4AF2A

C61s mutant of thiol peroxidase form e. coli.
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
QGIDPFTMSQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOL PEROXIDASE
publication title The Structure of an Orthorhombic Crystal Form of a `Forced Reduced' Thiol Peroxidase Reveals Lattice Formation Aided by the Presence of the Affinity Tag
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 52
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4af2A00
2M72A 2GQKA 1WWJA 2CV4A 4Q5NA 12GSA 1TOFA 1GSQA 5F06A 5L71A 1Z9HA 4OCFA 1EP8A 1WJKA 3HXSA 3L0HA 3TJBA 4XRAA 4KDUA 2PVOC 5H5RA 2LJRA 5DALA 2CX3A 2R5GA 1ZCPA 3KCMA 4O7HA 4XS4A 4K0GA 1BG5A 3CSJA 3FZ9A 3KTBA 2FD3A 1TTZA 5IMDA 4POBA 4WF5A 3LYKA 3SWLA 2EIRA 3A2VA 5H5SA 2LEGA 2CZ3A 2GZPA 1H75A 3EMPA 2K18A 3VWXA 1AUCA 2YOIA 3APSA 2AUVA 3TRPA 2AHEA 5D96A 3EINA 1ZYQB 3HCZA 3ZIJA 2I9HA 3I69A 4WF4A 3UMAA 2X8HA 3F8UA 3GH6A 3TRQA 1AW9A 3UVHA 2YV7A 2KUCA 3D21A 4EF0A 1MD4A 4N0VA 2EIOA 2VD0A 1JHBA 2ALBA 2EIQA 5D8IA 2XC2A 3DD3A 3U5RE 5AIXA 2PERA 1FVKA 1PKWA 3UL3A 4ZBDA 2BJXA 3HJPA 4XS6A 5A4VA 19GSA 3ZRDA 3GL5A 17GSA 4OMVA 2X8CA 2N5BA 5CP1A 4DSRA 3K8NA 1OE8A 4HEA2 2VOCA 5G5FA 3IRAA 1GLQA 2GT6A 3KP8A 2FNOA 3O6TA 4O32A 5A5KA 2DSAA 3IE3A 1CQGA 4O5RA 2AB6A 2IPAA 1TK5B 2LSTA 1SK0A 3RPNA 2DC5A 1DE1A 5CAXA 2RIIA 4IP6A 5B7CA 3PR8A 3PINA 2F8FA 3C7MA 4POKA 3LG6A 4ILFA 4V2NA 1QXHA 3F0IA 1X5CA 1ZYEA 2YN1A 2VCTA 1JLVA 4PQIA 4Z7XA 7GSSA 4IW9A 4G10A 1XVQA 3KEBA 4K1FA 4PURA 1KTEA 2L59A 4MJCA 1JZOA 3IDVA 1RK4A 3IOSA 6GSWA 1K0NA 3CBUA 1R26A 2V2GA 2WFCA 4NXIA 5IOWA 1Z6NA 2G2QA 1J0FA 1Q98A 5HR3A 1HYUA 4DSSA 2O8VB 3HD5A 3DIEA 1TXXA 4MH3A 3FKFA 3IA1A 2CX4A 1TRSA 1O7UA 2FWGA 2CT6A 1XFLA 2HLSA 4ML6A 4RQXA 1U87A 1F3AA 5DCGA 5DVBA 4YQUA 2WCIA 4L0WA 5HR1A 5A4WA 2C80A 4X1UA 1MDJA 4TR3A 3FR3A 3EURA 1GTAA 3WD6A 3QAVA 1MEKA 1SYRA 4FYUA 1V9WA 4GXZA 4HU7A 4X43A 1PL2A 1YJ6A 2VCVA 5D9XA 5ECHB 1OC9B 1MTCA 5ELGA 2VL2C 3GMFA 1GL8A 1FOVA 2H1DA 5HR2A 2OKAA 