4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
4WOAA 1LSCA 4EMNA 4H9EA 2MEGA 2EIZC 4I8SA 3G3BB 4RLMA 4E3UA 1LKSA 1SLYA 4LYZA 2G4PA 5KXZA 3LYMA 1ZV5L 4W94A 2LYOA 3EMSA 4J1AA 3WUMA 4NGOA 3CT0A 4FJRA 4PHIA 4XJIA 4YF2A 1KIQC 4WO6A 3A3QA 1CKCA 1LSYA 1T6VL 3B0IA 4HJVA 1IOSA 5DL9A 2BLXA 1G7MC 1JKCA 1IO5A 3IJVA 4GLAA 4G9SA 2ZYPA 3WUNA 3WL2A 1YAOA 2ZIJA 4PJ2C 1IX0A 4CFPA 4H91A 8LYZA 5LAFA 194LA 1YKYX 4NGVA 1E8LA 4DYGA 1GB2A 3GXRA 3BKVA 5LIOA 3B6LA 2F4GA 153LA 4NHTA 1C7PA 1J1OY 1VDQA 2BQLA 5FHWA 1B5VA 4WM6A 1H87A 3A67Y 4R0FA 1JJ3A 1WVUA 1GDWA 1XSFA 4NHIA 3WH1A 2LHMA 2Z39A 4LGKA 1REMA 4LT0A 3A91A 1REYA 1WTMA 3A6BY 4N5RA 4DWXA 5EBHA 5IDDA 1IC4Y 4ETCA 1HF4A 2ZWBA 4ETAA 1IWYA 1GFUA 1IEEA 2F2NA 1QDRA 1GFTA 4QY9A 2H9KA 2ZNXY 2Z2EA 4NSIA 3WU8A 3M3UA 2ZIKA 4ET8A 3SP3A 4WM4A 1LMQA 1VFBC 2CDSA 3FI7A 3HFMY 1IWVA 3AYQA 3LN2A 1JKDA 4PRQA 1GB0A 1GAZA 1FN5A 3W6EA 5KXWA 3A94A 4NWHA 1PZYA 2I26L 2DQHY 3ZVQB 1B7NA 4B4EA 1SQ2L 2Z2FA 4DD1A 1C08C 3A8ZA 4HV1A 1GB9A 1GB8A 1B0DA 1ZMYL 1JWRA 1CJ6A 2LYMA 2YBLA 4LFXA 134LA 1WQPA 1UACY 1B9OA 4RW2A 1KXYA 3T6UA 4WM3A 4XJDA 2BQJA 3CT1A 1NDMC 4G49A 4HJYA 1IORA 2CJLA 1XGUC 5IHGA 3KAMA 3WU7A 3B0OA 1WVVA 1A2YC 1LSBA 4XN6A 4BAFA 5HMVA 2HUBA 5LA8A 5DN5A 2YBMA 4H93A 1UCOA 3P68A 5II3A 3QNGA 1LZAA 4GCFA 5LINA 207LA 4N9RA 5HLLA 1LZCA 4NHPA 2BQHA 3TXDA 1LJJA 1XEKA 5LYTA 3LZTA 1B5YA 4Z98A 3WU9A 5KY1A 4HPIA 1DI3A 3W6DA 1RJCB 1BVKC 3A93A 1OP9B 1LMOA 2XJWA 4IJ4A 5B59A 1REXA 4WLYA 3TXIA 3AW6A 4DD2A 6LYTA 1V7TA 4H9FA 4Z3MA 4KL7A 1QUSA 1GFAA 3W6AA 1GXV2 2BLYA 1HMKA 1LHHA 4HP0A 4LYBA 1GF3A 1G7HC 3LYZA 1LJGA 3M18B 1DPWA 2BQMA 2MECA 4G4CA 1DPXA 1IP1A 3ATNA 4II8A 5KXPA 3K3TA 1H6MA 1PS5A 4A7DA 4DDCA 3QY4A 1IOTA 1G7JC 1IC5Y 1LZYA 1RCMA 1QTEA 1VEDA 2IHLA 1GB3A 4WM1A 3P65A 3A6CY 1YANA 4PPOA 5B1GA 1I56A 4GN4A 1D0MA 1QTKA 2HEEA 1FLWA 2LZTA 3HBEX 1UC0A 1GPQC 1WQMA 4NGJA 193LA 2HTXA 5KXNA 1LMTA 1N4FA 1YAMA 4CHXA 4DD9A 4IATA 1YQVY 1HHLA 2ZILA 1NMMA 