4AVFA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
467
structure length
314
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title The Aeropath Project Targeting Pseudomonas Aeruginosa: Crystallographic Studies for Assessment of Potential Targets in Early-Stage Drug Discovery
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
total genus 98
structure length 314
sequence length 467
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4avfA00
1I2PA 1A53A 2PE4A 1TCDA 1ME8A 3STCA 1C29A 3SW6A 4O13A 4XBKA 3EXTA 5DXXA 1GVRA 5KTLA 1Y0EA 4POCA 1NF0A 3SY5A 3OHIA 1R2SA 3MYOA 3E0IA 5FF4A 4FHAA 4QSHA 4LNYA 1XBYA 1NEYA 3V75A 2FTPA 3W71A 1G7UA 3HMJG 2FPYA 4XUGA 2WNZA 3C4UA 5LGXA 2E5BA 3LRMA 3TQ0A 1XCFA 3FLUA 2NXHA 4XTIA 1RQEA 5LNSA 1ZAIA 1JVNA 3R5EA 5DN1A 4CCEA 1W3TA 2FIQA 3N19B 4LV4A 2VENA 4M7TA 1N7KA 1ADOA 3I65A 3NVTA 4NXSA 5DBUA 4JEQA 5LNVA 3BG5A 4QAIA 4O53A 3BW4A 4NJJA 4XKYB 2DJXA 2NX9A 4FNTA 1HTIA 1K3UA 4RZ5A 1D9EA 4FIRA 4ZMGA 2OX1A 2CLHA 4KKXA 5LHEA 2VFDA 4LVBA 3LBMA 5K3VA 1OG0A 3CTLA 1Z48A 3KAOA 4PH6A 1XM3A 3M7WA 3BO9A 4UXDA 1A5SA 4NZFA 3IVUA 4KWVA 4J9JA 3GAKA 2B0MA 4CCDA 4IJBA 3G0UA 1SO3A 2X30A 4DPPA 3GIYA 3TX9A 1WBJA 4JGDA 3G0SA 4MLJA 5CG7A 4DF0A 4JTEA 4IX2A 2ZA1A 3FJ6A 3CLMA 2WQPA 1ONRA 2YDAA 1H63A 1LYXA 3TMQA 4O18A 1VS1A 2DJLA 4LVAA 4MY1A 2QCHA 3PBVA 3W07A 1Q3NA 3QQ0A 1TYGA 1TPWA 1OX4B 2GVLA 3OIXA 4ONVA 2PRHA 5F4SA 2EKCA 1A5CA 3KXQA 3B8DA 1HL2A 3HIJA 1GYNA 3PUDA 3DKLA 3UPWA 1D3HA 1D3GA 1O94A 4GNJA 4Y8FA 4ZZ9A 1JCNA 1QPNA 3NL2A 4P2VA 2ZZ7A 2PRMA 5HUOA 2A0NA 1QMLA 5I3FA 3EWYA 1ZJIA 4FNQA 3F4WA 1NFBA 4UTWA 3FKRA 1VCFA 4N9EA 5IBXC 1DL3A 3FKKA 4S2BA 4M6PA 4EIVA 2Y88A 3STGA 5E93A 1XXXA 1G6CA 1LLWA 1UB3A 3NPXA 1TTPA 5F1VA 5J5DA 2CLIA 3L0KA 1F73A 4AF0A 1MEIA 1SW0A 1ML1A 4EF8A 2QCGA 4TO8A 4WY0A 4U4MA 2BLEA 3VE7A 4FF7A 1KFJA 3PB2A 1BWKA 2FPVA 1GWJA 5KINA 1E51A 3P82A 1W5OA 2Q3RA 3NEVA 1W5QA 4GRSA 3P8JA 4WD0A 1M7OA 4MIMA 4BI6A 4YWIA 3NQEA 3E12A 3G1XA 