3VI5A 3CXGA 4GCIA 6GSTA 5JCGA 1ERVA 1MDKA 5C04A 5KN2A 4NWYA 3L9UA 4TXVA 1EP7A 3ISOA 1GRXA 2MMAA 1G6WA 2VAFA 4CHSA 1W89A 3EU3A 4WBRD 4PUAA 2VL3A 2A4VA 1RW1A 1SJIA 2HRFA 1BEDA 1OC9A 14GSA 4I5QA 1ACVA 2PWJA 1QMVA 3C8EA 5GZZB 2GT5A 4MABA 4Q5RA 2N5AA 2HRNA 1V57A 5D93A 5CRHA 1AQVA 5HQPA 4JRRA 4MP4A 3RHBA 3KZQA 2Z9SA 5IOXA 4WKWA 4KDYA 1DSBA 2C0DA 1FB0A 4HU9A 4PQ1A 4F82A 3LGCA 1SJ6A 4WXTA 1R7HA 1ZOFA 2DJ3A 3O76A 4I8BA 4NPBA 1ERWA 3GKMA 1JZWA 4N0ZA 4OWYA 2KP2A 3GTUA 4KCAA 3G9BA 2R6KA 2H6ZA 4IGJA 5B8BA 1S3DA 1XZOA 2HT9A 2LV3A 2FCHA 2LRCA 3MWHA 3L4NA 4E8HA 1A2MA 1W4VA 4ZB6A 1T4ZA 1U3AA 1A2LA 2GVPA 5DBQA 5B8AA 3GKKA 4TR1B 3VPTA 4TXOA 1NM3A 2OE0A 4BWQA 4YAVA 4ZXGA 2LQQA 2DMMA 2LQOA 3ME7A 3D5JA 5IMCA 5ABRA 2JZTA 2DJ0A 2VLUA 1ON4A 4ECCA 4MPGA 1Z3EA 2YANA 5G31A 4NV5A 2X99A 4NV2A 2XBIA 4MJEA 2GQMA 1ML6A 2LJAA 3IK7A 5KN0A 1S3AA 2R4VA 2V6OA 2PBJA 3LXZA 1X9MB 2E7PA 2GQLA 1X9SB 1I5GA 4P3YB 1XCCA 1T00A 5AN1A 2HZEA 5C00A 3KD0A 4TN8A 2ZCTA 4F0CA 5IM9A 1XWBA 1K0OA 3VWWA 1O8XA 4ZL8A 3ERWA 2RLIA 1HQOA 3TJGA 1K3LA 2C0GA 1AQWA 4KDXA 1XWCA 3Q74A 3KMOA 3L9SA 3GNJA 3CTFA 4MK3A 4LL1B 2LUSA 2O7KA 3ZMLA 10GSA 5ELAA 3EMXA 2F9SA 4TOPA 4ZB9A 4D73B 2IMDA 5ENUA 5IO0A 3I6AA 1B9YC 6GSUA 4LLRA 4WR5A 2WJUA 3GV1A 5D9VA 3M1GA 4LMVA 4EE0A 4K7OA 2PMTA 1SK2A 2H6YA 3MAKA 1EEMA 2VCQA 2WULA 2F3MA 1Z7RA 1GNEA 4MJAA 4XCSA 4N10A 6GSSA 4NAXA 3H1NA 3P90A 4MCUA 2ZUPA 3F4RA 1M7TA 1PKZA 3FY7A 1XOBA 4V2LA 1SKWB 5ECMB 2B7KA 1E2YA 4X0XA 2NDOA 3BD2A 3E9JB 9GSSA 1BYEA 3EYTA 2VL2A 3FHKA 3H8QA 2FWFA 2FA8A 2L5LA 1WP0A 5DALB 3EE2A 3TUEA 1TRUA 2DIYA 4XS4B 1OC8A 3LORA 4HUAA 4ACSA 5HR0A 4F2IA 2KOKA 3QFAC 2AJQB 5HFKA 2H66A 5EY6A 4L5OA 4G2EA 4K6XA 2JADA 1HD2A 4GLTA 1FVJA 1VF1A 1OKTA 5CO3A 3ZVJD 1G0TA 3N5OA 4V1Ap 5FT3A 1ZL9A 4O92A 1K0DA 3HZ8A 4AF2A 5J41A 3P7XA 5IO2A 4GSTA 2H8LA 5B6NA 2B5EA 4WETA 4YQMA 1X0RA 5KN1A 1EV9A 2OE3A 5CRDA 3QAWA 3LYPA 2VIMA 3LSZA 2GSTA 3KH7A 2YJ7A 4KE3A 1A8YA 2IFQA 1G6YA 3VWVA 3VI7A 1KNGA 3C73A 2KHPA 3F6DA 4GRFA 4ECBA 