4BVPA

Legionella pneumophila ntpdase1 crystal form ii (closed) in complex with heptamolybdate and octamolybdate
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
NPCEKHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELDYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRALEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ECTONUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE DIPHOSPHOHYDROLASE I
publication title Structures of Legionella Pneumophila Ntpdase1 in Complex with Polyoxometallates.
pubmed doi rcsb
source organism Legionella pneumophila
molecule tags Hydrolase
total genus 124
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bvpA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 4bvpA02
5AQHA 2F9WA 3EZWA 5AFUH 3BF1A 1BWFO 2GWKA 3H3OB 2QWOA 2A6AA 5EXWA 1ATRA 4HWIA 3VEZA 2A41A 1YVNA 3BF3A 3MCPA 4PKGA 1HKBA 4FWQA 1GLFO 2P9KB 4FPAA 3D7EO 4FWRA 1T6DA 2ZF5O 3LDPA 5AQFA 4EFHA 5KPZA 4RWTA 3AAQA 3OHRA 3FZMA 1GLCG 2YHWA 4Y0WA 2QWLA 3SMPA 1NGCA 5BPNA 1V4SA 1Q18A 2CGJA 3CJBA 5EY4A 1SQKA 1MWKA 1K8KB 3ZX3A 1JCEA 2ASOA 2CH6A 3ZX0A 4BGBA 4XH5A 2DPNA 2HF4A 3O1BA 3QDKA 2ITMA 4B1VA 2F9TA 5FPEA 3UKUB 3D2FA 1X3MA 3QFUA 2GUPA 3MDQA 3LDLA 3DXKA 1XQSC 5AQPA 2FF3B 3VGKA 3BEXA 3U9ZA 1QZ6A 4JHDA 3QMLA 2P9SA 3UB5A 4FL9A 5AZJB 5AQMA 3VEWA 3WQUA 2NRHA 3A0IX 3LDNA 4EHUA 4O5FA 4H0XB 3LM9A 1YXQA 4B1ZA 3L4IA 4DQ8A 4BC2A 2Q0UA 3VETA 2E8AA 2PBDA 4BC3A 1NGAA 4CZJA 3LDOA 2VYPA 4K41A 3DJCA 4MO4A 3S41A 2I7NA 2UYTA 3D2EA 4CJ7A 5BPMA 3UKRA 1ZXOA 2A40A 2P9LA 3VESA 2NLXA 4BR9A 4I6MB 3C0BA 3EN9A 3A5OC 3ATVA 4FOIA 5AZIA 4B1XB 3GBTA 2GEMA 4CD3A 1NGBA 3QBWA 4H0PA 3D2FB 3C7NA 1BUPA 1Z6RA 3DXKB 4FSVA 4BRKA 3CQXA 1BO5O 2P9NA 4NO7A 4MLEA 3KVGA 5KPTA 2P9SB 3HM8A 4BQLA 4IXCA 4KBOA 3U4LA 3I33A 3CI5A 3ULEA 4E1JA 1E4GT 3DWLA 3ZEUA 5AQIA 4BR0A 4FPBA 4B1WB 1BA1A 1KXPA 2E2OA 4B1YB 4FWKA 1YAGA 1EQYA 3AAPA 3VPZA 3O80A 2IVPA 1T44A 4AM7A 1P8ZA 3FZLA 4BC4A 1QZ5A 2YI1A 1J6ZA 4YDUC 2HMPA 3G25A 2A42A 2ZGYA 3MMVA 5AZIB 1LCUA 5AFUA 4CZGA 1U2VB 2E2PA 4BRHA 4H5VA 4CZHA 3HTVA 5E26A 5FPDA 