The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYNATRWTDLSFHKGEKFQILDGDSGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| total genus |
11
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ABQ A; 3C0C A; 2DF6 A; 3FJ5 A; 3RBB B; 1HJD A; 1GBQ A; 4JZ4 A; 2J6K A; 2O31 A; 4GBQ A; 2JS2 A; 1E6H A; 2G6F X; 4HVU A; 1OPK A; 2MCN A; 2DL4 A; 2JW4 A; 2DL8 A; 1X2Q A; 4M4Z A; 3LH5 A; 3A98 A; 1SSH A; 2J06 A; 2K9G A; 1X27 A; 3U23 A; 1OV3 A; 2XMF A; 4Z89 A; 2C0T A; 2V1Q A; 2BZY A; 2L2P A; 2F2V A; 1VYT A; 2O9S A; 4Z8A A; 3REB B; 3VS0 A; 2DIL A; 5IXB A; 1H3H A; 4FSS A; 1NYF A; 2DVJ A; 2VWF A; 2EPD A; 2DYB A; 2LZ6 B; 1UGV A; 4RTV A; 2KT8 A; 1WIE A; 4Z88 A; 4E6R A; 2QDL A; 2DA9 A; 1AD5 A; 2I0N A; 4RTT A; 3VS5 A; 4RTY A; 1U3O A; 2ED1 A; 2YUQ A; 1UEC A; 1M30 A; 2HSP A; 1UHC A; 1K9A A; 2BZX A; 1IO6 A; 2PNI A; 4HVW A; 2RQU A; 2L3P A; 2LQW A; 4D8K A; 1N5Z A; 2EBP A; 4J9H A; 1CKA A; 1UG1 A; 3NPF A; 1SEM A; 2HCK A; 2KT1 A; 3I35 A; 4ORZ A; 5HCK A; 3M0Q A; 2K79 A; 2CDT A; 3M0U A; 4LUE A; 1T0J A; 1M8M A; 2EYZ A; 2JM8 A; 1U5S A; 2J05 A; 4ESR A; 1QCF A; 5I22 A; 4HXJ A; 2J6O A; 4CC7 A; 2P4R A; 1PWT A; 2YUO A; 3NGP A; 4J9G A; 2KNB B; 1W70 A; 1NEB A; 2L3S A; 1ZUK A; 2LJ3 A; 2DBK A; 2J6F A; 1NLP C; 2KRS A; 3RNJ A; 4RTU A; 1M3A A; 3UA6 A; 2NWM A; 1AWO A; 1GCQ C; 1WXT A; 1UHF A; 2RPN A; 2RQW A; 1SHG A; 2M0Y A; 2LCS A; 4IIO A; 3TSZ A; 4J9F A; 1E7O A; 1K0S A; 5ECA A; 3VS7 A; 2ROT A; 4QT7 A; 1I07 A; 1OOT A; 2M51 A; 3EG1 A; 2A37 A; 2RN8 A; 2EYY A; 1GFC A; 3PVL A; 1WA7 A; 2KXC A; 4AG2 C; 1NG2 A; 2AKL A; 2O2O A; 4AFU C; 2BZ8 A; 2E5K A; 2DMO A; 2FRY A; 1ZBJ A; 2EGC A; 4RUG A; 2F2X A; 2KYB A; 1CSK A; 3VS6 A; 2EQI A; 5IHN A; 2EGA A; 4GLM A; 2JMC A; 2DJQ A; 5I11 A; 2K2M A; 1ARK A; 2JT4 A; 1FMK A; 2JS0 A; 4RTZ A; 2VKN A; 1M3C A; 1A0N B; 4HVV A; 2GTJ A; 1K1Z A; 1GBR A; 3TSW A; 2X3W D; 1KSW A; 2AZV A; 1YNZ A; 2KRN A; 1RI9 A; 2SRC A; 2RQT A; 4J9D A; 3PVQ A; 4R0K A; 4F16 A; 3QWY A; 1KFZ A; 1I1J A; 2K7A A; 2FG0 A; 4CC3 A; 1BBZ A; 1I0C A; 1AVZ C; 2FEI A; 1UJY A; 3CQT A; 1WX6 A; 5FW9 A; 3VS3 A; 3M0S A; 4LE9 A; 1MUZ A; 2HBW A; 1YP5 A; 1JO8 A; 1V1C