4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
2DQDY 3WW6A 3GXRA 4DD7A 4NSJA 4TX7A 3HBDA 1FKVA 1YIKA 4RLMA 1LSFA 1B5WA 1B5ZA 3LYOA 2I6ZA 2BQJA 2Z2FA 5B59A 1B0DA 4HTQA 1TAYA 2AUBA 4LYTA 4MCKA 4UWVA 1GF4A 1DPWA 5L3HA 1INUA 1GF5A 1LSBA 2W1YA 1YQVY 4HJVA 1OUIA 1IWXA 3A8ZA 1JSFA 1REYA 4DWXA 1HMKA 3A91A 4OWCA 4N0JA 3ULRA 1GFHA 5LVKA 3T6UA 3RT5X 5KJ9A 2YBHA 4ET9A 1LHMA 1LHKA 1LJNA 1NMMA 1TCYA 2VB1A 4OW1A 1BB6A 1JJ3A 2LZ2A 1GB5A 3GXKA 3EXDA 4A7DA 1B5XA 2BPUA 1BVKC 2YBIA 1GBYA 2BQOA 5KKJA 5LYTA 3RW8A 4XJFA 1JUGA 1D0LA 2XJWA 1OUHA 4WG1A 4NWHA 4HJYA 4LT1A 1NDGC 4NSIA 1LSPA 1REXA 1UA6Y 3WW5A 4XADA 4OOTA 2BQNA 4UWUA 2DQEY 1GE4A 1GBSA 1XEIA 1OUDA 1IP4A 4RDSA 1GFKA 1D6PA 1BB3A 3EBAB 2DQCY 1RE2A 4PGJB 1D6QA 4NSGA 2DBTA 1GE3A 1WQRA 1UIHA 3B0KA 1J1PY 5KKIA 1V7SA 2Q0MX 4WO6A 1YKXX 3TXJA 1JTPL 4J7VA 4TSBA 1IWVA 1GD6A 4WG7A 4NGOA 5IDDA 5DN5A 2BAAA 1CKHA 1GB6A 1JSEA 3WL2A 1AM7A 4Z98A 2Z2EA 1C7PA 5I53A 1UUZC 3E3DA 4WM2A 2H9JA 1WTNA 4G4HA 1WQOA 2D6BA 1LZCA 1OUFA 4G4BA 1B7NA 4TUNA 1O23A 4QEQA 5DN4A 4RW1A 4NWEA 3CSQA 4WOAA 4HPEA 3TXDA 4ZEEA 1W6ZA 1TDYA 4ZIXA 1QTEA 5LYMA 4XN6A 4H9BA 4LYMA 3AYQA 1KIRC 5B05A 5L3IA 153LA 4GCFA 1IP6A 1HFZA 2DQJY 5E4PA 1JJ1A 2BQAA 2CGIA 1JTTL 1NBZC 3HFMY 4XJDA 4H9CA 1JTOL 5LVJA 3RU5A 3WUNA 2ZQ4A 1EQ4A 4D9ZA 1A2YC 1IOQA 4MR1A 2BLYA 1OUJA 2LYOA 3A90A 4TTDA 1XGQC 4NIJA 2Z19A 4NGKA 1HEQA 1QTKA 3A93A 1J1XY 2YBJA 1LOZA 1LYSA 1PS5A 3AZ5A 1UICA 5APDA 5I4YA 5F81A 1GFAA 2DKVA 1OQMA 3WULA 3TXKA 3ZVQB 2HEBA 1IWZA 5IHGA 3ATOA 4GN3A 2BQMA 3J4GA 4GCEA 1LTMA 5ILFA 1D9UA 5E9RA 5EBHA 1HEOA 1JJ0A 1HMLA 3AZ4A 5FEKA 4J1AA 1VDPA 2CWIA 2FBDA 5KXOA 4IATA 4XYYA 4OWHA 1NHEA 3A67Y 5KXWA 2CJLA 1LZNA 1VAUA 3FE0A 4LT0A 1MLCE 2PC2A 2F30A 4CJ2A 1B7PA 4H94A 5C6IA 1YAPA 1FBIX 2HTXA 3LZTA 