The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
b'GPGPEDWLSLLLKLEKNSVPLSDALLNKLIGRYSQAIEALPPDKYGQNESFARIQVRFAELKAIQEPDDARDYFQMARANCKKFAFVHISFAQFELSQGNVKKSKQLLQKAVERGAVPLEMLEIALRNLNLQKKQLLSEEE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
DUAL SPECIFICITY PROTEIN KINASE TTK
|
| publication title |
A Tpr Domain-Containing N-Terminal Module of Mps1 is Required for its Kinetochore Localization by Aurora B.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature |
ec
2.7.12.1: Dual-specificity kinase. |
| pdb deposition date | 2012-08-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5G04 J; 4YND A; 3CKB A; 3Q5M A; 3FP3 A; 3GZ2 A; 4RG9 A; 4XI9 A; 3QWP A; 5G04 C; 3LY9 A; 3GYZ A; 3SF4 A; 1FCH A; 1Y8M A; 3LY7 A; 2UY1 A; 3ULQ A; 4KBQ A; 1ZBP A; 4BTA A; 1B89 A; 1ELW A; 3ZHE B; 4G2V A; 4I17 A; 5LCW J; 4AY6 A; 4N3A A; 3ASG A; 1NZN A; 1KLX A; 5D0Q D; 5KJK A; 3QOU A; 2Y4U A; 5LCW C; 4H7Y A; 2YQ8 A; 3WXX A; 2LSV A; 3EDT B; 3VTY A; 4N3C A; 3MA5 A; 3U4T A; 3UQ3 A; 4I9C A; 3RU0 A; 3OXG A; 3Q15 A; 4W9R A; 3S7B A; 1TJC A; 2XGS A; 1HXI A; 2UY1 B; 2JLB A; 4WND A; 4IN3 B; 4YVO A; 4GYW A; 4I2Z A; 3BEE A; 5KJN A; 3O48 A; 3KS2 A; 4CGV A; 1A17 A; 5KJL A; 3N71 A; 2VSY A; 2DBA A; 3CV0 A; 5EX0 A; 2HYZ A; 4N2S A; 4U04 A; 5CHE E; 4NRH B; 2KAT A; 3SZ7 A; 4EQF A; 4UQY A; 3JYS A; 5G05 J; 4I2W A; 4U0S A; 4GZ6 A; 3RO3 A; 4YVQ C; 2VGY A; 4APO A; 4HOS A; 3K9I A; 5D0O D; 5JJT A; 5JJ6 A; 1QQE A; 2YHC A; 5G05 C; 4H7X A; 2BUG A; 2PQR A; 4A1S A; 3U3W A; 3LY8 A; 4G25 A; 2V5F A; 4GCN A; 2OOE A; 3OXL A; 3CKC A; 2VGX B; 2Y4T A; 4GZ3 A; 4BT9 A; 4GA1 A; 3Q47 B; 4BWR A; 2C2L A; 2IFU A; 1HH8 A; 5KJM A; 1WAO 1; 2PZI A; 4NQ0 A; 4O6F A; 2Q7F A; 1ZU2 A; 3E4B A; 4GYY A; 4GYO A; 2NC9 A; 3RIB A; 2E2E A; 4F3V A; 2OND A; 3URZ A; 4WNF A; 2FI7 A; 4ABN A; 2IF4 A; 4GCO A; 2AVP A; 3QWW A; 3CVP A; 2WQH A; 4N3B A; 1ELR A; 3HYM B; 4UQZ A; 5FJY A; 2VQ2 A; 4J8D A; 5EX3 A; 3AS4 A; 4UQX A; 4I9E A; 3CVL A; 2LSU A; 3MEK