4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
b'DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Contractile protein
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
3CJCA 3M6GA 3UE5A 2V51B 1KAXA 3MN7A 2D0PA 3FFKB 2P9NA 3BEXA 3MN9A 4B1ZA 2BTFA 4YDUA 2QWLA 4EHUA 4I6MB 4JHDA 3LDNA 2A5XA 5BRHA 1G99A 3HTVA 3DAWA 3VEZA 2NRHA 4BG8A 1NGBA 4H03B 4CZEA 3CETA 2ASPA 2P9UB 4DB3A 2E1ZA 3O8MA 2YHXA 5I9EB 4CZLA 4CI6A 1IG8A 5FPMA 2P9IA 3ENHA 3VEXA 2E2PA 4BR5A 1Y64A 5F1XA 1TYQA 3H45C 3CHWA 1ZBSA 2QW9A 1BUPA 3HI0A 4K42A 2KHOA 2J4RA 4BRMA 3ATVA 4FWKA 1YAGA 3UKUB 4XH1A 1QZ6A 2BUPA 3H3NO 5AZIA 4A62A 2YHWA 3QDKA 4LC9B 3H1VX 3D2FA 4H0OA 5ELZA 2P9SB 3C7NB 1QQNA 3CQXA 4FWPA 1KXPA 1NBWA 3VOVA 4Y0WA 2P9KA 3VEVA 2Q31A 1GLBG 3CERA 1D4XA 4H5TA 5AQWA 3IUCA 4AM7A 3R9PA 3TPQA 4EIAA 4WYBA 4BQLA 2P9NB 4WQ5A 2VWBA 1RDWX 3LDOA 2Q0RA 2A40A 2ZGZA 4H5VA 4JHDB 1BO5O 4XEIA 5ADXH 4A2AA 5AFUA 2ASMA 3CJ1A 4BR7A 3SJHA 4JD2B 3VENA 3A5MC 4BC3A 5JLHA 1NGEA 1JCFA 2QWPA 1HKBA 3M3ZA 2GEMA 3O80A 3VESA 4I6MA 2GTDA 4H0YB 2FF3B 2IVPA 3VERA 3SMSA 3WQUA 3FZKA 3U9DA 1TYQB 1P8ZA 4FSVA 2PAVA 4GNIA 5AFUH 5AQTA 3S41A 5LJVA 3IDHA 3A5NC 3WEEB 3C0BA 2E88A 3AAQA 2P9UA 4NB4A 2QWQA 3UKRA 2AP1A 5BPMA 2W40A 3ENOA 5AZIB 3UB5A 5AQRA 4RWTA 4BREA 2F9WA 3VF2A 2HMPA 2EWSA 4BRPA 1BWFO 3GE1A 3VGKA 1ZXOA 3H6EA 2FLOA 4FOIA 4Z94A 3L6QA 3U4LA 3U9ZA 1QZ5A 4BC4A 4BR9A 2ZF5O 1T6CA 3OHRA 4B9QA 1GLCG 3QFPA 2QWRA 4A61A 4JN4A 5F2RA 1KAYA 3WT0A 3VEOA 5LY3A 5BRFA 1S3XA 3O5BA 2P9SA 3P4IA 2ZGYA 1E4GT 3JXUA 4IO8A 4MLEA 1X3NA 2ITMA 4BG9A 4B1YB 3CI5A 1C0FA 4FPAA 5F0XA 4BR2A 3M1FA 3FR0A 3ZX3A 1CZAN 3BP8A 3H1QA 4O5FA 4EHTA 4F9OA 4IWVA 3D2EA 1ZC6A 2P9LB 3FGUA 5KQDA 3DXKB 3WXIA 4CD3A 2I7NA 3ATUA 1HPMA 1GLDG 1RFQA 3QMLA 