4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
3LDLA 5ADXH 3HTVA 2QM1A 1HLUA 1XQSC 2GUPA 4XH1A 1SZ2A 1DEJA 2F9WA 1BOTO 3R6MA 4ISEA 1GLJO 3FZKA 4BRKA 3HI0A 5AQXA 1NGJA 4FWPA 3SMSA 2PAVA 2E88A 3DWLA 4RCHA 2E2PA 3MK6A 4FWQA 4PL8A 3ZX0A 3D2FB 2GWJA 1K8KB 2QWRA 5EVZA 4KBOA 3A0IX 4NB4A 1E4GT 3IFRA 3O08A 4FOEA 2IVNA 4EAHD 5BRHA 3DJCA 4H5NA 4DHYA 2ASMA 4CZJA 2QW9A 5ELZA 2E2OA 1ZBSA 2ASPA 2Q36A 4RTFD 3H1QA 3WQTA 4BR9A 1GLFO 1HKBA 2IVPA 3MN9A 4BR2A 3HBTA 3AARA 1HJOA 4EHUA 1CZAN 5AQHA 3FFKB 1HKGA 3ULEB 5AZIA 3ATUA 3MN5A 4YDUC 4B1YB 3CJ7A 4CBUA 4BRQA 3VF6A 3H46O 3ZEUB 1HPMA 3CI5A 4M7XA 4BQLA 1JCEA 3C7NA 3FE1A 3DXKB 3H45C 3LDOA 3U8XA 4JD2B 4M63C 4ISFA 1NGIA 4BRDA 2Q31A 4FWKA 4JNEA 3U9DA 3KHYA 1G99A 3MDQA 1TUUA 3H3NO 4CBXA 3DXMB 1XUPO 2HOEA 2P9UB 5AQJA 1GLDG 3QMLA 2D0OA 1ESVA 3UKUB 3TPQA 1YAGA 4K41A 5EXWA 4B1ZA 3AY9A 3CJBA 4H0VB 2E2QA 5KPZA 3UB5A 5KQDA 5JMVA 3CHWA 4FSVA 4CJ7A 3HSCA 1NGCA 3H3OB 3O1WA 1RDWX 2FXUA 3EKSA 5F2RA 4FO0A 5BN9A 3ZX3A 1ATRA 3VEWA 4A62A 3A5LC 3J8AA 2P9IB 1ATNA 1NMDA 3FZMA 5BPNA 4EIAA 3AAQA 3GOIA 4BC5A 2CGKA 2Q1NA 2E20A 1Z05A 5CE3A 5LY3A 1QQNA 2P9SB 3TU5A 3LL3A 2GWKA 4I6MA 4BG8A 3S41A 2D4WA 4IJNA 3B8AX 3WXLA 3DXKA 4Y0WA 3FZFA 1QZ5A 1KAYA 5EX5A 2VCPA 3UE5A 5BN8A 5AQPA 5AQYA 2P9UA 2A42A 2WUSA 3QBWA 3QB0A 2DPNA 1EQYA 4CZLA 4BVPA 1YUWA 3ID8A 2P9PA 2W40A 4BRIA 4BRHA 3FZLA 4FWNA 2YHWA 5BR9A 3A5OC 3CJCA 4BRPA 5AFUA 5AQTA 3CETA 2D0PA 1LOTB 4CZFA 5AQMA 2CH6A 3D7EO 3DAWA 1JCFA 4JAXA 1T6CA 1YVNA 3WUHA 4QS7A 3ZX2A 2A6AA 1MDUB 4H0YB 3IUCA 3CJ1A 5EOYA 1NBWA 4CZKA 1QHAA 4BC2A 2F9TA 4K42A 2P9KB 2P9IA 1X3NA 2P9LB 3BF3A 4GNIA 3WEEB 2I7PA 3LDPA 4IO8A 4BGAA 2E8AA 3G25A 4FWRA 4IJAA 1U2VB 4K43A 3M6GA 4H0TB 2A3ZA 1Y64A 3SMPA 4BG9A 4FL9A 4FWOA 4DCHA 2GTDA 2Q0UA 2V7ZA 5LJWA 4FPBA 1LCUA 1JCGA 3LM2A 1ZC6A 2PBDA 2VYPA 2E2NA 2ZGZA 4E1JA 1BDGA 3W0LA 5KPRA 4B1UB 1DGKN 1BWFO 2NRHA 4O8KA 4QS9A 5I9EB 4CZHA 