4ADTA

Crystal structure of plasmodial plp synthase
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
278
structure length
273
Chain Sequence
DNDSILLKHGWCEMLKGGVIMDVKNVEQAKIAEKAGAIGVMILENIPTDGVARSVDPLKIEEIRKCISINVLAKVRIGHFVEAQILEELKVDMLDESEVLTMADEYNHINKHKFKTPFVCGCTNLGEALRRISEGASMIRTKGEAGTGNIIEAIKHIRTVNNEIKYLCSLDESEVYNFAKKLRAPIDLILLTRKLKRLPVVNFAAGGIATPADAAMCMQLGMDGVFVGSGIFESENPQKMASSIVMAVSNFNNPKILLNVSLGLGKAMHGNTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Assembly of the Eukaryotic Plp-Synthase Complex from Plasmodium and Activation of the Pdx1 Enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PYRIDOXINE BIOSYNTHETIC ENZYME PDX1 HOMOLOGUE, PUTATIVE
molecule tags Transferase
source organism Plasmodium berghei
total genus 96
structure length 273
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4adtA00
2F7FA 4MLRA 2V8ZA 2DZVA 1LBLA 1WDWA 4HSNA 1M7PA 2CU0A 1G4TA 3ABQA 3ZWSA 1YTEA 1ME9A 3MI6A 2C19A 5DCDA 3OBKA 4O19A 5KITA 1HFBA 3HG5A 3ANYA 1S5WA 4XKYA 4Z1AA 2ZQ0A 2QDGA 4L4MA 1TTJA 1J4EA 5D2VA 5HNRA 3D0CA 2E6YA 4MJMA 3FA5A 4ZL1A 2VEIA 5C5YA 4UTTA 2FDSA 5KMYA 1VQTA 1KBIA 1PV8A 1RR2A 4JTJA 1J5TA 3LCHA 1QPOA 2ZYFA 3UWUA 1F6PA 4HNVA 2BXVA 3LRKA 1F5ZA 2ZRXA 8TIMA 4O13A 3FYPA 4YXGA 3KRZA 3KVMA 3W7KA 1R2TA 3W88A 1H61A 2ZDRA 3UWZA 3P5ZA 3NM3A 1YPFA 5AHMA 1OK4A 5F2LA 3HMJG 2QF7A 3GNNA 5D03A 4LY8A 2V9DA 2OT1A 3QRHA 3NYZA 2B4GA 1XBVA 3S1XA 2ATSA 5LNSA 2HS6A 5DY2A 1OX4A 4WXZA 1XUZA 2EF9A 2NXGA 1KM0A 1ZCOA 5LNVA 1XKYA 1G69A 4K38A 2A0NA 3QYQA 3L66A 1PHWA 1IIGA 4NJKA 1YADA 4EIVA 2NX3A 4NU7A 4DF2A 4O1AA 3O06A 3PULA 3TAOA 1F6KA 2ZBTA 2A2IA 3LXAA 2ABBA 1ADOA 1OF6A 3IVTA 4MLJA 3LTYA 4FEZA 4HT3A 4BR1A 1SW7A 3B05A 4RXGA 2WSRA 4C1KA 2WQPA 1JQVA 3MP4A 3Q37A 1HO1A 1KLYA 2A7PA 2X30A 3W2LA 3PB2A 3SGZA 4HKPA 3NO5A 2QJHA 3Q2DA 3OVRA 3Q58A 2NXIA 3JRKA 1QFEA 1TPH1 4NNCA 