A; 1PC2 A; 3ZPJ A; 4Y6C A; 5FZS A; 3GZ1 A; 3LKU A; 3TGO A; 4WNE A; 4JA7 A; 5ARF A; 4N39 A; 4G1T A; 3CK9 A; 5M72 A; 4GPK A; 3MKR A; 5A6C A; 2FO7 A; 2XCC A; 3CK7 A; 3LPZ A; 1YA0 A; 1IYG A; 4KYO B; 2KC7 A; 4HOQ A; 4U07 A; 3LYA A; 3ASH A; 3ESK A; 4JL0 A; 3RKV A; 2J9Q A; 3ASF A; 3ZFW A; 2C0M A; 2PQN A; 5BNW A; 4N2Q A; 4CDR A; 5FTP A; 2FEZ A; 3OXF A; 5EKQ D; 2GW1 A; 4I1A A; 4WUY A; 4G26 A; 2R5S A; 3QWV A; 1QZ2 A; 3AS8 A; 3LCA A; 3ZGQ A; 4HOT A; 3AS5 A; 4UI9 K; 2KCV A; 4Y6W A; 3UUX A; 3MV2 B; 5CCM A; 2XPI A; 3RJV A; 4J8F A; 3PE3 A; 2XEV A; 5ARG A; 4LEU A; 4JA9 A; 2FBN A; 3TG4 A; 2QFC A; 3Q49 B; 5C1D A; 5DBK A; 4XIF A; 4U0U A; 3MV3 B; 4BT8 A; 5HI7 A; 1NA0 A; 4BTB A; 4KXK B; 2VSN A; 1W3B A; 1HZ4 A; 3CK8 A; 3R9A B; 3KAE A; 2P58 C; 4AIF A; 5FT9 A; 4XI0 A; 5AYW D; 3ZN3 A; 4J8E A; 2XCB A; 3FFL A; 4RG6 A; 4GA2 A; 2UWJ G; 5BW8 C; 1P5Q A; 5DIZ A; 3S7J A; 4UI9 J; 4JHR A; 3CEQ A; 3NF1 A; 2I6H A; 3FWV A; 3TAX A; 4U0Z A; 1KT0 A; 4WNG A; 1NA3 A; 4UI9 C; 3S7F A; 5A7D B; 2XGM A; 4GZ5 A; 2KCL A; 3GW4 A; 3RO2 A; 5FZQ A; 3CVN A; 4G23 A; 4GA0 A; 3ASD A; 5CCL A; 4HOR A; 2VGX A; 1KT1 A; 1XNF A; 3TG5 A; 2FF4 A; 3S7D A; 2XGO A; 3UPV A; 3Q4A B; 3PE4 A; 2VYI A; 2L6J A; 4B94 A; 1WM5 A; 5HQ8 A; 4N5C A; 4J0U A; 2PL2 A; 3ZHE A; 3KD7 A; 2HO1 A; 2LNI A; 1OUV A; 4AM9 A; 3QDN A; 4ME2 A; 4AY5 A; 2KCK A; 3IEG A; 3VTX A; 3PDN A; 5BT1 A; 1IHG A; 2C0L A; 5JJ7 A; 1E96 B; 3QKY A; 2MHK A; 3CVQ A; 4HOU A; 5FZR A; 4CGW A; 2WPV A; 4G24 A; 2HR2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JWF A; 1JCS A; 3Q5M A; 1TN7 A; 4RG9 A; 3L08 A; 4ANX A; 4DI4 A; 2GRP B; 1YCS B; 2CG3 A; 4ZHB A; 5AAO A; 4BET A; 4XEI G; 3DWL G; 2H6F A; 1O5M A; 3SD5 A; 3IKO B; 3ZW3 A; 3L17 A; 5LCW J; 3Q9N C; 3CHR A; 3UXG A; 2KZT A; 1H0A A; 3VLF A; 3ASG A; 3FTU A; 1KLX A; 2XPY A; 3TWV A; 4KVO A; 1DVP A; 1ELK A; 4ILI A; 2YQ8 A; 1BLX B; 2ZGD A; 3APC A; 3WXX A; 1EF1 C; 2LSV A; 2GRL A; 4J8S A; 5AJL A; 3S7B A; 4DUI A; 4URK A; 1H6P A; 5KNG A; 1TJC A; 3L6A