3SK3A 1RGIA 3BP8A 1BDGA 5JMVA 4PL8A 4QS7A 3P4IA 4IJNA 4MO5A 1TYQB 2W40A 3IUCA 5AQXA 4A61A 3QICA 2WUSA 4LC9B 3WT0A 1TUYA 1SZ2A 1JCGA 1NLVA 2Q97A 1NBWA 5AQNA 3I8BA 3UKUA 1NWKA 1WUAA 4BVPA 1DEJA 4WQ4A 5AR0A 1G99A 2ZWHA 1BA0A 3MN9A 1GLBG 1BOTO 4WYBA 3AY9A 3LM2A 3CJAA 5AZJA 2GTDA 1NGHA 1HKGA 4IWVA 1QHAA 5BR9A 1XUPO 4RTFD 4AM6A 2BUPA 4C23A 1HUXA 4H5TA 1ATNA 4BRPA 3ZETB 3FZKA 5JICA 1C0GA 3A5MC 4H03B 3WXLA 3FGUA 1X9JA 4I6MA 1IJJA 2J4RA 5BRFA 4DCHA 3FLCO 2QWRA 3MN7A 1NGGA 3H3NO 5AQKA 2ASMA 2E2NA 4H0VB 5KQDA 5JLHA 3DXMA 2HOEA 3WEEA 2Q1NA 1HX1A 1LOTB 4IZ9A 4BRLA 3VF2A 1R59O 2W41A 4BVOA 3L6QA 3GDQA 4JN4A 1OKJA 3TU5A 4PKIA 2H3GX 4XEIA 3VENA 3ID8A 5AQZA 1YUWA 2KHOA 3MK6A 3O4WA 3AARA 3ENHA 5KQ8A 3HZ6A 5ADXH 2OANA 3EL2A 4ISGA 1GLLO 2ASPA 5AQJA 3IFRA 4BGAA 4CZEA 3QFPA 3HI0A 5LY3A 5B8HA 5JLFA 2QW9A 1NGEA 4FOEA 4H5RA 3MN5A 4GY2B 1JCFA 1U2VA 3A5LC 3VEOA 5AQLA 3DXMB 3WEEB 4HTLA 4CBWA 2P9UB 2YJEA 3FZFA 1TYQA 3JXUA 3VEVA 3WXJA 4BR7A 4BRMA 1IG8A 1NGIA 1U6ZA 4CI6A 3RSEB 1NGJA 3VEXA 5KPRA 1NGDA 4WQ5C 3DAWA 5F2RA 3B8AX 4IO8A 2Q31A 2FF6A 1QQMA 2V51B 3VOVA 4DHYA 2CGKA 3O8MA 1HPMA 2NZTA 4CBXA 1CZAN 2A3ZA 3F9MA 4EAHD 3L0QA 4BROA 1DKGD 4FWNA 5BREA 3O1WA 4CZIA 3IMXA 3SMSA 3VGLA 4EIAA 2QM1A 5BRDA 1D4XA 4K43A 3SJHA 2E20A 2V7YA 2YHXA 3A5NC 5EVZA 4DB3A 4A62A 3ZETA 5E84A 4Z94A 1ESVA 4JD2A 3MN6A 2VWBA 5LJVA 3TPQA 5FPNA 2AP1A 4JAXA 1WOQA 2A5XA 4L3QA 2FXUA 1QQNA 2E2QA 4CZMA 4EHTA 3CHWA 2QWQA 3CETA 4QS8A 1BG3A 4BR5A 5F0XA 4BC5A 4O8KA 4H5WA 3UE5A 2I7PA 3CERA 2ZGZA 2FLOA 3H45C 1KAXA 5BN9A 4RCHA 2IIRA 3O6WA 1HLUA 4B9QA 1HJOA 2E1YA 4MLHA 1SAZA 2HF3A 4M63C 4M7XA 3FFKB 4ISFA 4YDUA 3HSCA 3VF4A 2VCPA 5LJWA 4BRNA 4JD2B 5AQQA 4F9OA 4BRIA 5F1XA 3CJ9A 4BR4A 4ISEA 5AQRA 4BQZA 4BRCA 3GOIA 2P9PA 3U9DA 4FWPA 4A2AA 1BU6O 1XC3A 4M7YA 4FO0A 1Z05A 4FWOA 3QBXA 4H0YB 2YHYA 5ADXA 1GLJO 1ATSA 4XH1A 5BPLA 5AQGA 2BTFA 2P9UA 5AQSA 4BRGA 3M6GA 1NM1A 3ZX2A 2AA4A 2GWJA 4H0OA 3EKUA 2YCHA 3RSEA 5TKYA 3H6EA 2IVNA 4PL7A 3O5BA 4CD1A 3BUZB 3WXIA 3LL3A 3LDQA 4A2BA 3CJCA 3VERA 3O08A 2IVOA 5AQVA 2E88A 2QXLA 2QWPA 3FZHA 1QQOA 3WUHA 1X3NA 