3DH7A 1YLVA 3P60A 2E77A 3GKFA 1JRCA 2Y7DA 4H4IA 3OEXA 4R7JA 2EGZA 3W1NA 4MZ1A 5AHIA 3L2IA 5EL1A 1VLIA 4N9CA 4HIBA 2WSQA 2OZ0A 4LS0A 3HPXA 4R53A 1JCJA 2ZYFA 1XFBA 3MP4A 4LS1A 5K9CA 1FCQA 1MXSA 1FCBA 2IQTA 5CSRA 5CPLA 1CI1A 2FFCA 2ZRZA 3T55A 1EPXA 5C55A 1KV5A 3O1NA 1TTIA 4GUGA 1S5VA 1G4SA 2DZPA 3S1WA 1SU5A 3THAA 1XBZA 4L4MA 4MUZA 3MI2A 1KFCA 2Y89A 2V5BA 1YXDA 3KVKA 5EY5A 4AMAA 3DGRA 4FNSA 1MO0A 5CZJA 1YXYA 2RFGA 2QJHA 1K7EA 1TJRA 1LORA 1L2UA 4RZ6A 2NV1A 1OVDA 4Z08A 2YR1A 5HWJA 2FQIA 3LCHA 5FEXA 1H50A 3PSVA 3E49A 3OVPA 3ABOA 4PODA 2G96A 1LOLA 2PC4A 3R2GA 3O15A 1TPUA 2DP3A 1ZFJA 4RKAA 5CZTA 2C3ZA 2PRLA 4YXGA 3DFQA 3N34A 2CLKA 2E5CA 1H7WA 4JTHA 4XQ6A 3SIZA 1NF7A 1EB3A 2CZFA 1P4CA 4UNKA 4K39A 4FNRA 4O8RA 4YL2A 4WQ6A 2A7RA 3K30A 4AHQA 1GVFA 3BVJA 2ZZ3A 4BI7A 1S5WA 2VEPA 1OX6A 1W3IA 3G1DA 1L6YA 2H3DA 1KM5A 3CIXA 4MLRA 1QAPA 1OFDA 3LI0A 3BARA 4DO4A 4GUFA 4LUJA 5D04C 4KWWA 1G4PA 2XN2A 2LLEA 1F05A 1I2OA 1SSDA 3NZ1A 1QO2A 2KZHA 3QSRA 2CFFA 1ICSA 3GDLA 4Y90A 4QISA 3TSMA 4ZVJA 4O17A 1SUXA 5BRBA 1Q6RA 4TU1A 4HPJA 4MJZA 5HR7A 1B3OA 4JY8A 2ZDRA 3L68A 4JYDA 1FQ0A 2VFHA 1IGSA 2CW6A 3W7IA 3W7RA 1PHWA 2J6XA 4OU1A 4IX0A 2RDUA 1KM4A 3NQAA 4GXMA 5HJLA 1YPIA 1YXCA 1TREA 3HG5A 4GE8A 1DKWA 2Z1BA 2EPHA 3HG3A 3LHYA 3NQFA 3PBYA 5BMXA 2B7PA 1O95A 2Y61A 5D37A 2BX7A 3VCRA 2OCZA 3N9RA 1HFBA 1TJPA 4Q4KA 3M47A 4OQVA 3C2VA 3W7JA 3LHTA 2YFNA 3DFOA 3KFTA 4NJHA 3R8RA 3S5YA 4UMCA 4LVDA 4RX0A 2XFWA 2Q8ZA 3PBWA 1QOPA 2PCQA 1SZEA 3W7DA 3QMSA 3NQ6A 3W72A 1K8ZA 3SZ8A 1GT8A 4UCGA 1KTNA 4UFMA 3UWUA 4DO6A 3PC0A 4NX5A 4Z0JA 5AFDA 3FIGA 2ATMA 1H51A 3MHGA 4NUWA 5CPNA 4PA8A 1JCXA 2HTMA 1SPQA 2BWGA 3H53A 2TYSA 1SSGA 1K7FA 4K38A 3W22A 3AJXA 2O7SA 3LHVA 3EB2A 1VYRA 4BWLA 3ATZA 3QRHA 4BI5A 5BMWA 1T0OA 1OFQA 3LI1A 4FXSA 4E2DA 4GUIA 2C6QA 4UTJA 1QPOA 4PCFA 4AXKA 5C2XA 1PCKA 3G0XA 3C6CA 5DY2A 1XUZA 2C1HA 1P1XA 3P5YA 4UFIA 4HSNA 2QDHA 1H61A 3W87A 3A5FA 3E9AA 1O5XA 3NGJA 4GUHA 5HWNA 2DZUA 3TW7A 4M6VA 3LRLA 5D02A 