4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Contractile protein
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
1ATRA 1TUYA 2P9KB 2YI1A 3LM2A 3QICA 1NGIA 4BRCA 3KHYA 4BGBA 4H0VB 4BR9A 4Z94A 2E8AA 1DEJA 2FXUA 4O5FA 4IO8A 4MLHA 2CGLA 3AY9A 2ZGZA 4BRQA 3GBTA 4FOIA 1E4GT 4A2AA 2YJFA 1U2VA 2J4RA 3S41A 4BRLA 5LY3A 4H0TB 1IG8A 4B1ZA 1BA1A 2FF3B 4FWMA 2P9SB 2I7PA 5AZJB 4BRGA 1NM1A 1KAXA 4HWIA 1T6DA 3FZLA 1TUUA 1JCFA 5BPNA 3CJ1A 5B8HA 3ZX2A 2P9UA 4B1WB 3M6GA 4H5VA 4FL9A 3A5NC 2QWNA 3IFRA 1Z6RA 2E1ZA 3AARA 5BR9A 3WXKA 2QWRA 1NGDA 4NB4A 2P9PA 4B9QA 5AQFA 3VESA 2W41A 3ZEUB 4O8KA 3VOVA 4BC4A 3CJBA 4DQ8A 1OKJA 4XH5A 2D4WA 2QWLA 4Y0WA 1XQSC 2CGKA 1K8KB 4C23A 4BREA 4PKGA 2EWSA 2QWQA 3FZKA 4XH4A 3U9DA 3H1QA 1HLUA 1JCEA 3RSEA 3VGKA 3EKUA 4FSVA 4B1UB 3FR0A 3BUZB 4IWVA 1U2VB 1ZBSA 2PAVA 1C0FA 3ID8A 2D1KA 5JLFA 2ZWHA 4YDUA 4FWLA 1V4SA 4IJAA 4QS9A 4YDUC 5AQQA 2ZF5O 4EAHD 1V4TA 1S22A 2A5XA 2QM1A 3A5OC 3B8AX 3D7EO 5AZIA 2ITMA 4BRAA 3LL3A 4EHTA 2P9UB 3QFUA 4A2BA 4BR4A 4CZJA 1QQNA 1RFQA 2E20A 1MA9B 4H5RA 3SJHA 3FFKB 4FWNA 1Q18A 2FLOA 2VCPA 4BRIA 3FZHA 2FSNA 3WXLA 3A0IX 1LOTB 4RTFD 4CZMA 3BF1A 3C7NA 2WUSA 5FPEA 2QWPA 3J8AA 4FWKA 1DGKN 1WOQA 1G99A 2Q0RA 1GLAG 5F0XA 4B1VA 5ELZA 2D0OA 1GLEG 1NGFA 4I6MA 1BUPA 1HX1A 4BRKA 4GNIA 5AQKA 1SAZA 4H0OA 4H5TA 3UKRA 3SK3A 3FZFA 2V52B 3DJCA 2Q97A 4GY2B 4BR0A 4LC9B 1P8ZA 3SLCA 1HKCA 3GG4A 1CZAN 3L4IA 4ISEA 4BROA 4AM7A 3O1BA 5AZIB 1ZXOA 3F9MA 3D2FA 2DPNA 1NGBA 4K25A 4MO4A 3H3OB 2E2OA 5E84A 1J6ZA 3QBWA 4FWPA 3H6EA 1NGJA 1GLCG 4M63C 3ULEA 4IXCA 3H3NO 3W0LA 1H1VA 3C7NB 4IZ9A 3WEEA 3OHRA 2HOEA 3BF3A 4M7XA 1Z05A 1KXPA 1XUPO 4JHDA 4BRMA 1JCGA 5KPRA 3IUCA 4I6MB 3UKUB 2V7YA 2YHWA 2F9TA 5JMVA 3I33A 1BWFO 5E26A 3H45C 5KQDA 5BN8A 1YVNA 5AQOA 3VEOA 2VYPA 1NWKA 5AQUA 4BGAA 1BG3A 4XEIA 4BC2A 5AR0A 4CZKA 4BVPA 3ATVA 4K43A 4BRHA 5EXWA 1BA0A 5AQGA 1HUXA 4BRFA 4EFHA 1RGIA 1EQYA 2ASPA 3HI0A 2P9IB 3CJCA 