4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
2XGXA 3OF1A 4IEXA 1I5ZA 1YX0A 1ZZ8A 2PYTA 4HZFA 1S7FA 3G3SA 4RS2A 3O14A 4KL1A 4M3SA 4I2OA 2Q7BA 1O3QA 2OZHA 2PHLA 1FXZA 1UPIA 3M3IA 3FJSA 4H7LA 1FT9A 1RL3A 4XF9A 1O3RA 3CLPA 3JUWA 3NE7A 1YREA 3MGDA 2PHDA 3R9GA 2IXHA 2QDRA 1N71A 4R3KA 2WPWA 4UWJA 4FBFA 4IERA 1DGWA 4XFGA 4K30A 5F48A 5EBVA 3H50A 4FAGA 2ATRA 4WZCA 1IIDA 1Q2CA 5KHKA 4KUAA 2EVNA 4LX9A 3R9EA 2GE3A 3S6FA 5LEJA 1NMTA 4FD4A 1ZZ9A 4L2NA 3VHRA 4XPKA 3R96A 1EP0A 2VQAA 5BV6A 1P0HA 3RYKA 1QXRA 3F0AA 2CGPA 4MI4A 4UBGA 2OB0A 3I54A 3B8GA 3HIFA 1IPJA 1XE7A 5HMNA 4IEQA 5JPHA 4CRYB 3RDIA 1WK4A 1KUYA 3SXOA 1XE8A 2AE6A 2B4DA 3G7DA 1X8EA 4Q0SA 2ZXVA 3FIXA 4R3LA 2XLFA 4L11A 1XEBA 2B5GB 3PVBB 1DZTA 2Q0YA 1OD5A 3C26A 3DR6A 4MY3A 2R8VA 1KUXA 2H0VA 2PTMA 3RPQA 2ZW7A 4J1XA 1NE4A 3TOBA 3QAHA 1YUDA 4FD5A 2GANA 4U9ZA 2EAAA 1VR3A 4HSLA 2REFA 4PJYA 1CJWA 5I93A 4MY0A 3KCCA 2Q4SA 4OFGA 3U0ZA 1J59A 4IETA 1RUNA 4KUBA 3EJKA 5FPXA 2Y0MA 1VJ2A 2A4NA 4XNHB 3QOPA 4YRDA 1Y9QA 2VZZA 1J3PA 3RZZA 1NE6A 2QCSB 4YRHA 1S7LA 4XEZA 4MGIE 3I59B 2BUEA 1QSOA 2BEOA 3C3VA 1YR0A 4DINB 4YSFA 2OH1A 2OZJA 2QJVA 4I3PA 2QIRA 2Z10A 3CXSA 5JCTA 1NSLA 2MNGA 4PK2A 3NL1A 1VKCA 4HNWB 1JUHA 4XF4A 1M4GA 2WC2A 3ES4A 2JEVA 4BMHA 4R9MA 3PGPA 1IYLA 3D3SA 2BNMA 3W6SA 4AG7A 2UYAA 2J8NA 2PQQA 4F0YA 3FE5A 2P6FA 2B4DB 4IESA 5AVPA 3OGJA 1J4JA 5ISVA 3E6BA 1CAUB 4XFBA 1K4JA 3NJZA 2ZPAA 2J8MA 5J3UA 4Q0VA 3EBRA 5KHHA 1ZNPA 3GYDA 4L8AA 1V70A 3BB6A 1CM0A 5C6CA 4XPDB 4E2GA 1YLLA 1X7NA 5BXXA 1ZZCA 1XE4A 4HKFA 2FS5A 2FE7A 4IUSA 5KHJA 5CNPA 1YVOA 2IXLA 1M4DA 1CAXA 4AVCA 4XF0A 3EHKA 3PP9A 2MPFA 1J58A 2ATFA 5I0UA 3CF6E 1ON0A 3TTHA 3LWCA 1O3SA 3P2FA 4FAHA 3H3ZA 3RYRA 4YYOA 1ZRFA 3BJ7A 5IB0A 2FCKA 4XETA 3E5XA 1I21A 1CX4A 2Z69A 4ORFA 3D82A 