4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
4AXOA 2AE6A 4OFGA 4FD4A 2XL9A 3OCPA 2VECA 4N9HA 2CNMA 1WGPA 2VBQA 1NXMA 2PAMA 3NKTA 3CJXA 2EA7A 4B5OA 1XEBA 2BUEA 2DXQA 1KUVA 3LOIA 4AVAA 4EVYA 4IESA 3DNSA 1BO4A 2B8MA 3RNSA 3DSBA 4YYOA 2XKPA 3R95A 2Y0OA 4XFFA 1BOBA 1IB1E 2ATFA 4AG9A 1DZTA 3E0KA 4R57A 3D0JA 5IB0A 3S6FA 2K0GA 2D5HA 3KGLA 4OAEA 3S7IA 3UKTA 2Q0YA 4MBUA 4KVOE 4HLTA 4L89A 3I54A 3FFQA 2GH2A 1CAXB 5FLIA 5CNPA 5KTCA 2PQ8A 2IL4A 4I01A 4QMAA 2FSRA 4R9MA 5F47A 3L2HA 3EFAA 4KOVA 1VJ2A 3G7DA 4L8AA 2FQPA 1OMIA 4FT8A 2Z2SB 4QM9A 2BL1A 4UBRA 4HKFA 1IIDA 2IXKA 3FBUA 3FIXA 4U5YA 4XFHA 3QOPA 3EJKA 4IEVA 5HI0A 3FB3A 3S6KA 5I0CA 2D93A 1CAUB 3HQXA 5KHGA 4QUSA 3F5BA 1LRZA 1ZRDA 2IXHA 3DN7A 2R98A 4RS2A 4WZCA 5FPXA 4MUVA 2PRBA 1O3RA 2B9UA 5IX3A 1N71A 1ZZBA 5EFUA 5I8YA 2CNSA 4MJ8A 4L11A 4AVBA 4E2SA 4U9ZA 4I0BA 2Z11A 3PZJA 2XKOA 4KOWA 4HN1A 1XIXA 3TO9A 3DL3A 4KOSA 4KOYA 4E0AA 5J8FA 3D3SA 3LA2A 1X7NA 3HT1A 3SCFA 5KTAA 4QXKA 4FD5A 1YFXA 2BGCA 4PJYA 1FY7A 4KVME 4XPDB 4KU7A 3C3VA 4OADA 4XF1A 3V8IA 4HNYB 1J3RA 3FRMA 4XPDC 4LUKA 5C82A 4N9IA 4KWKA 2HQYA 3SHRA 1DZRA 2P6GA 1J1LA 1QSNA 2VZZA 1CAXA 5J3UA 3TE4A 4CAVA 1P0HA 2WPXA 3GYDA 2X7BA 5J8CA 2WFPA 3E6CC 4YGOA 1QXRA 1U12A 2FIWA 2GZWA 2IXJA 4J1XA 1I1DA 3KKWA 1Q2CA 2IXLA 2QCSB 4ZU5A 2PR1A 3BCWA 3RYRA 1M44A 4YNIA 4QVTA 1RL3A 4KVXA 4UBHA 4ZBGA 3R9GA 4LEJA 5BUVA 1IPKA 1CAUA 1ZZCA 3H1MA 3P2HA 3WW2A 2ZKLA 3TOBA 5FLJA 1WLTA 5JCTA 2BEOA 2D40A 4XFIA 1YVKA 4YSFA 2P6FA 4J3GA 2EVNA 5F46A 1YUDA 3EBRA 4EV0A 1WK4A 3FE5A 1FXZA 4MY0A 4R3LA 4LUMA 5CADA 2OZJA 4FAHA 1PUAA 1Q43A 1XF8A 3QB8A 2BYVE 4DNCA 1V0CA 2VEZA 4K8FA 3TTHA 3I7DA 4TLFA 4FD6A 5J48A 3RDIA 4QX5A 1RTVA 3KGZA 4EROA 5C6CA 1SEFA 2BNMA 1O7FA 4CS0B 4IEQA 2H6BA 5FPZA 4CAWA 4H6UA 2VXKA 2V09A 1L0CA 3JVNA 