4AZ5A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
434
structure length
434
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 172
structure length 434
sequence length 434
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az5A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az5A01
2AAAA 1JFHA 1SMDA 1KCKA 2X09A 1CGTA 1UH4A 1E0XA 4ZXOA 1HJVA 8CGTA 2PF0A 2WLYA 3A47A 1E72M 3DYPA 4ZEPA 4PMRA 3SUSA 1OGSA 4P7QA 1UR4A 5E6ZA 1R86A 1BYBA 3WH5A 4PUDA 1BF2A 4M29A 4HA4A 4YHEA 4PMQA 1WZAA 3OZOA 4GI6A 4PCTA 1G5AA 1WB0A 1UWRA 5HPOA 4B16A 3ARUA 3DHPA 3PZOA 1KR1A 2VX7A 1CGXA 4RL3A 2WBKA 1S46A 1QNRA 3MUIA 4H04A 5D4YA 5EMYA 2WYSA 1JZ5A 1U33A 1WZKA 2VRQA 4PYSA 1E3XA 1V6UA 2PMRA 2VCBA 3AZRA 2XVNA 5I2UA 2BY1A 1F4AA 1MW2A 5KZ6A 2ZWZA 1J10A 3FAXA 4X9YA 4WKAA 3W24A 4YHGA 1WZMA 2O9OA 3BSHA 2QPSA 1KQYA 1TG7A 2FH8A 1G1YA 1I1WA 1X1NA 2DH3A 1KCLA 2GK1A 3W38A 4UR9A 1TFVA 5C71A 1PX4A 2GFTA 3IK2A 5CGTA 2FGZA 2E8YA 3MV11 5HNNA 1BFNA 3TA9A 3WQ8A 4MJ2A 2J7EA 1NWSA 3AS1A 3WFLA 4JL2A 2WZHA 3O6AA 4TX8A 5FCZA 4Q7NA 3MUZ1 2E4TA 3CZLA 3LPFA 1E0WA 1OGBA 2ZXBA 2VTFA 1XC6A 1E1EA 3VO0A 2J7HA 2VMFA 4C7GA 1ISXA 2UY5A 1QPKA 2V3FA 4DUVA 4MADA 4CCDA 3OB8A 3W26A 5GQBA 3ARQA 3NYDA 5E6YA 2E8ZA 5E9AA 1PAMA 1GNXA 2WMKA 1UR2A 5EFFA 1SYTA 3VGDA 2YL9A 5M3WA 2J78A 4QLJA 3OBAA 1LF1A 1QOXA 1UH2A 1RH9A 3IAQA 5AYIA 3WY1A 5A8MA 4W85A 3T08A 1H0IA 2W62A 1YQ2A 1UWQA 5I5RA 4CVUA 4UZSA 4MDOA 1UD6A 4U3CA 1L8NA 3ARTA 3BCFA 4D71A 3WNNA 2VCCA 5JIWA 1I75A 4P7LA 3WUGA 1GQIA 4PTMA 5E09A 3WD3A 1CXHA 1E4LA 4KRTA 3WH9A 1J18A 4FLQA 2W92A 3WEZA 5CLTA 4E8CA 2VUYA 3AS2A 3EDKA 4PUEA 2DGAA 1JDCA 3CUHA 4E4PA 3AISA 3T2PA 4OIFA 5A6LA 1E1FA 4UOJA 1JI2A 3WF0A 3MS8A 1TMQA 1UH3A 2EQDA 2WWCA 4Z2KA 4FZOA 1BGGA 5FL1A 3KL5A 2Y5EA 2XUCA 1VJZA 1PPIA 3M7SA 4GIAA 3WN6A 2A3BA 4AZ7A 4E2OA 4GXPA 4BQ4A 2V3EA 3WNKA 1HJWA 4JL1A 4Z2IA 3QGVA 3WDJA 1WKYA 5F7UA 1QHPA 3AMCA 2DEPA 2HVMA 1UA3A 2WLZA 1TVNA 