1E4FT 3M3ZA 1S3XA 2FSKA 1MA9B 4H5NA 3GG4A 2P9PB 2FSNA 1ZBSA 3CQYA 5AQWA 1DGKN 1GLAG 2Q36A 3FR0A 2V52B 5AQYA 1GLEG 3EKSA 4BRFA 1H1VA 3ATUA 4CZFA 4BRAA 3CJ1A 2D0PA 3KZBA 1Y64A 4PKHA 2P9IA 2QWNA 2Q0RA 5AQUA 1KAYA 3W0LA 3R9PA 1V4TA 4GNIA 3ENOA 2FSJA 3CJ7A 2CH5A 4BG8A 1HKCA 4K25A 3CIPA 5EOYA 4BG9A 3VEYA 3KHYA 3EO3A 2QWMA 3H46O 2EWSA 3GE1A 3H1VX 2D0OA 4BR2A 4BREA 4JHDB 4CZLA 3U8XA 2Q2RA 4WQ4C 4B1UB 4J8FA 5ELZA 3J8AA 4BRQA 3WXKA 1NGFA 1NMDA 3JS6A 2E1ZA 3GL1A 1GLDG 1MWMA 1S22A 5AQTA 3VF6A 3W3DA 5BN8A 4JNEA 4CZKA 1RDWX 5EX5A 1MDUB 1ZC6A 3R8EA 3HBTA 1T6CA 3D2EB 4XH4A 1C0FA 4BRDA 2P9IB 3UKRB 2P9LB 2P9KA 4CBUA 2D4WA 4NB4A 1TUUA 2PAVA 4H0TB 2YJFA 3WQTA 4K42A 4FWLA 5I9EB 4WQ5A 1RFQA 3SLCA 3C7NB 3QB0A 4IJAA 5BRHA 5FPMA 4FWSA 4FWMA 3R6MA 5AQOA 3VGMA 2CGLA 2D1KA 2GELA 2P9NB 1K8KA 4QS9A 2V7ZA 3H1QA 3A8YA 3IDHA 5CE3A 3M1FA 3ULEB 1KAZA 3FE1A 3ZEUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUPA 1EETA 2QKBA 3K5MA 4CJSA 3MXMA 3TR8A 2AJQA 2JGUA 5EXWA 5CZ2A 3K59A 3U3YA 1T8EA 4GVEA 1UA0A 3MCPA 2QA4N 3C94A 4X62K 4CEQA 3D7EO 2YNGA 3NGIA 4CHPA 1TKZA 4IOAL 1MU2A 4Y0WA 1RT4A 1NGCA 4CGDA 3MEEA 3CMAN 1T3VA 3RMDA 4ZTFA 3HPHA 1J5OA 1MWKA 4PUOA 2FBYA 2ASOA 2CH6A 4O4GA 1VQ4N 1S9EA 1VSMA 4BGBA 4XH5A 4EZ9A 2HF4A 3O1BA 3QDKA 3THWB 1VQPN 3AVAA 3MDQA 4J2AA 3LDLA 5AQPA 3VGKA 3OYGA 3K5LA 1TK0A 1WBBA 4B9VA 2RHKA 1X9WA 3ZSXA 4FJ9A 5AZJB 4EHUA 1ASUA 3V6DA 2NRHA 3A0IX 3DOLA 4H0XB 1EO1A 3KK3A 3AVKA 5MLCQ 4NXMK 1YXQA 4B1ZA 4DQ8A 4E1MA 4BC2A 3U6FA 3HYFA 5HRNA 3OYJA 3SCXA 5HOOA 1SKWA 4BC3A 2G8KA 4K41A 3DJCA 4N76A 5HP1A 3L4QA 3NF8A 2I7NA 3D2EA 5BPMA 2P9LA 4M3UA 4B9UA 2Q3SA 3VQ7A 3EN9A 4PWDA 4FOIA 2HHWA 4NYNA 3NH0A 2OPRA 1BUPA 1VSHA 3DXKB 1VQMN 1L3SA 1N32K 4DLEA 5GAGP 2P9SB 4F2SA 1OH8A 3E9OA 3CFOA 4Z4CA 4FLUA 4M3XA 1NJWA 3AVLA 4B1YB 3PY8A 3DRPA 5C25A 1EQYA 3AAPA 1OH6A 3O80A 5I3UA 4BC4A 1IKYA 2YI1A 2VWKA 4DTRA 2EX3A 4QCLA 3NGYA 3L2QA 1J6ZA 2A42A 2ZGYA 2D0BA 2IAJA 4Q0BA 4CF2A 4MDAA 4KTWA 4FJ5A 4CZGA 4OGEA 4BRHA 4H5VA 4CZHA 5E26A 2Z1JA 4PQUA 3D6RA 2WBNA 4QS7A 4MO5A 2YX6A 3L2VA 4FM1A 1SZ2A 1NWKA 2O8EB 4BVPA 