3R1KA 4DINB 2BNNA 2GAUA 3C26A 3W6XA 5BV6A 2OB0A 4QGNA 1SQ4A 4CRZB 1UIKA 4XF0A 2VQYA 3EHKA 3EO4A 2CNTA 1UIJA 2I45A 1YREA 2K5TA 4X5KA 4XEZA 4MI4A 4PSXA 3D0SA 3H4QA 1XRUA 1OD5A 1Y3TA 1FT9A 2P6EA 1M1DA 5KHHA 2PDOA 4Q0PA 2HV2A 3OTFA 4O9GA 5D1IA 4IEPA 2I79A 3TFYA 5H86A 5LRRA 3N7ZA 3PLQA 3U10A 4KLVA 2GE3A 3CEWA 4EWAA 4WVZA 1GQHA 3I59B 4ONUA 1MJAA 2PR8A 3PGPA 1Y9WA 3D2MA 2QIRA 4PIZA 3TCVA 3E5QA 3FYNA 1CX4A 5KHJA 5BXXA 1ZRRA 2O8QA 4D7TA 2GIVA 4BIFA 3DDDA 4KUBA 5HMNA 4ORFA 3WW4A 3PP9A 4AG7A 2OH1A 3OF1A 3E5XA 5FLHA 4IF5A 5I91A 2A4NA 4YARA 3EY5A 4XNHC 5F1RA 2CAVA 3BPZA 4PK2A 4Q29A 2HJIA 3QACA 2EVXA 1M4GA 4KORA 5FVJA 3GKRA 4B5PB 4HNWB 4PIYA 2NMTA 1ZZ6A 2R1IA 2QVSB 3CLPA 4MGIE 1UD1A 2B5GB 3CXQA 3K9UA 2HUZA 2VPVA 3TNQA 2FL4A 3RPQA 1FI2A 4JD6A 3R96A 4X6QB 1MJ9A 4NXYA 4F7ZA 3H7JA 1Q2DA 1SQHA 3MGDA 3KCCA 1CAVB 2B5HA 3RYPA 3OWCA 4KOUA 2K9ZA 2PAEA 2ZCWA 2E9QA 1RUOA 3E6DA 2Y0MA 3F0AA 2Q7BA 3RYOA 3SHPA 5T3NA 4EWEA 3R9EA 2IXIA 2G0BA 2Q44A 1YWKA 1KZFA 3BJ7A 4RI1A 3GY9A 1S7LA 4XPLA 4LX9A 3UKNA 2B3VA 4HN0A 3I59A 3LA7A 4R52A 4FBFA 2FE7A 2PC1A 3EXNA 3LODA 4XNHB 5H84A 3TO6A 3EQEA 1IPJA 2D4PA 3CXSA 3IGRA 3UY5A 1X8MA 3FZ3A 2ZW4A 1RO5A 1GQGA 2F4PA 3PVBB 3LWCA 1NYWA 5LEJA 1CAWB 3ELNA 2PSWA 5JSOA 1QSMA 3LAGA 4I09A 5EZWA 2GC1A 1Z4RA 4HMZA 4KWJA 2Z69A 3DR6A 3VWDA 1QSTA 3D82A 4KZTA 3BALA 3I9SA 4LULA 2QNKA 1Q2YA 3FX3A 2OU2A 2N7GA 1QY4A 3SXOA 1LB2A 1VKCA 5JR7B 1I6XA 1DGWA 1J4JA 4F8AA 2JLMA 4HZFA 2WC2A 3DKWA 4I2OA 4B5PA 3H3ZA 4ZU7A 3E5UA 1G6NA 2B5GA 4J1WA 5I0TA 4IEWA 3P2FA 1O4TA 4Q0SA 2P17A 4I49A 2XLFA 3PNAA 4Z82A 3H50A 4WBBA 4HNXB 5K8SA 1UCXA 3KMHA 1YK3A 4LUAA 2CV6A 3H1YA 4MH0E 3D8PA 2FXFA 1O5LA 5LRSA 1QSOA 1CAVA 3T9YA 2CY2A 2FMYA 3B02A 4MV2A 4I3PA 1O3SA 2ET1A 4H6ZA 2HKXA 3WW1A 4NCZA 2ZXVA 3E97A 4MGKE 1GHEA 2OZUA 2F5IA 