1BG3A 3RSEA 5B8HA 5LJVA 5AFUH 3U4LA 2V52B 1X3MA 4C23A 2ITMA 5E84A 3BP8A 3ZETA 4PKHA 3M3ZA 3HM8A 2BUPA 1NGEA 1YXQA 3A5NC 2QWMA 3FLCO 4LC9B 2QWOA 3IDHA 3OHRA 1HUXA 1NGBA 4B1WB 3VENA 4H5WA 2P9KA 1NWKA 4BREA 1WUAA 1NGHA 1QZ6A 3CJ9A 5JICA 2HMPA 5FPNA 4PKIA 4FPAA 2NZTA 5AQSA 2QWPA 4GY2B 2YJEA 3O1BA 1RFQA 4A61A 1IG8A 4WYBA 2HF4A 3D2FA 3VEZA 1K8KA 2D1KA 1NGFA 4EHTA 3QFUA 3SJHA 3VPZA 3FR0A 3SK3A 4MLHA 3FZHA 5AZJB 3A8YA 1Q18A 4BRLA 1RGIA 2V51B 1P8ZA 3VEXA 2Q0RA 3W3DA 2FF3B 1NM1A 4JHDB 4CZMA 2P9NB 1T6DA 1SQKA 4EFHA 4BRMA 5AQOA 2IIRA 4F9OA 3VGMA 3CERA 3ULEA 4A2BA 1TYQB 2CH5A 1R59O 4QS8A 3EN9A 3ZEUA 3JS6A 2GEMA 3I33A 1C0GA 3O5BA 4JD2A 1KAXA 3WT0A 3MMVA 3MN7A 3DXMA 3FGUA 4WQ5A 3A5MC 4XEIA 5AQVA 5JLFA 5AQQA 2FSKA 3H6EA 4IWVA 3UKUA 1QQOA 3SLCA 3U9ZA 2IVOA 3CIPA 3IMXA 4CZGA 2BTFA 3BF1A 5AQNA 4H5RA 2H3GX 4CBWA 3VGKA 5AQUA 1SAZA 2J4RA 2V7YA 4CZEA 2CGLA 5F0XA 4CZIA 5FPEA 2NLXA 3KVGA 2YHXA 4M7YA 4BRGA 5BRDA 4BC4A 4H5VA 4H0OA 3HZ6A 3L6QA 3WXJA 5BREA 2P9SA 5AQLA 4BR5A 2YCHA 3JXUA 1GLLO 5AZIB 4BROA 2FLOA 4FWMA 5AQKA 1S22A 3C7NB 4DQ8A 4XH4A 1BU6O 3MN6A 2AP1A 1KAZA 4WQ4A 4MLEA 5BPMA 4XH5A 5AQWA 3EL2A 1U6ZA 4H0PA 4B9QA 3GL1A 4B1XB 3WQUA 4AM7A 1KXPA 1S3XA 1Z6RA 3C0BA 3H1VX 3VETA 5FPDA 4H5TA 2YI1A 4PKGA 2ZWHA 3VESA 1MWKA 3CQYA 4K25A 2E1ZA 1BUPA 4B1VA 2QWNA 2QWQA 3VGLA 1V4TA 3ENHA 3EO3A 1BA1A 2Q2RA 2ASOA 2P9LA 3CJAA 3VOVA 4BRFA 2QWLA 3WEEA 4IXCA 3GBTA 5KQ8A 3LDNA 5AQRA 3O80A 1WOQA 3QDKA 1U2VA 3O4WA 1ZXOA 5JLHA 3L0QA 2CGJA 3L4IA 3O6WA 4ISGA 4I6MB 4MO4A 3BUZB 1BO5O 2W41A 2GELA 5AQZA 3M1FA 4A2AA 4DB3A 1X9JA 2AA4A 3UKRB 5AQIA 1GLBG 3F9MA 4WQ5C 1XC3A 1NLVA 4BR0A 3QBXA 3O8MA 4L3QA 1HKCA 1E4FT 3VEVA 2Q97A 1GLAG 3WXIA 1NGGA 2P9PB 3VERA 4JN4A 2ZF5O 1GLCG 4BQZA 4CI6A 4BVOA 4FWSA 2E1YA 1QQMA 4J8FA 4O5FA 4YDUA 1IJJA 1H1VA 4NO7A 2FSJA 3I8BA 3P4IA 3WXKA 4CD3A 3GE1A 2A41A 3LM9A 4H03B 5AR0A 3D2EB 1BA0A 1NGAA 5BRFA 5BPLA 4BRNA 4HWIA 1GLEG 