4BC5A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with inhibitor 5- deoxy-5-fluoro-d-xylulose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
524
structure length
524
Chain Sequence
b'RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 180
structure length 524
sequence length 524
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc5A01
4IO8A 1SQKA 4JN4A 1P8ZA 3LDOA 4DQ8A 3ZETA 4AM7A 2P9NA 3IDHA 3VGLA 3D2EB 4I6MA 3LDQA 3SMPA 3VF4A 2P9IA 3FZLA 4FWMA 1SZ2A 3QDKA 1GLCG 4H5VA 1JCEA 4A2BA 3F9MA 5AFUH 4XH4A 3SMSA 3U4LA 4XH5A 1BU6O 3MN6A 4QS9A 2VCPA 3LDLA 3VOVA 1MWMA 3M6GA 1ATSA 1NGBA 2F9WA 3WXKA 4CJ7A 2P9KB 5AZJB 4PKGA 2CGLA 3DXKA 1DKGD 5AQMA 2V7ZA 3BF1A 5KPTA 1RGIA 5BN8A 2BUPA 4FWQA 1U2VA 3AAQA 1Z05A 2QWQA 2PAVA 4JHDB 4PL7A 5JICA 4NB4A 1K8KA 3A5LC 5EX5A 3EZWA 1ESVA 1YXQA 1HX1A 4B9QA 4BRQA 2E8AA 1SAZA 5KPRA 1HKBA 1GLEG 4CBXA 5JLHA 1HLUA 4BRLA 3C0BA 1QZ5A 1XUPO 4BR7A 2AP1A 3ZETB 1HKCA 1HKGA 4BRDA 2P9NB 4PL8A 4F9OA 3MN9A 4I6MB 3CETA 3CJBA 1J6ZA 4CD3A 2P9LA 3WQTA 5BPNA 1V4TA 3LDPA 1QQNA 1DEJA 2P9IB 4B1WB 3ATVA 5AQIA 1GLFO 3MDQA 3ID8A 3QFPA 1E4FT 1ZC6A 2ZGZA 1MDUB 3UKRA 1TUYA 3DJCA 5AQPA 4B1YB 2J4RA 3DXKB 5BRFA 2E88A 2VWBA 3P4IA 4O5FA 2ASOA 3G25A 4GNIA 2YHYA 3CJ7A 3WUHA 2WUSA 4FWOA 3RSEA 1K8KB 3QBWA 5BR9A 2KHOA 2QWMA 3BEXA 1NGFA 3D2FA 4CZKA 3MMVA 4A2AA 2QWOA 5AQTA 4B1ZA 4JD2A 4K25A 5AQNA 5JLFA 5EXWA 4BC4A 1BUPA 4B1UB 1S3XA 3WT0A 2QM1A 3ZX3A 4CI6A 1RFQA 4DCHA 1YAGA 2FSJA 3CI5A 5F2RA 1D4XA 3M3ZA 4WYBA 5AQLA 4CBUA 2FLOA 3FGUA 3UKUA 4BRMA 2FF6A 2P9LB 4A62A 1QZ6A 3WXJA 3A8YA 2Q0UA 3KHYA 1U6ZA 5AQZA 5AQKA 2IVOA 3UKRB 4BGAA 3DXMB 4FWLA 4M7XA 3FZKA 3UB5A 4WQ5C 2ASMA 1NBWA 2IVPA 2A6AA 3C7NA 3JS6A 3VF2A 1T6DA 3RSEB 3L6QA 3A5MC 3A5NC 3D7EO 3WQUA 1CZAN 4M63C 3DAWA 4H0OA 2BTFA 2GTDA 3D2FB 4E1JA 2FXUA 4JD2B 4DHYA 4EAHD 3SK3A 4BQZA 3CHWA 1BWFO 3VPZA 5FPEA 4BRKA 3IMXA 5I9EB 4Z94A 3W3DA 3LDNA 5AQGA 3H1VX 2GELA 3VEYA 4H5RA 1S22A 1V4SA 4RTFD 1TUUA 2Q31A 2W40A 4H0PA 3UKUB 4BROA 