4META 3E6BA 4IEZA 5CU1A 2B4DB 1YGHA 3JUWA 2VZYA 1IICA 3EC4A 1P4NA 2FS5A 5GCNA 4HSJA 1WA4A 1NE4A 1ZNPA 1I21A 4R8HA 1RUNA 4MGYE 3SXNA 4M85A 1CAWA 3OD0A 1YFWA 4JTOA 3IDBB 3NL1A 3M70A 4U9YA 5C88A 4B29A 4R87A 2UY8A 4QGLA 1JUHA 1ZRFA 1Y7RA 3T90A 3MPBA 1J3PA 4QBJA 4IEOA 2GC3A 2QJVA 2OYZA 1IYLA 1CGPA 3IIAA 2Q4VA 3R9FA 5CVRA 2JDDA 2PAKA 4XF9A 4MY3A 2PQQA 4NSQA 3ETQA 4JTNA 4BMHA 4MX3A 3SCHA 4JV4A 1PM7A 1Z4EA 1ZZ7A 1Q3EA 2GC2A 5EC4A 3W6SA 4LA2A 5I0RA 4MZUA 2PYTA 3NJZA 5FQ0B 2REEA 2IXCA 1TIQA 4IETA 5ISVA 3U11A 2QMLA 4BHPA 4HVRA 2OZGA 3I3GA 4UBGA 4NF1A 2ZPAA 4YFJA 5AVPA 3CF6E 4UXAA 2XLAA 4E2QA 4KUAA 1VHSA 2UYAA 4Q0VA 3D2PA 1M4DA 4QB9A 3TOAA 2ZW7A 5HH1A 1PMIA 2Q4YA 1QWRA 2PTMA 1DGRA 1EPZA 3IDCB 1Y9QA 3JZVA 1ZZ8A 2Q0AA 4O9EA 3SMHA 2XLGA 1B87A 2B4DA 2FT0A 2G3TA 4GS4A 2O1QA 4KU8A 1V70A 1I5ZA 1LR5A 2UYBA 3NSTA 3LD2A 4F0YA 4OLLA 2CGPA 3IBMA 1M4IA 2Z0ZA 1LRHA 4IUSA 4QM8A 3HT2A 3RYKA 4LLOA 1X8EA 3ACLA 1YVOA 4CRYB 3U0ZA 5IV0A 3H1WA 1MJBA 2XL7A 1S7KA 4YRDA 2B3UA 2VI7A 4E2GA 3TO7A 5E16A 1S5KA 4AVCA 1Y9KA 2MHFA 3NE7A 2J8MA 1ON0A 1NE9A 3GYAA 3NW4A 1NZCA 5JSRA 4FAGA 3S6HA 3WR7A 2OZ6A 2I00A 3ZDSA 2BEIA 2OZHA 2ET7A 1K4JA 1SFNA 4Y49B 2Q4SA 3MYXA 3SXWA 2H5MA 3FXTA 1J58A 2XHKA 2KXLA 4KLWA 4M3SA 3CO2A 3RZZA 5KHIA 3GBFA 1YLEA 2BNOA 4JVAA 1YFYA 3TNPB 2O28A 5FQ0A 4LA3A 2FIAA 1L3JA 4X6RB 1KUYA 4AQ2A 2RC4A 2QDRA 1X82A 4KOXA 1S3ZA 2ZW5A 1S7FA 4BYYA 2Z10A 3S6GA 2AJ6A 4R3KA 5KBFA 1VR3A 1OI6A 4A2UA 3BLNA 5E1RA 3R6SA 4JWPA 2B58A 4UA3A 4KWLA 1H1IA 3USSA 2R7HA 5JSPA 1O3QA 1OZPA 2EAAA 2Q1ZB 2C27A 4JJXA 2MPFA 4II9A 2PHDA 5BPXA 4EWDA 5EBVA 2ETEA 3EO6A 2B4BA 4PIXA 1O3TA 1RC6A 3H9AA 4Q0UA 4Z07A 5FCCA 2PFWA 2QECA 4XETA 2REFA 3W91A 1O5UA 3S7EA 1H1MA 1UFHA 4HSLA 2JEVA 2GANA 5JPHA 1EY2A 1YLLA 5LEKA 5BY5A 4JXQA 4HBNA 1IYKA 2DCTA 