4C0RA

Molecular and structural basis of glutathione import in gram-positive bacteria via gsht and the cystine abc importer tcybc of streptococcus mutans.
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
MDKTVTLATVGTTNPFSYEKKGKLTGYDIEVAKEVFKASDKYDVKYQKTEWTSIFSGLDSDKYQIGANNISYTKERANKYLYSNPTASNPLVLVVPKDSDIKSYNDIAGHSTQVVQGNTTVPMLQKFNKNHENNQVKLNFTSEDLAHQIRNVSDGKYDFKIFEKISAETIIKEQGLDNLKVIDLPSDQKPYVYFIFAQDQKDLQKFVNKRLKKLYENGTLEKLSKKYLGGSYLPDKKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular and Structural Basis of Glutathione Import in Gram-Positive Bacteria Via Gsht and the Cystine Abc Importer Tcybc of Streptococcus Mutans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE AMINO ACID BINDING PROTEIN
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus mutans
total genus 79
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4c0rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4c0rA02
4F3BA 2HAVA 3CFLA 4QFNA 3H6UA 3O6HA 3HN0A 3K00A 3FATA 3UORA 1II5A 3E9XA 1UTBB 4DE8A 3SDFA 3H6WA 5I56B 4HTGA 1BTJA 3C4MA 4F3GA 1B40A 4EXLA 1NMUA 2I4BA 2ONKE 2DYXA 4F18A 3W15C 4EXKA 3FIRA 3FVNA 1B9JA 3FXUA 5FHOA 3PU5A 1B1HA 1B5IA 5DT6A 3EPEA 2O1LA 2PYYA 2REGA 3H6VA 5A5XA 2HCAA 1JQFA 4AB6A 2XXRA 4I9DA 2Q2AA 3SETA 4FIMA 3T9HB 2Z22A 1JW5A 1O64A 1EZPA 3ODBA 5I58A 1IXCA 5AA2B 1FTJA 1Y9UA 4OENA 3C34A 2A5TB 1Y3NA 2Q88A 3TAJA 4RPOA 1NNKA 1QKAA 3HSTA 1N7XA 4OTEA 3N5LA 4OFJA 5JK4A 3A3UA 4OZ9A 1H76A 3B6WA 4MH5A 4JDFA 5BUUA 3K01A 3G3FA 3PMXA 4KHZE 2ZNUA 2X7QA 3B6QA 5IKBA 1B32A 4IB2A 4F39A 3H06B 5JTYA 1POTA 4NF6A 4IGTA 4KYDA 4U1ZA 5TPAA 5AA3A 3HHGA 3HV1A 1B2HA 4WXJA 4ECFA 5I2NA 3V89B 4QHQA 1JNFA 3D4CA 1UQWA 3D4GA 3CSGA 1I6AA 2ZYMA 5I57B 1A54A 4ZEFA 5H8FA 4HW8A 2NVUB 1VSOA 3RPWA 1P1QA 1IXIA 3UGWA 4R72A 3OMBA 1MXVA 2Y7KA 3TTNA 1PC3A 4OEVA 1B3EA 2B3FA 4AQ4A 3PUYE 4G8NA 5DEXB 5I59B 1AH5A 3KSXA 1Y4TA 3C35A 4RK9A 1M5EA 1LFGA 2ALUA 4OMBA 4GOTA 2VOZA 3G3IA 1MRPA 3O9PA 4F31B 4ZEKA 3K1PA 1M5BA 2XXUA 2M8CA 4P0GA 1ZLQA 4QSDA 4IO5A 3AXFA 4YZZA 