4BC5A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with inhibitor 5- deoxy-5-fluoro-d-xylulose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
524
structure length
524
Chain Sequence
RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
total genus 180
structure length 524
sequence length 524
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc5A01
3W0LA 1HKGA 3GDQA 3AY9A 3ULEA 3I33A 4O5FA 2V7ZA 3FZMA 3WUHA 1KAZA 4BR2A 2QW9A 4FWMA 5FPMA 2PBDA 2GEMA 3S41A 4MLHA 3RSEB 2J4RA 3QBXA 1GLAG 4JD2A 3O5BA 1Q18A 3CERA 5FPDA 1XUPO 3HZ6A 4YDUC 3UKUB 2CGKA 3J8AA 4BQZA 2FXUA 4JN4A 5LJWA 3VENA 1JCFA 1NGCA 2P9LA 1HKBA 3CJ1A 3HM8A 3LDOA 3D2FA 2DPNA 4B1YB 5B8HA 3G25A 1V4TA 3WQUA 1HX1A 3CI5A 3CJAA 4BC5A 3VESA 4BVPA 1DEJA 5AQXA 4BR9A 1NGEA 2FLOA 1J6ZA 1T6CA 1MWMA 3QDKA 4MLEA 5AQLA 3FE1A 1SZ2A 4K25A 3SJHA 3FZHA 1NBWA 4MO5A 4M63C 5FPNA 4CZKA 3ZEUB 3MCPA 3U9DA 2GUPA 4GY2B 1T6DA 4L3QA 3A0IX 5KPRA 3P4IA 2Q31A 3SK3A 3BP8A 5AQHA 3WEEB 3LL3A 1SQKA 1MA9B 2PAVA 2IVNA 3I8BA 3O08A 3VOVA 4IJNA 4BRNA 3H3NO 5EY4A 4B1ZA 4IZ9A 3C0BA 4BRAA 4BRHA 4RWTA 1D4XA 3QFPA 2E2NA 4EHUA 1NGBA 1U6ZA 2GTDA 3EZWA 1LCUA 3GOIA 4H5TA 4K41A 2AA4A 1ZC6A 4B1UB 3BF1A 3HTVA 2P9IA 4CBWA 4O8KA 4CJ7A 3VPZA 2ASOA 3QBWA 3ATVA 2Q97A 3CJCA 3ZX3A 3M1FA 3WXIA 3VF4A 5KQDA 3MN9A 4BR5A 4CBXA 2P9SB 3QMLA 1QHAA 4PKHA 2ZWHA 3LDPA 3CJBA 2AP1A 4QS8A 2NRHA 3CIPA 1X3NA 2D0OA 3CJ7A 1GLJO 3D2EA 4FWOA 4CZEA 5KQ8A 3HBTA 4XH1A 3DXKA 3CHWA 4PKIA 4B9QA 5BREA 5AZIA 4PL8A 2D0PA 2BTFA 3IUCA 5BRHA 5FPEA 2CH5A 2W40A 5BPLA 2E20A 4BRIA 1HKCA 2HF4A 4IO8A 1K8KB 3SMSA 1CZAN 2VCPA 5AQYA 1HLUA 4BRMA 1NGJA 3LDLA 1X9JA 2A3ZA 2V52B 3DWLA 1ATNA 4BG9A 5LY3A 1QQOA 3ATUA 5AFUA 2CH6A 2HMPA 3FGUA 4AM6A 2E88A 2E8AA 4H0XB 4EHTA 3VEOA 3UKRB 1GLLO 1BO5O 1ATSA 3WT0A 4H0VB 4H5RA 3F9MA 4I6MA 4IWVA 3ZETA 2P9NB 3C7NB 4H5VA 5F0XA 2V7YA 3UE5A 2QWRA 4EIAA 3H6EA 4K42A 3ZX0A 3HI0A 5F1XA 2E2QA 2YCHA 1R59O 3EL2A 5E84A 1S3XA 3ZX2A 1P8ZA 3ID8A 4CZGA 1KXPA 1H1VA 1BA1A 4QS9A 