A; 2PZ1 A; 1GRI A; 2IIM A; 4OMQ A; 2GBQ A; 2W10 A; 2RQV A; 1T0H A; 2EYW A; 1WYX A; 2LX7 A; 1WDX A; 2DL3 A; 2ED0 A; 2LNH B; 1BK2 A; 1X2K A; 3IQL A; 3REA B; 2CUB A; 3H0H A; 1PHT A; 2A08 A; 2DM1 A; 1ABO A; 4HCK A; 4J9E A; 2RNA A; 4IIM A; 5EC7 A; 2X3X D; 1ZUU A; 3JV3 A; 1WLP B; 1ZX6 A; 4OMP A; 2MIO A; 2A36 A; 1CKB A; 4JJD A; 1AWJ A; 4LN2 A; 1JU5 C; 4J9B A; 1ZLM A; 2YT6 A; 2EYX A; 1M27 C; 1HSQ A; 4CC2 A; 1H8K A; 2KR3 A; 1PRL C; 3M0P A; 1Y0M A; 1YN8 A; 2RF0 A; 2L0A A; 2FPF A; 2FPE A; 3ZL7 C; 4Y92 A; 1GFD A; 1JQQ A; 2J7I A; 4KRT A; 4AFQ C; 2NUZ A; 2PTK A; 2C0O A; 4RTX A; 1HD3 A; 1MV0 B; 1PNJ A; 5IHK A; 1B3Q A; 1AZE A; 2FPD A; 4J9C A; 4LUD A; 1NEG A; 4AG1 C; 1RLQ C; 2L3Q A; 2CT4 A; 2YUN A; 1T3L A; 2LJ1 A; 4EIK A; 2O88 A; 1WXB A; 4JJC A; 1AOJ A; 2CUD A; 4X1V A; 2JTE A; 1S1N A; 3UF4 A; 1NLO C; 2FRW A; 3EHR A; 2F2W A; 3M0R A; 1ZSG A; 4OMM A; 2B86 A; 2EKH A; 1UE9 A; 1Y57 A; 2DL7 A; 2DL5 A; 2KYM A; 3VRZ A; 5GJV B; 4WCI A; 1X43 A; 1W1F A; 2CT3 A; 2CRE A; 3TVT A; 4AFZ C; 2LJ0 A; 3EG0 A; 1WXU A; 1TUC A; 1K0X A; 2EVR A; 2LP5 A; 3VS1 A; 1U06 A; 2BTT A; 4J9I A; 2EGE A; 4OMN A; 1X6G A; 2JXB A; 1W6X A; 1BB9 A; 1WI7 A; 1UTI A; 3EGU A; 1Z9Z A; 4RTW A; 1ZUY A; 1VYV A; 2HEQ A; 2ABL A; 3I5R A; 1YWP A; 2GNC A; 1BU1 A; 1XOV A; 5GJW B; 3THK A; 3R6N A; 1OEB A; 4F14 A; 1JEG A; 2D8J A; 2YDL A; 1MV3 A; 1T3S A; 1QWE A; 3UAT A; 1X6B A; 1G2B A; 3SEM A; 1WFW A; 2KXD A; 1UJ0 A; 2HDA A; 3VRY A; 2YSQ A; 2OJ2 A; 2D8H A; 1JXO A; 1PKS A; 4DEY A; 3I9Q A; 2ROL A; 3KFV A; 1YWO A; 2ENM A; 3EG2 A; 4F17 A; 2RMO A; 4ZNX A; 3VS2 A; 2KRO A; 2YUP A; 2AK5 A; 4JPB W; 2KBT A; 1M3B A; 4OMO A; 3VS4 A; 4LNP A; 3NMZ C; 3M0T A; 1K76 A; 2CSQ A; 3O5Z A; 1QKX A; 1SRL A; 3H0I A; 2VVK A; 2CH4 W; 1GL5 A; 5IH2 A; 2KEA A; 4CC4 B; 1NM7 A; 1J3T A; 1UDL A; 5FWC A; 2H8H A; 2KRM A; 2LQN A; 1SRM A; 2GTO A; 2D1X A; 1NYG A; 2GQI A; 2ECZ A; 1RLP C; 1E6G A; 2CH4 A; 2CSI A; 2V1R A; 2GGR A; 5IXF A; 3UA7 A; 1B07 A; 1FYN A; 1H92 A; 1OPL A; 1YCS B; 4AFS C; 1X69 A; 2AKK A; 2SEM A; 2DNU A; 3NHN A; 3QWX X; 3SHW A; 2C0I A; 2D0N A; 1PKT A; 1JXM A; 2KGT A; 2DRK A; 1SPK A; 1EFN A; 1SHF A; 1G83 