4BDOA

Crystal structure of the gluk2 k531a-t779g lbd dimer in complex with kainate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
250
structure length
242
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSAPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKIGIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Correlating Efficacy and Desensitization with Gluk2 Ligand-Binding Domain Movements.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Metal transport
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
total genus 77
structure length 242
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4bdoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4bdoA02
2D3IA 3MP1A 4IO2A 4TOZA 2Q8JA 4C1UA 4FIMA 2A5SA 1NNKA 1FCKA 2I4CA 1MY1A 2O69A 2UYEA 3JZJA 4GQOA 2OCUA 1MS7A 4R72A 3SEYA 4POXA 3TTNA 4U21A 5B70A 2XXWA 3IOTA 4LUBA 4LQ5A 1LGBC 4R74A 1MQHA 3LBSA 3QK6A 2F8DA 5K2XA 5DT6A 3K1PA 1AMFA 2XX9A 3RTFB 1HSJA 1Y4TA 1JW1A 4DDDA 5I2NB 3ZS6A 5CMMA 2I4BA 1HSLA 4EUOA 4HCWA 5TU0A 4Z0IA 1H45A 2O68A 2XXPA 1MQGA 3OMBA 3OXNA 4H5GA 3UORA 1AIVA 4U4XA 5DEXB 3HSTA 4OERA 2H4IA 3SEUA 4ESXA 2I49A 3G3GA 2Z8DA 4TLMB 3RT8A 3IJXB 1NKXA 2BJJX 3OEMA 1DMBA 1N3WA 1MH4A 2ONSA 4GL0A 4I62A 5DYHA 5M2VA 4F3SA 3ECRA 3MUQA 5JEIA 4DCYA 1IQ7A 3B6TA 2OWTA 4F3GA 3H7MA 4YB5A 2VP1A 1YCJA 3EQ1A 4MF3A 4JWOA 3T66A 1O64A 3TMGA 5CMCA 1SDXA 3H6VA 1OMPA 3CSBA 1P1QA 1PB7A 5CMKA 1PBQA 2OLBA 3VLVA 3GZGA 5AE4A 4ZE8A 4I9DA 3PV0E 3IAZA 1BKAA 1TWYA 1B3GA 5JK4A 2XXQA 1LFGA 1ANFA 1DPEA 2XXYA 3FUZA 4JXIA 1DTZA 4U4SA 3SEWA 4Q8RA 1MQDA 1Q1KA 2REJA 4R75A 3UP9A 1IZ1A 1N0TA 4RXLA 1MXWA 2DE3A 2YPNA 3HV1A 3K01A 4G68C 4THIA 3B6WA 4PFUA 3W9VA 4DCXA 1MY3A 4IO5A 4RK2A 3F11A 3VFJA 3DP6A 3W9WA 2X7QA 1LFHA 2OZZA 5TPAA 1RYXA 