4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Contractile protein
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
5BR9A 4BRHA 4BROA 2FF6A 1U2VA 1NGAA 4IWVA 5BRDA 5JMVA 5AZIA 4BRDA 4CZKA 4BRQA 1NGIA 2ZGZA 1GLLO 2GELA 3WT0A 4MO4A 3EKSA 5ADXA 3VGMA 3CJ1A 2E2QA 3J8AA 3FZFA 3CIPA 1D4XA 2E1ZA 1BWFO 4H5TA 5JLFA 1WOQA 4IJAA 5AQKA 3A5OC 2QWQA 3EL2A 3RSEA 5BPLA 3DWLA 3M3ZA 1ATSA 2A5XA 4GNIA 4CBUA 1NGDA 4HTLA 3FFKB 4CBXA 4PKHA 4RWTA 2BTFA 4EAHD 3ULEB 4BRGA 4B1VA 3C7NA 4H03B 3BUZB 2A6AA 2V52B 4BR7A 3LDOA 4KBOA 5AQVA 2F9WA 1QQNA 4JHDA 4L3QA 4BR2A 1BA1A 4WQ5C 3VEZA 5EXWA 3EN9A 3GG4A 3A8YA 3I8BA 1KAZA 3D2EA 5KQDA 2ITMA 1NLVA 2W41A 3VERA 4BVPA 1BOTO 3A0IX 5JLHA 2ASPA 3CETA 1DEJA 1ZBSA 2FSNA 4MO5A 5KPTA 2HF4A 4BRPA 5AQXA 2D0PA 4J8FA 3DXMB 1RDWX 3M1FA 1Z05A 1X9JA 3CQYA 1MWKA 3VETA 1JCEA 3AAQA 4WQ4C 4BGBA 2ZWHA 5AQLA 1HKBA 3EKUA 4EFHA 1K8KB 1HKCA 2V51B 2HOEA 4JD2B 1YUWA 4A62A 3FR0A 3KHYA 4BRKA 4BRIA 3WXIA 2Q2RA 3KZBA 4M7XA 4H5VA 4FWSA 1ZC6A 1BA0A 3WXLA 5AQGA 5BRFA 2A42A 3BEXA 5AZIB 3QBXA 3VOVA 4CD3A 3LL3A 4FWQA 5AQUA 2P9PB 1T6CA 1NBWA 4XH1A 4FWOA 2E2NA 4CJ7A 2H3GX 3D2EB 1V4SA 4H5WA 2P9LB 1MWMA 5AR0A 2P9UA 4MLEA 2YJFA 1NM1A 1QQOA 3G25A 4BRAA 2Q31A 3F9MA 1GLDG 3QICA 4BRCA 4PKIA 2GTDA 2QWPA 4LC9B 3GL1A 3VEVA 3JS6A 1GLJO 2E8AA 4F9OA 3L0QA 4FOIA 2ASMA 1YAGA 1QQMA 3A5MC 3BF3A 3TPQA 4JN4A 3C7NB 3VGKA 2NZTA 1T44A 2E20A 1Q18A 1IJJA 1QZ6A 1XC3A 3ZETB 1J6ZA 1BUPA 1MA9B 3I33A 1MDUB 3WUHA 1P8ZA 3FZLA 4EIAA 2I7NA 3HBTA 3O8MA 2DPNA 4MLHA 3UB5A 4O5FA 1S22A 1NWKA 5FPMA 4FOEA 4BVOA 3H3OB 5ADXH 4BR5A 2AP1A 3C0BA 1NGJA 3OHRA 4NO7A 3CJAA 3VF4A 4BC4A 2Q36A 1HJOA 3ZX3A 4BREA 5AQRA 5TKYA 4CZJA 3LM9A 5AQYA 3LDNA 2QM1A 2IVOA 3ZEUB 1KAYA 2FXUA 2PBDA 4K42A 4BRNA 4ISEA 5FPEA 4JD2A 2D4WA 3CJBA 3FLCO 3QBWA 1GLBG 1NGHA 3RSEB 4BQLA 3DXKB 4Z94A 2D1KA 5AZJB 2P9SA 3M6GA 3VEWA 2KHOA 4IXCA 4CI6A 3ID8A 4XH5A 5KPRA 3WQUA 3VPZA 4I6MB 4CBWA 4M7YA 4HWIA 