A; 1QKW A; 3H41 A; 2LMJ A; 1K4U S; 3I5S A; 4A63 B; 1LCK A; 2JMA A; 2K3B A; 1TG0 A; 1AWW A; 2DE0 X; 2K6D A; 3PE0 A; 2KE9 A; 5FWB A; 2A28 A; 2DRM A; 1GCQ A; 2EW3 A; 1AZG B; 3H0F A; 5IHI A; 3GBQ A; 1PRM C; 2DLP A; 4K11 A; 1KJW A; 4DEX A; 5L23 A; 1GCP A; 1KIK A; 2OAW A; 1VA7 A; 3EHQ A; 2O9V A; 1VYU A; 1AWX A; 1UFF A; 4OML A; 2DX1 A; 1QLY A; 1UUE A; 2OI3 A; 2AZS A; 2RQR A; 1TUD A; 3EG3 A; 2DBM A; 3ULR B; 4JJB A; 2MOX A; 2JM9 A; 1AEY A; 2W0Z A; 4JZ3 A; 1RUW A; 1QWF A; 2FO0 A; 4D8D A; 2ESW A; 1Z9Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1X75 C; 1VIE A; 1PD1 A; 4ELY C; 2DF6 A; 1RAI B; 3LLR A; 2XID A; 2R58 A; 4XTY A; 1N27 A; 2VUB A; 1IRE B; 2O31 A; 1ZBX A; 2DTO A; 4GBQ A; 3X24 B; 2WAC A; 1E6H A; 4HVU A; 4MZM A; 3M54 A; 2MCN A; 2DL4 A; 4IUQ A; 1X2Q A; 4E7H A; 5D6Y A; 4BDY A; 5GMK h; 1DJ7 B; 5LJ5 f; 1SSH A; 2J06 A; 3U23 A; 1JJ2 A; 2RD1 A; 3JCM b; 5GAN g; 1D0Z A; 3EGX B; 4PFP A; 1VQ4 A; 2DKG A; 2L2P A; 2F2V A; 4PJO E; 3TRE A; 4FT2 A; 4Z8A A; 5DY9 A; 3SDZ A; 2QEX T; 1H3H A; 1KG1 A; 4Y28 E; 2QQA A; 2HSE B; 2M02 A; 1VIF A; 2VWF A; 1I8F A; 1WIE A; 4E6R A; 3CD6 T; 2QDL A; 4MDW A; 1AD5 A; 3JB9 F; 4RTY A; 4EMK C; 2YUQ A; 1UEC A; 2PNI A; 1NPP A; 1Q86 C; 1IO6 A; 4FU6 A; 2RQU A; 4C0F A; 2LQW A; 1Q82 U; 2E6Z A; 3E9F A; 1WPY A; 2BKD N; 4J9H A; 1UG1 A; 4RCC A; 1QQJ A; 1WHL A; 3NPF A; 1K9M C; 1MMD A; 1UGQ B; 5HCK A; 4PNO A; 3M0Q A; 2DD5 A; 2K79 A; 1KQS A; 2CDT A; 2HL3 A; 1MMG A; 9ATC B; 1T0J A; 3JCM c; 2X4W A; 4PJO C; 4IUR A; 4CC7 A; 4M77 E; 2DFU A; 3QJ6 A; 1PWT A; 1RAE B; 3CCV Q; 2Y4Y A; 2O01 E; 1ACM B; 1NEB A; 5I2S A; 3OW2 P; 2XDD A; 2CZ1 B; 3OS2 A; 5LJ5 d; 3OYI A; 3I55 Q; 3J7A F; 1NLP C; 2AIR B; 1N9S A; 4BI8 B; 4XTU A; 3C94 A; 2OTL T; 3DB3 A; 3UA6 A; 4N0A A; 4OMF B; 3EG9 A; 2XD0 A; 2RQW A; 1QCN A; 2M0Y A; 2EQM A; 1D3B A; 3L2Q A; 3M5A A; 1E7O A; 5AT1 B; 1K0S A; 2CZ7 B; 3CME T; 1OOT A; 2YRV A; 1VQ6 T; 4PJM A; 3CCJ Q; 3I56 A; 2RN8 A; 2EYY A; 3PVL A; 1M90 U; 1X01 A; 2EAY A; 4C92 E; 2KXC A; 5DLO A; 3HPW A; 3CCU A; 1MHN A; 2AKL A; 3CCS Q; 1OU9 A; 1VQ8 T; 4AFU C; 8AT1 B; 2BZ8 A; 4N4H A; 2JTM A; 4JRP A; 3QDF A; 1EX4 A; 2F2X