4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
1J1PY 1HFYA 3A3RX 4WL6A 2YBNA 1HMKA 3HFMY 4NGLA 3CT1A 4B1AA 4ETDA 3TXDA 3WXTA 5KXKA 4PGJB 1WVVA 4WM3A 2MEIA 4KXIA 3TMXA 5FELA 4HP0A 1GB3A 1RJCB 2Q0MX 4LT0A 1QDTA 1IWUA 1WTMA 2C8OA 4NWEA 4YM8A 3WW5A 1DPWA 1TAYA 4H9AA 4YENA 3TXGA 1QDRA 4NHIA 4QEQA 4XADA 1GF4A 5HLLA 2EIZC 2HEEA 1LHIA 1LMCA 1LSDA 3CQLA 4HPIA 5APCA 3AZ6A 2F2NA 2D6BA 1DZBX 2MEEA 1GBWA 2BQEA 1GF5A 2BAAA 154LA 1KXYA 1QQYA 4DD7A 5KXXA 2BQFA 1LSCA 1LZDA 1EQ5A 5C6IA 4NGIA 1GHLA 4NGOA 1OUBA 3ATNA 4H94A 2N5ZA 1GBXA 1JITA 3LYMA 1YAPA 5F81A 1CJ6A 3LYTA 1NMMA 1LZAA 1PS5A 1B0DA 1G7LC 1IC4Y 3LZTA 2BQJA 3A6BY 4HV1A 2BQGA 4DWXA 1IP5A 2BQIA 3VWOA 1LMQA 1JKAA 3A6CY 4R6CA 1WQQA 3A95A 3F6ZA 4CFPA 1GPQC 4H8ZA 3TXFA 1C7PA 1IEEA 1LMOA 1LSNA 1HNLA 5IHGA 4M6DA 2W1XA 4HTQA 1GB8A 4MR1A 1DQJC 1WQOA 4W94A 3T6UA 4OOOA 1LAAA 5I53A 4WM1A 1QIOA 3AZ5A 1JHLA 1RCMA 2A7FA 4C3WA 1J1XY 1UIAA 1GF3A 4LT3A 4UWVA 4W96A 5DN4A 1CJ7A 1JUGA 1GF7A 2IHLA 1D6PA 5DM9A 1JTTL 1LZ9A 1LJJA 1OUGA 1HHLA 3W3EA 1JSEA 2MEGA 3AZ4A 1GEVA 1REYA 4LT2A 1GBSA 2XBSA 4LYMA 4H8YA 5EBHA 3J4GA 2HEFA 4RW1A 2XJWA 1IOQA 4G4BA 1OUCA 4H8XA 4UWNA 1B5XA 1LJNA 2BQOA 4NHQA 1YILA 1BWIA 1JJ1A 3T36A 1AT5A 2F4AA 5LYZA 1NBYC 2EPEA 1WQMA 1WQRA 3AW7A 5FEKA 1F10A 1JKCA 5K7OA 2B5ZA 1LJKA 1HELA 1GAYA 1QUSA 1UIEA 1VDPA 4QGZA 5HNLA 1B9OA 1XGUC 4LYOA 1IP4A 1B5UA 3A94A 4G4HA 3MGWA 4HJYA 4OWEA 5APFA 2Z2EA 5B1GA 4XJFA 2DQIY 2GV0A 1UIFA 3P4ZA 1DI5A 1FKVA 1VDSA 1N4FA 1CJ9A 1IC5Y 1KXWA 3RZ4A 4WO9A 1IP1A 3K3TA 5DN5A 4DD9A 5HQ1A 1CKDA 2RSCA 5F9XA 2HEBA 4RW2A 1FLWA 2YVBA 3LN2A 1GD6A 4QDNA 7LYZA 1GB2A 1HSWA 1RE2A 1GBOA 4OWBA 1JJ3A 4TWSA 1EQEA 1GFGA 1UACY 1XSFA 1GWDA 4RDSA 1XGTC 2WARA 4XENA 1HENA 1LZTA 5KXYA 1XGQC 2CGIA 1IWXA 1TEWA 2ZNXY 3W6BA 1G7JC 6LYZA 3A91A 1B5YA 1LMPA 1JPOA 1LZGA 2MEDA 3W6EA 1FKQA 2HEDA 1TBYA 4H9CA 1LSYA 2BQAA 2HU3A 208LA 1HF4A 1JTPL 4YEOA 1LZ5A 3TXBA 3A3QA 4NG1A 4R0FA 