3LQ7A 5KEJA 4MZBA 2L6CA 4EVMA 2FUG2 3M0FA 3HKRA 2MMNA 3L9VA 4RI6A 2RM6A 1ERUA 3I43A 2B3SA 2PN8A 4ZBAA 2PGTA 5GAPD 5LCZA 3D4MA 2YPMA 4FYCA 4HI7A 4MZCA 4E8EA 4I6XA 2MBTA 3IHQA 2IWTA 1GLPA 3J7Yb 3S9FA 4IQ1A 4XHMA 1M2BA 3FRCA 4DSQA 18GSA 3QOUA 1M9AA 2LRTA 5GSSA 2ON5A 4IJ3A 3KIJA 3CYNA 4V1Ag 3E0UA 4L5LA 4EDYA 3QPMA 1UA5A 1GULA 2V1MA 2J23A 4POMA 2C8UA 3M8NA 4NMUA 2H1AA 3TB2A 1THOA 5DAKA 2P5QA 1SKRB 4L8EA 3HY2A 1N2AA 5G30A 1GUHA 5G1KA 5ECOB 4IHUA 4JE1A 1A23A 3US3A 1MD3A 1JZRA 1PRXA 2M46A 3TKPA 4DSSB 2VD1A 3BCIA 1TU8A 1XWGA 3F63A 1OAZA 2H19A 1PD21 1ZZYA 1SL1B 2CA8A 2CAIA 2F51A 3P8WA 1O8WA 1I9DA 5ID2A 4OFNA 3TOTA 5E4WA 2I4AA 4KX4A 4JEDA 1JFUA 2C3QA 2J9HA 5F8BA 2KLXA 5DJLA 2JZRA 1J9BA 1U6TA 5GSTA 1CQHA 3DXBA 5INYA 4ECJA 2MYGA 4LMWA 3CRTA 4KNDA 1YEXA 3KTLA 1QUWA 1ZMAA 3PGTA 3OR5A 1T8EB 1XW6A 1EEJA 1A8LA 1FB6A 3GSTA 3KMNA 2TIRA 3HJMA 1TRWA 4GTUA 4HQSA 2MBSA 4I97A 3G7IA 3UAPA 4MF6A 1EZKA 2B7JA 1TKDB 4AJ6A 3GURA 3MSZA 4PNGA 3IPZA 3F6FA 1T7PB 3TKSE 1TK8B 4QQ7A 2YP6A 5D9WA 1S3CA 5JWQB 2L57A 4OO4A 3TGZA 3TKRA 3GKXA 3HA9A 2FA4A 4ZL7A 4GQFA 5J5NA 4F03A 1LU4A 1B8XA 4PGTA 1FW1A 3HDCA 2O87A 4JR6A 1NHOA 3DVXA 4MDCA 4WBJA 5IMAA 2GTUA 1GTBA 3CRUA 2LJKA 2I81A 2D2ZA 5DDLA 1XVWA 4HQZA 1PGTA 3GFKA 1NW2A 3I9V2 3LEFA 3GN3A 3GTUB 3FR9A 2NBSA 1Z7PA 20GSA 4JU5A 1VF4A 4PUFC 3TCOA 1ABAA 1BAYA 1C72A 2IMKA 2LNTA 4N30A 2JZSA 3EU4A 2VM1A 3HYPA 2JSYA 4TXOB 2OACA 2GGTA 3DEXA 4ZIJA 3WGEA 2L5OA 2GSQA 1A0RP 1GUKA 3C1RA 2LKUA 3TRXA 1PL1A 2QGVA 5CYYA 5F07A 2LRNA 2QKEA 4Q5FA 3GH9A 4XS1A 2K8VA 3ZL5A 2YJHA 2JSZA 5DQYA 3EVIA 3MNGA 5KN3A 3IAS2 5LNKe 3VK9A 3KGKA 3GA4A 1V40A 3ZYWA 4OO5A 3GYKA 3UEMA 2OE1A 4IVFA 2GS3A 1M0UA 1OE7A 2HZEB 3UARA 5AIVA 3O3TA 1GSYA 3IBHA 1F9MA 3ZLPA 4G19A 2WRTA 3H4KA 4PNFA 4ZL9A 4MJBA 3FW2A 1EV4A 1PSQA 2RUFA 1AAZA 3A5WA 3ZVJA 5CNWA 4FIWA 3Q6OA 4EXJA 1DE2A 2YWMA 5DQSA 1BJXA 22GSA 1V58A 3ME8A 3DMLA 1TW9A 2NTOA 1FHEA 2B1KA 1XIYA 2REMA 1XOAA 1THXA 2YWNA 6GSVA 4ECIA 11GSA 4BWSA 2YWOA 2B5XA 1G7EA 