5FLHA 4XNHC 4ONUA 1TIQA 2D93A 2JDCA 2Z2SB 1L3JA 4E2QA 1YK3A 3ZDSA 5J8FA 4LA3A 4XFFA 1U6MA 2PA7A 1YGHA 1WA4A 5EFUA 2OZ6A 3D2MA 1EPZA 4I0AA 3EY5A 1QSMA 3KMHA 4QX5A 2ETEA 3MDPA 3RYOA 1NZCA 2EVXA 5E16A 2IXJA 4D7SA 3E97A 4PIXA 3S6HA 2GC2A 4MGYE 4NXYA 4QB9A 2UY8A 3D0JA 4OAEA 2VEZA 2VQYA 3KGLA 4XFIA 4AVBA 4AQ2A 3P2HA 3SXNA 4NSQA 3S6KA 3D2PA 1Q43A 4WVZA 2D40A 1J3RA 3ST7A 1J1LA 1S60A 2HV2A 4NF1A 3H4QA 3E6DA 4BH9A 2P17A 3I3GA 2CAUA 1SEFA 3QACA 4R87A 4XPDC 3EQEA 1OFNA 5H84A 2OU2A 4LEJA 1Y3TA 1OI6A 4M85A 4LUMA 1VP6A 4IEOA 1O7FA 1TQ5A 1GQHA 2GU9A 4QGLA 5I0TA 4F6AA 5J8CA 1PMIA 1OZPA 1DZRA 1WGPA 4R52A 4UBHA 3VWDA 4X5KA 2CY2A 3PLQA 1LB2A 5KTAA 1WLTA 4QVTA 4U5YA 3I9SA 3ETQA 1S7NA 3NSTA 2GZWA 4Z82A 3BPZA 3DKWA 1ZZ7A 3UKVA 1GHEA 1IB1E 4KLWA 5C8WA 1Y9WA 4XPLA 5F49A 1V0CA 2O8QA 4KWLA 2QNKA 2OPKA 2D5FA 5HI0A 1L0CA 3IDCB 5LRSA 3KGZA 2K9ZA 3E5UA 1MK4A 2UY9A 2KXLA 3LODA 3CJXA 2H6BA 3EFAA 2BNNA 3PZJA 4HVQA 1UFHA 1XMTA 4F7ZA 4F8AA 2CNMA 5BY5A 2VXKA 1XRUA 4IEPA 3N7ZA 2VI7A 2I45A 1KZFA 5I8TA 4A2UA 3TO7A 5IV0A 1IYKA 4L89A 4KU8A 2BEIA 3E0KA 2CNSA 2FIAA 3W6XA 5IX3A 2RC4A 1RXTA 2IC1A 4MUVA 5CVRA 2ARHA 3FFQA 2JDDA 3SCGA 3FNCA 3QB8A 5DWNA 2UYBA 5FLIA 4XF1A 1EYBA 4H89A 4E0AA 2G3AA 4MJ8A 4JXRA 2B8MA 4CAXA 3KKWA 4CAVA 2AJ6A 2QMLA 3U10A 2IXKA 4E2SA 3MZHA 1WWZA 2VBQA 3MYXA 3GKRA 2IL4A 4EV0A 1O5UA 3TNQA 1RO5A 2P6GA 1RUOA 1S3ZA 4UXAA 3F8KA 3UY5A 4EWEA 2OZGA 4JV4A 2OZUA 4O9GA 2C27A 1CGPA 4MV2A 4B5PA 1ZRRA 1IICA 3F5BA 3W91A 1J3QA 5I91A 3GY9A 4YFJA 1FI2A 3FYNA 1EY2A 2Z11A 4YGOA 1I1DA 4KVOE 3TO9A 5I0CA 1Q2YA 3UKNA 5LEKA 2PSWA 4JXQA 1GQGA 3B02A 3IWGA 3H3UA 1QXJA 4MZUA 4KZTA 4B5PB 4O9EA 1Z9UA 4H6ZA 4JVAA 4ZU7A 3ZJ0A 4Q0UA 4AQ6A 2Q04A 2XKPA 2ZKLA 3EC4A 4PK3A 2BL1A 4IEWA 4N9IA 4XFHA 3HT1A 2HQYA 4HMZA 1YFYA 3TO6A 5LRRA 