1GFUA 4ANRA 5DL9A 3QE8A 1G7IC 4IATA 3WPJA 4DDCA 1PZYA 3EXDA 2ZNWY 3B0KA 5F16A 2AUBA 5D5CA 4EOFA 1HEOA 4NWHA 4NGJA 4FJRA 3GXKA 3TXIA 1D0KA 1B2KA 1D9UA 4NHTA 1IP2A 1NQIA 5D5FA 1BB7A 5KXSA 4DC4A 5F14A 3AGHA 4B4EA 4OOTA 1ZVYB 2H9JA 3WUNA 4I8SA 1GFHA 2FYDA 4H93A 2ZQ3A 3IJVA 4MSTA 3WVYA 4DYGA 5LA5A 1YAQA 1LSGA 2EKSC 1SLYA 1OUAA 1UIDA 4OW1A 1CKGA 5B07A 3W6CA 1IWZA 3AB6A 1LJHA 1YIKA 1NWGA 1BB6A 3N9CA 5LIOA 5IELA 2BQKA 4TTDA 4LFPA 5B59A 3B0OA 4NG8A 4WL7A 4J1AA 3BKHA 4WM5A 2DQGY 2BLYA 1FDLY 1JTOL 4D9ZA 1IIZA 1AT6A 5DLAA 4ETAA 1QSAA 1UIHA 2D91A 5T3FA 3ZVQA 1UBZA 3WMKA 1GFEA 3RW8A 1LHHA 2ZIKA 3A90A 4H9FA 3A34A 5LYMA 1OUIA 5AMYA 2PC2A 4TSBA 1YANA 5B06A 3FE0A 1AZFA 4H90A 2BQLA 2F30A 4N0JA 5APDA 5KXLA 4HPEA 3WL2A 2DQAA 5LINA 4LYCA 1CJ8A 4HJVA 5KJ9A 2LZ2A 4NEBA 3TMUA 1VAUA 3WU9A 5ILFA 1HEWA 3TMWA 1LHMA 1UIGA 5FSTA 8LYZA 1GFVA 5A3ZA 4J1BA 4XYYA 3M3UA 4HV2A 1B7PA 4N1CC 5LAFA 1CKHA 2BQBA 134LA 5IDDA 1B7MA 1LJFA 3TMVA 3OJPA 4DT3A 1IX0A 1TCYA 1F6SA 5KKIA 1T3PA 1C45A 1IP6A 2HU1A 1CKCA 1LSMA 1LJGA 1FBIX 2H9KA 4LT1A 4ET9A 2Z19A 2DBTA 5HMJA 1OUDA 5KXWA 1GXXA 4DD0A 1B7RA 3LYZA 4TUNA 4GLAA 4BAPA 4XJDA 1B5WA 3WPLA 4U3XB 1E8LA 1DKKA 1HEMA 1GAZA 4HJZA 1OUEA 2VB1A 1OUHA 1B5VA 4ET8A 5LYTA 1JKBA 1JIYA 3B0IA 3A8ZA 1IWTA 4IJ4A 1H87A 4WM2A 5M1YA 4XJHA 2LHMA 1BVXA 4WM6A 4M4OA 3BKVA 4CJ2A 1GF6A 3SP3A 2Z37A 4GN4A 1I56A 4DD1A 4II8A 4UWUA 1LOZA 1GB5A 3OK0A 3CB7A 2I25L 2LYMA 194LA 3D3DA 1YL1X 4NGVA 5I4YA 4B0DA 1AM7A 1C43A 2F4GA 3M18B 4H9BA 4Z46A 3RNXA 1LMTA 1LSZA 5KXNA 1HC0A 3GXRA 3WW6A 1LSFA 2YSSC 5KXRA 1C46A 4N8ZA 1UC0A 4XJGA 4A7DA 3WVXA 1GFJA 1SQ2L 1WQNA 1LYSA 5E9RA 3AW6A 1OP9B 4N1EI 3RT5X 1B7LA 5I4WA 1GE4A 1DI4A 1GBZA 1INUA 3P65A 1UUZC 2BQDA 1DI3A 3G3AB 5APEA 4B49A 4DD3A 4G4CA 3HBEX 1P2CC 4J0LA 4RLNA 5F9UA 1C10A 3W6FA 1LZ4A 2NWDX 4WLYA 4AXTA 1GE3A 3CT0A 1YKYX 4P2EA 4LYTA 3TXEA 3WPKA 4J7VA 1BB4A 1DKJA 1EQ4A 1G7HC 1NBZC 4H9EA 3A67Y 5LVKA 3QNGA 2D4JA 