4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
3A92A 2Z39A 1HHLA 3G3AB 3TMWA 3WU8A 3WUMA 4LT0A 4NGVA 1LHMA 4H9HA 4NGZA 3W3EA 1HSXA 1VFBC 4KT3A 5II3A 4DDBA 4QGZA 5DM9A 5HMJA 1LSNA 1INUA 1LZ4A 1UUZC 3A96A 2Z2EA 2XBRA 1LHJA 4DD2A 1WTMA 9LYZA 1HFYA 1LJJA 4N9RA 5KXTA 5LVJA 3QY4A 1DPXA 1CKGA 4QEQA 4WO6A 2D4IA 1B7MA 3A95A 4B0DA 4LT2A 3EO5A 3WL2A 3W6DA 4RW2A 1UIFA 2G4NA 1IY3A 2MEBA 5K7OA 1PZYA 2ZIJA 2DQJY 3CQLA 4EMNA 1DI5A 1IWTA 5KXSA 3B6LA 4ML7A 4H93A 5LINA 5KXNA 3A91A 1MELL 1G7LC 3TMUA 3LYOA 1VAUA 1LZ1A 4NHQA 1B5UA 4J0LA 1C10A 1LSZA 1UIDA 1IP5A 2DQGY 1EQEA 3AYQA 2BQNA 4MSTA 4NGKA 1QDRA 1I1ZA 1GFHA 1LJ4A 2A7FA 2DQIY 5KXPA 1F6SA 2YBJA 1WVUA 2Z18A 5F16A 1GFJA 1IWUA 1JJ1A 5FEKA 1DPWA 3EMSA 1OUHA 3IJVA 5C6JA 4HJYA 2MEGA 1LJNA 1BVXA 2W1LA 4NGYA 1JSEA 2I6ZA 3CSRA 1IP2A 1GD6A 1I20A 4YENA 4N1CC 5A3ZA 3A3RX 5KXWA 3A34A 1GF3A 4OOOA 1JITA 1LMCA 1F10A 1UC0A 3AZ7A 5IDDA 4WO9A 4LZTA 3TMXA 1GBYA 4RLMA 1B5XA 1OUBA 2BQFA 3A6BY 2BPUA 4MCKA 1IOSA 1AM7A 1LSGA 3M3UA 4XJFA 1GFVA 1YILA 3B0IA 1WTNA 1HNLA 1QUSA 2LHMA 1XGUC 1GF4A 1WVVA 4MR1A 4OWBA 4WL6A 1OUEA 5FCPA 1A2YC 4A7DA 1O23A 1GE2A 3WXTA 1KIQC 2CJLA 1OUGA 2BQCA 4NY5A 4II8A 1TEWA 3LYZA 1LSMA 4ETDA 5FSTA 1GFTA 4NSIA 1G7IC 5HMVA 4OWEA 2HTXA 3TXDA 4ZFPA 5KXXA 1KIRC 4HJZA 4XJIA 1IX0A 1B7SA 1UIHA 4CFPA 1FBIX 3WMKA 3WU7A 4D9ZA 5DLAA 1REYA 1J1OY 2MEEA 4HTKA 4DD1A 1B7NA 1RI8B 3SP3A 4H8ZA 3P4ZA 1C45A 2HU3A 2HEEA 3QNGA 5KY1A 4H9EA 2MECA 1BQLY 2DQCY 4NGJA 4LFPA 1I56A 4NWHA 1B5WA 2RSCA 2Z12A 4PPOA 3ZVQA 1XGRC 2YVBA 1JPOA 4NHPA 3TXEA 2XTHA 1ZMYL 1T6VL 1FLUA 3GXRA 4N1EI 3LYTA 2BLXA 1NKHA 2MEDA 4NGWA 4TSBA 1DZBX 2I26L 5I54A 2HUBA 2F2NA 2Z2FA 1GF9A 1HSWA 1RCMA 4H9FA 3WPKA 3WW5A 4QY9A 1TDYA 4H1PA 4LYBA 1IP7A 4OWCA 3CB7A 1FLWA 1LSFA 1FN5A 2MEHA 1EQ5A 