1E4GT 3A5OC 4BRCA 3R8EA 4PL7A 2IIRA 2HOEA 3L4IA 4M7YA 5BRFA 3U9ZA 2QWPA 4BRLA 1V4SA 3VERA 4FL9A 4BROA 2P9KB 3MN7A 4WQ4C 4BR0A 2P9UB 4CZIA 4A62A 3ENHA 4AM7A 4J8FA 1NGIA 1TYQB 4BRQA 3RSEA 5AQJA 1BDGA 3AARA 2IVPA 5AQWA 4BREA 1DKGD 3IDHA 3H1VX 4KBOA 2Q2RA 3C7NA 4H0OA 3A5LC 1GLBG 3UKUA 4DHYA 2A41A 4BC2A 4BC4A 4LC9B 3MMVA 2FSJA 2D4WA 2FSKA 2Q36A 4FOEA 3VGLA 4CD3A 2I7PA 4NO7A 1Y64A 3TU5A 4FSVA 2GWKA 2FSNA 3FR0A 1GLEG 3BEXA 3U8XA 4HTLA 5LJVA 1NGHA 2NLXA 4XEIA 3OHRA 3SLCA 5ADXA 1IG8A 4ISFA 5AQKA 3GE1A 4MO4A 4FPBA 2E2PA 4E1JA 3EN9A 3ZEUA 2F9TA 2YHXA 2QM1A 1HPMA 2VWBA 4BRDA 3O80A 1ZXOA 3DAWA 4PKGA 3WEEA 4FWKA 5I9EB 1KAYA 2E2OA 2Q0RA 1BG3A 2YHYA 2FF6A 3R9PA 1JCEA 3A8YA 4B1XB 5EXWA 3DJCA 3VETA 3H45C 4GNIA 3B8AX 1C0GA 4BR4A 2A5XA 1ATRA 1NMDA 2YI1A 1MDUB 1TUYA 5CE3A 2ASMA 2CGLA 4EFHA 4H0PA 3WXJA 4JHDB 4FWNA 5AZJB 1NGGA 3M3ZA 3A5NC 4B1WB 4WQ5C 3DXMB 3BF3A 4M7XA 4WQ4A 4RTFD 3VEWA 3W3DA 3O4WA 3HSCA 4QS7A 5KPZA 1S22A 4FWPA 1QQNA 1Z6RA 2P9PB 4CBUA 1MWKA 4FPAA 4FWSA 4BRKA 4BR7A 3VF2A 3O1BA 3FZFA 5BR9A 2OANA 5BPMA 2ZGZA 2YJEA 5AFUH 3L6QA 3M6GA 3BUZB 4H5NA 3VEXA 1NGDA 3ULEB 3O8MA 3ENOA 4BRPA 4ISEA 1RGIA 5AQIA 2P9SA 1BOTO 5KPTA 2VYPA 1BWFO 4CZLA 1Z05A 3GL1A 3LDNA 4JD2B 4JHDA 4DQ8A 3VEZA 1XC3A 4EAHD 2A40A 1TUUA 3QICA 1IJJA 1U2VB 1BUPA 3U4LA 1ESVA 5JLHA 5AR0A 3LM9A 5AQNA 4B1VA 4BQLA 5AQRA 1EQYA 4CZHA 4FWLA 1BA0A 3EKUA 3MN5A 3H1QA 2Q0UA 1OKJA 5F2RA 4H0TB 1K8KA 1QQMA 2FF3B 2Q1NA 1NGFA 5JMVA 3KZBA 3KVGA 4DCHA 1KAXA 2I7NA 4Z94A 1RDWX 3CQYA 3IFRA 3MDQA 4A61A 4A2AA 3WXKA 3FFKB 5AQOA 2ZF5O 3AAQA 4H5WA 1RFQA 5AQPA 4CZMA 1GLFO 3L0QA 3QB0A 2E1YA 1T44A 3UKRA 1U2VA 3LM2A 5AQTA 2P9NA 3IMXA 4CI6A 3QFUA 1DGKN 2QWLA 1X3MA 4ISGA 3WQTA 4A2BA 4WQ5A 4F9OA 5ADXH 2WUSA 3VGKA 2W41A 1HUXA 3MK6A 4FO0A 5E26A 5BRDA 2YHWA 3TPQA 1BU6O 4C23A 2A42A 4FOIA 3D7EO 1YAGA 5AQVA 4BRFA 3EO3A 2IVOA 5AQFA 2P9KA 4CD1A 4NB4A 2P9UA 2P9IB 1XQSC 1SAZA 3AAPA 1TYQA 3EKSA 4BGAA 4BVOA 2D1KA 5EX5A 3LDQA 1ZBSA 4XH5A 5AQUA 1NM1A 2QWOA 3FZLA 2H3GX 