2UYTA 5ADXA 3VF2A 2QXLA 2KHOA 3QICA 4FWLA 4Z94A 1NGDA 5F1XA 2OANA 2A40A 2HF3A 5AQFA 1D4XA 3VEOA 3VEYA 3UKRA 1ATSA 5E26A 1T44A 3GG4A 5AZJA 3MCPA 5KPTA 4AM6A 4H0XB 4MO5A 1TUYA 2EWSA 4WQ4C 5FPMA 4JHDA 3GDQA 3RSEB 4BR4A 2P9NA 3BEXA 1V4SA 4BRCA 4RWTA 4BGBA 3KZBA 3CQXA 2VWBA 4BRAA 3EZWA 2I7NA 2FF6A 3R8EA 4HTLA 1OKJA 5TKYA 1J6ZA 2YJFA 3VF4A 5AQGA 3ZETB 1TYQA 3AAPA 4PL7A 3LDQA 1MA9B 3ATVA 5EY4A 1DKGD 2A5XA 4BR7A 4FOIA 2FSNA 4IZ9A 1HX1A 2YHYA 3QFPA 3EKUA 3ENOA 3R9PA 4BC3A 1MWMA 1C0FA 2ZGYA 4CD1A 3D2EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PUOA 3LDLA 3T1AA 5ADXH 4CCHA 2VG5A 4BE2A 1DEJA 3SV4A 4OPJA 1QTMA 3R6MA 3J81O 4BRKA 5AQXA 5J2QA 3PX4A 1TVRA 2IDOA 5M1QA 3OS0A 2E2PA 1IG9A 4FWQA 3THXA 4FJMA 1IKVA 2QWRA 4CJ5A 2P5OA 2OZMA 3A0IX 3ZT3A 1N8RO 5LL6Z 1XHXA 2OA8A 1YVUA 2HHTA 5ELZA 1Q7YO 4RTFD 1ZBSA 4BDZA 4HCCA 4CJ4A 1W97L 1VSMA 1GLFO 4DTPA 1VQ7N 2IVPA 1CZBA 3AO4A 3S9HA 1Y97A 1HJOA 1CZAN 5AQHA 1YI2N 4JI6K 2O4GA 3B6OA 4FJLA 4JS4A 3ATUA 3MN5A 3M8QA 4B1YB 4DF4A 1JXBA 3SI6A 1K8AO 3DXKB 3H45C 4KH4A 2GBZA 3LWMA 4DMNA 4FLUA 1A5WA 4M63C 4ISFA 2G8KA 2FBXA 1TKZA 1T03A 3MX2A 4YOYA 1ASUA 1RTHA 4DSJA 5DMRA 1LAWA 4F3TA 1WSHA 2E5LK 1YTUA 1QQCA 4DFPA 2BGGA 4B1ZA 1OH8A 1FKOA 4KHSA 3QEIA 4OPHA 5KQDA 4M3XA 4CJ7A 4FSVA 3HSCA 1RTIA 3RMAA 3O1WA 3RRGA 1RDWX 2QTDA 2FXUA 3O4QA 1ASWA 4FW1A 4I2QA 3J7AP 1DLOA 2NRWA 5K14A 5CZ2A 4MDAA 4CIGA 2KZZA 1ATNA 4HVJA 3L2UA 3QINA 2Q1NA 3NH2A 4M3TA 3PSIA 1QQNA 4CEDA 4Z4FA 3K5NA 2GWKA 4BG8A 1WSJA 3S41A 2D4WA 4WE1A 3I0SA 1VSLA 3WXLA 1KD1O 1SL2A 4CEZA 4LY7A 2HB5A 5HP1A 4B9LA 4DWIA 1VQ4N 4G9ZA 5EX5A 1ZBIA 2G8HA 5AQPA 4GVMA 2P9UA 2WUSA 3MEDA 4DQPA 2OPSA 4CZLA 3KLFA 2VWJA 4BRIA 4BRHA 4FWNA 4DLEA 5J2NA 2D0PA 1LOTB 5AQMA 1YVNA 4DR4K 3WUHA 4QS7A 3ZX2A 4CZKA 3QERA 1NKBA 4X66K 3CXCM 1QHAA 4KH6A 2F9TA 2P9KB 2P9IA 4E7KA 1J53A 4DTRA 4KHYA 4GNIA 2G8FA 3WEEB 3LDPA 3SCXA 1JLEA 4LSLA 4W5QA 2E8AA 4QCLA 