1VGLA 2L6DA 3IV4A 1PMTA 1RQMA 3KXOA 2MMZA 2E0QA 3ZREA 1WE0A 4V2MA 1QGVA 1F6MC 1GSSA 2WDUA 3NZNA 3D4TA 2P5RA 1XPVA 5A4UA 3H93A 3IAM2 1R4WA 1R5PA 1A2JA 1Z6MA 1DUGA 4LL4B 4DEJA 5AISA 4AJ8A 1GSDA 2H1GA 2CVDA 3NIVA 1V2AA 1TDIA 1ILOA 4POLA 3VURA 3WGXA 1N8JA 4IS0A 3ZZXA 4BPYA 2XPDA 2O85A 1BX9A 1FG4A 5ECQB 1SYXA 1X5DA 2H6XA 4TR4A 3TOUA 2OJLA 1AC1A 4JBBA 4YQVA 1LJRA 2GZYA 2HFDA 3JCML 3ED3A 1K0MA 2GSRA 4KGIA 2HE3A 3F4SA 2L4CA 4KW6A 4AJ7A 3ZFBA 5FWGA 4BVXA 4GWRA 1VRSD 5ECKB 1PA3A 3MDKA 1UC7A 3UBKA 4WEYA 3IC4A 5DJMA 2FGXA 2HXKA 4EUYA 1TRVA 3U6VA 3PH9A 2AV4A 4K2DA 2OADA 4XTSA 5COHA 3HVVA 1TU7A 2YNXA 3D22A 3J7Yk 1K0BA 1KBNA 3RPPA 1VF2A 2H76A 3GKNA 1GTIA 1QQ2A 1YF0A 2HYXA 2KP1A 2X64A 3GIXA 2HZFA 4K7IA 4IBPA 1A0FA 2CVKA 4GSSA 2GDRA 5B6MA 3QCPA 2ON7A 3IXRA 4HS1A 2C3NA 2YZHA 3QFBC 4ZILA 1HNAA 4AGSA 3TJJA 4TRXA 2H1BA 1EOGA 4MPFA 1WOUA 1SD9A 4TR0A 4QL9A 3F3RA 2I1UA 1O6JA 4GQCA 1T4YA 1A24A 2IMFA 2H74A 2K8SA 2HNLA 1OKDA 3M9KA 2VCZA 3FZAA 5IMFA 2QSIA 3DWVA 4IJIA 2DJKA 3ZITA 2H0HA 5CRWA 5G5EA 4K8MA 2IFQB 2X8GA 2N5FA 2H30A 1ST9A 3P2AA 5IPGA 4G9HA 1IYHA 3KM6A 2DIZA 2XPEA 4LA1A 4H86A 3DKSA 2FLSA 1EGOA 1K0CA 3GSSA 2C1YA 2DMLA 3G7JA 1SKSB 3V1WA 3HVXA 2PPTA 4JR4A 4RQRA 1GNWA 5IMVA 3QDNA 2P31A 2R2JA 1O81A 3WYWA 3TJKA 1BQ7A 4IP1A 2IJYA 4F9ZA 2OBKA 3F4TA 1NHYA 3LFLA 2K9FA 1GP1A 1EGRA 1WMJA 3W8JA 4JZQA 4MF7A 2IMIA 4IN0A 3TKSC 1AXDA 13GSA 4NHWA 1HNBA 5F0GA 3NOFA 2QC7A 1DBYA 1OVNA 6GSYA 4FH8A 3WGDA 1AIUA 2R37A 3M3MA 1ZGNA 2CZ2A 4ZB8A 3BCKA 1XBSA 2WB9A 1PQNA 1O85A 1KEBA 2DLXA 1GTUA 5DAKB 2H0IA 2YV9A 3VWUA 4MMMA 5EVOA 1TP9A 5J9CA 2PUKC 4ZBBA 1Y25A 4PXOA 4RUVA 4GF0A 1HNCA 4EDZA 5CRGA 3F3QA 3TKQA 1GSUA 4KSOA 3GL3A 3R2QA 3VFIA 1YDKA 3RDWA 2P0GA 4FO5A 1H4OA 4N11A 3BJ5A 3HJOA 4HOJA 4QL7A 1SU9A 3FYGA 5ECRB 5IQYA 3GRXA 1QFNA 5ID2B 3ZFLA 3LXTA 4KA0A 2GZZA 1GSEA 5ECPB 5J3RA 4YH2A 1Q4JA 3C71A 5IPHA 3M9JA 1FAAA 1F3BA 2HSHA 2VM2A 1B48A 1K3YA 2C0EA 1U3IA 5AGYA 3ZIVA 2VLVA 1YKCA 4EC0A 2AAWA 2VCXA 3CMIA 5D73A 4BL7A 