A; 4NS5 A; 4GLM A; 3BY7 A; 4QQD A; 4JLG A; 4XTV A; 4L59 A; 4RTZ A; 3CCE T; 2BE7 D; 4L5G A; 1M3C A; 5GAN 5; 1WHM A; 1VQM T; 5GAN 6; 2R5A A; 1WJR A; 2AZV A; 1RI9 A; 1YJW Q; 3CCV A; 5C0M A; 4ZGJ B; 5CKD A; 1BBZ A; 2FEI A; 1AVZ C; 3OBY A; 1UJY A; 3CEY A; 4MZT A; 4M7D F; 1VQK Q; 3CC4 T; 5FW9 A; 2CYZ B; 3M0S A; 3JCM X; 4C92 C; 3A8M B; 4PLI A; 1OZ2 A; 2HZY A; 1YJ9 Q; 1KC8 C; 3JSC A; 1GRI A; 4PJN A; 4M7D B; 1LVK A; 4M75 G; 4OMQ A; 1T0H A; 4CI0 C; 2QQB A; 2EYW A; 2LX7 A; 3RKX A; 1WDX A; 3A8G B; 3UDC A; 5DLQ E; 2Z0W A; 3MJX A; 3IQL A; 4C5G A; 4GLK A; 3OW2 S; 1PSF A; 4IUT A; 2DM1 A; 2XHC A; 2K57 A; 4HCK A; 4KGZ B; 5GAO p; 5EC7 A; 2F1L A; 3JV3 A; 1ZX6 A; 1G3T A; 1WGS A; 2MIO A; 3M57 A; 3CPW P; 2K4Y A; 1VQ7 T; 3OMG A; 3GIB A; 2CZ6 B; 3OYH A; 1JU5 C; 4EDU A; 1YJN A; 2G3R A; 2EYX A; 1JB0 E; 4X34 A; 3MP6 A; 4PKC C; 4B9W A; 2HKQ B; 1G5V A; 3M0P A; 1Y7X A; 4M77 D; 4MDX A; 3ZL7 C; 1VQ9 A; 2J7I A; 4KRT A; 2NUZ A; 3CCR A; 5D6X A; 3A1P A; 1FWZ A; 3M53 A; 3OB9 A; 5IHK A; 1B3Q A; 3SFM A; 2DJZ A; 1SSF A; 2FPD A; 4J9C A; 5CO7 A; 2DYI A; 3GOX A; 4AG1 C; 3AT1 B; 5GAO n; 4MMK A; 5D7U A; 2L3Q A; 1VQ6 Q; 3JCM V; 2YRD A; 4BAC A; 2ZPB B; 2E12 A; 3CC7 Q; 2LC4 A; 1Y71 A; 5GAO q; 1WXB A; 4GY5 A; 1AOJ A; 4E7J A; 1VQ8 Q; 3MEV A; 3ZBD A; 1RAF B; 3UF4 A; 1NLO C; 2QQS A; 2RHX A; 3G7Z A; 1WQW A; 1Y57 A; 2KYM A; 2COY A; 3MP1 A; 1X43 A; 1M2V B; 3HRU A; 2CRE A; 3UPU A; 3TVT A; 1N9R A; 5GAN 3; 3OYB A; 4JS5 A; 4AFZ C; 1MMA A; 1ZA1 B; 3LW5 E; 2DK3 A; 3E2U A; 2EVR A; 2XU8 A; 3VS1 A; 1D0Y A; 2QG9 B; 4LD6 A; 1JJ2 P; 4OB1 B; 4OMN A; 4X9D A; 1W6X A; 3QZ9 B; 2D9T A; 5KE2 A; 4RTW A; 2XIC A; 1VQP T; 2ABL A; 3I5R A; 1YWP A; 2GNC A; 3L2Z A; 1BU1 A; 4F14 A; 1Q82 R; 2DZ9 A; 2DXT A; 5GAO l; 3URG A; 2QDY B; 2FZC B; 3UAT A; 3JB9 I; 5I21 A; 2P0Q A; 2YWW A; 3JCM W; 3PIP A; 2HDA A; 2RJE A; 3G4S A; 2YSQ A; 3VJP A; 4OB0 B; 4ZN1 A; 5M9O A; 1RAC B; 3I9Q A; 2ROL A; 1NJI U; 1YWO A; 4F17 A; 1XQH A; 1YIJ T; 4ZNX A; 3VS2 A; 1BI2 A; 3SWN A; 4XU1 A; 2AK5 A; 1V29 B; 2FHD A; 2ZPH B; 1KK7 A; 3NMZ C; 1VQ7 Q; 4OB2 B; 4M7D E; 2CSQ A; 1QVP A; 1QKX A; 3G71 Q; 3EGD A; 3RIR A; 3QPH A; 3OYF