1JKAA 1LZ9A 2Q0MX 4LYMA 4LYZA 5HLLA 1IOTA 4FDYA 1IY4A 1DKKA 2I25L 4I0CA 3T36A 3LN2A 4WMGA 1RJCB 4WM2A 1A4VA 1LCNA 4LT3A 1GFUA 1QTEA 4YM8A 1TCYA 3P65A 4LYTA 1NHEA 1GBXA 1TBYA 4G4HA 1OUDA 1NBYC 5ILCA 3AZ6A 4XADA 3TXBA 2ZNWY 1LJKA 5KXKA 1AT6A 2XJWA 4FJRA 2ZNXY 4H9CA 5B06A 3LZTA 5F14A 4GN5C 1J1PY 5C6IA 1LYZA 1IWWA 1AKIA 1NDMC 4OWHA 3WVXA 1D6QA 1BB6A 1LYYA 4B1AA 5LVIA 1YKXX 5LAFA 4WG7A 3LHMA 4WM5A 1GF8A 1HF4A 4XJHA 2FBDA 193LA 1G7HC 1NQIA 3N9CA 5A3EA 4LYOA 1LZGA 1OP9B 1LTMA 1IP4A 3HFMY 3WPJA 2CDSA 3ATOA 5HQ1A 4XJDA 1SQ2L 5LYMA 1VATA 1D6PA 2YSSC 8LYZA 6LYZA 1XGTC 1UACY 5E4PA 3RT5X 2IHLA 5M1YA 1GFAA 1LAAA 1WQNA 5LYTA 135LA 1QDTA 1C08C 4RLNA 4ETBA 5KXZA 4NSGA 1BWHA 1YL1X 1JHLA 207LA 1LHIA 4YEMA 1OQMA 4WLTA 5LVGA 1XFPL 1JTTL 1GF5A 1YKZX 2W1MA 4H91A 5FHWA 2BQOA 1HFZA 2YBLA 1GXV2 4ET9A 2BQAA 1GF6A 3K3TA 1V7TA 3J6KA 2BQGA 2FYDA 1GEZA 1LMQA 5FDJA 4TUNA 4NGIA 1W08A 1LMOA 1LZ5A 2MEAA 4XENA 5F9XA 1AT5A 4GLVA 1GPQC 4OW1A 1UIGA 3LZ2A 3P64A 4ETAA 1VDPA 4HPIA 1IIZA 1C46A 4GCBA 5LAGA 4XN6A 4IJ4A 1LJGA 2BQMA 4H90A 4TTDA 4IATA 1NMMA 3D3DA 1FDLY 3TXJA 1XEJA 4J1BA 5I4YA 1F0WA 2YBHA 1CKHA 1HFXA 2ZIKA 1KXXA 4XJGA 1YROA 4GCEA 1LPIA 5B07A 5KXMA 4WM4A 1KIPC 1LZ6A 4O34A 4ZIXA 1XGPC 3WYHA 1IO5A 2HU1A 4G4CA 3WU9A 4DD7A 3AZ5A 5AMYA 5KXYA 1GE3A 4G9SA 3W6CA 5LXWA 2D6BA 2DQDY 3TXFA 4NHIA 1GFEA 1KXYA 2EPEA 2BQEA 4M6DA 1B0DA 4BS7A 1HMLA 2CGIA 2YBIA 7LYZA 4N0JA 4AGAA 1OUIA 5DN5A 1HEWA 1B7RA 2W1XA 4NHTA 4Z41A 1B7PA 3FE0A 4ET8A 1BGIA 3W6AA 2F4GA 2FBBA 1V7SA 1IP6A 1NDGC 3B0KA 3A3QA 3HBDA 1GB6A 1IWYA 4UWUA 1UIAA 4YEOA 3CSQA 1LZAA 1XGQC 3B0OA 1GB8A 3CT0A 1BB7A 2BQHA 1IC5Y 3WUNA 1LJ3A 1LOZA 1IWZA 1D0MA 1GBZA 3F6ZA 4I8SA 4KPMA 4OWAA 1WQRA 4BAPA 4GCDA 2F30A 4WL7A 1XEIA 2BQDA 5FELA 2HEDA 1N4FA 1YAOA 3A6CY 1GEVA 4WLYA 