4H5RA 5BPNA 5AQJA 4CZJA 3VETA 3BF1A 1U6ZA 1TUYA 5AZJA 3FZHA 2P9PB 4O8KA 2D4WA 4RCHA 1X9JA 3FLCO 5AQYA 4FWLA 4JD2A 1NMDA 3UKRB 4C23A 3CJ7A 4B1UB 2Q36A 3ZX2A 3W0LA 1J6ZA 1HUXA 4CBUA 4CZMA 1E4FT 5AQZA 4FO0A 4M63C 5AQQA 4PL8A 1Q18A 1QQOA 4H0XB 3O4WA 2D0OA 3EO3A 3WEEA 1GLLO 4BRLA 3F9MA 3LL3A 4BRDA 4M7YA 1K8KB 5FPNA 2OANA 1DKGD 4BGBA 2IVNA 1SZ2A 1Z05A 3MDQA 3QICA 3W3DA 2YJEA 4GY2B 2CGJA 4IZ9A 4M7XA 3WXJA 1KAZA 1RGIA 4WQ4C 5KPRA 1NGIA 4HWIA 3LDPA 4CZHA 3MN5A 4JAXA 3H46O 5BR9A 4BVOA 3D2EB 1XC3A 4BRQA 2FSJA 1NLVA 4FOEA 4CZFA 1LCUA 4CBXA 2YJFA 2QXLA 5BN8A 5BRDA 2CGLA 1S22A 1BDGA 4BRKA 2VCPA 5FPEA 1DGKN 5AQOA 4E1JA 3LDQA 1YVNA 4H0PA 5AZJB 5LJWA 3H3OB 2P9LA 3L4IA 3DXKA 4NO7A 4FL9A 1MDUB 1EQYA 2UYTA 1X3MA 1DEJA 4BGAA 5B8HA 4RTFD 4BR4A 4CD1A 3FZFA 4BVPA 1BG3A 3AAPA 5AQMA 3J8AA 1ESVA 1QHAA 2CH5A 2A41A 4BRFA 1MA9B 2P9PA 1T6DA 4HTLA 5E84A 4XH5A 5AQSA 5EX5A 3EN9A 2V52B 5AQFA 5KQ8A 2E2OA 2H3GX 3AARA 3D7EO 1NGFA 3I8BA 4BROA 1HJOA 2GWJA 3O08A 4J8FA 5EOYA 4H5WA 2E20A 1GLFO 2PBDA 4BRCA 3CIPA 4XH4A 2NZTA 4ISFA 3HBTA 1HX1A 5EVZA 3KHYA 3DJCA 4BRNA 4EFHA 3O1WA 5AQPA 1K8KA 1MWMA 4DQ8A 5JICA 4MLHA 2GWKA 1JCGA 4H0VB 1HKCA 3R8EA 3ULEB 4QS7A 2HOEA 3VPZA 5JMVA 3QFUA 1SQKA 3LM9A 3EKSA 2ASOA 3IMXA 2FF6A 5KPTA 1QQMA 4IJAA 1R59O 2DPNA 3BUZB 2FSKA 2A6AA 2D1KA 3R6MA 3A5LC 1T44A 3GL1A 2IIRA 5FPDA 1XQSC 3ZX0A 4BC5A 4BRIA 4A2BA 2E2NA 2E2QA 4H0TB 2CH6A 2A42A 1BU6O 4ISEA 2YCHA 4L3QA 4CZIA 3VEYA 3FZLA 4FWOA 4PKIA 4QS9A 4DCHA 4IJNA 2CGKA 2QM1A 1NWKA 1H1VA 3G25A 1NGAA 2YI1A 2Q1NA 4K43A 2F9TA 3GDQA 1GLJO 3A5OC 3HZ6A 4FWRA 5AQNA 1JCEA 2A3ZA 4FWSA 4K25A 5EXWA 4PL7A 1BA0A 3WXLA 3SK3A 3A8YA 4BRHA 4WQ4A 1ATRA 3MN6A 1XUPO 3QBWA 4B1WB 4DHYA 4K41A 1NGCA 1NGGA 2Q97A 3ZEUA 3GG4A 4YDUC 1WOQA 