2WO3A 2W3JA 1VBA3 3FJBA 2VMEA 1SR4C 2ZQOA 4P14A 4Y1ZA 4XUQA 5DUUA 1SLIA 2GMPA 2VXJA 5EZWA 5FYZA 3AKHA 1GANA 5I0DA 3N9QA 5KXBA 3RQ0A 3TN93 3ZXGA 4X6RB 4C1XA 4DXZA 4DEVA 3A0NA 2XPJA 2CAVA 4QX0A 1U12A 3T2QA 5KHGA 1AYM1 1DGRA 5EYXA 4A4AA 1QDCA 1RGSA 2AENA 4WVZA 3LAGA 2WABA 1PZ7A 5KBFA 3P6IA 5HBAA 1I5PA 1AXYA 4AXOA 4J23B 2R0HA 3D3AA 4LO6B 1IPSA 3WW4A 4AGGA 2WFF2 4WBCA 2DS0A 2RG4A 3M7AA 2FMDA 2UUSA 4QB2A 2RS53 4PF1A 1YEWA 4ONUA 5EPAA 5F3IA 3WF4A 3VT2A 1LRHA 2P6CA 3KV9A 1RITA 1LEMA 3VBOC 3IDAA 5IATA 1KEXA 2DUQA 3PVOA 3SEPA 4Q4V1 2C26A 1W9SA 2Z42A 2J42A 4IV3A 3N7LA 4KQ7A 4DEQA 1HX6A 1US3A 1LOFA 4DS0A 2CV6A 2FMYA 4WBBA 4DQAA 2W94A 2HWB1 2BNOA 1VP6A 1EV12 3B7MA 4JVAA 4LIUA 4KMQA 5CU1A 4BQYA 4J2KA 4LO3A 3CBNA 1COV3 2Y6FA 1HWPB 1TTUA 1GOFA 2UY9A 5G00A 5F9TA 2RR13 1C8NA 2WA4A 1NXD1 4RFT0 1J1LA 2JDNA 5EP9A 3WCRA 1U0AA 1MS4A 2AQZA 1O6UA 1QF3A 3JBG2 2R043 2ZHMA 2OYZA 3LD8A 3BA5A 3MLKA 4DRVA 1W0NA 2ZKLA 4XYXA 5GKAC 4DIQA 1X36A 2WRYA 1AR71 2JG9B 1OBNA 1SACA 3BN6A 3FMGA 4FPFA 2FDFA 1EYLA 4J2YA 3PVBB 5CADA 4QALA 3GHMA 1KXGA 4L99A 4RS5B 5F8PA 4NHYA 3SITA 3AYEA 3WQBA 4R9BA 2SBAA 2VZSA 4CCMA 4WVMB 1LU1A 1ULDA 3HQRA 4WM7B 2OA2A 3AKTA 3QR5A 2UURA 2JG9A 2KA3A 3GCWA 5FNXA 2RS12 1NZIA 1QOOA 2NS2A 4P00B 2RMU1 4RS5A 5CFDB 4OHXA 4QXBA 1S0JA 2Z4FA 5L36A 4FP3A 4WVMA 3SKJE 4WM7A 4D94A 5HCFA 3J8F1 1TME1 2BV4A 4CDUC 4COVA 1ISZA 1OUXA 3AMMA 4GWIA 5CFDA 5I0RA 2JDMA 3SNVA 2VMDA 1M2TB 4IERA 4MGYE 1ZBA1 2BFUL 2VL4A 3PL0A 3LEKA 1JOPA 1ZBE1 4A2UA 2UY8A 2VECA 3GZTB 3IDBB 2VE1A 5LASA 2ADDA 3HT2A 5K0UC 3IIIA 1D4M2 2XJUA 3Q9OA 3CRHA 4EYUA 1KQRA 2NQYA 2CNAA 2A7AA 4XBLA 1N1VA 1FMD3 3N3HA 2W87A 1VR3A 5FZ1A 4D6RA 4JZRA 2IWTB 4QX8A 3VHNA 1S4CA 5JAXA 1W2NA 1F2NA 1L2HA 3NNFA 4GMP3 3IM7A 3FN9A 4Q4W2 3MUY1 3VDDC 5J7MA 5F8YA 3U0ZA 4AGRA 2BNMA 3H6QA 4PC4A 1T2XA 4Q4X2 3SKVA 4XXPA 3H8OA 1GGPB 2XOAA 1O3TA 4LBOA 6I1BA 4X8NA 5FYUA 2C4XA 3V65A 1W8HA 4BHPA 3JD72 4XABA 1FPN3 5E1RA 1V6KA 3R4SA 1K5VA 2ZGKA 2FFVA 2WL1A 3PUBA 1XNCA 5FO7B 4GWJA 3J26N 3CO2A 2D24A 3F95A 3FUOA 1PNGA 3UK9A 4LHLA 1DYKA 1VBC3 3GBWA 4H3WA 2GH2A 2QQIA 3ILNA 1A6CA 3THTA 4ZKTB 1QHDA 3K75B 5A6XA 4K8FA 1SR4A 4INDA 3VKMA 1IHKA 3VZMA 3GXUA 1I5ZA 5FMOS 1JZ6A 2QDNA 4XFUA 4HXCA 2B46X 4ZA3B 4ZU7A 3HN1A 3CQOA 5ERLA 4BOWA 3Q7YA 1DQ6A 1WMXA 5IVCA 3IAGC 1MEC3 2A3WA 5I8YA 1Z7S2 2JECA 1ZX5A 2VUCA 3EB7A 3KGZA 4P9WA 5FPUA 1BMV2 4IE6A 3U75A 3ETPA 3LGRA 4GB32 2WKKA 1UF2C 2AUYA 3ZO0B 1BA7A 4CCDA 2EXKA 3L9JT 2DRYA 3VBOB 2ZHKA 1HV1A 3UYJA 3VZJA 4JP0A 3UJ0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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