2NUVA 2I0CA 3PGFA 4G4PA 4NF8A 4GLIA 3OEKA 3O29A 2F6PA 1UIVA 2QPQA 1S9TA 2THIA 1DTZA 3THIA 5CMMA 1FTMA 4KR5A 1LAXA 2QSXA 2BJJX 2XX9A 2QMWA 3M3LA 5H8QA 3U1OA 3EQ1A 1B1XA 3M3FA 5F7VA 3QK6A 2XXXA 3ILUB 4Z0IA 4RPNA 1OLAA 4KD5A 3QUJA 2QRYA 3FV1A 4G68A 4BDRA 4NF4B 5H8SA 3CR9A 3USDA 3FZVA 3E13X 3ONMA 3MP6A 4RK2A 5ITOA 3I6VA 4IO2A 1EH3A 3T9UA 3IR1A 1B3LA 3Q26A 1XC1A 2G29A 1P1WA 4RJZA 3S9EA 4R6YA 3RN8A 4F3PA 3T9VA 1FTLA 4XKPA 5DVIA 4RXLA 4ZECA 2XXIA 4F1VA 4GF8A 1LFIA 2Y7WA 2Y84A 3W9WA 4L17A 3FVGA 3RTFB 2QS3A 1SW1A 4FEDA 1YTVA 2H9BA 5KZTA 1NL5A 1NH7A 3G3HA 3KGCA 3UP9A 1MG1A 1Y1MA 2OWTA 1HSEA 5B7DA 3QXMA 2ONSA 4H8IA 4GL0A 4JB7A 5KCJA 1SW5A 3KOSA 4QFLA 4OXVA 4WKMA 4O3BA 2V3QA 1MPBA 3CG3A 3PPPA 1ZIUA 1LCFA 3QAXA 1VFEA 3R26A 1QW0A 3PPRA 4FORA 4TLMB 4N6PA 1O63A 3TTMA 4YKIA 3FJGA 1FQEA 3K1MA 4M4GA 4F3SA 1JEUA 4FE8A 3R7XA 3RUMA 1FQCA 1MXUA 4Z7EA 4JWYA 4X48A 2H98A 2D21A 2XXVA 3LUYA 2I58A 5FTIA 4NMYA 3FVKA 3QIMA 3TTRA 2F7AA 1ATGA 3M3KA 3PPOA 3MJNA 2QS1A 5CM6A 5CRYA 4EF2A 3LSLA 3MVXA 4TLLB 3IK6B 4RNSA 4R6HA 2DE2A 4NF5A 4OFOA 1USYE 4NEDA 3SERA 2RCAA 3V5AA 3G3JA 4XIGQ 3K6UA 1YPNA 1B5HA 1H3DA 1MQIA 4PFTA 3B7DA 3C31A 2I48A 5ITPA 1PEBA 3OOAA 2O68A 2XD3A 3H6TA 1SD3A 1D9YA 1IITA 3ECRA 2IEEA 1DMBA 4GIZA 2I3WA 1GTKA 3OSRA 1I6QA 4OYVA 3QSLA 2Q2CA 3VLVA 4KQPA 2PT1A 2NOOA 4YICA 4PE5B 3H03A 2H5YA 5H8HA 4DXUA 4OHNA 1PB8A 1UTHB 1MM6A 5FHNA 4PFWA 5EHMA 2O7IA 3K02A 2RC7A 3SEUA 3RT8A 4R6KA 1Q35A 4R9GA 3R6UA 1ZKBA 1TWYA 2Y7PA 3S4UA 1MY3A 3P7IA 2ZNTA 2XXTA 3O66A 3VVDA 4N13A 4FAJA 4QFOA 5TP9B 1H45A 1IEJA 3Q27A 1FQDA 1POY1 2F7BA 1MH3A 3LR1A 4R2FA 3L6HA 2UVHA 4EQBA 1B6HA 3HCQA 1BIYA 2Y7RA 3MQ9A 4MLQA 5ISUA 5CI5A 3L6GA 1LSTA 1O7TA 2REJA 3GBBA 3K6VA 4FJPA 2XX8A 2X7PA 4OFLA 1Z7NE 1SBPA 4ZEDA 1P1OA 4DXCA 1B51A 3V8XB 4YB6A 3TCFA 5TU0A 1VR5A 4H1XA 1AL3A 2XX7A 1AOVA 1A55A 2F34A 3MVWA 1B3FA 3EF7A 2AYSA 1LLSA 4KFQA 4C0RA 1I6BA 3PMWA 3N26A 3RLFE 5AA4B 4YAHX 3TZAA 3DP8A 3MZBA 2DP8A 2P0SA 2XXQA 3TQLA 2V3UA 3ZKLA 2ZMBA 4U1OA 4H5GA 2UVJA 2DWJA 1LB9A 1DPEA 5IAIA 3OSQA 2XHDA 4N07A 