2V93A 2ZYMA 2CMOA 1S50A 2UVGA 4JSDA 2QSXA 2HAUA 2GFEA 3LSFB 4NF4A 4YICA 3V5AA 5AA4A 1M5DA 3P7IA 2Z8FA 3RGYA 1IXCA 2QMWA 4ELPA 4KPTA 2H98A 3K2DA 2XD3A 4H1XA 4ZECA 5A5XA 3N5LA 2HXWA 2XXRA 4Q5TA 4YKPA 3PMVA 2Y7WA 3RY3A 2PT1A 4K3FA 1B52A 1JQFA 1UTBA 1FTLA 2Z23A 4UACA 1VE4A 5ITPA 1PDAA 5L9OA 3MVXA 2HEUA 2P2AA 3O29A 2FA7A 4YB7A 1QUIA 1DOTA 4NWCA 3MPKA 4NF6A 5FHMA 2XXUA 3ODBA 3K1NA 1HSEA 1H76A 2PT2A 3K1MA 4X48A 3SKPA 3GBBA 1JETA 3RN8A 1LBCA 5AA3A 2QS3A 3OO7A 3MJNA 3SERA 1KWHA 3TCHA 4F1YA 3KFMA 3O6GA 3U94A 1B7UA 4G8HA 4YKKA 1B4HA 3FXUA 4PFTA 3U93A 5IAIA 4G8NA 2GHAA 5DVIA 1SBPA 1ZKBA 2LAOA 2Z22A 4PFYA 1SW5A 4U1OA 4DXBA 1R6ZA 2F5XA 2F97A 1T0KA 3K0VA 4AB5A 2VOZA 4R2FA 1IEJA 1M5EA 1Q35A 3EHTA 4RY1A 4OEUA 3S9NC 2PBWA 3TCGA 1OLAA 1MPCA 3KEIA 3KN8A 4G8MA 3PPQA 4FEBA 5EHSA 1QUKA 3TYHA 1PEBA 4KYSA 4GXSB 1B0HA 1FQBA 2ABHA 2R71A 1N7XA 4LA9A 1SW2A 1MM6A 1SD3A 3EPEA 4G68B 1P1UA 2P0SA 2O84X 3H06B 1M5BA 4X1BA 2P1SA 1OQGA 4XIGQ 3I3VA 2I6EA 4LZ5A 3BFTA 4MFIA 4F2OA 1Y4CA 1ZBMA 1MXZA 3O97A 5DVJA 5CC2A 2NXOA 3RQTA 1AOVA 4QFKA 3PUYE 5H8FB 3FJ7A 3B6QA 1WODA 3S4UA 3VXCA 5CRYA 3T9XB 2AYSA 1D9YA 4MLVA 3VVDA 1TXFA 1R9LA 4OFLA 3V8XB 4I1DA 1QULA 2DYXA 4ZDMA 3IX1A 4FAJA 2OK2A 1Y3QA 3IOUA 4IY5A 3GLBA 3C33A 3R26A 3CI8A 4LQ2A 4NF8A 4YZZA 5I56B 3FASA 3UN6A 5AA2D 3LSXA 4RPNA 1Y9UA 5F1QA 2HZLA 2RCAA 1URDA 1US4A 1PB9A 4JWYA 4KCCA 5AA1A 3S9EA 1B5HA 1B3FA 3EHUA 3FVOA 3HO7A 4QHQA 2M8CA 3U1OA 2X7PA 4BDRA 4F22A 3TELA 1OVTA 3VVEA 1SW4A 4U1ZA 4XKNA 4F31B 1Y20A 3K4UA 1VFDA 2QS2A 2RF1A 1YAEA 1B3EA 2B3BA 2XD2A 4G2ZA 1B46A 1MRPA 4FECA 4KD5A 1A7LA 1RYOA 2B3FA 2Y7PA 4R9GA 2RC8A 1EZ9A 4U22A 2XXVA 4OQOA 3M3LA 3G3FA 2DVCA 3VVFA 3VV5A 3FD3A 4DZ1A 3RLFE 2X26A 3LSWA 2ZYOA 5CM6A 5I58A 4KHZE 4KR5A 5H8FA 3MVWA 2O51A 3PD9A 4OHNA 1ZJLA 