4MO5A 3MN6A 1QQOA 4JAXA 1NGCA 2OANA 3CI5A 3ULEB 4CZHA 4XH1A 4PKHA 1X3MA 3LDQA 3R6MA 1D4XA 3WEEB 3CETA 2ASOA 1MWMA 5AQVA 1NGHA 3H1VX 2A40A 4MLEA 5EY4A 3VEVA 4EHUA 4CZGA 1BDGA 1TYQA 3M1FA 3U4LA 4L3QA 5JICA 4CJ7A 1XC3A 4ISGA 3HZ6A 5FPNA 3VGLA 2P9NA 4JD2A 4BR2A 3KVGA 1KAYA 3VEXA 5KQ8A 3VETA 2D0PA 2VWBA 2BUPA 2P9PB 1RDWX 4CD3A 4BQLA 4AM6A 5AQWA 4M7YA 4B1XB 2NLXA 4RCHA 3VF4A 1S3XA 3G25A 2E2PA 3HTVA 3DAWA 3GL1A 2YHYA 1IJJA 1YAGA 3R8EA 4WQ5A 3MK6A 4WQ5C 5TKYA 3CQXA 1HKGA 1QQMA 3KZBA 5AQTA 2Q1NA 1ATSA 2I7NA 4WQ4C 2IIRA 4WQ4A 3LDPA 4E1JA 4BVOA 2P9KA 3RSEB 2YCHA 3MCPA 5LJVA 3O1WA 3WT0A 4RWTA 1SZ2A 3L6QA 3M3ZA 2A3ZA 2QWOA 3A5LC 4F9OA 1QHAA 1TYQB 4CZEA 2HMPA 4FWRA 4JNEA 4H0PA 1C0GA 3BP8A 3EKSA 3TPQA 2BTFA 3MMVA 2E1YA 2Q2RA 2P9NB 1DKGD 1GLJO 2GWJA 4PL8A 2E2QA 1HPMA 1LCUA 3MN9A 3ZETA 4IJNA 5I9EB 4PL7A 4DB3A 5AFUA 1QZ5A 1YUWA 5BRDA 2QWMA 5F1XA 3LDOA 5BRFA 4QS7A 1U6ZA 1KAZA 4WYBA 3U9ZA 3C0BA 1GLFO 5AQXA 2CH5A 4PKIA 3EZWA 3P4IA 2F9WA 5AFUH 1ATNA 3VEZA 5EX5A 3ZX3A 4BQZA 3LDNA 3QMLA 4DCHA 3JXUA 1QZ6A 3EN9A 4FOEA 3FZMA 3VF6A 1T6CA 3GDQA 4CD1A 4CI6A 5AQZA 1K8KA 4K42A 2IVOA 5AQIA 4K41A 3GOIA 3O8MA 2NRHA 3UKRB 4FPBA 3O6WA 5BRHA 3EL2A 3W3DA 5AQMA 1NMDA 3MN5A 1HKBA 5JLHA 1ZC6A 3IMXA 2ZGYA 3WXIA 4CBWA 3MN7A 2HF3A 2A6AA 3LDLA 3D2EA 3EO3A 2Q31A 4FWSA 4BRPA 3QB0A 4FPAA 4BR5A 4CZFA 3IDHA 3D2FB 4CZIA 3HBTA 3ZETB 4A62A 1T44A 3CQYA 3WXJA 1HJOA 2FSKA 4H5WA 4BG9A 4ISFA 5EOYA 3O4WA 4BR7A 1NGGA 1YXQA 2QXLA 3A5MC 4FWOA 3SMPA 3FE1A 4KBOA 3VPZA 3VEYA 1WUAA 1NGEA 4H0YB 5AQRA 4H0XB 3WQTA 4JHDB 4HTLA 2FSJA 3DXMA 2YJEA 2IVPA 2KHOA 4NO7A 1BU6O 3CIPA 3O80A 2IVNA 2AA4A 3HM8A 4BC5A 5FPMA 2GEMA 3DXKA 1MWKA 5KPTA 5F2RA 1BO5O 3R9PA 2Q36A 3JS6A 4CBUA 5CE3A 3FLCO 3CJ9A 3MDQA 5FPDA 1GLDG 2H3GX 3CERA 3CJ7A 2Q0UA 3GE1A 5AQSA 2YHXA 5AQHA 1MDUB 5BPLA 3VERA 3FGUA 2W40A 3D2EB 4BC3A 5AQNA 2AP1A 2E88A 2GUPA 5AQJA 5AQLA 3ENHA 1X3NA 2A42A 3BEXA 3WUHA 2CH6A 2PBDA 4FO0A 