4Y6GA 3IGUA 2JKAA 2CLLA 5H2ZA 2CLOA 4HNNA 3ZWTA 3FYOA 2TSYA 3UY8A 3GR8A 2H3BA 3W74A 1A5AA 4FX7A 2Z6JA 3DENA 3UY7A 5LNWA 1KFLA 4WZHA 3ABRA 4DQWA 2TMDA 5F4WA 4TMCA 5CZSA 3HQ1A 3VE9A 2X1TA 5HQEA 1NAL1 1UUMA 2A7PA 2B7NA 2NX3A 3E96A 4MFDA 3QSTA 1F6PA 1T99A 3QF0A 3PS7A 1KW1A 2J27A 1H1YA 2AQWA 3A23A 1BTMA 1B57A 3TFCA 5D2TA 1MZHA 3BV4A 5FF0A 2RKXA 5CGQA 4JYFA 1VYPX 3ABQA 4QIUA 3RLUA 3RLVA 4BFAA 3LB0A 4K8EA 1H1ZA 3MI3A 2C16A 3RU6A 5FEWA 4XTDA 1FDJA 1FWSA 2FLIA 3PF3A 5K2ZA 3B06A 3HO8A 4MJMA 4N4PA 2TRSA 2UV8G 4I7WA 1TPFA 2B7OA 1OK6A 4WX2A 1IF2A 3DAQA 3JS3A 2FDSA 2ZTKA 3NNTA 2J9XA 3E02A 1RD5A 3C56A 2WV8A 3GAYA 1Q6OA 4RV8A 4K37A 4O28A 3W83A 1NVMA 4PC8A 3M5YA 3MP3A 2QCNA 5L6UA 1PL9A 3W9ZA 3KRSA 1WYIA 3G24A 3W7NA 3EKZA 3G3MA 4C1LA 1R47A 5AHFA 1KM3A 2ZZ2A 3FS2A 3S6DA 1FUYA 4NJKA 3UWYA 3TKFA 2ISVA 5K9XA 3DU0A 2VFFA 3W7GA 3P74A 3UD6A 1SW7A 3W1TA 4IXHA 2A21A 2ISSA 1Q45A 3W7QA 4HHPA 4EWND 4QM1A 1QDSA 1W56A 5F4XA 3NPWA 2H6RA 1ZENA 3IIPA 3I7QA 1PIIA 5G2WA 1SR9A 1FBAA 5CZ0A 2CWNA 1F7BA 3BK0A 3GXNA 6ALDA 2A7NA 3L21A 4A2RA 3WK3A 1OFBA 1PS9A 1CX9A 3W1MA 3KOFA 1KM6A 3NQVA 5KITA 4IQLA 3C2FA 4JX5A 2VFEA 1JUKA 2XN0A 1YDVA 1QNVA 2WJZA 4NJGA 3LLDA 1LP6A 3MHUA 4S1FA 3PG8A 1AG1O 1L6WA 3HGSA 2J9YA 4GWEA 2EAWA 4O11A 1VZWA 3C2EA 4AF0B 1JCMP 3C2OA 4I7VA 4IMEA 1V5XA 2RDWA 3QMRA 4WY0B 3O6DA 4LTSA 4O10A 3NQ7A 1TPDA 1H7RA 2VELA 1UJPA 1KTBA 3O63A 2Q8LA 3NM3A 3KVMA 3W70A 1FWTA 2A5HA 4UTTA 3TXVA 4JR5A 4UTLA 3BLIA 1VCVA 3MP5A 4UTKA 2V2DA 2JKPA 2QUVA 3FOKA 3L65A 1VQTA 1FXQA 3F4NA 3QPZA 3QMTA 5K7JA 4A21A 2Y85A 4LS2A 4FNPA 3M5VA 4Y96A 3QPYA 4FB7A 1X8FA 1ZALA 1FCVA 1THFD 5F2MA 3W2NA 1ME7A 3OVQA 5D09A 5LNUA 5AYXA 3C61A 4XZ9A 3TNOA 1WX0A 3S8HA 4A3UA 1LBLA 1IXOA 1XBXA 4MFEA 3TROA 4RK8A 4TMBA 1SFLA 3L5LA 5G5IA 5BNKA 2NZLA 4E38A 3EWZA 3GVGA 4Y9AA 5SWUA 3LM7A 1PVNA 5AHEA 4LWWA 1NSJA 3BGGA 1AMKA 4C1KA 3DKJA 3HPZA 3NYZA 5FEZA 4ZQCA 4M7SA 4NT0A 3UZ5A 2QCFA 4FNUA 4CCCA 3LHUA 4Z1AA 1YDNA 1VH7A 5LSMA 1GEQA 3NXFA 