3GL1A 4FL9A 2HF3A 2HOEA 3LM9A 4BC2A 4BR0A 5AQOA 5F1XA 3CERA 2P9SA 2ITMA 3H3NO 5AQVA 3QB0A 3DWLA 5BN9A 3A5OC 3CJ9A 2EWSA 4IJNA 4CZLA 2GWJA 2D0PA 5AQXA 1ZXOA 5EY4A 1JCGA 1BA0A 1BOTO 2ZGYA 3C7NB 2FSKA 2Q1NA 3VEOA 3O1BA 3WEEA 4BC3A 2QWRA 5AR0A 3A0IX 3HI0A 1G99A 4K43A 1C0GA 3O5BA 4H0VB 4YDUC 3R6MA 2D1KA 2QWNA 3U9ZA 3H1QA 3LM2A 1QHAA 5B8HA 3H6EA 3MN7A 1ZBSA 5AQJA 2YJEA 3GBTA 5AQRA 2NZTA 3ENHA 1BA1A 4FOIA 5F0XA 2ASPA 3ENOA 3BF3A 5LJWA 2IVNA 3ATUA 2E2PA 1QQMA 4BR5A 5AQQA 3DXMA 3ZEUB 3AY9A 3O1WA 5FPDA 1TYQA 2CH5A 1NLVA 4BC5A 1RDWX 3ULEA 2P9SB 4FWSA 2P9UB 1NGJA 2Q97A 3M1FA 3EKUA 2A40A 1KAXA 3J8AA 4ISEA 2FF3B 2PBDA 1BDGA 1BG3A 2UYTA 3HBTA 2NRHA 4BRIA 1GLLO 3AAPA 3JXUA 3HM8A 5LY3A 3W0LA 4FO0A 2AA4A 4C23A 1NGAA 1WOQA 5EVZA 4DB3A 4CZEA 2IIRA 4K41A 3WEEB 4CBWA 4WQ4C 4QS8A 4L3QA 3H46O 3CJCA 3GE1A 2F9TA 3OHRA 4MLHA 4H0XB 2ZWHA 5ADXA 4QS7A 1OKJA 3SLCA 3TU5A 3FZFA 2Q2RA 4FWRA 1LCUA 4BRCA 2YI1A 5AQUA 4H03B 2QWLA 1X3NA 4JNEA 1NGGA 4ISFA 2ZF5O 4AM6A 4BREA 4MO5A 4IJAA 4CZJA 1TYQB 1T6CA 3EO3A 4FWPA 2E2OA 3ULEB 4BR2A 4BR4A 3EN9A 4H0YB 5AQHA 4CZFA 4IWVA 4HTLA 3QICA 1YVNA 3WXIA 4O8KA 1XQSC 3AARA 3WXLA 2VYPA 3HTVA 4BQLA 5LJVA 3FFKB 3L4IA 1MA9B 4GY2B 2E2QA 4MO4A 1GLDG 3LL3A 1GLAG 2Q36A 3CJAA 1GLJO 4PKIA 1BO5O 1KAYA 3BUZB 3MN5A 3MK6A 4H0TB 4BVOA 3VETA 1WUAA 5ADXH 4BG8A 5AQWA 2CGJA 2GEMA 3ZEUA 2A42A 3GDQA 4H5TA 1ATRA 4WQ5A 3ZX2A 3O8MA 2P9PB 3O6WA 4KBOA 4B1VA 4CZIA 2P9UA 3B8AX 3CIPA 4IXCA 1E4GT 1GLBG 2CH6A 4BRHA 5KPZA 1X9JA 3VGKA 5JMVA 3HSCA 4LC9B 3UE5A 3IUCA 5CE3A 2I7NA 4BRFA 5BRDA 3IFRA 2I7PA 1YUWA 4J8FA 4M7YA 3MCPA 2E1YA 4K42A 4FWNA 3R9PA 5BREA 2W41A 3O80A 1T44A 2YHWA 3QMLA 1JCFA 4BGBA 3VEXA 1NGCA 4IZ9A 2A41A 4CZHA 1C0FA 4EHUA 5AQFA 3VESA 3VF6A 3CJ1A 3EKSA 2OANA 3FZHA 1NGHA 4CZGA 2V51B 2H3GX 1DGKN 4ISGA 1LOTB 3VERA 5E84A 2DPNA 3CQXA 5AZIA 5BPLA 3FLCO 1Q18A 5AQSA 1MWKA 4BRNA 3VEZA 3CQYA 5BRHA 1QQOA 4B1XB 3GG4A 1KAZA 5TKYA 3VEVA 1R59O 5BPMA 4H5WA 3ZX0A 2GUPA 2QXLA 4PKHA 2E20A 4BG9A 2V52B 