3O14A 2J8NA 4K30A 1XE4A 1RGSA 4L2NA 1CM0A 3LA3A 2MNGA 2BSWA 4XFGA 4XPKA 3FWEA 5F48A 3ST7A 4P9GA 5I93A 1QSRA 4XFCA 5JAXA 3DR8A 2H6CA 4IEXA 1J59A 4JXRA 4HVOA 5I8TA 3H8UA 4PSWA 2P0WA 4AQ6A 1KUXA 4YRHA 4NVPA 4E2AA 3ES1A 3H3UA 4IEYA 1UW8A 4PK3A 4KOTA 1NSLA 3FHIB 1VP6A 1U6MA 2Q04A 2H0VA 2ARHA 2KCWA 1J3QA 2G3AA 2EUIA 3VWEA 1XE8A 3QAHA 4MHDA 2ATRA 2IC1A 3CL1A 4XFAA 3CXPA 1MK4A 1TQ5A 4IERA 3SCGA 1ZZ9A 3MDPA 3G8WA 1ZVFA 1PU9A 3VHRA 4BH9A 1WWZA 3M3IA 4KL1A 1ZX5A 3NVCA 3B8GA 4D7SA 1ZREA 3ZJ0A 4QGMA 5FDBA 1Z9UA 1YX0A 5C8WA 2CAUA 4F6AA 4NEXA 5E96A 1XE7A 1NE6A 3BJ8A 1R57A 1EYBA 4FD7A 4MGZE 3BU7A 2UY9A 4I02A 4XF4A 2XGXA 3N4MA 1CJWA 3IWGA 2D4OA 1HW5A 2J8RA 2D5FA 5I0SA 4GULA 4CAXA 5I8SA 1B6BA 4UWIA 2GU9A 2Q30A 3UKVA 1UPIA 1OFNA 3WW3A 3IWZA 2VQAA 5KHKA 1I12A 1S7NA 3FNCA 4RD7A 4LTAA 5J7MA 1YR0A 5F49A 4QC6A 3ROUA 2OA2A 3OGJA 2R8VA 1Q5OA 3KSCA 4PV6A 2PHLA 4Y49C 1ZRCA 5KTDA 3FJSA 4H89A 4E8OA 3BB6A 1LKNA 2GC0A 2PA7A 4ZU4A 4H7LA 1S60A 5DWMA 3S0MA 4JLYA 3HIFA 5DWNA 2OPKA 3TT2A 4CYDA 3H7YA 2JDCA 1YHFA 3ES4A 4XF3A 5JQ4A 4UWJA 3G3SA 3DV8A 3ZZIA 3F8KA 1EP0A 1QXJA 2C0ZA 1RXTA 4XFBA 2WPWA 4IEUA 4AB7A 1YFUA 3LZZA 4HVQA 4I0AA 5I0UA 2FCKA 3MZHA 1XMTA 2ZW6A 1NMTA 4Q0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AE6A 1A6CA 4KSAA 2Z79A 3RI9A 3CJXA 3SLIA 5HXMA 3ISXA 1OXCA 3RNSA 5FPAA 3ZIWA 3R95A 3WX5A 4CXWA 1IB1E 4IQPA 5AG7A 3MF6A 1IOAA 1S0EA 2GH2A 1XNDA 1G9DA 1GNZA 3G7DA 3SEEA 1TNFA 2AFOA 4AI9A 3PB8X 5LA0A 4XZPA 3EJKA 4IEVA 4ISQA 1ELMP 5AFEA 1LRZA 1GWKA 3FLTA 1NY71 2R98A 2PRBA 2VJXA 4CDWB 4AVBA 2Z3LA 1KITA 3UL2A 2XKOA 2VOTA 4XBNA 1RUI1 4KOYA 4Q4Y3 4CCMA 4BZ4A 2FDFA 5A3PA 5FYTA 4OADA 3B00A 4P02B 2YNEA 1H30A 1CZVA 2VZZA 4WVMB 5J3UA 3EYPA 3U1XA 3LKJA 2FIWA 1K45A 2PR1A 4ZU5A 4DUVA 3LEKA 4XBQA 2WL1A 1JU4A 4LIUA 1IPKA 