A; 5LJ3 h; 3OMC A; 3CCM A; 3FB9 A; 4CC4 B; 3CXC P; 2RM4 A; 4FYY B; 1RAG B; 4J6Y A; 2KRM A; 8ATC B; 1S72 T; 4M78 G; 2DXU A; 1YHQ T; 2LQN A; 1SRM A; 2D1X A; 2GQI A; 4P5N A; 1VQ5 A; 3L42 A; 1QVF P; 1VQN T; 2GGR A; 1TXQ A; 1FYN A; 1Q82 C; 1OPL A; 2AKK A; 2L8D A; 1Y96 B; 2DNU A; 3MO8 A; 3NHN A; 3QWX X; 5CKB A; 2Y4X A; 2CP6 A; 3VU3 C; 1D1A A; 1QKW A; 2CZ0 B; 2LMJ A; 5KYN A; 1LJO A; 2V8J A; 5A2Q E; 3M56 A; 1M8V A; 2MYS A; 3P8H A; 2K3B A; 4M7D C; 1TG0 A; 3RMS A; 1PM3 A; 2JTF A; 2RA2 A; 2DRM A; 3BDU A; 1GCQ A; 2EW3 A; 3OW2 A; 5IHI A; 3GBQ A; 1PRM C; 2DLP A; 4K11 A; 3HSB A; 3G1J A; 1C1A A; 1LNX A; 4CRI A; 2OAW A; 1Q7Y U; 1RAB B; 1YFN A; 1VYU A; 3Q1J A; 4OB3 B; 4OML A; 3G71 A; 1VQ4 T; 3R6O A; 3JCM f; 2OI3 A; 2RQR A; 5DM7 R; 3ULR B; 2LT1 A; 5GAN 4; 3NTI A; 3V7S A; 2QGF B; 3O8V A; 1VQO A; 1IZ6 A; 2ZPG B; 3QDR B; 2BUD A; 7AT1 B; 3C0C A; 2L5Q A; 2X51 A; 1HJD A; 3CCL Q; 4JZ4 A; 2J6K A; 3QO3 A; 2FB7 A; 3LYI A; 2DD4 A; 1SKU B; 4LDW A; 2G6F X; 2WSF E; 2X35 A; 4M7A A; 1H64 1; 4XTX A; 3FC3 A; 5LJ5 h; 5FU7 B; 3CXC S; 1YIJ Q; 3S3O A; 3JCM P; 2C0T A; 3VKI A; 4BUG A; 2BZY A; 4LDU A; 1VYT A; 2K5L A; 3VS0 A; 3EG9 B; 1QVF S; 2PVD B; 4FSS A; 2DVJ A; 1D3B B; 5J3B A; 2OTJ Q; 5GMK i; 2DYB A; 2LZ6 B; 2L3R A; 4M77 F; 4M7A G; 2HKN A; 2P4T A; 2V26 A; 4RTT A; 4O5V A; 3OYD A; 3G6E A; 2HSP A; 1K9A A; 3P8D A; 3CC2 Q; 3M58 A; 3JCM d; 1ZSZ B; 2L3P A; 1YHQ Q; 4DQ2 A; 4M77 B; 1N5Z A; 2QA4 A; 1SEM A; 2HCK A; 2KT1 A; 1WHG A; 3I35 A; 1TS9 A; 3CCQ Q; 3M0U A; 4A4G A; 5CQY A; 4ATO A; 2CP5 A; 3I56 T; 4LUE A; 2EYZ A; 1M8M A; 3QUI A; 4V2S A; 1I5O B; 4A4E A; 4ESR A; 3OA6 A; 5I22 A; 3CCU T; 2CP0 A; 2P4R A; 3HHT B; 2YUO A; 4RCB A; 4A4K A; 2X4Y A; 4HA8 A; 3MCA B; 1W70 A; 5EG2 A; 5LL6 S; 2KRS A; 4RG2 A; 1LPL A; 1QVG A; 2M0O A; 1M3A A; 1AWO A; 2NUT A; 1WXT A; 1XNI A; 4ZTJ A; 2RPN A; 2DET A; 1SHG A; 4QVC A; 4O6J A; 5FU6 B; 5ECA A; 2ROT A; 1MND A; 3M4Y A; 1C0M A; 2WSE E; 2A37 A; 1GFC A; 3E1S A; 1TWB A; 1WA7 A; 4BY6 B; 1M1K U; 2JJ9 A; 1O9S A; 2QAS A; 2HQE A; 1Q86 R; 2KSS A; 2O2O A; 2DTI A; 4F7U G; 2CKK A; 3PMT A; 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