4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
3WEZA 2WVVB 1HJVA 1QI5A 2BHZA 4PMDA 1V0KA 3WH8A 1UKQA 2VRKA 1E56A 4QAWA 2CYGA 4YPJA 4DUXA 4YHGA 2GJXB 2OYKA 2BVTA 3CMJA 5HOSA 3WNOA 3WKZA 5HNNA 3VD5A 4AZGA 2J7BA 2D2OA 3BLPX 2OWXA 4B9YA 1DWJM 4CU7A 3OGRA 2G3NA 3VNYA 3FY1A 4P8VA 5BWFA 5KZ6A 1CXFA 3PZNA 3RCNA 1XH1A 1MW2A 3AIVA 3AYSA 1EDGA 4MB1A 5A2CA 1E73M 4TVCA 2DT0A 2EPOA 5E6YA 1VBRA 4AD1A 1GQIA 2X0YA 3PZIA 3RO8A 2VX5A 5DMYA 1W1TA 1JGIA 1XD1A 3PZVA 1V6VA 3W25A 5I0DA 1BG9A 1FHLA 1HVXA 2J74A 2V3FA 4TTUA 2DDXA 2WHJA 2NSXA 1ISWA 4X0NA 1C7SA 1QI3A 2EPNA 2YA0A 4UFMA 4WSKA 4P7QA 1GOWA 1OIMA 1CXLA 5A8QA 2WCSA 1R86A 2XJ7A 1PAMA 4N0RA 3FNDA 2O9TA 1X6LA 3AMDA 1MXGA 5DT7A 2E8ZA 2RGLA 1VJSA 1M53A 4S3KA 1QNPA 1VEMA 4GIAA 4M8UA 2HISA 2GSJA 3U7VA 2A3EA 1VEOA 2ZX7A 2XM1A 4F9DA 2BV9A 4DWSC 3AZSA 4JKKA 2D22A 5A6AA 1ISZA 2YKKA 3WD1A 1RD6A 1WZLA 3FXYA 1NH6A 4AIOA 3RILA 1W1PA 1B2YA 1EH9A 1BVZA 4PMUA 1AVAA 1UWUA 1TFVA 3AMLA 3WF0A 2VZUA 4B9ZA 1FA2A 3B9AA 3LMYA 5ABFA 1HP4A 2A3HA 5A8OA 2E0PA 4J3UA 4WKFA 3SCQA 4EAMA 2W61A 1HJWA 4MNJA 3WH7A 4JHOA 2WMIB 4AZCB 4W85A 4B3LA 3PZTA 1GHSA 4M81A 5GQBA 3SCWA 2Y5EA 4HZ8A 3RJXA 4CCDA 3ZT5A 2PWGA 3QHOA 1NWTA 4M56A 1F4AA 1CZ1A 2C7FA 4AZCA 3W81A 1H3GA 2XFRA 1TG7A 3TTOA 1MYRA 2XSBA 1J10A 3SCUA 2VL4A 1TVPA 4GZJA 3M7SA 5M3WA 3VM5A 2WMGA 1UD6A 5A2BA 1WZAA 1X6NA 3WNPA 4HZ7A 2CITA 3KL5A 5BYWA 3CUHA 2WYSA 2WANA 1VJZA 3K46A 1UWSA 3LPFA 1K9DA 2V5CA 3MUIA 4B16A 4ACYA 5I78A 1E6RA 1GVYA 3WDQA 1NOFA 4XZBA 2G8ZA 2W67A 2ZX9A 4U3CA 4GKLA 4M29A 2IXVA 2XGIA 8A3HA 3GNPA 2VO5A 2WZEA 1GORA 2V5DA 2VCBA 3N9KA 5EBAA 1V3IA 1DWIM 1TVNA 2ZXAA 2OYLA 3AOFA 5HPCA 1V03A 3BMWA 1U33A 2VZSA 1HVQA 5E0CA 3BAWA 1VFMA 3SEPA 4AEFA 2ZE0A 1B3YA 3VGEA 1GOOA 1VB9A 1CPUA 3AMKA 4LPCA 4C91A 3WL0A 4AXNA 2VX4A 1NM9A 7TAAA 2B31A 1GONA 3AHYA 4ZE5A 1XH2A 1N82A 1C90A 1NP2A 1E6ZA 5HDRA 2EBNA 