3P4ZA 4H8ZA 134LA 1IIZA 1EQEA 3AJNA 5KXXA 1JITA 4NHIA 3A94A 1CKCA 3QY4A 1CKDA 1TEWA 1HEPA 1W08A 1QQYA 1LZSA 2MEGA 4ET8A 3WUMA 1EL1A 4NHTA 1H87A 5KXTA 5KXLA 2D4KA 5FHWA 1T3PA 4LZTA 4ANRA 1IORA 3SP3A 1F6RA 1LZ4A 2DQIY 3AW7A 1HC0A 2Z18A 1QDTA 1UIFA 4W94A 1LPIA 3AZ7A 4YEOA 5KXMA 5KY1A 1GF3A 1WTMA 1C08C 2IFFY 1CJ8A 2LYZA 5KXZA 4HV1A 4WL6A 5FELA 1IP1A 1B7RA 1YANA 3EO5A 5HMVA 2DQHY 2MECA 2MEDA 5FDJA 4B4EA 1YKYX 3P68A 3AZ6A 3CT0A 4H9FA 3W6EA 3WPLA 4N1EI 1GB3A 1XGTC 4Z3MA 1JKDA 3FI7A 1BB7A 2BQGA 1DZBX 3CB7A 3TXHA 2D4JA 2DQAA 2MEHA 1IWTA 2YSSC 2A7DA 3N9AA 4WM4A 132LA 2HU3A 5ILCA 4PRQA 1PZYA 4TSCA 4M6DA 1P2CC 2C8OA 2ZQ3A 3M18B 1BWJA 4LT3A 4XJGA 6LYTA 6LYZA 1LZAA 2ZIKA 1BWIA 2Z37A 1B7SA 3RZ4A 1GEVA 2H5ZA 4X3BA 4YENA 4EOFA 4PJ2C 1JKBA 1LCNA 2IHLA 2YBLA 5F14A 4XJBA 4ML7A 1IOTA 1GFRA 5HNLA 3WVYA 3W6BA 4H91A 5KXKA 3B6LA 4BAFA 1KIPC 1UIDA 1IEEA 5LYZA 5APFA 1GBWA 1GF0A 1HSXA 4EMNA 1AZFA 2BQFA 1OUEA 3TXIA 4DT3A 3RNXA 1LJFA 4KXIA 2X0AA 2EQLA 1HERA 1N4FA 3AW6A 4WM1A 4DDCA 3M3UA 4KT3A 3WXTA 1IWWA 1GFJA 3WYHA 1OUCA 1LMAA 4TWSA 1GB9A 1VDSA 1IWYA 1GE1A 135LA 4HV2A 5B1GA 1JPOA 2Y8PA 1G7MC 1QUTA 5I4WA 1NBYC 5FCPA 3LYTA 1E8LA 1I56A 9LYZA 5IELA 5LAFA 4WL7A 3A34A 1DI4A 1JEFA 2W1LA 1LJ4A 4NGLA 5F9UA 3TMWA 3W6FA 1HEWA 1LMNA 4ETBA 5KXPA 3G3AB 5KXRA 4GN4A 193LA 4O34A 5I5QA 1LZBA 1LJ3A 3TMUA 1IP5A 1LJGA 1G7JC 2HECA 2MEBA 3W6CA 1IP3A 3AGIA 2BQCA 1VDTA 4II8A 4CFOA 1UIGA 4ETCA 5HNCA 2ZYCA 4WMGA 1GF8A 1LMOA 3A95A 4M4OA 3TXFA 4WLXA 2F2NA 1IR9A 4RW2A 4G49A 1IC7Y 1UIAA 4YF2A 3K3TA 4NHPA 1LZYA 2LYMA 4LGKA 1IWUA 2Z38A 4J0LA 2BQIA 5HLLA 1B7QA 1OUBA 1IR7A 3HBEX 4H8YA 4P2EA 1B7MA 1XEJA 1BHZA 4QGZA 4PPOA 2ZNWY 5M1YA 4HSFA 1F10A 4W96A 1XGUC 1WVUA 1DI5A 3AGHA 1GBXA 4H8XA 1D0KA 1IOCA 1GFEA 1LZ5A 2I25L 4YOPA 1LMTA 1T6VL 