3AJNA 1ALCA 4Z41A 5FCPA 135LA 1FLQA 1HEQA 1YAMA 4E3UA 1GXV2 1D6QA 5KXTA 5LVGA 1VDTA 3W6DA 4HSFA 3P68A 3FI7A 3KAMA 4KPMA 4GCEA 5B1FA 5C6LA 1ZVHL 1LSEA 2HTXA 2X0AA 2Z18A 4ML7A 3TXKA 2FBBA 2Y8PA 4NSGA 1BVKC 1HEPA 4AGAA 1GFKA 4WG7A 2BQHA 4LGKA 4NSJA 5HNCA 4N9RA 2DQEY 2FYCA 3WU7A 1IOTA 1GDWA 1CKFA 1TDYA 4WLXA 5KXZA 2G4QA 1YQVY 4HTNA 1KIQC 1XEKA 4L41A 5KXOA 1VFBC 1FN5A 1IP3A 2MEAA 3HBDA 3LYOA 4NHPA 5KXPA 1OUJA 2BQMA 3WU8A 1NDMC 3QY4A 2W1MA 2MEHA 1NHEA 2Z2FA 4GCFA 4NIJA 1GFAA 4OWCA 1GE2A 2A7DA 4ZEEA 5LXWA 4DDAA 1GFTA 1QUTA 4BADA 1CNSA 1NF5A 2D4KA 1XEJA 2EQLA 2I26L 1HMLA 9LYZA 3P64A 1LHJA 4NY5A 2DQFC 4Z98A 132LA 2LYOA 1UICA 1YKXX 4N5RA 2DQJY 2HECA 3RU5A 2BQCA 2YBMA 3WYHA 1KIPC 2W1LA 2ZYPA 1LJ3A 2HEAA 1LYOA 4CGEA 4FDYA 1A4VA 1ZV5L 3B72A 1LSBA 1YL0X 2MEFA 4BS7A 2Z39A 4ETBA 5I4XA 5ILCA 5L3HA 2MECA 2ZIJA 1BB3A 3B6LA 3P66A 1IWYA 4LFXA 1MLCE 4ETEA 1BB5A 5L3IA 1B7NA 1GFRA 1FLUA 1W08A 4DD2A 5II3A 4GN3A 1LSAA 1T6VL 1YAOA 5B05A 1LZYA 1VDQA 5HMVA 1LZNA 2YDGA 6LYTA 1I20A 1REXA 4RLMA 4WOAA 4I0CA 3ZEKA 1JJ0A 1BWJA 4HTKA 1D0MA 5FDJA 4NGZA 1BQLY 1LZSA 4NSHA 1IY3A 1UCOA 5KKJA 4NGKA 4WLDA 1A2YC 4X3BA 4DDBA 1LZEA 1F6RA 3N9AA 4PPOA 1LZ8A 1GBYA 1KXXA 3AZ7A 5LA8A 1LSPA 5LVIA 4ZFPA 1OUFA 5L9JA 1V7SA 5JENB 4H92A 3WH1A 1WVUA 1JKDA 3AGIA 4CFOA 1DPXA 1HSXA 1KIRC 4NGWA 4H9HA 1GB9A 1LPIA 4TSCA 1VATA 1BGIA 5FHWA 5LAGA 4H91A 2DQCY 4BAFA 2G4NA 1BHZA 1XEIA 2XTHA 1JISA 1LKSA 1LYYA 1EL1A 3HBHA 1GE1A 3WUAA 2HUBA 2YBJA 4LZTA 5A3EA 4WMGA 2FBDA 1O23A 1JWRA 2LYZA 1IOCA 3TXHA 1B7QA 1IY4A 193LA 2Z38A 3CSZA 1WQPA 2H5ZA 3ATOA 1Z55A 2BPUA 1LZCA 5KXMA 1W6ZA 1WTNA 1IOSA 1GF0A 1YROA 4Z3MA 3CT5A 2LZTA 1B7OA 1GB6A 1GDXA 3N9EA 3W6AA 3G3BB 4GCBA 3WUMA 4O34A 1VEDA 1FLYA 1NKHA 4OWAA 3LZ2A 2DQDY 4WO6A 1LTMA 2CDSA 1XGPC 1QSWA 4GN5C 4ZIXA 1RFPA 4YF2A 3WXUA 5E4PA 4PRUA 1LJEA 1OQMA 3CSRA 1LHLA 4H1PA 1B5ZA 1HFXA 1I1ZA 2BLXA 1QTEA 1JEFA 4G49A 4XN6A 4WM4A 1IR9A 4MCKA 1HERA 