2DQVA 3H3GA 4ZEKA 4R6YA 1B2HA 2DXYA 3KBRA 4ZEFA 1Z7ME 1AL3A 2Q88A 1UTHA 3RNNA 3TUSA 5EYFA 5LOMA 2F35A 1IXIA 4N07A 4G68A 3GBAA 3KOTA 1TFAA 3QXMA 1MH3A 2QJEA 4ELQA 1LB8A 3IJOB 4YAHX 3MZ1A 2G29A 4M1VA 2F7BA 4OYVA 4HS7A 2DWIA 4PETA 1JVYA 5I58B 2F78A 1B6HA 3G3IA 3A09A 1ZMGA 2NUVA 3FV2A 1QUJA 2XXXA 1MDP1 3OO9A 4GIZA 4QFOA 1OLCA 2HQ0A 3QYTA 5CMBA 1VFEA 2Y7KA 4MH5A 2I0CA 2Y7IA 2ZXTA 1N7WA 3H03A 3DP8A 3PUVE 3Q26A 5B7DA 2AL5A 3Q27A 1USYE 1B51A 4IO7A 2ZMBA 1MY2A 2ZYNA 1A8EA 3CFXA 3OELA 4O3CA 4EF1A 3R7XA 4RNSA 1XOCA 1MY4A 1SQYA 2KLFA 3BKIB 3O66A 3ONMA 1POY1 3K6XA 3MZBA 4KCDA 2XXTA 4QSEA 3WAEA 4ZEDA 1LBBA 4RA1A 1A8FA 3IB0A 3IO4A 3VXBA 4DXCA 2UVJA 4H6DA 5HM4B 5I2KA 1A99A 3FVNA 5BUUA 1B0LA 3BBRA 3V83A 3A3UA 3CFLA 2A5TA 4UA8A 4IO6A 2F7AA 1URGA 4FORA 4P0IA 1SW1A 4YMAA 4R2BA 5CBSA 4NWDA 2Y84A 4H5FA 3EHSA 2ONKE 4JBZA 2OBGA 4MLQA 1JW4A 4EXLA 1S9TA 2FYIA 3A3CA 3KG2A 1YPNA 2DOJA 4NF4B 4ND9A 3KN7A 3JYRA 1EZPA 3TDJA 1MXUA 4FJPA 5TP9B 4PP0A 3TZAA 1LLSA 1JNFA 1JVXA 2H25A 4H0WA 4WEPA 1Y1ZA 2F6GA 2FNCA 1I6AA 3H6WA 5TPAB 3USDA 3KZGA 1N76A 3T96B 1XT8A 4BDOA 1BLFA 2ONRA 3KSJA 3AXFA 4FEDA 3TTMA 2YJPA 2ZNUA 3DM0A 4DXUA 5IKBA 5J1DA 4EDPA 1NMUA 3OENA 5I59A 3S9LC 3B7DA 3OO6A 5I2NA 3MW0A 1TT1A 2O1LA 4Q0CA 3O9PA 5ELVA 3O2AA 3ZKLA 1B1XA 4XKPA 2B65A 1SYIA 2NWJA 4NEDA 1FQFA 1POTA 4HCYA 2UYFA 5TP9A 2I3WA 3OEKA 3DELB 4TLLB 4BDMA 2QMXA 3ILUB 1MDQA 1O63A 3T22A 1N84A 2I0BA 3PMWA 3BFUA 4F3BA 4Q30B 4F1VA 2E1SA 3DP4A 5ICQA 1WVJA 4H67A 4E0WA 4IGRA 4GRKA 3O6HA 4ZEIA 3QUFA 1LAHE 2Y7RA 4RJZA 5KZTA 3TEPA 3CIJA 3VLUA 2RINA 3JV9A 5HPQA 1B5JA 1FTJA 1NL5A 3N26A 1JEVA 3PPPA 5FTIA 2PMSA 2DP8A 3LR1A 3LUYA 1MQIA 3Q29A 4JSOA 4JWXA 4OZ9A 3SETA 2DE4A 1LCTA 2F6PA 4HTGA 1NH7A 3FVKA 3E3KA 1F9BA 4QFPA 3C35A 4QSCA 3UA8A 4GFRA 4HW8A 4F29A 