2MEDA 3TXGA 1LZ9A 3A95A 2Z37A 1LZNA 5C6LA 3TMVA 3WVYA 5D5FA 1GFRA 1J1XY 5KXYA 5E9RA 2F4AA 4ETBA 3P66A 4HPEA 1QUTA 1GF4A 4J1BA 1YIKA 2MEFA 1GB5A 1TDYA 4GCBA 1BVXA 3AZ4A 1BB6A 1KXXA 2A7FA 1CJ8A 4WMGA 3IJUA 1LSGA 3T36A 2Z19A 3EBAB 3CSZA 1NDGC 3N9EA 4GCDA 3TMUA 5APCA 3TMXA 4DDBA 5A3ZA 1VDSA 2Z38A 4BADA 1LZRA 5B05A 1GBOA 3AZ5A 1GF7A 1UIHA 1INUA 1LZ1A 1RFPA 3LHMA 4OWAA 4U3XB 3ZEKA 5KXRA 1QSAA 1LJKA 1XGRC 1VATA 2FBBA 4UWUA 3EO5A 3EXDA 4NSHA 3WYHA 4TUNA 3TXJA 2BQOA 4XJGA 2C8OA 4ANRA 4GCEA 4FDYA 4Z41A 1LZ5A 3AGIA 4XENA 4LT3A 1FLUA 3RT5X 4WG1A 2H5ZA 2HEFA 1RI8B 1LSAA 3HBHA 2FYCA 1I20A 3VWOA 2BPUA 1UIBA 4H90A 1OUHA 1GF0A 3AZ6A 1GB7A 1YL0X 4X3BA 2BQFA 1BWIA 1YL1X 3P64A 1CKHA 1HSXA 3LYOA 3IWRA 3WULA 1FKVA 1TAYA 4NSGA 4WM5A 4M6DA 3W3EA 4N0JA 2EPEA 2I6ZA 5JENB 4OW1A 5DN4A 1T3PA 1GF9A 1WQNA 4LYTA 2YSSC 1BB7A 5FCPA 3WW5A 2BQCA 3CSQA 5ILFA 2BQDA 1IC7Y 1JTOL 4KPMA 5APFA 5M1YA 1JITA 1Z55A 1LZTA 1OUAA 5KXMA 5T3FA 1GBYA 1KIPC 1LZSA 3RNXA 1BB4A 1NWGA 5LVIA 5LA5A 1UBZA 1IR9A 2Z12A 3E3DA 1GDXA 4WL6A 4YOPA 2BQGA 1I1ZA 1JSFA 1B7LA 2W1LA 1LZ4A 4BAPA 4MCKA 1GF8A 5HNLA 5I4YA 5IELA 1MELL 4G4BA 1KIRC 3WUAA 4DD3A 5KXKA 2Z18A 1BHZA 1GF5A 1HELA 2C8PA 1J1PY 3FE0A 4N8ZA 4XADA 1IP7A 1VDTA 4H8XA 1DI5A 4LT1A 1HEQA 1BQLY 2BQEA 4DDAA 2WARA 1B5ZA 1JHLA 5B07A 5LVJA 2FYDA 4O34A 1GFVA 4NG8A 1LZDA 1NBZC 3B0KA 4L41A 4WL7A 1NHEA 3HBDA 4OOOA 4TX7A 4H94A 5HMJA 4H9BA 1IY4A 1GE1A 1JTPL 1GFJA 2PC2A 5E4PA 3BKHA 4B49A 2G4QA 2YDGA 1HEPA 1QIOA 208LA 3WPKA 1AKIA 5L9JA 2XBSA 1GE3A 3AB6A 1JUGA 3WPLA 2D4JA 1EL1A 1LSDA 1MLCE 3TMWA 5KXXA 4IASA 4OWEA 1FBIX 1JPOA 1OUEA 1V7SA 4RDSA 4B4JA 154LA 1LZGA 1O23A 1FKQA 4C3WA 1B7QA 3CT5A 4TSCA 1IOQA 1ZVYB 4B0DA 1GBWA 4NFVA 1FLQA 5F14A 132LA 1BWJA 4BS7A 2Y8PA 5KKJA 3QE8A 2ZQ3A 1ALCA 1QSWA 5KXLA 2NWDX 1NKHA 4OWBA 1LYYA 1AZFA 4NHQA 1EQ4A 1LMNA 1BGIA 1C43A 2CWIA 4YM8A 1A4VA 2D4KA 1D0KA 3W6BA 1LHLA 5HNCA 5I54A 3J4GA 5APDA 3LYTA 4ZEEA 1HNLA 3AGGG 9LYZA 1NBYC 4H9HA 