A; 1RW2 A; 3HVE A; 3J5P A; 4WND A; 1Y6I A; 4P29 A; 2EIL E; 4YVO A; 1DC2 A; 4FHK A; 3AG2 E; 2IY0 C; 4HI8 A; 2VGE A; 3AG3 E; 3CVU A; 4RSY A; 2VSY A; 4IUL A; 5EX0 A; 4U04 A; 3W9G A; 1E8Y A; 2F8X K; 1UN9 A; 3DSX A; 3SZ7 A; 1N9A A; 4DX6 D; 2DCP A; 1HX8 A; 3TL5 A; 3D9P A; 4EZL A; 3CST A; 5ENS D; 4WWN A; 3RO3 A; 5ENR D; 4YVQ C; 3FTX A; 5J90 A; 4U63 A; 1OT8 A; 4U7E B; 1OWL A; 4E6H A; 1H2U A; 3U3W A; 2KBX A; 4G25 A; 3FUJ A; 1A5E A; 3UM1 A; 1YMP A; 1FVH A; 4BT9 A; 3G2U A; 3Q47 B; 2ILR A; 5EYP F; 2IFU A; 1OY3 D; 1HH8 A; 3ZXP A; 4MS6 A; 4IRU A; 5FIN A; 4KMO A; 4F7A A; 4GYO A; 4JHK A; 4AJW A; 2E2E A; 2NYJ A; 4F3V A; 5CBO A; 2OND A; 2RKK A; 4XX5 A; 4BSX A; 4LG6 A; 2DYS E; 3ABM E; 4WNF A; 3HXF A; 2AVP A; 3EHR A; 5AEN A; 3FUL A; 3CVP A; 2B6C A; 4B0Z A; 2WMO A; 3HYM B; 2XEH A; 2LAI A; 4C0E A; 4JPS A; 3FU3 A; 5AQ7 A; 2F8Y A; 2VQ2 A; 4YDW A; 3TWW A; 3PEU B; 2ETB A; 1NL4 A; 4I9E A; 1HU3 A; 3MEK A; 4ANW A; 2DIW A; 4Y6C A; 1SZA A; 2J09 A; 5KWD A; 3QJZ A; 3ONL A; 3E37 A; 1HS6 A; 4UWF A; 5ARF A; 4I6E A; 3LDZ A; 4G1T A; 1Q2Z A; 2DZN A; 2FO7 A; 4G11 A; 3FUI A; 1E7U A; 2YIN A; 2CG2 A; 3NB2 A; 3CVX A; 4HNA D; 4JL0 A; 4ACL A; 2I1J A; 1UJK A; 3GZS A; 5BNW A; 1OWN A; 2L9B A; 4R7L A; 4G8K A; 4CDR A; 1TEZ A; 3D9M A; 4TXP A; 2XS1 A; 2GW1 A; 1U3C A; 1SW6 A; 4WUY A; 4DX1 A; 2R5S A; 3QWV A; 4DLQ A; 3BU8 A; 3AS8 A; 3B13 A; 3CGH A; 3LCA A; 3ZGQ A; 3S2A A; 3AS5 A; 1DNP A; 3D9N A; 4Y6W A; 2EIN E; 4FU3 A; 2YHE A; 1N54 A; 3HXD A; 3MV2 B; 4X8Q A; 2XPI A; 3RJV A; 2WXJ A; 3PE3 A; 4O1O A; 3DBS A; 2A5U A; 2FUL A; 1K8K G; 3L16 A; 1MYO A; 3TG4 A; 3SQV A; 2EIM E; 3QC1 A; 4MLP A; 4HRL A; 4JC8 A; 2P9U G; 1UN8 A; 2LUH A; 4KVM A; 4U0U A; 4ATZ D; 4BT8 A; 5HI7 A; 3LXU X; 5BXU A; 4KXK B; 2VSN A; 2JAB A; 2NSZ A; 2R03 A; 2J08 A; 4GML A; 5FT9 A; 4XI0 A; 4HRN A; 2XCB A; 4BES A; 4LER A; 3D9L A; 3ZNG A; 5E76 A; 5AQB A; 1BPO A; 1HG2 A; 1BU9 A; 5C2Y A; 3CEQ A; 3B7B A; 2I2O A; 3FWV A; 3U64 A; 4B89 A; 2J07 A; 4WNG A; 1NA3 A; 5T8I A; 