1LP6A 1KM5A 3I7RA 3TA6A 3CWNA 3LRLA 2J9YA 3BLFA 1I2OA 4HSOA 4JY9A 2XN0A 3NL5A 2YPIA 3CIWA 4FIRA 1I2QA 3R2GA 3STFA 3TMQA 1O4UA 1KM2A 2DORA 2J6XA 1B4KA 1W3IA 4N02A 2V5LA 5MHBA 3VCRA 3L0KA 4PTNA 3THAA 1QO2A 2WSYA 3QPZA 1M5WA 3P7YA 4MY8A 3T4CA 4O0ZA 2X1TA 5FEPA 3QMSA 5A5WA 3DZ1A 4AEOA 4E38A 1BKSA 5D2TA 4UTKA 4M7TA 1T99A 3NL6A 3RF9A 1C29A 1SSGA 1W0MA 4Y8FA 3BV4A 3Q94A 4LRSA 3TQKA 2FB2A 1DHPA 3EKLA 4I9AA 3MHUA 2VOMA 4JY8A 1F05A 1OFBA 4FNTA 1Q6RA 3LCIA 3TV8A 3NNTA 4MFDA 2EAWA 3SECA 4OGZA 5J5RA 3G0XA 1PCWA 4BWLA 1QNVA 5DXYA 3W1AA 2BLEA 2VFIA 5FF0A 4Z0JA 1GJPA 3IIZA 2P0OA 2RKXA 4BF9A 1H7NA 1KW1A 3PS7A 3EXSA 2E77A 3KX6A 1QMLA 1S5TA 3LHUA 4EF9A 3CU2A 3H54A 2AQWA 3TJXA 3TSBA 3DKLA 3C2VA 1FDYA 3SSJA 1TSIA 4O0KA 1KLZA 1O5XA 1OFOA 4JTUA 3W1TA 1G7VA 3LBMA 4AB4A 4AWUA 3LXBA 3KVKA 4JYDA 4S2BA 2LLEA 1FCBA 4ML9A 3UQNA 4DBEA 3CTLA 4YMZA 3M6YA 4K7VA 5CG7A 4IXHA 3BVJA 1KM3A 3HB9A 3G1FA 4PODA 3T40A 5EKYA 1YDOA 1U83A 2B0MA 4EVZA 2OZ0A 4OV4A 1NF7A 1LBMA 1JQXA 3W2UA 3QMRA 2WJZA 3HO8A 4YL2A 4RR4A 1VCFA 1P1XA 3STCA 4ZQCA 3NL2A 5T26A 3RU6A 3O16A 1DORA 1SO6A 2NX1A 3G3DA 1GYNA 4UR8A 1UJPA 1QDSA 2Y6ZA 4WUIA 3M5ZA 4I7VA 5K9XA 2O7QA 4JEQA 3L65A 4NJGA 2WOQA 1AG1O 1JJKA 4QJ1A 3S1WA 1A5CA 1TRDA 3PBYA 3W7OA 4UMBA 3W7PA 3W86A 4WY0F 2H8XA 3O05A 3NQ8A 2R94A 4IX2A 1F73A 2HSAA 1JUKA 3NQDA 4MOZA 5K4ZA 1DKWA 4M6QA 4XBKA 3G0SA 5CZTA 4TMCA 1O5KA 3GZ3A 3QMTA 2CLKA 1SZEA 3O15A 3NXFA 4YWIA 4Y9AA 3G1AA 1TV8A 4BFAA 4CLMA 1L6SA 2VELA 1T0OA 3L5LA 4O1CA 3HGJA 4NJIA 1GVFA 2QCHA 5AN7A 5EMUA 2Q3OA 1A5AA 3UPWA 3R8RA 4UCGA 3P60A 1FWSA 4UNLA 3HGSA 4LUIA 4QIUA 1FXPA 3LCFA 3MHFA 4AF0B 1QO5A 1R47A 1VHCA 2DZWA 3W1MA 2Q8LA 4N6FA 3NZ1A 3IGXA 2YW4A 3TU9A 4M6VA 3QF0A 1JCJA 1ICQA 4O4WA 4U4MA 3M43A 3S9YA 4IPIA 1XUUA 3SR7A 3SZ8A 3MYPA 2H3DA 2NV2A 4GRSA 1W56A 3W87A 1OFAA 3INPA 2CZ5A 4IJBA 4DEFA 3LI0A 4O11A 2FLIA 3QSTA 2BX7A 