4OWAA 7LYZA 1UACY 1LHJA 1IR8A 1LZ9A 3A92A 1IVMA 1JKCA 1ZV5L 1BWHA 1KIQC 3N9CA 2FBBA 4N8ZA 4FJRA 4XJIA 4LT2A 2WARA 1DI3A 1GHLA 1XSFA 1CKFA 1JISA 5FSTA 4N5RA 3CQLA 1UIBA 1LKRA 1GWDA 3IWRA 5DL9A 1KXYA 4HTNA 2B5ZA 1CJ7A 4LYOA 1LJKA 5II3A 1GF9A 3WPKA 4ETDA 1QDRA 3LHMA 5F16A 1LZRA 3TXBA 1GE2A 1CNSA 2BQBA 4GN5C 1CKGA 4R0FA 4B1AA 4DDAA 1BB5A 1GFTA 4LFPA 4N1CC 2MEIA 1QSWA 1V7TA 4DD3A 1ZVYB 1BQLY 1LMCA 4NHQA 1CJ6A 2W1XA 1I20A 1AT6A 2Z12A 4QDNA 1VEDA 1B5UA 5HMJA 4H1PA 3J6KA 1LZ1A 4NGZA 1GXV2 5C6LA 2W1MA 1QSAA 1RI8B 4HJZA 1C45A 1RCMA 2XBSA 2YVBA 4OWBA 5A3ZA 3ATNA 2HEFA 5APEA 4RLNA 1DQJC 1HEMA 3G3BB 5B1FA 1LJEA 1GDWA 1LYZA 1RFPA 4H90A 5LAGA 3VWOA 1HFYA 3WH1A 1GB8A 1B7LA 5LVIA 1LJJA 4NG8A 1IP2A 1DXJA 4HTKA 2MEFA 4BADA 1B5VA 208LA 3B0OA 1BB4A 4NGJA 1YAQA 4NY5A 4CGEA 3CT1A 3WXUA 4NGYA 1B5YA 1UC0A 1B2KA 3LN2A 1GEZA 1LSGA 4H9EA 4WO9A 2MEEA 4QY9A 1EQ5A 1DPXA 1F0WA 1C43A 1LJIA 3WU8A 4YM8A 1SQ2L 1NKHA 2YBNA 3W6AA 3T36A 4NFVA 4PRUA 1HELA 3BKHA 4NSHA 1HF4A 1LZTA 1YROA 2Z39A 1FLUA 5J7CA 5LINA 1YAMA 1WQPA 3ZVQA 5T3FA 4C5FA 1CJ9A 3HBHA 1LSYA 1REMA 4OOOA 4DD0A 4ETAA 1UCOA 3WPJA 3ZEKA 1GB0A 4IASA 3F6ZA 4I0CA 1XGPC 1C46A 2HEAA 3OK0A 4NEBA 3P65A 4WLDA 1WQMA 4CFPA 1LAAA 1GPQC 1LSMA 2ZILA 4G4CA 4H9IA 4C3WA 1NWGA 1YKZX 1NDMC 1Z55A 4Z46A 1LHIA 4WM5A 1AT5A 1QUSA 4B4IA 1LSDA 3A3QA 3QNGA 5A3EA 2CDSA 1LYOA 1OUAA 1C10A 2ZIJA 1IY3A 4WLTA 154LA 1GBZA 4DD1A 3P64A 4UWNA 1VDQA 4B49A 1IO5A 1XEKA 5LXWA 4NGWA 1BVXA 1G7IC 1HHLA 1LKSA 1LZGA 2RSCA 3CSZA 3KAMA 4GLVA 1UIEA 4H92A 4LYBA 1ZMYL 3CT5A 1QIOA 2BQHA 2BQLA 2C8PA 1LSCA 4H9AA 4I8SA 5AMYA 1ZVHL 5DM9A 1GB7A 1NQIA 2LZTA 5D5FA 4DYGA 194LA 3N9EA 5D5CA 1GFGA 2D91A 5LIOA 4KL7A 4LFXA 3TMVA 8LYZA 1G7LC 1LZ8A 3AB6A 3D9AC 4WM6A 4LYCA 5LA8A 3A3RX 3AGGG 3TXEA 1WQNA 1IC4Y 1JKAA 