2HMPA 2HF4A 4FPAA 4BVPA 2YCHA 1NGIA 4Y0WA 4FWKA 4YDUA 2E2NA 2QWPA 2FSNA 5AQYA 1EQYA 4XH1A 3EL2A 1IG8A 3VEWA 3I33A 4BRGA 3U8XA 1U2VB 1NM1A 4BRAA 3O4WA 5E26A 1NGEA 4XEIA 4BRPA 3GOIA 5FPMA 4H5NA 2A5XA 2CGKA 3VGMA 2QW9A 1Y64A 1NMDA 2NLXA 5ELZA 3D2EA 3HZ6A 3H45C 4MLEA 2P9PA 3SJHA 3U9DA 2GWKA 3KZBA 5KQDA 1XC3A 3L0QA 5FPNA 3R8EA 1X3MA 4EHTA 3TPQA 5AZIB 4EFHA 3KVGA 4CD1A 1KXPA 2E1ZA 4BR9A 2P9KA 1NGDA 1H1VA 1IJJA 3FZMA 4FSVA 5AFUA 5AZJA 4CZMA 5KQ8A 2Q0RA 4JAXA 1NWKA 4JHDA 1HUXA 4HWIA 3S41A 4WQ4A 4NO7A 4FOEA 3O08A 3I8BA 3FR0A 5EOYA 4EIAA 2V7YA 3FE1A 1ATNA 2D4WA 2YHXA 3BP8A 4RCHA 1Z6RA 3VENA 3QBXA 4RWTA 1HPMA 2A3ZA 2YJFA 4A61A 2D0OA 1HJOA 3H3OB 4FPBA 3QFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF1A 4B9MA 1U04A 2HBMA 3LDSA 4MDBA 1NU0A 3OBWA 3VQ6A 3IDHA 4O44A 3D2EB 1VQ9N 4PY5A 2HW3A 4I6MA 3LDQA 1RILA 1ZBFA 4FK2A 1TVRA 4DV6K 1SZ2A 4A2BA 1NG9A 2X74A 3F9MA 5AFUH 4M3TA 3AVNA 3LDLA 3LPUA 1HNIA 3M6GA 4YFUA 3WXKA 2P9KB 1DKGD 5J2PA 1IKXA 4FWQA 5KGXA 4B9UA 3AAQA 1Z05A 5CY4A 4PL7A 4IG3A 5DM6L 4KHUA 3NDKA 3KLEA 3QNOA 4YOXA 1YXQA 1HX1A 1LW0A 4W5NA 2FBVA 2XHBA 2O4IA 4W5OA 4CEAA 3DMJA 3OS2A 4JKGB 2VWJA 4WFBL 3NCIA 1Q9XA 1NKBA 1VSKA 2AP1A 3OYNA 2QK9A 5HP1A 3MCAB 3ZETB 4BRDA 1YIJN 4PL8A 3MN9A 1DTQA 4J2EA 3P1GA 1RT2A 1OH6A 3J7YP 3ATVA 1WSHA 3ID8A 2ZD1A 1ZC6A 1W2BM 3K59A 4V19S 2G8HA 1NJZA 2OTJN 1XNQK 5AQPA 1T03A 5BRFA 1JLEA 4O5FA 3G25A 4KFBA 4LFBK 3WUHA 4CGJA 2B5JA 4FZYA 4FWOA 1BIZA 1K8KB 1RBSA 1N32K 2KHOA 4O55A 1WBBA 3D2FA 1JLGA 1TKXA 1MU2A 4A2AA 5AQTA 4DR2K 4R5PA 3DOKA 4DF8A 2P5GA 5FRNA 3TAFA 4JI1K 1S3XA 3MX5A 3WT0A 3D0PA 2FSJA 2VGNA 2BANA 3D45A 4BWJA 4CBUA 2QEXN 1ZBHA 3FGUA 1ZBLA 4A62A 4C8OA 1NK8A 1N5YA 3CMEN 4NLCA 2KW4A 5AQZA 1NK0A 3IS9A 1ITGA 4E7HA 2HHWA 4IDHA 3RRGA 1JLCA 1YTAA 5HRSA 4HVJA 3HOSA 4JI0K 1NBWA 5E41A 3RSEB 1CZAN 1OH5A 1KQSM 3NF7A 1VQ7N 1VQON 3SJJA 4DHYA 2IAJA 4KTZA 2O8FA 5CR4A 3CC2N 3NGZA 1YJNN 3IMXA 2Z1IA 3WNFA 4Z94A 3W3DA 3LDNA 3KIOA 4KV8A 4F2SA 3H1VX 5KRTA 3ZSZA 