4C1LA

Crystal structure of pyrococcus furiosus 3-deoxy-d-arabino- heptulosonate 7-phosphate synthase i181d interface mutant
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
MKYSKEYKEKTVVKINDVKFGEGFTIIAGPCSIESRDQIMKVAEFLAEVGIKVLRGGAFKPRTSPYSFQGYGEKALRWMREAADEYGLVTVTEVMDTRHVELVAKYSDILQIGARNSQNFELLKEVGKVENPVLLKRGMGNTIQELLYSAEYIMAQGNENVILCERGIRTFETATRFTLDDSAVPVVKELSHLPIIVDPSHPAGRRSLVIPLAKAAYAIGADGIMVEVHPEPEKALSDSQQQLTFDDFLQLLKELEALGWKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Pyrococcus furiosus
publication title Destabilization of the homotetrameric assembly of 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from the hyperthermophile Pyrococcus furiosus enhances enzymatic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-dehydro-3-deoxyphosphoheptonate aldolase
total genus 98
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2013-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4c1lA00
4AHQA 5CSRA 4AWSA 2W79A 5G2HA 3OVQA 1AG1O 1TRDA 3Q58A 5D2VA 3W2JA 1LYXA 4YCOA 3EB2A 4H3DA 4DO6A 1OX6A 3KHJA 1FCQA 4G1KA 5FF7A 5DCEA 5MHBA 1GVOA 1TPVA 2ABAA 2FB3A 5LNSA 2ZZ1A 1R46A 3QYQA 4MY8A 2Y61A 3WK3A 4FXSA 1HG3A 1MEHA 2HSAA 1KLYA 3KVKA 1ADOA 2B7NA 4PL2A 5G2IA 1FWSA 2C0AA 1P5BA 3A5VA 3HG3A 4PTNA 2ZRWA 3TIMA 4LUJA 4NT0A 3MI3A 4K38A 2YGYA 2YSWA 4LUIA 1JQVA 4O1BA 3LCIA 3UWQA 3G1SA 4MY9A 1OFBA 1TPWA 3B04A 4JTFA 3W6YA 3BK0A 3KFTA 5DXYA 3HOJA 5CPNA 4JTKA 1TREA 3FA5A 1W8SA 3NZRA 1G67A 2V30A 3QEZA 3GLCA 1PL9A 1WXJA 1M7OA 4KWWA 5G5IA 3GDMA 3G0UA 2NX9A 3HGOA 2C3ZA 3W1TA 1XC4A 3DI1A 5J5RA 5FF0A 1RQHA 5HWMA 4AF0B 1EX5A 1FCUA 3A9IA 2WSYA 2HTMA 4MFDA 1EB3A 1M6JA 4X22A 3B05A 1W1ZA 2NV2A 3OA3A 1QO5A 2ATSA 2R94A 2YR1A 5CKSA 5CPMA 3STFA 1C9DA 4B5NA 2A5HA 3W87A 3BLEA 5LHEA 4AHOA 3L5AA 4QIUA 3JS3A 4M6QA 3PR2A 5D09A 5LHFA 4O4WA 4PODA 2AGKA 3P67A 3I7QA 4AMAA 5A8GA 2FPVA 3HG5A 4UC5A 2J6XA 4O54A 1Z48A 2DZTA 1Z42A 4ORMA 1H7OA 3TX9A 3M5ZA 5KZDA 2ZDRA 1C29A 3HPZA 1IXQA 3NQ6A 4IUOA 5LGXA 2Q8LA 5TBOA 3UQNA 3PBYA 4RK8A 3N9RA 4K37A 2GPTA 1ZNNA 1FX6A 3TR2A 3W2KA 4JX6A 1VYRA 3EKZA 3G1XA 