3KN3A 4H8JA 1MQJA 4F2QA 4XTCQ 3FGSA 1LB8A 4C1TA 2HXWA 2F6GA 3SEYA 4ELOA 1LGBC 4ZE9A 4ELRA 5K2YA 2OCUA 4R75A 3DLNA 4U2RA 3OEMA 4IY6A 3OXNA 4MF3A 3N6UA 2I4CA 4F1YA 4Q8RA 4Q30B 3GXAA 1EZOA 1B7UA 1IZ1A 3JV9A 2PT2A 1B46A 3VVEA 2DXYA 1FCKA 2ABHA 2V84A 4EF1A 5A5XB 3TTLA 4YKKA 4QSCA 4ZEIA 2F7CA 1A40A 2Z8EA 4XKNA 1S7YA 2CMOA 4G2ZA 3VVFA 4LZ7A 3RTWB 3G3KA 5I58B 4G8MA 3K1NA 3OO6A 1RYXA 4JXIA 5HPQA 1ANFA 4ISUA 3RT6B 3RQTA 2DVZA 1Y3QA 2OZZA 3SKPA 1XT8A 3RNNA 3QYTA 1T0KA 3BKIB 2DOJA 2PBWA 3TKDA 1I69A 3Q28A 3MP1A 1L5TA 3VLWA 3CFXA 3E3KA 2HFBA 4KYEA 4KPTA 3KSJA 3F11A 2KLFA 2OK2A 4U23A 1N76A 3VV5A 5JTYB 4NF6B 3TDJA 1URGA 1MQHA 5TPAB 3FJMA 1MM7A 4PETA 3IORA 5I2NB 2ZYNA 3IO4A 3HO7A 4LATA 2AIXA 3T9XB 3VXCA 3TMGA 4U4SA 4MLVA 4KI0E 5H8FB 3U92A 1M5DA 1IXGA 4R9FA 4PFUA 3UA8A 2GRVA 3SEVA 4POXA 4G68C 5KDTA 4H6DA 3U72A 1LAGE 1SW2A 1ZU0A 4ZZEA 1IQ7A 2RCBA 1OQHA 2YPNA 4NWDA 4FATA 4QSEA 1NFTA 1B52A 2HQ0A 4G8HA 2PVUA 4MBPA 2FA7A 2R6GE 4DIGA 1XHYA 1XVXA 3A09A 5L9SA 3SEXA 5AE4A 1QUIA 1NKXA 4NF8B 3PV0E 3IJOB 1GGGA 3IB1A 1LFHA 4DDDA 3TELA 4XKRA 3Q25A 3K4UA 3FV2A 1R1NA 4PFYA 1SVXB 1Y3PA 3MUQA 2O51A 3FJ7A 2B65A 5H8QB 1A99A 1FQAA 2O84X 3CRBA 5FHMA 1QVSA 1A7LA 1BLFA 3IOUA 5KDTB 4YKPA 4OETA 2E1SA 2VP1A 1MH4A 5FTHA 2O69A 1M5FA 5J1DA 2ZYKA 4LA9A 1N0TA 5CMBA 4G68B 4PQJA 4HCYA 1LBCA 3PPNA 2XD2A 3LSWA 3OO8A 3MZ9A 1US4A 1IXHA 4KCDA 5ICTA 3V83A 2YJPA 4R2BA 2F8DA 3CIJA 2DWHA 1S50A 2F5XA 1SI0A 3W9VA 3VFJA 3CVGA 4U4XA 1FQFA 1DOTA 4LZ8A 3H7MA 1MXZA 4NWCA 4YU0A 1Y4CA 2OBGA 1XVYA 2PMSA 1MQGA 1DSNA 2Y7IA 1MXXA 3O2AA 4WEDA 4ELQA 4LVQA 1EZ9A 1MY0A 1F9BA 1B4ZA 4QFKA 4OVJA 2ONRA 5KCJB 2GH9A 4E0WA 3TODA 4R73A 4BDLA 1GVCA 1WVJA 2FYIA 1DTGA 4H0WA 1D9VA 3LSXA 3S2VA 2UYEA 4OWDA 1UIUA 4IO6A 1MY2A 2ZYOA 1CE2A 1ZBMA 5DVJA 2DE3A 4FEBA 4TQUQ 3LC8A 2HZLA 3KJTA 3I5OA 4GD5A 1JW4A 4FECA 2HEUA 3TEPA 3KBRA 1M5CA 4POWA 1UTBA 5CMKA 1PB9A 3O6GA 3BFTA 4O3CA 2H99A 3S9LC 5I56A 5BWJA 2QS4A 3S9NC 1NNTA 2DWAA 2Q89A 3M8UA 1JVXA 2VD3A 4NF5B 3WAFA 3MW0A 2DWIA 4H5FA 4PP0A 2OJTA 4LONB 4RA1A 2HZKA 2P1SA 