1PB8A 2AIXA 4IB2A 4U23A 2I3VA 5I57A 2XHDA 3TTKA 4P11A 2ANJA 1MXVA 1VR5A 3QAXA 4IO4A 4ZE9A 1GVCA 3PUZE 1H44A 3PPNA 2PYYA 3G3KA 3FZVA 4IGTA 1ELJA 4LP2B 5ISUA 5I57B 2O1MA 1ZIUA 2IEEA 2GRVA 1S7YA 3TODA 3RTWB 3FGSA 4WKMA 3KSXA 1P99A 3FATA 3FJGA 3FIRA 3G7WA 3PGFA 3PU5A 1LFIA 4EQ7A 1A54A 3PD8A 4IY6A 1H3DA 3N94A 4OFJA 2PVUA 1II5A 4BLAA 3I5OA 4M4GA 3UK4A 4KYEA 4PE5B 2Z8EA 3VLWA 1WDNA 1AH5A 4ZZAA 4C1TA 2ZYKA 2HFBA 4I8CA 5AA4B 2H99A 4DIGA 2DS9A 1JW5A 1O7TA 1R1NA 2PX1A 1UTBB 2RCBA 4X9TA 1CB6A 3L6GA 5H8SA 1TFDA 2F34A 2F36A 1B1HA 3QSLA 3SEVA 3K6VA 3TTRA 2RC9A 3K6UA 4H65A 2HZKA 1FTKA 4GXAA 5A5XB 3WAFA 5KDTA 1A55A 5I84A 4OETA 3FXRA 1P1NA 2IA4A 3T9VA 4QSDA 1MY0A 3C9HA 1VSOA 3IK6B 4FE8A 1MXXA 4R6HA 3N6UA 4LVQA 1IUDA 2Q89A 4JDFA 5K2YA 1GV8A 3CR9A 3MWBA 1L5TA 4R73A 2I58A 3C34A 1MPDA 3OSQA 3PPRA 1J1NA 4OESA 3IR1A 5L9SA 1LCFA 1IXGA 5DEXA 2DVZA 4NMYA 4N6PA 1B7ZA 2G93A 2ALUA 2HCAA 3QUJA 2ESNA 2XX7A 4NTLA 1US5A 4XKQA 1SI0A 2RKMA 5H8NB 3M8UA 1DSNA 4G77A 3TAJA 3SEXA 1QKAA 1GR2A 2GHBA 4F18A 4QF9A 2ZNTA 5L8DA 3MVZA 5ITOA 1Y1MA 5FHOA 1OIBA 2DWJA 3C36A 4L17A 3V89B 1B3LA 3CSGA 4ISUA 1IITA 3MQ9A 4ONYA 5I56A 3VE1B 4TQUQ 2QS1A 4RK9A 1XVXA 2ZNSA 2RC7A 3IOVA 2F7CA 3IL1B 1MG1A 4WXJA 2QPQA 2GH9A 1XS5A 4RPOA 4X1DA 2H5YA 4ECFA 3C31A 3EN3A 2XX8A 3KJTA 4IO3A 1IXHA 3IB2A 3MZ9A 3DLNA 3K6WA 3L6HA 4G4PA 5EHMA 4NF5A 1ATGA 1FTOA 4ELRA 1USYH 3D4CA 5F7VA 5H8HB 1SYHA 2A5TB 3Q25A 3UIFA 1B05A 1EZOA 4GD5A 4LZ7A 5DVFA 1XVYA 2VD3A 4OMBA 3RPWA 4H8JA 5AA2A 3E4RA 3IB1A 4F19A 1UQWA 1FQEA 1B5IA 1B7HA 3PUXE 4OENA 4OXVA 1SI1A 1BTJA 1PBPA 2WKYA 3KOSA 4GOTA 3T9HB 3OD7A 3PUWE 4EQ9A 4BDNA 4KYDA 4PQJA 4YKJA 4OFOA 4DE8A 2NOOA 3G3JA 4O3AA 3T93B 2AL4A 4BDLA 4LATA 1OVBA 1DTGA 3O6IA 1NNFA 2VGQA 3K02A 1NNPA 4LONB 3MP6A 4GLIA 4LZ8A 2I48A 