2FB2A 1L6YA 3W72A 4N2YA 5FF3A 4UR8A 2NUWA 1A5CA 2ZRUA 1QDSA 3PG9A 5HMSA 4C1KA 3L2IA 3M41A 2A7NA 3I68A 5DELA 4UUIA 3P62A 4DPPA 3C0JA 1Q45A 1VYSX 3W7MA 2V2DA 2E6AA 1W3TA 4ZQCA 3RMJA 3N73A 2Z0IA 2Y7DA 1I8JA 2H3BA 3HB9A 5IBXA 3EXSA 1UUMA 2QCDB 3OIXA 2OZ0A 4OE7A 3OEXA 1GYLA 5LGZA 5HR6A 4FX7A 3S9YA 4GFSA 4ZZ9A 2Z2UA 3HBLA 4IPIA 4Y90A 1ZAIA 4JS3A 3M5XA 1T0OA 1JVNA 4BFAA 2GQ8A 5BOOA 1TYGA 3MYPA 2DZSA 5G2WA 3O1NA 1FCVA 1GT8A 2CLFA 4P61A 5DCBA 1XM3A 1MSSA 1H50A 2PC4A 1TTIA 3LDVA 4HPJA 4MVAA 4MZ8A 3IIVA 5KINA 3S8HA 3P84A 2GVGA 4OHQA 3LXBA 4YXGA 2V0TA 1G69A 4LV9A 4JYFA 3CHVA 3OG3A 4RZ4A 2ISVA 5C5YA 4N9DA 5T26A 1D9EA 2ATMA 4GUHA 3DFQA 5LNWA 4Z1CA 1H7PA 3TKFA 3L67A 4RXFA 1D3HA 1KM2A 1YYAA 3TQ0A 2O7QA 4Z1AA 5F2GA 4GUFA 3BV4A 3FS2A 4Z0JA 2FIQA 3GB6A 1QO2A 1EPXA 3W7CA 1GQNA 4CCCA 1X6UA 2JKPA 4IJBA 1NAL1 1YTEA 1LLZA 4CQ9A 1LCOA 1DORA 2ZZ6A 5HUPA 3VNDA 4EVZA 5C55A 3OVPA 4GUIA 5LNUA 3QM3A 4O11A 4M7SA 2Y7FA 2YXGA 2ZTJA 3S0CA 2V8ZA 4OBTA 3IEBA 2B7OA 4WD0A 3MP3A 3VKJA 1DOSA 4UNKA 5K9DA 1TTPA 3TH6A 1YADA 3C56A 1QR7A 2W0UA 3TC7A 4OT7A 5G1YA 2OX1A 2RFGA 1Q6RA 3PSVA 2IQTA 1KM4A 4IMGA 3HGRA 2QCNA 3HJZA 4O1DA 4UTWA 3O6YX 2X16A 4WJEA 3FEMA 3HF3A 4FO4A 3O6CA 3W22A 2FPTA 2DZUA 3L0NA 3TAOA 1FWNA 3L68A 4NJHA 2QUVA 1MEIA 2X30A 3CQ0A 4M6PA 4X2RA 5CGQA 1FXPA 3W1PA 3Q94A 4N4QA 5I3GA 1UCWA 4Q32A 3BPWA 2C15A 5KSWA 1LRTA 1KM6A 4OV9A 3SGZA 3G1HA 1LBFA 1LBMA 3DFNA 4MFEA 3B06A 1LRQA 2Q3RA 2B4GA 2Q8ZA 4K7VA 3LLDA 3VE7A 2RH9A 5AC8A 3NQEA 3G8RA 3E49A 3O8AA 4LTSA 4RCXA 1MO0A 3JR2A 1CX9A 4POCA 1XBXA 4JTHA 3W1NA 1THFD 3TXVA 3EX2A 1K8ZA 2AQWA 2RDUA 2GVLA 5F1VA 3LRKA 4WXYA 2CZ5A 1N8FA 3PC0A 4FEZA 4ZQRA 4GE8A 1IXPA 2J88A 3G3MA 4O1AA 3YPIA 5L6UA 3TMQA 2J27A 3FKKA 3HQ1A 4ALDA 5CG7A 5BMWA 2QCFA 3TAKA 1TV8A 3TFCA 2PE4A 1PHQA 2J9XA 2V81A 4OQVA 1QPOA 3LRMA 3IIOA 3FJ6A 3LCWA 4IX2A 3R2GA 4ONVA 4I7VA 4UFMA 1IXOA 4FNSA 3RK8A 2J9ZA 3LRLA 2RKXA 1D3GA 1FCBA 3BLFA 3UWYA 5AC7A 1ICSA 4O15A 1KM5A 3GKFA 3MI6A 4UNLA 1EIXA 4DF1A 4GUGA 1JJKA 1L6WA 2C1HA 3DFTA 3THAA 4WY0A 3UXDA 4JIPA 1JCJA 5C54A 3PB0A 1KFEA 1SO5A 3W2NA 5FF2A 1F6KA 4IMDA 