1YL0X 1D0MA 3EMSA 4BS7A 2HU1A 2MEAA 1AKIA 4H9HA 4YEMA 1XFPL 3LYZA 3OJPA 4KPMA 2EPEA 5LVGA 1GAYA 1GAZA 1LSNA 1LHHA 1LSAA 1LYYA 4NGIA 1LZDA 2D4IA 1GF7A 5HQ1A 4LYZA 4PHIA 2A7FA 2EIZC 4BAPA 3WVXA 1A4VA 4DC4A 1FDLY 4NGVA 5B07A 2YDGA 2N5ZA 2XTHA 1OP9B 1GE0A 1LZ6A 4L41A 4MSTA 5APCA 4DD2A 4ZFPA 2LHMA 1DKKA 1JHLA 1H6MA 2YBMA 1VATA 2BQKA 5KXSA 1YILA 4G9SA 5I54A 2HUBA 1GF6A 1NF5A 4CHXA 1IC5Y 3TMXA 1SLYA 3LYMA 1OUGA 1GFVA 1GDXA 1LMPA 1IOSA 1KXWA 1GB2A 2FYDA 4XENA 1VFBC 1LSEA 1JWRA 2BQEA 2I26L 1B9OA 2F4GA 2H9KA 5KXYA 1LHLA 2BQDA 4HPIA 1WQQA 4WLYA 2G4NA 2ZNXY 3A6CY 5C6JA 2F4AA 2DQGY 1TBYA 3A96A 4B0DA 5LVHA 1IP7A 4ETEA 3TXGA 1FLWA 1FLQA 5JENB 5I4XA 2HEDA 3QE8A 3B0IA 1HNLA 3WUAA 4FDYA 5F9XA 2ZYPA 4HP0A 5B06A 2ZWBA 1LJHA 1GXXA 1B7OA 4DDBA 1RJCB 3P66A 4E3UA 4IJ4A 1DKJA 1HENA 4N9RA 1KXXA 4OWEA 1UBZA 4B4JA 1HFXA 4GCCA 2EKSC 1WVVA 133LA 4NHSA 1YAOA 4XJHA 1HSWA 1LMQA 207LA 4J1BA 2XBRA 3IJVA 2FYCA 3BKVA 1XGRC 3D3DA 1JIYA 3WU7A 4Z41A 4GCDA 2G4QA 4GCBA 5K7OA 3W3EA 3W6DA 1IY4A 1F6SA 1GBOA 4AGAA 1REZA 1FN5A 3MGWA 5L9JA 2BLXA 5LA5A 1I1ZA 4GLAA 5KXNA 3IJUA 1LSZA 3LZ2A 4WM3A 1FKQA 2GV0A 3WU9A 2HEEA 2G4PA 1J1OY 5DLAA 2NWDX 1FLYA 1GFUA 2DQFC 3CSRA 1YL1X 4H93A 4NG1A 4AXTA 3B72A 1LZEA 1BGIA 1MELL 1IX0A 4DD9A 3A6BY 4R6CA 1ALCA 1G7HC 4U3XB 3WMKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DQDY 3WW6A 243LA 1XXHB 1Z5BA 3GRVA 3L29A 1YIKA 4RLMA 1LSFA 2CP8A 4I7QA 3OE8A 141LA 2FNAA 4HTQA 4UWVA 1ZMUA 4MCKA 1L61A 1OUIA 3FYDA 4JXJA 5DYIA 1C63A 1GFHA 3T6UA 3RT5X 5KJ9A 4ET9A 4DR1M 1QSQA 1LJNA 4OW1A 4KHPM 1BB6A 2LZ2A 2Y0TA 1DYGA 5EJCA 176LA 5EP3A 2BPUA 3DMZA 4YY3M 1OYUA 5KKJA 3RW8A 1JUGA 3IECA 2XJWA 1OUHA 3C83A 4I7RA 4LT1A 1NDGC 1REXA 1LWGA 2RB2X 3DN6A 1YUBA 2K6BA 1XEIA 1AUAA 255LA 4ARPA 4X66M 185LA 142LA 