5JWOB 1YKAA 2LTKA 1XWAA 1M2DA 3BBYA 3D0ZA 2GSSA 2RM5A 3DYRA 3LWAA 3FK8A 2PVQA 2JU5A 3FZ5A 4EO3A 4K7NA 3UIWA 1M2AA 3W6GA 2CVBA 2H73A 1TJDA 4ML1A 2VL9A 2NVLA 4K0NA 5J4UA 1TK0B 5J9BA 4GSNA 5G2ZA 2LS5A 2HI7A 4XIHA 2YCDA 4KB3A 3IR4A 2FY6A 3QAGA 1B4PA 1OYJA 2E2MA 3W8SA 3Q19A 1R5AA 3G7YA 1XW5A 2WS2A 4I2TA 2HSYA 5CREA 2R3XA 1IYIA 2C3TA 2A2RA 4J57E 3CSHA 3APQA 5F05A 2DBCA 5E59A 2M80A 1Z5YE 1JLWA 3QR6A 1SJZA 1FO5A 2LNSA 2MZCA 3BOAA 3CSIA 2V6KA 2BTOT 2MMOA 2YWIA 1U88A 5D9TA 2K6VA 3QMXA 3L78A 1EOHA 2RUEA 3GHAA 3TDGA 2H70A 1X9WB 5FHIA 1O73A 2YZUA 1B9XC 4TKYA 5EL8A 1G7OA 5JCWA 3UVTA 3QD9A 4KUNA 2H72A 1OC3A 5EPFA 5JWRB 4EKZA 4BA7A 3ZTLA 4RI7A 3VLNA 1QK8A 1TI3A 2DJ1A 3N9JA 1GSFA 3ERGA 5HFGA 4TW5A 2VUPA 5ECNB 1T1VA 1B4QA 1YEPA 2H01A 2OA7A 3IK9A 1GH2A 2TRCP 4PX1A 2TRXA 4WR4A 1X5EA 2FHEA 2H71A 3FR6A 1Y6EA 1YZXA 4L0UA 3TJFA 1GWCA 2B6MA 4CW9A 4MLYA 3EWLA 3ERFA 2IIYA 3Q18A 4KAEA 1TI1A 3TKSA 3RAZA 2G0FA 1WPIA 2FWHA 1VF3A 2FWEA 6GSXA 1F37A 4DVCA 5ECSA 4YAPA 3WT2A 2V32A 2WZ9A 1MDIA 4KH7A 2DJJA 1M99A 4J56E 4ISDA 4XRDA 4OFTA 8GSSA 1GUMA 16GSA 1PX6A 3KJYA 2B5YA 4Q5QA 2V41A 2O89A 2VCWA 1UN2A 3RBTA 1ERTA 2I3YA 4EL1A 4HDEA 3A2XA 4BVYA 2ES7A 3EC3A 3APOA 5ECIB 3UOMA 2L4QA 4KSMA 1K0AA 1SL0B 3E3EA 2WGRA 3A2WA 4IQAA 1WIKA 2E2GA 3GX8A 1SENA 2AYTA 5G1LA 5H5QA 5LD0A 1XXUA 1NSWA 4TR1A 5IMZA 3UJ1A 4MA9A 2IMEA 1UVZA 4OCEA 5HFIA 5GAND 4PQHA 2PU9C 2F8AA 4HZ4A 4MZWA 1K3OA 2VO4A 3HZ4A 1JZDA 1E6BA 3KH9A 3D6IA 2IL3A 4IKHA 2XBQA 1YQ1A 2H75A 5DCHA 2OBIA 4J2FA 3VPQA 3DGQA 1J08A 3WT1A 1URMA 4HJMA 2B1LA 2NPBA 2VLTA 1PX7A 4IELA 1T3BA 4ULXA 4NHZA 3CTGA 4ID0A 2XHFA 4F0BA 1XWKA 3DRNA 4HZ2A 2CQ9A 2C4JA 3KP9A 1LBKA 1SK1A 1YF1A 1PN9A 2JACA 1XW9A 4KCEA 4OFMA 1V98A 2GLRA 2CAQA 4CDOA 1SL2B 2ZNMA 1M9BA 1YY7A 3GUSA 3H79A 4MH2A 3F9UA 3HHVA 4MF5A 3DVWA 3GX0A 1WRYA 4D73A 1F2EA 1EWXA 2IN3A 4HJ2A 3ZMKA 2H0GA 2DJ2A 3AY8A 4I2UA 2A2SA 1USBA 2C0FA 3FZ4A 1AQXA 1SD8A 3SBCA 2BMXA 4K9ZA 3FEUA 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