4HMEA 3HJEA 1JZ7A 4MAVA 2WZHA 1Q6CA 2WM0A 1RP9A 5I5RA 2XWEA 2J62A 2WBKA 2PC8A 1V08A 2YBTA 1CNVA 3CBWA 4BQ2A 2EEXA 3S2CA 4TX8A 5F7UA 2FHCA 3T0AA 3PZUA 4D6CA 5D8WA 3OZPA 6TAAA 4K68A 4QLKA 3WUEA 3AXIA 3ZT7A 3VO0A 2WLZA 3BXWA 3BAJA 3TOPA 4UFJA 5FL1A 1GJWA 2NW0A 5A6KA 4LX4A 2MANA 3CUIA 2OWWA 1JZ8A 4GPNA 7CGTA 3ARVA 3UCQA 5LYRA 1NWUA 2DSZA 3PZ9A 3QOMA 3WDHA 4AZ7A 4AD3A 4BQ3A 1RH9A 3ZJ8A 4AZ5A 1AQHA 4D6FA 4WK9A 5GNXA 4Z2HA 3CZKA 1KXVA 2WC3A 4AD4A 3II1A 4UOQA 1O6IA 2UY4A 3QOKA 4LGXA 2FGZA 1NWRA 1CLVA 3GNOA 1GOIA 4AEEA 1UZ4A 4GZIA 2WAGA 3L4ZA 3AS3A 1LQ0A 3BAKA 2OYMA 4AD0A 3VIHA 5E09A 1XCXA 4CKQA 3ARQA 3K4DA 2BY2A 5TD4A 1UD8A 2X2YA 1JI2A 4Z2IA 4W87A 3MSGA 4JFVA 2QPSA 3VX0A 3WBAA 4FMVA 1UD5A 3CHCA 3WF1A 1TUXA 1H4PA 3AMCA 3KWXA 2CPUA 4OOUA 1UKSA 2A3CA 4W5UA 3ZMRA 3AS2A 4LYPA 3BGAA 2A3BA 3IK2A 3PTMA 3WQ5A 3SCPA 2WPGA 3VIMA 2VQUA 3ZM8A 3ZJ7A 1W9DM 2CESA 4NZCA 2W4XA 4W8AA 5HBFA 2PBGA 3ECQA 2YLAA 3BAYA 4OZOA 4DWSA 2XM2A 3MMUA 3D3AA 3VD4A 3WFZA 5LA0A 3DYOA 5CLWA 3GH4A 3HU7A 2XHYA 4Q22A 1L8NA 1XSJA 2AMGA 1LG2A 1W9BM 3WD3A 4F8XA 2DH2A 4UQCA 1OBAA 3CPUA 1HKIA 4FLSA 3ALFA 3AHVA 1QBAA 2OLHA 4E2OA 3AROA 3AI0A 5E70A 3VD7A 2X05A 5C8BB 4YHEA 1CXIA 4RE4A 1A3HA 4W5ZA 1ZBCA 1W32A 4W7VA 2VUYA 5FKYA 2XVLA 3A4XA 4CUCA 3VIJA 4J3WA 3ZSTA 1J11A 1E15A 3WDRA 2CERA 1WDRA 1LLOA 3SCOA 1VFUA 1B0IA 1JZ3A 3ZIZA 3MO4A 3MUY1 5CSYA 3PZGA 1W1YA 2WNWA 1MXDA 2G3JA 2ZX8A 1ZS2A 3OBAA 2DT1A 4MJ2A 1NQ6A 4JCMA 3POHA 1H1NA 4KMQA 2BY3A 3AXHA 5FD0A 3RMEA 3N15A 1CLXA 4W8BA 5AYIA 1HKKA 3SUSA 1VF8A 5D4YA 1E3XA 2EXOA 4GI8A 3VIOA 1MW0A 1KR1A 4PUEA 1J0ZA 1HKMA 1E5JA 1BYCA 2WMKA 3WDJA 1BLIA 1J0JA 3GYCA 3SUVA 1E6PA 5M17A 1GQLA 5HXMA 3D5HA 1E70M 3ARYA 5A3HA 2WMJA 3FAWA 4TUFA 1EDTA 3IAQA 4E8DA 4UNIA 3I3BA 2CIPA 3TP4A 5A6SA 3VDAA 1XD0A 1ZBVA 1V3HA 1UQZA 1DWGM 3U5UA 2G4FA 1HN1A 2O9RA 3BCFA 3AIQA 3WH5A 1PEZA 1W1VA 1BYDA 