4PGJB 102LA 1GE3A 1IN7A 4AKGA 2XLJA 160LA 1L05A 1UIHA 1J1PY 1R4GA 3TXJA 2Y21A 4EKRA 4J7VA 4TSBA 3PNYA 1GD6A 3LCVB 1LYJA 244LA 4WG7A 4NGOA 4MB7A 1CV1A 2OU0X 1GB6A 2KDLA 1AM7A 3RGPA 1L90A 3PDSA 1J7KA 1G07A 1NY6A 2H9JA 1WTNA 4LG2A 4G4HA 4G4BA 231LA 180LA 2KA6B 1O23A 1XEPA 1QUOA 1L26A 2DHYA 4ZEEA 1W6ZA 253LA 4ZPUA 4XN6A 3BXWA 1L13A 153LA 4I7JA 2DQJY 2RB1X 1JJ1A 1JTTL 3HFMY 3RU5A 2DENA 5E6JA 4Z6YA 1L54A 262LA 4DR6M 3A90A 4NIJA 3FE3A 131LA 3FA0A 1J1XY 4K0KM 2YBJA 1PS5A 1SX7A 1DO0A 3R8FA 1UICA 1C7YA 5APDA 1GFAA 3C80A 1TGUA 5KQDA 1PQDA 1QS5A 1L44A 3E46A 2BQMA 1LTMA 3TWKA 1D9UA 3GLFB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2DQD Y;  3WW6 A;  243L A;  1YIK A;  4RLM A;  1LSF A;  4I7Q A;  3OE8 A;  141L A;  4HTQ A;  4UWV A;  4MCK A;  1L61 A;  1OUI A;  1C63 A;  1GFH A;  3T6U A;  3RT5 X;  5KJ9 A;  4ET9 A;  1QSQ A;  1LJN A;  4OW1 A;  1BB6 A;  2LZ2 A;  1DYG A;  176L A;  3DMZ A;  2BPU A;  1OYU A;  5KKJ A;  3RW8 A;  1JUG A;  2XJW A;  1OUH A;  3C83 A;  4I7R A;  4LT1 A;  1NDG C;  1REX A;  1LWG A;  2RB2 X;  3DN6 A;  1XEI A;  255L A;  4ARP A;  185L A;  142L A;  4PGJ B;  102L A;  1GE3 A;  160L A;  1L05 A;  1UIH A;  1J1P Y;  3TXJ A;  4EKR A;  4J7V A;  4TSB A;  1GD6 A;  1LYJ A;  244L A;  4WG7 A;  4NGO A;  1CV1 A;  2OU0 X;  1GB6 A;  1AM7 A;  1L90 A;  3PDS A;  1G07 A;  2H9J A;  1WTN A;  4G4H A;  4G4B A;  231L A;  180L A;  1O23 A;  1XEP A;  1QUO A;  1L26 A;  4ZEE A;  1W6Z A;  253L A;  4ZPU A;  4XN6 A;  1L13 A;  153L A;  4I7J A;  2DQJ Y;  2RB1 X;  1JJ1 A;  1JTT L;  3HFM Y;  3RU5 A;  1L54 A;  262L A;  3A90 A;  4NIJ A;  131L A;  3FA0 A;  1J1X Y;  2YBJ A;  1PS5 A;  1SX7 A;  1UIC A;  5APD A;  1GFA A;  3C80 A;  1PQD A;  1QS5 A;  1L44 A; 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