2XBRA 4EMNA 1LZRA 5J7CA 4YOPA 1LZ6A 1GB0A 3EMSA 4GLVA 2BQNA 4WG1A 2W1YA 4TX7A 133LA 4PHIA 4WLTA 1IO5A 3WULA 1B7SA 1REMA 4H9IA 2YBHA 1LYZA 4KL7A 2ZILA 4NHSA 4YEMA 4NSIA 1JSFA 1LCNA 4KT3A 2IFFY 5LVHA 1V7TA 4IASA 1GF9A 3IJUA 3J6KA 3ULRA 3A96A 1LZBA 3AGGG 4XJBA 1LMNA 2ZQ4A 4B4IA 4ETCA 2G4PA 3A92A 2C8PA 4NGYA 4LYBA 1C08C 1QTKA 1LKRA 1REZA 1GF8A 3E3DA 3TXJA 2YBLA 5LVJA 1GB7A 1LHKA 1IR7A 1BWHA 1IORA 1IWWA 1UIBA 1AKIA 4LYZA 1RI8B 4NFVA 2ZYCA 2DKVA 2I6ZA 4QY9A 1XFPL 1IR8A 2DQHY 153LA 1GE0A 4OWHA 1ZMYL 1F0WA 207LA 3EO5A 1UA6Y 1IWVA 5KY1A 1GEZA 2D4IA 3CSQA 5I5QA 3EBAB 1J1OY 2CWIA 3LHMA 3A93A 1LZ1A 3AYQA 1XGRC 1IVMA 4XJIA 2MEBA 1DXJA 4PRQA 1IP7A 1G7MC 1LJIA 4CHXA 1H6MA 4C5FA 1IC7Y 2YBIA 1LJ4A 2CJLA 2Z12A 4GCCA 1NDGC 3D9AC 4PJ2C 3IWRA 2ZWBA 1LMAA 5I54A 4G9SA 4B4JA 3ZVQB 5C6JA 1MELL 4GCDA 1D0LA 1HFZA 1YKZX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U5ZB 4NXMM 3HFMY 235LA 3FTDA 4B1AA 4ETDA 1J7KA 3WXTA 3VLFB 141LA 2LVPC 4WM3A 2MEIA 5FELA 4BBAA 4OO9A 1RJCB 4LT0A 1L52A 2C8OA 1ZMWA 3HY5A 2CHQA 1L60A 1KY1A 1DPWA 3R8FA 4YENA 2HAKA 4NHIA 2B6YA 1LSDA 1LV7A 4HPIA 2LTUA 1DZBX 1L66A 1GF5A 1QZEA 2LBCA 2OO9A 241LA 1GHLA 1XWIA 3ATNA 5KPTA 3LYMA 2CHVA 3BXWA 3FUUA 4LGMA 2KZSA 4M0WA 1YAPA 3LYTA 3GLGB 1NMMA 5F81A 2LNHC 1PS5A 4HV1A 4XK8F 1IXSA 2DKLA 2KRKA 2CV0A 4CFPA 2BNKA 4K0KM 4B7FA 1L18A 1C7PA 1IEEA 1YE9A 152LA 4HTQA 3CDOA 1DQJC 1P7SA 1WQOA 2RBPA 4FWDA 3W0FA 5I53A 205LA 4C3WA 1P36A 2GQFA 3EIEA 2O4WA 1JUGA 1LI2A 1QUDA 4NSRA 1I94M 3W3EA 1G0MA 2XBSA 4F1IA 143LA 5EBHA 4RW1A 4UWNA 3CF2A 1OUCA 1JTNA 1GVNA 1B5XA 2BQOA 4NHQA 227LA 3GUPA 1JJ1A 5KPRA 4LDEA 4LF7M 1NVMA 1F10A 3GO8A 2KHHA 1HELA 4LF5M 3UMMA 1B5UA 1L86A 1TLAA 1Z5BA 4LJ4A 2XZFA 3GLIB 253LA 1L21A 2F2QA 4XJFA 2DQIY 3HJ8A 1C6KA 1X37A 1DI5A 1QTZA 2OE7X 1CJ9A 1NHWC 5DN5A 2RRUA 1XMQM 1LWGA 1L56A 4QDNA 7LYZA 1XB2B 1HSWA 2XFTA 1RE2A 4TWSA 1UACY 1L71A 1GWDA 4ZPXA 1LZTA 5KXYA 4GITA 3HWLA 