3ARSA 1B3VA 5A8PA 4PSPA 3GBEA 2PWEA 4PBGA 1CDGA 1CXKA 3BAIA 4BS0A 2WKGA 3UR7A 1PZ2A 1PX3A 2JEPA 2VR5A 4D72A 3AHZA 4CD7A 4GZEA 2J7DA 2J75A 1C93A 1HP5A 3VIKA 2WCGA 1JNDA 1VFOA 3A3HA 2PWFA 3OLIA 4P8XA 3FHAA 2XTKA 2Y8VA 1UYQA 4KRUA 4AISA 3KE0A 4H8UA 3VIGA 3U57A 3VDBA 4FLQA 1MFVA 1QNSA 2JEQA 2DGAA 3ARUA 4MDPA 1EOKA 1JFHA 4BZYA 3AZTA 4X0VA 4XX6A 3VIIA 2AOSA 5A95A 4PMOA 4EE9A 1BGGA 1E0WA 2ZUVA 3QR3A 1K9EA 3CH9A 4QCFA 1Z32X 2CETA 3LPGA 3IJ8A 4W7WA 2D23A 1BFNA 2QMKA 1UD4A 1B31A 3L4VA 3WNKA 2D0HA 3T2PA 4C90A 3F5KA 1UKTA 1UUQA 5BXRA 1GW1A 1QW9A 3GH7A 3N04A 2UY2A 5IFPA 3RPMA 5C70A 2WC4A 2OSXA 2W92A 2ZUUA 3ARZA 1GVIA 3M07A 1B3ZA 3TONA 4D6JA 1E6QM 4HU8A 1IZKA 1CIUA 1JZ6A 2D0GA 1M03A 4JCLA 3GZAA 1UWRA 3VNZA 2DSKA 3MU7A 1JG9A 3IJ7A 4J7RA 2WSKA 3A47A 2J4GA 2A3AA 3GTNA 3KL0A 4MADA 4HZ6A 3CZEA 4PMZA 2WWCA 1CGXA 1MW3A 1UR9A 4UTFA 3JUGA 2DT3A 1Y7VA 2JIEA 3T08A 5HPOA 2ZUNA 1JZ5A 4XZWA 1QPKA 4ZE4A 3O9NA 4DM2A 4U3AA 1KXQA 3AIRA 4KRTA 1CBGA 2EPMX 2XVNA 1UA3A 2ZUMA 2CNCA 3CUGA 1BHGA 1V6XA 2Y4SA 3AZRA 3VMNA 2YLLA 3VVGA 4LYQA 1W3KA 3WMCA 3T0DA 1E3ZA 4Z2LA 2OSYA 3WFLA 5ABFB 2YL6A 1G94A 4CU8A 3K8LA 4C7GA 2VRJA 1ODUA 3VPLA 1CTNA 2Z1KA 3UEQA 3N18A 5A2AA 4UR9A 1Q4NX 2Q8XA 1UG6A 3ZQ9A 3WELA 2IXUA 2OWCA 9CGTA 2BS9A 3RM9A 3W37A 1KBKA 1NWSA 4U5IA 5JBDA 3OZOA 2XSAA 1WZKA 4GINA 3ZR6A 1KCKA 1VBUA 3NDYA 4TX6A 1Q6GA 4IPNB 5JBEA 3B8SA 1OSEA 2YA1A 4U31A 3VGGA 3NIYA 4EANA 5EMYA 1QBBA 4F66A 1TZ7A 3VX1A 5CGTA 3A4WA 5I2UA 1W9PA 2D24A 3NUKA 3AHTA 4XB3A 4JHZA 4PMNA 4CCEA 4JKLA 2CKRA 4QLLA 3TA9A 2W5FA 4UZSA 4D6GA 3OIHA 4J3XA 3K8MA 1I75A 3T2QA 5ABEA 1IZJA 1C7TA 4JIEA 4N42A 1E0VA 4U5KA 1OM0A 3CHFA 3CO4A 4CCCA 5IHRA 4PYSA 1US3A 2CXGA 3KL3A 4CD5A 4UQ9A 2VTFA 5CPQA 2ZUSA 3UR8A 1EHAA 1H41A 4RE2A 1J01A 2EPLX 3W82A 5CJ5A 3FN9A 1JL8A 1JNEA 3NSXA 1BQCA 4J3SA 1R87A 4H04A 1VAHA 3AICA 2DSWA 4R27A 1MFUA 2J7HA 4F79A 