1S3XA 3AARA 4DB3A 2Q97A 2P9UB 4JHDB 2NLXA 4AM7A 1HUXA 1SAZA 2Q1NA 3MMVA 2GWKA 1TUYA 1NGFA 3BF1A 4K25A 1BG3A 4H0PA 3QFUA 2VWBA 3QFPA 5AQFA 4FPBA 2QWOA 3MN9A 2QXLA 4RTFD 4DHYA 2P9KB 3SJHA 5I9EB 5BPNA 3GE1A 4B1XB 1QHAA 4QS8A 4C23A 3ENOA 3WEEB 4CZFA 4BC5A 1HLUA 4B1YB 4EHUA 3O80A 4K43A 4QS7A 4H0YB 4YDUA 3ZETA 3H3NO 3CJ7A 4ISGA 2P9SB 2EWSA 4XEIA 3EZWA 4A2AA 4JNEA 5BREA 2QWMA 2CH6A 1NGCA 5LJVA 4IZ9A 5KQ8A 1ESVA 3CQXA 2YHWA 3WXKA 3VF6A 4B1WB 5FPNA 1KXPA 3A5LC 3VEXA 2YCHA 5EVZA 1JCFA 4JAXA 3QMLA 4A2BA 3DJCA 4BRLA 5BN9A 1BO5O 3UKRA 2FLOA 1JCGA 4A61A 2OANA 4GY2B 5CE3A 4B1UB 4IJNA 1RFQA 3IFRA 3AAPA 3D2FA 3UE5A 2P9LA 3LM2A 3ZEUA 1KAXA 4FWKA 1ATNA 4BRFA 4CZLA 1XQSC 4E1JA 4FPAA 1HPMA 1SQKA 2V7YA 5EOYA 3MN6A 4BGAA 2F9TA 2P9IA 3DXMA 3ZX0A 2QW9A 3WXJA 5EX5A 3IUCA 1U6ZA 3HI0A 1E4GT 1YXQA 2CGKA 3IDHA 2GUPA 1RGIA 2A40A 3SMPA 3SMSA 2D0OA 1OKJA 5AQJA 2E1YA 1U2VB 5AQOA 4FWLA 5F1XA 3HTVA 1BDGA 2IVPA 1E4FT 3UKRB 1HKGA 2WUSA 4H0OA 3VF2A 1TYQB 3GBTA 3MN5A 3AY9A 3MK6A 5EY4A 3U9DA 3WEEA 2FF3B 5JICA 4FWPA 3FZMA 3MN7A 5E26A 1CZAN 2ZGYA 4FWMA 2P9IB 5AQIA 2A41A 1QZ5A 3O6WA 4H5NA 4AM6A 4PKGA 2W40A 3B8AX 1XUPO 3ENHA 3U4LA 4BRMA 1GLEG 1X3NA 1LOTB 5AQTA 3ULEA 2GWJA 2YI1A 5BRHA 3GDQA 3L4IA 5AQNA 3H1QA 4Y0WA 4CZIA 4B9QA 3O1WA 2E2OA 3LDQA 4QS9A 3L6QA 1ZXOA 2CGJA 4K41A 4CZMA 5AFUA 3R6MA 4FL9A 1T6DA 1TYQA 2QWLA 2A3ZA 4RCHA 3QDKA 2P9NB 4DCHA 1SZ2A 4BR9A 3TU5A 4CZHA 1DGKN 4WQ4A 4M63C 3VESA 3CI5A 3ATUA 3O08A 3O5BA 1C0FA 4BR0A 3S41A 1Z6RA 2I7PA 3HZ6A 3UKUB 2P9KA 4O8KA 1YVNA 3CJCA 3SLCA 4FSVA 5AFUH 4FWRA 3H45C 1NGGA 3D7EO 5FPDA 1WUAA 4BC2A 3O1BA 2QWRA 3VEOA 3CHWA 5AZJA 5F0XA 2P9PA 2PAVA 3HM8A 1R59O 1TUUA 3A5NC 2IVNA 3WQTA 5AQWA 3JXUA 5BN8A 3FZKA 2E2PA 2ASOA 3ZX2A 3H6EA 2V7ZA 3CJ9A 4BG8A 4ISFA 4EHTA 3LDLA 1V4TA 4BG9A 5AQSA 3MCPA 3W3DA 1NGBA 1ATRA 5ELZA 3UKUA 2CH5A 2HMPA 4PL7A 2YJEA 3D2FB 4DQ8A 3GOIA 2QWNA 4H0XB 3U8XA 5AQZA 1K8KA 3VEYA 1LCUA 5BPMA 4WQ5A 3FGUA 