3AKSA 4Q4W3 3NNJA 2ZX0A 4X8PA 4NJ4A 1FXZA 4XJZA 2VXJA 4LUMA 2ZGKA 2VZRA 4BOWA 2JEWA 2VEZA 1AR91 1LENA 2BP6A 4Q26A 1XBUA 2VCBA 2UWAA 1UN1A 1KDMA 5HCBA 2WYSA 3MO4A 1IU8A 2CTCA 3VHOA 4GB33 2CY6A 1F4HA 1YC61 5KHHA 1HKDA 4O9GA 3VB9A 1LAMA 1W2TA 3HN1A 4MFQA 3GZUC 3O0VA 3FX6A 4DPNA 3I3MA 3H5ZA 1RMU3 2XVKA 3VHPA 4NGRA 5F1RA 3FEDA 2WS91 4UIBA 3FMGA 5CA6A 5EXOA 1QOTA 3K9UA 3BKZA 4NUBA 1UNBA 1FI2A 1XNCA 2W46A 2R7EB 2Q7BA 3L9JT 4M01A 1V6JA 2ZAHA 1ELLP 1HRV3 2C6SA 3QLQA 1FMD3 5IK5A 1OUXA 1Z8XA 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4HK8A
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AXO A;  2AE6 A;  4OFG A;  4FD4 A;  2XL9 A;  3OCP A;  2VEC A;  4N9H A;  2CNM A;  1WGP A;  2VBQ A;  1NXM A;  2PAM A;  3NKT A;  3CJX A;  2EA7 A;  4B5O A;  1XEB A;  2BUE A;  2DXQ A;  1KUV A;  3LOI A;  4AVA A;  4EVY A;  4IES A;  3DNS A;  1BO4 A;  2B8M A;  3RNS A;  3DSB A;  4YYO A;  2XKP A;  3R95 A;  2Y0O A;  4XFF A;  1BOB A;  1IB1 E;  2ATF A;  4AG9 A;  1DZT A;  3E0K A;  4R57 A;  3D0J A;  5IB0 A;  3S6F A;  2K0G A;  2D5H A;  3KGL A;  4OAE A;  3S7I A;  3UKT A;  2Q0Y A;  4MBU A;  4KVO E;  4HLT A;  4L89 A;  3I54 A;  3FFQ A;  2GH2 A;  1CAX B;  5FLI A;  5CNP A;  5KTC A;  2PQ8 A;  2IL4 A;  4I01 A;  4QMA A;  2FSR A;  4R9M A;  5F47 A;  3L2H A;  3EFA A;  4KOV A;  1VJ2 A;  3G7D A;  4L8A A;  2FQP A;  1OMI A;  4FT8 A;  2Z2S B;  4QM9 A;  2BL1 A;  4UBR A;  4HKF A;  1IID A;  2IXK A;  3FBU A;  3FIX A;  4U5Y A;  4XFH A;  3QOP A;  3EJK A;  4IEV A;  5HI0 A;  3FB3 A;  3S6K A;  5I0C A;  2D93 A;  1CAU B;  3HQX A;  5KHG A;  4QUS A;  3F5B A;  1LRZ A;  1ZRD A;  2IXH A;  3DN7 A;  2R98 A;  4RS2 A;  4WZC A;  5FPX A;  4MUV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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