1TO3A 3HBLA 4Z0SA 2V2CA 2B7PA 4PC8A 2H6RA 4Z1BA 4JICA 1VC4A 3IIXA 3C8FA 1SU5A 5KINA 4UC5A 1YXCA 4ORMA 4ZQRA 1WOBA 1W5NA 4U28A 1ZNNA 5K9DA 1UB3A 5D33A 2VXNA 3FS2A 1T8XA 1IIHA 3CWOX 4WQ6A 2RDWA 3DI1A 1OJXA 3R13A 2V5BA 2PRLA 1TPC1 2BTMA 5AC7A 4LVAA 1H7WA 3O6DA 4XTIA 5EYWA 5KSWA 3W7EA 3ATZA 4OWGA 4AHQA 1WBHA 2Y7DA 3FJ6A 3LDVA 3LV5A 5D2WA 4H6KA 5K7JA 2ZZ3A 1OFDA 3NOEA 3E9AA 1LM1A 5F2GA 3WJWA 3N3MA 3F4WA 2E5DA 4WX2A 5D2XA 4UTHA 1VJIA 2V2DA 1SO4A 4DF1A 3LCGA 1BWLA 1ZAJA 3BPWA 4TR9A 5U7SA 3W2JA 3KRUA 1GG1A 1W8SA 4HNTA 3AJXA 4TIMA 3M44A 4K6AA 4ZQPA 4XKYB 3EX3A 4LU0A 3MO7A 2ATMA 4AF0A 3F4NA 3L0GA 2WPBA 1L6WA 3MI2A 3DFPA 3FFSA 3LV6A 4FNQA 3HG2A 5DY3A 3M5VA 4KWVA 5LGXA 3WK3A 3DFOA 4M19A 2E5CA 4N2YA 3RLVA 3P67A 3L67A 1W3TA 3W73A 3TMLA 4CNNA 4CCCA 1WXJA 3R12A 3I6RA 5I3KA 1JRBA 2HS8A 2I14A 3W1PA 3QFEA 4NZFA 1K7XA 3C3NA 2VEMA 3U2OA 4O28A 3P82A 5SWUA 2CLOA 4AH7A 4AVFA 4Z08A 2QAPA 2V2HA 1AMKA 3CM4A 4UFJA 4ZQNA 1IXNA 1LOQA 4NVTA 3JR2A 3B03A 1K7EA 1VCGA 4UTLA 2QCFA 3HQ1A 2VKZG 3UZJA 5LNUA 4LS1A 3LTPA 4OHQA 5CPLA 3TAKA 4RZ4A 2A6NA 1GTHA 2GJNA 4IXXA 3LHZA 2QKFA 3P80A 3EWBX 5FF2A 3B06A 3M5YA 4NNAA 3PSVA 1Z41A 3HIJA 3S0CA 3W71A 3KAOA 4LTSA 1XC4A 4O54A 1Q6LA 4CQ8A 3FKKA 3HPSA 5AYXA 1OYBA 2J9XA 3UWVA 4AHOA 1K8XA 5KZDA 3NQVA 2FIQA 4MZYA 4Q32A 3W7GA 5FESA 4N9CA 4NX0A 3P61A 3DI0A 3TE9A 2JGQA 2Y70A 2C13A 4LW7A 4XUGA 4ADSA 2JKPA 1MXSA 3QQ0A 2A7NA 3NQ7A 4JTLA 4N6EA 1OFRA 3NA8A 1XBYA 3NPUA 1TTPA 4GFSA 3W07A 4MFEA 2ZZ1A 3UXDA 5AHLA 2OT0A 3VE9A 1SW3A 1VZWA 3L9CA 2TSYA 3S8HA 3W7NA 1DJNA 3W7RA 5K4XA 4LV9A 5HULA 1MSSA 7TIMA 1ML1A 3P81A 5KZEA 3GLCA 5G2HA 1B57A 1EP1A 1LRQA 2DZSA 3THQA 1OFQA 5FEZA 4E2DA 3BW3A 3NPVA 4UIOA 4KFNA 4TU1A 1A5SA 1JVNA 5I3FA 3S5OA 3CEUA 1DOSA 1K03A 4UTUA 1GVSA 3ZR4A 3A23A 1TTIA 4ADTA 1W5PA 1PVNA 2Q8ZA 1ZAIA 1PL9A 1DL3A 3I68A 4BK9A 5HWNA 4L4LA 2QCDB 3QC3A 3HGOA 2VEPA 