1S22A 4AHUA 4CJEA 4DV7K 1C1CA 3M8RA 2HF3A 3NVMA 4FJXA 5AQOA 4TSXA 2G8FA 5T7BA 4NCAA 3DLBA 4CJ3A 4DR5K 3VA0A 1LV5A 1NJYA 3PSIA 5BN9A 4BE0A 2OPPA 2W6KA 3OW2M 2EWSA 3DLLL 4CHOA 3TAQA 5AQXA 1RTHA 4CGDA 5EY4A 1JCGA 1BA0A 3V9WA 4DSLA 1RTIA 2Q1NA 3O1BA 5HRPA 4BC3A 5AR0A 3B6PA 3HI0A 1C1AA 4H0VB 5DMRA 2YNGA 1TV6A 4MQ3A 4YDUC 2D1KA 2QWNA 1XWLA 3HM9A 1Q86O 3ALYA 1S1XA 3P5JA 2YJEA 5AQRA 3OS0A 3C6TA 5F0XA 3CXCM 3ATUA 3ZEUB 2RN2A 4M3ZA 1KTQA 1C6VA 3TTFA 2DTUA 4IEIA 1UA0A 2P9SB 4FWSA 1JL2A 2P9UB 2GV9A 5M1PA 2PY5A 3TR8A 1RCHA 3SBGA 3BZCA 3EKUA 3KWIA 1KAXA 4ISEA 3QEPA 2FF3B 5JS1A 3HBTA 4OKJA 4BRIA 4DTXA 3SQ4A 4FO0A 4C23A 1NGAA 3VQ4A 3O4QA 4CECA 4C8LA 2IIRA 3OYIA 4CBWA 4QS8A 2OYQA 4AHVA 3O3GA 3OYDA 3IRXA 4KTQA 2F9TA 4C1NI 1KC8O 1BHLA 1NK5A 3OA9A 3FZFA 3THYB 4DWIA 4BRCA 1U49A 5AQUA 2QWLA 4CF2A 4DU4A 3F2KA 5I42A 2VQFK 2YNIA 3S9HA 5K14A 1S5JA 2BH1A 2E4LA 4BR2A 4BR4A 5AQHA 4JI2K 4IWVA 4HTLA 4MDAA 4HUEA 1NKEA 1VHXA 3TAPA 3E9OA 4DS5A 1UA1A 5LJVA 4GV6A 1ASUA 2Q36A 1KAYA 3MAQA 3MK6A 1BIUA 3VETA 5ADXH 2CGJA 2GEMA 4RW7A 3JSMA 3CCEN 1D9DA 4WQ5A 2P9PB 1SS6A 3HO1A 4IXCA 4F4KA 1GLBG 5KPZA 4LH4A 3SQ0A 4G1QA 4LC9B 3UE5A 5CE3A 2I7NA 4BRFA 5BRDA 3IFRA 1NK7A 4DU1A 4FCYA 4J8FA 2E6LA 3MCPA 3SI6A 1BQMA 4CJSA 3PSFA 4FWNA 1VSEA 4OGEA 3CFOA 3LP1A 3IG1A 2DFEA 2YHWA 3QMLA 4BGBA 4QCLA 4O0JA 3VEXA 1BQNA 1CXQA 3MXJA 5IWAK 3CCQN 3N4QA 2UXBK 1W97L 3VESA 1X9SA 2RHKA 4IO9L 1I3AA 3R3LA 3E9PA 4FLXA 1NJXA 3MX2A 2V51B 4JI5K 1DGKN 1SL1A 3L2RA 2WONA 5JVGL 3RMBA 3VQBA 4CJFA 1WLJA 5AZIA 4DV5K 3FLCO 1TKDA 5AQSA 1T7PA 2YX6A 5TKYA 4FJ8A 4M41A 3K9JA 4H5WA 4IKFA 3V1OA 2QXLA 4PKHA 2E20A 4FLZA 4KHNA 3ULDA 4BVPA 1WNSA 1XNRK 4A5BA 1TK8A 3AGKA 4OPKA 2O8BA 3OS1A 1VK0A 2YKNA 4JKFA 3F5TA 4CHYA 4XH1A 3M8SA 3VTIA 3QESA 3I33A 4X66K 3U8XA 5E26A 1NGEA 1JJ2M 4YORA 5M1NA 2ZJRL 3HT3A 1KVAA 2QW9A 2NLXA 3D2EA 3NAEA 4DSIA 2KKZA 4MLEA 1QQCA 3U9DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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