3I55N 4FLYA 3ZT1A 3M6GA 1Y64A 3SMPA 4FWOA 4DTSA 1Z26A 2GTDA 2V7ZA 1O13A 3CFOA 5LJWA 4FJ8A 4FPBA 2ZJRL 3K5LA 4DSKA 1JLGA 1LCUA 4Z4HA 1C6VA 1DGKN 4E89A 3MWTA 5I9EB 4DR6K 3ISNC 2O8EB 3RSEA 3L2WA 2DY4A 5AFUH 4LF8K 1S1VA 3NAEA 4OJRA 1VSJA 1Q9XA 5C15A 4PKHA 4NYFA 5E41A 1YXQA 1VSHA 2HMIA 4X62K 2QWMA 1I94K 3MWPA 1RDAA 3CM5A 1KFDA 3AVMA 1NGBA 4KB0A 1K9MO 4IEIA 4N5SA 4BREA 3HPGA 5JICA 4FJHA 5FPNA 3LP3A 2NZTA 4X64K 1J9AA 3TAPA 3C65A 1KSPA 3AO3A 1BI4B 4DF8A 4WYBA 4GV9A 3P31A 1N32K 1VSFA 3HRGA 1RDUA 3NCIA 5JS1A 1VQ8N 2BDPA 3MECA 3QFUA 3SJHA 2RKIA 4ID5A 4X65K 4MLHA 4WFBL 3FZHA 5AZJB 2WTUA 2OTLN 4U67L 2V51B 3W3DA 3VEXA 2Q0RA 3LPTA 1OH5A 4JHDB 4JI1K 4IOCL 4B3SK 2JWLA 4CGFA 4BRMA 2HVHA 3VGMA 3CERA 4DTXA 3E01A 4GW6A 3SUPA 1U48A 4LF7K 5FDLA 1LWEA 1X1PA 3OYNA 1RILA 1WAFA 3IKMA 3I33A 1KQSM 4V19S 4CEBA 4JLHA 1C0GA 1KAXA 2IC3A 5CR4A 5BR8K 1VRUA 3MMVA 3MN7A 3FGUA 4WQ5A 2Y1IA 4IO9L 5JLFA 4CEQA 1RTDA 2FSKA 4DV0K 4IWVA 1QQOA 1RT7A 1IKYA 4M3ZA 1RDCA 1OVQA 4H5RA 1TK8A 1M90O 2H3GX 4CBWA 4DKWA 3VGKA 4CZEA 2CGLA 5F0XA 4JRPA 2KKZA 3O9SA 4R79A 4CHQA 1RT6A 1LAVA 3MXJA 2YHXA 4C1NK 3I56N 3QEPA 5BRDA 4H5VA 1D9FA 1Q86O 3L6QA 3CC2N 4QAGA 2P9SA 5AQLA 4AHVA 1UWBA 4WCEL 5AZIB 4BROA 2FLOA 1S1TA 3P5JA 1RTJA 1ZBLA 2O8FB 3AVHA 3CMAN 5GAHP 1BU6O 3MN6A 3CCVN 4IKFA 2AP1A 2YNFA 4NLCA 2D0CA 3G6EN 3EY1A 3QETA 4WQ4A 4UY8O 5AQWA 3EL2A 3JAMO 4LF5K 3O3FA 3HPHA 4H0PA 2BE2A 3OJUA 2G8UA 4PY5A 2KFZA 4O0IA 2QKBA 2HVIA 2PY5A 1S3XA 1IBKK 4FYDA 3LZJA 5HRNA 3MAQA 1MWKA 4KKOA 2E1ZA 5HOOA 1BUPA 2X78A 4CGHA 4B08A 1NK7A 3T19A 3ULDA 3OYKA 2ASOA 2P9LA 3CJAA 3VOVA 1TL3A 3KLHA 4IXCA 4KO0A 3NMUA 2NNWA 5AQRA 1RT2A 3VTIA 4DV7K 4DR2K 3QDKA 3M8PA 3TANA 1JL2A 4PWDA 1XNQK 3L4IA 3V6DA 4I6MB 3AGKA 4MO4A 1W0HA 4GKKK 4DB3A 3EE9A 3K9JA 5AQIA 3CPWM 3F5TA 1XC3A 3O8MA 4CFBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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