3D0SA 3H7YA 3S6GA 1H1IA 1O3TA 2PAEA 5F1RA 1G6NA 4E8OA 4ZU4A 2QECA 1Q2DA 4HNYB 2PAKA 3TFYA 1ZVFA 4IEVA 3FBUA 3TNPB 3R9FA 4I01A 2HJIA 3NKTA 3ACLA 1NYWA 3HQXA 2FL4A 4QC6A 3LAGA 5FPZA 1S5KA 4OLLA 2PRBA 4UA3A 2GC1A 5DWMA 2O1QA 1FY7A 4DNCA 5J48A 3BLNA 1ZZ6A 2ET7A 5FCCA 2FQPA 2DCTA 2N7GA 3U11A 3S7IA 3LD2A 4HN0A 1RGSA 2PC1A 4META 1I12A 1YHFA 4QUSA 1M4IA 2VPVA 2IXCA 2QVSB 3TE4A 2Q30A 2XLAA 4XFCA 4AXOA 3FXTA 1MJ9A 2FSRA 2BNOA 3IIAA 4N9HA 4P9GA 2X7BA 3H1MA 4OADA 3DR8A 4X6RB 2BGCA 4QM8A 2GIVA 3WW1A 3H8UA 2I00A 5E1RA 1QSRA 3SHPA 3S7EA 4HBNA 1Q3EA 2ET1A 3LZZA 3OD0A 3N4MA 4PSXA 2VECA 4LLOA 4FD6A 4GS4A 4B5OA 5JR7B 5FLJA 3BU7A 1CAXB 1PUAA 4QM9A 4B29A 4CYDA 2PR8A 3OTFA 2JLMA 4KU7A 2HUZA 1U12A 2GC0A 4X6QB 3FZ3A 2ZW6A 1Z4EA 4IEZA 2FXFA 1CAVA 3K9UA 3TOAA 4PIYA 1Z4RA 4CS0B 4R8HA 4Q0PA 3TT2A 4CRZB 4QBJA 2C0ZA 4EWDA 5C82A 1O5LA 1ZRCA 1B6BA 1B87A 5I0SA 4AVAA 1NE9A 4UWIA 5E96A 5F46A 3SHRA 1SQHA 4I09A 4QGNA 4AG9A 1H1MA 2GAUA 4LULA 2BSWA 5H86A 3BJ8A 1YWKA 2HKXA 1LKNA 3RNSA 2FMYA 2FT0A 2Q4YA 2WPXA 5D1IA 3CEWA 1R57A 2B4BA 4E2AA 4HLTA 2GH2A 2Q44A 2GC3A 1UIKA 3I59A 4NVPA 3USSA 2WFPA 3GBFA 5K8SA 2R7HA 3H9AA 3M70A 3EXNA 4HSJA 1M1DA 1VHSA 4HNXB 4R57A 1ZREA 3S0MA 4NEXA 2F4PA 1QY4A 1I6XA 2P6EA 2J8RA 4I49A 4MHDA 2PDOA 3HT2A 5I8SA 3NVCA 4TLFA 2FIWA 2MHFA 3H1YA 4HVRA 2P0WA 4KORA 2B3VA 4ZU5A 2OA2A 2Q4VA 3L2HA 3KSCA 1UIJA 4LUAA 4IEYA 3JVNA 4KVXA 2PQ8A 3LA7A 3IDBB 3JZVA 4XF3A 1ZRDA 2REEA 5GCNA 4JTOA 4QXKA 4FT8A 2IXIA 2PFWA 3FX3A 2NMTA 1XF8A 1CAUA 1CAVB 1PM7A 1YFWA 4PIZA 3FB3A 1LR5A 3DN7A 3I7DA 3BALA 1UD1A 5KTCA 1CAWA 1RC6A 4LUKA 5KHGA 3V8IA 2ZCWA 3MPBA 3SCFA 4PV6A 3T90A 4JWPA 4KWJA 3R6SA 5KHIA 3IGRA 1OMIA 4YARA 3TCVA 2E9QA 4D7TA 2XKOA 3EO6A 3NW4A 4QGMA 1PU9A 4AB7A 5FDBA 4IF5A 4Q29A 4HN1A 3CXQA 4Y49B 3CO2A 