4PGJB 1HFYA 1LCNA 2DQAA 5F9XA 4PRUA 1NF5A 1LAAA 1XEIA 4WLXA 1IVMA 1DXJA 5AMYA 4C5FA 1WQRA 5A3EA 4WO9A 4OOTA 3WMKA 3WVXA 4W96A 4H92A 4B4IA 4LZTA 1LJNA 4GCCA 1LHIA 1LJIA 1YKXX 4NY5A 1GE4A 1DKKA 2EKSC 5KXTA 2HEDA 4LYOA 5F9UA 3WXTA 1JKBA 1GHLA 4NHSA 1QDTA 1GE2A 1GWDA 1LKRA 1JJ1A 5I5QA 3WW6A 1IWTA 1HEWA 1HERA 1UIDA 4HTQA 4NGZA 1GF6A 2YBHA 5LYZA 1GB6A 1KXWA 2MEAA 1IP2A 1DI4A 1LYOA 4YENA 1B7PA 1B7OA 5HQ1A 1LHJA 1OUFA 1F0WA 1OUJA 1GBXA 5I53A 1LHKA 4ZIXA 1LHMA 1LOZA 1LPIA 1UIEA 1EQ5A 1CJ7A 1XGPC 1QQYA 1BB5A 2ZNWY 4TSBA 2DQJY 1OUGA 4UWVA 1CKFA 1VDPA 4TWSA 1HFXA 5LVKA 5LVGA 1OUCA 2HU1A 1CJ9A 4AXTA 1IWZA 4NG1A 4WG7A 2HEAA 2G4NA 4P2EA 4I0CA 4J0LA 1B7MA 4EOFA 4NGKA 3D9AC 2GV0A 5ILCA 2BQKA 1IOCA 4D9ZA 1GFHA 1NQIA 1HSWA 3ATOA 3RW8A 1IP3A 1HEMA 1IP4A 1AM7A 1JTTL 1LSPA 3D3DA 4DD7A 1LSZA 2MEEA 1XGQC 5LYMA 1LSFA 2D6BA 4G4HA 4MR1A 3CSRA 1IP5A 4R6CA 4HTNA 2RSCA 5KXOA 5D5CA 1B7RA 1YAPA 2DQDY 4MSTA 133LA 1B2KA 2W1YA 1IIZA 1YROA 4H1PA 1FDLY 1UIAA 2XBRA 3TXKA 4HJZA 4DD0A 1IR7A 2B5ZA 3A90A 5APEA 4GN3A 1LYSA 3P4ZA 3AJNA 4CJ2A 1AT5A 2DQEY 4LT2A 5FELA 1D9UA 1JISA 2A7DA 1CKGA 4LYCA 4WLTA 4WM2A 4NGLA 3CB7A 4LYMA 4NIJA 1UICA 3A92A 1IY3A 3MGWA 1C46A 2YBJA 3CQLA 1LYZA 1LJFA 1YKZX 1GFGA 2HECA 2ZYCA 1TBYA 4NGYA 6LYZA 4NGIA 2ZQ4A 2AUBA 2DQIY 4H9AA 2BQAA 1B7SA 1WTNA 4N1EI 4H8YA 2F30A 3TXEA 1LZBA 1OUDA 5I4XA 1F6RA 1F10A 1G7IC 3A34A 3AW7A 1XFPL 1JJ0A 1LZ8A 1VAUA 1IWXA 1GEVA 1P2CC 4NEBA 1CNSA 4GN5C 1IP6A 1D6QA 1LJ3A 1F6SA 1EQEA 1GFEA 1LMCA 1UUZC 4UWNA 4ET9A 4QGZA 1W6ZA 1AT6A 2CGIA 1GD6A 1TCYA 4H9IA 1CKDA 4HSFA 3TXHA 1XEJA 3GXKA 1XGTC 3WXUA 2DQCY 1JEFA 1GBZA 4J7VA 1TEWA 2LZ2A 4CFOA 4N1CC 3OK0A 2VB1A 2N5ZA 1DKJA 2FBDA 3A96A 4ML7A 4NSJA 2H9JA 2YBIA 1HENA 1JSEA 1BB3A 2D4IA 2DQFC 2Q0MX 1GE0A 4B1AA 1HC0A 2YBNA 3WPJA 4DT3A 1RE2A 1FLYA 2EQLA 4OWCA 4ETEA 1REZA 1UIGA 2W1XA 1GFKA 3ULRA 1LJEA 4XJBA 1JIYA 3A3RX 4WLDA 5B06A 5DLAA 2BQIA 5FSTA 1IWUA 1LMPA 1LSMA 3W6CA 4RLNA 3TXFA 1OUBA 2I25L 