2OU0X 3W6BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4XN6 A;  181L A;  1L08 A;  254L A;  4YOP A;  1L53 A;  1L75 A;  4WG1 A;  2BQN A;  4G6Z A;  1OYU A;  2LC9 A;  133L A;  1IO5 A;  1REM A;  1IN8 A;  2YBH A;  4D82 A;  2G8L A;  3C8S A;  4NHS A;  1QTB A;  3IJU A;  2JA2 A;  3L28 A;  4LJ9 A;  3SYL A;  4DV5 M;  3A96 A;  4B4I A;  3AV0 A;  2G4P A;  1C6C A;  1LHK A;  1BWH A;  1UIB A;  1RI8 B;  2I6Z A;  1XFP L;  2DQH Y;  2C96 A;  1WGN A;  153L A;  1GE0 A;  1CVK A;  3GUM A;  3EO5 A;  1IWV A;  2K0B X;  1GEZ A;  4GRI A;  2D4I A;  4I5S A;  3HH4 A;  3FRH A;  4QHT A;  4CHX A;  255L A;  1H6M A;  4C5F A;  2CUZ A;  4I7K A;  1IY2 A;  4GCC A;  2B6W A;  1FNN A;  1QTV A;  190L A;  4DR5 M;  2ZWB A;  2KW0 A;  4G4R A;  1D0L A;  2Y20 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3HFM Y;  235L A;  4B1A A;  4ETD A;  3WXT A;  141L A;  4WM3 A;  2MEI A;  5FEL A;  4OO9 A;  1RJC B;  4LT0 A;  1L52 A;  2C8O A;  1L60 A;  1KY1 A;  1DPW A;  4YEN A;  4NHI A;  2B6Y A;  1LSD A;  4HPI A;  1DZB X;  1L66 A;  1GF5 A;  241L A;  1GHL A;  3ATN A;  3LYM A;  1YAP A;  5F81 A;  3LYT A;  1NMM A;  4HV1 A;  1PS5 A;  4CFP A;  1L18 A;  1C7P A;  1IEE A;  152L A;  4HTQ A;  3CDO A;  1DQJ C;  1P7S A;  1WQO A;  2RBP A;  5I53 A;  205L A;  4C3W A;  1P36 A;  2O4W A;  1JUG A;  1LI2 A;  1QUD A;  3W3E A;  1G0M A;  2XBS A;  143L A;  5EBH A;  4RW1 A;  4UWN A;  1OUC A;  1JTN A;  1B5X A;  2BQO A;  4NHQ A;  227L A;  3GUP A;  1JJ1 A;  4LDE A;  1F10 A;  1HEL A;  1B5U A;  1L86 A;  1TLA A;  253L A;  1L21 A;  2F2Q A;  4XJF A;  2DQI Y;  1C6K A;  1DI5 A;  1QTZ A;  2OE7 X;  1CJ9 A;  5DN5 A;  1LWG A;  1L56 A;  4QDN A;  7LYZ A;  1HSW A;  1RE2 A;  4TWS A;  1UAC Y;  1L71 A;  1GWD A;  1LZT A;  5KXY A;  3HWL A;  2OU0 X;  3W6B A;  257L A;  3DN8 A;  1FKQ A;  3CDQ A;  1LSY A;  3HH3 A;  2HU3 A;  4EXM A;  1JTP L;  3TXB A;  3A3Q A; 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