3WH1A 4NIJA 154LA 1HELA 4GN3A 4LT1A 2H9KA 2G4PA 1BB5A 2BLYA 5B59A 1NF5A 3CSZA 1GE0A 3B72A 3EXDA 3RW8A 1GB3A 1QIOA 1CJ7A 2YBNA 1LMNA 3EBAB 4J1AA 1D0KA 1JKBA 4W94A 4WM6A 1BHZA 4XJBA 2C8OA 1BB3A 1HEQA 1VDSA 4NEBA 3VWOA 4P2EA 2B5ZA 2YDGA 5I4WA 1GAYA 1W6ZA 5I5QA 4EOFA 1FKVA 3WVYA 2Z38A 4TSCA 1EQ4A 1B7QA 2D91A 3TXHA 3W6FA 5KXLA 4NSHA 5L3IA 2BQIA 3RU5A 2H5ZA 5I53A 1BWIA 4C3WA 4ZEEA 4G4BA 1IR7A 2IFFY 2BQJA 5I4XA 4IASA 1OUCA 1DXJA 2AUBA 1JEFA 1H6MA 1CNSA 3AW6A 1ALCA 4NFVA 3AB6A 5APCA 2EIZC 5KKIA 6LYTA 3RNXA 2F4AA 1JISA 4HPEA 1C7PA 4CGEA 2G4QA 1ZV5L 3AGGG 1FKQA 2W1YA 2ZILA 1JIYA 3P68A 4WLXA 4BAFA 4PRUA 2MEFA 5F81A 1LSCA 3IJUA 5E9RA 5KXOA 1LMPA 1YQVY 2X0AA 5B1GA 1LYSA 1GAZA 4HSFA 4BADA 1LZEA 5KKJA 1UICA 4H9IA 4H9AA 2N5ZA 4DT3A 2DQAA 5HNLA 3AGIA 5LYZA 194LA 132LA 2VB1A 4GN4A 1GWDA 4LFXA 3QE8A 4GCCA 1HERA 1CKFA 5B1FA 1B7OA 5LIOA 1IR9A 1IR8A 2ZYCA 1JWRA 134LA 1J1XY 1LZSA 1BVKC 1RFPA 1T3PA 2ZQ4A 1LZTA 3N9AA 3KAMA 1GDWA 1JJ0A 2Z37A 3BKVA 4Z46A 3IWRA 5DN4A 1CKCA 3LYMA 2A7DA 4LGKA 2MEIA 1IORA 1CJ9A 3OJPA 1DKJA 2NWDX 3RZ4A 1QUTA 3E3DA 1WQPA 4OOTA 3HBHA 1GB5A 1YAPA 2DQHY 3FI7A 1GBWA 1GB7A 3M18B 2LZTA 4PJ2C 2BQBA 1F6RA 4H8XA 5IHGA 2DQFC 5D5CA 1IWVA 1FLYA 1GB9A 4N5RA 4RDSA 4TX7A 3A67Y 4CJ2A 1LHKA 3N9EA 4DD0A 1JKDA 1GBOA 1LJIA 4QDNA 1YIKA 1JUGA 2DQEY 4NGLA 1QQYA 2EKSC 1LMAA 1D9UA 4WLDA 4WM1A 3D9AC 1IOCA 2Z19A 2YBMA 4WG1A 3MGWA 2XBSA 1LSEA 2WARA 1LSYA 4HJVA 1LZ8A 1MLCE 4XYYA 1D0LA 1SLYA 1GFGA 4GLAA 2C8PA 3OK0A 3WXUA 1LZNA 1B5ZA 5B05A 3WW6A 4NSJA 1IC4Y 1WQQA 1LZDA 1PS5A 1GHLA 1LJFA 1OUJA 1QSWA 3WUAA 3TXIA 1HEOA 1HC0A 1Z55A 1G7JC 1YL0X 5D5FA 1LZYA 1QTKA 3A94A 3TMVA 1WQMA 2BQLA 1AZFA 1LSPA 4PHIA 3W6BA 4W96A 4TWSA 4C5FA 4YOPA 1B5YA 4R6CA 153LA 3CT5A 3GXKA 1REZA 3G3BB 1UIEA 3HBEX 4ETCA 5JENB 