4BG8A 1LOTB 1NWKA 3MN6A 4HWIA 2QWQA 4CZFA 5TKYA 2QWMA 3FZKA 2BUPA 4WYBA 5BN9A 3VEYA 4FWRA 3D2EB 3O1WA 3FLCO 2CGJA 2E1ZA 3DXKB 5AZIB 3R6MA 4BGBA 4FWQA 1NLVA 1HJOA 2HF3A 5AQMA 3SMPA 1QZ5A 3JS6A 4K43A 1JCGA 5BN8A 3CETA 1NGAA 3VEVA 3GG4A 1WUAA 4H03B 2QXLA 5AQGA 4YDUA 2ZGYA 4Y0WA 3UB5A 3H3OB 5AQSA 2NZTA 5JICA 2QWNA 4DB3A 5JLFA 4CZJA 4XH4A 5AQQA 1GLCG 3H46O 1QZ6A 5EOYA 5EVZA 5BPNA 2UYTA 4H0YB 5AQZA 1YXQA 1GLDG 1E4FT 1YVNA 1WOQA 3GBTA 4JNEA 2ITMA 2GWJA 3A5MC 4RCHA 4IXCA 3VGMA 5ELZA 4I6MB 3ZETB 2EWSA 5AZJA 2GELA 2V51B 3CQXA 1YUWA 4IJAA 3O6WA 3DXMA 3WXLA 4BC3A 2YJFA 2KHOA 4JAXA 2P9LB 3JXUA 3KHYA 3CJ9A 3D2FB 2ASPA 2P9PA 3VF6A 1C0FA 1G99A 2F9WA 2A6AA 4BRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HR0K 4AF1A 4OVLA 3AVAA 1TL3A 4OKEA 4KB0A 4OGCA 1NJWA 4BR2A 1HRHA 2QW9A 3AVCA 4FWMA 1YJWN 2AJQA 5FPMA 3M8QA 3TTFA 4LY7A 4DFJA 3S41A 3O4QA 3SUPA 4MLHA 1JL1A 2QTDA 3OBYA 2UUCK 3NHGA 1LWFA 3QBXA 1I3AA 4JD2A 3O5BA 1Q18A 3PIPL 3CERA 5FPDA 3K59A 3CC4N 2O8DB 3N4PA 4F2RA 2D0CA 1FK9A 1XUPO 1SKRA 2BH1A 1K6YA 4BQZA 4JN4A 4N41A 2HHXA 3D2FA 2DPNA 4DR6K 5B8HA 4CJKA 3WQUA 4OX9K 1VRTA 3CCEN 1BQNA 4BVPA 2JWLA 3ZSVA 4JI2K 5JVGL 4BR9A 4JS5A 1FW6A 4QOZB 1EO1A 4AQYK 1J6ZA 1YT3A 4B8AB 4K25A 3SJHA 1VSEA 3SZ2A 3FZHA 2O8CB 4CZKA 1WSFA 3ZEUB 2G8WA 1IBLK 1T6DA 3BP8A 5AQHA 4F4KA 3WEEB 3LL3A 4DV6K 5KI6A 4DS4A 4DTSA 2IVNA 3I8BA 3VQAA 3M8PA 4IJNA 2F4VK 3NF7A 4B1ZA 3C0BA 2E4LA 2OYQA 4NXMK 3QFPA 4DUYK 5HL7L 3V4IA 3LAMA 2HVHA 4KTQA 4KH4A 2AA4A 1ZC6A 4RW7A 1T03A 4FLZA 2P9IA 1U04A 4CJ7A 5J2MA 3J7ZO 2ZD1A 1BI4B 1QSYA 1VSLA 3WXIA 2HHQA 4Q5VA 3LP0A 3MN9A 1IBMK 3CM6A 4FJ8A 3OYHA 3ZSZA 1NK9A 4FLWA 2YV0X 3L3VA 1GLJO 4CZEA 3Q7BA 3NH0A 3ZLJA 2NUBA 2HNDA 2D0PA 2BTFA 2CH5A 5H1SQ 1EXQA 3THWB 4LH5A 4LH4A 1HKCA 1VQKN 3PLAA 3OTOK 4KAZA 2HF4A 1K8KB 4AH9A 1EWQA 3SMSA 4OPHA 2NRWA 3AVFA 3SQ0A 4IOXA 1YTAA 5AQYA 4DU3A 4YNQA 2F96A 1EWRA 1ATNA 2NRZA 3MXIA 2DFHA 2CH6A 3KLFA 3FGUA 4JKAA 4OGEA 3OJUA 4EHTA 1RILA 4CHNA 4BACA 3TTDA 1BO5O 