4A29A 4UIOA 2OMAA 3TU9A 1RZMA 1OF8A 1AW5A 2F84A 4L4LA 4O14A 4LRSA 3LDVA 4JN6A 3UXDA 1YADA 2Y63A 5KZEA 1WV2A 3CT7A 3ZWSA 4XBSA 2DZVA 1SO6A 3O6CA 4EF9A 3LXBA 1SFJA 1GJPA 4QNEA 2R91A 2ZQ0A 2EF9A 2YSWA 2GQAA 2JKEA 2CLFA 2ATSA 5C5YA 1H60A 3LLFA 1DJQA 3R89A 3S5OA 3G1VA 2CLMA 2ZA2A 4K6AA 4LUIA 5LNRA 2J9ZA 1ZNNA 3TSBA 3M5XA 2A6NA 4YMZA 4OT7A 3IIOA 1G7VA 3VI2A 3W1PA 3ANYA 1QCWA 2YXGA 3ATYA 4O0ZA 4AWTA 3M43A 1IIHA 2NWRA 3S5ZA 4EVZA 2GVJA 4IMCA 4JYEA 4HNUA 3LERA 1W54A 3P7YA 3TR2A 1WA3A 2ZZ1A 4PL1A 1EP2A 4H6KA 1SO5A 1EUAA 1FX6A 3DFTA 3PM6A 3NM1A 2VEKA 3TW6A 1KTCA 1DBTA 4KFOA 2NUXA 3WJWA 3NQGA 1DQWA 2R14A 3MI6A 3T78A 3UPBA 1DVJA 4UFHA 1LRQA 5FEPA 4RXFA 1KBJA 5HR6A 2X16A 4DXVA 3KVLA 1R46A 1BKSA 2Y6ZA 4OV9A 3SGZA 3DI0A 1KBIA 2J24A 4NVTA 5CPOA 3LOTA 4UTWC 3PUEA 3M41A 5MHBA 3IIZA 2R94A 2YYTA 4JDYA 4CQ8A 4LV9A 2GJLA 3UYCA 4HNVA 2QAFA 5HULA 3HGJA 3TFXA 5G1YA 1W5NA 4AEOA 3EX3A 1XDLA 3A21A 5CPMA 4E0CA 4JICA 4JIPA 4MKNA 2Q3OA 1H62A 1QO5A 2HMCA 4NQ1A 1TV5A 3B4UA 3A9IA 2ZRUA 4H3DA 3U2OA 2QR6A 4O1AA 3F1QA 3L5MA 1C9DA 5D03A 3C8FA 3ABSA 1JUEA 1LBFA 1N55A 3BG3A 1KFKA 3LGEA 5I3JA 4LT9A 5DBTA 3TH6A 1YTDA 3L0NA 3NQ8A 4MZ8A 4ZQOA 3T7VA 1EEPA 3W2MA 3PB0A 2YW3A 4MZYA 3UQNA 1KM2A 4D2JA 5HNRA 2HS8A 3HG2A 2D73A 4AAJA 1VRDA 4R33A 3W1UA 1EIXA 3P81A 1P5BA 1PE1A 2NXIA 1JR1A 3O05A 4TIMA 3GR7A 2ALDA 1JCLA 3DFNA 5HMSA 1DORA 3G22A 3TC7A 4HPXA 5DCEA 3M6YA 2Z0IA 1L6SA 4UC5A 2JK2A 2QF7A 1KM1A 1TPB1 2RH9A 1W37A 2ZZ5A 2GUUA 4FO4A 4WOZA 3TAKA 1PCWA 1S3HA 3LRKA 3UWWA 2H8XA 4ORMA 2B7QA 3PAJA 3GDTA 1DQXA 1WXJA 4N02A 4BR1A 3W3OA 4JTJA 3QEZA 1SQ7A 3S9YA 3TIMA 4Q32A 1LOSA 4WXZA 1OFRA 2BTMA 3W2LA 4O19A 4ZQNA 2V8ZA 5TBOA 3BW2A 3ZFHA 4Z1DA 3G8EA 3SI9A 5FESA 3N9SA 3GKAA 3QFEA 2QCLA 1LTDA 3DZ1A 5DY3A 1AW1A 4OE7A 3T4CA 3CEUA 3LV6A 3WJSA 1QOQA 1JULA 1HUVA 3P62A 1TRIA 3NR0A 2E5DA 3FA5A 4DPQA 3UZJA 4RZ4A 3M1ZA 5I3KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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