3SESA 3TQLA 3K00A 3U8QA 3FJMA 1ZU0A 4DLDA 1YTVA 1B40A 1P1WA 1B9JA 3RUMA 4GL8A 3M3KA 4MBPA 4E0XA 4PFWA 3I6VA 4F39A 1LAFE 1UIUA 1XHYA 2UVIA 2THIA 5H8HA 4YB6A 3QIMA 1RKMA 2VHAA 5CBRA 1CE2A 1Y3PA 2UXAA 1EU8A 3HPIA 1BP5A 1B58A 1Z7NE 3OOAA 2REGA 3CG1A 5FTHA 4Z7EA 5H8QB 1MM7A 4NE4A 4XTCQ 1M5FA 1B4ZA 1GGGA 2R9JA 3EF7A 4ZS9A 5L9MA 2VD2A 2O6AA 2XXIA 3ZSFA 1OQHA 1I6BA 4GF8A 1LAXA 2DWAA 3S9MC 1NNTA 4WEDA 2YLNA 3UGWA 5DTBA 1B3HA 1NFTA 1FQAA 3MP8A 3KN3A 1D3KA 3IO6A 4GWOA 2W7YA 4RYAA 5JTYA 4AB6A 3MVYA 1XC1A 1QKBA 4QRZA 1NH8A 2CZLA 3E9XA 4GVOA 3KGCA 1R9QA 2V3UA 4YMBA 3C4MA 4QFNA 4EF2A 2QL3A 5H8NA 3RT6B 3TQWA 4EXKA 3MAMA 3LSLA 3IORA 3KJ7A 3CG3A 4OVJA 4XKRA 1QVSA 3G3HA 4R9FA 4POWA 4JB7A 2O7UA 3ILTB 1A40A 1LB9A 4KQPA 4NF8B 5CI5A 3TTLA 4AQ4A 3HHFA 1D4NA 4KI0E 2DSFA 4F2QA 5JTYB 3HHGA 1LSTA 2QRYA 3O28A 4NF5B 3THIA 3TKDA 2V84A 1PC3A 1QW0A 3H6UA 1I69A 3H4ZA 3PMXA 4N13A 1DPPA 2E0SA 2O7IA 4OEVA 4U2RA 2OWSA 3U72A 4BDQA 5HBCA 1UIVA 3CFZA 1D9VA 2QS4A 3CVGA 1MPBA 4YKIA 1P1OA 3S2VA 3SDFA 3TPAA 4C0RA 4ESWA 4P0GA 1M5CA 2UVHA 5I2KB 2DWHA 5BWJA 2D5WA 3LC8A 3W15C 1EH3A 3MPLA 1MQJA 3FVGA 1QJMA 1FQCA 2V3TA 2DE2A 4OTEA 3TFLA 4KFQA 1GTKA 2R6GE 3R6UA 3VDFA 1B32A 2H9BA 1SVXB 1LAGE 3OSRA 4OWDA 5FHNA 4QFLA 1IIWA 4R6KA 2V25A 4FATA 4YU0A 2HAVA 3Q28A 3IOWA 3M3FA 4XXUA 1Y3NA 1N3XA 1JEUA 3MC2A 3C32A 1ZLQA 2Q2CA 3PPOA 5I59B 2D21A 2DXRA 3CRBA 2OJTA 3HN0A 1BIYA 1I6QA 4O3BA 3GXAA 1FTMA 3ZKKA 3N6TA 3HCQA 1MXYA 4ELOA 3H6TA 5KDTB 4F3PA 3TCFA 1ZTYA 5ICTA 5KCJA 4NF6B 2Q9TA 3OO8A 2NVUB 1URSA 4EQBA 5AA2B 2XXHA 3E13X 1H43A 1N04A 4H8IA 3MBPA 4F1UA 5H8QA 3FV1A 4ZEBA 1FW0A 4ZZEA 1UTHB 3T9UA 2V3QA 3U92A 2Q2AA 3D4GA 1FQDA 5KCJB 3FXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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