2NRRA 4X66K 1WB9A 3ZSOA 1NJIO 3O9TA 3F9MA 3ZETA 3BGRA 5F0XA 2QWRA 3VQ4A 1KVAA 1FJGK 3H6EA 4K42A 3ZX0A 3HI0A 4CEQA 2E2QA 3MAQA 3KK3A 1R59O 5E84A 4KFBA 1S3XA 3T3FA 4CZGA 2HVIA 1RT1A 1BA1A 1VHXA 1E4GT 2QKKA 3L4IA 4KHUA 4M7YA 1YVUA 1V4SA 4B3OA 2YKMA 5HRSA 3K58A 4BR0A 2GUIA 1ZYQA 3G0ZA 1SKSA 4CF0A 3QIOA 5AQWA 1DKGD 3H1VX 4N76A 2Q2RA 1X1PA 2WBNA 3AO5A 4W5RA 4F8RA 3P1GA 3UKUA 1NOZA 1LW0A 4KHWA 2D4WA 2OPPA 4E7JA 3VGLA 3QO9A 4CF1A 1HNIA 4AHCA 5C10A 5CY4A 5HRRA 4J2AA 3DM2A 1GLEG 1XNRK 1JLGA 3LP3A 3QNOA 2NRVA 1OVYA 1S72N 5MLCQ 3AVNA 4KKOA 1N8RO 4I9LA 1O1WA 2QKBA 3AVKA 4B08A 5GINA 4FPBA 3E9LA 4BDPA 1SS6A 2PYLA 2WC9A 4YOTA 5FROA 4B3MK 4G9ZA 3NH2A 2F9TA 4O55A 2F7TA 2YHXA 2VWBA 4BRDA 2HB5A 4FWKA 3HO1A 2Q0RA 3KLGA 3DLRA 4PUOA 2FF6A 4NYFA 4B1XB 1QHTA 1HQUA 3V9UA 3H45C 3OS2A 3AVHA 2XRIA 1MDUB 4OLAA 2ASMA 4IOCL 4W5NA 4QAGA 1RDBA 2RF2A 4JHDB 4Z4FA 1ZBIA 1NGGA 5GAEP 4B1WB 3B6PA 4FJ5A 1T8EA 4NLBA 3RMDA 3NH1A 3O4WA 3HSCA 4QS7A 3K5OA 1IV0A 4JRQA 2KFNA 4PWDA 1YI2N 5FDLA 4BR7A 3FZFA 1KFSA 5BPMA 2ZGZA 3BUZB 3I56N 3C65A 3SCXA 3AVJA 3ENOA 3KK2A 4ISEA 4DTPA 3AVIA 4E89A 4EP4A 4YOUA 1BOTO 5KPTA 3CCSN 1KSPA 2VYPA 1VQLN 3LPUA 1OVQA 1Z05A 5JS1A 1BL3A 3GL1A 4ILJA 3V6DA 2A40A 1VSFA 3TANA 1Q86O 2UXDK 4BDZA 3CPWM 2X6NA 2YX6A 4CEZA 4B1VA 3FFIA 4N47A 4W5OA 3EKUA 2GX9A 3QEPA 4MDBA 1QVFM 4C8MA 1OH5A 4BE2A 1QQMA 2KZZA 2FF3B 4DKWA 4DTXA 2Q1NA 4DSLA 3HL8A 1NGFA 3ZT2A 3KVGA 1TKZA 4DCHA 1KAXA 2I7NA 1RDWX 1K73O 4A2AA 1RTDA 4CZMA 1GLFO 4JK8A 3G71N 3UKRA 1CLQA 3UIQA 3LM2A 5AQTA 1DGKN 5K14A 3CF5L 2IS3A 4N5SA 4ISGA 2WUSA 3MK6A 4FO0A 5BRDA 3TAGA 2YHAA 3KWGA 3AA5X 4FOIA 2G8IA 2RN2A 1NK5A 1YAGA 4JRPA 4CD1A 2DFFA 1RTIA 4NB4A 2P9UA 4FLUA 1X9MA 4Q0BA 1L3UA 2QI2A 1CXQA 3EKSA 2HW3A 3SUNA 2D1KA 2JWKA 1OH8A 2XO7A 4JK9A 1NM1A 2QWOA 5KRTA 2QXFA 4BE0A 3LWLA 3VQ8A 4CHQA 3TSUA 1UAXA 3FZKA 2BUPA 4JI6K 4CJWA 3THXA 3VEYA 1U49A 3D2EB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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