4DUWA 2PWEA 4AISA 4JCMA 3LPGA 1ISVA 4XZWA 3PTKA 3WDRA 4BCEA 4HZ8A 3L4XA 4AIEA 1H1NA 1GW1A 3S2CA 1UKOA 3F4VA 2X2YA 1K9TA 1JZ3A 8A3HA 3U57A 4OBSA 5C8BB 4PMXA 1B3XA 4M80A 2PWHA 2GDUA 2VZUA 4J3VA 3EMCA 3WMSA 1G0CA 3G6MA 2TAAA 1XYFA 2WVTA 3A6OA 4RE3A 1JZ2A 3BAWA 4W84A 1B2YA 1FFRA 1MXGA 2J8FA 3AYSA 4HZ7A 5DFAA 5GNYA 3OG2A 2DSKA 4CD4A 2JEQA 3OGVA 3ZMRA 1E73M 1M03A 1HVQA 1BG4A 4MAZA 2G3JA 4UQ9A 1D7FA 4GI9A 4H8HA 1W32A 2EJ1A 3CZEA 3CUFA 1UR1A 1VFMA 4BQ2A 1XSKA 3UCQA 4XUYA 4CCEA 5GNXA 2G41A 1BYDA 3NDYA 1E71M 2E3ZA 4JFUA 5D8ZA 2IUZA 2Y8VA 4B15A 2VVSA 5ABEA 3VINA 1E70M 1V0MA 3PTQA 3ZJ8A 2FGLA 1J11A 4H7VA 4W5UA 2BFGA 5CXPA 4YPJA 2YLLA 3U7VA 1WDPA 1ZS2A 1GOQA 2Y8KA 5A94A 4AZCA 2DDXA 2WMFA 4AD4A 1KXHA 3MMUA 2W5FA 1WAWA 1GVYA 3ZJ7A 1JD7A 3GYCA 1B1YA 1HJXA 1ZJAA 4BS0A 4F66A 3SIMA 1UWUA 4QLLA 3OLDA 4C7DA 2CBJA 3AIVA 3GTNA 4HZ6A 4XV0A 3WD4A 1EIBA 1MFVA 2WSPA 3PZUA 1H5VA 1LL6A 1KBKA 2BY2A 4OOUA 1WDRA 1SFSA 3J7HA 2J7CA 1Q6EA 3JUGA 4AWEA 4WKHA 5CG0A 2D23A 3FY1A 3N9KA 2UY2A 1H2JA 1W3JA 6CGTA 3WH8A 4W87A 4MAVA 1W9UA 1VENA 5A6SA 2ZXQA 1XD0A 2J74A 2VL4A 2DT1A 3CIVA 1YHTA 4W8AA 3SCVA 3AICA 4JFSA 1UQZA 3RO8A 1VEOA 2BXYA 4YN5A 3AXHA 2OWXA 2Y2WA 1KWGA 3AJ7A 2Z1SA 4HA3A 4LQ1A 4WF7A 1CGYA 1TVPA 1EOKA 1GJUA 3W53A 4CU8A 1V3JA 4OUEA 4EANA 3NCOA 2AOSA 1B31A 1NARA 1R7OA 1CENA 4LYPA 4Z2LA 5HBFA 3RM4A 1GOKA 2ZX8A 4PSRA 1V3LA 5I23A 3GDBA 3ALFA 2DH2A 3HJEA 3RDKA 3VIJA 2V3DA 4U5IA 3W4RA 2VO5A 5BCAA 1GCYA 4P7RA 2GVYA 4FLRA 5TD4A 1B3ZA 4TUFA 3GNPA 3VDAA 4TXEA 2CHNA 3GH7A 1AQHA 3WNMA 2WMIB 2WPGA 1UUQA 1FOBA 2XSAA 5E0FA 7TAAA 4BA0A 2Q8XA 3K46A 3W25A 3VD4A 1W9PA 5CSUA 4JCLA 2OLHA 4W7VA 3CPUA 1C8YA 3IAPA 3HU7A 3OGSA 4FLOA 3WDHA 3I3BA 1OSEA 2JNKA 4W8LA 2BY0A 1HX0A 2XWDA 4AEFA 2D0FA 3CGTA 1H41A 2YOCA 5M17A 3PZNA 4IPNB 3FHQA 4HU8A 3RILA 1H0GA 5D8WA 3SCQA 3S6TA 3GXIA 1R87A 3W81A 3BXWA 5AC4A 3VDCA 4CD5A 4DM2A 2WHLA 1CECA 1QVBA 4ATLA 1ODUA 1P6WA 3W82A 1C7SA 3GXFA 1HT6A 