3DXMB 4BRAA 5AQVA 1NGJA 1V4SA 4H5NA 4FWMA 3CJ9A 3RSEB 3EL2A 3QB0A 2V7YA 1YXQA 4MO4A 3ZETA 4MO5A 4CZGA 2ZWHA 3LM2A 4QS8A 3GBTA 5E26A 4PKGA 2VYPA 3ID8A 3JS6A 3HM8A 1IJJA 3O1BA 1U2VB 2FSNA 5AQHA 1WUAA 3ULEA 1HLUA 3MK6A 4ISGA 2I7PA 3KVGA 5BN9A 3VF6A 2HF4A 1NGDA 4BRGA 2NLXA 3CJBA 4B1XB 3TU5A 2GELA 5AQUA 5ADXA 3I33A 4JNEA 3WXKA 1GLEG 5AQIA 3BF3A 4FPBA 2IVOA 3FE1A 3MMVA 3QBXA 3FZMA 4AM6A 3WUHA 4EAHD 2WUSA 2QWNA 2E1YA 3EKUA 3WQTA 2Q0UA 5AQGA 3O6WA 1TUUA 3L0QA 1GLAG 3ZEUB 4WQ5C 3VEWA 3GOIA 2GUPA 1YUWA 2HF3A 3HSCA 1ATSA 5TKYA 3B8AX 2FXUA 1LOTB 1BOTO 2P9IB 1OKJA 1BA1A 4KBOA 4CBWA 1V4TA 4FWQA 3SLCA 3ZETB 2QWOA 4BC2A 4PKHA 3CQYA 5KPZA 5BPLA 1SAZA 5AR0A 3VF4A 3DXMA 2AA4A 1MWKA 1HKGA 5AQXA 2E8AA 3LDLA 1NM1A 3MCPA 5JLFA 3IFRA 1NGHA 3D2FB 3VGMA 3RSEA 2Q2RA 4FWNA 1Z6RA 2P9KB 1ATNA 3U8XA 2V7ZA 3A0IX 5AQKA 5BREA 4BR0A 5AQLA 3UKUA 4IXCA 2QWMA 3EZWA 3KZBA 2YHYA 4CZKA 1U2VA 3VGLA 3C7NA 3AY9A 3SMPA 2W41A 4B1VA 1C0GA 4CJ7A 3DWLA 4BQZA 3CJAA 5CE3A 5EY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VGMA 3M6GA 3MN7A 3BEXA 2BTFA 4YDUA 2QWLA 4B8CA 2XO7A 4IBNA 3TAFA 1TL3A 4CGJA 5GAGP 5BRHA 2NRHA 3KLEA 2ASPA 4FJ5A 2P5OA 2P9UB 4DB3A 1JXEA 2A1SA 3RTVA 3O8MA 2YHXA 3MX2A 4CZLA 1IG8A 3TSQA 4EP5A 3VEXA 2YKNA 1QSYA 1Y64A 5F1XA 1BUPA 1NOZA 3AA4A 3E9OA 4BRMA 3NH0A 4QAGA 3TAMA 1KQSM 1T3VA 2BUPA 5AZIA 2VWJA 3H1VX 4F4KA 3C7NB 2OTJN 4FWPA 1DTQA 3VOVA 3AA2A 4AF1A 3LP2A 4J2DA 4DR2K 2P9KA 3ID6A 4E7KA 4H5TA 3LANA 3KTQA 2HVHA 1VSHA 3ZYYX 3TPQA 5HBMA 4M3XA 4BQLA 4X66K 3WNGA 4JHDB 1WN7A 4H5VA 3VQ7A 1BO5O 1K8AO 4B9SA 5ADXH 4DF8A 1EWRA 1WB9A 1Q9YA 1WSHA 2VG6A 3CJ1A 4BR7A 3ZSQA 3E9LA 3HP6A 1SV5A 4LH4A 5HRSA 5GIOA 4C1NK 3VESA 2HMIA 3DLRA 4H0YB 2NRZA 3WQUA 4DV0K 1TYQB 4GNIA 3O3FA 2WBNA 5LJVA 