4Z1BA 3U8GA 4XBKA 1EP3A 5AFDA 4ZQNA 2DORA 2VEIA 2EAWA 1OFPA 3C2OA 3DENA 2WKJA 3I6RA 3EX3A 3W84A 3FJLA 4O0ZA 3P5ZA 4NU7A 3DHDA 4AAJA 4N02A 1EA0A 4Y6GA 2QJHA 3MP4A 4MYAA 4X9SA 1GJPA 1P4CA 1V5XA 3PB2A 5SWUA 3ZS4A 3V1PA 1XUUA 4KKXA 1LROA 4BWLC 2YW4A 3S1UA 2VEKA 3B0VC 5LKYA 3TW7A 3KRSA 2NZLA 5I3KA 5HULA 4NJKA 1GEQA 5AYYA 1TPUA 3BW3A 1O5XA 2DP3A 3M16A 1A50A 1KM3A 3LX9A 1X7FA 1O4UA 3LHZA 1F6PA 3GR7A 1KFKA 2JGQA 3NQ7A 4QNEA 2ZZ2A 4XUGA 4JYEA 4O1CA 2ZZ3A 3T78A 3KVLA 3DI0A 1W3NA 1ZAJA 4O10A 4YL2A 3SW6A 4RZ5A 2Z1BA 2ISWA 3ATZA 3NPUA 1HFBA 4LV4A 3P81A 2G97A 1I4NA 5BMXA 2FFCA 2TRSA 2V2CA 2Z6JA 4TU1A 3W7PA 4AVFA 3C3NA 4ADUA 5AYZA 1SZFA 3DBPA 5U4NA 5AHLA 1H1YA 3PY2A 3NPWA 3TMLA 3HIJA 1J2WA 5LNRA 1BKSA 5G1TA 3LM7A 1OFRA 2ZFAA 3V75A 1KFLA 2CLOA 4K36A 5GVJA 2CLEA 4L4MA 2G96A 1QWGA 3EKLA 2CLKA 3BG5A 1LZOA 5HINA 2YYTA 4JN6A 5KMYA 2P0OA 2QCLA 1TJPA 4MYXA 2CU0A 3NXFA 2XFWA 3LCXA 4MLRA 3W7DA 4KFOA 2OMAA 3SJ3A 4UMBA 3IVUA 2WPBA 1S3HA 3NL2A 2W6RA 1TTQA 2YDAA 3A22A 3NQGA 4JGDA 4Y96A 1LTDA 2GQ9A 1GVRA 3W7LA 1TPB1 3WJWA 2QAFA 5HNRA 4O13A 4ZMGA 4UFIA 3SY5A 4QNWA 3VE9A 1R2RA 4GJ1A 2CW6A 2DZWA 2GUUA 4ZQPA 2P1FA 5EA9A 3FYPA 4DBDA 4H6KA 4HSOA 5IBXC 4BI7A 1KM1A 2HMCA 4NNAA 3KRZA 1G4SA 4O52A 1RV8A 1SFJA 4AH7A 1KBJA 2C6QA 4E38A 1FQ0A 1OF6A 5FEPA 1Q3NA 4E2BA 2WNZA 3SGUA 4GWEA 4JY9A 5AHEA 4ORIA 4CCEA 1OK6A 1ZCOA 3TU9A 1H7RA 3O63A 1NEYA 3ABSA 1IIHA 4O50A 4M6VA 1TPDA 4UFLA 1K8XA 2A4AA 4WX2A 3C8FA 3W7HA 3LBCA 5FEXA 4W9TA 2DJXA 2TPSA 4PC8A 2ZBTA 2NWRA 3P80A 2JGYA 2ZA3A 3QZEA 3GDKA 3W88A 3STCA 3CM4A 2C16A 3T4CA 1QPQA 2EF9A 1KV5A 2JBMA 1KFJA 3PUEA 1W31A 4YLWA 3B8DA 3WJXA 1W56A 3CIXA 3OBKA 4UTTA 4ICNA 3QQ0A 1ME8A 3CTLA 3I7SA 3H53A 1SUXA 3UNDA 1K7XA 4R33A 4PL1A 5F2MA 1WBHA 5EPDA 1WOAA 1H1ZA 3P82A 4JD4A 3R89A 4NNBA 3P8JA 4GC4A 3W07A 4A29A 1YXCA 1FWTA 1VJIA 3NL5A 4AXKA 3N34A 4LOCA 3LI0A 3S1XA 1I2RA 4FHAA 4DF2A 4ZVJA 8TIMA 3MUXA 3GDTA 3N19B 4K6AA 3WK1A 4LRTA 2UV8G 4DELA 3PUOA 1I2QA 2E6YA 2DZXA 5HQEA 3UPBA 4CNPA 4EIVA 1O95A 2WSRA 1BTMA 1CI1A 5CPOA 5D32A 1H63A 1RZMA 3NQMA 4TR9A 4ZQMA 3CEPA 2NLIA 1SO3A 5CZSA 3QW4B 1XCFA 