4CZEA 5F2RA 3HSCA 1IG8A 2J4RA 3VENA 4BR4A 2YHXA 3ATVA 2AA4A 2NRHA 2HF3A 3FE1A 3EO3A 1DKGD 2GEMA 1Y64A 3MDQA 1GLAG 1NGEA 4XH4A 4BC3A 1X3MA 2P9NA 4FWNA 4H5RA 5AQMA 3R9PA 1GLFO 5KPZA 4B1ZA 4I6MA 1GLCG 2Q0RA 5AQPA 3H1VX 2YHYA 1EQYA 4H0TB 1NMDA 3BP8A 3FZHA 4IO8A 3W0LA 3DAWA 2CGLA 2VYPA 4H0VB 1HX1A 2IIRA 3CERA 4CZGA 1G99A 3QB0A 5LY3A 2VCPA 4FO0A 1C0GA 5AQHA 1H1VA 3O4WA 4YDUC 4NB4A 5LJWA 2Q0UA 3DXKA 4PL8A 2E88A 5AQQA 4CD1A 5B8HA 2UYTA 2ZF5O 3KVGA 3LDPA 3U9ZA 4WYBA 3SK3A 3VGLA 4BQZA 2FSKA 5E84A 2FSJA 3P4IA 2BUPA 3R8EA 3H46O 3IMXA 1BU6O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TARA 1S9EA 4BRHA 4JKHA 4WFBL 3CC4N 1XI1A 4IOAL 2FF6A 4PHTX 5M1QA 3ZT1A 4DTPA 4B9TA 4CJPA 5JMVA 4CZKA 1KLMA 1TK5A 1D5AA 2GELA 3LAMA 4BDPA 5ADXA 1YF5L 1T05A 1JXEA 3J8AA 3QIPA 3AVFA 4OLBA 4M42A 1EWRA 2IAJA 4H5TA 1WOQA 1BHLA 4IOCL 5BPLA 1FXXA 4GNIA 4LF4K 4CBUA 1NGDA 4HTLA 3FFKB 4CBXA 3HVTA 4PKHA 3HL8A 2HHTA 3DLKA 3ULEB 4BRGA 4EAHD 2A6AA 2V52B 3OTOK 5GAGP 1ASWA 4FW1A 4WQ5C 5EXWA 3EN9A 3CF5L 3GG4A 3A8YA 4JI8K 1RTDA 1S5JA 1KAZA 4ID1A 2ITMA 2PYJA 2F7TA 3SV4A 3CCRN 4MO5A 5KPTA 3OYGA 1IKVA 3VQAA 2ATQA 2PYLA 4J8FA 3DXMB 4MDBA 3TSPA 1X9JA 2BDPA 3VETA 4FCYA 4M3WA 2ZWHA 1HKCA 4GKKK 2FBXA 1HPZA 3NF9A 1YUWA 3FR0A 4BRKA 2Q2RA 1ZC6A 4NLCA 1L3VA 4OGCA 1RDDA 4MDAA 4XH1A 2HHUA 3D2EB 2O8CA 3DOKA 4CEZA 5AR0A 4MLEA 3G25A 4BRAA 3LDSA 3CCSN 3HJFA 1BIZA 3VQ4A 5A2QO 3AVCA 4LC9B 4CGDA 1HNZK 2F8SA 3JS6A 2E8AA 4DFPA 2GBZA 1MU2A 4DV6K 3LPUA 1OVYA 4NLBA 1YAGA 1QQMA 1BQMA 1NJZA 3CXCM 4U67L 2IGIA 4FJ5A 1NK0A 5JS1A 3M8PA 3SPZA 1HYVA 3HM9A 1MA9B 4CF8A 3I33A 1HYZA 2I7NA 3HBTA 3O8MA 4CHZA 3UB5A 3F73A 3SAHA 4FOEA 3H3OB 4BR5A 4LF9K 3OYMA 1NOYA 1TK0A 2A1RA 4NO7A 4IFEA 3CJAA 4WCEL 3T3FA 4B9SA 4BWJA 1WAJA 3HP6A 4CZJA 3LM9A 5AQYA 4NCBA 3OS0A 4CHPA 3QESA 3ZEUB 4M45A 1KAYA 2PBDA 3PSFA 2FBYA 3QEVA 3CJBA 5GIPA 1GLBG 1NGHA 4DTOA 4GMJB 1YI2N 4Z94A 2KKZA 2D1KA 2P9SA 3M6GA 1VK0A 3ZT3A 