2D4JA 2PC2A 4PGJB 2HEBA 2D4KA 4WM3A 4ETEA 1DI3A 4DDCA 1OUFA 3W6EA 1ZVHL 1GBSA 3WULA 5LVKA 2LZ2A 4N8ZA 1LZRA 5KJ9A 5F9UA 3AZ4A 1H87A 1LKSA 4HP0A 1IP3A 1LHLA 3A90A 1IOQA 1UCOA 4Z3MA 1XSFA 4M4OA 4DD3A 3ZVQB 2LYOA 1GF0A 2LYZA 1TAYA 5LA5A 4Z98A 4LYCA 1P2CC 3WPLA 1B2KA 1EL1A 5ILFA 1GFKA 1B7LA 2Y8PA 4HV2A 1VDTA 2H9JA 1KXWA 5APEA 5L3HA 4PRQA 1LSAA 5J7CA 1JTPL 1B5VA 2HEAA 2ZYPA 5HNCA 1YAMA 4NWEA 4GCFA 1G7MC 2DBTA 1JJ3A 1GE4A 5T3FA 2HECA 1FLQA 1GF7A 1IC7Y 4U3XB 2LYMA 5L9JA 4WOAA 1WQOA 1LJEA 4DD9A 4E3UA 2GV0A 4DWXA 1BB4A 5EBHA 4HV1A 2ZWBA 1DQJC 4DDAA 3TXKA 1YANA 4DYGA 2BAAA 3BKHA 1UIBA 1UBZA 4H92A 2FYCA 4L41A 1IP1A 3A8ZA 1LKRA 5C6LA 1GFRA 1IEEA 133LA 1UA6Y 3ATNA 3TXGA 5DL9A 4J7VA 1GB0A 1REMA 1REXA 4KL7A 5APDA 5LVHA 4NG8A 4NG1A 4NHSA 1LHHA 3ULRA 3J4GA 4RW1A 1GB2A 1JSFA 3P66A 5IELA 1JKCA 4X3BA 4CHXA 1B9OA 1GE1A 1LZBA 1JTOL 3AGHA 2EQLA 1QSAA 4KXIA 208LA 1LSDA 4B4JA 1LSBA 1YKYX 1CKDA 4R0FA 2BQKA 4DC4A 2ZQ3A 4G49A 4HTQA 4B49A 4ANRA 1LZCA 4UWVA 4YF2A 5KXRA 2DKVA 1NWGA 1VEDA 4CFOA 1BWJA 1RE2A 1CJ6A 4B4EA 5LA8A 3ZEKA 4B4IA 4HTNA 4UWNA 1NBZC 4NGOA 5APFA 1HENA 1DI4A 1HMKA 1LYOA 1LMTA 1HEPA 1ZVYB 4H94A 1C43A 3A93A 4H9BA 1CJ8A 1LJHA 1XEKA 3AJNA 4AXTA 4H8YA 3T6UA 2HEFA 1GDXA 1IWXA 1GXXA 1YAQA 1IVMA 3AW7A 3CT1A 2CWIA 1VDQA 1HEMA 1E8LA 1OUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L1TA 3G3AB 4ZPUA 3TMWA 3WUMA 4LF6M 3KXEC 1VFBC 5DM9A 4B7HA 1LSNA 1UUZC 1QS9A 4DD2A 1D3FA 1WTMA 4DUYM 3HWSA 1FJGM 5KXTA 1W5TA 2K9DA 2KA6B 3D8BA 1PQMA 3A95A 4IBJA 3NBIA 4IAPA 3FRIA 2G4NA 2R65A 1DYDA 4LGMA 1L56A 4R7GA 4GH9A 4EMNA 1Z5AA 2C99A 2LVNC 3B6LA 1WGLA 3TMUA 3FD9A 3LYOA 1LWKA 4GRVA 4MSTA 1XJTA 157LA 1IP5A 3AYQA 2HWJA 2XFTA 1WVUA 2RH1A 5FEKA 1DPWA 3EMSA 5C6JA 1L44A 1NV8A 1I20A 3HU8A 4GMQA 4WURA 3D4SA 4N1CC 