5C88A 4I02A 4JTNA 4H6UA 4RI1A 3VWEA 4PSWA 1SFNA 3DL3A 3ROUA 3SCHA 3SXWA 4GULA 5CU1A 4MH0E 4YNIA 4EWAA 5FQ0A 4KVME 4QMAA 1MJAA 2B9UA 1UW8A 3BCWA 2ZW5A 3IWZA 3FHIB 4Q0QA 4KOSA 2D4PA 2R1IA 3ES1A 4LTAA 3WW2A 2EUIA 4K8FA 1Y7RA 4XFAA 3WW3A 5BPXA 3DNSA 2Q0AA 2XHKA 2Y0OA 4KOTA 3RYPA 1MJBA 2G0BA 2Q1ZB 1ZZBA 4JLYA 3IBMA 3OCPA 3CXPA 3DSBA 4KOVA 2XL9A 3E6CC 1M44A 4EVYA 5CADA 1P4NA 1BOBA 4CAWA 5JSPA 1NXMA 1YFXA 4U9YA 2CAVA 1O4TA 1CAWB 1QSTA 5J7MA 3H7JA 1BO4A 2H5MA 4J3GA 4MBUA 4NCZA 3ZZIA 1X8MA 3T9YA 1SQ4A 2F5IA 2XL7A 3LOIA 5JQ4A 4BHPA 2D4OA 4FD7A 5HH1A 2K5TA 4UBRA 3G8WA 2R98A 4JD6A 5KBFA 4EROA 3LA3A 4KOXA 1Q5OA 3CL1A 3R1KA 2EA7A 1LRHA 4KOWA 4IEUA 5T3NA 4I0BA 1LRZA 5KTDA 2OYZA 4KOUA 2D5HA 3SMHA 2DXQA 2Z0ZA 3GYAA 1QWRA 5FQ0B 4MX3A 1X82A 3FWEA 3D8PA 2KCWA 5FVJA 3PNAA 2B5HA 2B3UA 4WBBA 3DDDA 2CV6A 4KWKA 2G3TA 2PR1A 2B58A 5BUVA 4MGKE 5EZWA 5I8YA 4KOYA 4HVOA 5I0RA 4BYYA 5EC4A 4BIFA 2XLGA 4KLVA 3H1WA 3WW4A 4Y49C 2VZYA 2I79A 1YLEA 1S7KA 2V09A 3OWCA 4ZBGA 1ZX5A 5JSOA 1KUVA 5F47A 4II9A 4RD7A 3ELNA 5JAXA 3EO4A 1DGRA 2H6CA 1XIXA 4Z07A 2CNTA 2K0GA 4LA2A 2BYVE 1QSNA 1YVKA 1IPKA 3UKTA 2O28A 3R95A 2PAMA 4JJXA 1YFUA 3LA2A 2B5GA 1RTVA 1Y9KA 3FRMA 4J1WA 3WR7A 1UCXA 5JSRA 4MGZE 3E5QA 2ZW4A 1HW5A 3DV8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XGXA 1CP6A 1OPOA 2XOMA 4Y26A 1KJLA 1OPMA 6CPAA 1AMPA 4EZHA 1O3QA 3M3IA 3FJSA 1F31A 1JZ2A 1VAKA 4LQ6A 4XFGA 2ARAA 3AKPA 2B42B 2B7YA 5FZCA 3R9EA 2WKKA 4AI8A 4YLZA 5C5UA 3ENRA 2JG8B 1JOJA 4KBBA 2JKBA 4CRYB 4ATEA 3POJA 3A22A 3AMPA 1DP0A 1LTEA 3C26A 4LO5B 5H9SA 4M01A 2P6HA 4MY0A 3GZAA 4M3CE 4O7XA 2VZZA 3IEHA 1FOD1 5EPAA 3VBRB 3WD5A 5M0TA 1ARLA 4DINB 2R16A 4A4AA 3H8OA 2PVVA 1JUHA 1JZ7A 2WC2A 2VD7A 1HJFA 5DZEA 3PGPA 3D3SA 5FXXA 2RFHA 2WUHA 1K5MA 3D7GA 1PGW1 3EBRA 