1YQ2A 3BH4A 2WVSA 4V28A 1KWGA 3POCA 1D2KA 4H7VA 4D1IA 5BCAA 1J9YA 2ZX5A 4MJ4A 4Q7NA 4W93A 4PMQA 3SUUA 1E4MM 3VGFA 1V0LA 2XWDA 2E9BA 4MB5A 2J7CA 3VIPA 1NOWA 2WC7A 3WMBA 3SCNA 2D0FA 1G1YA 2CEQA 3FHQA 1O7AA 1A47A 3E1F1 1SR0A 4HP5A 2DH3A 3SCVA 3SUWA 1ESWA 3VM7A 3L4UA 1U30A 2XUCA 1W9VA 1ECEA 1OGBA 1DHKA 2J47A 1J12A 4OUEA 1JI1A 4AW7A 1KB3A 4PCSA 2DPEA 3MKKA 1E40A 4ZEPA 2WB5A 2BY1A 3QHNA 3W26A 4L4PA 5CXPA 2ZIDA 2Y2WA 2QV4A 1DEDA 1QW8A 3K8KA 5C71A 3LPPA 1BF2A 2WZIA 1KGUA 2FGLA 1JYWA 1DTUA 4JFUA 3G6LA 5CGMA 3T0BA 3W53A 2CCRA 2ZXDA 3WF4A 2VNCA 4W8LA 2GFTA 3MS8A 5AY7A 2W63A 2E3ZA 1VEPA 2FH8A 1HJUA 1GCYA 2GUYA 3MUAA 5LA2A 4HTYA 3SURA 4PN2A 1OT1A 3MUZ1 5M03A 3W0KA 2FHFA 3BC9A 1CWYA 4FK9A 2VX7A 1LL4A 1WCGA 2W62A 1W3HA 4GI9A 1PJ9A 3VD9A 1WZMA 1TCMA 1OIFA 4MAZA 4OBRA 1I1WA 1W2PA 4TOQA 5AYBA 2NT1A 1QNRA 1V6YA 1V02E 3EMQA 1KXHA 2GK1A 4OIFA 3WD0A 3OB8A 2GDUA 4HMCA 4NRSA 2WSPA 1E4NA 3ARTA 2J78A 1ISVA 4HMDA 2VI0A 1UD2A 1K6AA 3EDJA 2QF8A 4WJXA 3CMGA 1B90A 5A69A 5A6LA 4NSBA 5CPTA 2CHNA 6CGTA 4FF5A 2YDRA 3RJYA 1QOXA 3EDDA 1EOMA 1ITXA 4W86A 4WKHA 3WL1A 1M04A 2VVSA 3VMOA 4Z2JA 3F4VA 1UR4A 1JYNA 5D9MA 4JFTA 4HA4A 1H0IA 1HX0A 1MWOA 1NARA 3RIKA 1HL8A 1UR1A 4OJYA 1FFRA 3CUJA 1G9HA 2YL9A 3WD2A 4U2ZA 1W91A 2Y8KA 4WKAA 1PZ3A 3CZJA 4AZ6A 3ZSSA 1US2A 4X9YA 4P8UA 1CGYA 3CTTA 1MQQA 1EIBA 4GO8A 3L2LA 4UOZA 4D1JA 4DWSB 1C8XA 2ZX6A 3VTRA 1RP8A 2CBVA 4NF7A 3AIWA 3AS1A 3RDKA 2AAAA 2VX6A 2YBUA 3ZO9A 5KEZA 5I3DA 4D71A 4AZBA 4ZXOA 1C91A 2VC9A 1JZ4A 4AZHA 1KQZA 1QI0A 2PBOA 1UKPA 3F5JA 2E8YA 2WMHA 4PMYA 2GVYA 3O6AA 4RL3A 5A6MA 3AIBA 4A3YA 4OOZA 2DQXA 2GDVA 2UWFA 4V2XA 4MB3A 4ACZA 3NCOA 4GXPA 4M82A 2X09A 4Z2KA 3AISA 4PSRA 1XYFA 2VR4A 4IUGA 4P7RA 1WNOA 5CZKA 1C8YA 3AIEA 1OD8A 1DWAM 1KGXA 4IISA 3UG4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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