3WQ5A 1UQYA 2EXOA 1E6PA 1OM0A 4XB3A 5A8QA 1AQ0A 1H3GA 4LXFA 1LL4A 2WHKA 3D5HA 5CPTA 2ZXDA 4DWSB 4M81A 1UKPA 3FAWA 1JYXA 4JKKA 4TTUA 2CIPA 5GNZA 1ISZA 2XVLA 4OZOA 3NJ3A 1BAGA 1PZ2A 1Q6GA 2E0PA 5C70A 1JYWA 4Y7EA 3U5YA 4AZCB 3II1A 4D1JA 2X0YA 2ZE0A 3SCPA 1QBBA 3I3DA 4PMNA 2CERA 4M24A 4MB3A 4AD0A 1K9DA 4JZ5A 1J0YA 3ECQA 4S3JA 5E70A 1PBGA 1RD6A 2A3HA 1HKKA 4BF7A 1QI2A 1MYRA 4FK9A 2BHUA 1Q6FA 2DPEA 2DSWA 3ZT7A 4CU6A 3SUVA 4NZCA 4J3WA 4H41A 1E6SM 4LYQA 2HISA 2PWFA 1UHVA 2FDMA 4WK9A 3CHDA 2J8GA 3GH4A 1VBRA 3MU7A 4J3SA 1AMYA 2DSZA 2ZUSA 3AOFA 3VM5A 5CJ5A 3EDEA 2MANA 3O9NA 2ZOXA 1IZJA 2D3NA 3M6DA 1ISYA 1JZ7A 1W9VA 3WD0A 4B3LA 3AIBA 1DWGM 4LYRA 1W3KA 2YBUA 4KGLA 1NOFA 1F4HA 4U2YA 4GO8A 4PCSA 3VGBA 1XSJA 1A3HA 1TR1A 1QI5A 4MTVA 2XFRA 3CUGA 3TTSA 3PZQA 4ACZA 2BHYA 2YIHA 2VURA 4GQRA 3BMWA 2O92A 1ZBCA 5HPCA 1QNQA 1X6LA 4PSPA 2PWDA 2QHAA 1PIFA 1EHNA 1HIZA 3L2MA 1OGGA 2PI6A 2OSYA 4NF7A 4AZ6A 3MMDA 4TVDA 1JD9A 1OWQA 4L4PA 1ECEA 2CXGA 1J12A 3PZIA 1MFUA 2CBVA 1WNOA 3OLIA 1R7AA 2E9BA 3VD9A 2VQUA 3IJ7A 4IM4A 4F9JA 2WK2A 3CZKA 3MO4A 3EBVA 2CPUA 1W2PA 3AS3A 4W7UA 3W0KA 1GQJA 1V6YA 4LGXA 2J7BA 1RP8A 1FH9A 1M53A 5CPSA 5DT5A 1XH1A 4J28A 1V6WA 1ZJBA 2O9RA 5ABHA 2CETA 3UEQA 3WDIA 1E6ZA 1WE5A 4MB1A 3QHOA 4LPCA 3VU2A 4ZE5A 3GM8A 5A69A 1MW3A 3K8KA 1B9ZA 4H8UA 3UESA 3WF4A 9CGTA 4U5KA 1EA9C 1TCMA 3L4ZA 2VZVA 1DTUA 1IT0A 1J0JA 1W9XA 2ZWYA 1C92A 4U3AA 2WHMA 2VX6A 4UCFA 2UY4A 3NSXA 4U2ZA 3WQ4A 4AD5A 4FZPA 1J0IA 2ZX5A 1EDGA 2OYLA 2Z1KA 1QNOA 1CPUA 4X0NA 3SCTA 1UWIA 1V08A 3VIIA 3N17A 3THDA 2YL8A 4FF5A 1US2A 2J7DA 3K4DA 1HKJA 3B9EA 3PTMA 2X05A 2D24A 4MNJA 1WDQA 4OOZA 2BS9A 4ZXLA 2CYGA 4EE9A 3KL3A 3NSMA 3LPPA 1WCGA 1BYCA 1E9LA 1J01A 1CGWA 2GJXA 2VNCA 3K4AA 1JNDA 1G94A 2XHYA 3CZGA 4W8BA 1XHGA 4U31A 1LG1A 2FHCA 2ZUVA 1H11A 3QOMA 1DWJM 4M82A 3DC0A 3AROA 3ZM8A 4ZENA 2E40A 1LWJA 2JEPA 1FFQA 1NWUA 4Z2JA 2GUYA 1VJSA 4S3KA 4W89A 3TOPA 1NQ6A 1GONA 1TZ7A 1E6XM 