4BINA 4DUWA 1EAH1 4A95A 4FAHA 4DXZA 3R0RA 4KH9A 1QJU3 4ORFA 2IJZA 3ZDSA 2BUKA 4I0AA 4B6ZA 2ES3A 3K46A 3IMNA 1AR81 1OD3A 3HR9A 4GXHA 3D0JA 4MFKA 2VQYA 5LBBA 2VL4A 1SDDB 2YFZA 4COUA 1S1AA 4Q7AA 4XCBA 4NF1A 4N90A 1W03A 3L9JT 1DDLA 1VAVA 2QYVA 4XPDC 5C3PA 4YZ1A 4QQLA 2GU9A 2V4AA 1ND2C 4X5KA 1E5RA 4CEYC 3WC7A 1WD4A 5HI0A 2Z3MA 5FYVA 1HDUA 2H6BA 4XURA 4QPGB 1E5HA 3SKVA 3GJBA 3O0XA 4X8PA 4QXCA 4ZY1A 1WA6X 5A3TA 4QX0A 1F5FA 2ZEZA 1W9WA 3PHMA 5IVCA 5DPNA 4MG2A 4H89A 1LU2A 2BU9A 5AG4A 4HPKB 4P9IA 1ULEA 1W8WA 1JZ3A 1P8JA 3GCWA 1YNAA 4AHWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XGX A;  3OF1 A;  4IEX A;  1I5Z A;  1YX0 A;  1ZZ8 A;  2PYT A;  4HZF A;  1S7F A;  3G3S A;  4RS2 A;  3O14 A;  4KL1 A;  4M3S A;  4I2O A;  2Q7B A;  1O3Q A;  2OZH A;  2PHL A;  1FXZ A;  1UPI A;  3M3I A;  3FJS A;  4H7L A;  1FT9 A;  1RL3 A;  4XF9 A;  1O3R A;  3CLP A;  3JUW A;  3NE7 A;  1YRE A;  3MGD A;  2PHD A;  3R9G A;  2IXH A;  2QDR A;  1N71 A;  4R3K A;  2WPW A;  4UWJ A;  4FBF A;  4IER A;  1DGW A;  4XFG A;  4K30 A;  5F48 A;  5EBV A;  3H50 A;  4FAG A;  2ATR A;  4WZC A;  1IID A;  1Q2C A;  5KHK A;  4KUA A;  2EVN A;  4LX9 A;  3R9E A;  2GE3 A;  3S6F A;  5LEJ A;  1NMT A;  4FD4 A;  1ZZ9 A;  4L2N A;  3VHR A;  4XPK A;  3R96 A;  1EP0 A;  2VQA A;  5BV6 A;  1P0H A;  3RYK A;  1QXR A;  3F0A A;  2CGP A;  4MI4 A;  4UBG A;  2OB0 A;  3I54 A;  3B8G A;  3HIF A;  1IPJ A;  1XE7 A;  5HMN A;  4IEQ A;  5JPH A;  4CRY B;  3RDI A;  1WK4 A;  1KUY A;  3SXO A;  1XE8 A;  2AE6 A;  2B4D A;  3G7D A;  1X8E A;  4Q0S A;  2ZXV A;  3FIX A;  4R3L A;  2XLF A;  4L11 A;  1XEB A;  2B5G B;  3PVB B;  1DZT A;  2Q0Y A;  1OD5 A;  3C26 A;  3DR6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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