3S7F A; 5A7D B; 3R7Q A; 3IHV A; 3ZUV B; 4GZ5 A; 2WXR A; 3GW4 A; 5FZQ A; 4C0M A; 3EJN A; 3ASD A; 4GMR A; 5CCL A; 3F6Q A; 2EIK E; 1KT1 A; 1XNF A; 3TG5 A; 4B93 B; 4YDY A; 2XGO A; 3Q4A B; 3TWU A; 2WM9 A; 2VYI A; 3DXK G; 1WM5 A; 3Q9U C; 3U9W A; 5G2N A; 3LS8 A; 1X81 A; 3TWQ A; 3ZHE A; 3SHF A; 1HO8 A; 2XS8 A; 3VTX A; 3AU4 A; 4TXQ A; 2P9K G; 4PDX A; 5BT1 A; 3QKY A; 2WXG A; 2R59 A; 5FZR A; 2I1K A; 4AV7 A; 4CGW A; 2WPV A; 4G24 A; 5CMW A; 5FQ7 A; 2WXO A; 1E7V A; 1E8Z A; 2J49 A; 5G04 C; 3GYZ A; 3SF4 A; 1FCH A; 1Y8M A; 1U2V G; 1OWO A; 4KBQ A; 2J8S D; 1ZBP A; 4GZD A; 3RRU A; 1OWM A; 4F53 A; 3D9K A; 3PH0 C; 5CMY A; 2X38 A; 2M63 A; 1ELW A; 2LXM A; 3JXJ A; 1S64 A; 3UIP C; 4I1O B; 1O1R A; 3HDX A; 4OVU A; 3DSS A; 3ZRH A; 1KZP A; 1NZN A; 5T4Y A; 3QOU A; 3ML8 A; 3PNT B; 3C98 A; 4PS8 A; 2QYJ A; 3PZD A; 3UKU G; 4UWG A; 3LVR E; 3EDT B; 3IV0 A; 4CYM D; 3B7T A; 4N3C A; 1HFA A; 4K5B A; 3UQ3 A; 2ETA A; 4W9R A; 2MOW A; 4A3V A; 2KXP C; 3Q7A A; 3SFZ A; 4PH4 B; 4I43 A; 3DRA A; 2XGS A; 2UY1 B; 5KBA A; 2PM6 A; 3FTZ A; 4IN3 B; 3FH8 A; 2IO2 C; 3ASN E; 3BEE A; 2X6I A; 1N4R A; 3EU9 A; 1A17 A; 5D2M C; 1LD7 A; 5HRY A; 4B8A A; 3EUV A; 4C9B B; 3FUK A; 4APF A; 4NRH B; 2ZU6 B; 1UJJ A; 5JHA A; 4DX7 D; 3JYS A; 4GZ6 A; 3FEY A; 4K5A B; 4EZK A; 2AXZ A; 5FIO A; 3FH7 A; 3SY2 A; 4DK5 A; 5G05 C; 2BUG A; 3MCX A; 1AWC B; 3FEX A; 4A1S A; 3LY8 A; 3FU0 A; 2X6F A; 2CHZ A; 2CHX A; 3ASO E; 2WXK A; 2CFU A; 2VGX B; 4HQD A; 4B8C B; 2Y1L E; 5ANR A; 3G2V A; 1SA4 A; 3AG1 E; 3NAW A; 1TNZ A; 1SVX A; 3T8M A; 1FT2 A; 3C72 A; 5KJM A; 1Z6T A; 4NQ0 A; 2Q7F A; 2CHW A; 3E4B A; 2GRM A; 3MYV A; 2X6J A; 3NBN B; 2DZO A; 3FUD A; 4CT0 A; 4XKC A; 1UG3 A; 2XEN A; 3DPD A; 3G2S A; 1N94 A; 2OVB A; 2GRR B; 4J7W A; 4CRW A; 1ELR A; 1SQM A; 4CDM A; 1JCR A; 3OAW A; 2OVF A; 4I1M A; 4TV3 A; 1PY1 A; 5FJY A; 2VJ8 A; 3PNL B; 3V31 A; 3AS4 A; 1TR4 A; 5FQ8 A; 1IQU A; 3NZU A; 4LSZ E; 3UIN C; 4A1G A; 4G8L A; 5BUZ A; 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