3EDJA 3MUY1 2A3EA 4NSBA 1ZBWA 2A3AA 4EK7A 1FA2A 1GQLA 2XGBA 2XVKA 4CU7A 5CZKA 2ZX7A 1BVNP 2WC3A 2CHOA 1UR0A 2EPNA 4MNLA 3UG5A 2DT2A 1V6VA 4J27A 3W27A 4JHOA 1HVXA 1LG2A 3OA5A 1EDTA 1FP8A 3WEOA 4HP5A 3OGRA 4L4OA 1E6NA 1UWTA 1KFWA 4P8UA 1MW0A 4UTFA 3MMWA 1KXTA 3RJXA 2ZUUA 3TTQA 3OIHA 1ZU8A 1V0KA 3GNRA 1WDSA 3E1F1 3WH6A 3WF2A 1JXKA 3DECA 3WELA 4ACZB 4D6DA 1XYZA 3N18A 1BPLB 2WVVA 1ODZA 4P7OA 3TTYA 3WL1A 4GPNA 3QHMA 4OBRA 2C8NA 1G01A 1VRXA 3VOCA 2BVDA 2D1ZA 4TTGA 3PZ9A 2XVGA 1KGUA 4ACYA 1ITCA 2UWFA 1FHLA 1OIMA 3L4TA 1CWYA 1V02A 2XSBA 3SEPA 1NM9A 4EAMA 1D2KA 3F5JA 3WEMA 5HXMA 4UQAA 5LYRA 3OLGA 1JZ8A 2ZUTA 1C90A 1VEPA 3PZGA 4J3XA 2VT0A 2XJ7A 4JKMA 1JYVA 3BLKA 5A1AA 4P8XA 2GK1B 4QLKA 2XIBA 3VNYA 3BLPX 5JIPA 3WBAA 1QNSA 1UKTA 1X6NA 2PBGA 4Z2GA 1H09A 2WZIA 2WBGA 2EPMX 5BXRA 3ZSTA 1EXPA 3CTTA 2Y24A 5ABFA 4URIA 5A6MA 3PZVA 3N11A 1UD8A 3DHUA 3UETA 4PMZA 1UZ1A 3GXMA 4MB5A 4AIUA 1I1XA 1G9HA 1GHRA 3EMZA 4UFJA 4PMUA 4PMOA 2X1IA 3WKZA 3K8MA 1ZBKA 4HMDA 1TUXA 1TA3A 3FW6A 7A3HA 4TOQA 2YJQA 4Q22A 3AHTA 4AEEA 2CBIA 4JFTA 4ATWA 1JDDA 3RMEA 2D2OA 4HOZA 1MQRA 3WBEA 2YLAA 3N12A 1BQCA 3ARXA 2JFEX 2D22A 2VZSA 3VX1A 1W3HA 4D1IA 2XTKA 4AY1A 1B3WA 1O7AA 1QI3A 2QMKA 3PBGA 1GORA 4UQCA 3A4XA 4M8UA 4QCEA 2GJXB 2NSXA 4MNKA 2JF7A 1HKIA 3VUPA 4K68A 2V5CA 4H2CA 3VIOA 1WZLA 2J7GA 2OO2A 2BXZA 3VMPA 1OT2A 3PN8A 5FOOA 1JL8A 2E9MA 3MSGA 5A6BA 1W9BM 1L0PA 1W9DM 3WSUA 1C8QA 3SUTA 1VEMA 3WUBA 3GZAA 2GDVA 1C91A 1H4PA 3AZSA 1EOMA 2WHJA 3CUJA 4HOWA 1C3FA 4W93A 4MJ4A 4W7WA 1Y7VA 4WKFA 2CCRA 2QF8A 4P8VA 1QI0A 5M03A 2OWWA 2NW0A 1Q6DA 3B9AA 4UQBA 4P7NA 1M7XA 4FLSA 4UOZA 2WC7A 2YA2A 3SURA 3MSDA 1CDGA 1EH9A 2W63A 1CXEA 1BTCA 3QHNA 3W37A 2WANA 1JF5A 1PEZA 4MB4A 2O9TA 2VX5A 3MKKA 2WVVB 5FKYA 3SCSA 1MW1A 1J0KA 1B90A 1UZ4A 2XFYA 3ZJKA 1OBAA 3EDFA 3OZPA 3VPLA 4AXNA 2J47A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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