1VQMN 2ZD1A 4WE1A 1EXQA 3WQUA 1NK9A 1CZ9A 4M7YA 4E7JA 1WBDA 3AARA 4JI2K 3ZSQA 2Q97A 2UUAK 4AM7A 2Q1NA 1SAZA 3MMVA 2GWKA 2HVIA 3OYCA 3MEDA 4FLVA 3V9WA 1VSDA 2D5RA 1SL2A 4FZYA 3QFUA 4BY9C 4JI6K 4RTFD 3NF6A 4DHYA 2P9KB 4IFVA 4DTJA 5BPNA 4FK4A 3GE1A 4B1XB 4QS8A 4C23A 1QVFM 4WFAL 5C2DA 3J7ZO 1VQ7N 1SV5A 4H0YB 4YDUA 4CF1A 1TL3A 1ILYA 1TL1A 4CJEA 4JNEA 5BREA 2HBMA 5KQ8A 3AVIA 1U48A 4V19S 1ESVA 4M3XA 3CQXA 5M1OA 5CHIA 1Z25A 2Q3SA 2UUCK 1WSEA 1KXPA 3A5LC 3CCMN 3TAMA 3NF7A 5DMRA 3DJCA 4J2BA 3KTQA 1BO5O 1JCGA 3ENBA 1J54A 5T7BA 4N76A 5M1KA 4DQRA 3SUOA 3WNFA 3IFRA 2FBVA 3AAPA 2G8VA 3ZEUA 1VSKA 3AV9A 3F2KA 4DV4K 2OZSA 1T03A 3N4PA 4F2RA 1XQSC 3G6EN 1YJNN 1SQKA 2B5JA 5EOYA 1K9MO 1RT3A 1HQEA 4BE1A 3RR8A 1CXUA 2QW9A 1LV5A 3LWMA 3BGRA 2FC0A 1RTHA 2CGKA 1C0UA 1RGIA 4E1MA 4DTSA 4B9MA 4AHTA 3SMSA 2G8WA 1IBMK 2E1YA 4LF5K 1NJXA 3V6DA 1W2BM 4TSXA 4Z0UA 3L2RA 4DSKA 3AGRA 5CY4A 2WBNA 3GBTA 3CFPA 1SKWA 3OYKA 3O9QA 4DV1K 5EU7A 4FJNA 5C10A 3THVA 2FF3B 1L3TA 1JL2A 1R0AA 4NCAA 4CHNA 2FBTA 1JLFA 4FWMA 2B6AA 1L3SA 4JKEA 1ZYQA 1QZ5A 3AA3A 1NJIO 1WSHA 4PKGA 3OYIA 4I7FA 3P38A 1XUPO 1J53A 1RT6A 4E1NA 1LOTB 4IBNA 2BE2A 2ZQBA 5BRHA 3L4IA 1WNSA 3PV8A 3H1QA 4CZIA 2ZM6K 4YFUA 1NOZA 4DSIA 4FJ9A 2VG7A 1N5YA 2P5OA 1ZXOA 1BI4A 3I8DA 4FL9A 1RDUA 4OJRA 4RCHA 1TYQA 3ZSOA 2A3ZA 1SZ2A 4OKEA 4BR9A 5HBMA 3NH0A 5C12A 4E3SA 4CGGA 2HVHA 3MEEA 4CFDA 3O08A 1KFDA 3QEPA 4MQ3A 4B3MK 4OPHA 3VA0A 2I7PA 4GVMA 3LPTA 4FM1A 1NK8A 4FWRA 3LZIA 4FJ7A 3OYNA 3VQPA 2XY7A 4BC2A 3O9SA 3O1BA 1I94K 3CHWA 3K5MA 1I3AA 1VQPN 2PAVA 3HM8A 1C0TA 3A5NC 2IVNA 4CK2A 2F8TA 1RT7A 2YNGA 4RW9A 1TKDA 4DU1A 3D45A 1YITN 4CFCA 3OYBA 3OW2M 2O8FB 1V4TA 5AQSA 3K5OA 1ATRA 3I0SA 3MEGA 2YJEA 3TSQA 3GOIA 1OH7A 2QWNA 1LCUA 1FW6A 3CPWM 3MXIA 4JKCA 3KKRA 5SWMA 2YHXA 2AA4A 2NRHA 1D9FA 1BI4B 2GEMA 3MDQA 1L5UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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