5LOMA 5CC2A 4EUOA 4BDNA 4DLDA 3PUVE 3IJXB 3PPQA 2I6EA 1MDP1 4KCCA 4LZ5A 3MZ1A 1B7HA 4XXUA 4HS7A 1R6ZA 2DS9A 3MC2A 4R74A 1ZTYA 3KJ7A 3GBAA 1ZMGA 2PX1A 1R9QA 3Q29A 3TQWA 2OLBA 1LBBA 2HAUA 2RF1A 5I84A 3PUWE 1QKBA 3N94A 3B6TA 4F19A 3ZS6A 5AA2A 3HPIA 1H44A 1IUDA 5H8HB 2A5TA 2ZNSA 3E4RA 4DCXA 4UACA 1PDAA 1XOCA 1MQDA 1HSLA 3SESA 2O1MA 3K0VA 4G77A 1P99A 2FNCA 1FQBA 2UVIA 4ZDMA 2QMXA 3OELA 1VFDA 4QFPA 4ZZAA 3MPKA 4X1BA 3KZGA 1D3KA 1SYIA 4EDPA 4F22A 3H3GA 1D4NA 2GHAA 4U22A 1MS7A 3DP6A 5EYFA 3MBPA 4H67A 3PMVA 3G3GA 3OENA 2ESNA 4GVOA 2ZXTA 3UIFA 3T93B 3N6TA 3EN3A 2G93A 1OQGA 3KOTA 1A8EA 5I57A 3O97A 3BFUA 3DELB 2A5SA 3TFLA 3OO9A 4GXAA 2R71A 1HSJA 4M1VA 3G7WA 3K6XA 3OO7A 5AA1A 1JEVA 4ND9A 4LQ2A 5JEIA 5DEXA 1TFDA 1TFAA 2XXWA 1OIBA 5CMCA 5I59A 1AIVA 1Y1ZA 3MP8A 1IIWA 4KYSA 3IOWA 3O28A 5DVFA 4Q0CA 3BBRA 4IGRA 2VD2A 4E0XA 1GV8A 1MXWA 1SQYA 3PD9A 4QF9A 4DXBA 2QL3A 2RC8A 5I2KA 3FASA 4JSOA 1B3GA 4NTLA 2AL4A 4WEPA 3K6WA 4RY1A 2XXPA 1JVYA 3DM0A 1SW4A 3TTKA 4JBZA 1USYH 1P1UA 3A3CA 2I49A 1B7ZA 1A8FA 3DP4A 3IOVA 1QUJA 2RKMA 2DE4A 5L9OA 1FTOA 4DCYA 3GLBA 1LAHE 1QULA 1N7WA 3IB0A 2B3BA 2R9JA 3KN7A 1ELJA 2RINA 1N3XA 3IOTA 1XS5A 5M2VA 5DTBA 5CBRA 1B0HA 2DQVA 4NF4A 1NH8A 4HCWA 4IO4A 2V93A 4ESWA 4GL8A 1B0LA 1NNFA 1BKAA 4I8CA 3TUSA 2IA4A 1GR2A 1RKMA 1R9LA 3FUZA 3MVYA 5AA2D 5I2KB 4I62A 2GHBA 3KN8A 4O3AA 3I3VA 4TOZA 3UK4A 2D5WA 1PBPA 3MWBA 3CG1A 1SI1A 4F2OA 4F29A 1N84A 2XXHA 1YCJA 1MY1A 2VHAA 2V25A 3VE1B 1MPCA 3VDFA 2F78A 3C9HA 4F1UA 1US5A 1H43A 3PUXE 3QUFA 1SDXA 4BLAA 1WODA 2Z23A 1MXYA 3OD7A 3FVOA 4QRZA 4LQ5A 3KEIA 2H4IA 3U8QA 3TYHA 4ELPA 3IX1A 2F97A 2W7YA 3FD3A 5CBSA 4ESXA 3CSBA 4OERA 1OVBA 1RYOA 1N3WA 1OLCA 2RC9A 4MFIA 1PB7A 2E0SA 3IAZA 2P2AA 4H65A 4LP2B 1CB6A 1OMPA 5EHSA 1Q1KA 1NNPA 4P0IA 2DSFA 4OQOA 2NWJA 3GZGA 4IY5A 2Z8FA 5B70A 5K2XA 3VXBA 2DXRA 3C33A 4I1DA 1B3HA 4JWOA 2XXYA 1EU8A 2GFEA 4LUBA 5L9MA 3IL1B 3MAMA 1J1NA 2F36A 2AL5A 4GWOA 1Z7ME 4EQ9A 3RY3A 3T66A 2YLNA 3ILTB 4U21A 3T22A 3H4ZA 3ZKKA 4UA8A 3K2DA 3EHTA 4ZE8A 4GQOA 1MY4A 1URDA 4YKJA 3JZJA 