1AW1A 1DBTA 3HGRA 1SPQA 3PBVA 4N9DA 2WV8A 3FLUA 3MYOA 4AXKA 4LNYA 3W76A 3LCLA 2A21A 3C2OA 1YTDA 1JULA 1Q3NA 1W1ZA 1JCNA 5C2XA 1X8FA 3LB0A 1KA9F 3IRDA 5AHIA 4JIPA 4O18A 5TBOA 5A8GA 3E96A 1J2WA 4DO6A 1WQ5A 2YSWA 3TNOA 1VR6A 1AK5A 1Y0EA 3G3MA 5D32A 1ZY9A 5HQEA 1FCQA 3LCXA 4K39A 4FXSA 1YXDA 1HTIA 1JUEA 2GOUA 1H60A 3N34A 1LOSA 1R46A 1W54A 4IPJA 3TDFA 3EWYA 4MY9A 2NWRA 2ZZ6A 1H7RA 1OYCA 1PHQA 3DBPA 1KBJA 3UWWA 3EXTA 5LHEA 6TIMA 4Z1CA 3T7VA 2TRSA 1TPWA 1D3HA 5K2ZA 5F1UA 3TIMA 4NXKA 1QOPA 4X22A 4LVDA 5G2IA 3EX6A 3TW7A 3LM7A 4D2JA 1AW2A 4HIBA 2TYSA 4NT0A 2W79A 3WK0A 3IVSA 4CNPA 3ABOA 4WY0B 3PVFA 4O4VA 3KVJA 2GVLA 3PAJA 3C2FA 1KM6A 5EPDA 3A5FA 4C1LA 1K7FA 3HJZA 2QCDA 3N2MA 5E0KA 4AHPA 2E6AA 1YDNA 3EX2A 3W7DA 1PS9A 3BGGA 3W7IA 1BEUA 2QUUA 1JUBA 5BOOA 4NJJA 2RFGA 4JDBA 5BRBA 1EUAA 2XFWA 1I45A 1RV8A 3NG3A 3W85A 2H8ZA 2RDTA 1SW0A 2CLFA 3EWZA 1SQ7A 4NZJA 4JYFA 2ZFAA 4CQ9A 1LLZA 3W22A 1NFBA 3W83A 2CW6A 3EX1A 2ZCGA 5TIMA 2A7RA 3EWXA 1O60A 3W7HA 5D02A 3DFQA 2QCEA 1K3UA 5DBUA 3I7QA 1B3OA 1LTDA 3NQAA 2CLIA 4NX5A 5G4WA 2NUXA 3ABRA 1KFLA 3TFCA 2CZEA 5GVJA 1SFJA 3P62A 1FX6A 3GAKA 3O6CA 1FWWA 3W1QA 1VPXA 3N73A 3EX4A 3NAVA 5AYZA 2P10A 4J9JA 3TSMA 4XBSA 4R53A 1XI3A 1SO5A 5AHEA 5HWMA 1ZALA 1G4EA 3NQGA 3LHTA 3IEBA 1QCWA 4JTKA 1BTMA 1HUVA 1TIMA 4NNBA 3CB8A 5AOUA 3USBA 3TUUA 1DQWA 1JR1A 3E02A 3IIVA 3CLMA 3OVQA 3BARA 3P8JA 2FFCA 2X1SA 3TW6A 1N7KA 4EOUA 4FX6M 3TJLA 1TV5A 2NV1A 3TSDA 3WJZA 1SUXA 2ZZ2A 4JDYA 1DJQA 4H4IA 1RPXA 2BWGA 3NR0A 4YCOA 1GT8A 3TK7A 2O7SA 4ZQOA 1FBAA 1FWRA 3QW4B 5HMSA 1FCVA 2DZPA 4IX0A 4Z1DA 3B0PA 4WY0A 2RDUA 3ATYA 3FEMA 2I9EA 4BI6A 1LORA 1L9WA 4X2RA 5HUOA 1TPB1 3A9IA 3QM3A 3GNDA 1VYRA 5F1VA 4DO4A 2C18A 1EA0A 4NJHA 5LSMA 2ZZ4A 3GK0A 1EUNA 4JR5A 1P4CA 1QAPA 1XBZA 3C2EA 3LLDA 3OVPA 1W5QA 1YDVA 4UMCA 2VEKA 5HWJA 1ME8A 2QEZA 3JS3A 4EWND 4JTGA 3LHWA 4QQ3A 1H7PA 1OX5A 