3AZ7A 4TTDA 4XJFA 4ETDA 1ZVHL 1JKAA 1LZEA 5DM9A 3ZVQA 2MEIA 5C6JA 1IWWA 1YILA 3J6KA 4DC4A 4Z46A 1UA6Y 2DQGY 1LSNA 2IFFY 4HTKA 4RW1A 4YEOA 4GLVA 5KJ9A 3G3AB 2D91A 4OWHA 2MEBA 1LJ4A 4NGWA 4LFPA 3F6ZA 4NWEA 2HEBA 3OJPA 2X0AA 5LAGA 2BQNA 1GXXA 5F16A 5FEKA 5C6IA 3RZ4A 1GAYA 4YEMA 2MEHA 4XYYA 1C45A 5K7OA 5LXWA 2HU3A 4AGAA 7LYZA 4H8ZA 4H9CA 1DZBX 1YAQA 2DKVA 1DQJC 4XJHA 5FDJA 2BAAA 4KT3A 1D0LA 5J7CA 3AGHA 135LA 2LYZA 1OQMA 3RU5A 1GBSA 2DBTA 2XTHA 1LTMA 1LMAA 2YVBA 5L3HA 4CGEA 1UIFA 4QEQA 5F81A 5LVHA 5KKIA 1B5XA 1HEOA 4QDNA 1C10A 4KXIA 4ZFPA 1B5WA 4HV2A 5L3IA 5KXSA 5B1FA 3N9AA 1G7LC 1LZ6A 1B5UA 1LSEA 3B72A 1W08A 2W1MA 1GEZA 3W6FA 5I4WA 4M4OA 2BQBA 1D6PA 1HMLA 3LZ2A 1LJHA 3N9CA 1WQOA 3TXBA 1BWHA 1HFZA 1OUIA 1IR8A 1WQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L28A 2X49A 1CVKA 4BLCA 1LKSA 2DWZB 1KFVA 1SLYA 4LYZA 5KXZA 1OIPA 3FUXA 3QAKA 1EIJA 1L66A 1ZV5L 2LYOA 3EMSA 2CUUA 3WUMA 2OU9A 4YF2A 7LZMA 2CP8A 1LSYA 1IOSA 2BWEA 3H4MA 1G7MC 1TTEA 3KP1E 1XJTA 2ZAMA 1JB0F 2Z7JA 3RE8A 1YAOA 2CHGA 4PJ2C 4W57A 1QT8A 4B08A 1G0PA 3KXEC 1NHGC 1WHCA 3SBJA 1L58A 2VQFM 1E8LA 4AQYM 1C6NA 4DYGA 3SAUA 3FUUA 4S0WA 5LIOA 4EKSA 1L23A 3A42A 1C7PA 2NTHA 146LA 2OTZX 1VDDA 4R0FA 5ITYA 1XSFA 1WVUA 3GLIE 1R2YA 5ITQA 3THGA 1REMA 2LHMA 2Z39A 3NYAA 4LGKA 3VK7A 1L2CA 5IDDA 1C68A 1C6PA 5IREB 4LG2A 4EKQA 3MJ5A 4ETAA 2H9KA 1WIVA 4DV7M 4NSIA 3WU8A 2ZIKA 4ET8A 1LMQA 3FI7A 2CDSA 1IWVA 3JR5A 177LA 180LA 240LA 3A94A 1TGUA 4NWHA 3K9OA 1CU0A 4B4EA 4DD1A 4I7RA 4LRTA 1C08C 1GB9A 1L11A 199LA 2KNVA 1CU6A 1ZMYL 3HHZA 4CFOA 3HHYA 134LA 1NHBA 3T6UA 4RF0A 2JA2A 3AKZA 4DV0M 1CUQA 4WM3A 1NDMC 1IORA 1L69A 1L20A 4G4NA 4DR4M 3SMPA 2HUBA 2B6XA 1L1ZA 2B6ZA 5LINA 2RAZX 4K5YA 1LZCA 2Z3XA 211LA 4IJFA 259LA 4NHPA 2BQHA 3D4SA 5LYTA 4Z98A 1UM8A 3TWMA 191LA 1RJCB 1OQYA 2RGHA 3K2LA 3DFZA 2RBQA 3LMMA 4DD2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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