3O08A 2V7ZA 4J8FA 3AAPA 3AAQA 1X9JA 3QDKA 1SQKA 4JN4A 2P9LA 5KPZA 3WQUA 2CGJA 5AQPA 3ENOA 4CBXA 4EIAA 3QFPA 1R59O 3L0QA 3VEWA 5AQYA 3VF2A 4A61A 3A8YA 3ZX0A 5BPMA 1ESVA 1E4FT 3ATUA 1NLVA 3UE5A 1GLLO 4B1YB 3TU5A 2GTDA 3DXMB 2E2NA 1GLBG 4FWQA 3HSCA 3SMSA 4BRNA 2QW9A 3DXKB 4H5NA 3UKUA 2ASMA 4JD2B 2V51B 2GELA 3I8BA 3U8XA 5ADXA 2P9SA 5AZJA 4BRDA 3LM9A 3CJAA 4DHYA 2HF4A 3CHWA 3DWLA 3O5BA 4BG8A 1NBWA 1NGAA 2FF6A 5ADXH 1Y64A 4CZLA 5BREA 2NZTA 2A41A 3QBXA 5EVZA 4H03B 3ZEUA 4QS8A 3H46O 5BN9A 2UYTA 3VENA 3VGMA 2GWKA 2P9LB 3UB5A 5LJWA 2P9IA 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBYA 3TAQA 3ZSVA 4CJVA 3CFRA 3LM2A 1NU0A 4GMJB 2DFFA 4X65K 4B9LA 3KHYA 4Q5VA 3V6DA 3V9UA 3ZT2A 4IO8A 5HL7L 3AY9A 2ZGZA 1EX4A 3SUQA 3QEPA 4FOIA 1E4GT 2YJFA 4OLAA 3CFPA 1YJWN 3SNNA 3S41A 4F2RA 5EU7A 4BRLA 5LY3A 4F3OA 4I2PA 3KWIA 3AVCA 2HNDA 3IAYA 2RKIA 4PWDA 1IO2A 3LP2A 3V9XA 5BPNA 4B1WB 4H5VA 1ZBHA 2NRRA 3JAMO 3HP9A 3IFRA 4DFPA 4LH5A 4JK8A 4B9QA 3VESA 3T7ZA 1QE1A 3BGRA 1ASVA 4CHZA 2HHHK 3SI6A 1NJIO 4DTNA 4DQ8A 1NOZA 1JLFA 2D4WA 2QWLA 2Z1GA 3DRSA 3KD5E 1TKZA 2QWQA 1RTDA 4YNQA 3H1QA 1OH8A 2D0CA 4CESA 3BUZB 5A2QO 1U2VB 1ZBSA 3CXCM 2PAVA 1C0FA 3DLHA 4YY3K 2ZJQL 4HUFA 2IDOA 5JLFA 1L5UA 4KREA 4YDUC 4QS9A 1MU2A 3QNOA 1V4TA 3V9SA 1VRUA 3A5OC 4JEPA 5MLCQ 4LSNA 2BH1A 3DRPA 2P9UB 3QFUA 4BR4A 1RFQA 2PYLA 3AO3A 2E20A 1Q18A 2VCPA 4BRIA 1O1WA 3K9KA 5DM7L 4KH4A 1KQSM 4CZMA 1QVFM 5FPEA 4B1VA 4DR1K 1JLGA 1NGFA 3VQ8A 4FLTA 1VSFA 4CEBA 1HX1A 3TSPA 4BRKA 3AVJA 4GNIA 4AH9A 3CD6N 5AQKA 3DLRA 4H5TA 3UKRA 3AVFA 3SLCA 1HKCA 2RHKA 4BROA 1RTJA 2HVIA 4FW1A 4AM7A 3MWPA 5C2FA 1VQ7N 4KV8A 1ZXOA 3VQPA 3TWHA 1QSSA 4OKEA 1XHZA 1NGBA 3AVGA 4KB0A 1WSEA 1CXUA 4IEIA 2RF2A 3QEIA 4AQYK 4IDKA 3RMDA 4IZ9A 4DQSA 3HSTB 3CPEA 2HOEA 4M7XA 1HPZA 3BY5A 3M8QA 4N56A 1XUPO 4JHDA 4BWMA 3K0SA 3RMBA 3KTQA 3EE8A 1CZBA 3THYA 2YKMA 4NXMK 1BWFO 1KLMA 3NMUA 1QSLA 4KTQA 3CCUN 3NH0A 3OS2A 1S9EA 