5KXWA 4JV5M 3TWKA 3DMXA 3HY5A 5IDDA 4WO9A 1TH4A 182LA 3HJSA 3TMXA 2N35A 3A6BY 1IOSA 1LSGA 1TH2A 5EXTA 2G3QA 3B0IA 1WTNA 1XGUC 1G0PA 1XC8A 3L29A 1C6LA 1R5LA 3HZJA 4W56A 1A2YC 1O23A 1GE2A 3WXTA 1KIQC 2EJSA 1LSMA 1OIZA 1QVRA 109LA 4HJZA 1B7SA 1DYBA 1J1OY 107LA 4DD1A 2UUCM 4H8ZA 2O4WA 1C6NA 188LA 1BQLY 1C6GA 1T97A 2DQCY 4NWHA 1B5WA 3ZVQA 3E9SA 2CP8A 2XTHA 3V76A 1ZMYL 4B7FA 5KQ8A 212LA 4I4LA 4N1EI 126LA 1GL6A 4LFAM 1DZBX 3H4MA 2D7EA 3HH5A 137LA 1IM2A 2NTHA 1TDYA 2E5LM 4LYBA 3SB7A 4OWCA 2F5SA 1L66A 3CB7A 1FLWA 1JQUA 1FN5A 3DN0A 2EUCA 1JKAA 3VK8A 3GUPA 4LYMA 4LDOA 1DKKA 1P3QQ 1XXHE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3G3A B;  4ZPU A;  3TMW A;  3WUM A;  1VFB C;  5DM9 A;  1LSN A;  1UUZ C;  1QS9 A;  4DD2 A;  1D3F A;  1WTM A;  5KXT A;  3A95 A;  1PQM A;  4IAP A;  2G4N A;  1DYD A;  1L56 A;  4EMN A;  3B6L A;  3TMU A;  3LYO A;  1LWK A;  4GRV A;  4MST A;  1XJT A;  157L A;  1IP5 A;  3AYQ A;  1WVU A;  2RH1 A;  5FEK A;  1DPW A;  3EMS A;  5C6J A;  1L44 A;  1I20 A;  3HU8 A;  3D4S A;  4N1C C;  5KXW A;  3DMX A;  5IDD A;  4WO9 A;  182L A;  3TMX A;  3A6B Y;  1IOS A;  1LSG A;  3B0I A;  1WTN A;  1XGU C;  1G0P A;  1C6L A;  4W56 A;  1A2Y C;  1O23 A;  1GE2 A;  3WXT A;  1KIQ C;  1LSM A;  109L A;  4HJZ A;  1B7S A;  1DYB A;  1J1O Y;  107L A;  4DD1 A;  4H8Z A;  2O4W A;  1C6N A;  188L A;  1BQL Y;  1C6G A;  1T97 A;  2DQC Y;  4NWH A;  1B5W A;  3ZVQ A;  2XTH A;  1ZMY L;  212L A;  4N1E I;  126L A;  1DZB X;  3HH5 A;  137L A;  2NTH A;  1TDY A;  4LYB A;  3SB7 A;  4OWC A;  1L66 A;  3CB7 A;  1FLW A;  1JQU A;  1FN5 A;  3DN0 A;  1JKA A;  3GUP A;  4LYM A;  4LDO A;  1DKK A;  3HUK A;  1D9W A;  1QT6 A;  4LT3 A;  3P65 A;  1TBY A;  257L A;  4G4H A; 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