4M3WA 3O4QA 4PHTX 2HVHA 3KWIA 3ZCMA 3CJAA 4ZHRA 3L3UA 1BGXT 3AVFA 4W5TA 4IWVA 1QHAA 1FKPA 3OYHA 4YFUA 3VQBA 3TAMA 1XUPO 4LFCK 4H4OA 4CFAA 2B4JA 5CZ1A 4B08A 1JLCA 1GOBA 3I55N 3FGUA 4I6MA 3ZSWA 1WNSA 3V9ZA 3CCVN 4FJ8A 5BRFA 4DCHA 3L2RA 3CC4N 3MN7A 3ZT1A 2O4GA 5AQKA 4HVJA 4H0VB 4L8RB 1HJRA 4FJ7A 3SUOA 1LOTB 1W7AA 3P39A 4BY9C 1S72N 4BVOA 3CFPA 1G15A 2KW4A 2E6LA 3RVCA 3VENA 3ID8A 3THVA 4DSEA 1EKEA 4DSLA 2XY8A 3MK6A 3MX2A 3O4NA 3O4WA 3AARA 3ENHA 5ADXH 4ISGA 1U49A 1GLLO 2ASPA 2OPSA 1VSIA 4B3OA 2O8FB 3LPUA 4M3RA 3NE6A 4ILHA 1RTDA 2HHTA 4H5RA 3MN5A 2OTJN 3T1AA 4DU1A 1XMOK 3A5LC 2RN2A 3VEOA 4LF8K 4XIUA 3LAMA 3WEEB 4FJGA 4HTLA 2P5OA 4CBWA 1NK8A 3WXJA 1WSFA 1U6ZA 3RSEB 1HRHA 3DAWA 1BI4B 4IO8A 1HNWK 1QQMA 1NOYA 3ZSVA 2XO7A 1LWCA 4IBNA 4RW7A 4ID5A 3WNFA 4NXNK 1D9DA 4WCEL 4BROA 4C1NK 4EP5A 4FJIA 5BREA 3IMXA 3RR8A 4EIAA 1HMVA 2QM1A 3MWPA 3M5RA 2E20A 2HB5A 3A5NC 3S3MA 3ZETA 5E84A 4Z94A 4RW8A 5J2QA 3MN6A 4YOWA 2BANA 5LJVA 2D0AA 5FPNA 4JAXA 2A5XA 4L3QA 1VSLA 4CHZA 5KGWA 4IFYA 3EE9A 2NRWA 3DRSA 4AILC 5D3GA 1NK4A 4BR5A 2PFUA 3V1QA 4BC5A 4H5WA 5M1QA 2I7PA 4CJ4A 4DR7K 1WSJA 4LD0A 5E41A 3H45C 4FLZA 3OBYA 1Q9YA 2IIRA 1Y97A 1RTIA 2E1YA 1N8RO 4MLHA 2Y1JA 3HP9A 2JWKA 4OPAA 4YDUA 1ZBUA 4F8RA 1RT7A 4QAGA 5DMRA 4K8ZA 1VQLN 4BRNA 4JD2B 3QESA 4LFAK 4ISEA 2OTLN 2OZMA 2BE2A 4JI0K 1JLFA 2P9PA 3C95A 1JLQA 4FWPA 1BU6O 4YNQA 4JS4A 1XC3A 2VQEK 2G8IA 5C24A 2F7TA 4DUYK 2YHYA 1BCMA 5ADXA 1TL1A 4G1QA 1ATSA 5BPLA 3HVTA 5AQGA 4DSIA 1FXXA 4LH5A 5AQSA 4DTSA 2AA4A 4YOXA 1W2BM 4CJPA 2IVNA 2GBZA 3K58A 4E7KA 4PL7A 4HUEA 1Q86O 4CD1A 4DQIA 3WXIA 2BGGA 3VTIA 3O08A 3E1YA 1B9DA 1RT2A 2ZM6K 1WSEA 1QQOA 5C15A 4DMNA 4GKJK 5BR8K 2P51A 4BE2A 1HNXK 4H5NA 4F4KA 4JKAA 3GG4A 1SL1A 2FSNA 4JKGA 3C6TA 4M3ZA 2NUBA 3ULDA 3FR0A 1GLEG 1GOAA 4Z4HA 4CZFA 1CXQA 3TAEA 3DM2A 4JK8A 3NBPA 4FZYA 2P9IA 2QWNA 3M8PA 3PV8A 1V4TA 3QNOA 2CH5A 4B3SK 3PSIA 4K25A 4CESA 5EOYA 3D45A 3VEYA 2QWMA 3GE1A 3HK2A 3H1VX 1N34K 4BREA 2NRXA 3ALYA 3QO9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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