4CJLA 4CZKA 2G8UA 4CEFA 4K43A 4FJXA 2O8CA 3A2FA 3AA2A 2VG7A 3DOLA 4C8MA 1NK8A 1VSHA 1XMOK 1NG9A 4A57A 4EFHA 3P39A 3F73A 2ASPA 1IV0A 3HI0A 4CGGA 4FJ5A 5KGWA 1NGCA 3O3FA 3L8BA 1Z25A 3I0RA 3WEEB 3CETA 4M3RA 5AQVA 5GAHP 1NGHA 4DUYK 4JV5K 2A40A 5EY4A 4EHUA 4CZGA 4A59A 1BI4B 4M41A 3U4LA 3OYDA 4L3QA 2VWJA 1YT3A 3CFOA 4KB1A 4CJ7A 1XC3A 4ISGA 4BR2A 4CJ5A 3NVMA 2G8KA 3VEXA 3AVIA 3MX2A 3Q7BA 1RDCA 3L2QA 4Z4CA 2D0PA 2BUPA 2P9PB 4CD3A 3K58A 3QINA 1NKCA 3VF4A 1Q7YO 4M3TA 1S3XA 1SV5A 3QIOA 4CJRA 3MECA 4WFAL 3SPZA 4KHSA 3R8EA 1WSFA 3DLBA 3MK6A 3IRXA 3H08A 2Q1NA 4WQ4C 4C1NI 3LDPA 4E1JA 1X1PA 4OPJA 2YCHA 2NRTA 1Q9XA 3MCPA 5LJVA 1HNWK 1QS4A 5KI6A 3M3ZA 1U45A 2QWOA 4F9OA 3MEEA 2HMPA 5IT9O 2QI2A 4DTOA 3VMFB 1ZBIA 3O9QA 3O4NA 3TPQA 1CXQA 3C6AA 4IDHA 4DQIA 3CCJN 1UAXA 1GLJO 3LAMA 4KTZA 1IBKK 2GBZA 1HPMA 3MN9A 3OY9A 4AHSA 2BANA 1EETA 3JYTA 5F1XA 4QS7A 4OPKA 3SBGA 4C8OA 4CJKA 1N36K 2OA8A 3QLHA 3HK2A 3C0BA 3RRHA 1GLFO 5AQXA 2CH5A 4JKHA 5AFUH 3NBPA 1VQ5N 2YNFA 3T69A 4FJ8A 5HOOA 3ZX3A 1HNZK 4DCHA 4B9UA 2D0BA 3EN9A 1IBLK 4N47A 2IOCA 4K42A 3G4SN 3S9HA 3MXIA 3SPYA 4JKEA 4FPBA 4YFUA 4B3RK 4GKKK 2O8EA 3W3DA 1HKBA 3R1XA 3QEXA 3IMXA 2QXFA 3L2VA 3WXIA 5CR4A 4BRPA 4FCYA 1C6VA 3D2EA 4HCCA 4FJHA 4DTUA 4BR5A 3AO2A 4CZFA 3CCLN 4ELVA 1K9MO 3D2FB 1JLQA 2F4VK 1T44A 4GV9A 2YHBA 4HUGA 1JLAA 2FSKA 4E7JA 1JLCA 1B92A 3CM6A 4BR7A 4A5BA 3SAGA 4FJJA 1REVA 4JI6K 5CHIA 5DMRA 3VQBA 4PQUA 3SMPA 1NKEA 3VPZA 1C0UA 2IGIA 3LP0A 1WUAA 4RW9A 4H0XB 1WBDA 4M3ZA 4QAGA 5GAGP 1BIZA 4HTLA 3VQ6A 2KTQA 5FDLA 4NO7A 1BU6O 3CIPA 2BE2A 2IVNA 2AA4A 2JWLA 3O80A 4GVMA 4BC5A 3OS0A 3IS9A 3DXKA 2OPRA 1FJGK 3FLCO 3MDQA 3CERA 2Q0UA 2YHXA 2D0AA 1NNEA 1MDUB 3VQAA 4B8CA 1OH7A 3FGUA 1T05A 1XC9A 2HHSA 5C10A 4MFBA 2O4GA 5AQNA 3TAPA 2E4LA 4JI1K 2QEXN 4J8FA 2V7ZA 1LAWA 3AAPA 4M3XA 3T1AA 3C6TA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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