4DV5K 3C0BA 2E88A 2P9UA 4NB4A 3OBYA 3UKRA 1TVRA 2W40A 1JXBA 3ENOA 1RDCA 4IG0A 5AQRA 3NGIA 2EWSA 1RILA 1BWFO 2YNFA 3ZSRA 4DSLA 4OKJA 2FLOA 3AVLA 4FOIA 4DSJA 3F2KA 4AHVA 3J80O 4KHUA 3OA9A 4H4MA 3DLLL 3QFPA 1HYZA 3K58A 4BDZA 3CG7A 2GV9A 1HMVA 3T3FA 2ITMA 4IG3A 3CCMN 1K73O 4JYAK 2O8FB 4FPAA 1B9FA 4Z4CA 4BR2A 4CVNE 1YF5L 1CZAN 4RW8A 4O5FA 4EHTA 4F9OA 1CXUA 4ELTA 1ZC6A 4DTJA 1DTTA 3FGUA 3K59A 2HBMA 3PSIA 2BANA 3D0PA 1SKRA 1OVQA 3ASMA 3SUPA 3QMLA 4H5RA 5BPNA 3AGKA 3VETA 2ZE2A 3BF1A 1U6ZA 3OYLA 4LFAK 3ZSZA 2IC3A 1RBUA 3FZHA 2P9PB 2X6SA 2D4WA 1VRTA 1X9JA 4OKEA 1IKVA 4C23A 2HBLA 3D45A 4B1UB 2Q36A 2OPQA 5AQZA 5AQQA 1YJWN 4F3TA 3EO3A 1B9DA 5C15A 3CM5A 3LL3A 1TL1A 2O8BB 1RBTA 4CJQA 5FPNA 2OANA 2IVNA 4RW7A 3MDQA 3AVKA 1C0MA 3W3DA 4GY2B 1VQNN 5KPRA 4I9QA 4CJVA 3L2UA 4CZHA 4PHTX 1TKDA 4JK9A 4BVOA 5SWMA 2FSJA 1NLVA 4C8NA 4HTUA 5GADP 5BRDA 3AVIA 4KH6A 2CGLA 1YI2N 4JKGA 1Q82O 1BDGA 1RDUA 3VQCA 4BRKA 1DGKN 5AQOA 2O8FA 3LDQA 4CFDA 3KK1A 3CC2N 3SPZA 1YVNA 4F2RA 2HHQA 4CJ5A 3J7ZO 4FVMA 3H3OB 2B4JA 4FVUA 2O8DB 3L4IA 1FW6A 1NKBA 1X3MA 1CLQA 4DMNA 4KHPK 1KC8O 4BR4A 4B3RK 4BVPA 3LPTA 1JLQA 3I0SA 5AQMA 4PQUA 1VSKA 2CH5A 3AVGA 2P9PA 1N34K 3AO1A 2E6LA 4KFBA 3MEDA 2HBJA 4BROA 1J9AA 1IV0A 4FJNA 3V1OA 2E20A 4CIEA 4LF6K 1BGXT 4IFVA 5KGXA 4C8LA 3ZCMA 4XH4A 2HB5A 3HBTA 3KHYA 3WNHA 2FBXA 2O8BA 2G8UA 4CF1A 4CHQA 4MLHA 4DR7K 3VQEA 1VK0A 1WNSA 3T19A 5C12A 3HO1A 3R8EA 3ULEB 5H1SQ 2HOEA 3VPZA 4OPJA 4O5BA 1LW2A 3CCQN 4EZ6A 1S6PA 4Z4IA 1VSDA 2ASOA 3IMXA 5KPTA 2IS3A 1R59O 3BZCA 4FJKA 3KWIA 3U6FA 4IEEA 1T03A 2E2QA 2ZJRL 3NF6A 1CXQA 1VSLA 3MCAB 3L8BA 1TKTA 3D6RA 4KREA 1N33K 2O8DA 2CGKA 2QM1A 1NWKA 3AA5X 3NVMA 2VG5A 4DFMA 2YI1A 4FWRA 1C0TA 4CJSA 4K25A 2A3ZA 3WXLA 3OBWA 3Q7CA 3FFIA 