1AMFA 4OESA 4ONYA 3KG2A 3HHFA 3IO6A 4Q5TA 4X9TA 4AB5A 3TPAA 3FXRA 3C36A 1P1NA 3U93A 1MPDA 4YMAA 4BDOA 1UTHA 2OWSA 1LAFE 2O6AA 4BDQA 1WDNA 3EHSA 4IO7A 5H8NA 1DPPA 1KWHA 4NE4A 2UYFA 1B58A 5L8DA 3U94A 2V3TA 3S9MC 2CZLA 3LBSA 2QS2A 4THIA 4P11A 4IO3A 1B5JA 1YAEA 2NXOA 3C32A 4JWXA 3TCGA 4ZS9A 4GFRA 1TT1A 3MVZA 5TP9A 2X26A 2ANJA 5ICQA 5HM4B 4K3FA 1FTKA 4YMBA 4ZEBA 4BDMA 1B05A 3FXQA 2WKYA 1FW0A 3MPLA 1MDQA 1PBQA 3EHUA 2I0BA 3JYRA 3VLUA 3ZSFA 5F1QA 2UVGA 1LCTA 4GRKA 3LSFB 4GXSB 1VE4A 2Z8DA 1Y20A 4XKQA 1QUKA 2I3VA 3TCHA 4X1DA 3PD8A 3RGYA 1ZJLA 2QJEA 4DZ1A 2H25A 1TXFA 2VGQA 2F35A 1JW1A 2DVCA 3CI8A 2UXAA 3IB2A 4JSDA 1URSA 5H8NB 1B4HA 1N04A 1QJMA 3UN6A 1BP5A 3KFMA 4YB7A 2LAOA 5AA4A 1JETA 3O6IA 4EQ7A 4YB5A 3SEWA 3CFZA 1OVTA 3WAEA 3PUZE 2O7UA 5DYHA 2Q9TA 5ELVA 2Q8JA 4C1UA 2D3IA 1SYHA 4OEUA 4RYAA 3T96B 5HBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F3BA 2HAVA 4O94A 3CFLA 4QFNA 3H6UA 3O6HA 3HN0A 3K00A 3FATA 3UORA 4HE1A 1II5A 3E9XA 1UTBB 4DE8A 4P1LA 3SDFA 3H6WA 5I56B 1LBZA 3E79A 5ET5A 4HTGA 1BTJA 3C4MA 4HE0A 4F3GA 4QBAA 4N17A 1B40A 2Q74A 4EXLA 1NMUA 3ROJA 2I4BA 2ONKE 2WEFA 4XF5A 2DYXA 4F18A 4N4UA 3W15C 4EXKA 3FIRA 3FVNA 1B9JA 3FXUA 5FHOA 3PU5A 3T1BA 1B1HA 1B5IA 5DT6A 4MCOA 1IMCA 3EPEA 2O1LA 2PYYA 2REGA 3H6VA 5A5XA 2HCAA 1JQFA 4AB6A 2XXRA 4I9DA 2Q2AA 3SETA 4FIMA 3T9HB 2Z22A 1JW5A 2ZZXA 1O64A 1EZPA 3ODBA 5I58A 1AWBA 1IXCA 1LBVA 5AA2B 3GYYA 1FTJA 1Y9UA 1FJ6A 4OENA 3C34A 4H45A 2A5TB 4HE2A 1Y3NA 2Q88A 3TAJA 4RPOA 1NNKA 1QKAA 3HSTA 4PGNA 1N7XA 4OTEA 3N5LA 4OFJA 5JK4A 3A3UA 4OZ9A 1H76A 3B6WA 4MH5A 4JDFA 4I3YA 5LDZA 1RDZA 5BUUA 3K01A 3G3FA 3PMXA 4KHZE 3HFUA 2ZNUA 2X7QA 3B6QA 5IKBA 1B32A 5EYHA 1G0IA 4IB2A 4F39A 3H06B 5JTYA 1POTA 4NF6A 4IGTA 4KYDA 4U1ZA 1NV5A 5TPAA 5AA3A 3HHGA 3HV1A 4MJOA 1B2HA 2ZZVA 1NUWA 4WXJA 4ECFA 1RDXA 5I2NA 3V89B 4O7IA 4QHQA 1JNFA 1NUYA 3D4CA 1UQWA 2FIXA 3D4GA 3CSGA 1I6AA 2ZYMA 1YXIA 5I57B 5F24A 1A54A 4ZEFA 5H8FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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