3AJXA 2XN0A 1SSDA 2A7PA 1KFCA 4OGZA 4N4PA 1HO4A 2JKEA 5H91A 1KBIA 3L9CA 4FNUA 2QCEA 5DLCA 4UTWC 1YTKA 1G4TA 4Z0SA 1Q6OA 3R5EA 4I7WA 5CZ0A 1DV7A 2LLEA 2NXIA 5EMUA 2WV8A 3P5YA 2CZDA 1ZHAA 4UR7A 1FWWA 1S5WA 1WX0A 3TC6A 3M5YA 3UWWA 4JIQA 1NF0A 1O94A 3EWWA 4JTUA 4XWUA 3MHUA 2A85A 3W70A 4HPXA 1PS9A 2QCMA 2ZA1A 4QAIA 5AOUA 2B0MA 4DF0A 2PURA 3W7GA 2E6DA 1W0MA 3O15A 3UPWA 1QOQA 1I2NA 1LM1A 5EYWA 1VLIA 3NQCA 5D37A 3LHWA 5DN1A 4NX5A 1W5MA 3GR8A 3N14A 2QCDA 4R53A 7TIMA 3QW3A 2Y6ZA 4N9CA 3BGGA 1PIIA 3FYOA 1Q6LA 5K4XA 5J5DA 2FDSA 3C52A 4CNOA 1XDMA 3M44A 4NZJA 4A21A 3B0PA 3SR7A 5KITA 3M5VA 3SECA 4EOUA 4UTIA 3PUDA 2GJNA 1AW5A 3KXQA 2A2IA 3W75A 3C61A 3M47A 4XBSA 1GYNA 1JUBA 1IGSA 2H8XA 2A21A 3S1VA 4ZL1A 5U7SA 1JRBA 1P1XA 4HSNA 4FF7A 3ZWSA 1AW2A 1GG0A 3P60A 1VPXA 4K8EA 3NL3A 4MJMA 1SZNA 1NSJA 4DO4A 3DXIA 3D0CA 5FESA 1JULA 4JEQA 5D30A 2VFFA 3KVJA 4JICA 5AHFA 1R47A 1TTJA 3SSJA 1OJXA 3P74A 4MUZA 3RU6A 3CEUA 4GRSA 3DFSA 5AHIA 1JUEA 1QOPA 1R30A 3PSWA 1J5TA 3TNOA 2B7PA 3LBMA 2VEMA 1U83A 2RDWA 4UTLA 4WUIA 2E09A 3ZFHA 3GYEA 4WXZA 4HNUA 3IVTA 5HWNA 3LGEA 5D38A 4JR5A 1GTHA 1XBVA 2I1OA 4LS0A 5TIMA 4BR1A 3LV5A 1MEWA 1PV8A 4FX8A 3U6WA 4WY0F 3N2XA 1FXQA 1SPQA 4LWWA 5E0KA 1K8YA 4BF9A 4CQ8A 3TSMA 1TQJA 3PBUA 4IPJA 5BNKA 1SSGA 3FFSA 4IXHA 2TYSA 2ZA2A 1A5AA 3MW7A 3QPZA 2F7FA 5D2TA 3MBFA 1T96A 3TK7A 4EWND 1K7EA 3TXZA 1P0NA 1YTDA 3TSDA 3MI2A 3IGXA 1JUKA 1JRCA 1Z41A 4LY8A 1FY6A 1TV5A 3USBA 5BW6A 3EWZA 4S2BA 1JCNA 1OYBA 2NWSA 2GJLA 2GVJA 1EUAA 1KM0A 1UJPA 1FWRA 3EX1A 1W5PA 3NA8A 3QPYA 4HNVA 3ABRA 3PBWA 2QF7A 1W54A 4RV8A 3F4NA 4QM1A 1F74A 3GK0A 1U5JA 2X1RA 3ZR4A 3EWXA 1KTNA 3LB0A 3PVFA 2H8ZA 3UWVA 1TRIA 2BXVA 3HPXA 2YFOA 4CNNA 3R13A 5K9CA 2EHHA 4UFKA 4HNTA 1E51A 2Y63A 3M0ZA 2PRMA 1WOBA 3B0UX 3QQ1A 1I45A 2PRHA 4UMCA 4TIMA 1OVDA 2PCQA 2Y88A 3ZWTA 4A2SA 1X1OA 2ZRXA 1HTIA 1A53A 3HGSA 1OX5A 1FDYA 3BGJA 2HS6A 1M5WA 2CZFA 4QSHA 1NVMA 4WZHA 1N7KA 3N2MA 3LTYA 1XFBA 1IIGA 1VYPX 4I9AA 4O19A 1YXYA 1GVFA 3OHIA 3L66A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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