4E2BA 2A4AA 3C61A 4ADUA 3P5YA 3W70A 4FB7A 2GQ9A 2QCMA 1THFD 3LERA 5ABTA 5HR7A 3T78A 1RQBA 4PA8A 4WXYA 2B7OA 2CLMA 5DN1A 1WX0A 4PCFA 6ALDA 5AC8A 4YLWA 3DAQA 4FF7A 5C54A 4K8EA 5HJLA 1L6YA 1ZAHA 4LT9A 1KFKA 2FPVA 2GVJA 4HNNA 1JCMP 1OVDA 2E6DA 3BG3A 5CPNA 5DELA 4K8HA 4IMGA 4RJEA 3OHIA 3BGJA 1WOAA 1ZJIA 4FNRA 4GNJA 1QPRA 1PE1A 3TCEA 3TXVA 2TMDA 1PCKA 2EHHA 3G1HA 2ISSA 3TH6A 4DPPA 5CPOA 5D2YA 4GJ1A 3GXNA 3O63A 4OQVA 4W9TA 2G95A 3EKZA 3V75A 2NXHA 2VC6A 3G24A 1Q45A 3FKRA 1VYPX 2PURA 3WK2A 3VE7A 4QISA 2NWSA 4N4QA 4QNWA 4XTDA 3EXRA 3BK0A 1O95A 5CZSA 2QCGA 5LNRA 4O57A 1XDLA 3B8DA 5G1YA 1X1ZA 4JN6A 4E0CA 4RK8A 2H90A 1KFCA 3CHVA 4XWUA 3W7MA 3GXPA 3NM1A 1D3GA 3MMTA 3LBCA 2QCLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RPM A;  2V8Z A;  2BS9 A;  3M0K A;  2CU0 A;  3ABQ A;  2V5D A;  3ARU A;  3MI6 A;  3OU8 A;  3OBK A;  5KIT A;  1HFB A;  4ZOB A;  1W3J A;  4DIA A;  1S5W A;  4CNS A;  1HXJ A;  1CDG A;  2QDG A;  4L4M A;  4LAZ A;  5D9M A;  3CK5 A;  1W8G A;  2E6Y A;  4MJM A;  1BVZ A;  3HZ3 A;  1UG6 A;  3QGA C;  1KBI A;  1KO0 A;  2Y8V A;  4JKK A;  1J5T A;  1RA0 A;  3UWU A;  4W7U A;  2VZS A;  1ITQ A;  4O13 A;  3V16 A;  4YXG A;  5ABG A;  1E0X A;  1IE7 C;  1H61 A;  3NSN A;  3UA4 A;  3NO1 A;  2QF7 A;  3GNN A;  4C6J A;  5D03 A;  3WUG A;  1ODZ A;  5I07 A;  3S1X A;  2ESC A;  3SUW A;  5DY2 A;  1PKL A;  1XUZ A;  4CNU A;  1KM0 A;  5LNV A;  2X09 A;  1XKY A;  3OLD A;  4J3S A;  1G69 A;  1PHW A;  2INZ A;  4EIV A;  5FCZ A;  3O0K A;  3EMQ A;  4UBP C;  2WVV A;  2ZBT A;  4GKT A;  1JZ3 A;  3REQ B;  2ABB A;  3H23 A;  2E8Z A;  3LTY A;  2E9M A;  4KWS A;  2XM2 A;  2DW7 A;  3E2R A;  1OCN A;  3UR2 A;  4C1K A;  2WQP A;  4AUB A;  1JQV A;  1QTW A;  2VQT A;  3QV6 A;  1HO1 A;  2OZT A;  1O68 A;  4WSJ A;  3BJT A;  4R27 A;  3OVR A;  2XVP A;  3KP0 A; 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