1LAVA 2OZMA 1U45A 2PYJA 4K41A 4U67L 3CXCM 3K2PA 1NGGA 4DKWA 4DQPA 4OLAA 2Q97A 4CJEA 3DYAA 4L8RB 1WOQA 4AHRA 3L2QA 2OYQA 1HQEA 4IOAL 3CJ9A 1J54A 2WC9A 3P31A 2WTUA 4MO4A 4M3UA 3NE6A 3GBTA 5E26A 3K5OA 1RDAA 2NUBA 4DQRA 4DQQA 2OPSA 3T1AA 3HT3A 3MWTA 1U2VB 2FSNA 3HPGA 3ULEA 2IAJA 2O8EA 3AO2A 4OGEA 5BN9A 2HF4A 4K8ZA 1VSMA 4WE1A 3P38A 3CJBA 4IO9L 4CW7B 4YOYA 3TU5A 1BCOA 5AQUA 1L3VA 4JNEA 4IOXA 4I9LA 1DT9A 3BF3A 4RW4A 2IVOA 4ID5A 4N56A 2E1YA 2G8HA 4CK3A 2KKZA 1YITN 5AQGA 3O3HA 3L0QA 4DSIA 4CCHA 1JLGA 3TAEA 4IKFA 1OKJA 3HK2A 4KBOA 1WSGA 3DLHA 4CBWA 3SLCA 4BC2A 2QWOA 2OZSA 4HVJA 3T69A 4A59A 5BPLA 4DR1K 2IGIA 1QVGM 3TTDA 2E8AA 1NGHA 3VGMA 4G9ZA 5FROA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4AIL C;  4E7I A;  1VSJ A;  4CHP A;  4YNQ A;  3V9X A;  2W6K A;  4GMJ B;  1L5U A;  1HJR A;  3MMV A;  2FBV A;  3J7Y P;  4Z4H A;  3O9Q A;  1TKZ A;  2WUS A;  1EWQ A;  3WQT A;  2Q0U A;  2Z1H A;  1TUU A;  4G1Q A;  3ZSX A;  1NJY A;  4CF8 A;  3GOI A;  1T8E A;  4QOZ B;  1YUW A;  2HF3 A;  4MDA A;  5HRR A;  3LPU A;  5TKY A;  3B8A X;  2FXU A;  4BY9 C;  3SCX A;  1Q7Y O;  3KK2 A;  1V4T A;  4GW6 A;  4CFB A;  2PZS A;  4GV3 A;  4ILH A;  3NF8 A;  5KPZ A;  4CGD A;  3OYK A;  3DXM A;  3SBT A;  1IBK K;  1VSE A;  5J2N A;  4DFJ A;  4DWI A;  3MCP A;  5JLF A;  3IFR A;  3DRR A;  3BY5 A;  1OH6 A;  4CIG A;  2B5J A;  1VQ7 N;  2DY4 A;  2P9K B;  4CF2 A;  1ATN A;  3U8X A;  3G4S N;  2V7Z A;  2Y1J A;  1O1W A;  4OGC A;  3KLH A;  3UKU A;  4E0D A;  3EZW A;  3KZB A;  4IFE A;  4CJ4 A;  3IS9 A;  4RW6 A;  1RCH A;  4FW1 A;  5DM6 L;  5HL7 L;  4J2A A;  1I94 K;  1D5A A;  2BGG A;  1FKP A;  3IKM A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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